基于网络药理学和分子对接探讨鼻炎数据挖掘核心方苍耳子散作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接技术探究苍耳子散（CRZS）治疗异质性鼻炎的作用机制以及“多成分-多靶点-多通路”的整体药理作用特征。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索CRZS的活性成分及靶点;从GeneCards、DisGeNET、Phenopedia、TTD和PharmGKB数据库获取相关鼻炎的基因。通过STRING数据库与Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络;利用STRING数据库对核心基因进行基因本体论（GO）富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。通过Cytoscape软件构建“中药成分-靶点-信号通路”网络并筛选核心靶点;采用AutoDock软件对筛选得到的关键通路靶点进行分子对接。结果 CRZS有131个核心基因,鼻炎相关靶点756个,交集靶点41个。GO生物富集条目2005条,KEGG通路富集条目151条,HIF-1、Lipid and atherosclerosis、Fluid shear stress and atherosclerosis等通路最具连接可能。分子对接显示,CEZS靶点的有效成分与3...     

基于网络药理学及分子对接研究穿心莲抗炎的分子机制

基于网络药理学方法以及分子对接技术,研究了穿心莲抗炎作用的潜在分子机制.利用TCMSP数据库挖掘穿心莲有效活性成分及靶点,DisGeNET、GeneCards数据库挖掘疾病靶点,分别在STRING、Metascape、Reactome网站提交交集基因,进行蛋白质相互作用网络(PPI)、基因本体(GO)及通路(KEGG)...     

基于网络药理学及分子对接技术的复方丹参滴丸治疗心绞痛潜在分子机制探讨

目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨复方丹参滴丸治疗心绞痛的潜在分子机制。方法 通过中药系统网络药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索复方丹参滴丸的活性成分,利用GeneCards、Disgnet和TTD数据库检索心绞痛疾病相关靶点,通过String数据库和Metascape开放平台对复方丹参滴丸与心绞痛的交集靶点进行京都基因与基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）通路富集分析及基因本体论（gene ontology,GO）注释。采用SYBYL2.1软件的Surflex-Dock模块对筛选的核心成分和核心靶点进行分子对接。结果 从复方丹参滴丸中筛选出76种活性化合物,涉及500个潜在靶点。复方丹参滴丸成分靶点与心绞痛疾病靶点取交集,共获得457个交集靶点;复方丹参滴丸治疗心绞痛作用靶标的蛋白相互作用（PPI）网络中共包含158个节点,其中重要的靶点有STAT3、TP53、AKT1、JUN、MAPK1、HSP90AA1等。复方丹参滴丸通过调控炎症反应、凋亡信号通路、积极调节细胞迁移等GO生物过程,参与流体剪切应力与动脉粥样硬化、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、HIF-1信号通路、TNF信号通路、IL17信号通路等信号通路,发挥治疗心绞痛的作用。分子对接结果表明筛选得到的活性成分与靶点有较强的结合。结论 运用网络药理学研究方法推测出复方丹参滴丸治疗心绞痛的潜在分子机制及作用靶点,分子对接验证了筛选的关键活性成分与重要靶点具有较强的结合活性。     

基于网络药理学与分子对接探究麻黄细辛附子汤治疗病态窦房结综合征的作用机制

目的 借助网络药理学方法探讨麻黄细辛附子汤（MXFT）治疗病态窦房结综合征（SSS）的分子机制。方法 基于中药系统药理分析平台（TCMSP）检索筛选MXFT的药物活性成分,Uniport数据库查找各成分潜在靶点。OMIM、GeneCards和DisGeNET数据库查找并去重得到SSS靶点;运用String结合Cytoscape 3.9.1对交集靶点进行蛋白质相互作用分析,Metascape数据库对其进行基因本体（GO）分析及京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析。通过Degree值筛选前3位的药物活性成分与前2位的基因进行分子对接。结果 从MXFT中筛选有效活性成分39种,共242个靶点。从SSS中筛选靶点1376个,交集靶点242个,蛋白激酶（AKT1）、肿瘤抑制因子（TP53）等可能是治疗SSS的关键靶点。GO分析共获得453个条目,其中生物过程220个条目、细胞组分113个条目、分子功能120个条目。KEGG分析共获得222个条目,主要涉及癌症通路、脂质和动脉粥样硬化、PI3K-AKT信号通路等。结论 通过网络药理学初步发现MXFT主要通过AKT1、TP53等靶点,山柰酚（...     

基于网络药理学和分子对接技术探讨儿脾醒颗粒治疗小儿厌食症的作用机制

目的 采用网络药理学和分子对接技术探讨儿脾醒颗粒治疗小儿厌食症的潜在作用机制。方法 通过检索中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）数据库获取儿脾醒颗粒的主要活性成分及对应靶点;检索GeneCards、OMIM、DrugBank、TTD数据库得到小儿厌食症相关靶点基因;取药物靶点与疾病靶点的交集,得出儿脾醒颗粒治疗小儿厌食症的有效靶点并绘制Venn图;运用Cytoscape 3.9.0软件构建药物与小儿厌食症疾病靶点互作网络图;利用STRING数据库绘制蛋白质相互作用（PPI）的可视化网络图,并进行网络拓扑分析;通过Bioconductor数据库和R语言对交集靶点进行基因本体（GO）分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,了解儿脾醒颗粒治疗小儿厌食症可能的生物过程及通路;最后运用SYBYL-x2.0软件实现分子对接验证。结果 获得儿脾醒颗粒主要活性成分46个、药物靶点蛋白236个;检索小儿厌食症疾病相关靶点共1 372个,活性成分与疾病交集靶点118个;发现儿脾醒颗粒通过作用于转录因子AP-1(JUN)、V-Rel网状内皮增生病毒癌基因同源物A(RELA)、肿瘤坏死...     

基于网络药理学及分子对接技术分析丹参-川芎-葛根抗高血压的分子机制

目的 运用网络药理学及分子对接技术探究丹参-川芎-葛根有效活性成分抗高血压的相关靶点及分子机制。方法 通过检索TCMSP、Uniport数据库,获得丹参-川芎-葛根的主要活性成分和相关靶点。通过Genecards数据库获得高血压相关靶点。运用Venny数据库构建丹参-川芎-葛根和疾病靶点韦恩图,得到交集靶点;并将得到的交集靶点导入STRING数据库得到蛋白质相互作用关系。使用RStudio 1.4.1106软件对交集靶点进行GO功能富集和KEGG信号通路富集分析。并利用Cytoscape 3.6.0软件对“药材-活性成分-靶点”、蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）、“活性成分-靶点-通路”网络进行可视化。采用AutoDock Tools 1.5.6软件将关键活性成分和核心靶点进行分子对接,运用PyMOL对对接结果进行可视化。结果 通过筛选共获得68个活性成分,759个高血压相关靶点,62个交集靶点。经KEGG通路富集分析发现,丹参-川芎-葛根通过调节流体剪切应力和动脉粥样硬化、钙信号通路、AGE-RAGE、松弛素、cGMP-PKG等通路起到抗高血压的作用。分子对接结果显示,丹参酮ⅡA、隐丹参酮、β-谷甾醇与NOS3、FOS、VEGFA、AKT1等核心靶点结合能力较好。结论 证实了丹参-川芎-葛根多成分、多靶点、多途径的作用规律。     

基于网络药理学及分子对接探讨加味六安煎治疗咳嗽变异性哮喘的作用机制

摘要：目的:基于网络药理学及分子对接技术探讨加味六安煎（JWLAD）治疗咳嗽变异性哮喘（CVA）潜在的作用机制。方法:采用中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）筛选JWLAD的活性成分及其潜在靶点,利用Genecards、Drugbank、OMIM、Disgenet、TTD数据库检索CVA相关靶点。运用Cytoscape及STRING平台构建活性成分-靶点、蛋白质互作（PPI）网络,借助Metascape对共同靶点进行基因本体（GO）及京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析,最后由Autodock Vina实现主要活性成分及核心靶点的分子对接。结果:最终得到中药活性成分64种涉及348个潜在靶点,CVA相关靶点1 290个,两者共同靶点167个。GO分析过程涉及2 336条生物过程、112条细胞组分和118条分子功能。KEGG共富集169条主要涉及各种癌症通路,白细胞介素17（IL-17）信号通路、肿瘤坏死因子（TNF）信号通路、神经活性配体和受体相互作用、细胞凋亡,Toll样受体信号通路、磷脂酰肌醇3激酶（PI3K）/蛋白激酶B（Akt）信号通路等。分子对接结果提示主要活性成分与核心靶点均有较强的亲和能力。结论:JWLAD通过多成分-多靶点-多通路综合调控网络发挥治疗CVA的作用,为后期临床和实验研究提供理论基础。     

基于网络药理学及分子对接技术探讨天麻眩晕宁颗粒治疗梅尼埃病的作用机制

摘要：目的:基于网络药理学及分子对接技术探讨天麻眩晕宁颗粒治疗梅尼埃病的机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、台湾中医药数据库收集天麻眩晕宁颗粒的活性成分及作用靶点,通过OMIM、DisGeNET、TTD和DrugBank数据库检索梅尼埃病疾病靶点。利用Cytoscape 3.9.0构建“药物-成分-预测靶点”网络、“药物-成分-潜在靶点”网络、梅尼埃病的蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络、“药物-成分-靶点-通路”网络。利用R软件RStudio对潜在靶点进行基因本体功能富集分析（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。应用Autodock对筛选出的有效成分和关键靶点进行分子对接。结果:筛选得到天麻眩晕宁颗粒的活性成分191种,以及梅尼埃病潜在靶点117个。GO分析过程涉及2 263条生物过程、108条细胞组分和196条分子功能。KEGG富集分析得到人类巨细胞病毒感染、钙离子信号通路、C型凝集素受体信号通路和甲状腺激素信号通路等158条通路。分子对接结果显示关键成分与相关靶点之间结合能较低,亲和力较好。结论:本研究验证和预测了天麻眩晕宁颗粒中的活性成分谷甾醇、泽泻醇C和去氢钩藤碱等能作用于多个靶点,调控多条通路实现对梅尼埃病的治疗,为其作用机制的研究与临床应用提供思路。     

基于网络药理学和分子对接八味沉香丸治疗先天性心脏病的潜在分子机制

目的 通过网络药理学及分子对接技术探究八味沉香丸治疗先天性心脏病(Congenital heart disease,CHD)的潜在分子机制。方法 应用TCMSP数据库及文献收集八味沉香丸活性成分及潜在作用靶点。利用Uniprot数据库功能将靶蛋白名转换为基因名。通过Genecards和OMIM数据库检索先天性心脏病相关的疾病基因。对八味沉香丸药物靶点和CHD相关基因取交集,使用Cytoscape构建“化合物-靶点-通路”网络。将交集靶点导入DAVID数据库,进行GO功能、KEGG通路富集分析。最终,对筛选出的蛋白与八味三香散活性成分进行分子对接。结果 分析表明与八味沉香丸治疗先天性心脏病相关的59个潜在活性成分作用于与CHD有关的204个靶点和135条通路。与CHD直接相关的信号通路涉及乙型肝炎、PI3K-Akt、HTLV-I感染、癌症中的蛋白聚糖、甲型流感、HIF-1信号通路等。分子对接结果 显示,筛选的靶点受体蛋白与活性成分具有较好的结合活性。结论 运用网络药理学和分子对接的方法 ,初步验证了八味沉香丸治疗先天性心脏病的药理作用机制,为后续深入探讨奠定了良好的基础     

基于网络药理学及分子对接探讨淡豆豉抗抑郁的作用机制

目的 采用网络药理学和分子对接技术预测淡豆豉抗抑郁活性成分、作用靶点及通路，探讨其潜在作用机制。方法 利用CNKI、TCMSP、TCMIP检索并筛选淡豆豉抗抑郁潜在活性成分；运用PharmMapper服务器预测活性成分的作用靶点；利用UniProt数据库查询靶点蛋白对应的基因名；运用DrugBank、GeneCards和DisGeNET数据库检索抗抑郁作用靶基因，并将活性成分靶点相互映射获得淡豆豉活性成分抗抑郁靶点；通过String数据库下载靶蛋白相互作用数据，与获取的潜在作用靶点利用Cytoscape 3.7.2.软件构建淡豆豉–活性成分–潜在靶点相互作用网络图。运用DAVID数据库分析潜在靶点的基因本体（GO）分子功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）信号通路，最后利用Autodock Vina和Pymol软件对药物有效活性成分和关键靶点进行分子对接验证。结果 预测获得淡豆豉主要活性成分8个，作用靶点396个，与抑郁症交集潜在靶点334个，GO分子功能和KEGG通路涉及多种生物学过程以及脂质和动脉粥样硬化通路、磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶B（PI3K-Akt）信号通路、小分子量G蛋白（Ras）信号通路、叉头框蛋白（FoxO）信号通路等多个信号通路。将关键活性成分和靶点进行对接，其中丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶1（AKT1）与大豆苷元结合能力较好；磷酸肌醇3-激酶调节亚基1（PIK3R1）与木犀草素、槲皮素结合能力较好；HSP90-α热休克蛋白（HSP90AA1）与黄豆黄素结合能力较好。结论 淡豆豉以多种活性成分、多个作用靶点和途径发挥其抗抑郁作用，为淡豆豉在临床上用于抑郁症的干预和治疗提供依据。     

基于网络药理学及分子对接探讨“柴胡-当归”药对治疗乳腺增生的作用机制

目的 通过网络药理学和分子对接技术探索“柴胡-当归”药对治疗乳腺增生的潜在作用机制。方法 基于网络药理学,通过TCMSP、UniProt等数据库检索获得“柴胡-当归”药对的活性成分及其对应靶点蛋白。在Genecards数据库检索乳腺增生相关靶点,利用Draw Venn Diagram在线作图网站获得其与“柴胡-当归”作用靶点的交集基因。通过Cytoscape 3.6.0软件及STRING数据库构建药对-活性成分-作用靶点-疾病网络和靶点间蛋白-蛋白相互作用（PPI）网络,根据度值大小筛选出排名前5的靶蛋白,并利用RCSB PDB数据库、Autodock Vina 1.1.2等软件预测其与“柴胡-当归”药对活性成分的结合活性。采用RStudio软件对交集基因进行GO富集分析和KEGG通路富集分析,最终构建活性成分-关键靶点-关键通路网络。结果 数据库中筛选获得药对活性成分共18种;其中活性成分的靶点与乳腺增生疾病的交集基因共150个,根据度值排名大小获得5个核心靶标,包括蛋白激酶、白细胞介素-6、肿瘤蛋白p53、血管内皮生长因子A及肿瘤坏死因子等。经分子对接分析发现,“柴胡-当归”药对的活性成分与核心靶标结合能力较强。结论 “柴胡-当归”药对的主要活性成分可能通过调节蛋白激酶、白细胞介素-6、肿瘤蛋白p53、血管内皮生长因子A及肿瘤坏死因子等核心靶点,参与调控白介素-7（IL-7）信号通路、内分泌耐药、丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）信号通路、肿瘤坏死因子（TNF）信号通路、缺氧诱导因子1（HIF-1）信号通路等途径,发挥对乳腺增生的治疗作用。     

基于网络药理学和分子对接探讨蒙药珍宝丸治疗缺血性脑卒中的作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接探讨蒙药珍宝丸治疗缺血性脑卒中的作用机制。方法 对珍宝丸中的有效活性成分及其对应靶点进行筛选,并运用DisGeNET、CTD以及GeneCards数据库,对缺血性脑卒中相关靶点进行搜集。将所获得的数据进行VENN分析,获得疾病与成分的交集靶点,然后将交集靶点通过Cytoscape软件进行拓扑分析及蛋白质互作（PPI）网络图绘制。通过DAVID网站对京都基因与基因组百科全书（KEGG）数据库及基因本体（GO）数据库进行基因通路的富集分析。最后通过Auto Dock软件进行分子对接验证。结果 筛选出珍宝丸中活性成分283种,搜集缺血性脑卒中靶点22 029个,相互交集的靶点113个。GO富集分析发现其主要富集在细胞因子活性、细胞对缺氧的反应等方面。KEGG分析发现涉及白细胞介素（IL）-17信号传导途径、脂质和动脉硬化等多条通路。分子对接结果中,能够紧密结合的占比61%,证明珍宝丸成分与缺血性脑卒中疾病关联密切。结论 珍宝丸可能通过参与调控MAPK/PPARG/VEGF/mTOR等信号通路,缓解缺血部位细胞凋亡,调控局部炎症反应,改善氧化应激,最终治疗缺血性脑...     

结合网络药理学和分子对接探讨小儿消积止咳口服液治疗支原体肺炎的物质基础和潜在机制

目的 用网络药理学和分子对接的分析方法 ,探讨小儿消积止咳口服液治疗小儿支原体肺炎的功效网络与作用机制。方法 通过化学成分分析文献,获取小儿消积止咳口服液的主要有效成分,通过SwissTargetPrediction数据库预测活性成分的潜在靶点。支原体肺炎相关靶点来自GeneCards和Disgenet数据库。筛选出疾病和成分的交集靶点,通过STRING和Cytoscape软件分析了共享靶点之间的蛋白质相互作用关系。利用DAVID数据库进行京都基因与基因组百科全书（KEGG）和基因本体论（GO）功能富集分析。通过分子对接技术,评估活性成分与核心靶点的结合活性。结果 共筛选得到小儿消积止咳口服液活性成分101个和813个成分的靶点,与306个支原体肺炎相关的靶点取交集,得到67个靶点。GO富集分析显示,相关靶点参与细胞凋亡、炎症、外来刺激等生物学过程发挥作用。KEGG富集分析显示,小儿消积止咳口服液治疗支原体肺炎的机制可能与肿瘤坏死因子（TNF）、磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)、乙型肝炎、细胞凋亡等信号通路有关。通过蛋白质相互作用（PPI）网络筛选出8个核心靶点,其...     

通过网络药理学和分子对接研究板蓝根治疗新型冠状病毒肺炎的潜在作用机制

目的：应用网络药理学及分子对接预测板蓝根治疗新型冠状病毒肺炎的有效性和潜在机制。方法：从TCMSP数据库和文献研究中获得板蓝根的活性成分及潜在靶点;通过Gene Cards数据库检索新型冠状病毒肺炎相关靶点基因,并得到活性成分作用靶点和新型冠状病毒肺炎相关靶点基因的交集靶点,然后利用STRING数据库构建蛋白相互作用网络;使用Cytoscape3.8.2软件进行PPI网络可视化,通过MCODE插件提取核心靶点;在DAVID数据库对核心靶点进行GO和KEGG通路富集分析;采用分子对接模拟,验证药物和靶标结合力。结果：共筛选出板蓝根的活性成分51个,对应210个靶点,与新型冠状病毒肺炎交集靶点共65个,得到34个核心靶点;经过网络分析和分子对接结果,11个靶点（PTGS2、RELA、TNF、NOS2、IL6、CASP3、MAPK14、IFNG、IL1B、TGFB1和CASP8）被认为是具有较好对接亲和力的主要治疗靶点;富集分析结果表明,其潜在机制主要集中在与免疫炎症、抗病毒和促凋亡相关的GO生物过程和KEGG通路上。此外,PI3K-AKT信号通路被认为可能是关键通路。结论：该研究表明,板蓝...     

基于网络药理学和分子对接技术的人参固本口服液治疗乳腺癌作用机制研究

目的：应用网络药理学和分子对接技术,探讨人参固本口服液治疗乳腺癌的潜在活性成分和可能的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台、BATMAN-TCM等数据库获取人参固本口服液中的活性成分和潜在靶点,并通过人类孟德尔遗传综合数据库、DigSee等数据库获取乳腺癌的相关疾病靶点。将潜在靶点和相关疾病靶点的交集靶点导入STRING网站进行蛋白质-蛋白质相互作用分析,得到的数据导入Cytoscape 3.8.2软件用MCODE插件进行模块分析,并将筛选出代表性的靶点通过Metascape和其他软件进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。用Cytoscape 3.8.2软件构建“化合物-靶点”“中药-化合物-靶点-通路”等网络。最后选取核心靶点与对应化合物进行分子对接。结果：筛选得到人参固本口服液与乳腺癌的共同靶点448个。核心靶点涉及SRC、STAT3、HSP90AA1、PIK3R1、Akt1、EGFR和ESR1。GO和KEGG富集分析结果显示,人参固本口服液治疗乳腺癌主要与细胞对氮化合物的反应、细胞对有机环状化合物的反应和MAPK级联反应等生物过...     

虎杖治疗肺动脉高压作用机制的网络药理学研究

目的 探讨虎杖药材治疗肺动脉高压（PAH）的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）和PubMed检索虎杖活性成分,构建活性成分库。通过TCMSP获取活性成分的潜在靶点,利用Uniprot数据库获取潜在靶基因。利用人类基因数据库（GeneCards）和人类孟德尔遗传数据库（OMIM）筛选PAH致病靶点与活性成分靶点基因,构建“药物-活性成分-疾病靶点”可视化网络。将潜在靶点导入String数据库,构建蛋白-蛋白相互作用（PPI）网络;利用DAVID数据库将潜在靶点进行基因本体论（GO）功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。将节点度值排名前7的活性成分与排名前6的核心靶点利用AutoDock Tools和PyMOL软件进行分子对接和可视化分析。结果 筛选出活性成分39个,对应靶基因323个,与PAH共同靶点138个。经PPI网络分析,其中关键靶点涉及AKT1,VEGFA,TNF等;GO功能富集分析主要涉及低氧反应、炎性反应、血管再生等功能;KEGG通路富集分析主要涉及细胞增殖、细胞凋亡、炎性反应等信号通路;分子对接结果表明,虎杖药材活性成...     

基于网络药理学及分子对接探讨“柴胡-当归”药对治疗乳腺增生的作用机制

目的 通过网络药理学和分子对接技术探索“柴胡-当归”药对治疗乳腺增生的潜在作用机制。方法 基于网络药理学,通过TCMSP、UniProt等数据库检索获得“柴胡-当归”药对的活性成分及其对应靶点蛋白。在Genecards数据库检索乳腺增生相关靶点,利用Draw Venn Diagram在线作图网站获得其与“柴胡-当归”作用靶点的交集基因。通过Cytoscape 3.6.0软件及STRING数据库构建药对-活性成分-作用靶点-疾病网络和靶点间蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,根据度值大小筛选出排名前5的靶蛋白,并利用RCSB PDB数据库、Autodock Vina 1.1.2等软件预测其与“柴胡-当归”药对活性成分的结合活性。采用RStudio软件对交集基因进行GO富集分析和KEGG通路富集分析,最终构建活性成分-关键靶点-关键通路网络。结果 数据库中筛选获得药对活性成分共18种;其中活性成分的靶点与乳腺增生疾病的交集基因共150个,根据度值排名大小获得5个核心靶标,包括蛋白激酶、白细胞介素-6、肿瘤蛋白p53、血管内皮生长因子A及肿瘤坏死因子等。经分子对接分析发现,“柴胡-当归”药对的活性成分与核心靶标结合能力较强。结论 “柴胡-当归”药对的主要活性成分可能通过调节蛋白激酶、白细胞介素-6、肿瘤蛋白p53、血管内皮生长因子A及肿瘤坏死因子等核心靶点,参与调控白介素-7(IL-7)信号通路、内分泌耐药、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、缺氧诱导因子1(HIF-1)信号通路等途径,发挥对乳腺增生的治疗作用。     

基于网络药理学和分子对接的逍遥散治疗肝癌并抑郁症的潜在机制探讨

目的 通过网络药理学和分子对接方法,探讨逍遥散治疗肝癌并抑郁症的潜在机制。方法 通过 TCMSP 数据库,以逍遥散组方中药中文名称为检索词,设置口服生物利用度（OB）＞30% 和类药性（DL）＞0.18 为筛选条件获取中药活性成分与靶点,从 GeneCards 数据库中获取肝癌和抑郁症疾病相关靶点,并将疾病靶点与药物成分靶点相互交集,获取共同交集靶点后,导入 DAVID 数据库进行京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路和基因本体（GO）功能的富集分析,并进行分子对接验证活性成分与关键靶点的亲和力。结果 获得逍遥散 161 个活性成分和 238 个靶点,而疾病靶点共计 11 204个;成分靶点和疾病靶点取交集得共同靶点 69 个;KEGG 通路富集在 AGEs-RAGE、癌症、HIF-1 等信号通路;分子对接显示核心成分 3β-乙酰氧基苍术酮与白细胞介素-6（IL-6）、肿瘤坏死因子（TNF）等靶点结合活性良好。结论 逍遥散主要通过 3β-乙酰氧基苍术酮介导 ILIB、TNF、BCL2 等靶标,调节 AGEs-RAGE、癌症等信号通路,发挥抗炎、免疫调控、促进细胞凋亡等作用,从而改善肝癌和抑郁症的症状。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨益气开秘方治疗便秘的作用靶点及效应机制

目的 运用网络药理学和分子对接技术研究益气开秘方治疗便秘的作用靶点及效应机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台收集筛选益气开秘方中组方药材的有效活性成分及对应靶点,利用GeneCards、OMIM、PharmGKB、TTD及DrugBank数据库获取疾病靶点;利用R软件4.1.1筛选成分和疾病的交集靶点,利用STRING数据库（version 11.5）和Cytoscape 3.8.2软件构建蛋白质–蛋白质相互作用（PPI）网络;运用R软件4.1.1进行基因本体（GO）功能及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;运用Autodock软件对关键作用靶点和活性成分进行分子对接,验证网络分析结果。结果 益气开秘方主要包含68个活性成分,活性成分对应靶点170个;便秘疾病靶点共1 586个;益气开秘方与便秘的交集靶点基因共68个。PPI分析出核心靶点为丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen-activated protein kinase 1,MAPK1)、MAPK3、蛋白激酶B1(AKT1)等;GO功能注释得到生物学过程条目1 825条（如衰老、平滑肌细胞增殖、肽基-丝氨酸...     

基于网络药理学和分子对接技术探讨如意金黄散抗炎作用的分子机制

目的：通过数据挖掘,运用网络药理学方法探讨如意金黄散抗炎作用的分子机制。方法：利用GeneCards数据库获取炎症相关靶点,运用BATMAN-TCM数据库获取如意金黄散中药物的活性成分及其相对应的靶点;将疾病靶点和药物靶点取交集后,构建药物-成分-靶点调控网络和蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;运用R软件进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,最后使用AutoDock Vina软件进行分子对接,验证结果的可靠性。结果：经过筛选共得到217个药物活性成分,159个炎症-如意金黄散交集基因,通过GO功能和KEGG通路富集分析得到2 051个GO条目和149条信号通路。如意金黄散可能是通过香芹酮、黄体酮和姜黄酮等多种酮类活性成分参与动脉粥样硬化信号通路、神经活性配体-受体相互作用信号通路、雌激素信号通路和肿瘤坏死因子(TNF)信号通路等多个途径作用于胰岛素、蛋白激酶B1、白蛋白、丝裂原激活的蛋白激酶1和TNF等多个关键靶点,从而发挥抗炎作用。分子对接结果显示,研究结果具有一定的可靠性。结论：本研究初步揭示了如意金黄散发挥抗炎作用的分子机制,为后...