Calpain10基因多态性与昆明地区人群2型糖尿病相关性研究

目的 探讨Calpain10基因多态性与昆明地区人群2型糖尿病遗传易感性的关系。方法采用病例-对照研究设计，以聚合酶链式反应-等位基因特异性扩增法（PCR-ASA），检测Calpain10基因单核苷酸多态性（SNP）43G／A位点和SNP44T／C位点基因型，并进行关联分析。结果 对131例2型糖尿病患者和131例正常对照进行了Calpain10基因SNP43和SNP44基因分型，与对照组相比，SNP43的G等位基因频率和SNP44的C等位基因频率在昆明地区2型糖尿病人群中显著升高（分别为93．13％，86．26％，P=0．0097；18．70％，9．92％，P=0．004）。结论 Calpain10基因SNP43位点G等位基因和SNP44位点C等位基因可能与昆明地区人群2型糖尿病的发病相关。     

安徽汉族人群PDCD1基因单核苷酸多态性与系统性红斑狼疮易感性分析

目的探讨程序性细胞死亡基因（PDCD1）单核苷酸多态性（SNP）对安徽籍汉族人群系统性红斑狼疮（SLE）患者易感性的影响。方法利用病例对照研究方法，收集122例SLE确诊患者和143名正常对照的血标本，用酚-氯仿-蛋白酶K提取法提取基因组DNA，用DNA单向测序法进行SNP因子检测和筛查。结果PDCD1基因7809位点的基因型全部为G／G型，PDCD1基因7872位点存在C和T2种多态性，PDCD1基因8162位点存在G和A2种多态性，在两组中分布差异有统计学意义（x^2=8．55，x^2=11．85，P〈0．05）。PDCD1基因7872位点，病例组C／C、C／T、T／T基因型频率分别为36．1％、41．8％、22．1％，对照组分别为51．7％、35．0％、13．3％，两组间基因型分布差异有统计学意义（0=7．411，P〈0．05）；PDCD1基因8162位点病例组G／G、G／A、A／A基因型频率分别为50．1％、20．3％、28．6％，对照组分别为57．6％、20．8％、22．6％，两组间等位基因型分布差异有统计学意义（x^2=7．547，P〈0．05）。PDCD1-7872杂合型、PDCD1-8162杂合型可能具有阻止汉族人发生SLE的作用（OR=0．583，OR=0．485）。结论安徽籍汉族人群PDCD1基因7809位点不呈现SNP，7872和8162位点SNP与SLE的易感性相关。     

中国维吾尔族、彝族人群VDR和HFE基因多态性分布

目的：研究不同民族的维生素D受体（VDR）基因多态性和血色素沉着症（HFE）基因突变的等位基因分布频率。方法：采用聚合酶链式反应（PCR）和Bsm I,Rsa I限制性酶切片段长度多态性（RFLP）方法，分析了206名维吾尔族人和142名彝族人的VDR基因Bsm I多态性和HFE基因C282Y突变及等位基因分布频率。结果：（1）VDR基因型分布：维吾尔族人群，bb基因型占42．0％，Bb基因型占45．4％，BB基因型占12．6％；彝族人群，bb基因型85．9％，Bb基因型占13．4％，BB基因型占0．7％。维吾尔族和彝族人群的VDR基因型分布存在非常显著性差异，维吾尔族人群的VDR B等位基因分布频率为35％，显著高于彝族人群的VDR B等位基因分布频率（7％）。（2）HFE基因型分布：维吾尔族人群中，正常基因型占97％，C282Y突变杂合子占3％，未检测到C282Y突变杂合和纯合基因型。维吾尔族和彝族人群的HFE基因型分布存在显著性差异，维吾尔族人群的HFE C282Y突变等位基因分布频率（1．5％）高于彝族人群的HFE C282Y突变等位基因分布频率（0％）。（3）ALAD基因型与VDR基因型间相关分析：维族人群上述两基因的基因型间未见明显相关，但是在彝族人群中，携带ALAD1－1基因型的个体更有可能携带VDR bb基因型（OR＝4．41，95％的可信限范围为0．60－28．22）。结论：维吾尔族人群的VDR基因Bsm I多态性等位基因和HFE基因C282Y突变等位基因分布频率与文献报道的高加索人群相近。彝族人群VDR基因Bsm I多态性等位基因和HFE基因C282Y突变等位基因分布频率与文献报道的亚洲人群相近。VDR和HFE基因在维吾尔族和彝族人群中的分布均存在明显的种族差异。彝族人群中发现ALAD基因型与VDR基因型间可能存在关联。     

钙蛋白酶10基因多态性与原发性高血压遗传易感性相关性研究

目的：探讨钙蛋白酶10基因多态性与原发性高血压遗传易感性的关系。方法：采用病例对照研究设计，以聚合酶链式反应-等位基因特异性扩增法（PCR-ASA），检测Calpain 10基因SNP43G／A位点和SNP44T／C位点基因型，并进行与原发性高血压的关联分析。结果：在非糖尿病人群中。原发高血压患者和血压正常者的钙蛋白酶10基因SNP43GG基因型频率分别为70．59％和72．73％，差异无统计学意义。其SNP44TT基因型频率分别为80．88％和78．41％，差异亦无统计学意义；分析原发性高血压与血糖、真胰岛素、C肽及胰岛素抵抗指数HOMA-IR等的关系，高血压患者与正常人群各项临床指标之间的差异无统计学意义（P〉0．05）。结论：钙蛋白酶10基因与昆明高原地区人群原发性高血压的发病无关，同时亦未发现原发性高血压与胰岛素抵抗的相关性。     

代谢酶基因多态性与结直肠癌易感性关系的病例对照研究

目的以自然随访人群为研究对象，研究Ⅰ、Ⅱ相代谢酶基因多态性与结直肠癌（CRC）易感性的关系。方法采用聚合酶链反应（PCR）-限制性片段长度多态性（RFLP）、等位基因特异性PCR（AS-PCR）和多重PCR分析技术，检测140例CRC患者和343名健康对照细胞色素P450氧化酶CYP1A16235T／C、CYP1A2734C／A、CYP2E1—12596／C和-1019C／T各位点多态性，谷胱甘肽转移酶GSTMu（GSTM1）和GSTTheta（GSTT1）缺陷型，以及N-乙酰基转移酶基因NAT1和NAT2各等位基因型分布频率，分析其对CRC易感性的影响。结果等位基因CYP1A16235C、CYP1A2734A、CYP2E1—1259C、CyP2E1—1019T、GSTM1缺陷型、GSTT1缺陷型、NAT1＊10和NAT2Mx（x=1，2，3）的分布频率在病例组依次为31．65％、63．77％、23．02％、32．61％、57．25％、17．39％、26．45％和39．21％，对照组依次为39．85％、66．62％、20．27％、28．61％、55．46％、20．35％、25．22％和39．36％，所有基因型分布均符合Hardy—Weinberg平衡定律。单基因、多基因联合分层分析表明，CYP1A16235CC突变纯合型可显著降低CRC风险（OR=0．79，95％CI=0．63～0．99）；在携带CYP1A2734A等位基因个体，CYP1A16235C等位基因也可显著降低CRC风险（OR=0．53．95％CI：0．34～0．83）；在GSTT1缺陷型个体，GSTM1缺陷型可使机体罹患CRC的风险显著升高（OR=4．41，95％CI=1．21～16．10）。结论CYP1A16235C等位基因、GSTM1和T1缺陷基因型可影响机体对CRC的遗传易感性，前者是CRC的保护因素，后两者可使机体罹患CRC的风险增高。     

复发性口腔溃疡五羟色胺转运体启动子基因多态性

目的：探讨5-羟色胺转运体（Serotonin Transporter，5-HTT）启动子区域基因多态性和复发性口腔溃疡之间是否存在关联性。方法：运用聚合酶链反应技术检测102例复发性口腔溃疡患者和96例健康对照组的5-HTT启动子区多态性的：分布频率。结果：比较发现，患者组和对照组5-羟色胺转运蛋白启动子区的S／S基因型频率分别为37．3％（38／102）和20．8％（20／96）．差异有显著性（χ^2=6．2434，P=0．044）；S等位基因频率分别为54．9％（56／102）和41．7％（40／96），差异无显著性（χ^2=3．383，P=0．0659）。结论：复发性口腔溃疡患者比正常人有较高频率的S／S基因型，5-羟色胺转运蛋白启动子区的S／S纯合子基因型可能是复发性口腔溃疡的易感基因之一。     

冠心病患者对氧磷酶启动子基因-909C/G多态性分析

目的探讨中国人对氧磷酶（PONI）启动子基因-909C／G遗传多态性与冠心病（CHD）及其血脂水平的关系。方法应用多聚酶链反应（PCR）对86例冠心病患者和128例正常对照者PONI基因酶切位点的限制性片段长度多态性（RFLP）进行分析。结果PONI启动子基因-909C／G位点存在多态性，出现3种基因型：CC、CG、GG。CHD组CC、CG、GG基因型频率及C、G等位基因频率分别为0．233、0．558、0．209和0．512、0．488，在健康对照组分别为0．258、0．523、0．219和0．520、0．480，两组间基因型频率和等位基因频率差异无统计学意义（P〉0．05）；正常对照组与CHD组间各基因型亚组血浆血脂水平差异亦无统计学意义（P〉0．05）。结论PONI基因启动子-909C／G多态性与中国人CHD无关联。     

肿瘤坏死因子-α基因多态性与安徽地区汉族人群Graves病的相关陛研究

摘要：目的探讨肿瘤坏死因子-α（TNF-α）基因-863、-857、-238三个位点多态性与安徽地区汉族人Graves病（CO）发病易感性的关系。方法采用聚合酶链反应-序列特异性引物（PCR—SSP）方法，检测和比较254例GD患者和212例正常对照者的TNF-α-863、-857、-238位点基因型和等位基因的频率。结果TNF-α-863位点A等位基因GD组频率（16．73％）高于正常对照组（11．79％），P〈O．05，OR=1．503；AA＋CA基因型频率GD组（32．68％）明显高于正常对照组（23．58％），P〈0．05，OR=I．573。TNF-α．-857、-238两位点基因型及等位基因频率在两组间比较差异无显著性。将GD组按性别分层后比较，-863、-857、-238三个位点的基因型及等位基因频率在不同性别间差异均无显著性。结论TNF-α-863位点基因多态性与安徽地区汉族人GD发病有相关性，而-857、-238位点基因多态性与安徽地区汉族人GD发病无明显相关性。     

瘦素受体Gln223Arg基因多态性与肥胖关系的研究

目的 研究瘦素受体Gln223Arg基因多态性与肥胖的关系。方法 2004年在山西省盂县选取一组人群，凋查其心血管病危险因素，同时抽血检测瘦素受体Gln223Arg基因多态性的基因型，并分析Gln223Arg基因多态性与肥胖的关系。结果 该组人群GG、GA及AA的基因型频率分别为0．7679、0．2171和0．0151；G和A等位基因频率分别为0．8764和0．1236。基因型频率分布符合Hardy-Weinberg平衡（P=0．934）。单因素分析结果表明携带A等位基因的研究对象具有更高的体重（63．2kg vs．61．9kg；P=0．0307）和体重指数（24．4kg／m^2 vs．24．1kg／m^2；P=00898）；在调整年龄、性别、体力活动和膳食之后，携带A等位基因者仍然具有较高的体重指数（24．5kg／m^2 vs．24．1kg/m^2；P=0．0396）和肥胖患病率（OR=1．30，95％CI：0．957～1．767；P=0．0935）。结论 瘦素受体Gln223Arg基因多态性与肥胖可能有关。     

心肌梗死患者细胞间黏附分子-1基因多态性研究

目的探讨汉族人群中细胞间黏附分子-1（ICAM-1）第4外显子＋12959G／A、第6外显子＋13848A／G基因多态性与心肌梗死（心梗）的相关性。方法提取165例心梗患者（包括急性心梗和陈旧性心梗）和199名健康对照者的DNA，采用序列特异性引物扩增法和聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术检测ICAM-1＋12959G／A、＋13848A／G基因多态性，同时测定血脂及血清超敏C-反应蛋白（hsCRP，采用定量酶联免疫吸附试验技术）水平。结果湖北地区汉族人群中存在＋13848A／G多态性，在心梗组中基因型分布为：AA型58．2％、AG型37．0％、GG型4．8％；对照组分别为45．7％、45．2％、9．0％，两组比较差异有统计学意义（P〈0．05）；基因型频率的相对风险分析发现，AA型患心梗的风险是GG型及AG型的1．651倍（OR=1．651，95％CI：1．089～2．504）。未检出＋12959G／A多态性。结论ICAM-1＋13848A／G基因多态性与湖北地区心梗易感性有关，＋13848A等位基因可能是心梗发病的重要易感基因。     

Mitochondrial DNA sequences of 37 collar-spined echinostomes (Digenea: Echinostomatidae) in Thailand and Lao PDR reveals presence of two species: Echinostoma revolutum and E. miyagawai

The “37 collar-spined” or “revolutum” group of echinostomes is recognized as a species complex. The identification of members of this complex by morphological taxonomic characters is difficult and confusing, and hence, molecular analyses are a useful alternative method for molecular systematic studies. The current study examined the genetic diversity of those 37 collar-spined echinostomes which are recognized morphologically as Echinostoma revolutum in Thailand and Lao PDR using the cytochrome c oxidase subunit 1 (CO1) and the NADH dehydrogenase subunit 1 (ND1) sequences. On the basis of molecular investigations, at least two species of 37 collar-spined echinostomes exist in Southeast Asia, namely E. revolutum and Echinostoma miyagawai. The specimens examined in this study, coming from ducks in Thailand and Lao PDR, were compared to isolates from America, Europe and Australia for which DNA sequences are available in public databases. Haplotype analysis detected 6 and 26 haplotypes when comparing the CO1 sequences of E. revolutum and E. miyagawai, respectively, from different geographical isolates from Thailand and Lao PDR. The phylogenetic trees, ND1 haplotype network and genetic differentiation (ɸ_ST) analyses showed that E. revolutum were genetically different on a continental scale, i.e. Eurasian and American lineages.     

结核杆菌Ag85B-DNA与H37Ra序贯免疫小鼠后细胞免疫的探讨

[目的]探讨用结核分枝杆菌Ag85B—DNA（pTB30m）和结核菌H37Ra序贯免疫小鼠后产生的特异性细胞免疫。[方法]用碱裂解法制备Ag85B成熟蛋白的真核表达质粒（pTB30m），初次免疫小鼠2周后，用H37Ra皮内加强免疫（DNA-85B／H37Ra组），同时设定Ag85B—DNA／BCG组、H37Ra组、BCG组及未免疫组。加强免疫4w和8w后，检测小鼠脾淋巴细胞被PPD刺激指数（SI）及其IFN-γ、IL-2的表达水平。[结果]（1）酶切鉴定pTB30m所含外源基因片段大小正确，纯度较高。（2）DNA-85B／H37Ra组小鼠脾淋巴细胞的SI均显著高于H37Ra组、BCG组和DNA-85B／BCG（P〈0．05）；（3）所有免疫组IFN-γ及IL-2表达与未免疫组比较，差异有统计学意义（P〈0．05），DNA-85B／H37Ra组与DNA-85B／BCG组均高于H37Ra组和BCG组（P〈0．05），DNA-85B／H37Ra略高于DNA-85B／H37Ra,但差异无统计学意义（P〉O．05）。[结论]DNA-85B／H37Ra序贯免疫效果略优于DNA-85B／BCG组，明显优于H37Ra组BCG组。     

HFRS病毒Z37株在绿猴肾传代细胞的病变作用和传代适应

[目的]研究肾综合征出血热（HFRS）病毒39疫苗株在绿猴肾传代细胞（vero,vero-E6)上的病变和传代适应增殖情况,为应用vero细胞研制出血热疫苗提供科学依据。[方法]将肾综合征出血热疫苗株Z37适应在绿猴肾传代细胞（vero,vero-E6)上,对细胞进行细胞病变（CPE）的动态观察,并于不同的时间取样,测定病毒滴度,比较静置培养、转瓶培养滴度的差异情况。[结果]Z37株不使vero-E6细胞产生病变,用HEPES诱导,3d可见明显病变现象。Z37株不使vero细胞产生病变,用HEPES诱导病变现象未获成功,Z37株在vero细胞中可高滴度繁殖,滴度达到10^7/ml,转瓶培养病毒滴度略高于静置培养。[结论]应用vero细胞研制HFRS疫苗是可行的。     

HLA-DRB1基因多态性与陕西汉族妇女患中重度EM风险的相关性

目的 探讨HLA-DRB1基因多态性在陕西汉族中重度子宫内膜异位症(EM)人群中的分布及其与EM发病风险的关联性.方法 采用聚合酶链反应-直接测序技术(PCR-SBT),检测50例中重度EM患者和52例正常对照人群中HLA-DRB1的基因多态性分型,分析其基因型分布及其与中重度EM发病风险的相关性.结果 HLA-DRB1基因在EM组和对照组人群中均呈高度多态性分布;EM组人群中检测到22种HLA-DRB1基因型,其中基因型频率大于5%分别为HLA-DRB1*07:01(18%),DRB1*15:01(12%),DRB1*09:01(11%),DRB1*12:01(7%),DRB1*12:02(7%),DRB1*14:54(6%),DRB1*15:02(6%)和DRB1*14:05(5%).在对照组中人群中检测到24种HLA-DRB1基因型,其中基因型频率大于5%分别为HLA-DRB1*15:01(16.3%),DRB1*07:01(14.4%),DRB1*12:02(8.7%),DRB1*12:01(8.7%),DRB1*09:01(6.7%)和DRB1*04:05(5.8%).HLA-DRB1各基因型在EM组与对照组中的分布未见明显统计学差异.结论 HLA-DRB1基因多态性与陕西汉族中重度EM发病风险无明显关联.     

SVM-Based Generalized Multifactor Dimensionality Reduction Approaches for Detecting Gene-Gene Interactions in Family Studies

Gene-gene interaction plays an important role in the etiology of complex diseases, which may exist without a genetic main effect. Most current statistical approaches, however, focus on assessing an interaction effect in the presence of the gene's main effects. It would be very helpful to develop methods that can detect not only the gene's main effects but also gene-gene interaction effects regardless of the existence of the gene's main effects while adjusting for confounding factors. In addition, when a disease variant is rare or when the sample size is quite limited, the statistical asymptotic properties are not applicable; therefore, approaches based on a reasonable and applicable computational framework would be practical and frequently applied. In this study, we have developed an extended support vector machine (SVM) method and an SVM-based pedigree-based generalized multifactor dimensionality reduction (PGMDR) method to study interactions in the presence or absence of main effects of genes with an adjustment for covariates using limited samples of families. A new test statistic is proposed for classifying the affected and the unaffected in the SVM-based PGMDR approach to improve performance in detecting gene-gene interactions. Simulation studies under various scenarios have been performed to compare the performances of the proposed and the original methods. The proposed and original approaches have been applied to a real data example for illustration and comparison. Both the simulation and real data studies show that the proposed SVM and SVM-based PGMDR methods have great prediction accuracies, consistencies, and power in detecting gene-gene interactions.     

糖负荷对小鼠腹内侧核PGC-1α表达的影响

目的探讨小鼠糖负荷后血糖的变化与下丘脑腹内侧核神经元表达PGC-1α变化之间的关系。方法昆明小鼠禁食禁水过夜后,随机分为空腹对照组、灌胃50%葡萄糖(2 g/kg)30、60、120和180 min组。分别于观察时间点尾静脉血糖测试结果,并利用免疫组织化学方法半定量观察小鼠下丘脑腹内侧核PGC-1α阳性细胞的变化。结果糖负荷结果:与空腹对照组相比,糖负荷后血糖开始升高,30 min组血糖水平最高,之后开始下降,180 min组降至糖负荷前水平。分别为7.25±2.84(对照组)、16.22±3.51(30 min组)、14.08±4.14(60 min组)、12.07±1.85(120 min组)、10.12±1.31 mmol/L(180 min组)。免疫组化结果:与空腹对照组相比,糖负荷后各组腹内侧核PGC-1α阳性神经细胞数量均显著性降低(P0.05);糖负荷120 min组最低,之后开始恢复。相关性分析显示血糖水平与下丘脑腹内侧核PGC-1α阳性神经细胞数变化之间有显著的相关性(r=0.983)。结论在小鼠糖负荷实验过程中,血糖升高与下丘脑腹内侧核神经元PGC-1表达下调之间显著相关,提示下丘脑PGC-1表达可能是维持血糖稳定的环节之一。     

具有细胞毒素相关蛋白和细胞空泡毒素的幽门螺杆菌与消化性溃疡的相关性研究

目的探讨能产生细胞毒素相关蛋白（ＣａｇＡ）与细胞空泡毒素（ＶａｃＡ）的幽门螺杆菌（ＨＰ）与消化性溃疡的关系。方法用免疫印迹法检测分析经尿素酶及组织学Ｇｉｅｍｓａ染色证实ＨＰ阳性的血清标本共１１２份，其中慢性胃炎６５份，消化性溃疡４７份。观察两种疾病中ＣａｇＡ与ＶａｃＡ阳性的ＨＰ检测结果。结果慢性胃炎组、消化性溃疡组的ＣａｇＡ与ＶａｃＡ阳性的ＨＰ感染率分别为３３．８５％和５９．５７％，差异有显著性（Ｐ＜０．０１）。结论具有ＣａｇＡ与ＶａｃＡ的ＨＰ菌株与消化性溃疡发病密切相关     

耐甲氧西林金黄色葡萄球菌耐药基因及耐消毒剂基因的研究

目的对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)进行细菌耐药性分析及耐药基因和耐消毒剂基因的试验研究。方法对临床分离47株MRSA进行菌株鉴定、药敏试验和β-内酰胺类耐药相关基因(mecA),氨基糖苷类耐药相关基因[aac(6′)/aph(2″)、aph(3′)-Ⅲ、ant(4′,4″)],耐消毒剂基因[qac(A/B)]等主要耐药基因和耐消毒剂基因的检测。结果47株MRSA对抗菌药物氨苄西林/舒巴坦、头孢西丁、红霉素、苯唑西林、青霉素均耐药,其他抗菌药物耐药率分别为克林霉素(87.0%)、庆大霉素(91.3%)、利福平(28.3%)、四环素(76.1%)、复方新诺明(65.2%)、左氧氟沙星(71.7%)、呋喃妥因(0.0)、万古霉素(0.0);47株MRSA共检出mecA基因46株,aac(6′)/aph(2″)基因39株,aph(3′)-Ⅲ基因30株,ant(4′,4″)基因6株,qac(A/B)基因19株。结论MRSA为多重耐药菌,对氨基糖苷类耐药和耐消毒剂分别与携带氨基糖苷类耐药基因和耐消毒剂基因有关,临床医生应重视MRSA的诊断与治疗,加强MRSA的医院感染控制。     

G, N, and P gene-based analysis of Chandipura viruses, India

An encephalitis outbreak in 2003 in children from India was attributed to Chandipura virus. Sequence analyses of G, N, and P genes showed 95.6%-97.6% nucleotide identity with the 1965 isolate (G gene, 7-11 amino acid changes); N and P genes were highly conserved.