肉苁蓉种质资源多样性的AFLP分析

目的分析栽培与野生肉苁蓉Cistanche deserticola种质资源多样性。方法对58个种植基地和野生肉苁蓉单株进行AFLP分析,利用PopGene32软件分析群体的遗传多样性。结果栽培肉苁蓉多态位点百分率79.16%,野生居群总计多态位点百分率89.53%,4个居群平均Nei's基因多样性指数为0.1938,Shannon's多态性信息指数为0.3004,基因分化系数Gst为0.0979。结论栽培与野生肉苁蓉遗传多样性均较高,遗传分化很小。说明现阶段该物种的种内丰度较高,其濒危原因不在于此。因此,野生抚育和人工栽培是保护肉苁蓉资源并实现可持续利用的根本方向。     

人参农家类型遗传多样性的ISSR分析

目的探讨人参农家类型的遗传多样性和亲缘关系,为人参的栽培和选育种提供遗传学依据。方法采用ISSR分子标记分析5种人参农家类型7个居群120个样本的遗传多样性。结果人参农家类型有较丰富的遗传多样性,平均多态位点百分率为48.85%;不同农家类型的遗传多样性水平有差异,和其他农家类型相比,长脖和竹节芦的遗传变异较小,且两者之间的相似性系数高达97%;不同产地的同一人参农家类型间也存在很大的遗传差异。结论研究表明人参农家类型的遗传差异主要存在于各类型内部,而且可能更多地存在于同一类型的不同居群内部。为促进人参新品种的选育,有必要在现有的栽培群体中补充不同产地的同一类型的种质资源。     

野生和栽培茅苍术RAPD分析

目的 获取野生与栽培茅苍术差异遗传信息.方法 运用RAPD分子标记方法,从DNA水平上分析野生与栽培茅苍术的遗传变异.结果 筛选了60个随机引物,从中选取18个多态性强、重复性好的引物进行扩增,共检测到228个位点,110个多态性位点,多态位点比率为48.25％;野生与栽培茅苍术的遗传距离为0.32.结论 野生和栽培茅苍术基因组DNA存在显著差异,研究工作为茅苍术优良种质资源鉴定和可持续利用提供科学依据.     

明党参栽培过程中遗传变异的RAPD分析

目的：从DNA水平上分析野生型明党参和栽培得到的明党参植株之间的遗传变异。方法：通过RAPD分子标记方法,筛选了80个随机引物,其中有52条随机引物能够扩增出条带,从中选取7个多态性强、重复性好的引物进行扩增。结果：实验共检测到31个位点,13个多态性位点,多态位点比率为41.9%,平均每个引物扩增4~5个条带,多态性条带2个。聚类分析显示野生明党参和栽培明党参之间遗传间距达0.277。结论：研究结果表明RAPD分子标记方法可以鉴定野生和栽培明党参,结果也表明明党参在栽培过程中出现了较强的遗传变异。     

不同产地野生玉竹种质资源多样性与亲缘关系的ISSR分析

目的 研究中国不同居群野生玉竹种质资源的遗传多样性。方法 选取我国11个不同居群的野生玉竹样品和1个居群的栽培样品进行ISSR分析,Popgene 32及Ntsyspc-2.1软件分析处理数据。结果 通过筛选得到10条ISSR引物,扩增得到115条带,其中108条为多态性条带,多态性条带百分率为93.38%;Nei’s基因多样性（H）为0.432 1±0.084 1,Shannon信息指数（I）为0.619 7±0.100 5,遗传距离（GD）变异为0.128 9～0.496 5;利用UPGMA法构建分子树状图,可将12个居群聚合为两大类。结论 不同产地野生玉竹种间存在较高的多态性,遗传多样性较为丰富;野生玉竹的遗传多样性高于栽培居群的遗传多样性,可能与栽培方式和环境因素有关;药用植物玉竹对环境变化的适应能力强,地理来源相同的野生居群和栽培居群先行聚合,与其种质间的亲缘关系较近有关;聚类结果可以部分反映地理分布的特点,为种质资源的鉴定打下良好基础。     

巴戟天遗传多样性的RAPD研究

目的应用随机扩增多态性DNA(random amplified polymorphic DNA,RAPD)标记技术对广东产5个类群的栽培巴戟天进行遗传多样性研究。方法应用15种引物对64个个体进行检测,应用Popgen32软件分析群体的遗传多样性。结果共得到224条带,其中多态位点112个,多态百分率为50.00%。种群内多态位点百分率在37.05%～53.13%,平均为45.86%。Shannon指数和Nei指数均反映出巴戟天各类群遗传多样性有一定的变化。Shannon指数为0.287 6,各类群的Shannon指数在0.103 3～0.236 2,Nei指数为0.175 6,各类群的Nei指数在0.074 5～0.154 0。结论目前栽培巴戟天居群间有一定的分化,并产生了多种农家类型,其中小叶巴戟天(POP2)遗传多样性明显高于其他类型,这些可能是导致目前栽培巴戟天质量产生变异的主要原因。     

浙南海域野生坛紫菜遗传多样性的ISSR分析

目的:研究浙南海域野生坛紫菜的遗传多样性.方法:采用简单序列重复区间扩增多态性(ISSR)分子标记技术,分析采自浙江南部海域的苍南铁钉岛、洞头竹屿岛、南麂列岛、温岭斜头岛等地坛紫菜(Porphyra hai tanesis)的4个野生种群.结果:6条ISSR引物共获得268个位点,257个多态位点,4个种群野生坛紫菜多态位点百分率(PPL)为95,90％,等位基因数(Na)为1.8081,有效等位基因数(Ne)为1.5326,Nei's基因多样性(H)为0.1618,Shannon's指数(I)为0.3509,均高于个体水平;种群内和种群间Nei's基因多样性计算遗传分化水平(Gst)为0.2832,种群间的基因交流为Nm=2.3591,表明野生坛紫菜种群间存在着较高的遗传多样性,遗传变异中有28.32％发生于群体间.108株坛紫菜的聚类分析结果同样也表明坛紫菜种群间的遗传分化水平较低,遗传变异主要存在于种群的个体间.结论:浙南海域野生坛紫菜种群间遗传差异较大,遗传多样性水平较高,个体间的遗传差异较小.表明目前浙南野生坛紫菜的种质资源较好.     

栀子遗传多样性及遗传分化的RAPD分析

目的 应用随机扩增多态性DNA(random amplifed polymorphic DNA,RAPD)标记技术对栀子8个种群遗传多样性和遗传分化进行研究.方法 18种随机引物对92个个体进行检测,应用POPGENE软件和AMOVA软件对结果进行处理.结果 共得到120个可重复的位点,其中多态位点75个,多态百分率为62.5%.各种群内多态位点百分率在39.17%～68.83%之间,平均为56.98%.河南南阳(POP1)种群最高,其次是江西新干县野生种群(POP7),最低是江西抚州水栀子种群(POP3).Shannon指数和Nei指数均反映出栀子各种群具有较高的遗传多样性.Shannon指数为0.431 3,各种群Shannon指数在0.2256～0.380 6之间,Nei指数为0.289 2,各种群Nei指数在0.148 2～0.263 0之间.AMOVA揭示种群内遗传多样性占总遗传多样性的76.05%,而种群间遗传多样性只占23.95%.运用POPGENE也得出种群内遗传变异(69.34%)大于种群间(30.66%)的结论.种群间的遗传分化系数为0.306 6.栀子种群间的基因流为1.130 6,遗传相似度平均为0.129 09,遗传距离平均为0.880 72.根据遗传距离聚类分析,河南南阳种群(POP1)与江西樟树新干种群(POP4,POP5,POP6,POP7)聚为一类,湖南种群(POP8)与江西抚州栀子种群(POP2)聚为一类,江西抚州水栀子种群(POP3)与其他各种群间的遗传关系较远.结论 目前,虽然野生资源逐年减少以及多年栽培中的品种选育,栀子遗传多样性仍较丰富,且种群内大于种群间,种群间存在较少的遗传分化.     

基于简单重复序列间扩增分子标记的金钗石斛遗传多样性研究

[目的]对不同产地金钗石斛进行遗传多样性分析为金钗石斛的种质资源保护及新品种选育提供参考。[方法]利用简单重复序列间扩增(inter simple sequence repeat,ISSR)分子标记技术对金钗石斛7个地区21个居群的152个样本进行分析,利用POPGENE1.32软件进行遗传多样性指数分析用NTSYSpc 2.10e软件构建居群间非加权配对算术平均法(unweighted pair group with arithmetic average,UPGMA)聚类图。[结果]筛选出不同产地金钗石斛10条ISSR引物,共扩增出多态性条带292条多态性百分率为100%。在物种水平,等位基因数是2.0000,有效等位基因数是1.3 863期望杂合度是0.2398,香农信息指数为0.3783;在居群水平多态百分率为9.93%～47.95%期望杂合度为0.0411～0.1674,香农信息指数为0.0601-0.2519。遗传结构分析表明,21个居群遗传一致性为0.7149～0.9527,平均为0.8506,居群间的遗传变异(57.79%)略高于居群内(42.21%)。在物种水平上,金钗石斛较小的基因流(0.1826)导致了居群的分化。遗传距离聚类分析表明,金钗石斛的遗传距离与地理分布有一定的相关性。[结论]金钗石斛具有丰富的遗传多样性,栽培居群与野生居群的遗传多样性均较高表明金钗石斛在栽培过程中遗传多样性基本上没有丧失,居群间的遗传变异略高于居群内,说明金钗石斛居群在地区间有遗传分化的趋势。云南居群具有较高的遗传多样性建议在该地区进行大面积的人工栽培,以栽培品替代野生品作药用,缓解资源紧缺的状况。     

不同居群美花石斛种质资源的RAPD分析

目的分析不同居群美花石斛种质资源的遗传多样性、濒危现状以及亲缘关系。方法利用RAPD分子标记技术和方法对不同居群美花石斛进行检测;通过计算遗传相似系数建立其聚类分析图。结果从117个随机引物中,共筛选出8个有效引物,对8个美花石斛居群进行RAPD-PCR扩增,共扩增出287个条带,平均每个引物的扩增条带为35.88个;287个条带共占据78个位点,其中11个位点是8个居群的共有位点,67个为多态位点,多态性比率达85.95%;8个居群的相似性系数在0.149~0.517。结论美花石斛遗传多样性水平低于铁皮石斛种内遗传多样性水平;美花石斛的濒危原因与人为过度采收、种子自然萌发力弱和遗传多样性水平较低有一定的关系;美花石斛8个居群比较自然地向3个方向演化发展,并形成3个分支;美花石斛系统演化规律与其地理分布的相关性有待于进一步研究。     

云南铁线莲属12种药用植物的RAPD分析

目的:通过对12种铁线莲属药用植物进行遗传多样性和亲缘关系分析,为生药鉴定提供依据.方法:随机扩增多态性DNA(RAPD)技术分析遗传多样性,UPGMA类平均法进行聚类分析.结果:利用筛选出的10个随机引物对供试材料DNA进行随机扩增,共得到89条带,其中多态性带有89条,多态性百分率为100%.采用UPGM聚类法对扩增出的谱带进行遗传聚类分析,得出反映各种间亲缘关系的树状图.对多数种而言,种间差异明显,同种不同分布点也存在差异,但同一分布点的不同个体差异较小.结论:该标记技术对铁线莲属植物的生药鉴定是可行的,在系统学方面的应用有待进一步研究.     

主产区远志种质资源遗传多样性的ISSR分析

目的 对主产区远志种质资源进行遗传多样性研究。方法 利用ISSR分子标记分析来自于主产区陕西、山西和河北3个省的10个居群的远志种质资源的遗传多样性。结果 12条ISSR引物扩增出276条带,其中有271条为多态性条带,聚类分析结果表明,地理来源相同的野生居群和栽培居群先行聚合。野生和栽培远志居群的遗传变异主要发生在居群间,栽培居群的遗传多样性略低于野生居群,二者均不符合距离隔离模型。结论 聚类分析结果与栽培居群多为就地取材的事实相符。造成远志这种遗传变异型式的原因在于其本身的繁殖生物学特性以及当前的粗放栽培模式。     

川产羌活种质遗传多样性的RAPD分析

目的考察羌活Notopterygium incisum的遗传特征,探讨不同产地且有形态变异的羌活种质资源的遗传多样性、遗传分化及与环境因子的相关性。方法用RAPD方法选择15个随机引物对四川西部4个居群33株个体叶片DNA进行扩增,从个体间遗传关系及居群间遗传分化方面对羌活的遗传结构进行分析。结果RAPD共检测到185条谱带,其中128个位点为多态位点,多态性百分率为69.19%,Nei's基因多样性为0.2237,Shannon's信息指数为0.3375;壤塘和九龙居群聚为一类,理县和泸定居群聚为一类;茎秆颜色花纹性状与遗传差异间未表现明显相关性,不同性状的羌活个体仍主要按居群,即产地来源聚类;羌活居群内和居群间的变异分别占总变异的74.67%和25.33%;羌活居群间的遗传距离与地理距离间没有明显相关性(r=-0.1105,P=0.5855);羌活4个居群遗传多样性大小与年均温负相关,未达到显著水平(r=-0.771,P=0.229);与年均降雨量正相关,但相关不显著(r=0.291,P=0.709)。结论本研究表明羌活遗传多样性水平较高;羌活的遗传变异主要分布在居群内,但居群间已形成一定的遗传分化;壤塘和九龙羌活个体间的遗传距离较小,各自遗传背景较为相似。产地差异对遗传变异的影响大于因其茎秆颜色花纹不同所造成的影响。     

Natural fertility in northeastern Mexico: genetic structure by year of birth and birthplace

BACKGROUND: The aims of this population genetics study were 1) to ascertain whether 417 Mexican women with natural fertility (45 years of age, married, not using any family planning methods, residing in the state of Nuevo León) were genetically homogeneous, and 2) to compare the genetic structure of this selected population with the previously reported data of random populations of northeastern Mexico. METHODS: A sample of 417 women was interviewed and selected in seven medical units of the Mexican Social Security Institute. They were grouped by their year of birth (1896-1925 and 1926-1955) and birthplace [persons whose four grandparents were born in the northeastern states (NE) and outside the northeastern states (Not-NE) of Mexico]. Eight genetic marker systems were analyzed. RESULTS: Gene diversity analysis suggests that more than 99.1% of the total gene diversity can be attributed to variation between individuals within the population. Genetic admixture analysis suggests that this selected population, stratified by year of birth and birthplace, have received a predominantly Spanish contribution followed by a lesser Mexican Indian contribution. CONCLUSIONS: The genetic structure of this selected population was homogeneous and similar to the random populations of northeastern Mexico. This finding corroborates the utility of this selected population for genetic and epidemiological studies.     

利用RAPD分析13种石斛属植物的遗传多样性和亲缘关系

目的通过对13种石斛属植物进行遗传多样性和亲缘关系分析,为更好地开发利用石斛资源奠定基础。方法随机扩增多态性DNA(RAPD)技术分析遗传多样性,U PGM A类平均法进行聚类分析。结果利用筛选出的10个随机引物对供试材料DNA进行随机扩增,共得到188条带,其中多态性带有180条,多态性百分率为95.74%。采用U PGM A类平均法对扩增出的谱带进行遗传聚类分析,得出反映各种间亲缘关系的树状图。在遗传距离(D)=0.63处,可将供试材料分为3类,RAPD对基因组的分析结果与传统分类学的结果差异不大。结论该标记技术对石斛属植物的遗传多样性和分类研究是可行的。     

不同薯蓣皂苷元的盾叶薯蓣遗传关系的RAPD分析

目的从DNA水平分析鉴定不同薯蓣皂苷元盾叶薯蓣的遗传关系。方法从40个10 bp随机引物中筛选出12个引物,进行RAPD分析,应用POPGENE 1.31软件对扩增结果进行聚类分析。结果共扩增出73条DNA片段,其中多态性片段64条,占87.67%,盾叶薯蓣类型间具有明显的多态性差异。结论DNA分子多样性差异与薯蓣皂苷元量差异具有相关性,说明盾叶薯蓣的遗传基础可能对薯蓣皂苷元的形成和积累有显著的影响。     

丹参主要居群的遗传关系及药材道地性的初步研究

目的 研究丹参主要居群的遗传关系及药材的道地性问题。方法 选择丹参主要产地样本44个（包括9个居群样本），进行RAPD分析，得到的扩增条带用NTSYS－pc和AMOVA软件进行数据处理。结果 （1）从100多个引物中选择出11个多态性强和重复性好的引物，扩增得到129条带；（2）不同居群内多态位点比率为20.9%－55.0%；（3）用UPGMA法得到所有样本的聚类图，可分为6个主要分支组和3个组外个体，其中四川中江居群的5个样本聚为一组，并与其他样本遗传距离较大；（4）按产地分组，遗传差异的80.44%存在于居群内，8.29%来自于组内居群间，11.27%的遗传差异来自于组间。结论 （1）丹参居群内遗传多样性十分丰富；（2）山东和河南的栽培居群栽培种源来自于当地野生居群，尚没有进行人工选择，丹参酮ⅡA等成分的减少的原因主要是栽培条件不理想；（3）地区间居群的遗传分化不均衡，四川中江和河北承德居群与其他居群距离较远；（4）丹参的道地性的确定应当依据现代的优质药材评价系统，山东和河南产的丹参也可主为是丹参的道地药材。     

混合遗传算法在随机规划问题中的应用

以含有机会约束的生产管理动态规划问题为例,基于随机模拟技术的混合遗传算法实现最优化决策,构造了数学模型。采用ＶＢ编辑,计算机模拟结果显示该模型能很好解决生产过程中的最优化决策问题,它是简单的基于二进制编码的遗传算法所不能解决的。该算法具有很高的鲁棒性,避免了在局部最优解附近徘徊,且因为随机规划问题要求许多数学知识,而算法本身并不要求对优化问题的性质作一些深入的数学分析,从而对那些不太熟悉数学理论和     

幽门螺杆菌基因型与慢性胃炎和消化性溃疡的相关性

目的 探讨Hp基因型与慢性胃炎、消化性溃疡的关系。方法 对标准株和临床分离株幽门螺杆菌空泡毒素基因vacA和致病岛基因的cagA、cagE、cagT片段进行PCR扩增，对基因组DNA进行随机扩增多态性分析（RAPD），并以Hela细胞测定全部菌株的VacA毒素活性。SPSS13．0软件聚类分析进行基因分型。结果 全部菌株被分为3个型别，慢性胃炎、消化性溃疡和非胃炎非溃疡分别有自己的优势基因型，且各型之间的总体分布差异具有统计学意义。结论 Hp基因型与疾病类型有关，空泡毒素基因和致病岛基因可作为Hp基因分型的靶基因，RAPD是有效的基因分型手段。