miR-146b靶标预测及功能分析

目的 通过对miR-146b进行系统的生物信息学分析,预测miR-146b的靶基因及其功能.方法 应用miRBase获取并分析miR-146b的序列特征;应用TargetScan、PicTar及miRanda预测miR-146b的靶基因,进行功能注释和信号转导通路分析;应用PubMed、Google等信息搜索工具综述miR-146b已有功能研究.结果 miR-146b在各物种之间具有高度保守性.功能注释显示预测靶基因主要富集于促细胞增殖、转录调控、调控细胞分化等生物学过程.信号转导通路分析显示预测靶基因显著富集于白血病、ErbB信号通路、促分裂原活化的蛋白激酶通路等.结论 生物信息学分析提示,miR-146b可能与细胞分化、代谢密切相关.     

基于生物信息学筛选乙型肝炎差异表达基因及其在预测肝癌预后中的作用

目的:应用生物数据库及生物信息分析技术探索乙型肝炎病毒(HBV)感染肝细胞的差异表达基因,分析其在肝癌预后中的预测价值。方法:登录基因芯片公共数据库(GEO)下载数据并检测基因芯片品质,应用R软件甄选差异基因,富集分析对差异基因进行分类注释,构建蛋白质相互作用网络筛选核心基因,运用基因表达谱数据动态分析(GEPIA)验证核心差异表达基因,分析5年生存率。结果:合计1041个基因在乙型肝炎病毒感染肝细胞中存在表达差异,基因本体(GO)富集分析显示差异基因主要与细胞外间隙、胞外区、胞外外泌体、环氧化酶P450通路、受体结合相关。京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析显示差异基因主要参与补体及凝血级联反应、糖酵解/糖异生、视黄醇代谢、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路、碳代谢、代谢途径、初级胆汁酸生物合成、癌症中的蛋白聚糖、胆汁分泌等信号通路。蛋白互作网络筛选出10个关键基因。GEPIA数据库验证结果显示其6个基因高表达于肝癌组织,而生存分析验证激肽原基因1(KNG1)高表达组肝癌患者5年生存率更高。结论:生物信息学技术能有效筛选HBV感染肝细胞中的核心差异基因,并具有预测肝癌预后的作用。     

hsa-miR-4444调控的SLC12A3作为肾透明细胞癌潜在治疗靶点的生物信息学分析

目的 应用生物信息学技术探索肾透明细胞癌（KIRC）的发病机制,为KIRC的诊断和治疗提供生物信息学依据。方法 在GEO数据库中在线分析GSE16449中KIRC组织和正常肾组织的差异表达基因（DEGs）,通过GO分析、KEGG通路富集分析以及蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络筛选关键基因（Hub基因）,并在GEPIA数据库对Hub基因进行验证,运用Target Scan数据库预测调控靶基因的microRNAs,并用UALCAN分析microRNAs在KIRC组织中的表达及其与KIRC患者生存预后的关系。结果 共筛选出120个DEGs。GO分析表明,DEGs主要参与血管生成、骨形态发生蛋白（BMP）信号通路的调节。KEGG通路富集分析表明,DEGs显著富集于氧化磷酸化、嘧啶代谢。PPI网络筛选出10个Hub基因。GEPIA数据库验证显示SLC12A3在KIRC组织中低表达,与KIRC患者的不良预后有关。hsa-miR-4444与SLC12A3mRNA的3’未翻译区（3’UTR）结合。与正常组织相比,hsa-miR-4444在KIRC组织中表达明显上调,与KIRC患者预后具有一定相关性...     

石榴皮鞣质改善慢性肾小球肾炎大鼠的尿液代谢组学的通路分析

摘 要 目的：探讨石榴皮鞣质改善慢性肾小球肾炎大鼠尿液代谢组学的通路。方法: 运用KEGG 数据库进行信号通路分析,用HMDB 数据库对代谢产物分子注释、相关的酶或转运蛋白及其相关性质进行分析,MetPA 网络软件对代谢产物路径进行可视化作图。结果: 12个差异性代谢产物共参与了16条代谢途径,其中“色氨酸代谢”、“三羧酸循环”、“苯丙氨酸代谢”、“半胱氨酸和甲硫氨酸代谢”的代谢通路影响显著（P<0.05）。结论:石榴皮鞣质干预下的慢性肾小球肾炎大鼠中“色氨酸代谢”、“三羧酸循环”、“苯丙氨酸代谢”、“半胱氨酸和甲硫氨酸代谢”发生变化参与其病理过程。     

基于生物信息学分析丝甘蛋白聚糖对卵巢癌耐药性的影响及作用机制

目的:研究丝甘蛋白聚糖(SRGN)对卵巢癌耐药性的影响及作用机制。方法:采用基因表达谱交互分析工具(GEPIA)提取卵巢癌相关数据集并分析SRGN m RNA在人类正常卵巢组织与卵巢癌组织的表达差异;基于基因表达数据库(GEO)获取SRGN mRNA在顺铂敏感性与顺铂耐药性卵巢癌细胞株(A2780)中的表达差异;采用STRING在线数据库筛选SRGN的互作蛋白(置信度为0.900,联结数为10),然后通过生物学信息注释数据库(DAVID)进行京都基因和基因组百科全书(KEGG)代谢通路分析,预测SRGN调节卵巢癌耐药性的潜在通路;采用医学本体信息检索平台COREMINE挖掘SRGN、卵巢癌、耐药性三者显著关联的生物过程。结果:SRGN mRNA在卵巢癌组织中的表达显著高于正常卵巢组织(P<0.05),在顺铂耐药性卵巢癌细胞株中表达显著高于顺铂敏感性卵巢癌细胞株(P<0.001)。筛选出10个与SRGN互作的蛋白,包括白蛋白、转化生长因子β1、血小板因子4、血纤维蛋白溶酶原、血管内皮生长因子A等;SRGN参与调节卵巢癌耐药性的KEGG代谢通路有缺氧诱导因子1α信号通路、细胞因子-细胞因子受体通路、凝血与补体级联反应信号通路等,生物过程有基因表达、细胞生长、凋亡过程、细胞死亡。结论:SRGN介导卵巢癌耐药可能与缺氧诱导因子1α信号通路、细胞因子-细胞因子受体通路等有关。     

脊髓损伤中差异表达基因的生物信息学分析及其在神经炎症细胞内的变化水平研究

目的 使用生物信息学方法筛选参与脊髓损伤发展过程中的差异表达基因(DEGs),并于体外实验探索脂多糖(LPS)激活的BV2细胞DEGs的变化情况，以期为脊髓损伤的治疗提供新靶点。方法 从GEO数据库下载基因芯片数据，并将数据集中的样本分为脊髓损伤Day2组和Day5组，应用R软件处理来自不同数据集样本间的批次效应，对基因芯片的表达数据进行标准化处理，应用R软件分析标准化后的基因表达矩阵，以得到差异基因。将差异基因导入DAVID数据库进行基因本体论(GO)分析，并通过KEGG数据库进行通路分析。应用STRING蛋白数据库构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络，并通过Cytoscape软件分析得到10个Hub基因。实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)分析LPS激活后BV2小胶质细胞Hub基因中分值高的前2个基因。结果 与Day2组比较，Day5组有340个DEGs,对其生物信息分析发现，DEGs富集于细胞炎症反应和物质代谢中。通过STRING软件进行模块分析得出10个中心节点，10个基因经KEGG再次分析后发现CXCL10、CCR3、CCR10和CCL2基因显著富集于趋化因子信号通路和...     

乳腺癌脑转移差异基因的生物信息学分析

目的 利用生物信息学方法筛选乳腺癌脑转移瘤差异表达的核心基因。方法 从GEO数据库下载GSE125989数据集，运用GEO在线分析工具GEO2R分析数据集的差异基因。利用在线工具DAVID对差异表达基因进行GO功能注释和KEGG通路富集分析，将获得的差异表达基因数据输入STRING数据库并通过Rstudio进行可视化。利用Rstudio的CytoHubba插件筛选核心基因。利用Kaplan-Meier Plotter在线工具验证核心基因与总生存期的关系。结果 经GEO2R工具筛选出22 277个基因，进一步筛选集中获得差异表达基因74个，GO功能注释发现，差异表达基因主要在细胞外基质组织等方面显著富集；KEGG通路主要在蛋白质消化吸收等通路富集。通过CytoHubba插件以度筛选出PPI网络中排名前10位的差异表达基因为核心基因。生存分析显示DCN、ELN与患者总生存期具有显著的相关性。结论 本研究共筛选出2个与乳腺癌脑转移预后相关的核心基因，分别为DCN、ELN。     

增液汤的网络靶标预测及作用机制研究

目的 采用网络药理学方法对增液汤中活性成分的作用机制进行分析,探讨其成分、靶点及通路间的相关关系。方法 运用中药系统药理学成分分析平台（BAT-MAN）数据库获取增液汤的作用靶标基因,采用Cytoscape 3.5.1软件构建活性成分-靶点网络,STRING平台构建靶蛋白互作网络,利用BiNGO和MCODE插件对相互作用的靶基因进行GO生物过程富集和聚类分析,借助生物学信息注释数据库对靶点进行KEGG信号通路分析。结果 增液汤中23个药效成分作用于268个潜在靶点,聚类分析862个GO生物过程得到物质合成代谢、氧化应激、细胞离子平衡、炎症反应、凝血调节等23个子簇。KEGG信号通路富集主要涉及代谢、神经递质、氨基酸合成、信号转导、心血管和其他等6大类22条信号通路。结论 本研究揭示了增液汤活性成分、靶点及多维药理作用机制,为其临床治疗价值拓展提供新的线索。     

基于生物信息学技术探讨补骨脂致肝损伤的作用机制

目的 基于生物信息学技术建立补骨脂成分-靶点-信号通路-肝损伤网络,探讨补骨脂导致肝损伤的作用机制。方法 通过TCMIP数据库收集补骨脂成分以及肝损伤有关的靶点,依据反向药效团匹配方法预测补骨脂成分的作用靶点;采用Cytoscape构建补骨脂成分-靶点网络,对补骨脂作用靶点构建网络模型进行GO与KEGG富集分析。结果 补骨脂中有22个成分作用于31个肝损伤靶点蛋白,血清白蛋白（ALB）、谷胱甘肽S-转移酶P(GSTP1)、运甲状腺素蛋白（TTR）和过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)可能是关键节点蛋白。KEGG分析遴选出化学物致癌、AMPK、PPAR信号、P450代谢和谷胱甘肽等信号通路。结论 补骨脂可能是作用于ALB、GSTP1、TTR与PPARG等靶点并调控五类信号通路导致肝损伤。     

基于网络药理学与分子对接探究雷公藤致心脏毒性的作用机制

摘要：目的:基于网络药理学方法初步探究雷公藤致心脏毒性靶点及作用机制,为雷公藤的心脏毒性研究提供理论依据。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）收集雷公藤有效成分及其相应靶点,与生物信息数据库Genecards中收集的心脏毒性靶点进行匹配,得雷公藤有效成分的心脏毒性靶点,利用生物信息分析软件Cytoscape3.8.0构建雷公藤有效成分-心脏毒性靶点网络图。通过String数据库构建雷公藤心脏毒性靶点蛋白相互作用网络图。同时通过生物信息学资源数据库DAVID对潜在毒性靶点进行基因本体（GO）和京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析,得到潜在的毒性靶点所涉及到的相关生物学过程和代谢通路。最后通过分子模拟软件Discovery Studio对关键心脏毒性靶点与雷公藤主要毒性成分雷公藤甲素进行分子对接。结果:通过TCMSP数据库和Genecards数据库的筛选,得到25种雷公藤的主要毒性成分以及90个潜在的心脏毒性靶点。雷公藤的活性化合物中,雷公藤甲素、蜜桔黄素、豆甾醇等为心脏毒性作用靶点较多的几个化合物。前列腺素内过氧化物合酶（PTGS2）、心脏电压门控钠离子通道（SCN5A）、电压门控钾离子通道（KCNH2）等均为雷公藤心脏毒性中高频作用的靶点。KEGG结果表明,雷公藤可能作用于细胞凋亡和氧化应激等通路导致心脏毒性的发生。分子对接结果显示,雷公藤甲素与白细胞介素8 （CXCL8）和丝裂原激活蛋白激酶8 （MAPK8）具有较好的结合活性。结论:应用网络药理学的方法,初步揭示了雷公藤引起心脏毒性的作用靶点以及相关作用通路,为进一步研究雷公藤的心脏毒性提供理论依据。     

子宫中隔切除术后预防粘连方法探讨

目的 探讨子宫中隔并不孕患者宫腔镜术后不同处理方法预防宫腔粘连的效果.方法 55例子宫中隔并不孕患者行腹腔镜监护下宫腔镜子宫中隔切除术(TCRS),术后针对不同患者采用不同术后处理措施,包括宫腔放置与不放IUD,是否进行人工周期治疗,部分患者术后使用GnRH-a类药物治疗术后第1、3个月行宫腔镜检查随访,宫内放置IUD的患者;于术后第3个月取环.结果 54例患者术后进行宫腔镜检查随访,其中40例分别于术后第1、3个月完成了术后2次宫腔镜检查,另14例只完成一次检查.宫腔术后放环与否对术后宫腔形态影响无差异(P>0.05),术后使用人工周期治疗患者较未使用者子宫内膜厚,此两者术后第3个月宫腔镜检查发现宫底创面均已有内膜覆盖.使用GnRH-a类药物患者术后官腔形态满意.结论 TCRS术后宫腔放置IUD无助于预防术后粘连的发生;术后人工周期治疗应更个体化并有针对性的使用GnRH-a类药物治疗.术后及时进行宫腔镜检查随访可防止术后宫底新粘连的形成.     

10例狂犬病误诊原因分析

狂犬病近年来发病率有逐年增加的趋势,近十二年来,我们共遇见狂大病２３例,其中１０例被误诊为其它疾病,现就其误诊原因进行分析如下。１临床资料１．１ 一般资料：男８例,女２例;年龄最大７８岁,最小４岁。发病季节为３月～１１月。首诊科室,儿科３例、内科３例、转院３例、急诊科１例。１．２ 临床表现：发热７例,恐风５例,恐水６例,怕光３例,流涎１０例,胸闷、气促、呼吸困难４例,烦躁不安１０例,多汗７例,恐惧６例,肢体麻木４例,抽搐４例,恶心、呕吐２例,昏厥１例。所有病例发病至死亡时间为２天～６天,死亡原因为…     

住院患者精神用药情况调查分析

目的：了解目前住院精神患者的药物使用情况。方法：采用一日法调查西安市精神卫生中心403例住院精神患者诊断和治疗情况，并与上海市精神卫生中心2004年调查结果相比较。结果：①传统精神药物使用显著减少，新型精神药物使用占据首位；②抗精神病药物使用趋向小剂量化；③本组联用丙戊酸盐类药物显著增多；④我院精神药物使用情况与上海精神卫生中心比较有显著差异。结论：近年来精神药物使用情况已发生了显著变化，与新型精神药物疗效好，副作用少，患者依从性高有关。     

欧洲药典适用性认证介绍

目的介绍欧洲药典适用性认证程序,为国内药品监管机构和原料药生产企业提供信息,促进我国原料药生产企业的国际化。方法通过查阅调研欧盟相关药品法规和与EDQM同行面对面的交流,详细了解欧洲药典适用性认证的组织机构和具体程序。结果与结论欧洲药典适用性认证程序在对原料药的质量控制有重要作用,加强了药典的监管力度,进一步保证了原料药的质量、安全性和有效性。     

新疆维吾尔自治区基层医院平均住院日调查分析

目的 通过对新疆维吾尔自治区14个县乡级医疗机构住院患者平均住院日及影响因素进行分析,为县乡级医疗机构进一步提高医疗管理质量提供依据.方法 将2009-2010年1504例县乡级医院住院患者平均住院天数,按性别、年龄、院别、付费方式、疾病分类进行描述性统计和秩和检验分析.结果 不同性别间及院别间平均住院日差异均有统计学意义(均P＜0.05),男性平均住院日为10.39 d,女性为8.69d,乡级医院为9.27d,县级医院为9.50 d.不同年龄间平均住院日差异有统计学意义(P＜0.05),小于15岁组、15 ～24岁组、25～44岁组、45 ～65岁组、大干65岁组平均住院日分别为8.10 d、7.66d、8.83 d、10.26 d和11.33 d.自费患者平均住院日为8.39 d,新农合组为9.10 d,商业保险组10.17 d,社会基本医疗保险患者则为11.08 d.不同疾病分类间平均住院日差异明显,妊娠类平均住院日最短,为6.73 d,而肿瘤患者则为14.26 d.结论 不同性别、不同年龄段、不同疾病分类及不同付费方式间平均住院日存在差异,县级医疗机构和乡级医疗机构住院患者平均住院日也存在差异.     

不同方法治疗慢性宫颈炎的疗效分析

目的慢性宫颈炎是妇科最常见的疾病之一,可引起盆腔脏器炎症,并且与宫颈癌的发生关系密切。本文诣在探讨不同方法在慢性宫颈炎中的疗效。方法回顾性分析新乡市中心医院收治的210例宫颈炎患者,采用药物保妇康栓、聚焦超声治疗及宫腔镜下宫颈电切术的临床效果进行统计分析。结果宫颈电切术治疗有效率为97.9%,明显高于另外两组,差异有统计学意义。结论宫腔镜下宫颈电切术治愈慢性宫颈炎,并且切除宫颈移行带,减少宫颈癌发生。     

The effect of temperature and of cetrimide on the rate of loss of refractility of spores of Bacillus megaterium

The rate of germination of spores of Bacillus megaterium at 30° is not significantly different from the rate at 37° but the onset of germination is delayed; outgrowth is normal. At 45° germination of some spores occurs but the rate is much slower than at 37°, and there is no lag; emergence occurs from only a proportion of the germinated spores and after 3 or 4 vegetative cells have been produced, replication ceases. A single regression equation can represent the germination rate of the spores at 37° in the presence of from 0.0005 to 0.02% w/v of cetrimide and in its absence. In 0.0005% w/v of cetrimide, germ cells emerge from some of the germinated spores but many of them become swollen and disintegrate. Concentrations of 0.00125% w/v or more progressively inhibit swelling and completely inhibit emergence.     

经尿道前列腺汽化电切术与经尿道前列腺电切术治疗前列腺增生症的效果对比

目的 对比分析经尿道前列腺汽化电切术与经尿道前列腺电切术治疗前列腺增生症的效果.方法 将本院2011年3月～2013年2月收治的90例前列腺增生症患者随机分为观察组（n=45）和对照组（n=45）,观察组患者采用经尿道前列腺汽化电切术治疗,对照组患者采用尿道前列腺电切术治疗,比较两组患者的疗效.结果 观察组的手术时间、术中出血量、术后冲洗时间、术后留置导尿管时间、住院时间少于对照组（P＜0.05）,残余尿量、国际前列腺症状评分和生活质量评分优于对照组（P＜0.05）,但是两组患者的并发症发生率差异无统计学意义（P＞0.05）.结论 经尿道前列腺汽化电切术治疗前列腺增生症具有疗效更确切、出血少、恢复快等优势,可以作为治疗前列腺增生症的首选方法.