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DNA指纹实验得到的原始数据是各DNA片段在凝胶上的迁移距离 ,而我们通常感兴趣的则是各DNA片段的长度 ,因此需要通过迁移距离来计算其片段长度。由于DNA片段越长 ,在凝胶上的迁移距离越短 ,将一组已知长度的标记 (marker)在一块凝胶上电泳就为这块凝胶提供了校正的手段。如果将长度标记简单地用于鉴别与之迁移同样距离的其他片段 ,则几乎不存在什么问题。但如要估计与之迁移距离不同的其他片段的长度 ,则需要采用一些其他的计算方法。一、材料与方法本实验采用片段长度已知的标记λ DNA/ECoRⅠ HindⅢ作为实… 相似文献
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本文概述了PCR-RFLP、IS6110-PCR、DRE-PCR和Spoligotyping等以PCR为基础的分枝杆菌染色体DNA指纹图谱技术,介绍它们的基本原理和特点以及在分枝杆菌鉴定中的应用,提出了改进的方向。 相似文献
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1 概述
冬虫夏草[Cordyceps sinensis(Berk)Sacc]具有很高的药用价值,是珍贵的中药材.它是由虫草属(Cordyceps)真菌寄生在鳞翅目(Lepidoptera)昆虫蝙蝠蛾科(Hepialidae)幼虫体上而形成的一种虫生真菌,它与人参、鹿茸齐名并誉为中国的三大补药.冬虫夏草主要产于我国青海、云南、四川、西藏等省海拔3000~5000 m的高原地区,其僵虫部分名"虫",头部生长的子座为"草". 相似文献
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郭晏海 《国外医学(流行病学.传染病学分册)》2001,28(1):31-34
本文概述了PCR-RFLP、IS6110-PCR、DRE-PCR和Spoligotyping等以PCR为基础的分枝杆菌染色体DNA指纹图谱技术,介绍它们的基本原理和特点以及在分枝杆菌鉴定中的应用,提出了改进的方向。 相似文献
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河南省结核分枝杆菌IS6110DNA指纹图谱特征分析 总被引:1,自引:0,他引:1
目的:从分子流行病学角度探讨河南省结核分支杆菌的分布特征。方法:样本的获得采用全省范围等比例分层整群随机抽样;构建以IS6110 RFLPDNA指纹方法和以DR为基础的Spoligotyping DNA指纹方法;采用Gel compare4.1软件对DNA指纹图谱进行聚类(cluster)分析。结果:共获得66株可进行IS6110 RFLP DNA指纹分析的结核分支杆菌;其中59.09%(39/66)用Spoligotyping DNA指纹方法鉴定为“北京基因型”菌株。结论:北京基因型结核分支杆菌在河南省呈较高水平的流行。 相似文献
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随机扩增多态DNA指纹技术的研究及在检测医院感染中的应用 总被引:2,自引:3,他引:2
目的 探讨医院感染常见病原菌的基因鉴定及分型方法,了解其分子流行病学情况。方法 优化随机扩增多态DNA指纹技术(RAPD)的实验条件,利用RAPD技术成功地检测了儿科病房呼吸道合肥病毒(RSV)、脑外科病房铜绿单胞菌(PA)及血液病房白色念珠菌(CA)的医院感染。同时进行了RSV分离、PA菌和CA菌培养。结果 构建了金黄色葡萄球菌(SA)、志贺菌(SB)、大肠埃希菌(EC)、肠炎沙门菌(Salm( 相似文献
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北京、广东、宁夏三地结核分支杆菌DNA指纹的应用研究 总被引:12,自引:1,他引:12
目的 分析“北京家族”结核分支杆菌,从分子流行病学角度探讨北京、广东及宁夏三地结核分支杆菌的分布特征。方法 采用Gel compare4.1软件对来自三地的206株结核分支杆菌的插入序列IS6110 DNA指纹图谱进行数字化,经互联网与世界结核分支杆菌DNA指纹库进行相似性比较;同时应用该软件对上述菌株行聚类分析;构建标准的结核分支杆菌Spoligotyping(间隔区寡核苷酸分型法)DNA指纹方法;用χ^2检验比较不同组别肺结核病人临床分离菌株成簇率的差别,同时计算相对危险度(OR)。结果 206株结核分支杆菌的IS6110 DNA指纹图谱与DNA指纹图谱库相比较,未发现相同者。56.8%(117/206)的结核分支杆菌IS6110 DNA指纹相似值在1.00—0.65之间,且它们的Spo1igotyping指纹图谱均与“北京家族”结核分支杆菌相一致;分组统计显示:男性组与女性组、年龄≥42岁组与<42岁组成簇率之间差异有显著性(P<0.05),OR值为男性4.43,95%CI:0.94—28.76;<42岁为5.06,95%CI:1.00—34.34。其他各组之间差异无显著统计学意义(P>0.05)。结论 “北京家族”结核分支杆菌在三地呈较高水平的流行;结核分支杆菌在男性和<42岁人群中的传播频率较女性和≥42岁人群为高,且男性和<42岁可能是三地结核病近期传播的危险因素。利用结核分支杆菌的DNA指纹图谱和互联网技术,可以实现结核分支杆菌传染源全球范围的追踪。 相似文献
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目的:分析南方部队结核病患者和当地患者中结核分支杆菌分离株DNA指纹特征,探讨南方部队结核病的分子流行病学特征。方法:用限制性内切酶PvuⅡ消化结核分支杆菌DNA,后用琼脂糖凝胶电泳,再用Southern免疫转印,用[α^32P]-dCTP标记的DNA IS6110序列中的245bp片段作探针,进行杂交后得到限制性片段长度多态性图谱,结合一般流行病学资料加以分析比较。结果:共检测185株结核分支杆菌分离株。检测菌株的IS6110拷贝数范围为1~22。部队患者和当地患者的IS6110拷贝数分布差异无显著姓。部队患者结核菌分离株的IS6110拷贝数主要集中在6~20个,当地分离株主要集中在7~20个;全部菌株指纹特征分成8个组,部队分离株和当地分离株均主要集中在Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ 3个组里。耐药菌株指纹特征在各组中的分布与敏感菌株差异有显著性;患者是否接种卡介苗在各组中的分布差异无显著性。结论:南方部队患者与当地患者结核菌分离株在遗传关系上较接近,在基因水平上相关程度较强。提示部队结核病的发生与当地结核分支杆菌菌株的传播密切相关。 相似文献