厦门地区婴幼儿腹泻诺如病毒分子流行病学研究

目的:了解厦门地区婴幼儿腹泻诺如病毒(NV)分子流行病学特征。方法:收集2010年5月～2011年4月全年轮状病毒抗原阴性的急性非细菌性腹泻标本,用实时荧光RT-PCR法扩增NV ORF1-ORF2结合区,测序扩增片段后进行比对、分型及构建系统进化树。结果:全年共获得366份标本,共检测出81份为NV阳性标本,其中GI组5例,GII组76例;NV在厦门地区全年可见散发,但在每年7和11月有明显的流行高峰,且腹泻感染患儿主要集中在3岁以下;已分型的NV基因组(55例)以GII-4/2006b占绝对优势,其构成比达60.00%(33/55),其余为GII-3占25.45%(14/55),GII-6占5.45%(3/55),GII-2占3.64%(2/55),此外GII-12、GI-4、GI-5各占1.81%(1/55)。结论:厦门地区NV夏秋季发病率较高,GII-4/2006b变异株为优势株,且感染的NV可能存在病毒重组。     

厦门地区婴幼儿腹泻诺如病毒的基因分型研究

目的:了解厦门地区婴幼儿腹泻诺如病毒(Norovirus,NV)分子流行病学特征。方法:收集2010年5月-2011年4月全年轮状病毒抗原阴性的急性非细菌性腹泻标本,用实时荧光RT-PCR法扩增NV ORF1-ORF2结合区,测序扩增片段后进行比对、分型及构建系统进化树。结果:全年共获得366份标本,共检测出81份为NV阳性标本,其中GI组5例,GII组76例,NV在厦门地区全年可见散发,但在每年7月和11月有明显的流行高峰,且腹泻感染患儿主要集中在3岁以下患儿,已分型的NV基因组(55例)以GII-4/2006b占绝对优势,其构成比达60.00%(33/55),其余为GII-3占25.45%(14/55),GII-6占5.45%(3/55),GII-2占3.64%(2/55),此外GII-12、GI-4、GI-5各占1.81%(1/55)。结论:厦门地区NV夏秋季发病率较高,GII-4/2006b变异株为优势株,且感染的NV可能存在病毒重组。     

北京地区诺如病毒分子生物学特点初步研究

目的了解北京地区诺如病毒的分子生物学特点。方法收集北京市2007年1—3月非细菌性胃肠炎暴发和散发病例，采集患者粪便标本，使用逆转录聚合酶链反应（RT—PCR）对粪便标本进行诺如病毒RNA检测，对RT—PCR阳性标本的PCR产物进行克隆测序。结果检测38例粪便标本，共有27例阳性。随机选择其中4例PCR产物进行克隆测序，获得4株诺如病毒序列进行比对分析，结果显示，该4株病毒序列与诺如病毒GⅡ／4型参考株同源性最高，其中与荷兰和日本提交的诺如病毒GⅡ／4型变异株最为接近，同源性分别为97．8％～98．5％和95．2％～95．9％。系统发生树分析表明，该4株诺如病毒与荷兰、日本流行的GⅡ／4型变异株处于同一分支上。结论北京地区存在诺如病毒GⅡ／4型变异株流行，其与2006年荷兰和日本的诺如病毒流行株属同一类GⅡ／4型变异株。     

北京地区79例婴幼儿诺如病毒腹泻的临床特点分析

目的分析婴幼儿诺如病毒腹泻的发病特点，为临床诊断提供依据。方法对2002年1月至2006年12月在首都儿科研究所附属儿童医院就诊的318例急性腹泻患儿采集粪便标本，用酶联免疫吸附试验（ELISA）检测粪便诺如病毒抗原，同时用聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE）检测轮状病毒。结果经检测的318份粪便标本中，诺如病毒阳性标本共79份，阳性检出率为24．8％（79/318）。其中有48例在10-12月份检出，占阳性标本的60．8％（48/79）。2岁以内患儿占91．2％。有16例同时合并轮状病毒感染。经统计学分析，轮状病毒混合感染组与单纯诺如病毒感染组在发热的严重程度上有差异，但是在腹泻严重程度上的差异无统计学意义。诺如病毒阳性患儿中有14例是以其他疾病住院，分别于住院1-11d出现腹泻。结论诺如病毒是引起婴幼儿急性腹泻的病原之一，也是医院内感染性腹泻的病因之一。     

天津市婴幼儿病毒性腹泻诺如病毒检测

目的研究天津市秋冬季婴幼儿腹泻患儿中诺如病毒感染的流行情况及其基因型别。方法 2008年10-12月收集天津市儿童医院住院部310例疑似病毒性腹泻的婴幼儿粪便标本,应用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)法检测粪便中诺如病毒核酸,并将部分阳性株的PCR产物进行测序,采用序列分析软件分析测序结果 ,推断其毒株型别。结果 310份腹泻标本中,诺如病毒RT-PCR阳性37份(GII型37份,GI型0例),检出率为11.94%;23份PCR产物送往测序,经Genebank Blast及系统进化树分析,所有诺如病毒均为诺如病毒基因组Ⅱ型,其中GII-4/2006b占95.65%(22/23),GII-3占4.35%(1/23);感染诺如病毒的患儿多为1岁以下,且11月份检出率最高。结论诺如病毒是天津市秋冬季婴幼儿病毒性腹泻的重要病原体,2008年诺如病毒以GII-4/2006b型毒株流行为主。     

山东省济宁市病毒性腹泻样本诺如病毒分子流行病学与基因特征分析

目的 了解山东省济宁市诺如病毒的分子流行病学特征及诺如病毒的优势基因型,为诺如病毒感染防控提供科学依据。方法 按照《山东省病毒性腹泻监测方案》,2018年1月-2020年12月从山东省济宁市每县(市、区)每月采集3～5份病毒性腹泻标本,进行流行病学调查,采用Real time RT-PCR方法检测诺如病毒GI/GⅡ组,对阳性样本进行基因型别鉴定。结果 共采集粪便标本1 230份,诺如病毒阳性165份(其中GⅠ8份、GⅡ157份),检出率为13.41%(165/1 230)。每年除2月份外,其他月份均检出诺如病毒,以6月、7月检出率高。基因型分别为GⅡ.4型25份,占32.05%;GⅡ.2型18份,占23.08%;GⅡ.6型14份,占17.95%;GⅡ.3型13份,占16.67%。3年间优势毒株不同,2018年为GⅡ.3型9份,占69.23%;2019年为GⅡ.2型14份,占43.75%;2020年为GⅡ.4型17份,占53.13%。结论 山东省济宁市诺如病毒感染6月和7月流行强度较强,以GⅡ组为主,基因型存在多样性,处于动态变化中,以GⅡ.2[P16]型和GⅡ.4[P31]型为主要型别...     

2016 - 2017年宁夏地区急性腹泻患者中诺如病毒的流行特征分析

目的 了解宁夏地区急性腹泻患者中诺如病毒的流行特征。方法 2016 - 2017年在宁夏5个市10家哨点医院门诊收集符合纳入条件的腹泻标本2 334例,采用实时荧光定量RT - PCR方法进行定性检测,采用RT - PCR分别对GⅡ型阳性NoV标本的RdRp区和VP1区进行扩增、测序,并进行基因分型及进化树构建。结果 2 334例粪便标本中（男性1 343例,女性991例）,诺如病毒总阳性率为15.68%（366/2 334）,GⅠ型阳性率0.86%（20/2 334）,GⅡ型阳性率为14.82%（346/2 334）;10～20岁年龄组阳性率最高,为27.19%（31/114）,其次为0～2岁年龄组,为18.12%（251/1385）,50～60岁年龄组阳性率最低,为5.48%（4/73）;冬春季发病率高。序列分析显示,GⅡ型NoV的RdRp区序列分为5种亚型,依次为GⅡ.Pe、GⅡ.P12、GⅡ.P16、GⅡ.P17和GⅡ.P7;VP1区序列分为6种亚型,依次为GⅡ.4 Sydney_2012、GⅡ.3、GⅡ.2、GⅡ.1、GⅡ.17和GⅡ.6。结论 2016 - 2017年宁夏地区GⅡ型NoV存在多种基因型感染,RdRp区以GⅡ.Pe和GⅡ.P12为主,VP1区以GⅡ.4 Sydney_2012、GⅡ.3为主。     

南宁市散发性腹泻诺如病毒分子流行病学分析

目的 研究广西南宁市散发性腹泻病例中诺如病毒( norovirus,NV)感染的分子流行病学特征.方法 对2007年1月- 2008年12月南宁市某医院门诊696例散发腹泻病例进行流行病学资料分析,并应用实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应对其粪便标本进行NV及其基因组别检测;随机选择部分阳性标本进行核苷酸序列测定和遗传进化树分析,确定基因型.结果 在696份粪便标本中,NV核酸检测阳性183份,总阳性率26.30％,其中180份(98.36％)属于基因Ⅱ组(genogroupⅡ,GⅡ),另外3份(1.64％)为基因Ⅰ组(GⅠ);随机选择30株GⅡ组NV进行核苷酸序列分析,绝大多数属于GⅡ.4基因型(26株),其余为GⅡ.12(2株)、GⅡ.7(1株)、GⅡ.16(1株);3株GⅠ组NV分属于GⅠ.2、GⅠ.4、GI.8型;NV所致散发性腹泻在冬春季节呈现高发.NV阳性检出率无性别和年龄组差异.结论 NV是南宁市散发性腹泻病例的主要病原体,优势毒株为GⅡ.4型,同时存在多种其他基因型感染.     

一起诺如病毒感染性腹泻暴发的调查

2007年7月初,江西省某高校出现多例感染性腹泻患者,后被证实由诺如病毒(NV)感染引起,是江西省首起经实验室确认的NV感染性腹泻暴发疫情,现将调查结果报道如下.     

杭州地区2014-2015年急性胃肠炎患者感染诺如病毒的流行病学特征分析

目的 了解2014-2015年杭州地区急性胃肠炎患者中诺如病毒的流行病学特征。方法 收集1 109份急性胃肠炎患者的临床流行病学资料和粪便样本,采用一步法双重荧光RT-PCR对样本中诺如病毒(GⅠ、GⅡ型)进行初筛,然后随机选择诺如病毒阳性的样本核酸进行多重RT-PCR扩增,对产物进行测序分析。结果 1 109份的粪便样本中,诺如病毒检出率为26.87%(298/1 109),以GⅡ亚型为主,占25.52%(283/1 109),GⅠ亚型占1.35%(15/1 109);不同性别人群诺如病毒检出率差异无统计学意义(P>0.05);不同年龄组人群中诺如病毒检出率分别为16.94%(<5岁)、19.45%(5~18岁)和32.26%(≥18岁);全年均可检出诺如病毒感染,高发季节为12月至次年3月,阳性率为29.67%~37.08%。序列分析显示,GⅡ基因亚型中以GⅡ-4/Sydney株为主(46.43%,13/28),其次为GⅡ-4/2006b株;GⅠ基因亚型中以GⅠ-1亚型为主(55.56%,5/9)。结论 诺如病毒是导致2014-2015年杭州地区急性胃肠炎的主要病原之一,GⅡ基因亚型特别是GⅡ-4/Sydney变异株和GⅡ-4/2006b变异株是该地区流行的优势毒株。     

北京市某医院院内感染Noro病毒胃肠炎的调查

目的了解Noro病毒感染引起医院内暴发集体腹泻的临床特点。方法分析一起18例医院内暴发腹泻患者的流行病学和临床资料,同时对每例患者粪便标本进行细菌培养,随机选择7例粪便标本用抗原检测和聚丙烯酰胺凝胶电泳进行轮状病毒RNA检测;用逆转录-聚合酶链反应检测Noro病毒核酸以确定感染的病原,分析感染患者的临床特点和易感因素。结果发病者多为老年合并多种基础疾病;腹泻主要为稀水便(12/18,66.67%),个别为黏液稀便(3/18,16.67%);大部分粪便常规检测正常(10/18,55.56%),个别见少量白细胞(3/18,16.67%)和潜血弱阳性(4/18,22.22%);全部粪便标本细菌学培养阴性;轮状病毒RNA检测阴性;3份标本中检出Noro病毒核酸,阳性率为42.86%(3/7)。结论Noro病毒是此次医院内集体暴发腹泻的重要病原之一,尤其多见于有基础疾病、体弱的老年患者。     

深圳地区2006年诺如病毒分子流行病学研究

诺如病毒是世界范围内引起急性胃肠炎的主要病原体,1990年首次证实我国也存在该病毒引起的感染[1],此后北京、长春、河北、兰州、广州、福州等地均发现存在诺如病毒感染,表明我国急性胃肠炎病例诺如病毒感染亦相当普遍.本研究对2006年深圳地区急性胃肠炎中诺如病毒进行分子生物学研究.     

病毒性腹泻的流行病学研究进展

本文对病毒性腹泻的病原学、流行病学、疾病负担、预防和控制的研究进展进行综述,为更好地开展疾病防控提供依据.     

Genetic diversity of noroviruses in Chinese adults: Potential recombination hotspots and GII-4/Den Haag-specific mutations at a putative epitope

Little is known about the role of noroviruses (NVs) in sporadic cases of acute gastroenteritis in adults. The GII-4 NVs are currently the globally dominant genotype with diverse genetic makeups. The mechanism(s) underlying the persistence and rapid evolution of the viruses are not yet clear. In this study we collected 547 specimens from adult of >14 years of age with acute gastroenteritis in Beijing, China from September 2007 to Febraury 2008. NVs were screened and sequenced to determine their genotypes. Bioinformatics methods were used to detect NV recombination and their breakpoints. The residue variations of the capsid proteins between GII-4/Den Haag and previous predominant variants of GII-4 were compared to identify mutations that are likely important for current epidemic wave. Putative epitopes were predicted based upon the crystal structure. 106 (19.4%) NVs were identified among 547 specimens. While GII-4 remains predominant, at least six other genotypes were observed. Two recombinant types were identified with both predicted breakpoints locating within the 24–27 bp region upstream the start codon of ORF2. We found the emergent mutations H414P/Q of the capsid protein are specific for GII-4/Den Haag and this site lies within a predicted antibody-binding epitope. Our data demonstrated that NVs were an important cause of acute gastroenteritis in Chinese adults. The shared breakpoints identified in the GI and GII recombinants imply the presence of recombination hotspots in NVs. The mutations at residue 414 and its location within a putative antigenic epitope suggested a possible mechanism that may allow GII-4 NVs to escape from herd immunity.     

承德市2006年麻疹野病毒株的基因分型及流行特点分析

目的研究麻疹病毒分离及其分子流行病学特征。方法对承德市2006年采集的麻疹疑似病例咽拭子标本检测结果和个案资料进行分析。结果2006年河北省疾病预防控制中心麻疹实验室在承德市分离到16株麻疹野病毒,均属H1a基因亚型,16例患者15例采集了血标本,其中11例麻疹IgM抗体阳性(73.33%)。16株病毒来自30～45岁、1～6岁和4～10月龄患者;分布于6个县(区);2例为爆发病例,14例为散发病例;15例为出疹3d内采集的标本。结论承德市2006年流行的麻疹病毒均为H1a基因亚型,与国内流行的麻疹病毒优势基因型一致,为消除麻疹提供了科学依据。     

2012-2015年湖北省麻疹病毒基因测定分析

目的：通过对2012—2015年湖北省麻疹病毒流行株的基因型别和特征进行分析,了解湖北省麻疹病毒流行株基因特点,为制定消除麻疹策略提供依据。方法选取2012—2015年湖北省麻疹病例咽拭子标本126份,提取病毒核酸,对其中86份核酸阳性标本通过RT－PCR扩增麻疹病毒N基因并进行序列测定,对病毒基因型别进行分析。结果通过基因测序定型发现2012—2015年湖北省麻疹病毒基因型主要为 H1a亚型,仅发现一例 D8亚型,2例麻疹病毒疫苗株 A 基因。结论2012—2015年湖北省麻疹病毒主要为H1a基因亚型,首次发现一例麻疹D8基因亚型,存在少数疫苗相关病例。建议进一步加强麻疹病毒基因型别监测,实时了解全省麻疹病毒基因型别变化特征,为中国消除麻疹行动计划提供科学依据。