母系遗传氨基糖苷类抗生素致聋家系的线粒体DNA突变分析

目的确定母系遗传氨基糖苷类抗生素致聋家系的线粒体DNA突变位点，并研究其临床表型．方法应用PCR和DNA序列分析技术，对一个有明确氨基糖苷类抗生素应用史的母系遗传耳聋家系共18人(包括聋人和听力正常者)的线粒体DNA进行研究。结果该家系中有9份样品存在线粒体DNA 12SrRNA1555位点A—G的突变，其余样品为1555G点突变阴性。结论提示线粒体DNA点突变是导致该家系致聋的主要因素之一。     

邢台市聋哑学生线粒体DNA C1494T和A1555G突变分析

目的调查邢台市聋哑学校耳聋患者线粒体DNA m.C1494T和m.A1555G突变情况。方法对2013-2014年河北省邢台市聋哑学校的115例耳聋学生进行遗传性耳聋问卷调查、体格检查和听力学评估。采用Sanger测序法检测线粒体12SrRNA m.C1494T和m.A1555G两个突变位点。结果 2例(1.7%)携带线粒体DNA m.A1555G均质性突变,1例(0.9%)携带线粒体DNA m.C1494T均质性突变。结论邢台地区线粒体DNA m.A1555G突变发生率与其他地区比较偏低,m.C1494T突变发生率与其他地区比较偏高。在地区性耳聋病因调查中运用基因诊断技术,可以用于早期诊断,遗传咨询和指导该家系成员预防药物性耳聋。     

LEBER''S病家系人群外周血NO、NOS的相关性研究

Leber s遗传性视神经病变 (LHON)是一种主要累及视网膜、巩膜筛板前部视乳头黄斑束纤维 ,导致视神经变性的遗传性疾病。本病临床上主要表现为双眼同时或先后急性或亚急性中心视野缺失 ,眼底检查可见视神经退行性病变[1] 。该病自从Wallace等在 1988年首先发现是由线粒体DNA (mtDNA)突变造成以来 ,LHON与mtDNA突变及相关因素研究一直是神经眼科研究的热点。我国mtND4 LHON11778A尤其高发 ,同时也有人认为本病还与氧化应激、环境因素、核基因遗传及自身免疫等方面有关。本研究对三个已发现有线粒体DNA11778点突变的LHON家系人…     

锰中毒性帕金森综合征与线粒体基因突变的关系

目的探讨线粒体DNA(mtDNA)基因突变与锰中毒性帕金森综合征之间的关系,以了解其是否为锰中毒性帕金森综合征发病中的一环。方法采用聚合酶链反应(PCR)、单链构象多态性分析(SSCP)、测序方法对临床诊断为锰中毒性帕金森综合征的18例患者和40名健康对照组的mtDNA点8344、11778及12SrRNA区域所在片段进行分析。结果有15例存在mtDNA 9bp片段缺失;在锰中毒性帕金森综合征患者中发现有4例存在mtDNA8175G>A点突变、3例存在mtDNA11914G>A点突变;所有研究对象均未检测到mtDNA点8344、11778及12SrRNA区域突变。结论广西人群mtDNA 9bp缺失率较高(25.9%);mtDNA 8175G>A和mtDNA 11914G>A点突变可能为锰中毒性帕金森综合征的1个致病突变;mtDNA点8344、11778及12SrRNA区域突变可能不是锰中毒性帕金森综合征的突变热点。     

两种错义突变p.Glu502Lys和p.Gly542Ser所致遗传性Ⅻ缺陷症家系的分析

目的对1个近亲结婚的遗传性凝血因子Ⅻ(FⅫ)缺陷症家系进行凝血指标检测和基因突变分析,探讨其分子发病机制。方法检测先证者及其家系成员血浆凝血酶原时间(PT)、活化部分凝血活酶时间(APTT)、FⅫ活性(FⅫ:C)等凝血指标;对先证者FⅫ基因所有的外显子及其侧翼序列进行PCR扩增和DNA直接测序。针对先证者的突变位点,对该家系成员进行相应的基因突变检测。结果先证者和其妹妹APTT、FⅫ:C明显异常,分别为174.8 s、0.8%和109.5 s、1.9%。基因测序发现先证者和其妹妹FⅫ基因存在13号外显子c.1561G>A(p.Glu502Lys)及14号外显子c.1681 G>A(p.Gly542Ser)2种杂合错义突变。家系分析表明先证者父亲和儿子携带c.1561G>A杂合突变,母亲携带c.1681 G>A杂合突变。先证者及家系成员FⅫ基因第1外显子启动子区46位多态性均为46C>T型。结论 FⅫ基因p.Glu502Lys和p.Gly542Ser 2种杂合错义突变是导致先证者遗传性FⅫ缺陷症的分子发病机制。     

胰腺癌细胞线粒体DNA突变的检测和分析

目的 研究胰腺癌细胞线粒体DNA调控序列（D-loop）区突变情况.方法 用PCR与直接测序相结合的方法,对比分析二株胰腺癌细胞株SW1990,JF-305和1例原代培养的正常胰腺细胞的线粒体DNA D-loop区的突变位点.结果 二株胰腺癌细胞系和正常胰腺细胞的线粒体DNA D-loop区均存在不同程度的点突变,SW1990共检测到8个突变位点,JF-305共检测9个突变位点,其中73位A-G,16223位C-T,16358位C-T这三个突变位点在二株癌细胞和正常胰腺细胞中均检测到,考虑为多态性变化,其中16211位C-T,16311位T-C两个相同的突变位点在二株胰腺癌细胞中均检测到,考虑为特征性突变.结论 胰腺癌细胞线粒体DNA D-loop区具有多态性和突变性,其特征性突变有望成为新的分子标记.     

线粒体DNA A1555G位点突变与氨基糖甙类抗生素致聋遗传易感性的研究

应用PCR-限制性内切酶酶切片段长度多态性技术,对83例过去应用过氨基糖甙类抗生素药物而目前有听力下降的患者的外周血线粒体DNA的A1555G位点突变情况进行了研究.结果发现6例患者线粒体DNA的12S rRNA基因A1555G位点发生了点突变的阳性率7.2%.而其余77例患者及50例正常人无一例在此位点有突变.研究显示mtDNA A1555G点突变是药物性耳聋遗传易感性最常见的基因突变类型.     

Peutz-Jeghers综合征一家系的STK11基因的突变研究

目的研究Peutz-Jeghers综合征一家系的STK11基因突变情况。方法收集1例Peutz-Jeghers综合征家系,采用聚合酶链反应(PCR)及直接测序法对该家系中4例患者STK11基因进行突变检测,以家系中的8例健康者和100例无亲缘关系的正常人作对照。结果家系中4例患者STK11基因的5号外显子第725位碱基鸟嘌呤(G)被腺嘌呤(A)替代,导致第242位的甘氨酸被谷氨酸取代(G242E),而在家系中健康者及无亲缘关系的正常人中均未发现此突变。结论错义突变c.725G>A是导致该家系临床表型的主要原因。     

新生儿常见致聋基因突变位点的大样本筛查分析

目的 探讨新生儿常见聋病易感基因突变位点分布情况,为临床干预奠定基础.方法 采用实时荧光聚合酶链反应(PCR)技术对11121例新生儿进行常见聋病易感基因突变位点筛查,筛查位点为我国常见的3个致聋基因GJB2(c.235 del C、c.299-300 del AT)、线粒体DNA 12S rRNA(c.1494 C>T、c.1555 A>C)和SLC26A4(c.2168 A>G、c.IVS7-2 A>G)的6个突变位点;基因突变者进行测序验证及听力诊断.结果 11121例新生儿中发生耳聋基因突变者517例,其中纯合突变39例、杂合突变469例、单基因复合杂合突变2例,双基因复合杂合突变7例,阳性率4.65%.基因突变包括:GJB2突变286例(包括2例c.235 del C杂合突变复合c.299-300 del AT杂合突变);线粒体DNA 12S rRNA基因突变189例;SLC26A4基因突变35例;双基因复合杂合突变7例,男婴耳聋基因突变阳性率显著高于女婴(χ2=8.653,P<0.01).测序结果与PCR结果一致,517例基因突变新生儿中13例发生听力损伤,其中轻度6例,中度3例,极重度4例.结论 GJB2基因的c.235 del C位点突变率最高,其次为SLC26A4基因的c.IVS7-2A>G位点,线粒体DNA 12S rRNA基因的c.1494C>T位点突变极低,不属于本地区的致聋热点基因,且男女婴之间突变阳性率存在显著差异,为该地区耳聋基因筛查方向提供了重要依据.     

原发性肝癌表皮生长因子受体突变的研究

目的对原发性肝癌患者EGFR基因进行检测,分析EGFR基因突变与原发性肝癌及患者年龄组成的关系。方法对2 507例确诊原发性肝癌的石蜡包埋组织样本用PCR扩增法和双向测序法检测EGFR基因突变状态。结果 2 507例患者仅检测出620例(24.74%)EGFR基因20外显子同义突变Q787Q(2361G>A)和263例(10.49%)19内含子点突变(2284-60T>C);EGFR基因突变与患者性别、病理类型无关(P>0.05),与患者的年龄段组成明显相关(P<0.05),且基于年龄段的分布,20外显子突变与19内含子突变呈显著正相关(P<0.05)。结论本研究中未发现EGFR基因热点突变。同义突变位点Q787Q尚存在进一步需要被证实的功能。20外显子突变和19内含子突变与患者年龄分布有明显相关性,可为原发性肝癌患者提供更具体的个体化治疗方案。     

Grand rounds: could occupational exposure to n-hexane and other solvents precipitate visual failure in leber hereditary optic neuropathy?

CONTEXT: Leber hereditary optic neuropathy (LHON) is a maternally inherited loss of central vision related to pathogenic mutations in the mitochondrial genome, which are a necessary but not sufficient condition to develop the disease. Investigation of precipitating environmental/occupational (and additional genetic) factors could be relevant for prevention. CASE PRESENTATION: After a 6-month period of occupational exposure to n-hexane and other organic solvents, a 27-year-old man (a moderate smoker) developed an optic neuropathy. The patient had a full ophthalmologic and neurologic investigation, including standardized cycloergometer test for serum lactic acid levels and a skeletal muscle biopsy. His exposure history was also detailed, and he underwent genetic testing for LHON mitochondrial DNA mutations. The patient suffered a sequential optic neuropathy with the hallmarks of LHON and tested positive for the homoplasmic 11778G--> A/ND4 mutation. Routine laboratory monitoring revealed increased concentrations of urinary 2.5 hexandione (n-hexane metabolite) and hippuric acid (toluene metabolite) in the period immediately preceding the visual loss. DISCUSSION: In a subject carrying an LHON mutation, the strict temporal sequence of prolonged appreciable occupational exposure followed by sudden onset of visual loss must raise a suspicion of causality (with a possible further interaction with tobacco smoke). RELEVANCE: In this article, we add to the candidate occupational/environmental triggers of LHON and highlight the need for appropriate case-control (and laboratory) studies to validate the causal effect of mixed toxic exposures.     

一种新的BRCA1等位基因

目的　对乳腺癌易感基因- 1(BRCA 1) m RNA进行全长序列分析。方法　采用逆转录PCR(RT-PCR)技术和c DNA测序,分析3名个体的BRCA1基因m RNA全长序列,3名个体中,2名为乳腺癌患者,另一名为健康献血者。结果　健康献血者的BRCA1基因m RNA序列与以往报道的正常m RNA序列(U 14 6 80 )完全一致;1名患者的BRCA 1m RNA序列在第11外显子发现5处碱基突变外:2 2 0 1C>T,2 4 30 T>C,2 731C>T,32 32 A>G和36 6 7A>G,在第13和第15外显子各有一处碱基变异:4 4 2 7T>C和4 95 6 A>G;另一名患者则在上述碱基变异位点均表现为正常BRCA1基因和突变等位基因的杂合性。结论　结果表明通过BRCA 1基因m RNA序列分析,发现一新的等位基因,该基因与正常BRCA1编码区序列存在7处碱基差异,新等位基因已由EMBL /Gen Bank/DDBJ收录,注册号为AY75 14 90。     

非综合征性耳聋家系的临床分析与基因检测

目的:探讨母系遗传氨基糖甙类抗生素致聋家系的临床表型与基因突变的关系。方法:收集贵州省遵义地区不同民族的6个母系遗传非综合征性耳聋家系的临床资料及血液样本,经PCR-RFLP及测序技术检测线粒体DNA 1555G、3243G、7445G突变,并通过对各家系线粒体DNA高变区序列测定及编码区限制性片段多态性分析以划分单倍型类群。结果:经酶切及测序证实其中4个家系存在线粒体DNA 1555G突变,但未发现线粒体DNA 3243G、7445G突变。6个耳聋家系分别属于A、D6、D、G、B5 a及M*单倍型。结论:该地区线粒体DNA 1555G突变引起氨基糖甙类抗生素高度敏感致聋的家系发生率较高,提示线粒体DNA 1555G突变检测有一定的临床应用价值。     

遗传性白内障家系收集及其遗传资源库的初步建立

目的：抢救性收集遗传性白内障家系资源,初步建立白内障遗传资源库。方法：利用本市出生缺陷监测网络系统,开展遗传性白内障调查以及家系成员患病状况调查,并经过专科检查、遗传学表型和系谱分析确认遗传性白内障家系。抽取患者和正常家庭成员外周血,提取DNA。结果：鉴定检查2个家系,共25人,其中遗传性白内障患者7人,系谱分析确认该病在这两个家系中的遗传方式均为常染色体显性遗传;收集到散发病例25个。外周血提取基因组DNA,质量经琼脂糖凝胶电泳确认带纹明显、清晰,效果佳。提取DNA样本储存-80℃冰箱。结论：成功地获得到2个遗传性白内障家系的详细背景资料、血样及基因组DNA,初步建立遗传性白内障遗传资源库。为全基因组扫描,寻找该病的易感基因及其初步定位奠定基础。     

遗传性耳聋基因芯片检测的临床应用研究

目的应用遗传性耳聋基因芯片对散发性耳聋患者进行耳聋基因筛查,评价其在临床上快速检测常见遗传性耳聋基因的可行性。方法研究对象为76例耳聋患儿,取外周血5mL,分离提取全血淋巴细胞基因组DNA,用遗传性耳聋基因芯片检测中国人中常见的4个耳聋相关基因上的9个热点突变,包括GJB2(35delG、176del16、235delC及299delAT)、GJB3(C538T)、SLC26A4(IVS7-2A>G、A2168G)以及线粒体12S rRNA(A1555G、C1494T)。结果在76例样本中,共检出9例突变,其中5例为SLC26A4IVS7-2A>G杂合突变型;1例线粒体12S rRNA1555A>G均质突变型;1例GJB2235delC/GJB2299delAT复合杂合突变型;1例GJB2235delC纯合突变型;1例SLC26A4IVS7-2A>G纯合突变型。结论遗传性耳聋基因芯片对中国人中常见耳聋相关基因突变位点检出率高,可满足临床耳聋基因检测的要求,具有广阔的临床应用前景。     

线粒体DNA突变和肿瘤发生

肿瘤细胞线粒体及线粒体DNA的研究已从形态学改变进展至分子水平的变化。由于近年来在多种肿瘤组织中发现了线粒体DNA的突变 ,而且线粒体DNA的突变率明显高于核基因 ,所以研究者们趋向认为线粒体DNA的突变与肿瘤发生密切相关。我们就近年来线粒体DNA突变与肿瘤关系的研究进展做一综述 ,以期探讨线粒体DNA突变在肿瘤发生中的作用     

Association Testing of the Mitochondrial Genome Using Pedigree Data

In humans, mitochondria contain their own DNA (mtDNA) that is inherited exclusively from the mother. The mitochondrial genome encodes 13 polypeptides that are components of oxidative phosphorylation to produce energy. Any disruption in these genes might interfere with energy production and thus contribute to metabolic derangement. Mitochondria also regulate several important cellular activities including cell death and calcium homeostasis. Aided by sharply declining costs of high‐density genotyping, hundreds of mitochondrial variants will soon be available in several cohorts with pedigree structures. Association testing of mitochondrial variants with disease traits using pedigree data raises unique challenges because of the difficulty in separating the effects of nuclear and mitochondrial genomes, which display different modes of inheritance. Failing to correctly account for these effects might decrease power or inflate type I error in association tests. In this report, we sought to identify the best strategy for association testing of mitochondrial variants when genotype and phenotype data are available in pedigrees. We proposed several strategies to account for polygenic effects of the nuclear and mitochondrial genomes and we performed extensive simulation studies to evaluate type I error and power of these strategies. In addition, we proposed two permutation tests to obtain empirical P values for these strategies. Furthermore, we applied two of the analytical strategies to association analysis of 196 mitochondrial variants with blood pressure and fasting blood glucose in the pedigree rich, Framingham Heart Study. Finally, we discussed strategies for study design, genotyping, and data cleaning in association testing of mtDNA in pedigrees.     

脊髓小脑性共济失调3型、7型患者三家系的临床表现和基因突变

目的 探讨脊髓小脑性共济失调3型、7型的基因突变特点及临床表现.方法 总结3个家系中13例患者的临床表现,对13例患者、4例＂健康＂成员和4例普通成员,采用PCR法、琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物、基因测序等技术分析SCA3、7型基因内CAG三核苷酸重复序列的长度和扩增数.结果 1个家系中4例患者存在SCA3/MJD（CAG）n扩增突变,CAG重复数为65～74次;2个家系中9例患者存在SCA7（CAG）n扩增突变,CAG重复数为40～52次.两亚型在神经系统受累部位等方面存在差异.结论 SCA3/MJD和SCA7型患者临床表现存在一定的差异,有利于鉴别及分型,但是基因检测是SCA患者确诊的唯一有效的诊断方法.     

深圳地区人群苯丙酮尿症患者基因分析

目的 探讨深圳地区苯丙酮尿症(PKU)患血苯丙氨酸羟化酶(phenylalanine hydroxylase，PAH)基因单核苷酸多态性位点。方法 设计7对引物，应用多聚酶链反应-单链构像多态(PCR-SSCP)银染技术和DNA序列分析了3个PKU家族共13个成员的PAH基因。结果 PCR-SSCP分析发现，其中2个家族的子女及其父母有电泳条带异常。测序结果示两多态性位点均在内含子10上。结论 2种突变类型可能为单核苷酸变化。