Rapid and High-throughput Identification of Recombinant Bacteria with Mass Spectrometry Assay

Objective To construct a rapid and high-throughput assay for identifying recombinant bacteria based on mass spectrometry.Methods Matrix assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry(MALDI-TOF MS) techniques were used to identify 12 recombinant proteins(10 of Yersinia pestis,1 of Campylobacter jejuni and 1 of Helicobacter pylori).A classification model for the various phase of recombinant bacteria was established,optimized and validated,using MALDI-TOF MS-ClinProTools system.The differences in the peptide mass spectra were analyzed by using Biotyper and FlexAnalysis softwares.Results Models of GA,SNN,and QC were established.After optimizing the parameters,the GA recognition model showed good classification capabilities:RC=100%,mean CVA=98.7%(the CVA was96.4%in phase 1,100%in phase 2,98.4%in phase 3,and 100%in phase 4,respectively) and PPV=95%.This model can be used to classify the bacteria and their recombinant,which only requires 3.7xl03 cells for analysis.The total time needed is only 10 min from protein extraction to reporting the result for one sample.Furthermore,this assay can automatically detect and test 96 samples concurrently.A total of 48specific peaks(9,16,9,and 14 for the four stages,respectively) was found in the various phase of recombinant bacteria.Conclusion MALDI-TOF MS can be used as a fast,accurate,and high-throughput method to identify recombinant bacteria,which provide a new ideas not only for recombinant bacteria but also for the identification of mutant strains and bioterrorism pathogens.     

MALDI-TOF MS直接鉴定腹水培养阳性样本的研究

目的 探讨用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)直接鉴定腹水培养阳性病原菌的方法.方法 收集2016年9～11月培养阳性的腹水标本202瓶,差速离心法富集菌体,利用MALDI-TOF MS对菌液进行直接鉴定.结果 202瓶样本中,196瓶为单菌株感染,6瓶为混合菌感染.单菌株感染中,菌株的种、属鉴定符合率分别为77.6％和93.4％.其中革兰阴性菌的种、属鉴定符合率为75.9％和91.1％;革兰阳性菌的种、属鉴定符合率为80.2％和95.3％;真菌的菌种、属鉴定符合率为12.5％和50.0％.6瓶混合菌感染样本,均鉴定出其中一种菌.结论 利用MALDI-TOF MS直接鉴定腹水培养阳性样本中的病原菌,鉴定准确率高,检测时间短,为腹腔感染的快速诊断提供了有力的检测手段.     

基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱在鼠伤寒沙门菌同源性分析中的应用价值

目的:研究基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)在鼠伤寒沙门菌同源性分析中的应用价值.方法:利用MALDI-TOF MS对分离于广州市的44株鼠伤寒沙门菌进行分型,与脉冲场凝胶电泳分型(PFGE)进行比较,并分析主要质谱型的质谱图.结果:对PFGE结果聚类分析可以将44株鼠伤寒沙门菌分为15型.在聚类相似度为80%时,44株鼠伤寒沙门菌被分为8个MALDI-TOF MS型,与PFGE分型较一致.其中MS1型(52.3%)为主要的质谱型,MS1型包含多个PFGE型.结论:MALDI-TOF MS方法分型结果显示了广州市鼠伤寒沙门菌相对集中的亲缘关系,是一种简便、快速、高通量的方法.     

MALDI-TOF MS技术在鉴定临床少见非发酵菌中的应用

摘要：目的  评价基质辅助激光解析电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）技术在快速鉴定临床少见非发酵菌中的应用价值。方法  选取2013年7月-2016年10月安徽医科大学第一附属医院检验科分离的67株临床少见非发酵菌,包括痰液分离的21株,尿液分离的13株,血液分离的9株,骨髓液分离的9株,分泌物分离的8株,腹透液分离的2株,脑脊液分离的1株,胆汁分离的1株,其他体液分离的3株。以16S核糖体RNA（16SrRNA）序列分析为金标准,比较MALDI-TOF MS与Vitek2 Compact鉴定系统鉴定的准确性。结果  67株临床少见非发酵菌中,MALDI-TOF MS将66株（98.5%）鉴定到种水平,1株（1.5%）鉴定到属水平;Vitek2 Compact鉴定系统将59株（88.1%）鉴定到种水平,8株（11.9%）未能鉴定;67株少见非发酵菌均扩增到16SrRNA目的基因片段并成功测序,67株（100.0%）都成功鉴定到种水平。以16SrRNA序列分析为金标准,MALDI- TOF MS和Vitek2 Compact鉴定系统正确鉴定到种水平准确性分别为98.5%（66/67）和88.1%（59/67）。结论  与传统的细菌生化反应方法相比,MALDI-TOF MS技术操作简便、耗时短、费用低,鉴定结果与16SrRNA序列分析的符合率高,可以提高临床对少见非发酵菌鉴定的准确率。

     

应用MAIDI-TOF MS 分析黄连素作用前后耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌质谱峰图的改变*

目的应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪(matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry, MALDI-TOF MS)分析产碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌被黄连素作用前后蛋白质谱峰的改变。方法 收集浙江中医药大学附属第一医院产碳青霉烯酶（KPC）肺炎克雷伯菌20例，使用培养法得到黄连素作用后传代菌株，应用MAIDI-TOF MS 分组检测每代菌株，,ClinProTools 3. 0 软件对 MALDI-TOF MS 鉴定细菌所产生的质谱峰图进行分析。结果 质谱将黄连素作用前KPC肺炎克雷伯菌和黄连素作用后第三代肺炎克雷伯菌较清晰地划分成两个区域， ClinProTools 软件的3种算法所得出的结果基本一致，灵敏度均大于 95.0%，其中监督式神经网络算法（ＳＮＮ）灵敏度最高，为100.0%，三种算法特异性均大于85.0%。质荷比为15143.96m/ z、 12265.75m/z、16099.26m/z、15048.83m/z的质谱峰是用于区分作用前后最为主要的特征性峰，在峰强度上存在一定的差异。结论 黄连素作用于碳青霉烯类肺炎克雷伯菌后蛋白质谱峰发生了明显的改变。     

基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱仪快速鉴别青霉素耐药及敏感的肺炎链球菌的应用

目的 探讨基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱仪（matrix-assisted laser desorption/ ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS）快速鉴别青霉素耐药及青霉素敏感的肺炎链球菌的可行性。方法 收集2017年1月到2019年12月广州市番禺区中心医院青霉素耐药的肺炎链球菌（PRSP）10株及青霉素敏感的肺炎链球菌（PSSP）30株。其中31株肺炎链球菌分离自呼吸道标本,占77.5%,18株肺炎链球菌分离自儿科,占45.0%。年龄分布,60岁以上15株,12岁以下18株。用MALDI-TOF MS进行菌株鉴定,用VITEK 2 Compact的药敏卡AST-GP68进行耐药性检测,用VITEK MS的Launch pad软件对MALDI-TOF MS鉴定的肺炎链球菌所产生的质谱峰图进行分析。结果 质谱峰m/z的3992、4419为肺炎链球菌的特征峰,质谱峰m/z的 3853、4218、4619是用于区分PRSP及PSSP最主要的特征峰,不同菌株质谱峰略有不同。164株肺炎链球菌青霉素的耐药率为8.5%,万古霉素﹑利奈唑胺﹑厄他培南的敏感率均为100.0%。90株PSSP及64株PRSP对15种抗生素的药敏结果显示,PSSP的阿莫西林及青霉素的敏感率分别为100.0%,而PRSP的阿莫西林及青霉素的敏感率为0。结论 MALDI-TOF MS可快速准确鉴别PRSP及PSSP,具有耗时短,灵敏度高,特异性好等特点。     

质谱快速鉴定血培养阳性标本的方法研究

目的 建立快速、精准的细菌质谱鉴定方法,以缩短血培养阳性的实验周转时间。方法 共收 集血培养阳性瓶91 个（活性炭吸附瓶）,采集培养液分别转种肉汤和血平板增菌培养4 h 后,用基质辅助激光 解吸/ 电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）进行菌种鉴定。以血平板培养24 h 的质谱鉴定结果为对照, 比较2 种方法细菌质谱鉴定符合率。结果 91 株细菌包括51 株革兰阴性菌和40 株革兰阳性菌。4 h 肉汤增 菌法和4 h 血平板培养法鉴定到种的符合率分别为46.15% 和89.01%,无鉴定结果率分别为47.25% 和3.30%, 错误鉴定率分别为3.30% 和4.40%。2 种方法鉴定到种的符合率比较,差异有统计学意义（P <0.05）,4 h 血平 板培养法鉴定到种的符合率高于4 h 肉汤增菌法。2 种方法对革兰阴性菌鉴定到种的符合率分别为58.82% 和 94.12%,差异有统计学意义（P <0.05）,4 h 血平板培养法高于4 h 肉汤增菌法。2 种方法对革兰阳性菌鉴定到 种的符合率分别为30.00% 和82.50%,差异有统计学意义（P <0.05）,4 h 血平板培养法高于4 h 肉汤增菌法。 结论 4 h 血平板培养质谱鉴定法可快速鉴定血培养阳性标本中的病原菌。     

利用时间质谱检出312例6月龄内健康婴儿鼻咽部微生态菌群的分布特征

目的 利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术研究济南地区6月龄内健康婴儿鼻咽部微生态菌群分布特征,为鼻咽部微生态研究提供样本库信息。 方法 采集2019年11月至2020年4月济南地区312例6月龄内健康婴儿鼻咽拭子,增菌后,分离培养获得纯菌株;利用MALDI-TOF MS技术鉴定分离株到种置信水平;312例婴儿分为月龄≤2组、3月龄组、4月龄组和5月龄组,组间比较采用SPSS 22.0统计学软件,卡方或Fisher确切概率法统计分析。 结果 312例健康婴儿鼻咽拭子获得纯菌株741株,分属于25个属74种细菌。优势菌属为葡萄球菌属(31.6%)、棒杆菌属(30.8%)、链球菌属(18.9%)、莫拉菌属(8.6%)和狡诈球菌属(2.0%)。同时发现一些不常见菌种,例如缺陷乏氧菌、放射根瘤菌等。金黄色葡萄球菌检出率男婴(40.5%)高于女婴(26.4%),接近棒杆菌女婴(42.4%)高于男婴(27.4%)。4个年龄组中,假白喉棒杆菌检出率依次升高(10.8%、17.7%、18.9%、46.7%);肺炎链球菌检出率依次升高(2.2%、2.3%、4.1%、20.0%)。 结论 济南地区健康6月龄内婴儿鼻咽部微生态菌群以优势菌为主呈现多样化,MALDI-TOF MS是鉴定常见和不常见微生物菌种的快速、高通量技术手段。本研究可为济南地区儿童鼻咽部微生态研究提供有价值的样本库资料。     

Evaluation of Matrix-assisted laser desorption/ionization Time-of flight Mass spectrometry (MALDI TOF MS) and VITEK 2 in routine microbial identification

BacgroundMicrobial Identification was done by phenotypic methods. VITEK-2 and Matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) are now being increasingly used in laboratories.ObjectivesTo compare and evaluate the usefulness of MALDI-TOF MS and VITEK-2 in routine microbial identification.MethodsThe performances of MALDI-TOF MS and VITEK 2 were compared for identifying microorganisms.ResultsMALDI- TOF MS and VITEK-2 correctly identified 96 % (96/100) and 97% (97/100) of the isolates upto the genus level.ConclusionMALDI TOF MS and VITEK -2 gave comparable identification and error rates. The rapid reduction in turnaround time with MALDI TOF is a significant game-changer in the field of clinical microbiology.FundingState Board of Medical Research (SBMR).     

耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌碳青霉烯酶基因检测和同源性分析

目的 了解清远市人民医院耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(Carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii,CRABA)对碳青霉烯类抗菌药物的耐药机制和同源性.方法 应用BD Phoenix M50全自动细菌鉴定药敏系统进行细菌鉴定和药敏检测,应用聚合酶链式反应(PCR)和基因测序检测C...     

肽质量指纹图谱鉴别诊断IgA肾病和非IgA肾病的可行性分析

目的探索肽质量指纹图谱(PMF)在IgA肾病和非IgA肾病的分类中是否可行。方法采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF MS)分析IgA肾病和非IgA肾病患者的血清肽质量指纹图谱。结果 IgA肾病和非IgA肾病的血清肽质量指纹图谱具有9个差异多肽;其中,最显著的两个多肽峰是4476.46和1968.10,ROC曲线下面积分别为86.18%和79.77%;主因素分析(PCA)表明前8个因素(差异峰)的累积解释变异量超过95%,说明该模型的鉴别诊断能力较MA好L。DI比-T对OF蛋质白谱质技数术据在库Ig,A多肾肽病53和3非8.0I8gA为肾粘病蛋的白分4类同中工,型具的有片可段行;性而,此多技肽术20在82系.7统7为疾α病1-的Ⅱ亚型类胶分原类同中工具型有的广片阔段的。前景结。论     

基质辅助激光解析电离时间飞行质谱技术检测miR146a单核苷酸多态性

目的：运用基质辅助激光解析电离时间飞行质谱技术（MALDI-TOF-MS）检测miR146a基因单核苷酸多态性,并探讨其与哈萨克族食管癌的相关性。方法：运用MALDI-TOF-MS检测261例哈族食管癌患者及190例同地区对照样本miR146a基因rs2910164位点单核苷酸多态性。结果：成功应用MALDI-TOF-MS检测了哈族食管癌miR146a基因rs2910164位点G/C多态,其基因型分布频率分别是36.4%,49.0%和14.6%,与对照组基因型分布频率（分别是36.3%,49.5%,14.2%）之间差异无统计学意义（P〉0.05）。结论：基于MALDI-TOF-MS技术检测miR146a基因多态性的方法是一个快速、准确和可靠的检测方法。     

不同方法鉴定临床常见念珠菌性能评价

目的 评估表型鉴定、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱分析、真菌核糖体内转录间隔区序列测序三种方法鉴定念珠菌株的性能。方法收集分离自临床标本的63株念珠菌,采用表型鉴定、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱分析、真菌核糖体内转录间隔区序列分析三种方法进行念珠菌鉴定,以序列分析作为参考方法,比较表型鉴定与质谱分析对于念珠菌的鉴定性能。结果（1）真菌表型鉴定与测序鉴定结果一致率93.44%（57/61）。（2）基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱与测序鉴定结果一致率96.7%（59/61）。（3）表型鉴定与质谱分析鉴定结果差异无统计学意义。结论念珠菌生化表型鉴定可作为临床念珠菌株的常规鉴定方法,满足临床需要。当临床念珠菌株生化表型鉴定结果不确定时,应直接进行真菌rDNA ITS测序,不应加做质谱鉴定。有条件的实验室应首选MALDI-TOF MS质谱分析方法鉴定念珠菌以获得最大的鉴定效率,并可作为疑难菌种鉴定确诊方法。当质谱鉴定的结果不确定时,应直接进行真菌rDNA ITS测序,不应再用表型鉴定的方法确认鉴定结果。     

基于MALDI-TOF MS检测肺泡灌洗液病原菌分布和耐药性分析

目的 了解呼吸危重症医学科和重症监护病房(Intensive care unit,ICU)肺部疾病患者支气管肺泡灌洗液(Bronchoalveolar lavage fluid,BALF)病原菌种类及其耐药性。方法 回顾性分析2017年1月～2018年12月我院呼吸危重症医学科和ICU肺部疾病患者BALF分离的病原菌种类及耐药性情况。采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(Matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)对病原菌进行鉴定。结果 BALF阳性检出率为17.80%(162/910),共分离培养出病原菌191株,其中真菌98株(51.31%),以念珠菌、曲霉菌和新生隐球菌为主;革兰阴性杆菌共90株(47.12%),以鲍曼不动杆菌、铜绿假单胞菌和肺炎克雷伯菌为主,多药耐药鲍曼不动杆菌对亚胺培南和美罗培南的耐药率均为58.33%,对头孢哌酮/舒巴坦和替加环素的耐药率分别为45.83%、16.67%,对哌拉西林/他唑巴坦及头孢类药物的耐药率均大于54.0%。其他革兰阴性杆菌对常用抗菌药物的耐药率不高。结论 基于MALDI-TOF MS鉴定的BALF病原菌种类多样,以真菌和革兰阴性杆菌为主,其中鲍曼不动杆菌多药耐药现象严重。病原菌的准确鉴定和敏感药物使用为临床提供治疗依据。     

突变的肝细胞生长因子受体被肝癌细胞HLA-A2分子递呈的实验研究

目的 寻找肝癌细胞抗原肽。方法 应用细胞膜酸洗技术使抗原肽从人肝癌细胞膜表面脱落,经过凝胶层析,应用反相高效液相色谱层析得到不同组份多肽。细胞表位重建及生物学鉴定确定其活性,高效液相色谱－质谱仪联用技术获得抗原肽的一经结构,在互联网上进行氨基酸同源性分析确定其同源性序列。结果 经过反相高效液相色谱层析后可以获得20多个多肽组份,生物活性鉴定有2个活性组份,其中1个组分经过液 质联用鉴定和氨基酸同源性分析,确定其序列为SLIVHLNEV,是肝细胞生长因子受体前体第1175－1183肽段发生突变,第1180位点的苯丙氨酸变为亮氨酸。结论 液质联用技术为寻找抗原肽的有效方法,肝细胞生长因子受体突变体SLIVHLNEV为肝癌抗原体。     

Up-regulated manganese superoxide dismutase expression increases apoptosis resistance in human esophageal squamous cell carcinomas

Background Esophageal cancer is one of the most common malignancies in the world. In order to identify the proteins associated with esophageal squamous cell carcinomas （ESCC）, we analyzed the protein profiles of ESCC cases with tumor and matched adjacent normal tissues. Methods Two-dimensional electrophoresis （2-DE） was carried out to analyze the protein profiles. Dysregulated protein spots were identified by Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization Time-of-Flight （MALDI-TOF） and verified by liquid chromatography/electrospray ionization ion trap-mass spectrometry/mass spectrometry （LC-ESI-IT MS）. RT-PCR and immunohistochemistry on tissue microarray were performed to confirm the gene dysregulation in esophageal cancerous tissues. RNA interference （RNAi） was used to knock down the gene expression in ESCC cell lines. Apoptosis assay with annexin V-FITC/PI staining was conducted and cells were analyzed by flow cytometry. Results 2-DE showed that two protein spots with approximate molecular weights and different pl were elevated in 12 out of 18 ESCCs as compared to the corresponding normal tissues. Both the two spots were identified as MnSOD by MALDI-TOF and were verified by LC-ESI-IT MS. MnSOD overexpression was detected in 14 tumors out of 24 cases by RT-PCR and 52 tumors out of 116 cases by immunohistochemistry comparing to normal epithelia, siRNA-mediated silencing of MnSOD in KYSE450 and KYSE150 cell lines revealed that MnSOD protected ESCC cells from apoptosis induced by ultraviolet （UV） and doxorubicin （DOX）. Conclusions These findings suggest that there existed two isoforms of MnSOD protein in normal and tumor esophageal tissues. MnSOD was overexpressed in ESCC and its up-regulation in esophageal cancer cells was associated with apoptosis resistance.     

基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱鉴定非结核分枝杆菌及药敏试验分析

目的 研究非结核分枝杆菌(NTM)基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)分型结果,比较不同NTM菌种耐药情况,为临床合理用药提供依据。方法 回顾性分析2019年3月—2021年6月绍兴市区结核病定点医院(绍兴文理学院附属医院)NTM菌株相关资料,将来源为相同患者的菌株资料排除后,剩余128株NTM菌株,用MALDI-TOF MS技术对NTM菌种进行分型,同时进行基因测序分型,以基因测序分型结果为金标准,计算出MALDI-TOF MS技术分型结果的准确率,并对分型后排名前三的NTM进行药敏试验分析。结果 MALDI-TOF MS技术对NTM分型结果的准确率为98.4%。胞内分枝杆菌对阿米卡星、克拉霉素、利奈唑胺、莫西沙星和利福平的敏感率分别为98.5%、89.4%、86.4%、83.3%和62.1%;鸟分枝杆菌对阿米卡星、克拉霉素、利奈唑胺、莫西沙星和利福平的敏感率分别为100.0%、92.9%、100.0%、82.1%和89.3%;两者对米诺环素的耐药率分别为90.9%、82.1%。堪萨斯分枝杆菌对阿米卡星、克拉霉素、利福平的敏感率分别为100.0%、100.0%...     

液质联用技术鉴定蛋白的方法建立

目的:建立液质联用鉴定蛋白的方法。方法:通过与目前最常用质谱(MALDI-TOF/TOF-MS)鉴定蛋白对比,判断液相色谱与质谱联用鉴定蛋白技术——增加色谱(CapLC)分离,用质谱鉴定蛋白是否是一种可行的实验方法。结果:直接使用MALDI-TOF/TOF-MS鉴定出酶切产物中的17种肽段,覆盖率:31.5%检索的得分为130;CapLC联合使用MALDI-TOF/TOF-MS共鉴定出35种肽段,覆盖率为59.35%,检索的得分为2976。结论:CapLC联合使用MALDI-TOF/TOF-MS对酶切产物进行鉴定的方法,是一种可行的实验方法,并且该技术路线与MALDI-TOF/TOF-MS相比,是更加准确有效的蛋白鉴定方法。     

ALDH2和ADH1B基因多态性与食管癌淋巴结转移的相关性

目的： 研究中国汉族人群中乙醛脱氢酶2（aldehyde dehydrogenase 2,ALDH2）和乙醇脱氢酶1B（alcohol dehydrogenase 1B,ADH1B）基因多态性与食管癌淋巴结转移风险性的关系。方法： 采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption/ ionization time of flight mass spectrometry, MALDI TOF MS)技术分析85例有淋巴结转移的食管癌和270例无淋巴结转移的食管癌标本ALDH2 rs671和ADH1B rs1229984基因多态性,计算各种基因型与食管癌淋巴结转移的相对风险度及其95%可信区间。结果： ALDH2 rs671 G>A3种多态基因型GG,GA,AA在食管癌淋巴结转移组和无淋巴结转移组的频率分别为58.8%(GG),38.8%(GA),2.4%(AA)和59.3%(GG),37.4%(GA),3.3%(AA)(χ2 =0.237, P=0.888);以ALDH2 rs671 GG基因型作参照,ALDH2 rs671 AA基因型食管癌淋巴结转移发生的风险降低（调整年龄、性别、吸烟及饮酒状态OR=0.70, 95% CI=0.14 ~3.45）, 但相关性未达到明显统计学意义。ADH1B rs1229984 A>G3种多态基因型AA, AG, GG在食管癌淋巴结转移组和无淋巴结转移组的频率分别为38.8%(AA), 50.6%(AG), 10.6%(GG)和42.8%(AA), 41.6%(AG), 15.6%(GG)(χ2=2.553, P=0.279),以ADH1B rs1229984 AA基因型作参照,ADH1B rs1229984 GG基因型食管癌淋巴结转移发生的风险降低（调整年龄、性别、吸烟及饮酒状态OR=0.66, 95% CI=0.29 ~1.53), 但相关性未达到明显统计学意义。结论： ALDH2 rs671 G>A和ADH1B rs1229984 A>G基因多态性可能与食管癌淋巴结转移的风险无明显相关,需进一步研究证实。     

结核分枝杆菌复合体VNTR位点多态性与菌株MALDI-TOF MS蛋白谱差异的关系

  目的  研究结核分枝杆菌复合体(Mycobacterium tuberculosis complex, MTBC)数目可变串联重复序列(variable number tandem repeat, VNTR)重复单位拷贝数与菌株蛋白质谱差异的关系。  方法  采用多位点数目可变串联重复序列分析(multiple locus variable number tandem repeat analysis, MLVA)对MTBC进行基因分型。同时,利用基质辅助激光解析/电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser-desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry, MALDI-TOF MS)对菌株的蛋白质谱进行主成分分析(principal components analysis,PCA),分析VNTR位点重复单位拷贝数差异(多态性)与菌株PCA聚类的关系。  结果  共收集157株MTBC菌株。146株MTBC(质谱鉴定得分≥1.700)生成的PCA树状图分为3个群,分别为Ⅰ群(61株)、Ⅱ群(26株)和Ⅲ群(59株)。24个VNTR位点多态性存在差异,其中7个高、7个中等和10个低多态性。MTBC菌株的Mtub39、QUB26、QUB4156位点多态性与菌株MALDI-TOF MS聚类有关(P=0.000,P=0.035,P=0.017)。  结论  MTBC菌株的Mtub39、QUB26、QUB4156位点多态性与菌株蛋白质谱的差异有关,3个位点可能具有调控菌株蛋白质谱构成的作用。