A Longitudinal Survey for Genome-based Identification of SARS-CoV-2 in Sewage Water in Selected Lockdown Areas of Lahore City,Pakistan: A Potential Approach for Future Smart Lockdown Strategy

In 2019, the newly emerged SARS-CoV-2 virus caused pneumonia-like illness. The disease rapidly spread globally, leading to a worldwide outbreak referred to as the COVID-19 pandemic. The affected patients show symptoms of fever, dry cough, respiratory distress, myalgia, and gastrointestinal disturbance. As of April 5, 2021, 132,083,022 people worldwide were affected by COVID-19, while 2,868,454 people died due to the disease[1]. SARS-CoV-2-positive patients may remain asymptomatic or start showing symptoms in 2?14 days after exposure to the virus[2]. The viral infection can be diagnosed from nasopharyngeal, throat, alveolar lavage, lacrimal, blood, and stool samples. The patient starts shedding the virus in stool regardless of being symptomatic or asymptomatic, which makes sewage-based detection of the virus to be more beneficial in the early infection stage.     

从一对夫妻患者的诊治过程探讨2019冠状病毒病(COVID-19)疑似患者的管理

观察2例2019冠状病毒病（COVID-19）疑似患者诊断、治疗以及隔离管理的过程,结合文献分析COVID-19疑似患者的临床特征和管理重点。COVID-19是由严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）感染所致的疾病,SARS-CoV-2具有很强的传染性,甚至无症状感染者也可能传播病毒。SARS-CoV-2可通过接触传播、飞沫传播,并可能通过气溶胶传播。在临床发热门诊的患者管理中,准确识别并管理好疑似患者,采取严格的隔离措施,对院内感染的防控极为重要。     

支气管镜技术在新型冠状病毒肺炎诊断中的应用及相关职业防护

由严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）引起的新型冠状病毒肺炎（COVID-19）已发展为全球大流行,对民众健康和经济发展造成严重影响。本文总结了SARS-CoV-2首次分离、鉴定样本的来源及病毒RNA病原学检测过程中存在的问题,探讨了支气管镜技术应用于COVID-19诊断的必要性和局限性,阐述了在对COVID-19患者进行支气管镜操作中的职业防护措施,提出加快研发支气管镜操作相关的一次性防护装置的重要性。     

SARS-CoV-2溯源新进展

从2019年12月~2020年11月19日,COVID-19大流行已导致全球55 928 327例确诊病例,造成1 344 003人死亡。但是,我们对这次疫情的病原体-新型冠状病毒（SARS-CoV-2）的来源仍然未了解清楚。本综述总结和分析SARS-CoV-2溯源研究进展,为进一步的研究提供启示。现有证据表明SARS-CoV-2有可能是在40~70年前由蝙蝠冠状病毒分化而来;该病毒在进化过程中同时存在多种变异及自然选择现象,病毒基因不同区域可能发生不同变异并受到不同的选择压力,这些都增加了病毒溯源的困难性;有多种动物被认为可能是SARS-CoV-2的宿主,包括猫、狮子、老虎、狗、水貂等;SARS-CoV-2可能可由人类传播给动物,且该病毒也可以在动物间互相传播;现有证据不支持该病毒的源头是中国。我们仍未清楚该病毒如何传播到人类,仍然需要更多的研究去探索SARS-CoV-2的来源、宿主、中间宿主及其跨物种传播的机制。     

Antiviral,immunomodulatory, and anticoagulant effects of quercetin and its derivatives: Potential role in prevention and management of COVID-19

The coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infection has caused a devastating health crisis worldwide. In this review, we have discussed that prophylactic phytochemical quercetin supplementation in the form of foods or nutraceuticals may help manage the COVID-19 pandemic. The following evidence supports our argument. First, nuclear factor erythroid-derived 2-like 2 (NRF2) agonists abrogate replication of SARS-CoV-2 in lung cells, and quercetin is a potent NRF2 agonist. Second, quercetin exerts antiviral activity against several zoonotic coronaviruses, including SARS-CoV-2, mainly by inhibiting the entry of virions into host cells. Third, inflammatory pathways activated by nuclear factor kappa B, inflammasome, and interleukin-6 signals elicit cytokine release syndrome that promotes acute respiratory distress syndrome in patients with COVID-19, and quercetin inhibits these pro-inflammatory signals. Fourth, patients with COVID-19 develop thrombosis, and quercetin mitigates coagulation abnormalities by inhibiting plasma protein disulfide isomerase. This review provides a strong rationale for testing quercetin for the management of COVID-19.     

新型冠状病毒肺炎患者围手术期处理策略与要点

新型冠状病毒肺炎（COVID-19）已发展成全球大流行,对公共卫生安全造成严重威胁。由于其病原体严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）可通过飞沫、接触等途径在人与人之间传播,疑似或确诊COVID-19患者在手术室或ICU接受治疗时,如何在实施全面有效治疗的过程中避免病毒进一步播散成为医务人员关注的重点与难点。本文针对SARS-CoV-2的传播特征、围手术期特殊环境及特定操作下的疾病处理和感染控制措施展开讨论。     

新型冠状病毒肺炎的流行病学、临床治疗与疫情防控

本文系统介绍新型冠状病毒肺炎的病原学、流行病学、传播动力学、临床特征、治疗及防控等多个领域的最新研究进展,同时比较新型冠状病毒与严重急性呼吸综合症冠状病毒、中东呼吸综合症冠状病毒及H1N1流感病毒所致疫情特征的异同。新型冠状病毒的原始宿主可能为蝙蝠,患者和无症状感染者为传染源,可借助飞沫和接触途径进行人际传播,人群普遍易感。患者临床症状主要表现为发热和咳嗽,伴有白细胞和淋巴细胞减少,但目前尚无特效治疗药物。防控策略上,一方面应着力研发疫苗开展一级预防;另一方面继续贯彻对患者和密切接触者的隔离、佩戴口罩、及时进行公共场所消毒,同时大力研发快速检测试剂盒,实现对疾病的血清学监测,开展早发现、早诊断、早隔离、早治疗的二级防控策略。此外,应着力降低人群对疾病恐慌、加强防疫宣传与健康教育,共同防控疫情蔓延。     

全球自然感染SARS-CoV-2人群的抗体水平研究

新型冠状病毒肺炎（COVID-19）已蔓延至全球二百二十多个国家和地区,造成了全球大流行。通过SARS-CoV-2的特异性抗体的血清学检测可以估计人群感染的状况,有助于回顾性评估研究人群中疫情的规模或感染程度。本文对全球自然感染SARS-CoV-2一般人群和医务工作者、儿童、孕妇等特殊人群的血清抗体水平研究进行综述,以期更好地理解COVID-19流行期间人群的血清学特征和规律,对疾病的认识和后期疫情防控提供重要借鉴。综述发现全球范围内报告的自然感染SARS-CoV-2血清抗体阳性率在不同国家或地区有所不同,阳性率从低于0.1%到超过20%,其高低与不同血清学检测方法、检测时所处的疫情流行阶段有关。儿童的血清抗体阳性率低于其他年龄组,医务工作者、孕妇的血清抗体阳性率则与一般人群相似。未来有必要进一步持续监测血清抗体阳性水平,以评估COVID-19所致的疾病负担,为COVID-19疫情控制提供科学证据。     

SARS-Cov-2实验室检测技术的应用及展望

新型冠状病毒肺炎疫情爆发以来,我国的病毒检测能力不断提高,检测技术也在不断地发展和创新。以实时荧光定量PCR（qRT-PCR）和宏基因组测序为代表的病毒检测技术在辅助疾病确诊、监测病毒变异等方面发挥了关键作用;基于血清/血浆IgM/IgG抗体的检测技术是辅助确诊的重要方法;高特异性的逆转录环介导等温扩增技术、能够核酸定量的数字PCR和灵敏度更高的SHERLOCK技术也极具特色与发展潜力。以上检测技术代表了病原微生物检测技术的现在及未来发展方向。本文对新型冠状病毒检测技术的基本原理、技术特点及应用现状进行探讨。     

后疫情时代精神心理问题的挑战与应对

新型冠状病毒感染疫情（新冠疫情）暴发以来,新型冠状病毒持续变异,国内新发疫情不断出现,疫情防控形势依然严峻。新冠疫情不仅会影响患者的精神心理健康,还会导致家属、医务人员、大学生、青少年、儿童、甚至普通人群的精神心理问题明显增加。目前我国新冠疫情形势复杂,公众面临着病毒感染或再次感染的新威胁和疫情对个人的工作、学习、经济收入等各方面的严重影响,与疫情相关的精神心理问题仍非常突出。我国政府相关部门和卫生机构在实施疫情防控工作过程中,非常重视公众的心理健康工作,如何紧密配合我国疫情防控要求,提高我国突发公共卫生事件精神心理卫生服务水平,保证后疫情时代下公众的心理健康状况和幸福水平是当前的一项重要任务。本文在总结前期新冠疫情相关的精神心理问题的基础上,提出后疫情时代精神心理问题的应对策略。     

PCR-核酸飞行时间质谱系统检测新型冠状病毒方法的建立及应用研究

背景　新型冠状病毒肺炎（COVID-19）在全球暴发,实验室检测结果是疾病诊断的重要依据,检测方法的灵敏度和特异度是影响实验结果的关键因素,现实时荧光定量聚合酶链反应（PCR）核酸检测方法是COVID-19确诊的通用方法,但其检测灵敏度有方法局限性,依赖标本病毒含量。通过对PCR-核酸飞行时间质谱检测方法的优化,从而提高对低新型冠状病毒（SARS-CoV-2）含量病例检测的灵敏度,可为现有方法做有效补充。目的　应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）原理,在Clin-ToF Ⅱ飞行时间质谱系统上,建立PCR-核酸飞行时间质谱（PCR-TOF MS）系统检测SARS-CoV-2的方法,并评估其实际应用价值。方法　2020年2-3月于上海市临床检验中心室间质评阳性样本40份、阴性样本7份,国家卫生健康委员会室间质评阳性样本41份、阴性样本33份,本实验室购买阳性质粒及稀释样本32份,健康人样本28份,空白对照超纯水5份,共186份样本作为建立PCR-TOF MS系统数据。于2020年1-2月收集安徽省内临床送检到安徽省疾病预防控制中心的疑似COVID-19患者上呼吸道样本80份（咽拭子样本55份、痰液样本25份）及健康人群样本20份（均为咽拭子样本）作为评估PCR-TOF MS系统效果的数据。建立PCR-TOF MS系统试验体系步骤,包括PCR扩增、虾碱性磷酸酶（SAP）消化、单碱基延伸和质谱检测;并基于阳性质粒优化模版量,根据186份样本检测质谱峰的信噪比（SNP）确定该方法在SARS-CoV-2检测时的判读标准。对80份疑似SARS-CoV-2样本和20份健康人群样本进行检测分析,并与实时荧光定量PCR法进行对比。结果　通过对PCR-TOF MS 模板条件的优化,模版量6 μl时,扩增产物可获得典型的质谱峰图。建立的PCR-TOF MS反应体系可以对SARS-CoV-2核酸的开放读码框1ab（ORF1ab）基因和核壳蛋白（N）基因进行有效扩增检测。本研究PCR-TOF MS方法对临床疑似病例样本的检出率为90.00%,高于实时荧光定量PCR法的75.00%,同时,结果显示,实时荧光定量PCR法检出中含有25.00%的可疑结果,而PCR-TOF MS则无可疑结果。对于痰液和咽拭子两种样本的检出率,PCR-TOF MS法分别为100.00%和85.45%,高于荧光定量PCR法的64.00%和43.64%。阴性样本两种方法均未检出。结论　通过PCR技术与飞行时间质谱技术的结合,使得检测SARS-CoV-2目标片段指数级扩大,从而提高样本的检测灵敏度。MALDI-TOF MS技术通过对离子分子量的检测分析,具有较高的准确性和特异性,同时证实了痰液样本优于咽拭子样本。该方法可作为实时荧光定量PCR法的补充和协同,在一定程度上有利于弥补假阴性的问题,从而降低临床漏诊率,提高检测效率,为疫情的研判缩短时间。     

用于新型冠状病毒核酸检测的即时检测方法研究进展

新型冠状病毒（SARS-CoV-2）引起的新型冠状病毒肺炎（corona virus disease 2019，COVID-19）在全世界范围内快速传播，截至2020年9月30日全球感染人数已达3 300万人，造成100多万人死亡，给公众的生命健康造成严重威胁。基于实验室的标准化核酸检测方法周转时间长、成本高，因此急需开发便捷检测新冠病毒的方法，实现在资源有限的情况下快速测试以及时控制疫情。本文从提取、扩增、检测3个方面总结了针对新型冠状病毒所开发的核酸即时检测方法（point-of-care testing，POCT），并对整合了这3个步骤的商业化即时检测装置进行简要介绍，以期为COVID-19及其他新兴传染病的紧急应对和快速部署提供参考。     

The potential of miRNA-based therapeutics in severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infection: A review

Since the World Health Organization (WHO) declared COVID-19, the disease caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), as a pandemic in March 2020, and more than 117 million people worldwide have been confirmed to have been infected. Scientists, medical professionals, and other stakeholders are racing against time to find and develop effective medicines for COVID-19. However, no drug with high efficacy to treat SARS-CoV-2 infection has been approved. With the increasing popularity of gene therapy, scientists have explored the utilization of small RNAs such as microRNAs (miRNAs) as therapeutics. miRNAs are non-coding RNAs with high affinity for the 3′-UTRs of targeted messenger RNAs (mRNAs). Interactions between host cells and viral genomes may induce the upregulation or downregulation of various miRNAs. Therefore, understanding the expression patterns of these miRNAs and their functions will provide insights into potential miRNA-based therapies. This review systematically summarizes the potential targets of miRNA-based therapies for SARS-CoV-2 infection and examines the viability of possible transfection methods.     

COVID-19 vaccine candidates and vaccine development platforms available worldwide

The pandemic caused by the worldwide spread of the coronavirus, which first appeared in 2019, has been named coronavirus disease 19 (COVID-19). More than 4.5 million deaths have been recorded due to the pandemic caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), according to the World Health Organization. COVID-19 Dashboard in September 2021. Apart from the wildtype, other variations have been successfully transmitted early in the outbreak although they were not discovered until March 2020. Modifications in the SARS-CoV-2 genetic material, such as mutation and recombination, have the ability to modify the viral life span, along with transitivity, cellular tropism, and symptom severity. Several processes are involved in introducing novel vaccines to the population, including vaccine manufacturing, preclinical studies, Food and Drug Administration permission or certification, processing, and marketing. COVID-19 vaccine candidates have been developed by a number of public and private groups employing a variety of strategies, such as RNA, DNA, protein, and viral vectored vaccines. This comprehensive review, which included the most subsequent evidence on unique features of SARS-CoV-2 and the associated morbidity and mortality, was carried out using a systematic search of recent online databases in order to generate useful knowledge about the COVID-19 updated versions and their consequences on the disease symptoms and vaccine development.     

营养支持在新型冠状病毒感染防治中的重要作用

新型冠状病毒（新冠病毒）感染导致了一场持续的全球大流行,适宜的营养支持有助于增强机体免疫力,提升高危人群对新冠病毒的防御能力,降低患病率,预防轻症感染者发展为重症,同时减少康复期不良症状的发生,是预防病毒感染、促进患者康复及改善预后的重要保障。以新冠病毒感染者病症特点为基础设计的全营养配方食品可提供配比适宜的全面营养支持,可有效改善患者营养状况、为提高生存质量提供有力技术支持。在当前新型冠状病毒防控的关键时期,需更加重视营养支持的核心作用,充分发挥营养支持的临床功效。     

新型冠状病毒IgM-IgG抗体检测试剂盒的制备及对15例患者临床应用初试

目的 开发一种快速检测SARS-CoV-2病毒的IgM-IgG抗体的胶体金免疫层析检测试剂盒,并优化研发及应用策略,分析IgM-IgG抗体联合检测在新冠病毒检测中的临床应用价值。 方法 表达纯化SARS-CoV-2病毒S蛋白的RBD和NTD结构域,通过胶体金制备工艺包被抗原及多克隆抗体,制备IgM-IgG抗体检测试剂盒;收集15例阳性患者的血清进行抗体检测分析,计算试剂盒检测的阳性率,分析SARS-CoV-2抗体IgM-IgG对病毒响应的过程。 结果 在15例核酸RT-PCR检测阳性的患者血清样本中,IgM-IgG联合抗体检测的阳性率为73.33%,其中IgM阳性占总标本数的53.33%,IgG阳性占总标本数的60.00%;5例境外人员中有3例为抗体阳性;对患者的流行病学分析发现,病毒感染1周以上的患者共7例,抗体检测全部为阳性;抗体检测试剂盒的灵敏度73.33%,特异性95.00%。 结论 IgM-IgG联合抗体检测法具有快速、方便、易操作等特点,可以作为核酸检测的辅助手段对疑似患者(尤其是境外人员及无症状患者)进行初筛;且IgM-IgG的检测结果可以作为推测患者病毒感染过程的依据;快速检测IgM-IgG抗体将为COVID-19疾病的诊断和治疗提供帮助。     

当前新冠病毒的主要检测手段

2019年,由新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染引起的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)被报道,随后疫情在世界上各个国家和地区暴发且迅速流行.COVID-19的传染性强、病死率高,为有效控制疫情的发展,新冠病毒的检测至关重要,国内外各研究团队及机构已研发出各种检测新冠病毒的有效手段和仪器设备,本文从背景原理、应...     

Angiotensin-converting enzyme 2 as a potential therapeutic target for COVID-19: A review

As of August 16, 2021, there have been 207,173,086 confirmed cases and 4,361,996 deaths due to the coronavirus disease (COVID-19), and the pandemic remains a global challenge. To date, no effective and approved drugs are available for the treatment of COVID-19. Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) plays a crucial role in the invasion into host cells by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), the etiological agent of COVID-19. Notably, ACE2 density is influenced by medical conditions, such as hypertension, or by drugs, including angiotensin-converting enzyme inhibitors (ACEIs) and angiotensin receptor blockers (ARBs), which can change the fate of SARS-CoV-2 infectivity. ACE2 is a target for these drugs and can be manipulated to limit the viral entry and replication within the cells. Different strategies aimed at blocking ACE2 with small molecules, peptides, and antibodies, or by neutralizing the virus through its competitive binding with human recombinant soluble ACE2 (hrsACE2) are currently under investigation. In this article, we review the current state of knowledge that emphasizes the need to find effective therapeutic agents against COVID-19 by exploiting ACE2 as a potential target. The increased soluble ACE2 levels and the application of hrsACE2 in patients with COVID-19 can be implemented to control the disease. It has not yet been established whether hypertension and other comorbidities, independent of age, have a direct role in COVID-19. Therefore, the use of renin-angiotensin system inhibitors, ACEIs and ARBs, should not be discontinued during COVID-19 treatment.     

严重急性呼吸综合征冠状病毒2与新型冠状病毒肺炎

目前正在暴发流行的新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的病原体是严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）,这是近年来继严重急性呼吸综合征冠状病毒（SARS-CoV）和中东呼吸综合征冠状病毒（MERSCoV）之后发现的能够感染人的第7种冠状病毒。SARS-CoV-2系单股正链RNA病毒,传染性强,人群普遍对其缺乏免疫力,疫情目前仍在持续。2020年1月30日（当地时间）,WHO将此次疫情列为国际关注的突发公共卫生事件（PHEIC）。本文就SARS-CoV-2病原学、致病性及COVID-19的检测诊断、预防控制和临床治疗等领域的进展进行讨论。     

COVID-19患者静脉血栓栓塞症的诊治进展

2019冠状病毒病(COVID-19)在过去三年多时间里引发了全球大流行并造成大量患者死亡。静脉血栓栓塞症(VTE)是COVID-19常见的并发症。严重急性呼吸综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2)感染可引起细胞因子释放、免疫细胞激活和促凝级联反应激活,从而导致内皮炎和血管损伤,影响凝血系统并引起凝血功能障碍。抗血栓治疗可以减少COVID-19患者需器官支持的比例并提高生存率,但对其抗凝治疗的最佳药物、剂量和使用时间仍不清楚。对出血风险较低的COVID-19非危重症患者,最新指南建议使用治疗剂量抗凝;而对于COVID-19危重症患者,由于VTE风险因素较多,抗凝治疗更具挑战性。早期研究认为对COVID-19危重症患者需要增加抗凝强度,然而并未发现治疗剂量能够获益。最新的临床试验结果表明,治疗剂量抗凝并不优于标准剂量抗凝。本文总结了COVID-19患者VTE的危险因素、发生机制和抗凝治疗的最新进展,并对其做一评述。