TNF-α启动子基因多态性对北方汉族HBV感染者结局的影响

目的探讨TNF-α启动子区基因多态性是否与宿主感染乙型肝炎病毒（hepatitis Bvirus,HBV）后形成不同的结局相关联。方法采用病例-对照研究方法,以362例慢性乙型肝炎患者作为病例组,212例乙型肝炎病毒自限性感染者作为对照组,应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）方法对TNF-α基因启动子区-238G/A、-857C/T、-863C/A位点进行基因分型。结果慢性乙肝组携带TNF-α-238GA基因型36例（10.0%）、-857CC基因型289例（79.8%）,自限性感染组分别为-238GA基因型11例（5.2%）、-857CC基因型149例（70.3%）,慢性乙肝组均显著高于自限性感染组（P〈0.05）。3个位点组成的单体型-238G/-857C/-863A的频率在慢性乙肝组显著高于HBV自限感染组（64.36%vs.58.26%）。单体型-238G/-857T/-863A在慢性乙肝组显著低于HBV自限感染组（7.32%vs.12.26%）。结论 TNF-α启动子区基因多态性可能与宿主感染HBV后形成慢性化结局相关联。     

北方汉族慢性HBV感染者TNF-α启动子区基因多态性分析

目的：探讨北方汉族人群TNF-α启动子区基因多态性与乙型肝炎病毒（hepatitis B virus,HBV）感染不同慢性化结局的关系。方法：用病例-对照研究方法,以362例慢性乙型肝炎患者作为病例组,204例慢性无症状HBV携带者作为对照组,应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）方法对TNF-α基因启动子区-238G/A、-857C/T、-863C/A位点进行基因分型。结果：TNF-α-857 CC基因型在慢性乙肝组为79.8%,高于无症状HBV携带者组的68%,-857 TT基因型则低于HBV携带组;-863 CC基因型在慢性乙肝组为8.7%,低于HBV携带组的16.4%（P均〈0.05）;3位点组成-238G/-857C/-863A单体型频率在慢性乙肝组显著高于HBV携带者组,-238G/-857T/-863C低于HBV携带组（P均〈0.05）。结论：TNF-α启动子区基因多态性可能是影响HBV感染慢性化结局的宿主遗传因素之一。     

强直性脊柱炎患者肿瘤坏死因子α-857和-863位点基因多态性分析

目的探讨肿瘤坏死因子（TNF）α-857和-863位点基因多态性与强直性脊柱炎（AS）的相关性。方法用序列特异引物PCR方法对112例AS患者和96例健康对照人群,以及98例HLAB27阳性AS患者和14例阴性AS患者的TNF—α-857（C／T）和-863（C／A）位点基因多态性进行分析。结果AS患者组TNF—α-857位点基因型和等位基因频率分布与健康对照组有显著统计学差异（P〈0．01）,AS患者的T等位基因频率明显高于对照组,而AS患者TNF-α-863位点基因型和等位基因频率分布与健康对照组无统计学差异（P〉0．05）。HLA-B27阳性As患者和阴性AS患者TNF—α-857位点基因型频率亦有显著统计学差异（P〈0．01）。结论TNF—α-857位点基因多态性与AS相关,T等位基因可能增加AS的易感性。     

贵州汉族人群肿瘤坏死因子-α基因启动子区的单核苷酸多态性

目的: 了解贵州汉族人群肿瘤坏死因子-α (tumor necrosis factor alpha, TNF-α)基因启动子区的基因多态性.方法: 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP) 和序列特异性引物-PCR(SSP-PCR) 方法,对贵州汉族人群中TNF-α基因启动子区已知的5个多态性位点进行基因分型检测,并用统计学方法分析各位点基因型、等位基因频率及其组间差异.结果: 贵州汉族人群中TNF-α基因启动子区5个位点的等位基因频率分别为-238(G,96%;A,4.0%)、-308(G,92%;A,8%)、-857(C,65.0%;T,35.0%)、-863(C,80.0%;A,20.0%)、-1 031(T,48.0%;C,52.0%).结论: 贵州汉族人群中TNF-α基因启动子区单核苷酸多态性具有独特的特征,这为TNF-α基因多态性与疾病的相关性研究提供了基础资料.     

TNF－α启动子区基因多态性与SARS易感性及症状关系研究

【目的】研究TNF-α基因多态性在严重急性呼吸道综合征（sever acute respiratory syndrome,SARS）发生中的作用。【方法】采用病例对照研究设计,采用PCR-SBT（PCR sequencing based typing）方法检测75例SARS康复人员、41例医护人员和92例健康人员的TNF-α基因启动子区多态性,分析TNF-α基因启动子区多态性与SARS-Cov易感性关系;在SARS康复病人中采用病例-病例对照研究设计,分析TNF-α基因多态性与SAPS症状的关系。进行TNF-α启动子区基因多态性检测,运用SPSS11．5进行统计结果分析。【结果】TNF-α启动子区基因多态性位点有-1031、-863、-857、-572、-308、-238、-204和-163,其中-572（A→C）和-204（T→C）为新发现多态性位点。在这些多态性位点中,-204位点的基因多态性在SAPS康复人员和健康人员中存在差别（χ^2=4．20,P=0．04）,突变基因型（CT）可能为SARS—Cov感染的保护基因型（OR=0．95,95％CI 0．90—0．99）,未见其他多态性位点在该三人群分布差别。-308位点G和A等位基因在SAPS康复人员和健康人员分布不一致,SARS人群的A等位基因显著高于对照人群（χ^2=8．96,P=0．003）。同时,未见,INF-α启动子区基因多态性与SARS临床症状之间关联。等位基因分析也未见差别。【结论】TNF-α启动子区-204位点的T→C改变可能减少SARS的发生风险,而-308位点A等位基因可能是SARS发生的风险之一。而TNF-α启动子区基因多态性与SARS的临床症状程度无关。     

用Taqman MGB探针研究中国人群TNF-α基因启动子区单核苷酸多态性

 【目的】了解中国人群肿瘤坏死因子α（the tumour necrosis factor α，TNF-α）基因启动子区多态性。【方法】 随机选取20名深圳地区汉族健康体检者，采用两对引物PCR扩增TNF-α基因启动子区（-1389nt～＋125nt），对PCR产物进行序列分析，寻找单核苷酸多态性位点（single nueleofide polymorphisms，SNPs）。采用Taqman MGB探针建立了-857nt（C／T）位点的实时定量PCR（thereal-time PCR）分型方法，并对中国汉族、壮族、布依族，水族及苗族群体共l108份样本进行了基因分型。【结果】在启动子区（-1322nt～＋67at），发现6个SNP位点，即-885（A／G）、-863（C／A）、-646（G／A）、-648（G/A）、-568（G／C）和-857（C/T），其中位点-646nt（G→A）为新发现SNP。-885、-648及-568nt位点碱基虽然与Genbank不同，但测序的20个个体基因分型相同。中国人群-857nt（C／T）位点基因型频率分别为0．79（CC），0．19（CT）和0．02（TT），中国汉族、壮族、布依族，水族及苗族群体间无显著性差异。中国人群-857T等位基因频率为0．116，与文献报道的韩国人群相同，但比日本人群低。【结论】中国人群TNF-α基因启动子区单核苷酸多态性可能较保守。采用Taqman MGB探针实时定量PCR技术对SNPs进行基因分型简便、快速及准确，易于自动化，为大规模的疾病相关性研究提供了有效的工具。     

用Taqman MGB探针研究中国人群TNF-α基因启动子区单核苷酸多态性

【目的】了解中国人群肿瘤坏死因子α（the tumour necrosis factor α，TNF-α）基因启动子区多态性。【方法】 随机选取20名深圳地区汉族健康体检者，采用两对引物PCR扩增TNF-α基因启动子区（-1389nt～＋125nt），对PCR产物进行序列分析，寻找单核苷酸多态性位点（single nueleofide polymorphisms，SNPs）。采用Taqman MGB探针建立了-857nt（C／T）位点的实时定量PCR（thereal-time PCR）分型方法，并对中国汉族、壮族、布依族，水族及苗族群体共l108份样本进行了基因分型。【结果】在启动子区（-1322nt～＋67at），发现6个SNP位点，即-885（A／G）、-863（C／A）、-646（G／A）、-648（G/A）、-568（G／C）和-857（C/T），其中位点-646nt（G→A）为新发现SNP。-885、-648及-568nt位点碱基虽然与Genbank不同，但测序的20个个体基因分型相同。中国人群-857nt（C／T）位点基因型频率分别为0．79（CC），0．19（CT）和0．02（TT），中国汉族、壮族、布依族，水族及苗族群体间无显著性差异。中国人群-857T等位基因频率为0．116，与文献报道的韩国人群相同，但比日本人群低。【结论】中国人群TNF-α基因启动子区单核苷酸多态性可能较保守。采用Taqman MGB探针实时定量PCR技术对SNPs进行基因分型简便、快速及准确，易于自动化，为大规模的疾病相关性研究提供了有效的工具。     

北京地区慢性乙型重型肝炎患者肿瘤坏死因子基因多态性相关性分析

目的：探讨肿瘤坏死因子（TNF-α）基因启动子-238G／A、-308G／A、-857C／T、-863C／A等位基因多态性和血清TNF-α水平与慢性重型乙型肝炎的相关性。方法：2002年12月至2005年12月北京佑安医院住院慢性重型乙型肝炎患者98例,慢性乙型肝炎患者211例。采用聚合酶链反应限制性片段长度多态性分析方法检测TNF-α启动子-238G／A、-308G／A、-857C／T、-863C／A等位基因多态性。结果：两组-863C／A、-238G／A位点的等位基因（X^62=0．61,P=0．436;X^2=0,001,P=0．976）,基因型频率比较差异无统计学意义（X^2=1．16,P=0．552;X^2=0．63,P=0,486）。两组比较TNF-α-308G／A和-857C／T等位基因差异都具有统计学意义（X^2=59．01,P=0．000;X^1=11．59,P=0．000）;-308GA和-857TT基因型频率显著高于慢性乙型肝炎组（X^2=28．06,P=0．000;X^2=19．69,P=0.000）,差异有统计学意义。-308GA与-857TT基因型与慢性重型乙型肝炎有显著性关联OR=4．176;95％ CI2．416-7．216;OR=6．09;95％CI2．652-14．001。慢性重型乙型肝炎患者血清TNF-α水平明显高于慢性肝炎患者,两组比较差异有统计学意义（t=3,951,P=0．000）。结论TNF-α-308GA与-857TT基因型携带者感染HBV后可能增加成为慢性重型乙型肝炎的风险。TNF-α基因启动子区基因多态性与北京地区汉族人群中慢性重型乙型肝炎的发生可能密切相关。     

荔波少数民族人群 HBV感染与 ESRα基因 Pvu Ⅱ和T29 C位点基因多态性研究

目的：了解贵州荔波少数民族人群雌激素受体（ ESRα）基因PvuⅡ位点和T29C位点多态性与乙型肝炎病毒（ HBV）易感性的关系。方法：选取贵州荔波县少数民族健康对照91例和HBsAg携带者80例,采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性（ PCR-RFLP）方法测定受检者基因组中ESRα基因PvuⅡ和T29C位点多态性,分析两位点多态性与HBV易感性的关系。结果：在荔波少数民族健康对照组和HBsAg携带组中均检出ESRα基因PvuⅡ和T29C位点3种基因型,但3种基因频率和等位基因频率在两组间分布差异无统计学意义（P>0.05）。结论：ESRα基因的PvuⅡ和T29C基因多态性与荔波少数民族人群中乙肝感染无关。     

肿瘤坏死因子α基因启动子-857 位C →T基因突变与强直性脊柱炎相关性研究

目的探讨中国湖南籍汉族强直性脊柱炎(AS)患者人群中,TNF-α-857位C→T基因突变与AS的相关性,及其致病的可能分子生物学机制。方法在164例AS患者和121名正常对照中,用等位基因特异性扩增的方法,对TNF-α基因启动子-857C/T单核苷酸多态性(single nucleotide polymor-phisms,SNPs)进行基因分型,分析单个位点的等位基因和基因型频率是否与AS相关。结果AS患者组TNF-α-857T的等位基因频率(P=0.002)和基因型频率(P=0.000002)均显著超过正常对照组,经Bon-ferroni校正后仍为阳性。结论本研究显示TNF-α-857基因多态性与AS存在显著的相关性,TNF-α-857T可能增加AS的易感性。     

肿瘤坏死因子α基因启动子区多态性位点与阿尔茨海默病的相关性研究

目的:探讨肿瘤坏死因子α(TNF-α)基因启动子区-857C/T和-1031T/C位点多态性与阿尔茨海默病发生的相关性。方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析(PCR-PFLP)方法检测98例阿尔茨海默病、122例健康对照各个多态性位点的基因型,采用SPSS13.0进行统计学分析。结果:TNF-α基因-857C/T位点的基因型及等位基因频率分布在AD组与正常对照组均存在显著性差异(P<0.05),T等位基因的频率在AD组显著高于对照组(χ2=10.178,P=0.001,OR=2.081,95%CI=1.320-3.280)。结论:TNF-α基因-857C/T位点可能与阿尔茨海默病的发病存在关系,其中C等位基因可能是易感基因,携带C的个体可能更易患有AD。     

肿瘤坏死因子α基因启动区基因多态性与HBV感染的研究

目的 探讨肿瘤坏死因子α (TNF-α)基因启动子区-308和-238位点多态性与乙型肝炎病毒感染的关系.方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析(PCR-RFLP)技术,分析56例HBV无症状携带者,46例HBV感染肝功能异常者和49名健康对照者了NF-α-238位点和-308位点基因型.结果 TNF-α基因启动子区-308和-238位等位基因在HBV感染者与健康对照者中的分布频率无明显差异.结论 TNF-α基因启动子区-308和-238位基因多态性与HBV感染及肝细胞损伤无相关性.     

肿瘤坏死因子α基因启动子区-308位点多态性与2型糖尿病的相关性研究

目的探讨肿瘤坏死因子α基因启动子区-G308A多态性与2型糖尿病的相关性。方法利用PCR-RFLP方法对宁夏汉族100例2型糖尿病患者及101例正常对照者的TNF-α基因启动子区-308位点基因多态性进行分析。结果T2DM组和对照组的TNF-α基因启动子区-308位点GA＋AA基因型频率分别为15.0%和10.89%;A等位基因频率分别为7.5%和5.45%,两组间差异无统计学意义（P〉0.05）。结论肿瘤坏死因子α基因启动子区-G308A多态性与宁夏汉族人群2型糖尿病发病无明显相关性。     

IL-18基因启动子-607C/A位点多态性与冠心病关系的研究

目的:探讨汉族人群IL-18基因启动子-607C/A位点多态性与冠心病(CHD)发生之间的关系。方法:应用序列特异性引物-聚合酶链反应技术,检测141例CHD患者和240例健康对照者IL-18基因启动子-607C/A单核苷酸多态性位点基因型,分析CHD组和对照组基因型频率和等位基因频率分布;同时进行血脂检测。结果:CHD组和健康对照组IL-18基因启动子-607C/A位点的基因型CC、CA、AA频率分别为33.3%、50.4%、16.3%和21.3%、51.3%、27.4%,等位基因C和A的频率分别为58.5%、41.5%和46.9%、53.1%。CHD组CC基因型和C等位基因频率明显高于健康对照组(χ2=4.56,P=0.03;χ2=7.49,P=0.01),具有显著性差异。结论:IL-18基因启动子-607C/A位点CC基因型人群冠心病易感性增高,C等位基因可能是CHD发生的一个遗传危险因子。     

TNF-α及其受体基因多态性与类风湿性关节炎易感性和血清学指标相关性分析

[摘要] 目的 探讨TNF-α及其受体基因多态性与中国西北地区汉族人群类风湿性关节炎（rheumatoid arthritis, RA）易感性及其血清学指标的相关性。方法 利用高分辨率熔解曲线技术（high resolution melting, HRM)检测452例RA患者和匹配的356例正常对照人群的TNF-α及其受体6个SNP位点的基因多态性（TNFA-857C>T、TNFA -863C>A、TNFA-308G>A、TNFA-238G>A、TNFR1-383A>C、TNFR2-exonT>G)进行病例-对照研究。此外,采用临床常规方法测定RA患者的抗环瓜氨酸肽抗体（anti-CCP）和类风湿因子（RF）,分析其与6个SNP位点的相关性。结果 TNFA-308GA和-863CA基因型在RA病例组和正常对照组中分布频率有统计学差异(P=0.001, P=0.002),TNFA-238GA、TNFA -238AA、TNFR2-exonTG和TNFR2-exonGG基因型在两组间分布频率无统计学差异（P=0.701,P=0.999,P=0.825,P=0.330）。由TNFA三个位点构成的单倍型-238G/-308A/-863C（GAC）、-238G/-308G/-863A（GGA）和-238G/-308G/-863C（GGC）在两组间的分布频率均有统计学差异(P=0.016;P=0.033;P=0.023)。TNF-α及其受体基因多态性与RA血清学指标（RF、anti-CCP)无统计学差异（P>0.05）。结论 TNFA-308GA和TNFA-863CA与中国西北地区汉人群RA易感性相关;TNFA单倍型GAC、GGA和GGC与RA易感性相关;TNF-α及其受体基因多态性与RA患者血清学指标没有相关性。     

肿瘤坏死因子α及其基因-238G＞A和-863C＞A多态性与广西壮族原发性高血压的相关性研究

目的 探讨肿瘤坏死因子α（TNF-α）基因-238G＞A和-863C＞A多态性与广西壮族原发性高血压（EH）的相关性.方法 采用ELISA法检测152例广西壮族EH患者（EH组）和50例广西壮族健康者（对照组）血清TNF-α、血脂、血糖（FBG）水平,用 PCR-SBT（PCR Sequencing Based Typing）方法检测TNF-α基因-238G＞A和-863C＞A多态性,探讨血压、血脂、FBG、TNF-α水平与TNF-α基因-238G＞A和-863C＞A的关联性.结果 EH组收缩压（SBP）、舒张压（DBP）、FBG、TNF-α、总胆固醇（TC）、甘油三酯（TG）、高密度脂蛋白（HDL）、低密度脂蛋白（LDL）、体重指数（BMI）与对照组比较差异有统计学意义（P＜0.05或0.01）;与对照组比较,EH组TNF-α-863-C＞A GG基因型和等位基因频率更高（P＜0.05或0.01）,TNF-α-238-G＞A AA基因型和等位基因频率差异无统计学意义（P＞0.05）.结论 广西壮族原发性高血压患者血清TNF-α水平增高可能与TNF-α-238G＞A有关联,与-863C＞A基因多态性无明确关联.     

慢性阻塞性肺疾病吸烟病人纤维蛋白原Bβ-249C/T基因多态性

目的探讨纤维蛋白原（Fg）Bβ-249C/T基因多态性与慢性阻塞性肺疾病及吸烟的相关性。方法慢性阻塞性肺疾病急性加重期住院病人80例作为病例组,同期健康体检者100名作为对照组。采用酶联免疫吸附法检测血浆Fg水平,采用放射免疫法测定IL-8、TNF-α水平;采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析技术分析FgBβ-249C/T位点基因多态性,统计基因突变率。结果FgBβ-249C/T位点存在基因多态性。2组中吸烟者Fg、IL-8、TNF-α水平和FgBβ-249C/T位点基因型突变比例及CT+TT型Fg水平均明显高于不吸烟者（P < 0.01）,且病例组吸烟者Fg、IL-8、TNF-α水平、FgBβ-249C/T位点基因型突变比例及CT+TT型Fg水平均明显高于对照组吸烟者（P < 0.01）。结论吸烟与FgBβ-249C/T基因多态性及慢性阻塞性肺疾病存在一定关联性,选择性Fg Bβ-249C/T基因多态性位点的检测有助于临床上对慢性阻塞性肺疾病易患人群的筛查。     

中国人群中VEGF基因启动子区-460T/C与-634G/C单倍型与结肠癌的易感性研究

目的探讨血管内皮细胞生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)基因启动子区-460T/C与-634G/C多态性位点单倍型在中国汉族人群中与结肠癌发生的易感性关联。方法外周血样本DNA提取后,采用PCR-限制性片段长度多态性技术(PCR-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)检测182例结肠癌患者与216例健康对照者VEGF基因启动子区-460T/C、-634G/C位点多态性;并利用PHASE 1.0软件构建其单倍型,以非条件Logistic回归校正混杂因素,进行单倍型与结肠癌易感风险的统计学分析。结果 VEGF基因-460T/C与-634G/C位点多态性在中国人群中均存在,且基因频率分布符合Hardy-Weinberg平衡定律;-460T/C多态性位点在检测的结肠癌患者与正常人群中,等位基因频率差异有统计学意义(P=0.002),而-634G/C位点等位基因频率在两组间比较差异无统计学意义(P=0.103);在单倍型统计分析中,VEGF基因多态性位点-460C与-634C组成的C-C单倍型频率在两组人群中差异无统计学意义(P<0.001,OR=4.28)(95%CI:2.77～13.41)。结论VEGF基因启动子区-460T/C与-634G/C多态性位点组成的单倍型C-C与结肠癌的发生有易感风险关联。     

白细胞介素-6基因-174G/C、-572C/G多态性与慢性牙周炎的相关性研究

目的 研究白细胞介素-6（IL-6）基因-174G/C、-572C/G多态性与慢性牙周炎的关系。方法 采用病例对照实验设计,应用聚合酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性基因分析方法,比较195例慢性牙周炎患者和164例健康者IL-6 基因-174、-572位点基因型和等位基因分布特点。 结果 IL-6基因-174位点GG、GC基因型检出率为99.4％、0.6%,无CC基因型,两种基因型和G、C等位基因频率在组间分布差异无统计学意义;IL-6基因-572位点CC、GC、GG基因型检出率分别为66.9%、30.6%、2.5%,C、G等位基因检出率为81.9% 、18.1%,三种基因型和C、G等位基因频率在组间分布差异无统计学意义（P＞0.05）。结论 IL-6基因-174位点在中国汉族人群中变异率低,-572位点的多态性与慢性牙周炎的易感性无关。     

MxA启动子-88的基因多态性与干扰素治疗慢性乙型肝炎疗效的关系

目的探讨抗黏液蛋白A(MxA)启动子-88位点的单核苷酸多态性(SNP)与干扰素(IFN)疗效的关系。方法262例慢性乙型肝炎(CHB)患者给予-αIFN治疗12个月。应用多聚酶链式反应(PCR)及限制片段长度多态性(RFLP)分析宿主的抗病毒蛋白MxA启动子-88位点的SNP,并比较SNP与IFN疗效的关系。结果262例患者中,IFN持久应答(SR)50例(19.1%),非持久应答(NSR)212例(80.9%)。MxA启动子-88位点GT基因型频率在SR组为50.0%,与NSR组的17.5%比较,差异有统计学意义(P<0.01)。结论MxA启动子-88位点为GT杂合基因型的CHB患者对IFN治疗反应好。