基于网络药理学探讨补阳还五汤治疗腰椎术后疼痛综合征的作用机制

目的：采用网络药理学分析方法探讨补阳还五汤对腰椎术后疼痛综合征的作用机制。方法：通过检索中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）和阅读文献筛选补阳还五汤中可被人体吸收的活性成分及靶点,利用Cytoscape 3.9.0软件构建补阳还五汤活性成分-靶点网络图。利用在线人类孟德尔遗传（OMIM）数据库、Disgenet数据库检索“疼痛,术后（Pain,Postoperative）、炎性疼痛（Inflammatory Pain）、下腰痛（Low Back Pain）、骨痛（Bone Pain）”,将获取的疾病基因靶点与补阳还五汤的靶点取交集,预测补阳还五汤治疗腰椎术后疼痛综合征的靶点基因。使用Cytoscape 3.9.0软件构建补阳还五汤治疗腰椎术后疼痛综合征的“活性成分-靶点”网络及蛋白质-蛋白质相互作用网络,利用“微生信”网站进行靶点基因本体论（GO）分析与京都基因与基因组百科全书（KEGG）分析。筛选补阳还五汤治疗腰椎术后疼痛综合征的“活性成分-靶点”的主要活性成分和关键靶点进行分子对接。结果：从TCMSP和文献中筛选并去除重复后符合标准的活性成分70个、靶点292个,通过OMI...     

基于网络药理学探讨补阳还五汤抗动脉粥样硬化的作用机制

目的:利用网络药理学探讨补阳还五汤抗动脉粥样硬化的作用机制.方法:通过TCMSP数据库检索中药成分、靶点,利用SwissTargetPrediction、PubChem 2个在线网站预测中药成分靶点;通过OMIM、DisGeNE、TTD、DrugBank 4个数据库检索动脉粥样硬化靶点;以VENN图展现补阳还五汤靶点与...     

基于网络药理学的补阳还五汤治疗阿尔兹海默症的作用机制研究

目的：运用网络药理学的研究方法,初步探讨补阳还五汤治疗阿尔兹海默症（AD）的作用机制。方法：借助中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、OMIM、DrugBank、TTD数据库检索和收集AD的相关靶点;利用TCMSP和TCM@TAIWAN数据库检索和筛选补阳还五汤组方药物的活性成分,并通过PharmMapper服务器预测化合物潜在作用靶点;通过与收集的AD靶点比对获得活性成分作用的AD靶点,并利用STRING数据库和Cytoscape软件构建和分析AD靶点的PPI网络图和“组方药物-活性成分-AD靶点”网络图;分别通过DAVID系统、KOBAS 3.0数据库对AD靶点进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：从补阳还五汤中筛选出92个活性成分,其中来自赤芍的芍药内酯苷、4-乙基芍药苷、4-氧-甲基-芍药苷可能是重要的多效活性成分;活性成分经靶点预测和比对后确定33个抗AD靶点,其中CASP3、MAPK14、BCHE、BACE1可能是抗AD的关键靶点。活性成分通过作用上述AD靶点调控MAPK、PI3K/AKT、Rap1、Ras等信号通路,影响蛋白水解、蛋白磷酸化、雌激素应答等生物过程,抑制Aβ的生成,降低神经元炎症反应和神经细胞凋亡,减弱胆碱酯酶活性,进而达到治疗AD的目的。结论：通过网络药理学方法研究补阳还五汤治疗AD的活性成分和作用机制,揭示了补阳还五汤在治疗AD方面具有多成分、多靶点、多途径的优点,为补阳还五汤的后期实验提供新思路。     

基于网络药理学和分子对接探讨补阳还五汤治疗糖尿病脑病的作用机制

目的：基于网络药理学方法和分子对接技术,探讨补阳还五汤有效成分治疗糖尿病脑病潜在作用机制。方法：从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和中科院化学专业数据库筛选出补阳还五汤有效化学成分及其靶点,通过GeneCards、在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库收集糖尿病脑病靶点,运用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图并通过Cytoscape 3.8.0软件中CytoNCA插件筛选关键靶点。利用ClusterProfiler程序包进行基因本体(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,并通过Cytoscape 3.8.0软件构建补阳还五汤药物-成分-靶点-通路网络,最后利用AutoDock软件进行分子对接验证。结果：筛选得到补阳还五汤中活性成分108种,对应潜在靶点469个,网络图显示槲皮素、甘氨酸、洋川芎醌等是补阳还五汤治疗糖尿病脑病的关键成分,蛋白激酶、P53蛋白、肿瘤坏死因子等是该方治疗糖尿病脑病的关键靶点。GO富集分析显示该方可能通过对氧化应激的反应、对药物的反应、对金属离子的反应等生物过程发挥作用,与膜筏、膜微域、膜区域等细胞组分有关,与...     

基于网络药理学探讨黄芪桂枝五物汤治疗雷诺病的作用机制

目的:运用网络药理学方法探讨黄芪桂枝五物汤治疗雷诺病的作用机制.方法:通过TCMSP数据库检索黄芪、桂枝、白芍、大枣、生姜的活性成分及其靶点,通过Geencards、OMIM数据库获取雷诺病主要靶点,将药物靶点与疾病靶点取交集得到黄芪桂枝五物汤治疗雷诺病的靶点,利用STRING数据库分析蛋白质相互作用,构建PPI网络图...     

基于网络药理学和Meta分析探讨补阳还五汤治疗特发性肺纤维化作用机制

目的:运用网络药理学探讨补阳还五汤治疗肺纤维化的作用机制,并运用Meta分析进一步验证临床疗效。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及上海有机所化学数据库检索成分靶点,在基因卡片(GeneCards)、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、药物银行(DRUGBANK)数据库获得特发性肺纤维化的疾病靶点,应用String网构建蛋白质与蛋白质相互作用(PPI)网络,采用Metascape进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。检索中国知网(CNKI)等7个中英文数据库,纳入7项随机对照研究,采用RevMan 5.3进行Meta分析。结果:网络药理学筛选得到补阳还五汤有效活性成分132个、作用靶点241个、疾病靶点1088个,取交集得靶点76个,PPI分析发现关键靶点涉及IL6、TNF、VEGFA等。富集分析得到GO条目1470条(P<0.01);KEGG富集得到181条通路(P<0.01)。Meta分析纳入412例患者,分析显示补阳还五汤可提高临床总有效率(RR=1.38,95%CI[1.23,1.56],P<0.00001)和动脉...     

基于网络药理学和分子对接研究泽泻汤治疗良性阵发性位置性眩晕的作用机制

目的:通过网络药理学方法及分子对接技术研究泽泻汤防治良性阵发性位置性眩晕(Benign Paroxysmal Positional Vertigo,BPPV)的分子效应机制,为泽泻汤治疗BPPV的临床应用提供理论支持。方法:检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),获取泽泻汤的主要化学活性成分,再通过设定药物代谢动力学值筛选出主要活性成分并提取相关靶点;查找相关文献补充TCMSP数据库未能预测到的成分,并运用Swiss Target Prediction数据库预测靶点。运用GeneCards、OMIM及DisGeNET数据库提取BPPV疾病的相关靶点;运用STRING 11.8数据库、Cytoscape 3.8.0软件建立交集靶点的蛋白质-蛋白质相互作用网络,并进行可视化;利用DAVID6.8数据库对核心靶点开展基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;而后运用Cytoscape 3.8.0软件建立“泽泻汤成分-BPPV靶点-信号通路”网络。最后使用AutoDock软件进行分子对接验证。结果:预测到泽泻汤主要化学成分19种,包括泽泻醇B、泽泻醇C、α...     

补阳还五汤治疗糖尿病周围神经病变的网络药理学分子机制研究

[目的] 采用网络药理学对补阳还五汤治疗糖尿病周围神经病变（DPN）的分子机制进行探讨。[方法] 利用中药系统药理学分析平台（TCMSP）数据库、化学专业数据库收集补阳还五汤中7味中药的相关化学成分及作用靶点，与Drugbank、GeneCards数据库获得的DPN疾病靶点相映射，得到补阳还五汤治疗DPN的潜在靶点；通过STRING在线数据库得到蛋白互作关系并筛选出关键靶点，进而运用Cytoscape软件构建蛋白相互作用（PPI）网络和"补阳还五汤-活性成分-关键作用靶点"网络；使用R软件对补阳还五汤的关键作用靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析，并构建"补阳还五汤-活性成分-靶点-KEGG通路"多维网络图。[结果] 筛选得到补阳还五汤81个活性成分和238个作用靶点，DPN疾病相关靶点4 334个，补阳还五汤治疗DPN的关键靶点124个，槲皮素（quercetin）、β-谷甾醇（beta-sitosterol）、黄芩素（baicalein）等12个成分具有潜在抗DPN活性，其可能作用于丝裂原活化蛋白激酶1（MAPK1）、SRC、JUN、肿瘤坏死因子（TNF）、白细胞介素-6（IL-6）等靶点，通过AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、HIF-1信号通路等发挥治疗DPN的作用。[结论] 补阳还五汤通过多成分、多靶点、多途径起到干预治疗DPN的作用，为补阳还五汤治疗DPN的基础和临床研究提供新方向。     

细胞膜固相色谱法联合网络药理学探讨补阳还五汤促进缺血性脑卒中康复的作用

目的:采用细胞膜固相色谱法联合网络药理学探讨补阳还五汤促进缺血性脑卒中康复的作用机制.方法:细胞膜固相色谱法筛选补阳还五汤供试液中与海马神经元细胞特异性结合的成分;检索PubChem,PharmMapper,在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM),GeneCards等数据库获取特异性结合成分的作用靶点及缺血性脑卒中疾病的...     

基于网络药理学和分子对接技术探讨杜仲-续断治疗复发性流产作用机制

目的:采用网络药理学和分子对接技术探讨杜仲-续断治疗复发性流产(RSA)的作用机制.方法:利用中药系统药理学数据库(TCMSP)检索杜仲-续断的活性成分和基因靶点.在GeneCards、OMIM和PharmGkb数据库收集RSA疾病靶点,在Cytoscape 3.7.2软件中构建活性成分-靶点网络,基于STRING数据...     

苗药定痛汤治疗偏头痛网络药理学研究

目的:基于网络药理学初步筛选苗药定痛汤治疗偏头痛的作用靶点并探索其可能的分子机制.方法:通过TCMSP筛选苗药定痛汤潜在活性成分和作用靶点,利用TTD、GeneCards、OMIM数据库整理偏头痛疾病靶点,STRING数据库进行蛋白互作分析,Cytoscape_v3.8.0构建药物-疾病-靶点多维网络,再利用DAVID...     

基于网络药理学探讨青风藤治疗类风湿关节炎的作用机制

目的:基于网络药理学方法探讨青风藤治疗类风湿关节炎(RA)的可能机制.方法:通过TCMSP平台筛选青风藤活性成分,利用UniProt数据库将相应靶点蛋白转换为标准蛋白基因名,经Cytoscape3.7.1软件构建网络图.在GeneCards数据库、OMIM数据库、CTD数据库中检索"Rheumatoid Arthrit...     

基于网络药理学探讨补阳还五汤治疗高脂血症的作用机制＊

目的 本研究探讨补阳还五汤治疗高脂血症的物质基础与作用机制。方法 运用TCMSP数据库和STICH数据库收集补阳还五汤化学成分和靶点信息，通过HPO数据库筛选疾病的靶点，然后利用Cytoscape 3.6.1软件对成分靶点和疾病靶点进行网络拓扑学分析，获取补阳还五汤治疗高脂血症的作用靶点，再运用DAVID在线分析工具对作用靶点进行KEGG通路富集及分析，最后构建“补阳还五汤-化学成分-核心靶点-关键通路”的多层次网络关联图。结果 共得到补阳还五汤潜在活性成分107个，药物靶点487个，疾病靶点95个，拓扑分析共得核心靶点113个，主要KEGG通路20条。本研究结果表明，补阳还五汤治疗高脂血症的作用机制可能与CREBBP、TP53和PPARA等靶点及脂肪细胞因子、FoxO、TNF、HIF-1和PI3K-Akt信号通路有关。结论 本研究筛选了补阳还五汤治疗高脂血症的关键靶点和通路，为补阳还五汤用于临床治疗提供了科学依据。     

基于网络药理学研究补阳还五汤干预缺血性脑卒中神经血管单元的作用机制

目的利用网络药理学方法研究补阳还五汤治疗缺血性脑卒中涉及的重要信号通路和保护神经血管单元的作用机制。方法使用TCMSP、上海有机所中药与化学成分数据库和相关文献获取并筛选补阳还五汤的活性成分及作用靶点;使用DrugBank数据库、药物靶标数据库(TTD)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)和GeneCards数据库获取缺血性脑卒中靶点。使用Cytoscape 3.7.2软件建立活性成分-治疗靶点网络,分析网络获取关键靶点。使用Metascape数据库对治疗靶点进行GO富集分析和KEGG信号通路富集分析。使用AlzData数据库分析治疗靶点的基因表达情况。结果通过网络分析,获得了补阳还五汤治疗缺血性脑卒中的关键靶点,包括前列腺素内过氧化物合酶2、前列腺素内过氧化物合酶1、毒蕈碱型乙酰胆碱受体M1、β2肾上腺素能受体等;通过富集分析获取了补阳还五汤治疗缺血性脑卒中的多条关键信号通路,包括PI3K-Akt信号通路、钙信号通路、IL-17信号通路、血小板活化、Apelin信号通路、NF-κB信号通路、AMPK信号通路和花生四烯酸代谢通路等;通过基因表达分析了补阳还五汤对不同组织细胞的作用,发现治疗靶点在内皮细胞、星形胶质细胞、小胶质细胞、少突胶质细胞、少突胶质细胞前体细胞和神经元中调控多种生物过程、细胞组成和分子功能。结论补阳还五汤治疗缺血性脑卒中具有多成分、多靶点、多通路、联系复杂的特点,在基因的细胞表达层面与神经血管单元密切相关,治疗作用机制包括神经保护、神经发生、抗血栓、促血管再生、胶质细胞调控等。     

基于网络药理学的辛夷治疗过敏性鼻炎作用机制研究

目的 基于网络药理学探讨辛夷治疗过敏性鼻炎的活性成分及作用机制.方法 检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取辛夷活性成分,并借助SwissTargetPrediction、PubChem进行辛夷成分的作用靶点预测和筛选,构建成分-靶点网络.通过TTD、DrugBank、DisGeNET、OMIM数据库获取...     

基于网络药理学和分子对接技术探讨独活寄生汤治疗退行性腰椎管狭窄症的分子作用机制

目的 运用网络药理学的研究方法,初步分析独活寄生汤治疗退行性腰椎管狭窄症(DLSS)的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索和筛选独活寄生汤方药物的活性成分,同时在GeneCards、OMIM数据库中检索DLSS的靶点。利用Venny平台得到独活寄生汤治疗DLSS的潜在作用靶点。利用STRING数据库和Cytoscape软件构建独活寄生汤治疗DLSS的“单味药—活性成分—作用靶点”网络和蛋白质相互作用网络(PPI),并通过David数据库对独活寄生汤治疗DLSS的作用靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,研究独活寄生汤治疗DLSS的作用机制,并通过分子对接来模拟活性成分作用于靶蛋白的结合情况。结果 共探索出独活寄生汤主要涉及1939个有效活性成分及对应292个潜在靶点,DLSS靶点1258个,筛选出共同靶点122个。经PPI互作图显示蛋白ALB、AKT1、IL-6、IL-1B、CASP3等存在较多连线。药物-活性成分-靶点网络图显示,度值较高的活性成分主要涉及柚皮素、芒柄花黄素、甘草查尔酮A、黄芩素等,被影响较多的靶点...     

基于网络药理学探讨玄参-麦冬药对治疗焦虑症作用机制

目的 应用网络药理学方法探讨玄参-麦冬药对治疗焦虑症的作用机制,为临床应用玄参-麦冬药对提供依据。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）和中医药整合药理学研究平台（TCMIP）收集玄参、麦冬的化学成分,结合TCMSP、SwissADME数据库及文献筛选活性成分,利用Swiss TargetPrediction数据库预测活性成分作用靶点;通过OMIM、GeneCards、DrugBank数据库获取焦虑症的相关靶点,与活性成分作用靶点取交集;利用STRING数据库建立活性成分-疾病共同靶点蛋白相互作用（PPI）网络,采用Cytoscape3.8软件对PPI网络进行MCODE聚类分析,得出关键靶点;利用DAVID6.8数据库对活性成分-疾病共同靶点进行GO和KEGG富集分析,通过活性成分-靶点-通路网络筛选核心活性成分,用分子对接模拟核心活性成分与关键靶点的结合强度。结果 共筛选出玄参-麦冬药对37个活性成分,潜在靶点471个,焦虑症相关靶点753个,活性成分-疾病共同靶点42个,对其PPI网络进行MCODE聚类分析得到4种类簇,筛选出关键靶点14个。GO和KEGG富集分析显...     

基于网络药理学分析生蒲黄-墨旱莲药对治疗糖尿病视网膜病变的作用机制

目的:通过网络药理学研究方法探讨生蒲黄-墨旱莲药对治疗糖尿病视网膜病变(Diabetic retinopathy,DR)的作用机制。方法:通过中药药理数据库和分析平台(TCMSP)检索药物的活性成分和靶点;在GeneCards、DrugBank和OMIM数据库检索糖尿病视网膜病变相关靶点;利用Venny工具找出疾病与药物的交集靶点;通过Sting数据库对交集靶点进行分析;结果导入Cytoscape 3.9.1软件进行拓扑异构分析;筛选出核心靶点并绘制蛋白质-蛋白质相互作用网络图。将交集靶点录入Metascape进行基因本体论(GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,得到潜在作用通路。结果:(1)药物活性成分及靶点:通过TCMSP数据库筛选出生蒲黄-墨旱莲活性成分17个、作用靶点222个。(2)疾病靶点:经GeneCards、DrugBank、OMIM数据库筛选去重后获得相关的疾病靶点4 005个,将药物靶点与疾病靶点交集后共获得108个共有靶点。(3)核心靶点:通过Cytoscape 3.9.1软件筛选出核心靶点为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/T...     

基于网络药理学探讨补阳还五汤治疗冠心病的作用机制

目的：采用网络药理学方法探讨补阳还五汤治疗冠心病的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取补阳还五汤的有效成分并预测活性成分所对应的靶标;通过Genecards、OMIM数据库,收集冠心病相关的靶点,并利用Venn图与药物作用靶点取交集,筛选补阳还五汤治疗冠心病的关键靶点。利用STRING平台建立预测靶蛋白之间的相互关系网络,根据联系密切程度筛选出核心靶标。用R语言进行核心靶标的GO生物过程分析和KEGG通路富集分析。结果：收集到补阳还五汤符合筛选条件的活性成分11个,药物与冠心病共同靶点192个,主要作用于AKT1、JUN、MAP激酶(MAPK1、MAPK8、MAPK14)、RELA、APP、白细胞介素(IL-6、CXCL8)、FOS、CTNNB1、ESR1、表皮生长因子受体(EGFR)、PRKCA、血管内皮生长因子A(VEGFA)等多个靶基因,调控流体剪切应力与动脉粥样硬化、PI3K-Akt信号通路、人巨细胞病毒感染、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、乙型肝炎、前列腺癌、Kaposi肉瘤相关疱疹病毒感染、白细胞介素-17信号通路、丙型肝炎、TNF...     

基于网络药理学研究补阳还五汤治疗急性高原低氧性脑损伤的作用机制

目的 基于网络药理学研究补阳还五汤治疗急性高原低氧性脑损伤的有效活性成分及作用靶点,分析其作用机制。方法 运用TCMSP、Swiss ADME、Swiss Target Prediction数据库筛选补阳还五汤的有效成分及作用靶点;运用OMIM、Gene Cards数据库获取急性高原低氧性脑损伤的疾病靶点,筛出疾病与药物的共同靶点;运用String在线数据库构建疾病与药物蛋白质相互作用图;运用Cytoscape3.7.1软件绘制“药物-活性成分-靶点-疾病”网络图;运用Metascape在线数据库进行GO分析和KEGG信号通路富集分析。结果 补阳还五汤中发挥治疗急性高原低氧性脑损伤的主要成分是木犀草素、杨梅酮、芒柄花黄素、山奈酚、鞣花酸、毛蕊异黄酮等活性成分,主要靶点是蛋白激酶B1、白介素-6、肿瘤坏死因子、肿瘤蛋白P53、血管内皮生长因子A、白介素-1β、缺氧诱导因子1α等;通路主要富集在磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶B信号通路、缺氧诱导因子-1信号通路、Janus激酶/信号转导子和转录激活子信号通路等。结论 补阳还五汤治疗急性高原低氧性脑损伤的机制可能是通过调节炎症反应、抗氧化应激...