应用"酶生物信号放大系统"放大DNA压电传感器检测信号的研究

目的 研究"酶生物信号放大系统"用于放大DNA压电传感器检测信号的可行性和有效性.方法 在压电石英基片金膜上固定标有biotin的金黄色葡萄球菌oligo探针,加入HRP和底物DAB生成附着于金膜的不可溶沉淀,观察频率对沉淀的响应.在金膜上固定金黄色葡萄球菌oligo探针后与标有biotin的靶序列杂交,加入HRP和底物DAB.比较直接检测杂交时频率变化值和酶系统放大后信号频率变化值.结果 该系统生成的沉淀可显著降低谐振频率.经酶系统放大后检测信号频率变化值显著高于直接检测信号频率变化值.结论 酶生物信号放大系统可有效地放大DNA传感器检测信号,降低非特异信号的产生.     

金黄色葡萄球菌nuc基因特异性核酸探针的制备及应用

目的　建立核酸探针检测实验动物金黄色葡萄球菌的方法。方法　将重组质粒pGEM NUC中金黄色葡萄球菌nuc基因特异性片段酶切回收 ,经生物素标记后作为核酸斑点杂交试验探针 ,对细菌菌株及临床样品进行了检测。结果　核酸探针与金黄色葡萄球菌DNA呈杂交阳性 ,而与表皮葡萄球菌、化脓性链球菌、大肠埃希菌等其他细菌DNA呈杂交阴性 ,斑点杂交检测的灵敏度为 1pg基因组DNA。用斑点杂交试验和PCR对 32 2份SPF小鼠的临床样品进行了检测 ,检出率为 3 1% (10 /32 2 ) ,符合率为 10 0 % ,与细菌学检查的结果相一致。结论　建立的DNA探针检测金黄色葡萄球菌方法具有高度的特异性和敏感性 ,且较快速 ,可用于实验动物金黄色葡萄球菌的监测。     

压电石英晶体传感器检测单链DNA的研究

目的：对石英晶体传感器检测单链DNA的可行性进行论证，并对其DNA固定方法进行研究。方法：利用聚乙烯亚胺(PEI)黏附和戊二醛(Glu)交联法，将单链DNA探针固定在基频为10MHz的AT切型石英晶体的镀金表面，制成压电石英晶体DNA传感器，用该DNA传感器进行互补单链DNA定量定性检测，并用1．2mol/L NaOH和1．2mol/L HCl对杂交后的传感器进行了再生。结果:在50-400ng/ml的范围内，响应信号与检测浓度成线性相关，并具有良好的特异性。杂交后的DNA传感器能反复再利用。结论：石英晶体传感器可以用于DNA的杂交检测。     

链置换扩增(SDA)压电DNA传感器

目的：构建链置换扩增（SDA）压电DNA传感器，研究其响应特性，方法：（1）将SDA与压电DNA传感器结合，建SDA压电DNA传感器结合技术。（2）以结构菌IS6110片段为检测对象，研究SDA压电DNA传感器的响应特性，结果：（1）SDA压电DNA传感器的响应信号达到500Hz左右；（2）SDA压电DNA传感器出现频率下降的时间长度（响应时间）与加入的检测核酸的浓度相关；（3）不同浓度检测核酸（靶核酸）导致的频率下降绝对值差别不大。结论：SDA压电DNA传感器能直接检测基因组DNA；其响应时间与检测物（靶核酸）的加入量相关，可以用作定量依据。     

压电石英晶体微阵列免疫传感器检测IgG的实验研究

目的 构建一种新型压电石英晶体人免疫球蛋白(IgG)的免疫微阵列传感器。方法 抗IgG单克隆抗体采用蛋白A(SPA)法固定在AT切向、基频10MHz的石英晶体微阵列金膜电极表面制成抗体敏感膜，构成压电石英晶体IgG免疫微阵列传感器。结果 构建的IgG压电石英晶体免疫微阵列传感器对IgG的响应特性良好，其检测下线为0．5mIU／ml。结论 研制的压电石英晶体IgG免疫微阵列传感器具有灵敏度高、特异性好、成本低廉、操作简单、快速，能在线实时检测等优点，可用于临床实验诊断。     

压电石英晶体微阵列免疫传感器检测hCG的实验研究

目的　构建一种新型压电石英晶体人绒毛膜促性腺激素 (hCG)免疫微阵列传感器。方法　抗hCG β单克隆抗体采用蛋白A(SPA)法固定在 2× 5的AT切向、基频 1 0MHz的石英晶体微阵列金膜电极表面制成抗体敏感膜 ,构成压电石英晶体hCG免疫微阵列传感器。结果　构建的hCG压电石英晶体微阵列免疫传感器对hCG的响应特性良好 ,其检测线性范围为 2 .5～ 2 50mIU ml,TSH、FSH、LH对hCG的检测基本无干扰 ;60例临床标本检测结果与荧光免疫检测法符合 (P >0 .0 5) ,两种方法的相关系数为 0 .92。结论　研制的压电石英晶体hCG免疫微阵列传感器具有灵敏度高、特异性好、成本低廉、省时、操作简单、不需标记、能在线实时检测等优点 ,对比实验表明其检测结果准确 ,能用于临床实验诊断检测     

2种不同类型的核酸探针对压电基因传感器阵列检测特异性的影响

目的探讨用PNA作为探针与普通的DNA探针相比对压电传感器基因杂交的优越性.方法用生物素-亲和素法分别将PNA、DNA两种探针固定在基因传感器的金膜表面,分别与完全匹配、1个碱基错配、2个碱基错配的互补靶序列进行杂交,观察2种不同的探针与靶序列反应所引起的频率变化及所用的时间.结果相对于DNA探针,PNA探针识别碱基错配的能力明显高,且杂交时间更短.结论 PNA与靶序列DNA结合有高度的特异性,选用PNA作探针,可提高压电基因传感器检测的特异性.     

链延伸反应提高压电基因传感器的灵敏度的实验研究

目的　利用链延伸反应的原理延长引物链以提高压电基因传感器表面的质量负载 ,从而提高传感器的灵敏度。方法　基因传感器阵列表面分别固定上金黄色葡萄球菌mecA及femA两种探针片段 ,待杂交上相应的靶序列片段后 ,加入Klenow酶 ,室温下 (2 0℃左右 )进行链延伸反应 8h。结果　 50nmol L单链mecA在杂交反应及链延伸反应的过程中 ,频率的下降值分别为 (99.2± 8.5)Hz、(1 92 .9± 1 3 .3 )Hz。而femA则分别下降了 (1 42 .4± 1 1 .2 )Hz、(2 2 2 .6± 1 6.6)Hz。mecA、femA在链延伸反应前的检测灵敏度为 0 .5nmol L ,但经链延伸反应后检测灵敏度提高到了 0 .0 5nmol L。结论　链延伸反应有效地提高了压电基因传感器的灵敏度 ,可用于微量DNA的检测、核酸同源性分析等方面     

DNA生物传感器在乙型肝炎基因诊断中的应用

目的：建立石英晶体DNA传感器检测乙肝病毒基因的方法。方法：在石英晶体金表面固定单链DNA，构成压电晶体HBVDNA生物传感 器，与待测样品进行杂交反应。结果：DNA传感器能准确诊断血清中的HBV病毒基因。结论：石英晶体HBV DNA生物传感器操作省时、简单，具有用于临床基因诊断的前景。     

压电石英晶体传感器中的温度效应

目的探讨温度因素对压电石英晶体传感器检测频率变化的影响.方法在传感器体系中,于不同温度条件下测定空白芯片、已包被芯片在气相中和液相中频率达到稳定的时间,和抗原抗体反应时间随温度变化量.结果随着外界温度升高,频率呈下降的趋势;外界温度降低,频率呈上升的趋势.环境温度过高或过低都会延长检测时间.结论传感器对温度的变化较为敏感,故应在检测前进行检测池的预热,并将环境温度控制在最适温度内.     

金黄色葡萄球菌抗生素耐药质粒DNA的抽提及检测

本文报道了用溶菌酶合并使用少量溶葡萄菌素作为破壁酶提取金黄色葡萄球菌质粒DNA,然后用琼脂糖凝胶电泳来检测的方法。比较研究了一株自南京地区分离的金黄色葡萄球菌多剂耐药株(22)及用大黄素处理后所得的不同耐药性消除菌株的质粒DNA。结果证明,在金黄色葡萄球菌(22)中含有4条质粒带。分子量较小的二条质粒带可能与四环素耐药性及青霉素耐药性有关。它们的分子量约为2.6及2.0 Mdal。     

用溶菌酶—SDS微量法提取金黄色葡萄球菌质粒DNA

本文报道了检测金黄色葡萄球菌质粒DNA的微量方法(溶菌酶-SDS微量法),无需使用溶葡萄球菌素(Lyostaphin)。方法用少量的斜面培养物,经溶菌酶、SDS、EDTA裂解细胞,碱酚和氯仿-异戊醇一次脱蛋白,乙醇沉淀DNA,便得到可以直接用于琼脂糖凝胶电泳检测的质粒DNA。将该法与常规的溶葡萄球菌素法进行比较,分别检测了30株从南京地区临床分离的耐药性金黄色葡萄球菌。两种方法对细胞的裂解率为100%,质粒检出率为96.6%。用两种方法所得到的质粒电泳图谱基本相同,有些菌株发现有大质粒带。     

金黄色葡萄球菌诱导人脐静脉内皮细胞凋亡的观察

目的观察人脐静脉内皮细胞株ECV．304对金黄色葡萄球菌（S．aureus）感染的反应。方法常规方法制备金黄色葡萄球菌悬液,以1：1、1：10和1：100的感染复数感染ECV．304细胞1、3、6、12h和24h后,估算细胞吞噬细菌数,采用Hoechst33258染色,DNAladder及细胞凋亡相关因子RT．PCR检测细菌感染后细胞凋亡情况。结果金黄色葡萄球菌感染复数越高,细胞内吞噬的活细菌数越多。金黄色葡萄球菌感染导致ECV-304细胞发生凋亡,凋亡具有时间依赖性,随着感染时间的延长,凋亡小体增多,DNA片段也随之增多。抗凋亡细胞因子Bcl2mRNA表达量随着感染时间的延长下降,而促凋亡细胞因子Bax和Caspase．3表达量增多。结论金黄色葡萄球菌感染ECV-304细胞后,通过下调抗凋亡细胞因子Bcl2、上调促凋亡细胞因子Bax和Caspase-3诱导细胞凋亡。金黄色葡萄球菌感染内皮细胞的可能致病机制为临床治疗提供了实验依据。     

Detection of interaction of binding affinity of aromatic hydrocarbon receptor to the specific DNA by exonuclease protection mediated PCR assay

A novel exonuelease protection mediated PCR assay (EPM-PCR) to detect the interaction of protein and DNA at a dioxin-responsive enhancer (DRE) upstream of the CYP1A1 gene in rat hepatic cytosol was established. A double-stranded DNA fragment containing two binding sites was designed and incubated with the aryl hydrocarbon receptor (AhR) transformed by 2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p dioxin (TCDD) to generate TCDD: AhR: DNA complex which could protect receptor-binding DNA against exonuclease Ⅲ (Exo Ⅲ ) digestion. With ExoⅢ treatment, free DNAs were digested and receptor-bound DNAs remained that could be amplified by PCR. By agarose gel electrophoreses a clear band (285bp) was detected using TCDD-treated sample, while nothing with control samples. To detect transformed AhR-DRE complex, 2 fmol DNAs and 3 ug cytosol proteins were found to be sufficient in the experiment. Compared with gel retardation assay, this new method is more sensitive for monitoring the Ah receptor-enhancer interaction without radioactive pollution.     

金黄色葡萄球菌rep-PCR指纹图谱分型技术反应条件的优化

[目的]优化金黄色葡萄球菌细菌基因组重复序列PCR(rep-PCR)指纹图谱的分型方法,为构建金黄色葡萄球菌同源性追踪体系提供依据。[方法]以金黄色葡萄球菌ATCC25923基因组DNA作为模板,对参考文献提供的PCR引物,反应体系的引物浓度以及退火温度进行优化,以期得到最佳的指纹图谱。[结果]对于金黄色葡萄球菌进行指纹图谱的构建,引物rep为最佳引物,PCR反应体系引物浓度为1.0 pmol/μL,退火温度为45℃时,指纹图谱条带最清晰,明亮。[结论]优化了金黄色葡萄球菌rep-PCR分子分型技术。     

葡萄球菌的原生质体融合及遗传转移

本文报道在金黄色葡萄球菌多剂抗生素耐药菌株(22)及白色葡萄球菌(Rif~r,Nal~r)间进行的原生质体融合试验。在高渗缓冲培养基中,将对数生长期中、后期的培养物,以溶菌酶及溶葡萄球菌素处理,DM_3培养基再生得原生质体。将二亲本葡萄球菌的原生质体混合,以CaCl_2及PEG(6000)处理使发生融合及种间遗传转移。根据重组子的色素、耐药性及在琼脂糖凝胶电泳中显示的质粒带进行遗传分析,证明在金黄色葡萄球菌及白色葡萄球菌中,质粒和染色体的遗传标记均可相互转移,再次证实在金黄色葡萄球菌(22)中存在分子量为2.0Mdal的pcr质粒。     

金黄色葡萄球菌DNA提取方法的研究

目的:建立一种简易的金黄色葡萄球菌DNA提取方法。方法:用4种不同的细菌DNA提取方法提取金黄色葡萄球菌DNA,用琼脂糖凝胶电泳及PCR检测提取物并比较结果。结果和结论:溶菌酶能有效的降解金黄色葡萄球菌细胞壁,且用溶菌酶破壁后提取的DNA适于PCR实验,本研究成功的得到一种简易的、改良的金黄色葡萄球菌DNA的提取方法。     

New method for typing Staphylococcus aureus resistant to methicillin based on sulphur-35 methionine labelled proteins: its application in an outbreak

Sodium dodecyl sulphate polyacrylamide gel electrophoresis of sulphur-35 methionine labelled cellular proteins of Staphylococcus aureus resistant to methicillin was used as a typing method during an outbreak on a cardiothoracic ward. This showed that the outbreak strain was indistinguishable from the epidemic strain of methicillin resistant S aureus prevalent in London. In contrast, 44 epidemiologically separate strains of S aureus gave individually distinct radiolabelled protein profiles. This method permitted rapid confirmation that an epidemic strain was responsible and indicated the need for urgent control measures.     

金黄色葡萄球菌RAPD基因分型研究

目的了解医院内金黄色葡萄球菌RAPD基因分型,分析MRSA的流行传播情况。方法应用K-B纸片扩散法和随机多态性扩增DNA技术（Randomly amplified polymorphic DNA,RAPD）对医院分离的金黄色葡萄球菌进行MRSA鉴定和基因分型。结果 57株金黄色葡萄球菌中有MRSA31株,经RAPD扩增后,扩增产物在2~6条带之间,通过聚类分析57株菌产生10个基因型。结论Ⅵ型为本院金黄色葡萄球菌的流行优势基因型,不同来源菌株基因型分布有明显差异。RAPD分型技术简便、快速,在医院感染流行病学研究具有很大的应用前景。     

金黄色葡萄球菌SEB基因的克隆及其系统发生分析

目的克隆和测定金黄色葡萄球菌深圳分离株S4070肠毒素B（SEB）基因序列,并作系统发生分析。方法采用PCR法从金黄色葡萄球菌S4070基因组中扩增出SEB基因片段,纯化后与pMD-18T载体连接构建重组子pMD-18T-SEB,并转化E.coli DH5α;阳性克隆质粒经双酶切法鉴定后,采用双脱氧末端终止法作序列测定,并以BLAST和MEGA4软件分析其分子特征。结果从金黄色葡萄球菌基因组DNA中扩增出约704bp的基因片段,阳性克隆质粒鉴定结果与预期一致;序列测定结果显示,所克隆的SEB基因片段含704个碱基,与GenBank中17株金黄色葡萄球菌SEB基因序列比对,无碱基的插入或缺失,同源性均为98%以上;基于SEB基因序列,采用邻位连接法（Neigh bor-joining）构建系统发生树,深圳S4070株与日本分离株NN35、NN37、NN41-F1D、NN41-F1F和NN41-F1G以及印度分离株DQ535901、DQ535902的遗传距离小,同处在一个分支群上。结论实验成功克隆了金葡菌深圳株S4070 SEB基因,不同分离株间SEB基因序列相对保守,本分离株与日本和印度分离株遗传关系较近。