脉冲场凝胶电泳在副溶血性弧菌食物中毒的同源性分析

目的应用脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术,对一起食物中毒分离的副溶血性弧菌进行同源性分析。方法将食物中毒患者肛拭标本中分离的7株副溶血性弧菌用限制性内切酶NotⅠ酶切后进行PFGE分子分型,用BioNumerics软件对PFGE分型图谱进行聚类分析。结果患者样本分离的7株副溶血性弧菌PFGE图谱条带一致,相似性为100%。结论脉冲场凝胶电泳技术适用于食物中毒事件分离菌株的同源性分析。 更多还原     

深圳市甲型副伤寒PulseNet数据库的建立与应用

目的建立深圳市甲型副伤寒PulseNet数据库,用于甲型副伤寒的实时监测和分子流行病学调查。方法采用脉冲场凝胶电泳（PFGE）技术,对深圳市2002-2007年散发和爆发的243株甲型副伤寒沙门菌的染色体DNA进行酶切电泳,用BioNumerics软件对PFGE分型图谱电子化数据分析,建立分子分型数据库。结果深圳市甲型副伤寒菌株各年间差异较小,用Xba酶切仅呈现6种PFGE图谱。同一起甲副暴发的临床分离株具有相同的PFGE图谱。各区和各年代的分离株都存在有相同的PFGE带型。结论深圳市甲型副伤寒沙门菌变异较小,呈长期流行趋势,甲型副伤寒PulseNet数据库的初步建立,对直观地分析各起疫情之间的相互关系,对疫情的控制和传染来源的追踪具有重要意义。     

云南省食源性沙门菌血清分型及脉冲场凝胶电泳的指纹图谱

目的 研究云南省食源性沙门菌的血清型, 用脉冲场凝胶电泳 (PFGE) 方法对优势血清型进行分子分型, 建立云南省食源性沙门菌PFGE指纹图谱资料库, 为食源性疾病溯源提供数据.方法 对2013年至2016年从云南省食源性疾病监测中分离到的322株食源性沙门菌进行血清学分型, 采用Bio Numerics软件对148株沙门菌DNA酶切图谱进行类聚分析, 通过聚类比较分析菌株间的相关性, 建立指纹图谱库.结果 322株沙门菌血清分型主要包括A、B、C、D、E、F、G群等7个群, 鼠伤寒沙门氏菌是主要血清型, 占11.4% (37/322) .采用Bio Numerics软件对148株沙门菌DNA酶切图谱进行类聚分析, 根据电泳产生条带的位置和数量的不同, 共分为102个不同的PFGE带型.按照90%的相似度, 这些PFGE带型可以分为39个大小不一的聚类群, 呈现多样性.结论 云南省食源性沙门菌分子分型复杂, 以鼠伤寒沙门氏菌为主, PFGE带型呈现多样性.     

沙门菌携带者分离株血清学及PFGE分型研究

目的建立在健康携带者分离的沙门菌的血清型及PFGE分子型别图谱库,探讨其多态相关性关系。方法将预防性健康体检分离获得的21株沙门菌鉴定培养,进行血清分型;将确定后的菌株用限制性内切酶Xba I消化酶切其基因组DNA,在脉冲场凝胶电泳仪进行DNA电泳,所得的分子型别图谱用Bionumerics5.1软件建立图谱数据库,并进行聚类分析。结果21株沙门菌分属于O：4（B）、O：9（D1）和O：3,10（E1）3个菌群,8种血清型;以德尔卑沙门菌为主,共7株占所有分离株的占33.3%,其次为阿贡纳沙门菌19.1%（4/21）,鼠伤寒沙门菌14.3%（3/21）。经比对分析,18株沙门菌分为15个PFGE型别,菌株间的相似值在53.9%～100%之间,同一血清型别的沙门菌可对应多个PFGE型别。结论沙门菌的PFGE型别呈现多样性,脉冲场凝胶电泳对从业人员体检沙门菌有较高的分型能力,可为沙门菌的日常监测和相关疫情的处理提供重要的技术支撑。     

大肠埃希菌基因组结构分型及其与疾病关系的研究

目的 通过研究大肠埃希菌的基因组结构并分型，探讨分型与临床疾病之间的关系。方法 取临床不同疾病患者的痰、尿、血、分泌物等标本，分离大肠埃希菌62株，经I-CeuⅠ酶切全基因组DNA、脉冲场凝胶电泳分离片段，按酶切图谱的异同进行分型。结果62株大肠埃希菌基因组结构中。均有7个I-CeuⅠ酶切位点，表明有7个rrn操纵子。基因组大小在4500-5000kb之间。根据基因组结构细微差别分为30个型。结论临床分离大肠埃希菌基因组结构存在多样性，基因组结构分型与临床疾病之间有一定的对应关系。     

大肠埃希菌临床分离株的基因组结构分型研究

目的 通过基因组结构分析对临床分离的大肠埃希茵进行分型，并探讨型别与临床疾病的关系。方法 取临床不同疾病病人的痰、尿、血、分泌物等标本，分离大肠埃希菌。用I-CeuI酶切全基因组DNA以及用脉冲场凝胶电泳分离DNA片段后，根据酶切图谱的异同进行分型。结果 从临床上分离的64株大肠埃希菌中，62株有7个I-CeuI酶切住点，2株有8个I-CeuI酶切位点。菌株间I-CeuI酶切图谱差异明显。这些菌株根据基因组结构的差异分为32个型，某些疾病与特定基因组型密切相关。结论 临床分离的大肠埃希菌基因组结构存在多样性，其与临床疾病之间存在一定的对应关系，但尚需大宗病例进一步研究。     

钩端螺旋体基因组大小的初步研究

作者采用脉冲场凝胶电泳技术,对不同属、群(型)的5株钩端螺旋体基因组DNA分子量进行了研究,并用限制性内切酶Not I对基因组DNA进行分析。结果表明:钩端螺旋体基因组大小为2000kb;各株钩体基因组大小无明显差异;限制性内切酶Not I可将钩体基因组消化为11个大片段;钩体基因组DNA被Not I消化后电泳图谱与细菌基因组DNA图谱有很大差异。     

应用PFGE技术对乌龟引起人鼠伤寒沙门菌感染的溯源调查

目的应用脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)技术对乌龟引起幼儿鼠伤寒沙门菌感染的溯源调查。方法对一例多次检测鼠伤寒沙门菌阳性的病例采集粪便标本以及接触过的乌龟外表涂抹样本进行脉冲场凝胶电泳、血清分型、耐药性分析。结果 4株菌株的XbaI酶切图谱与BlnI酶切图谱100%一致,表明乌龟身上携带的鼠伤寒沙门菌是患儿周某感染的源头。结论龟源性沙门氏菌感染应引起重视,应用PFGE技术开展食源性疾病溯源调查值得推广。     

食品中副溶血弧菌血清学分型与分子分型的研究

目的分析深圳市2007～2010年监测食品中副溶血弧菌存在的优势血清型与基因型之间的相似性,初步建立深圳市食源性副溶血弧菌脉冲场凝胶电泳分子分型监测网络。方法选择2007～2010年监测食品中分离出来的副溶血弧菌主要血清群（O1-O4）55株,基因组DNA经Sfi1酶切,通过脉冲场凝胶电泳PFGE获得图谱,利用BioNumerics分析软件对图谱进行聚类分析。结果相似性在90%以上的有15株,其中有9株相似性为100%,分别是2株O2：K28;1株O1：KUT与1株O4：K42;5株O3：K6,其余菌株谱型差异较大。结论监测食品中分离的副溶血弧菌PFGE型别多,且相互之间关系分散。PFGE分子分型监测网络的建立,有助于食源性疾病发生时的主动监测,爆发调查和传染源追踪。     

PFGE分型方法在食源性单核细胞增生李斯特氏菌分型中的应用

目的了解河北省食源性单核细胞增生李斯特氏菌(Lm)脉冲场凝胶电泳(Pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)基因分型分布特征,建立分子分型数据库,为Lm分子流行病学研究提供资料。方法分别以Apa I和Asc I两种内切酶对食品中分离的57株Lm进行PFGE基因分型检测,并以Bio Numerics Version 6.6软件绘制进化树。结果 57株食源性Lm经Apa I和Asc I双酶切后,可产生32个基因型别(PFGE types,PT),分辨率为0.9 516。优势型别为PT11、PT12、PT5和PT10型。结论河北省食品中污染的Lm菌型分散,来源于不同的克隆株。