基于LAMP技术建立解脲支原体基因试纸条检测方法

目的 建立一种灵敏度高、特异性强、检测速度快的方法检测解脲支原体.方法 基于环介导恒温扩增技术(LAMP),根据解脲支原体序列特征设计3对引物进行解脲支原体DNA切口酶核酸恒温扩增,扩增过程在一对引物中标记生物素,随着扩增的进行生物素直接引入扩增片段中,扩增结束后产物在密闭装置中进行免疫试纸条显色反应,根据显色卡的颜色判定结果的阴阳性.结果 该技术检测解脲支原体较实时荧光PCR技术灵敏度要高10倍以上,其它病原体检测均阴性该方法特异性与实时荧光PCR技术相当.结论 恒温扩增联合试纸条技术检测解脲支原体具有较高的敏感性和特异性,检测速度快,适合各医院开展.     

实时荧光定量PCR检测泌尿生殖道患者尿液解脲脲原体

目的应用实时荧光核酸恒温扩增检测技术（SAT）检测泌尿生殖道患者尿液解脲脲原体（UU）,并评价其敏感性和特异性。方法对140例疑似泌尿生殖道感染患者的拭子和尿液样本,分别采用培养法、SAT进行解脲脲原体检测,检测结果有差异的标本用实时荧光定量PCR法对拭子进行复测,根据实验结果评估SAT检测尿液UU的敏感性和特异性。结果 140例疑似患者试子培养和尿液SAT检测阳性率均为60%,两者比较差异无统计学意义（P〉0.05）,其中16例培养结果与SAT检测结果不一致,8例培养法阳性、SAT阴性的拭子PCR结果复测阳性;8例培养法阴性、SAT阳性的拭子标本PCR结果 4例阴性、4例阳性,结合培养法结果和PCR结果作为＂扩大金标准＂,得出SAT对尿液检测的敏感性为95.5%、特异性为100%。结论 SAT检测泌尿生殖道患者尿液UU具有取样方便,检测快速、准确等优点,适用于临床实验室泌尿生殖道UU的检测。     

脂血标本的核酸定量检测效果评价

目的评价脂血标本的核酸定量检测实时扩增曲线，以探讨此类标本进行HBVDNA定量检测的可接受性。方法建立扩增曲线观察法、扩增效率Grubbs离散值分析法及扩增效率置信区间估计法，评价接收脂血标本进行荧光定量PCR法HBVDNA定量检测的有效性。结果该2批次扩增的各样品扩增效率数值未发现离散值，3例脂血标本的扩增效率在同批样品扩增效率的90％置信区间内，与扩增曲线观察法结果一致。结论3种评价方法均对修正标准操作程序以接收该类标本提供了支持性的依据。     

四种方法检测乙型肝炎病毒基因型的比较

目的 比较四种方法检测乙型肝炎病毒基因型的差异性.方法 对36例乙型肝炎患者的血清分别采用测序技术,荧光定量PCR技术,恒温扩增技术,基因芯片技术进行乙肝病毒基因型的检测.结果 36份血清以测序技术为金标,观测荧光定量PCR技术特异性100%,敏感性83%,恒温扩增技术特异性100%,敏感性89%,基因芯片技术特异性100%,敏感度92%.结论 目前临床采用的四种方法检测乙型肝炎病毒基因型的特异性相同,敏感度以测序为金标准,基因芯片技术最灵敏,其次为恒温扩增技术,最后为荧光定量PCR技术.     

核酸试纸条法检测HBV基因型方法的建立

目的 建立一种快速、肉眼可观测的方法检测乙型肝炎病毒(HBV)基因型.方法 根据GenBank中已发表的明确HBV分型全序列,设计特异的引物和标记生物素探针,建立核酸试纸条法检测150例乙型患者和20例健康体检者的乙型肝炎基因型,同时采用荧光定量PCR法进行比较.结果 150例标本中B型检出率为34.00%(51/150),C型占61.33%(92/150),B/C混合型占4.00%(6/150),未分型占0.67%(1/150).与荧光定量PCR法进行比较,结果一致.结论 核酸试纸条法检测HBV基因型与荧光定量pCR法相比较灵敏度和特异性相似,但该方法更简便、快速,更适合临床开展.     

荧光定量PCR法与免疫组织化学法检测胃黏膜活检标本中幽门螺杆菌感染的比较

目的比较荧光定量PCR法与免疫组织化学法在检测胃黏膜活检标本中幽门螺杆菌(HP)感染的符合率。方法收集首都医科大学附属北京安贞医院2016年4至5月临床诊断为慢性胃炎的胃黏膜活检标本92例, 分别采用荧光定量PCR法和免疫组织化学法进行HP检测, 观察两组感染情况, 比较荧光定量PCR法与免疫组织化学法检测HP感染的符合率。结果荧光定量PCR法与免疫组织化学法检测HP感染阳性符合率达82.1%(23/28), 阴性符合率达92.8%(64/69), 总体符合率达94.6%(87/92), 差异无统计学意义(P>0.05)。荧光定量PCR法与免疫组织化学法区分HP感染强度差异有统计学意义(P<0.05), 在感染轻度组与中重度合并组比较时, 差异有统计学意义(P<0.05)。荧光定量PCR法能够对HP菌株进行分型检测, 检测出4例Ⅱ型菌株感染, 检出率14.3%。对于荧光定量PCR法与免疫组织化学法检测HP 5例不一致样本再进行HP 23S rRNA基因突变核酸检测进一步验证, 结果与荧光定量PCR法检测HP结果一致。结论免疫组织化学法与荧光定量PCR法检测HP均具备较...     

荧光定量PCR基因检测对G6PD缺乏症的诊断价值探讨

目的通过对比高铁血红蛋白还原法、G6PD/6PGD比值法等传统方法,探讨荧光定量PCR基因检测对G6PD缺乏症的诊断价值。方法通过高铁血红蛋白还原法、G6PD/6PGD比值法检测400例血样,(其中阴性标本,阳性标本各约为200例),并用荧光定量PCR法对这400例血样中,中国人常见的6个突变位点进行检测。最终以Sanger测序结果为金标准对这三种方法进行方法学评价。结果高铁血红蛋白还原法诊断G6PD缺乏症的灵敏度、特异性、阳性预测值、阴性预测值、诊断符合率分别为94.5%、95.0%、94.9%、94.6%、94.8%;G6PD/6PGD比值法诊断G6PD缺乏症的灵敏度、特异性、阳性预测值、阴性预测值、诊断符合率分别为97.5%、98.0%、98.0%、97.5%、97.8%;荧光PCR法诊断G6PD缺乏症的灵敏度、特异性、阳性预测值、阴性预测值、诊断符合率分别为98.0%、100.0%、100.0%、98.0%、99.0%。荧光PCR法能检测出另外两种方法不能检测出的杂合子突变。结论荧光定量PCR基因检测方法快速、简单、价格低廉、可提高杂合子检出率,灵敏度、特异性、阳性预测值、阴性预测值、诊断符合率均优于另外两种常用的筛查方法。故G6PD基因筛查方法适合G6PD缺乏症基因临床筛查使用。     

荧光定量RT-PCR检测甲型H1N1病毒核酸的临床意义

目的观察荧光定量RT-PCR技术在检测甲型H1N1病毒核酸的临床意义。方法对135例经确诊为甲型H1N1的感染患者的咽式子采用荧光定量PCR技术检测H1N1病毒核酸,同时对40例健康体检者的咽式子做为对照组一同进行甲型H1N1病毒核酸检测。结果 135例确诊为甲型H1N1的患者经荧光定量PCR检测阳性129例,符合率为96.99%。40例健康体检者结果全阴性。结论荧光定量PCR检测甲型H1N1病毒核酸具有快速、特异性高等特点,在采用此方法诊断甲型H1N1时,阳性即可确诊,阴性者要结合临床。     

实时荧光环介导等温扩增检测 HIV-1 DNA反应体系的建立

目的建立一种快速、敏感度高的实时荧光环介导等温定量检测HIV-1 DNA的方法。方法根据HIV病毒基因序列选择6个保守区域设计4条环介导等温扩增（ LAMP）引物,建立环介导等温扩增体系,同时在体系中加入SYBR GreenⅠ荧光染料,并评价该方法的特异性和敏感度。结果成功合成实时荧光环介导等温定量检测HIV-1 DNA反应体系,检测200例HIV感染者外周淋巴细胞HIV-1 DNA,其中有195例阳性,并检测50例健康对照结果均阴性。其中有HIV-1 DNA定量结果显示最低含量为51拷贝/ml,最高含量为8．21×106拷贝/ml,平均值含量为5．78×105拷贝/ml,其中病毒含量比较集中在105数量级范围,共162例占83．08％。采用10倍稀释法发现该方法最低检出限为50拷贝/ml。对乙型肝炎病毒、疱疹病毒、丙型肝炎病毒进行交叉实验结果均为阴性。结论HIV感染者外周血中几乎都存在HIV-DNA,实时荧光环介导等温扩增是一种快速、敏感度高、特异性强的方法,适合各级医院的临床检测。     

SAT在活动性肺结核疑似患者中的应用研究

目的探讨实时荧光核酸恒温扩增检测技术在肺结核患者确诊中的应用价值。方法随机抽取了2015年7月至2017年6月在我院就诊的仅X线检查显示与活动性肺结核相符的281例患者进行分析,每人留取5mL痰标本送检,痰标本被分成三份同时进行结核菌培养、PCR、SAT检测。以中和离心法的结核培养为金标准,对SAT和PCR检测结果进行分析比较。结果除去12例通过PNB、TCH鉴定为非结核分枝杆菌病的患者,以中和离心法的培养为金标准,SAT检测269例活动性肺结核疑似患者的灵敏度98.3%,特异性85.6%,与培养法检测结果差异有统计学意义(χ^2=5.1,P=0.024);PCR检测这269例患者的灵敏度97.2%,特异性82.2%,与培养法检测结果差异有统计学意义(χ^2=4.8,P=0.029),SAT检测的特异性和灵敏度都稍高于PCR。结论SAT法适用于活动性肺结核的快速诊断。     

核酸检测技术在血液筛查中的应用研究

目的大样本、多方法调查深圳地区无偿献血人群中乙肝、丙肝和艾滋病病毒血清学阴性者的核酸阳性率,探讨在我国血液筛查中引进核酸扩增技术的必要性,了解和分析献血者血清学阴性核酸阳性感染状况。方法采用大样本数调查,应用ROCHE PCR-ELISA、PCR-微流芯片、实时荧光PCR方法和CHIRON TMA（转录依赖的扩增技术）多种方法对血清学检测阴性的献血者进行HBV DNA、HCV RNA和HIV-1RNA检测,对乙肝阳性献血者追踪检测ALT和乙肝两对半标志物,对丙肝核酸阳性献血者追踪检测ALT及抗-HCV及HBV DNA和HCV RNA病毒载量。结果共对141288人份血样进行了检测,检出HBsAg（-）、HBV DNA阳性28例,总阳性率为0.020%,其中21例为anti-HBc阳性,占0.015%。HIV-1RNA未检出阳性,17例HBsAg（-）、HBV DNA阳性样本追踪发现,9例发生了血清转换现象,4例呈窗口期特征,所有追踪的HBV DNA阳性献血者ALT检测结果正常。1例anti-HCV（-）、HCV RNA阳性献血者追踪发现为典型窗口期献血,ALT显著升高。结论应采用高灵敏度的核酸扩增技术筛查血液中的乙肝和丙肝病毒,可提高血液安全。     

人类疱疹病毒6型荧光定量PCR检测方法的建立和应用

目的 建立人类疱疹病毒6型(HHV-6)荧光定量PCR检测方法,并检测临床样本.方法 根据文献合成HHV-6 U65-66基因片段的特异性引物和TaqMan探针,构建质粒制备标准品,评估该方法的特异性、灵敏度和重复性;并用该方法检测93份临床诊断为病毒性脑炎的脑脊液标本.结果 本实验检测HHV-6的灵敏度为3×10(0)拷贝/μl;标准曲线间线性关系(R2)为0.999,扩增效率为97.9％;同一样本重复检测3次,组内Ct值的变异系数最大为0.61％,组间为3.13％;特异性检测中只有HHV-6阳性标本出现扩增曲线.93份临床标本中检出HHV-6阳性2例,检出率为2.15％.结论 本实验所建立的荧光定量PCR检测HHV-6的方法特异强、灵敏高、重复性好,具有应用于临床检测的潜在价值.     

实时荧光PCR法检测HER2基因扩增方法的建立

目的探讨应用双标准曲线的实时荧光PCR法检测原癌基因人类表皮生长因子受体2（HER2）基因扩增在临床乳腺癌诊治中的可行性。方法收集500例乳腺癌术后新鲜组织标本,抽提组织DNA进行实时荧光PCR检测,采用双标准曲线法定量,通过计算目的基因浓度和内标基因浓度的比值来判断HER2基因的扩增情况。选择灵敏度和特异度均较高的荧光原位杂交方法作为对照方法。结果检测阳性标本72例,阴性样本419例。该方法检测的灵敏度为85.9%,特异度为98.79%,准确度为96.74。与荧光原位杂交法（FISH）检测结果相比,二者具有较好的一致性。结论双标准曲线的实时荧光PCR法用于检测HER2基因扩增相对准确可靠,有较好的临床应用前景。     

单核细胞乙型肝炎病毒cccDNA检测方法及应用价值

目的 建立检测HBV共价闭合环状DNA（ cccDNA）的巢式-荧光定量PCR法,检测外周血单核细胞（ PBMC）及骨髓单核细胞（MMNC）中cccDNA。方法 根据HBV cccDNA与松弛结构DNA（rcDNA）结构上的差异,设计2对跨缺口的特异性引物及下游的特异性TaqMan探针。根据Mung Bean Nuclease对rcDNA与cccDNA作用的不同,使cccDNA扩增而使rcDNA降解,分别用外引物及内引物进行PCR反应,再用荧光探针进行实时荧光定量PCR,根据阳性参照物,计算出检测标本定量值。结果 成功建立了HBV cccDNA巢式-荧光定量PCR的检测方法,线性范围为5.0× 10２～3.9×107拷贝/ml。用上述方法检测25例慢乙肝及肝硬化血清HBV DNA阳性患者外周血单核细胞中cccDNA,7例骨髓单核细胞中cccDNA,21例健康献血者外周血单核细胞中cccDNA,骨髓标本中有3例cccDNA阳性,25例外周血标本中有9例cccDNA阳性。结论 巢式-荧光定量PCR法可检测乙肝患者PBMC及MMNC中的HBVcccDNA含量。PBMC及MMNC中可检测到HBVcccDNA.     

淋病奈瑟菌三种检测方法的评价

本文评价泌尿生殖道标本中淋病奈瑟菌(NG)用直接涂片、细菌培养和实时荧光PCR三种方法同时检测300例标本,并设50例健康对照组。直接涂片革兰氏染色法检出率为28.7%;培养法检出率为26.3%;PCR法检出率为31.7%。实时荧光PCR法特异性强、灵敏度高,但有假阳性;培养法是诊断NG感染的"金标准",检出率较PCR法低;直接涂片革兰氏染色法易被球杆菌等混淆,易误诊。现将结果报告如下。     

恒温扩增检测结核分枝杆菌特异性IS6110片段在肺结核检测中的应用

目的 比较恒温扩增技术检测、抗酸杆菌涂片、结核分枝杆菌培养在肺结核患者检测中的应用.方法 收集2016年1月1日至12月31日我院呼吸科肺结核患者清晨痰液,将标本分为3份,分别进行痰涂片抗酸染色,结核菌培养及恒温扩增检测结核分枝杆菌特异性IS6110片段,统计分析3种方法的检测结果.结果 56例痰标本,恒温扩增检测结核分枝杆菌特异性IS6110片段阳性33例,阳性率为58.93％,抗酸染色阳性15例,阳性率为26.79％,恒温扩增检测结核分枝杆菌特异性IS6110片段阳性率高于抗酸染色方法;结核分枝杆菌培养阳性为35例,阳性率62.50％;恒温扩增检测结核分枝杆菌特异性IS6110片段和结核分枝杆菌培养两种方法检测Kappa系数为0.776,检测一致性较好.结论 恒温扩增检测结核分枝杆菌特异性IS6110片段是一种简便、高灵敏度的检出结核分枝杆菌的方法.     

间变性大细胞淋巴瘤患儿EEF1G/ALK融合基因的鉴定与检测

目的 明确1例伴少见ALK融合基因的间变性大细胞淋巴瘤患儿的分子诊断,建立该融合基因的实时荧光定量PCR检测方法。方法 采用基于锚定多重PCR的二代测序技术,鉴定患儿腹股沟肿大淋巴结组织中ALK基因的伙伴基因。建立EEF1G/ALK融合基因实时荧光定量PCR方法,并对方法的重复性、灵敏度和特异性进行性能评价。在此基础上检测此患儿肿瘤组织、骨髓、外周血和脑脊液EEF1G/ALK融合基因的表达。结果 经二代测序鉴定该患儿肿瘤细胞EEF1G/ALK融合基因阳性,Sanger测序验证为EEF1G Exon 6和ALK Exon 20的融合。建立的实时荧光定量PCR方法最低定量限为40拷贝/体系;弱阳性标本和强阳性标本的批内精密度CV分别为0.52%和0.17%;批间精密度CV分别为1.32%和1.14%,重复性好;检测其他ALK融合阳性标本结果为阴性,特异性好。复发时送检的淋巴结穿刺组织和外周血的融合基因定量检测结果为138.92%和0.0039%,其余检测为阴性。结论 明确此例间变性大细胞淋巴瘤为少见EEF1G/ALK融合基因阳性。建立的EEF1G/ALK融合基因定量检测方法特异性、重复性好...     

登革热病毒多重荧光PCR检测及基因分型方法的研究

目的建立一种登革热病毒双靶基因多重荧光PCR检测方法,用于登革热病毒的实验室诊断和基因分型。方法选取登革热病毒Ⅰ-Ⅳ型病毒保守区设计型特异性引物探针和通用型引物探针。评估多重荧光PCR检测方法的特异性、重复性和检测限;并对20份阳性样本进行检测。结果20个登革热阳性核酸标本在通用型检测全部为阳性,特异性型别检测发现登革热病毒Ⅰ型10例、登革热病毒Ⅱ型3例、登革热病毒Ⅲ型3例、登革热病毒Ⅳ型4例;20名正常无症状人群标本提取的核酸和HIV、HCV和HEV通用型和特异性型别检测全部为阴性。梯度检测的变异系数均小于5％。对登革热Ⅰ-Ⅳ型病毒检测最低检测限达10^3 eopies／ml。结论本研究建立的登革热病毒双靶基因多重荧光PCR检测及分型方法具有特异性好、重复性好、快速易操作等优点,可用于登革热病毒的快速检测和基因分型鉴定。     

艰难梭菌毒素A/B、BD-PCR毒素基因及GDH检测对艰难梭菌相关性腹泻的诊断价值

目的探讨艰难梭菌毒素A/B及其相关毒素基因检测对艰难梭菌相关性腹泻的诊断价值。方法收集2015年1月至2015年10月我院ICU病房腹泻疑似艰难梭菌感染患者的粪便标本133例作为研究对象,分别采用艰难梭菌培养法、CDAB法、PCR毒素基因检测法及艰难梭菌毒素GDH检测法进行检测,以艰难梭菌培养法结果为金标准,计算各方法的诊断指标所包含有的特异度、敏感度、阴性预测值和阳性预测值等。结果本研究收集的133例粪便标本中,经过金标准粪便样本厌氧培养法检出阳性结果 20例,阴性结果 113例。CDAB法具有低敏感度(0.550)和高特异度(0.912),诊断符合率为0.932,BD-PCR毒素基因检测法具有高敏感度(0.950)和高特异度(0.929),诊断符合率为0.932,艰难梭菌毒素GDH检测法的高敏感度(0.900)和低特异度(0.779),诊断符合率为0.797。结论对于疑似艰难梭菌感染,可联合艰难梭菌GDH、艰难梭菌毒素A/B(CDAB)或进行荧光定量PCR毒素基因共同检测,有效降低检测时间,为临床医师及时提供准确的诊断依据,并制定行之有效的治疗措施。     

细菌培养法、免疫层析法及实时荧光定量PCR法在孕晚期B族链球菌筛查中的应用对比研究

目的:研究细菌培养法、免疫层析法及实时荧光定量PCR法在孕晚期B族链球菌(Group B Streptococcus,GBS)筛查中的应用价值.方法:选取 2021 年 3 月至 2023 年 5 月在我院接受产检的孕晚期孕妇 154 例.以病理活检为金标准,分析GBS筛查结果;对比细菌培养法、免疫层析法及实时荧光定量PCR法单独及联合诊断孕晚期GBS的效能;分析细菌培养法、免疫层析法及实时荧光定量PCR法单独及联合筛查与病理筛查结果的一致性.结果:154 例孕晚期孕妇中,经病理活检检出 39 例孕妇GBS为阳性;三者联合诊断GBS的灵敏度、特异度、准确率、阳性预测值以及阴性预测值均高于细菌培养法、免疫层析法与实时荧光定量PCR法单独检测(P＜0.05);三者联合检测与病理结果的Kappa值为 0.936,均高于细菌培养法、免疫层析法、实时荧光定量PCR法单独检测.结论:在筛查孕晚期孕妇GBS中,实时荧光定量PCR法联合细菌培养法、免疫层析法诊断效能高于单独检测,可通过三者联合检测为早期诊断孕妇是否感染GBS提供依据