血管生成相关基因多态性与肾透明细胞癌的相关性研究

目的 探讨血管生成相关基因多态性与肾透明细胞癌发病风险的关系. 方法 选取2005年6月至2012年9月收治的859例经病理检查证实的肾透明细胞癌患者及1 004例健康对照人群,采集研究对象外周血,在7个与血管生成有关的基因中(HIF1A,EPAS1,VEGFA,VEGFR1,VEGFR2,VEGFR3和PDGFRB)筛选出24个候选单核苷酸多态性位点,采用单碱基微测序技术进行基因分型.应用Logistic回归模型调整混杂因素后,分析各基因型与肾透明细胞癌发生的关系.结果 24个SNP位点中19个对照组基因型均符合遗传平衡定律.VEGFA基因rs2010963位点,VEGFR1基因rs3812867位点,VEGFR3基因rs1382302、rs448012、rs 1049095位点等5个位点的多态性与肾透明细胞癌发生显著相关(P＜0.05).多重检验校正后,仅有VEGFA基因rs2010963位点和VEGFR3基因的rs448012位点与肾透明细胞癌发生存在相关性(P＜0.05).VEGFA基因rs2010963位点携带CC/GC基因型的患者较携带GG基因型患者的肾透明细胞癌发病率显著升高(FDR=0.048,OR=1.38,95％ CI:1.13 ～ 1.69),VEGFR3基因rs448012位点携带CC/GC基因型的患者肾透明细胞癌的发病率显著高于携带GG基因型的患者(FDR=0.045,OR=1.36,95％CI:1.12～1.66). 结论 VEGFA基因的rs2010963位点与VEGFR3基因的rs448012位点多态性与肾透明细胞癌发病相关.     

前列腺癌易感性与丝裂原活化蛋白激酶激酶4基因多态性的关系

目的 探讨苏皖地区汉族人群中丝裂原活化蛋白激酶激酶4(MKK4)基因多态性与前列腺癌(PCa)易感性的关系.方法 采用病例对照研究,提取174例PCa患者和252例健康人(对照组)外周血基因组DNA,应用聚合酶链反应-连接酶特异检测技术(PCR-LDR)分析PCa患者和对照组MKK4基因-1304位点的多态性,比较不同基因型与PCa易感性的关系,并探讨吸烟、饮酒等因素在其中的影响.结果 MKK4基因启动子区存在1个SNP位点(- 1304 T＞G),基因型分别为TT型、TG型和GG型;Logistic回归分析显示,携带TG、GG和TG+GG基因型的个体与PCa发病风险之间无明显相关性[比值比(OR)=0.775,95％可信区间(CI) =0.516～1.164;OR =0.650,95％CI =0.216～1.956;OR =0.763,95％ CI =0.514～1.135].在高龄(＞70岁)和非饮酒人群中,TG+GG基因型的个体发病率明显减少,调整后的OR(95％ CI)分别为0.575(0.348 ～ 0.951)、0.477(0.252 ～0.906).结论 苏皖地区汉族人群中MKK4基因-1304位点基因多态性对PCa易感性无明显影响.     

巨噬细胞清道夫受体单核苷酸多态性与前列腺癌易感及患者预后的相关性分析

目的探讨分析巨噬细胞清道夫受体(MSR1)单核苷酸多态性与前列腺癌易感及患者治疗预后的相关性。方法选择2017年3月至2019年5月在本院治疗的前列腺癌患者103例设为前列腺癌组,再选取同期在本院健康体检的男性受试者97例设为对照组。检测两组受试者MSRI基因r918位点及rs1904577位点的基因多态性分布情况,并分析前列腺癌化疗相关因素及MSRI基因rs918.rs1904577位点与前列腺癌患者生存预后的关系。结果两组受试者MISRI基因rs918位点基因型GG、AG.AA比较,差异具有统计学意义(P<0.05),携带AG、AA基因型者相对于携带GG基因型者罹患前列腺癌的OR值分别为1.364.7.941;两组受试者MSRI基因rs1904577位点基因型GG,AG.AA比较,差异具有统计学意义(P<0.05),携带AG、AA基因型者相对于携带GG基因型者罹患前列腺癌的OR值分别为1.819.8.228。对可能影响患者化疗疗效的各因素进行单因素及多因素logstie回归分析,其中T分期.CGleason评分以及MSRI基因rs1904577位点基因型进人回归模型(P<0.05),是影响患者化疗疗效的重要因素。MSR1基因rs918位点CG以及AG+AA基因型前列腺癌患者生存情况比较,差异无统计学意义(P>0.05)。MSRI基因rs1904577位点GG基因型前列腺癌患者生存情况显著优于AG+AA基因型患者(P<0.05)。结论MSR1基因ns918位点和rs1904577位点单核苷酸多态性与前列腺癌易感性相关,其中rs1904577位点单核苷酸多态性与患者化疗的疗效及生存预后有关。     

胰腺癌易感性与X射线损伤修复交叉互补基因基因多态性联合吸烟的关系

目的 观察X射线损伤修复交叉互补基因(XRCC1)基因多态性与吸烟的交互作用对胰腺癌易感性的影响.方法 对210例胰腺癌患者和213例对照者提取外周血DNA,应用SNaPshot技术对XRCC1基因7个单核苷酸多态性(SNP)位点进行基因分型,比较不同基因型联合吸烟与胰腺癌易感性的关系.结果 胰腺癌患者rs25487位点A等位基因频率高于对照(P＜0.05);携带突变等位基因A(GA、AA或GA +AA)的个体发生胰腺癌的风险增高(P＜0.05);携带突变等位基因A(GA+ AA)且累积吸烟量≥20包/年的个体胰腺癌的发病风险增高了1.718倍(P＜0.05).胰腺癌患者rs1799782位点T等位基因频率高于对照(P＜0.05);携带突变等位基因T(CT、TT或CT +TT)的个体胰腺癌的发病风险增高(P＜0.05);携带突变等位基因T(CT+ TT)且累积吸烟量≥20包/年的个体胰腺癌的发病风险增高了1.905倍(P＜0.05).结论 XRCC1基因rs25487、rs1799782位点的SNP可能与胰腺癌相关,其多态性联合吸烟对胰腺癌的发病风险有一定影响.     

南京地区汉族人群TRAIL基因多态性与前列腺癌的易感性研究

目的:探讨南京地区汉族人群中肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体(TRAIL)基因多态性与前列腺癌(PCa)易感性的关系。方法:采用病例对照研究,提取187例PCa患者和237例非PCa健康人(对照组)外周血基因组DNA,应用聚合酶链反应-连接酶特异检测技术(PCR-LDR)分析186例PCa患者和237例对照组TRAIL基因-716位点的多态性,比较不同基因型与PCa易感性的关系。结果:TRAIL基因启动子区存在一个SNP位点(-716A/G),基因型分别为AA型、AG型和GG型;Logistic回归分析显示,携带AG、GG和AG+GG基因型的个体与PCa发病风险之间无明显相关性(OR=0.89,95%CI=0.54～1.47;OR=0.94,95%CI=0.69～1.27;OR=0.87,95%CI=0.54～1.41)。结论:中国南京地区汉族人群中TRAIL基因-716位点基因多态性对PCa易感性无明显影响。     

汉族人群白介素17受体C基因单核苷酸多态性与青少年特发性脊柱侧凸的相关性

【摘要】　目的：探讨白介素17受体C（IL-17RC）基因单核苷酸多态性与中国汉族人群青少年特发性脊柱侧凸（adolescent idiopathic scoliosis,AIS）易感性之间的相关性。方法：收集529例AIS女性患者及512例正常同龄女性青少年的静脉血标本,采用聚合酶链反应－限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）方法鉴定和统计两组人群IL-17RC基因rs708567和rs279545多态性位点的基因型及等位基因分布频率;比较两组间不同多态性位点各基因型及等位基因分布频率的差异。结果：研究Power值（81%）大于80%,AIS患者组及正常对照组各多态性位点的基因型分布均符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律。AIS组rs708567多态性位点GG基因型和G等位基因的分布频率显著高于对照组GG基因型（90.17% vs. 85.55%,P=0.023）和G等位基因（95.1% vs. 92.8%,P=0.028）的分布频率;携带GG基因型青少年中AIS的发病率约为携带AG基因型青少年的1.5倍（OR值=1.55;95% CI:1.45~3.11）。rs279545多态性位点各基因型及等位基因的分布频率在两组间均无统计学差异。结论：中国汉族人群中IL-17RC基因单核苷酸多态性与AIS的发生相关。     

IL-17基因rs2275913多态性与胃癌易感性的Meta分析

目的:探讨IL-17基因rs2275913多态性与胃癌易感性的关系。方法:检索多个国内外数据库,收集有关IL-17基因GA多态性位点rs2275913(G197A)与胃癌易感性的病例-对照研究。筛选文献、提取数据和文献质量评价后,采用STATA 12.1统计软件进行Meta分析。结果:最终纳入10个病例-对照研究,其中病例组4 371例,对照组5 345例。Meta分析结果显示,IL-17基因rs2275913位点多态性的等位基因模型(A vs.G)(OR=1.22,95%CI=1.10~1.37)与相加模型(AA vs.GG)(OR=1.58,95%CI=1.23~2.04)胃癌风险增加,显性模型(AG+GG vs.AA)(OR=0.63,95%CI=0.48~0.84)、隐性模型(GG vs.AG+AA)(OR=0.86,95%CI=0.78~0.94)胃癌风险降低(均P0.05),但共显性模型(AG vs.AA+GG)(OR=0.91,95%CI=0.78~1.07)与罹患胃癌的风险无明显关系(P0.05)。结论:IL-17基因rs2275913多态性的与胃癌易感性密切相关。     

乳腺癌发病风险及侵袭特性与白细胞介素-8和CXCR2基因多态性的关系

目的 探讨细胞因子白细胞介素( 1L)-8(- 251)位点及其受体CXCR2(±1208)位点多态性与乳腺癌发病风险及侵袭特性的关系.方法 采用等位基因特异-聚合酶链反应(AS-PCR)分析方法检测228名乳腺癌患者和100例健康对照者的IL-8(- 251)位点及其受体CXCR2(±1208)位点多态性分布,并进行统计学分析.结果 IL-8(- 251)位点TA型和AA型以及CXCR2(± 1208) TT型是乳腺癌的高危基因型[比值比(OR)=1.57,95％可信区间(CI)=1.08～2.32;OR =2.68,95％ CI=1.26 ～2.99;0R=2.02,95％CI=1.08～3.62],在两组间表达频率的差异有统计学意义(P＜0.05).携带1个及以上高危基因型增加患乳腺癌的风险.分层分析表明携带IL-8(-251)等位基因A和CXCR2(± 1208)等位基因T增加乳腺癌的侵袭特性,其分布频率在肿瘤的高组织学分级(OR=1.95,P＜0.01;OR=1.52,P＜0.05)和淋巴结转移阳性(OR=1.65,P＜0.05;0R=1.66,P＜0.01)中差异有统计学意义.另外,IL-8(-251)A等位基因与ER( -)乳腺癌显著相关( OR=1.65,P＜0.05).结论 IL-8和CXCR2的基因多态性可能与女性乳腺癌的发生发展关系密切,可作为乳腺癌早期基因诊断的指标.     

云南汉族非综合征性唇腭裂与p53基因多态性的相关性研究

目的:分析p53基因单核苷酸多态性(SNPs)位点的多态性,探究云南汉族非综合征性唇腭裂与p53基因的相关性。方法:选取2016年1月-2018年12月于笔者医院就诊的非综合征性唇腭裂患儿100例为试验组,选取医院同期无先天性畸形正常患儿100例为对照组。采用Taqman探针荧光定量PCR法对p53基因的SNPs位点rs12947788和rs1042522进行基因分型,并用χ^2检验和Logistic回归分析多态位点与非综合征性唇腭裂的相关性。结果:p53的基因SNPs位点rs12947788的等位基因变体A携带者(AA+GA vs GG)发生非综合征性唇腭裂的风险增加(OR=1.393,95%CI 1.030~1.884,P=0.032)。rs1042522(CC vs CG+GG)增加吸烟者母亲生下NSCL/P患儿的风险(OR=2.561,95%CI=1.146~5.721,P=0.022)。rs12947788(AA+GA vs GG)可明显增加有饮酒史母亲(OR=3.235,95%CI=1.158~9.040,P=0.025)生下NSCL/P患儿的风险。结论:云南汉族人群非综合征性唇腭裂与p53基因rs1042522、rs12947788多态具有一定的相关性。     

信号传导与转录激活因子-4基因rs7574865位点单核苷酸多态性与类风湿关节炎易感性荟萃分析

目的：综合评价信息传导与转录激活因子-4基因（STAT4基因）rs7574865位点单核苷酸多态性与类风湿关节炎易感性的相关性。方法：计算机检索Pubmed、Embase、中国生物医学文献数据库和万方数据库数据库等,并手工检索相关杂志,收集有关不同人群STAT4基因rs7574865位点单核苷酸多态性的等位基因频率、基因型频率与类风湿性关节炎易感性相关性的研究,采用Stata 12.0软件进行Meta分析;选择的遗传模型包括GT＋TT与GG比较,TT与GT＋GG比较,TT与GG比较以及等位基因T与G之间比较。结果：STAT4基因rs7574865位点T等位基因频率与类风湿性关节炎易感性可能具有相关性（OR=1.259,95%CI=1.202-1.319, P＜0.001）;T等位基因频率与类风湿性关节炎易感性的相关性在欧洲、亚洲、非洲、拉丁美洲人群中有统计学意义;在总体人口中STAT4基因rs7574865位点的基因型与类风湿性关节炎易感性可能具有相关性;在总体人口中STAT4基因rs7574865位点多态性与抗CCP抗体阳性或RF因子阳性类风湿性关节炎易感性仍可能具有相关性。结论：STAT4基因rs7574865位点单核苷酸多态性与类风湿性关节炎易感性可能具有相关性,而且这种相关性可能独立于患者RF因子以及抗CCP抗体水平。     

食管癌易感性与细胞毒性T淋巴细胞相关抗原4基因多态性的关系

目的 探讨细胞毒性T淋巴细胞相关抗原4(CTLA4)基因3个位点基因型及单倍型频率分布与食管癌易感性的关系.方法 应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法,检测205例食管癌患者(男113例,女92例)和205例与病例组同性别、同年龄的正常对照者CTLA4基因第一外显子区+49A/G、启动子区-1661A/G和-1772A/G位点的基因型,采用条件Logistic回归模型分别进行基因多态性、单倍型与食管癌易感性的相关分析.结果 CTLA4+49位点基因型AG和AA均增加食管癌发病风险(P＜0.01,OR=2.280;P＜0.O1,OR=2.192).-1661位点AG基因型频率在病例组也高于对照组(P＜0.01,OR=1.848),而GG基因型在两组间分布差异无统计学意义(P＞0.05);-1772位点各基因型频率在病例组和对照组分布差异均无统计学意义(P＞0.05).单倍型分析显示AAG单倍型可增加食管癌的风险(P＜0.01,0R=5.035),而GAA单倍型则降低食管癌风险(P＜0.01,0R=0.413).结论 CTLA4基因+49A/G和-1661A/G位点基因多态性与食管癌易感性相关,单倍型分析进一步证实AAG单倍型为食管癌的危险因素,而GAA单倍型是其保护因素.     

Association of uromodulin gene polymorphism with diabetic kidney disease in Han population in Tianjin of China

Objective To investigate the association of single nucleotide polymorphism (SNP) rs13333226 in uromodulin (UMOD) gene with diabetic kidney diseases (DKD) in Han population in Tianjin, China. Methods A total of 210 type 2 diabetes (T2DM), 90 normal controls (NC) and 280 DKD patients were recruited. According to the level of estimated glomerular filtration rate (eGFR), the DKD subjects were further subdivided into three groups: GFR≥90 ml/min group (n=105), 60 ml/mim≤GFR＜90 ml/min group (n=84) and GFR＜60 ml/min group (n=91). Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) was used for UMOD rs13333226C genotyping. Results The frequencies of AA, GA, GG genotype were 27.8%, 58.9%, 13.3% in NC group and 41.0%, 48.6%, 10.5% in T2DM group and 54.3%, 36.1%, 9.6% in DKD group．The frequency of G allele was 42.8% in NC group, 34.8% in T2DM group and 27.7% in DKD group. The genotype distribution of UMOD was statistically significant between NC group and DKD group, and between T2DM group and DKD group (P＜0.05). G allele of UMOD was an independent protective gene polymorphism of DKD in Logistic regression (B=-0.248, Wald=8.012, P=0.021, OR=0.780, 95%CI 0.612-0.968). Conclusion The G allele of UMOD gene may be an independent protective factor of DKD in Han population in Tianjin, China.     

The impact of polymorphism on prostate specific antigen gene on the risk, tumor volume and pathological stage of prostate cancer

PURPOSE: A single nucleotide polymorphism with adenine (A) to guanine (G) substitution is identified at position -158 in the androgen response elements region of the prostate specific antigen (PSA) gene. We evaluated the relationship between the PSA -158A/G polymorphism and the risk, tumor volume and pathological stage of prostate cancer. MATERIALS AND METHODS: Peripheral venous blood samples were obtained from 122 patients with prostate cancer and 84 controls with benign prostatic hyperplasia. The diagnosis, tumor volume and pathological stage of prostate cancer were all determined according to the pathological reports of transrectal ultrasound guided prostate biopsy, transurethral prostate resection and radical prostatectomy. The PSA -158A/G polymorphism was determined by polymerase chain reaction based restriction fragment length polymorphism methods. RESULTS: Patients with prostate cancer had significantly greater frequencies of the G allele (87.3% vs 77.4%) and GG genotype (78.7% vs 61.9%) than the control group (p = 0.008 and 0.028, respectively). The OR of GG to AG and AA was 2.27 (p = 0.008). In the prostate cancer group the GG genotype was also associated with larger tumor volume (2.34 vs 0.82 ml) and higher pathological stage (organ confined cancer 68.2% vs 31.8% and extracapsular extension 100% vs 0%) than the GA and AA genotypes (p = 0.013 and 0.036, respectively). CONCLUSIONS: The PSA -158A/G polymorphism is associated with prostate cancer. The G allele increases the risk of prostate cancer and the GG genotype is associated with larger tumor volume and higher pathological stage.     

膝骨关节炎与相关金属蛋白酶的基因多态性关联研究

目的探讨带有血小板凝血酶敏感蛋白样模体的解整链蛋白金属蛋白酶5(ADAMTS-5)基因单核苷酸多态性(SNP)与膝骨关节炎的关联性。 方法连续收集洛阳正骨医院188例膝骨关节炎患者作为病例组，对照组收集排除疾病诊断的100人。应用基因组变异服务器(GVS)网站选择ADAMTS-5基因共计15个SNP位点，采用基质辅助激光解析飞行时间质谱分析技术(MALDI-TOF-MS)进行SNP分型，先行哈迪温伯格(HW)平衡检测，对符合HW平衡的SNP位点等位基因进行卡方检验及单体型分析，对基因型进行logistic回归分析。 结果病例组rs2249350位点C等位基因显著多于对照组[比值比(OR)＝1.176，95%置信区间(CI)(1.025，1.351)，P＝0.016]，A等位基因显著少于对照组[OR＝0.761，95%CI(0.612，0.947)，P＝0.016]；rs2249350位点AA基因型[OR＝0.288，95%CI(0.124，0.669)，P＝0.004]及隐性基因模型[OR＝0.348，95%CI(0.162，0.749)，P＝0.007]均与膝关节骨关节炎负相关；rs229054、rs2249350两位点存在连锁不平衡，构成GC、GA、AC共3个单体型区块，其中病例组单体型GC显著多于对照组[OR＝1.259，95%CI(1.032，1.537)，P＝0.019]，而GA则显著少于对照组[OR＝0.763，95%CI(0.614，0.949)，P＝0.017]。 结论ADAMTS-5基因rs2249350位点C等位基因可能是膝关节骨关节炎的致病性因素，A等位基因则可能是保护性因素；rs2249350位点AA基因型可能是膝关节骨关节炎的保护性基因型，降低患病风险，且A等位基因可能为隐性基因，隐性遗传；rs229054、rs2249350位点GC单体型可能是膝关节骨关节炎的致病性因素，而GA单体型则可能是保护性因素。该位点等位基因、基因型及单体型与膝关节骨关节炎的关系仍需进一步深入研究和验证。     

胰头癌遗传易感性与EGF61*G/G基因型的关系

目的 通过研究表皮生长因子(EGF)61*G/A基因功能多态性了解EGF因子对胰头癌生成的影响.方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法 检测胰头癌组及正常对照组的EGF 61*G/A基因型.结果 胰头癌患者EGF 61*G/G基因型或61*G等位基因明显高于对照组,其差异有统计学意义(基因型χ~2=6.042,P＜0.05,0R=2.618,95%CI=1.195～5.738;等位基因χ~2=6.007,P＜0.05,OR=1.696,95%CI=1.110～2.592).结论 EGF 61*G/G基因型或61*G等位基因与胰头癌的生成相关.     

肾透明细胞癌易感性与表皮生长因子基因-61G＞A多态性的相关性

目的 探讨中国南方汉族人群中表皮生长因子(EGF)基因-61G＞A多态性与肾透明细胞癌(CCRCC)易感性的相关性.方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测中国南方汉族295例患者和295例正常人群的EGF-61G＞A基因型,分层分析探讨罹患CCRCC的相关因素.结果 与GG型携带者比较,GA型(OR=1.49,95%CI=1.05～2.12)或AA型(1.99,1.12～3.52)携带者发生CCRCC的危险性明显升高.分层分析显示当携带GA或AA型的患者年龄、性别、吸烟以及体质量指数大于23是发生CCRCC的危险因素(年龄:2.48,1.54～4.01;男性:1.56,1.03～2.36;吸烟:2.17,1.23～3.82;体质量指数:1.96,1.28～3.01).结论 EGF-61 G＞A多态性可能与我国南方地区汉族人群CCRCC易感性有关.

Abstract：

Objective To investigate the association between the -61G ＞ A polymorphism in the epidermal growth factor (EGF) gene and susceptibility to renal clear cell carcinoma (RCC) in a southern Chinese population. Methods We obtained information on demographic factors by a personal interview.The polymorphism was analyzed by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) using genomic DNA isolated from 295 patients with RCC and 295 age- and sex-matched controls. Stratification analysis by age, sex, smoking, drinking and BMI status was performed. Results As compared with the -61GG genotype, individuals carrying GA genotype (OR = 1.49, 95％ CI = 1.05 -2. 12) or AA genotype (1.99, 1.12-3.52) had an increased risk of RCC. Stratified analysis revealed that the increased risk was more pronounced among young people (2. 48, 1.54-4. 01 ), males ( 1.56, 1.03-2. 36), smokers (2. 17, 1.23-3. 82) and those with body mass index larger than 23 ( 1.96, 1.28-3.01 ).Conclusion EGF-61G ＞ A polymorphism may contribute to the etiology of RCC in a southern Chinese population.