3种耐药结核分枝杆菌检测及临床应用

目的探讨耐链霉素(SM)、利福平(RFP)、异烟肼(INH)结核分枝杆菌rpsL、rpoB、KatG3种基因突变情况及在耐药检测中临床应用的可行性。方法采用聚合酶链反应单链构象多态性(PCR-SSCP)技术对221株临床分离株,100例涂片阳性肺结核病痰标本进行rpsL、rpoB、KatG3种基因突变分析。221株临床分离株中敏感株34株,单耐SM、RFP、INH分别为32株、37株、28株,耐SH、SR、HR、SHR分别为14株、30株、8株、52株,100例痰标本耐SM、RFP、INH分别为51例、54例、40例。结果以结核分枝杆菌H37RV为对照,34株敏感株rpsL、rpoB基因SSCP图谱正常,特异性为100%,KatG基因2株SSCP图谱异常,特异性为94.1%。单耐SM、RFP、INH结核分枝杆菌rpsL、rpoB、KatG基因突变率分别为78.1%(25/32)、86.5%(32/37)、53.6%(15/28),耐多药(SM、RFP、INH)结核分枝杆菌rpsL、rpoB、KatG基因突变率分别为78.1%(75/96)、88.9%(80/90)、55.4%(41/74)。100例涂片阳性肺结核患者痰标本经PCR扩增67例阳性,直接检测耐SM、RFP、INH结核分枝杆菌rpsL、rpoB、KatG基因突变率分别为74.1%(25/35)、89.1%(33/37)、48.0%(12/25),阳性检出率分别为49.0%、61.1%、30.0%。结论耐单药和耐多药(SM、RFP、INH)结核分枝杆菌rpsL、rpoB、KatG基因突变率分别经χ2分析差别无统计学意义(P>0.05),也就是耐单药和耐多药结核分枝杆菌rpsL、rpoB、KatG基因突变率相同,耐多药结核分枝杆菌rpsL、rpoB、KatG3种基因突变相互之间无影响。PCR-SSC技术有望直接用于检测涂片阳性肺结核患者痰标本中rpsL、rpoB、KatG基因突变判定耐药,但还需在方法学上进一步改进以达到技术容易掌握、操作简便、影响因素少,结果检出率高等。     

糖尿病合并肺结核患者耐多药结核分枝杆菌基因突变的检测

目的：探讨耐多药结核分枝杆菌临床分离株rPOB、KatG和rpsL基因突变在糖尿病合并肺结核患者耐药性检测中的应用价值。方法：采用聚合酶链反应-单链构象多态性（PCR-SSCP）技术对41株自糖尿病合并肺结核患者痰液中培养分离的同时耐利福平（RFP）、异烟肼（INH）、链霉素（SM）的多耐药临床分离株和46株对RFP、INH、SM敏感株的rPOB、KatG、rpsL基因突变状况。结果：46株药物敏感株的rPOB、KatG、rpsL基因SSCP图谱正常，特异性为100％。PCR扩增产物SSCP分析结果显示：41株多耐药临床分离株中，36株rPOB基因图谱异常，26株KatG基因图谱异常，29株rpsL基因图谱异常，检测敏感性分别为rPOB（87．8％）、KatG（63．4％），rpsL（70．7％）。结论：结核分枝杆菌对RFP、INH、SM产生耐药性的机制主要是由于rPOB、KatG和rpsL基因突变所致。     

广东地区临床分离结核分枝杆菌KatG、rpoB、rpsL耐药基因变异研究

目的本研究主要针对从广东地区500例疑似结核病患者痰液中分离的结核分枝杆菌对异烟肼(INH)、利福平(RFP)、链霉素(SM)耐药情况与其对应的突变基因katG、rpoB、rpsL 关系研究.方法采用PCR和DNA测序法对结核分枝杆菌临床分离株katG、rpoB 和rpsL 基因进行序列分析.结果分离得到耐INH 35株、耐RFP 27株、耐SM 25株.INH耐药株katG 基因突变率为71.4%(25/35),RFP耐药株rpoB 基因的突变率为81.5%(22/27),SM 耐药株rpsL 基因突变率为76%(19/25);INH以Ser315Thr突变60%(21/35)最常见,RFP以Ser531Leu突变55.6%(15/27)最常见,SM以Lys43Arg位氨基酸突变72%(18/25)常见.结论 katG、rpoB 和rpsL 基因突变被证实是广东地区结核分枝杆菌INH、RFP和SM耐药性产生的主要分子机制,PCR-DNA测序法可快速检测结核分枝杆菌INH、RFP和SM耐药性.     

结核分支杆菌耐药基因的杂交检测

目的采用PCR-反向斑点杂交检测结核分支杆菌中rpoB基因、KatG基因和rpsL基因突变。评价该方法检测结核分支杆菌利福平（RFP）、异烟肼（INH）和链霉素耐药性,探讨直接检测结核患者痰标本的可行性。方法用PCR-反向斑点杂交技术分析对75株临床分离株和45例肺结核患者涂阳痰标本进行rpoB、rpsL和KatG基因突变的检测。结果临床耐药株分离株进行rpoB、rpsL和KatG基因突变的检测,其突变率分别为83.9%、62.5%、57.1%。肺结核患者涂阳痰标本中耐药株突变率分别为81.0%、60.0%、52.9%。结论rpoB基因、KatG基因和rpsL基因突变与结核分支杆菌耐利福平、异烟肼和链霉素密切相关,应用PCR-反向斑点杂交技术可快速检测结核分支杆菌对异烟肼、链霉素和利福平耐药性。PCR-反向斑点杂交技术有望成为结核分支杆菌耐药性检测的重要方法之一。     

结核分支杆菌rpoB基因突变与耐利福平的临床应用

目的：研究结核分支杆菌耐利福平（RFP）分离株rpoB基因突变情况并评价其应用价值。方法：采用聚合酶链反应一单链构象多态性（PCR—SSCP）方法对355株结核分支杆菌临床分离株（其中敏感株109株，耐RFP或含耐RFP株246株）rpoB基因进行检测，并对其中17株耐药株用双氧末端终止法进行测序分析。结果：以结核分支杆菌H37RV为对照，109株药物敏感株的rpoB基因均无突变，特异性100％；246株耐药株中，225株rpoB基因SSCP图谱异常，其敏感性91．5％。17株耐药株（其中SSCP异常11株，正常6株）PCR扩增产物经测序证实，11株在531位密码子TCG-TTG，4株在526位密码子CAC-TAC，1株在516位密码子GAC—GTC，1株未改变。结论：rpoB基因突变是耐RFP结核分支杆菌耐药性的主要分子机制；其最常见的突变位点是531位色氨酸和526位组氨酸，应用PCR—SSCP技术可快速检测结核分支杆菌对RFP的耐药性。     

应用单链探针反向杂交试验检测结核分枝杆菌耐药性分析

目的探讨单链探针反向杂交试验检测结核分枝杆菌耐药性,评价此方法在耐药性检测中的临床应用价值。方法采用聚合酶链反应-单链探针反向杂交试验技术,PCR扩增50株结核分枝杆菌rpoB、katG、rpsL、rrs、embB耐药基因,将标记生物素的基因扩增产物与固定在硝酸纤维膜上的核酸探针杂交,通过链亲和素碱性磷酸酶,BICP/NBT显色系统检测分析基因突变,同时与传统药物敏感实验比对分析。结果 PCR-LiPA方法分析50株结核分枝杆菌临床分离株,耐RFP菌株中检出4株,耐INH菌株中检出5株,耐SM菌株中检出7株,SM敏感株检出1株,50株rrs基因均未检测到相应位点的突变;耐EMB菌株1株、EMB敏感株1株检测到embB基因突变。结论应用PCR-LiPA可快速、简便地检出部分结核分枝杆菌耐药株,可作为临床辅助诊断手段。     

PCR-SSCP技术直接快速检测痰标本中结核分支杆菌rpoB,katG,ahpC基因突变的研究

目的：应用PCR－SSCP技术直接快速检测痰标本中结核分支杆菌rpoB,katG及ahpC基因突变,评价此方法用于结核分杆菌利福平（RFP）及异烟肼（INH）耐药性试验的意义。方法：以结核分支杆菌H37Rv为对照,30例耐RFP（单耐或多耐）、21例耐INH（单耐和多耐）的结核分枝杆菌临床分离株及10例敏感菌株;39例菌阳肺结核患者及30例非结核 性肺部疾病患者痰标本,采用PCR－SS－CP技术检测痰标本和菌株中的结核杆菌rpoB,katG,ahpC基因突变,并与药敏试验对照。结果：PCR－SSCP检测痰标本中结核分支杆菌rpoB,katG及ahpC基因突变的阳性率分别为79％（31／39）、46％（18／39）及5％（2／39）.结论：PCR－SSCP可望成为直接检测临床痰标本中结核分枝杆菌耐利福平及耐异烟肼的快速方法。     

结核分枝杆菌异烟肼耐药基因katG点突变的快速检测

目的：探讨快速检测结核分枝杆菌异烟肼（INH）耐药基因型的分子药敏方法。方法：用聚合酶链反应－单链构象多态性（PCR－SSCP）检测了30株INH敏感菌株及30株耐药株的katG基因，随后用SSCP方法鉴定扩增产物有无突变，以结核分枝杆菌H37Rv作对照。结果：所有INH敏感株均观察到katG基因扩增产物，30株INH耐药株中28株观察到katG基因扩增产物。以H37Rv标准株为对照，30株敏感株SSCP带谱与对照相同；28株INH耐药株中13株与对照相同，15株有不同程度的差异。与药敏试验比较，PCR－SSCP检测INH耐药结核菌的敏感性为57%，特异性为100％。结论：多数结核分枝杆菌耐INH是由于katG基因突变所致，用PCR－SSCP筛选突变株可达到快速检测结核分枝杆菌INH耐药基因型的目的。     

结核分支杆菌耐异烟肼分子机制的研究

目的 探讨结核分支杆菌对异烟肼(INH)的耐药分子机制,检测KatG、inhA基因突变在结核分支杆菌对INH耐药性测定中的应用价值.方法采用PCR和PCR-SSCP方法对95株结核分支杆菌临床分离株和47例耐INH肺结核患者痰标本KatG基因突变进行检测.结果以结核分支杆菌H37RV为对照,44株药物敏感株的KatG、inhA基因突变率分别为4.5%、0.51株耐INH分离株中,31株KatG基因发生突变,突变率为60.8%;3株inhA基因发生突变,突变率为5.9%.47例耐INH肺结核患者痰标本中,KatG基因44例扩增阳性、inhA基因40例扩增阳性,其基因突变检测率分别为47.7%、7.5%.结论 KatG基因突变是INH耐药性的重要分子机制,inhA基因与INH耐药性有相关性.     

结核分支杆菌链霉素耐药基因的杂交检测

目的探讨结核分支杆菌对链霉素（Sm）的耐药分子机制,评估应用PCR-寡核苷酸探针反相斑点杂交技术检测rpsL、rrs基因突变在结核分支杆菌对链霉素耐药性测定中的应用价值。方法采用PCR-寡核苷酸探针反相斑点杂交技术对55株结核分支杆菌临床分离株（其中药物敏感株23株,耐INH或含耐,INH耐多药株32株）和25例耐SM肺结核患者痰标本的rpsL、rrs基因突变进行检测。结果以结核分支杆菌H37RV为对照,23株药物敏感株的rpsL、rrs基因突变率分别为4.3%、0。32株耐链霉素分离株中,21株rpsL基因发生突变,突变率为65.6%;4株rrs基因发生突变,突变率为12.5%。25例耐链霉素肺结核患者痰标本中,rpsL基因18例扩增阳性、rrs基因14例扩增阳性,其基因突变检测率分别为50.0%、7.2%。结论rpsL、rrs基因突变是INH耐药性的重要分子机制。PCR-寡核苷酸探针反相斑点杂交技术可以快速、准确地检测结核分支杆菌rpsL、rrs基因突变,该技术有望直接用于临床标本耐药性检测。     

结核分支杆菌耐药基因检测结果分析

目的 分析肺结核患者结核分支杆菌获得性耐药情况,比较两种耐药性检测方法的检测效果.方法 用药敏试验(绝对浓度法)检测结核分支杆菌株对利福平(RFP)、异烟肼(INH)、链霉素(SM)、吡嗪酰胺(PZA)和乙胺丁醇(EMB)的耐药情况,采用聚合酶链反应-单链构象多态性分析(PCR-SSCP)检测结核分支杆菌耐药rpoB、katG、rpsL、pncA和embB基因突变.结果:400例肺结核耐药患者常规药敏试验耐药316例(79.8%);耐药基因检测耐药株288株,突变率72.0%.RFP耐药例数和耐药率明显高于SM、PZA和EMB(耐药例数:F=2.45,2.56,2.69,P＜0.05;耐药率:F=2.55,2.66,2.79,P＜0.05),rpoB突变株和突变率明显高于katG、rpsL、pncA和embB(突变株:F=2.28,2.46,3.19,3.33,P＜0.05～0.01;突变率:F=2.36,2.61,3.25,3.45,P＜0.05～0.01),高浓度药物耐药菌株的突变株和突变率显著高于低浓度药物耐药菌株,随着不规律用药时间的延长,耐药率和突变率均逐渐上升(耐药率:F=2.77,2.88,P＜0.05;突变率:F=2.72,2.85,P＜0.05).结论 PCR-SSCP是一种快速检测结核杆菌rpoB、katG、rpsL、pncA和embB基因突变敏感、特异的方法.     

应用PCR—直接测序法测定结核分支杆菌rpsL基因突变的研究

目的：了解我国结核分支杆菌耐链霉素（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｉｎ,ＳＭ）分离株ｒｐｓＬ基因突变情况,建立快速检测结核分支杆菌耐药基因型的分子药敏试验方法。方法：通过聚合酶链反应（ＰｏｌｙｍｅｒａｓｅＣｈａｉｎＲｅａｃｔｉｏｎ,ＰＣＲ）－单链构象多态性（Ｓｉｎｇｌｅ－ｓｔｒａｎｄｅｄＣｏｎｆｏｒｍａｔｉｏｎＰｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ,ＳＳＣＰ）、ＰＣＲ－限制性片段长度多态性（ＲｅｓｔｒｉｃｔｉｏｎＦｒａｇｍｅｎｔＬｅｎｇｔｈＰｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ,ＲＦＬＰ）和ＰＣＲ－直接测序法（ＤｉｒｅｃｔＳｅｑｕｅｎｃｉｎｇ,ＤＳ）分析３８株结核分支杆菌耐ＳＭ分离株的ｒｐｓＬ基因。结果３８株耐ＳＭ分离株中,２５株ＳＳＣＰ异常、不被ＭｂｏⅡ消化、ＤＳ分析４３位密码子ＡＡＧ→ＡＧＧ突变;１株ＳＳＣＰ异常、可被ＭｂｏⅡ消化、ＤＳ分析３３位密码子ＧＴＡ→ＡＴＡ突变;１２株ＳＳＣＰ正常、可被ＭｂｏⅡ消化、ＤＳ分析未见异常;未发现８８位密码子突变。结论：大多数结核分支杆菌耐ＳＭ是由于其ｒｐｓＬ基因４３位密码子突变所致,采用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ、ＰＣＲ－ＲＦＬＰ和ＰＣＲ－ＤＳ方法可快速测定部分结核分支杆菌ＳＭ耐药基因型。     

单管半套式PCR-SSCP用于结核分支杆菌rpoB基因突变的研究

目的 ①证明单管半套式聚合酶链反应(PCR)是检测结核分支杆菌的特异性方法;②研究结核分支杆菌rpoB基因突变与利福平耐药性的关系。方法 设计三条针对结核分支杆菌的特异性引物,采用单管半套式PCR-单链构象多态性(SSCP)方法对结核分支杆菌、其它分支杆菌和富含GC碱基的细菌进行分析。结果 ①结核分支杆菌标准菌株H_(37)Rv和55株临床分离株均扩增出一条193bp片段,其特异性为100％,敏感性约为10pgDNA;15株非结核分支杆菌和8株富含GC的细菌均未得到扩增;②55株结核分支杆菌临床分离株193bp扩增片段SSCP图谱特点:以H_(37)Rv为对照,15株利福平敏感株均无区别;40株耐药株除6株外其余34株SSCP图谱有明显区别,检测阳性率为85％。结论 单管半套式PCR检测结核分支杆菌简便、敏感、特异,结合SSCP可检出耐利福平结核分枝杆菌rpoB基因突变,此突变与利福平耐药关系密切。     

结核分枝杆菌katG和inhA基因突变的研究

为了解结核分枝杆菌耐异烟肼（ＩＮＨ）分离株ｋａｔＧ基因和ｉｎｈＡ调节序列的突变情况，探讨其在ＩＮＨ耐药性中的可能作用。应用聚合酶链反应（ＰＣＲ）和ＰＣＲ－单链构象多态性（ＳＳＣＰ）方法对６２株结核分枝杆菌临床分离株的ｋａｔＧ基因和ｉｎｈＡ调节序列进行分析。ＰＣＲ分析结果显示：ｋａｔＧ基因和ｉｎｈＡ调节序列的敏感性为１～１０ｐｇＤＮＡ；其引物ＰＣＲ扩增都具有较高的特异性。以Ｈ３７Ｒｖ标准株为对照，１３株敏感株中，１２株ｋａｔＧ基因扩增产物ＳＳＣＰ泳动正常，１株ｋａｔＧ异常；２４株耐非ＩＮＨ抗结核药物株中，８株ｋａｔＧＳＳＣＰ异常；上述２７株的ｉｎｈＡ调节序列ＳＳＣＰ均泳动正常。２５株耐ＩＮＨ株中，３株ｋａｔＧ基因ＰＣＲ扩增阴性，２２株ｋａｔＧ扩增阳性，其中１６株ＳＳＣＰ泳动异常；４株ｉｎｈＡ调节序列ＳＳＣＰ泳动异常，其ｋａｔＧ基因ＳＳＣＰ也异常。结果表明，某些结核分枝杆菌ＩＮＨ耐药性可能是由于其ｋａｔＧ基因完全缺失、ｋａｔＧ基因或ｉｎｈＡ调节序列突变所致，但某些菌株也可能与其无关，是其它耐药基因所致或存在多种机制，尚需进一步探讨。     

快速检测结核分支杆菌对利福平的耐药性

目的：建立快速检测结核分支杆菌耐药基因型的分子药敏试验方法。方法：用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)分析结核分支杆菌rpoB基因突变并与药敏试验对照。结果：116株结核分支杆菌的PCR-SSCP图谱与H37Rv为对照，81株耐药菌73株有明显区别，而35株敏感，仅1株位置有区别；检测阳性率90．1％；特异性97．1％。结论：rpoB基因突变是结核分支杆菌耐利福平的主要机理，PCR-SSCP可简便快速地检出rpoB基因的突变，有助于结核分支杆菌耐药性的快速检测和研究。     

Determination of in vitro synergy when three antimicrobial agents are combined against Mycobacterium tuberculosis

We determined the in vitro antimycobacterial activity of rifampicin, isoniazid and a third agent in combination using a three-dimensional chequerboard in Middlebrook 7H9 broth microdilutions. Of 28 agents screened, ethambutol, streptomycin, clarithromycin, minocycline, ciprofloxacin, levofloxacin, sparfloxacin, gatifloxacin and sitafloxacin were potentially synergistic. A further three-dimensional chequerboard assay quantitatively looked for synergy against ten clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis, including seven multidrug-resistant isolates. Sitafloxacin, gatifloxacin and clarithromycin showed significant synergy, with fractional inhibitory concentration indices ranging from 0.41 to 0.79, 0.39 to 0.90 and 0.48 to 0.95, respectively. It is concluded that three-dimensional chequerboard assay can quantitatively determine antimycobacterial synergy, and that fluoroquinolones and antibacterial agents such as clarithromycin are effective against multidrug-resistant isolates of M. tuberculosis when combined with rifampicin and isoniazid.     

Drugs for tuberculosis

RECOMMENDATIONS: The standard treatment for latent tuberculosis is nine months of isoniazid taken daily, or twice weekly under direct observation by a healthcare worker. Taking isoniazid and rifapentine once weekly for 12 weeks under direct observation is an alternative for patients >12 years old. Initial therapy for patients with active or suspected tuberculosis should include isoniazid, rifampin,pyrazinamide and ethambutol until susceptibility is known. In patients with drug-susceptible pulmonary tuberculosis, the continuation phase of treatment should be a combination of isoniazid and either rifampin or rifapentine, taken for 4 or 7 months depending on risk factors. Confirmed multidrug-resistant tuberculosis or extensively drug-resistant tuberculosis should be treated with directly observed therapy in collaboration with a clinician familiar with management of these conditions. Treatment must include at least 4 drugs to which the organism is susceptible; the duration of therapy should usually be 18-24 months. Directly observed therapy by a healthcare worker should be offered to all patients with active tuberculosis to minimize treatment failure, relapse and the emergence of drug resistance.     

广东地区结核分枝杆菌利福平耐药与基因rpoB突变关系分析

目的 为了解广东地区结核分枝杆菌rpoB基因突变特点,并探讨其与利福平耐药之间的关系.方法 本研究根据结核病诊断细菌学检验规程从临床结核病疑似患者痰液中分离鉴定结核分枝杆菌,采用绝对浓度法对其进行药敏试验,并用PCR-DNA直接测序法对结核分枝杆菌rpoB基因进行序列分析.结果 结果分离得到利福平耐药株27株,其中低浓度耐药8株,高浓度耐药19株.经测序分析,所有利福平敏感株rpoB基因均未发生氨基酸突变 利福平耐药株rpoB基因的突变率为81.5%（22/27）,突变均发生在利福平耐药决定区内,突变位点为526、531及533,以Ser531Leu突变最为常见（55.6%,15/27）,并且高浓度耐药株的突变率明显高于低浓度耐药株.结论 结果表明广东省结核分枝杆菌rpoB基因突变是结核分枝杆菌利福平耐药性产生的主要分子机制,突变位点同国内外研究基本一致,但各位点突变形式所占比例有自身特点.