肺癌E-cadherin基因启动子CpG岛甲基化与蛋白表达的关系及其意义

背景与目的：目前认为CpG岛甲基化导致转录抑制是恶性肿瘤发生的重要机制之一.E-cadherin能抑制肿瘤细胞的浸润和转移,被公认为是浸润、转移抑制基因.本研究检测肺癌组织中E-cadherin基因启动子CpG岛甲基化的状况,并探讨基因异常甲基化与蛋白表达的关系及其意义.方法：采用甲基化特异性PCR技术,检测22例肺癌组织,相应的癌旁组织和9例正常肺组织中E-cadherin基因启动子CpG岛甲基化的状况.采用免疫组化S-P法相应检测了E-cadherin蛋白的表达.结果：肺癌中E-cadherin基因启动子CpG岛完全甲基化率为13.6%（3/22）,部分甲基化率为27.3%（6/22）,总甲基化率为40.9%（9/22）,显著高于相应癌旁组织中该基因的甲基化率9.1%（2/22） （P＜0.05）.9例正常肺组织中未检测到此基因的甲基化（0/9）.22例癌组织中E-cadherin蛋白表达减弱或缺失率59.1%（13/22）,显著高于相应癌旁组织蛋白表达减弱缺失率27.3%（6/22）.肺癌组织中发生甲基化者蛋白表达率及强度明显低于未甲基化者.结论：肺癌组织中存在E-cadherin基因启动子CpG岛的异常甲基化,E-cadherin基因启动子CpG岛的异常甲基化可能是E-cadherin蛋白表达下调的主要原因.     

胃癌E-cadherin基因启动子CpG岛甲基化的研究

背景与目的:目前认为CpG岛甲基化导致转录抑制是恶性肿瘤发生的重要机制之一。E-cadherin能抑制肿瘤细胞的浸润和转移,被公认为是浸润、转移抑制基因。低分化胃癌常表现有E-cadherin基因失活。我们通过检测胃癌及癌旁组织中E-cadherin基因启动子CpG岛甲基化水平,初步探讨胃癌的发病机制。方法:采用特异性甲基化PCR(MSP)法检测51例胃癌组织及37例癌旁组织中的E-cadherin基因启动子CpG岛甲基化水平,采用免疫组织化学染色法检测E-cadherin表达。结果:健康对照组织中未检测到CpG岛甲基化,4例(10.8%)癌旁组织检测到CpG岛甲基化,32例(62.7%)胃癌组织中检测到CpG岛甲基化。低分化腺癌(72.2%,26/36)CpG岛甲基化显著高于高分化腺癌(33.3%,6/15)(P<0.01),T1/T2期(55.6%,10/18)与T3/T4期胃癌(66.7%,22/33)的CpG岛甲基化率无显著性差异(P>0.05)。32例CpG岛甲基化胃癌中27例(84.5%)E-cadherin表达下调,19例非甲基化胃癌中5例(26.3%)E-cadherin表达下调。未发现E-cadherin基因CpG岛甲基化与幽门螺杆菌感染有关。结论:胃癌、尤其是低分化腺癌广泛存在E-cadherin基因启动子CpG岛甲基化,启动子CpG岛甲基化可能参与胃癌的早期过程,E-cadherin基因CpG岛甲基化与幽门螺杆菌感染无相关关系。     

耐紫杉醇人肺腺癌A549细胞株中BRCA1基因启动子CpG岛甲基化的研究

目的检测耐紫杉醇人肺腺癌A549细胞株(A549/Taxol)中BRCA1基因启动子CpG岛甲基化状态,探讨A549/Taxol细胞对紫杉醇的耐药机制。方法应用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)技术,检测耐紫杉醇人肺腺癌A549细胞株BRCA1基因启动子CpG岛甲基化状态。结果 A549/Taxol细胞存在BRCA1基因异常甲基化,呈部分甲基化。结论 A549/Taxol细胞存在BRCA1基因异常甲基化,可能是A549/Taxol细胞对紫杉醇耐药的机制之一。     

食管癌中hMSH2启动子区CpG岛过甲基化研究

[目的]探讨hMSH2甲基化在食管癌发生发展中的作用。[方法]应用实时荧光甲基化特异性聚合酶链反应(real-time MSP)分别检测130例食管癌患者癌组织及癌旁正常组织中hMSH2甲基化情况,并分析其与临床病理等参数及预后之间的关系。[结果]在130例原发性食管癌组织中,hMSH2甲基化的有63例(48.5%),与之相对应的癌旁正常组织中甲基化的有18例(13.8%)(P<0.05)。hMSH2高甲基化分别与患者的年龄、肿瘤远处转移及不良预后有关(P<0.05),而与患者性别、淋巴结转移及临床分期等无关(P>0.05)。[结论]hMSH2高甲基化是食管癌频发的分子事件,也是导致其错配修复功能缺陷的重要原因之一。hMSH2基因启动子区甲基化可能在老龄化及食管癌的发生发展过程中发挥重要作用,是一个潜在的预后相关因子。     

应用CpG岛芯片技术分析人肝癌细胞株CpG岛甲基化差异基因

目的 在全基因组水平研究与肝细胞癌发生及转移相关的cpc岛甲基化谱型改变.方法 采用加拿大University Health Network芯片中心的12K人CpG岛芯片,对多系列人肝癌细胞株HepB、HepG2、PLC/RPF/5/RPF/5、SMMC-7721、BEL-7402、MHCC97-H、MHCC97-L、HCCLM3和HCCLM6进行全基因组CpG岛甲基化差异扫描,以Chang's liver细胞株为对照.其中MHCC97系列细胞株(MHCC97-H、HCCLM3、HCCLM6)均以低转移潜能细胞株MHCC97-L作为对照,筛选转移潜能相关差异基因.对数据进行归一化处理及聚类分析,筛选出具有甲基化差异的基因,并随机选取2个基因进行甲基化特异性PCR(MSP)验证.结果 以Cy5/cy3≥2或者≤0.5为差异显著性标准,筛选出9个肝癌细胞株中差异表达趋势一致的CpG岛差异甲摹化位点58个,其上下游肿瘤相关基因66个,包括抑癌基因及其配体基因、凋亡基因及抗凋亡基因、细胞增殖分化基因、细胞周期相关基因、细胞信号通路关键基因等.MHCC97系列高转移潜能细胞株MHCC97-H、HCCLM3和HCCLM6筛选出转移潜能相关CpG岛甲基化差异位点分别为16、13和6个,肿瘤相关基因分别为24、16和6个.MSP验证与芯片结果相符.结论 在肝癌的发生、发展过程中,存在一系列关键基因CpG岛甲基化改变.在肝癌细胞株中,抑癌基因及相关信号通路关键基因可能由于其启动子区CpG岛高甲基化而表达下调,而促癌基因及相关信号通路关键基因可能由于其启动子区CpG岛低甲基化而上调表达.     

肝癌细胞系中肝癌转移相关候选基因启动子区域CpG岛甲基化和表达水平的相关性研究

背景与目的：DNA甲基化被认为是反映细胞内DNA转录状态的重要表观遗传学标记。本研究旨在对启动子区域CpG岛的甲基化与基因转录水平的相关性进行评估。方法：采用甲基化特异性PCR的方法确定7个与肝癌转移相关的候选基因的启动子区域在6个肝细胞系(包括5个肝癌源性的)中的甲基化状态,并通过半定量PCR的方法确定6个基因稳定态的mRNA水平。结果：仅有纯合和杂合去甲基化的基因状态得到发现。RT-PCR分析表明除了OXCT基因在其处于杂合去甲基化状态的HepG2和HCCLM3细胞中不表达,在其他的情况下,7个候选基因均有表达。讨论：本研究中的7个肝癌转移相关基因的甲基化状态仅在细胞系中部分的反映了基因的转录状态,提示其它转录调控机制的存在。     

甲基化特异性PCR检测肺癌p16基因甲基化及其临床意义

目的：探讨甲基化特异性聚合酶链反应(methylation—specific PCR，MSPCR)在肺癌临床诊断中的应用价值。方法：选取56例肺部疾病住院患者手术切除的病变肺组织和相应的支气管肺泡灌洗液(BALF)及痰标本，其中32例为肺癌．24例为良性肺部疾病。标本经一般处理，PCR扩增后，产物经电泳EB染色，紫外灯下观察。结果：32例肺癌组织标本中，14例(43．8％)在p16基因启动子区域呈现异常甲基化，其中9例(643％)在相应的BALF中检测出甲基化存在。5例(35．8％)在相应的痰标本中也检测出甲基化存在。24例良性肺部疾病，其中肺囊肿10例，肺结核14例。手术切除标本和BALF及痰标本中均未检测出p16基因甲基化存在。结论：MSPCR技术对肺癌患者BALF及痰标本中的异常甲基化检测具有高度特异性，是一项有潜力的肺癌早期诊断新技术。     

四种肿瘤细胞p16基因CpG岛甲基化的检测

目的:检测4种肿瘤细胞系中p16基因CpG岛甲基化的状况。方法:利用甲基化特异性PCR(MSP)检测了4种肿瘤细胞(SPC-A1、BIU-87、T24、Hep-G2)的甲基化状况。结果:除BIU-87外,其它3种肿瘤细胞p16基因都有不同程度的甲基化。结论:p16基因CpG岛的甲基化与肿瘤的发生、发展关系密切。     

CDKN2／p16基因5‘—CpG岛SmaⅠ位点甲基化与肺癌的关系

目的 研究ＣＤＫＮ２／ｐ１６基因５’端调控序列ＣｐＧ岛甲基化的状态与肺癌发生发展的关系。方法 采用对甲基化敏感的核酸内切酶ＳｍａⅠ,酶切基因组ＤＮＡ的方法,对８９例肺癌标本和１０例正常肺组织的ＣＤＫＮ２／ｐ１６,基因进行Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交分析。结果 ８９例肺癌中,ＣＤＮＫ２／ｐ１６基因甲基化１５例,甲基化频率为１６．９％。４２例ｐ１６蛋白阴性的肺癌患中,有１２例发生甲基化,甲基化频率为２８．６％;另有４７例ｐ１６蛋白阳性患中仅有３例发生甲基化。１０例正常肺组织中均未发现ＣＤＮＫ２／ｐ１６基因有甲基化现象。结论 ＣＤＮＫ２／ｐ１６基因５’端ＣｐＧ岛甲基化是该基因失活的重要机制,是肺癌细胞区别于正常细胞的分子事件之一,可能参与肺癌的发生发展过程。     

甲基化特异性PCR检测肺癌p16基因甲基化及其临床意义

目的:探讨甲基化特异性聚合酶链反应(methylation-specific PCR,MSPCR)在肺癌临床诊断中的应用价值.方法:选取56例肺部疾病住院患者手术切除的病变肺组织和相应的支气管肺泡灌洗液(BALF)及痰标本,其中32例为肺癌,24例为良性肺部疾病.标本经一般处理,PCR扩增后,产物经电泳EB染色,紫外灯下观察.结果:32例肺癌组织标本中,14例(43.8%)在p16基因启动子区域呈现异常甲基化,其中9例(64.3%)在相应的BALF中检测出甲基化存在,5例(35.8%)在相应的痰标本中也检测出甲基化存在.24例良性肺部疾病,其中肺囊肿10例,肺结核14例,手术切除标本和BALF及痰标本中均未检测出p16基因甲基化存在.结论:MSPCR技术对肺癌患者BALF及痰标本中的异常甲基化检测具有高度特异性,是一项有潜力的肺癌早期诊断新技术.     

FHIT基因甲基化检测对肺癌早期诊断的临床意义

目的探讨人原发性肺癌中FHIT基因启动子区的甲基化状态及其临床意义。方法采用甲基化特异性聚合酶链技术（MSP）,对59例人原发性肺癌组织（肺癌组）、32例肺正常组织（正常组）、15例癌旁组织（癌旁组）及11例支气管鳞状化生组织进行FHIT基因5’-CpG岛甲基化状况检测,甲基化阳性标本采用基因克隆测序技术进行序列测定。结果肺癌组、癌旁组和正常组的FHIT基因甲基化率分别为37．3％（22／59）、20．0％（3／15）、0（0／32）,三组相比差异有统计学意义（P〈0．01）;支气管鳞状化生组织的甲基化阳性率为18．1％（2／11）。FHIT基因甲基化率肺癌吸烟者与非吸烟者差异无统计学意义（P〉0．05）。FHIT甲基化扩增产物测序结果显示,所有CpG岛中的胞嘧啶均保持不变,而CpG岛二核苷酸以外的胞嘧啶经过PCR扩增后,则被胸腺嘧啶取代。结论FHIT基因5’-CpG岛甲基化参与了肺癌的演变,可能在肺癌发生的早期阶段,采用MsP方法进行FHIT甲基化检测,可能对肺癌的早期诊断具有一定的临床意义。     

凝血栓蛋白1基因异常甲基化与大肠腺癌关联

目的 探讨凝血栓蛋白l（THBS1）基因启动子CpG岛异常甲基化与大肠腺癌及其临床病理特征的关联。方法 THBS1基因甲基化状态用甲基化特异性PCR检测。结果 大肠腺癌、癌旁组织中，THBSI基因启动子cpG岛甲基化率的差异有显著性（X^2=5．93，P=0．025）；老年患者肿瘤组织中THBS1基因甲基化率明显商于非老年患者（X^2=5.68，P=0．017），直径≥3cm的肿瘤组织中THBSl基因甲基化率显著高于直径〈3cm的肿瘤（X^2=4．16，P=0．041），C期和D期肿瘤组织中THBS1基因甲基化率显著高于A期或B期肿瘤（X^2=8．04，u=2，P=0．018）。结论 THBS1基因甲基化与大肠腺癌的发生有关，肿瘤以老年、晚期和直径较大的肿瘤多见。     

大肠癌组织p16基因甲基化与临床病理特征的关系

目的：研究p16基因启动子CpG区甲基化的改变与大肠癌发生及其临床病理特征的关系。方法：采用甲基化特异PCR技术（MSP法）研究大肠癌组织p16基因甲基化,并分析其与临床病理特征的关系。结果：30例大肠癌组织中有12例（40．0％）呈p16CpG区甲基化阳性。DukesC、D期组织p16CpG区甲基化发生率明显高于DukesA、B期。有转移的大肠癌组织p16甲基化发生率（84．6％）明显高于无转移者（5．9％）。结论p16启动子区甲基化导致p16抑癌基因失活,参与大肠癌的发生和发展。大肠癌组织p16CpG区甲基化与Dukes分期、肿瘤转移有关。p16甲基化可作为评估大肠癌患者预后的1个指标。     

RKIP PTEN基因启动子区甲基化与肺癌的关系

探讨RKIP基因和PTEN基因启动子区甲基化与肺癌及其临床病理特征的关系。方法：采用甲基化特异性PCR（MSP）法,分析肺癌组织及相应癌旁正常肺组织中RKIP和PTEN启动子区甲基化表达情况。结果：45.8%（38/83）的肺癌组织和13.3%（11/83）的癌旁肺组织RKIP基因启动子区发生甲基化,51.8%（43/83）的肺癌组织和15.7%（13/83）的癌旁肺组织PTEN基因启动子区发生甲基化,癌组织中RKIP和PTEN启动子区甲基化率显著增高（P<0.05）;发生淋巴结转移的43例肺癌组织中,27例RKIP基因启动子区发生甲基化,30例PTEN基因启动子区发生甲基化,淋巴结转移组RKIP及PTEN基因启动子区甲基化均显著高于无淋巴结转移组（P<0.05）。结论：肺癌中RKIP和PTEN基因启动子区甲基化,可能是肺癌发生、发展及转移的重要原因之一。     

食管癌细胞系中MT-3基因CpG岛甲基化的意义

目的研究食管癌细胞系中MT-3基因CpG岛甲基化与其mRNA表达的关系。方法选取4种食管癌细胞系OE21，OE19，OE33和TE7，经重亚硫酸钠处理后，采用限制性酶切图谱分析(COBRA)和逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术，在DNA甲基转移酶抑制剂5-氮2^ -脱氧胞苷(5-aza-CdR)处理前后，对其MT-3基因CpG岛的甲基化情况及mRNA的表达情况进行对比研究。结果4种食管癌细胞系的MT-3基因均存在不同程度的CpG岛超甲基化。经5-aza-CdR处理后，超甲基化状态解除，mRNA的表达水平也较处理前明显提高(P=0.002)。结论食管癌细胞系中MT-3基因CpG岛的超甲基化可抑制其mRNA表达。当其超甲基化解除后，MT-3基因的mRNA表达水平也会相应升高。     

大肠癌组织中unc5c基因启动子甲基化的分析

目的分析大肠癌(colorectal cancer,CRC)组织中unc5c基因启动子区域甲基化的改变状况及其临床意义。方法运用甲基化特异性PCR技术,检测73例大肠癌患者手术切除的癌组织和相应的癌旁组织及28例正常组织、36例腺瘤患者手术切除的腺瘤组织中unc5c基因启动子区域甲基化的改变情况,并分析与临床病理特征之间的关系。结果73例癌组织样本中甲基化检出率为75％(55/73),相应的癌旁组织为7％(5/73),腺瘤组织为63％(23/36),而正常组织中未检出unc5c基因甲基化。unc5c基因甲基化检出率与年龄、分化程度及TNM分期有关。结论检测unc5c基因启动子区域异常甲基化是大肠癌早期辅助诊断的分子标志物之一。