Bax反义硫代脱氧寡核苷酸的体外抗辐射效应研究

目的 :Bcl_2 Bax蛋白比值降低是辐射所致细胞凋亡启动的检查点。本研究拟用Bax反义核酸干预Bax基因的表达 ,提高Bcl_2 Bax蛋白比值 ,抑制辐射所致凋亡 ,促进细胞存活。方法 :人胚肺成纤维细胞 (HELF)和小鼠受γ射线照射后 ,立即用Bax反义脱氧寡核苷酸处理HELF细胞和小鼠骨髓细胞 6h(终浓度均为 10 0nmol L) ,用MTT法、SRB法和小鼠骨髓中性粒细胞_巨噬细胞系祖细胞 (CFU_GM)集落形成法 ,确定细胞的存活状况。用RT_PCR方法和流式细胞仪检测BaxmRNA的表达状况、细胞周期的变化 ,分析其作用机制。结果 :HELF细胞的存活率分别增加 2 4 .4 % (MTT法 ,P <0 .0 1)和 12 .8% (SRB法 ,P <0 .0 1) ;骨髓细胞处理组CFU_GM集落形成数量远高于照射对照(72± 17vs 13± 6 ,P <0 .0 1) ;RT_PCR检测显示 ,处理组的目标条带和内标条带的灰度比值 (Bax β_actin)低于对照组(分别为 4 3.9%和 6 8.6 % ) ;流式细胞仪检测表明 ,处理组总S期细胞的比例高于对照组 ,分别为 2 4 .2 %和 7.7% ,提示处理组细胞内BaxmRNA拷贝数量低于对照组 ,细胞增殖活动较强。结论 :靶向BaxmRNA的反义硫代脱氧寡核苷酸 ,能够促进γ射线辐射后细胞的存活 ,其机制与破坏靶mRNA分子 ,继而造成Bax蛋白表达减少 ,抑制凋亡启动并促进细胞增殖活动有关。     

半乳糖修饰的反义硫代寡核苷酸的肝细胞导向及抗乙型肝炎病毒…

人工合成两种半乳糖多聚赖氨酸导向配体，与荧光素标记的互补于ＨＢＶｍＲＮＡ多聚腺苷酸信号部分的２１－聚反义硫代脱氧核苷酸（ＡＳＯＤＮ）电性结合，与２．２．１５细胞共同孵育，４０ｍｉｎ后配体组对ＨＢｓＡｇ和ＨＢｅＡｇ的抑制率为４１％～４７％和２８％～３１％，单纯ＡＳＯＤＮ组为１１％和５％，３ｄ后配体组为８８％～８９％和７１％～７４％，单纯组为６４％和５３％，经流式细胞分析，配体组使２．２．１５细胞荧光     

半乳糖修饰的反义硫代寡核苷酸的肝细胞导向及抗乙型肝炎病毒活性研究

人工合成两种半乳糖多聚赖氨酸导向配体，与荧光素标记的互补于ＨＢＶｍＲＮＡ多聚腺苷酸信号部分的２１－聚反义硫代脱氧核苷酸（ＡＳＯＤＮ）电性结合，与２．２．１５细胞共同孵育，４０ｍｉｎ后配体组对ＨＢｓＡｇ和ＨＢｅＡｇ的抑制率为４１％～４７％和２８％～３１％，单纯ＡＳＯＤＮ组为１１％和５％；３ｄ后配体组为８８％～８９％和７１％～７４％，单纯组为６４％和５３％。经流式细胞分析，配体组使２．２．１５细胞荧光染色率达７５．３％和８３．８％；单纯组为２４．３％。结果表明，两种人工配体均具有良好的导向ＡＳＯＤＮ入肝细胞的功能，且可以明显提高ＡＳＯＤＮ抗ＨＢＶ的活性。     

无胶筛分毛细管电泳分离相差单个碱基的脱氧寡核苷酸方法初探

目的：建立和优化分离不同碱基数目硫代脱氧寡核苷酸的有效方法。方法：用去离子水溶解硫代脱氧寡核苷酸样品并采用核酸蛋白分析仪定量。在无胶筛分毛细管电泳分离分析之前超声波和高速离心脱气。无胶筛分毛细管电泳以线性大分子ssDNA 100-R Gel作为分离介质。为得到最佳效果，对毛细管温度、分离电压、进样方式和进样时间进行了优化。结果：灵敏度、迁移时间和重现性的最佳实验条件为：毛细管温度25℃，电动进样10kV10s，DAD检测器波长为255nm，18kV恒压分离模式。在此条件下，成功分离了依次相差一个碱基的21种脱氧寡核苷酸[pd(A)40-60]。结论：建立并优化了一种简单快速分离相差单个碱基的脱氧寡核苷酸的毛细管电泳方法。     

WT1反义寡核苷酸对白血病细胞的抑制作用

造血细胞的增殖受多种因子的调控 ,白血病的发生与基因的异常表达有关。Ｗｉｌｍｓ肿瘤基因(ＷＴ1)位于染色体 11ｐ13,编码一个具有激活和抑制双重功能的转录调控蛋白。ＷＴ1可以作用于许多与造血细胞增殖有关的基因 ,在不同的肿瘤发生和发展过程中起重要作用〔1、2〕。ＷＴ1在成熟细胞中未见表达或表达很低 ,而在大多数白血病细胞中则高度表达 ,且与白血病患者的预后有关 ,表达增高并持续阳性者 ,预后较差 〔3、4〕。本研究应用ＷＴ1反义寡核苷酸 (ＷＴ1ＡＳＯ)封闭白血病细胞ＷＴ1基因的表达 ,然后观察其对白血病细胞增殖的抑制作用 ,以探…     

HER-2反义寡核苷酸对靶基因抑制作用的时相变化与微观分布研究

目的:研究靶向HER-2基因、具有不同活性的反义硫代寡核苷酸(S-ODNs)在SK-BR-3细胞内的微观分布差异,以及与靶基因转录和翻译抑制作用的关系.方法:运用实时定量PCR和Western印迹方法检测反义寡核苷酸对细胞靶基因转录和翻译抑制的时相性变化,用激光扫描共聚焦显微镜(LSM)观察6-羧基荧光素标记S-ODNs在靶细胞内的分布.结果:反义S-ODNs能够在mRNA与蛋白水平抑制HER-2的表达.不同序列的抑制活性各不相同,但最大抑制强度均出现于转染后48～72 h之间,此后靶基因表达逐渐恢复.高活性序列主要均匀分布于细胞核,且持续时间长,低活性序列呈点状分布于胞质,少量分布于细胞核且持续时间短.结论:活性不同的S-ODNs亚细胞分布有显著区别,且分布变化与对靶基因的抑制效应具有对应关系.     

碘标记c-myc反义寡核苷酸乳腺癌显像的实验研究

用反义核酸为示踪剂 ,靶组织必须具有特异的或高表达的靶分子 ,即ＤＮＡ/ＲＮＡ。在正常组织中 ,一般基因都是单拷贝的 ,而肿瘤组织中绝大部分细胞都有某种或几种癌基因的扩增和高表达。因此 ,利用反义核酸进行肿瘤显像在理论上是可行的。 1994年 ,Ｄｅｗａｎｊｅｅ等[1]首先报道利用111Ｉｎ标记的ｃ ｍｙｃ反义寡核苷酸探针进行ＢＡＬＢ/ｃ乳腺癌动物模型显像 ,实验结果证实了该方法的准确性和灵敏性。参照该实验和131Ｉ标记反义寡核苷酸的方法[2 ] ,我们研究了12 5Ｉ标记的反义和正义寡核苷酸在正常津白Ⅱ号小鼠和乳腺癌自发瘤模型中的分…     

反义寡核苷酸体外抗丁型肝炎病毒的初步研究

以质粒（ｓＳＶＬＤ３）为模板，通过聚合酶链反应（ＰＣＲ）扩增得到一条１３９ｂｐ的片段，它含有丁型肝炎病毒（ＨＤＶ）基因组ＲＮＡ中核酶（ｒｉｂｏｚｙｍｅ）区的ｃＤＮＡ，该核酶具有自身裂解功能，将上述片段插入到ｐＧＥＭ－３Ｚ中，经筛选、鉴定，得到一重组质粒（ｐＨＤＶ１０８），经测序发现有２个碱基变异，以该质粒为模板，通过Ｔ７ＲＮＡ聚合酶，转录出核酶的前体，并观察到其自身裂解产物，自裂率达７１％。针对核酶两个重要的单链区，设计并合成二条反义寡核背酸（ＡＳＯＮ），当在转录反应中同时加入ＡＳＯＮ后，核酶的自裂率下降均较明显，当ＡＳＯＮ浓度为１６ｕｍｏ１／Ｌ时，核酶自裂抑制率均在７０％以上。提示，ＡＳＯＮ可与核酶两个重要的单链区结合，从而抑制核酶的自裂活性。     

反义寡核苷酸抑制肝癌细胞血管内皮生长因子的表达

目的：研究血管内皮生长因子(VEGF)反义寡核苷酸(ODN)对人肝癌细胞系VEGF表达的抑制作用，探讨肝癌基因治疗的新方法。方法：人肝癌细胞系SMMC7721能表达VFGF，采用人工合成反义、正义ODN分别作用于SMMC7721细胞，RT—RCR、流式细胞仪比较各处理组VFGF mRNA及其蛋白的表达变化情况。结果：VEGF RT—PCR扩增条带的图像分析平均灰度值显示，反义组为0．4379，正义组为0．7367，对照组为0．7462。流式细胞仪分析VFGF蛋白表达率，反义组为17．2％，正义组为31．8％，对照组为31．2％。结论：反义ODN能够抑制人肝癌细胞的表达，其有望成为抗肝癌的新一代基因治疗药物。     

C-myc反义寡核苷酸对胃癌荷瘤裸鼠抑瘤作用的研究

目的:探讨C-myc反义寡核苷酸(ASODN)对胃癌荷瘤裸鼠的抑瘤作用。方法:将21只裸鼠建立人胃癌MKN-45细胞移植瘤动物模型。成瘤后动物随机平均分为3组,分别由皮下瘤体内注射脂质体(lipofectin,Lip)、C-mycSODN/Lip、C-mycASODN/Lip,每周1次,共3次。观察肿瘤抑制率、肿瘤体积和动物存活情况。免疫组化ABC法检测各组肿瘤的C-myc蛋白表达情况。结果:ASODN/Lip组肿瘤体积明显减少,肿瘤生长抑制,抑瘤率达41.5%;ASODN/Lip组裸鼠生存期较SODN/Lip组和Lip对照组延长明显(P<0.05);ASODN/Lip组肿瘤的C-myc蛋白表达明显降低。结论:C-myc反义寡核苷酸可以有效抑制人胃癌裸鼠皮下肿瘤的生长,延长动物生存期,为胃癌的治疗提供新的思路。     

反义寡聚核苷酸对阿片类药物药理作用的影响

阿片受体及受体后信号转导分子的反义寡聚核苷酸能影响相应阿片受体亚型激动剂的药理作用 ,其中包括阿片类药物的镇痛及其所致的耐受和依赖。其作用机制可能与抑制阿片受体表达 ,减少阿片受体量 ,影响受体后信号转导分子功能有关。这方面的研究对直接在分子水平探讨特定阿片受体的功能 ,阿片受体分型 ,分析阿片类药物产生镇痛、耐受和依赖等一系列药理作用的确切机制具有重要意义     

脂质体介导C-myc基因反义寡核苷酸对人膀胱癌细胞系Biu-87的生物学影响

目的 :探讨应用脂质体 (LR )介导C -myc基因反义寡核苷酸 (ASODN)对人膀胱癌细胞系Biu - 87的生物学影响。方法 :采用细胞计数、MTT比色法评价反义C -myc寡核苷酸对Biu - 87细胞体外增殖的影响 ,应用免疫组化 (SABC)、DAB显色检测C -myc反义寡核苷酸作用癌细胞后C -myc蛋白的表达情况。结果 :脂质体介导C -myc反义寡核苷酸组与对照组相比 ,Biu - 87细胞增殖活性受到明显抑制 (P <0 .0 5 ) ,12h后可抑制C -myc基因蛋白表达。结论 :脂质体介导C -myc反义寡核苷酸可抑制人膀胱癌细胞体外增殖活性。应用反义技术封闭C -myc癌基因表达 ,为膀胱癌的基因治疗提供了新的思路     

MAPK反义寡核苷酸对乙醛活化HSC增殖和JNK信号通路的影响

目的:探讨丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)反义寡核苷酸(ASO)对乙醛活化肝星状细胞(HSC)增殖和MAPK中的c-Jun氨基末端激酶(JNK)信号通路的影响。方法:用脂质体转染法将MAPKASO导入乙醛活化HSC中,通过MTT法检测细胞增殖情况、流式细胞仪检测MAPK-JNK表达。结果:MAPK ASO可明显抑制细胞增殖及抑制JNK信号通路的表达,其抑制率分别为40.81%、60.6%。与对照组比较有显著差异(P<0.05)。结论:MAPKASO能够抑制HSC的增殖,阻断JNK信号通路,这可能成为治疗肝纤维化的一个有效途径。     

DNA序列测定法与实时荧光PCR法检测YMDD突变结果的比较

目的比较DNA序列测定法与实时荧光法检测YMDD突变的结果,并对除YMDD突变之外的耐药相关基因突变及其意义进行讨论。方法收集89例慢性乙肝患者的92份血清样本,均用实时荧光PCR法做YMDD突变检测。采用巢式PCR法扩增HBV反转录酶(RT)基因,对PCR产物进行DNA双向测序,采用NTI软件比对结果,并对RT基因上其他11个已知耐药相关突变位点进行分析。结果在37份YMDD突变阴性的样本中,DNA测序法检测结果为33份M204M(未突变)、1份M204I、3份M204V;4份YMDD突变阳性样本均为突变/未突变序列共存;另检出7份样本存在ADV耐药相关突变,占18.9%(7/37)。在55份YMDD突变阳性样本中,DNA测序法检测到52份,阳性结果符合率为94.5%(52/55);另检出5例存在ADV或ETV耐药相关突变,占9.1%(5/55)。结论DNA序列测定法检测HBVRT基因耐药相关突变敏感性高,重复性好,与实时荧光PCR方法的检测结果有较高的符合率,可同时检出YMDD突变以外的各种耐药相关突变,有助于临床全面了解患者对核苷(酸)类似物的耐药情况,合理地制订抗HBV治疗方案。     

血管内皮生长因子反义寡聚脱氧核苷酸与碘油混合栓塞治疗大鼠肝癌的实验研究

目的　观察血管内皮生长因子 (vascularendothelialgrowthfactor,VEGF)反义寡聚脱氧核苷酸 (antisenseoligodeoxynucleotides,asODN)抑制体外培养的Walker 2 5 6瘤细胞VEGF表达的情况 ,评价其与碘油混合行肝动脉栓塞对大鼠肝癌的治疗效果。方法　将反义和正义VEGF寡核苷酸加入无血清培养的Walker 2 5 6瘤细胞的培养液中 ,4 8h后酶联免疫吸附试验 (ELISA)法测定上清VEGF含量 ,并观察上清刺激血管内皮细胞 (ECV 30 4 )生长受抑情况。 30只Walker 2 5 6移植性大鼠肝癌模型数字法随机分成 3组 ,分别经肝动脉注入超液态碘油 (UFLP) 0 2ml(UFLP组 ,n =10 ) ,UFLP 0 2ml+VEGFasODN 3OD混合物 (UFLP +asODN组 ,n =10 ) ,生理盐水 0 2ml (对照组 ,n =10 )。于术前及术后第 7天行MR检查观察肿瘤的体积 ,用逆转录聚合酶链反应 (RT PCR)方法检测瘤内及瘤周VEGFmRNA含量 ,免疫组织化学法检测肿瘤组织VEGF的表达及微血管密度 (microvesseldensity ,MVD)。结果　VEGFasODN可以明显抑制培养的Walker 2 5 6瘤细胞VEGF的表达。动脉栓塞实验中 ,UFLP +asODN组肿瘤生长率明显低于UFLP组和对照组 [分别为 (14 0 1± 33 8) %、(177 9± 6 4 9) %和 (4 0 3 9±6 9 4 ) % ;F =6 0 0 2 ,P <0 0 1]。瘤内及瘤周VEGFmRNA含量     

125I标记反义寡核苷酸及其识别淋巴瘤细胞的实验研究

目的　探讨用1 2 5I标记免疫球蛋白重链V1家族框架区 (IgHV1FR)mRNA反义寡核苷酸(1 2 5I FR ASON)作为反义显像剂和反义治疗药物的可能性。方法　用DNA合成仪将含酪胺 (tyramine)的单体连接在 18聚体寡核苷酸的 5′端 ,再用氯胺 T法进行1 2 5I标记。用阳离子脂质体DMRIE C包裹1 2 5I ASON转导Namalwa细胞 (B淋巴瘤细胞系 )和HL 6 0细胞 (人髓系白血病细胞系 ) ,测定转导效率 ,同时比较未用脂质体情况下的转导效率。质量分数为 2 0 %聚丙烯酰胺凝胶电泳 (PAGE)测定tyramine ASON与血清保温后的稳定性。结果　标记率为 80 .7% ,放化纯为 98.7% ,2 4h放化纯仍高于 90 %。脂质体介导ASON转导Namalwa细胞的效率为 (2 6 .8± 1.5 4 ) % ,是未用脂质体的近 18倍 ,转导HL 6 0细胞的效率是 (13.6± 2 .5 4 ) % ,两组比较差异有显著性 (P <0 .0 1)。质量分数 2 0 %PAGE于2、6和 2 4h时点未见异常条带。结论　通过连接酪胺碘标记寡核苷酸法是比较成功的方法。1 2 5I FR ASON对Namalwa细胞具有较强的特异性 ,可用于淋巴瘤反义显像和反义放射治疗的研究。     

绵羊c-Myc的克隆与序列分析

参照GenBank上绵羊c-Myc序列设计引物,利用RT-PCR技术从60d左右胎羊生殖嵴总RNA中扩增得到绵羊c-Myc基因编码区序列,其为包括终止密码子在内的1320 bp,编码有439个氨基酸。同源性分析结果显示,绵羊c-Myc基因编码区与牛、猪、猫、人、大鼠、小鼠、鸡、爪蟾和斑马鱼的核苷酸序列同源性分别为98.0%、94.1%、92.4%、90.4%、86.9%、86.2%、75.2%、66.4%和63.9%,其氨基酸序列同源性分别为98.0%、94.0%、92.5%、90.3%、87.2%、86.5%、72.2%、65.5%和64.6%;生物信息学软件分析显示,绵羊c-Myc含有细胞核定位模体和HLH结构域。本研究为进一步研究c-Myc基因的功能及探讨其中绵羊体细胞重编程中的作用奠定了基础。     

t(8;21)白血病的发病机制及二代测序技术在白血病中的应用进展

急性髓系白血病(AML)在急性白血病中最为常见,是一类具有高度异质性的侵袭性血液系统疾病,其中t(8;21)(q22;q22)染色体易位是AML中最常见的染色体易位,可产生AML l-ETO融合基因并编码AMLl-ETO融合蛋白.本文对急性髓系白血病发生的“二次打击”学说,t(8;2l)AML的发病机制,涉及t(8;21)AML发生发展的各种因素,AMLl-ETO融合蛋白组成成分的功能等进行综述,为t(8;21)AML的临床治疗和预后提供重要的基本信息.同时本文还总结了二代测序技术在白血病领域的研究进展,以期为t(8;21)AML的精准治疗提供新方法.     

绵羊Oct4基因的克隆及序列分析

为了克隆出绵羊的Oct4基因的编码区序列,研究利用RT-PCR技术,根据GenBank中小鼠、人,猪、牛等的Oct4基因编码区序列设计出特异性引物,从绵羊囊胚中扩增绵羊Oct4编码区序列并进行测序,分析。结果表明,绵羊Oct4基因的编码区长度为1083bp,其中包括终止密码子,可以编码360个氨基酸。绵羊Oct4基因CDS区的核苷酸序列与牛、猫、人、恒河猴、小鼠、兔、大鼠和猪等物种相似,比较相应序列,同源性分别为97.8%、91.1%、89.1%、89.0%、82.3%、85.7%、83.2%和94.7%;比较其氨基酸序列,同源性分别为98.3%、93.1%、91.4%、91.1%、83.8%、85.7%和97.2%;使用生物信息学软件分析结果表明,绵羊Oct4基因含有两个POU特异结构域和1个HOMEOBOX-1结构域。本研究为进一步探索Oct4基因的功能及探讨其在绵羊体细胞重编程的过程中的作用奠定了基础。     

肽序列从头测序算法

从头测序为蛋白质组研究提供了一种不用借助于任何蛋白质序列数据库信息，直接解读串联质谱数据的方法。其基本算法主要由4个部分组成：质谱图的构建，离子类型的确定，测序算法以及打分算法。质谱图的构建和离子类型的确定是从头测序算法的基础。测序算法是从头测序算法的关键，比较常用的是动态规划算法。打分算法是整个从头测序算法的核心部分，各种从头测序算法对基本算法的改进通常都是围绕着打分算法进行的。