一例男性乳腺癌的罕见 BRCA2基因胚系变异分析

目的:对1例男性乳腺癌患者的基因组变异进行分析,为检测后的遗传咨询提供依据。方法:检测前了解家族史、医疗史,告知被检者检测潜在的风险及可能的检测结果,利用二代测序技术对先证者进行全外显子组检测,应用Sanger测序对先证者及家系成员进行变异位点验证。结果:二代测序结果显示先证者 BRCA2基因存在c.601...     

23例B亚型的分子生物学分析

目的:探讨红细胞B抗原弱表达的分子生物学原因。方法:应用血清学方法进行血型鉴定,包括正反定型检测,抗-A1,抗-H检测,并进行吸收放散试验以检测弱B抗原。应用直接测序对第1-7外显子进行分析,并对其中1例进行克隆后测序。结果:血清学检测的23例患者红细胞均含有弱B抗原。DNA测序确定这些B亚型的等位基因,包括2例Bel...     

一例 DYM基因移码变异所致Dyggve-Melchior-Clausen综合征患儿的临床及遗传学分析

目的:对1个Dyggve-Melchior-Clausen综合征家系进行基因变异检测,明确其遗传学病因。方法:应用全外显子及Sanger测序对家系成员进行致病变异检测,并通过蛋白免疫印迹法(Western blotting)对变异位点进行功能分析。结果:测序结果显示家系的两例患儿 DYM基因均存在c.122...     

一例 FBN1基因变异所致家族遗传性胸主动脉瘤/夹层患者临床表现及遗传学分析

目的:对1例超声心动图表现为B型主动脉夹层及胸主动脉瘤的患者及其家系进行基因检测,明确其可能的致病变异基因。方法:对先证者进行全外显子测序,重点分析遗传性主动脉疾病相关致病基因,依据ACMG指南,判定变异的致病性。并应用Sanger测序对患者及家系成员的候选位点进行检测。结果:二代测序结果经生物信息学分析,在患者的基因...     

1例B(A)亚型血型鉴定及分析

目的:对1例献血者ABO血型检测与初筛血型检测不符样本进行血清学及分子生物学鉴定并分析其原因。方法:纸片法初筛血型,应用PK7300血型仪进行ABO血型鉴定,试管法进行血型血清学复测ABO血型,使用测序技术对献血者ABO基因进行测序并比对测序结果。结果:纸片法血型鉴定为AB型,PK7300血型仪正反鉴定一致为B型,试管法血型检测该献血者为B(A)型,测序分析证实ABO基因型:B(A).02/O.01.02,在700位有CG杂合突变,测序结果与试管法血型血清学检测一致,证实该献血员为B(A)亚型。结论:PK7300血型仪鉴定血型存在亚型漏检,试管法ABO血型鉴定是实验室全自动血型检测方法很好的补充。     

一例孤独症谱系障碍合并45，X/46，XY嵌合体患儿的全外显子测序分析

目的:对1例孤独症谱系障碍合并45,X/46,XY嵌合体患者进行基因检测。方法:抽取家系的血液标本提取DNA进行全外显子测序(whole exome sequencing,WES)筛选可疑致病性变异位点,并应用Sanger测序方法对变异位点进行验证。结果:检测到先证者中孤独症谱系障碍相关基因 CACNA1I...     

一例成骨不全家系致病变异的鉴定及胚胎植入前遗传学检测

目的:明确一例成骨不全(osteogenesis imperfecta,OI)家系的致病变异并为其提供胚胎植入前遗传学检测(preimplantation genetic testing,PGT)。方法:应用高通量测序结合Sanger测序的方法鉴定患者的候选变异,用直接检测变异的方法对胚胎进行PGT检测,同时筛查囊胚的...     

一个 PCDH15基因变异所致的Usher综合征家系的遗传学分析及产前诊断

目的:对1个Usher综合征家系的临床特征及基因变异进行分析,明确其遗传病因。方法:对家系中患儿进行全外显子测序,就发现的可疑致病变异用Sanger测序法对患儿及其父母进行检测,明确先证者病因后,进一步对家系中的胎儿进行产前诊断。结果:测序结果显示先证者 PCDH15基因(NM_033056)存在c.17_...     

Dravet综合征患者 SCN1A基因变异分析

目的:分析Dravet综合征(Dravet syndrome,DS)患者的临床特征和基因变异特点,明确其致病原因。方法:采集患者及其父母外周血并提取基因组DNA,应用高通量测序技术进行检测,对疑似致病变异进行Sanger测序验证及生物信息学分析。结果:高通量测序显示例1 SCN1A基因第12外显子存在c....     

一例Rothmund-Thomson综合征患儿的 RECQL4基因变异分析

目的:探讨1例Rothmund-Thomson综合征(Rothmund-Thomson syndrome, RTS)患儿的临床表现和基因变异,明确其可能的致病原因。方法:采集患儿及其父母、妹妹的外周血,对患儿进行全外显子组测序进行基因变异分析,并用Sanger测序方法对变异基因的家系分布进行验证。结果:基因检测结果显示...     

应用高通量测序检测妇科恶性肿瘤患者血浆游离DNA的临床效果

目的:分析高通量测序在妇科恶性肿瘤患者血浆游离DNA检测中的应用.方法:收集中山市博爱医院2019年-2020年12月50例血液样本,采用高通量测序技术对其进行测序分析,比较高通量测序技术的准确性及敏感性.结果:对50例血液样本进行分析,检出其中5例确诊为妇科恶性肿瘤患者,4例为子宫内膜样腺癌,1例为卵巢癌,45例为非恶性肿瘤患者.高通量测序结果显示,仅卵巢癌患者发现多条染色体大片段拷贝数变异(copy number variation,CNV),而其余病例未发现染色体数目异常.以最终诊断结果为标准,高通量测序对恶性妇科肿瘤诊断的灵敏度为20.00％,特异度为100.00％.结论:高通量测序技术可检测出卵巢癌患者血浆中的肿瘤细胞游离DNA(cell-free circulating tumor DNA,ctDNA),但子宫内膜癌患者在本次实验中未检测出阳性结果.     

一个致死性先天性挛缩综合征7型家系的 CNTNAP1基因变异分析

目的:确定1个3次妊娠均出现羊水过多、早产,其中两例活产出生,出生后表现为呼吸困难、四肢挛缩、早亡等的家系的病因。方法:应用全外显子测序技术(whole exome sequencing,WES)对胎儿组织及父母外周血样进行检测。经生物信息学分析,对疑似致病性位点进行Sanger测序验证。结果:WES检测到胎儿组织标本...     

液相定点基因测序仪问世

基因测序是基因治疗中必不可少的关键一步,也是基因检测的金标准。一般基因测序主要包括三个步骤:PCR扩增,对待检测的DNA进行复制放量;用诺贝尔奖成果"末端终止法"进行测序反应;对完成反应的基因序列进行毛细管电泳,而后检测DNA中含有的荧光信号,即可获取基因序列的"密码"。这种方法要求被检样品的癌细胞数不得低于40%,否则会出现假阴性。     

全基因组测序在环境样本新型冠状病毒检测中的应用

目的:通过对环境样本进行全基因组测序,为全基因组测序在检测环境标本中SARS-CoV-2的应用提供实践基础,为新冠肺炎疫情的溯源和防控工作提供科学依据.方法:采用新冠病毒全基因组靶向扩增结合Illumina二代测序的技术对5例SARS-CoV-2核酸阳性环境样本进行全基因组测序,应用多种分析软件及在线病毒变异分析平台,...     

一例Helsmoortel-van der Aa综合征患儿的 ADNP基因变异分析

目的:探讨l例特殊面容、智力低下、语言发育迟缓和自闭症谱系障碍患者的分子遗传学病因。方法:抽提患者及其家系成员外周血基因组DNA,应用二代测序技术对患者外显子组基因序列进行检测,Sanger测序验证家系可疑致病位点,依据美国医学遗传学与基因组学学会指南对疑似致病性变异位点进行分析。结果:全外显子测序提示患者 ...     

福尔马林固定石蜡包埋标本二代测序终文库去除引物二聚体的方法

二代测序(next generation sequencing,NGS)技术能够同时对上百万乃至数十亿个DNA分子进行测序,相较于传统测序技术,其速度较快、一次可检测大量靶基因,因而广泛应用于染色体非整倍体无创产前筛查、肿瘤靶向治疗基因突变检测、遗传性肿瘤检测、病原微生物及宏基因组检测等领域。影响NGS结果的限制性因素包括:平台类别、靶区域富集方法、文库构建及扩增效率、测序数据量、生物信息学分析流程等。NGS流程主要包括3个部分:文库制备、测序和数据分析,建库是NGS实验第一步,终文库质量的好坏直接影响后续测序仪上机实验及数据分析。     

乙型肝炎病毒复制期与病毒耐药基因突变相关性

目的:研究乙肝病毒不同复制期与乙型肝炎患者抗病毒用药后基因突变两者的相关性。方法:选取203例慢性乙型肝炎患者血清标本为对象。经巢式PCR扩增及磁珠分离,制备焦磷酸测序单链模板,将PCR扩增得到HBV病毒P区和BCP区产物经焦磷酸测序进行突变频率检测,并在PyroMark ID遗传分析系统上进行焦磷酸测序。结果:检测乙型肝炎病毒DNA含量,按照HBV定量结果阳性(拷贝数≥103copies/ml)和阴性(拷贝数<103copies/ml)的标本分组分析,HBV定量阳性标本具有极高的敏感性。批量突变检测,乙型肝炎病毒复制率越高,突变率越高,检测率越高。结论:选择乙肝病毒的复制阳性标本,结合焦磷酸测序进行高通量、快速、准确检测耐药基因区突变,能满足临床批量用药检测及治疗方案设计的需要。     

呼吸道感染多病原检测试剂盒Luminex NxTAG TM RPP与一代测序性能对比

目的:评价Luminex NxTAG TM RPP对17种呼吸道病原体的检测性能。 方法:通过比较Luminex NxTAG TM RPP试剂盒与一代测序检测临床标本的结果,以评价Luminex NxTAG TM RPP试剂盒的检测性能。 结果:与一代测序相比,L...     

两例Mowat-Wilson综合征患者的 ZEB2基因变异分析

目的:分析两例疑似Mowat-Wilson综合征(Mowat-Wilson syndrome,MWS)患儿的遗传学病因,帮助确诊并为家系遗传咨询提供依据。方法:采集2例无亲缘关系患儿及其家系成员静脉全血提取基因组DNA,应用家系全外显子组测序及基因组拷贝数变异测序进行变异检测,可疑变异位点利用Sanger测序对先证者及...     

一例 MSTO1基因复合杂合变异所致的线粒体肌病并小脑萎缩共济失调患儿的分析

目的:分析1例表现肌病和小脑萎缩共济失调患儿的遗传学病因。方法:对患儿进行临床和实验室检查,应用全外显子二代测序技术对患儿进行检测,对可疑变异位点进行致病性预测,并进行患儿及其父母的Sanger测序验证。结果:患儿表现为运动发育落后、共济失调、肌张力减低,血清肌酸激酶升高,头部磁共振成像显示小脑萎缩且进行性加重。基因检...