幽门螺杆菌可塑区的结构及功能研究进展

比较菌株H．pyloriJ99和26695的基因组序列时发现,约占3～4％基因组的基因片段G＋C含量为34～35％,低亍H．pylori整体G＋C含量（39％）,被命名为可塑区。可塑区具有明显的菌株特异性,推测与其致病性关的新基因可能位于该区.研究表明可塑区中部分基因已经被确认为H．pylori新的致病标志,流行病学调查发现他们与cagPA1有显著的相关性,并且与临床上的胃溃疡和胃癌的发生及发展有关。     

乙肝病毒基因组序列扩增的条件优化和结果分析

目的优化乙型肝炎病毒(HBV)不同长度基因片段PCR扩增条件,为后续机制研究提供实验基础。方法运用PCR或巢式PCR(Nested PCR)方法扩增6例临床乙肝患者HBV DNA,针对特异性目的片段,通过优化Mg2+浓度、引物浓度、Taq酶用量、DMSO浓度等,获得特异性扩增条带,PCR产物直接测序并使用CHROMAS、MEGA等生物学软件进行结果分析。结果通过综合分析各种实验条件对PCR扩增结果的影响,最终确认在50μL扩增体系中,2.5 mmol/L Mg2+、200 nmol/L特异性引物、1.5 U Taq酶、56℃退火在本实验室可获得良好的扩增效果,适量二甲基亚砜(DMSO)可减少非特异性干扰,同时建议对短片段可酌量减少Taq酶使用量。生物信息学分析示6例HBV感染标本中1例为B基因型,5例为C基因型,共发现S基因21个核酸变异及9个氨基酸可改变。结论建立了适合本实验室的HBV DNA扩增体系以及后续生物信息学分析方法,明确了不同的扩增体系条件对PCR扩增效果具有重要影响。     

甲基化PCR作为白血病微量残留病检测方法的探索

本实验研究探讨以甲基化特异性聚合酶链反应（MS—PCR）作为白血病微量残留病（MRD）检测方法的可行性。将Id4基因呈完全甲基化的HL-60细胞和Id4基因呈完全非甲基化的Hek937细胞按不同比例混合,实验分为3组：A组为10％HL-60＋9％Hek937．B组为1％HL-60＋99％Hek937,C组为0．1％HL-60＋99．9％Hek937。用MS-PCR方法检测不同白血病细胞比例下Id4基因甲基化情况。结果表明,HL-60细胞仅有155bp的Id4基因甲基化特异性扩增,呈Id4基因完全甲基化;Hek937细胞仅有156bp的Id4基因非甲基化特异性扩增,呈Id4基因完全非甲基化。A、B、C组同时有155bp的Id4基因甲基化和156bp的Id4基因非甲基化特异性扩增,显示Id4基因甲基化表达。结论：MS-PCR方法可从0．1％比例含量的白血病细胞样本中检测到Id4基因甲基化,加之Id4基因甲基化在不同类型白血病中差异不明显,因此用MS-PCR检测Id4基因甲基化状态可以作为一种检测各种类型白血病微量残留病的方法。     

吸烟者内皮型一氧化氮合酶基因G894T多态性与冠心病的相关性研究

目的探讨吸烟者内皮型一氧化氮合酶基因（eNOS）G894T多态性与冠状动脉粥样硬化性心脏病（冠心病）的发生及其严重程度间的关系。方法将203例吸烟者和182例非吸烟者根据冠状动脉造影结果分为冠心病组（196例）和对照组（189例），以冠状动脉病变支数判定严重程度。以聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性（PCR—RFIP）检测eNOS基因G894T多态性，按吸烟与否分析G894T多态性与冠心病的关系。结果冠心病组GT＋TT基因型分布与T基因突变频数明显高于对照组（x^2=4．26、6．21，P均〈0．05）；吸烟者基因GT＋TT型及T等位基因频率均显著高于非吸烟者（x^2〈5．82、5．77，P均〈0．05）；冠心病组eNOS基因型分布在单支与多支病变组之间差异无统计学意义（x^2=3．36，P〉0．05），而吸烟的冠心病患者差异有统计学意义（x^2=6.48，P〈0．05），吸烟的GG＋TT型者更可能发生多支病变，OR=3．42，95％CI（1．440—4.400）。结论eNOS894位点G→T、吸烟与冠心病的发生及其严重程度间的关系密切。     

乙型肝炎病毒基因的巢式聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分型及初步应用

目的 用改进的乙型肝炎病毒(HBV)巢式聚合酶链反应—限制性片段长度多态性(PCR—RFLP)的基因分型方法初探广州地区HBV基因型分布状态。方法 设计巢式PCR扩增前S基因，经限制性内切酶AvaⅡ和DpnⅡ酶切鉴别HBV A—G基因型；并对140份乙型肝炎患者血清进行基因分型，其中随机挑选3份进行克隆测序，并对20份患者血清进行巢式PCR—RFLP重复分型试验，以验证此分型技术的稳定性和特异性。同时采用PCR和巢式PCR对92份乙型肝炎病毒e抗原(HBeAg)阴性血清进行HBV DNA阳性率检测比较。结果 基因分型与测序结果一致；基因分型重复试验符合率100％；92份HBeAg阴性血清经PCR和巢式PCR扩增HBV DNA的阳性率分别为20．7％和68．5％。140份乙型肝炎患者血清中HBV基因型以C型(94份)和B型(42份)为主，偶见A型(4份)。结论 巢式PCR—RFLP HBV基因分型方法具有良好的敏感性、特异性、稳定性，且操作简便，适用于临床和流行病学调查研究。     

单细胞PCR用于HLA配型的研究

目的研究用筑巢式多重PCR技术对单细胞进行HLA配型，分析影响单细胞PCR扩增的因素。方法首先分别采用不同的细胞裂解方法制备单细胞DNA模板，然后采用多重PCR分别扩增HLA—A，B基因的第2、3外显子和第2内含子区域，HLA—DRB1基因的第2外显子区域，最后根据大量DNA的常规HLA分型结果对单细胞第1轮扩增产物进行第2轮筑巢式序列特异性引物PCR（PCR-SSP）分型。结果酶解法制备单细胞DNA模板效率最高，第1轮扩增成功率为93．3％，而碱裂法和冻融法分别为83．3％和73．3％；采用酶解法制备单细胞DNA模板进行第2轮PCR—SSP分型验证，20份标本扩增成功率为95％，有3份标本只扩增出一条染色体，等位基因脱扣发生率为15％，全部操作可在6h内完成。结论筑巢式多重PCR技术对单细胞HLA分型具有较高的扩增效率，操作时间短，可望应用于妊娠前诊断。     

新疆哈萨克族冠心病患者eNOS基因G894T多态性分析

目的探讨新疆哈萨克族人群内皮型一氧化氮合酶（eNOS）基因多态性与冠心病的相关性。方法应用聚合酶链反应（PCR）一限制性片段长度多态性分析（PCR—RFLP）,检测新疆哈萨克族70例健康个体和87例冠心病患者eNOS基因G894T多态性。结果新疆哈萨克族健康个体及冠心病患者的eNOS基因G894T多态性GG、GT、Tr基因型频率分布分别为51．43％、30．00％、18．57％和24．14％、55．17％、21．69％,G和T等位基因分布频率分别为75．71％、24．29％和56．32％、43．68％,冠心病患者存在G等位基因频率下降,T等位基因频率升高趋势。结论eNOS基因G894T多态性分析,与新疆哈萨克族冠心病有相关性。     

建立实时荧光定量PCR检测新型隐球菌CAPIO基因及其初步应用

目的建立FQ-PCR（real-time Fluorescent Quantitative PCR）系统定量检测新型隐球菌CAP10基因，为将其应用于新型隐球菌感染的诊断和疗效判断奠定基础。方法根据新型隐球菌5种血清型（A、B、C、D、AD）中同源序列设计引物和探针，PCR扩增CAP10基因片段，并将其克隆到pGEM-T Easy载体上，构建质粒标准品；建立FQ—PCR体系，优化反应条件，建立标准曲线，进行特异性、敏感性、重复性实验。结果FQ-PCR系统用于检测CAP10基因片段，敏感性为1拷贝数／出，重复性好，批内变异系数（CV）为1．36％，批间变异系数（CV）为1．86％，特异性好，对临床其他常见脑膜炎病原体不出现特异性扩增曲线。结论成功建立了新型隐球菌CAP10基因FQ-PCR检测方法，结果稳定、准确，有望为判断新型隐球菌性脑膜炎疗效、预后提供新的依据。     

采用PCR-CTPP检测白细胞介素2基因多态性

目的采用PCR-CTPP技术，检测中国浙南地区白细胞介素-2（IL-2）基因．330位的多态性，并分析其可能的临床应用。方法针对IL-2基因．330（T／G）多态性设计两条序列特异性引物，结合两侧引物，在同一反应管中进行PCR。对PCR条件进行优化，并与测序结果进行对比。在此优化条件对101名体检个体的DNA进行IL-2基因多态性分析。结果通过条件优化，PCR-CIPP（polyrnerase chain reaction with confronting two-pair primers）可以区分IL-2—330位T或G的单核苷酸的多态性，并与测序结果相符合。101位体检个体中TT纯合子为43例（42．6％），GG纯合子为11例（10．9％），T／G杂合子为47例（46．5％），结果按HardyWeinberg分布（P〉0．05）。结论PCR-CTPP可区分IL-2-330（T／G）多态性，且简单、方便，具有临床应用价值。     

新生儿CYP1A1、GSTM1、GSTT1基因的多态性分布

目的 研究新生儿CYP1A1、GSTM1、GSTT1基因的多态性分布，为新生儿建立相应基因型记录，达到防病治病的目的。方法 收集新生儿脐血，抽提其中有核细胞的DNA，PCR扩增CYP1A1、GSTM1、GSTT1基因的特征性外显子片段。限制酶切CYP1A1扩增产物，RFLP分析每个标本的基因型；非变性聚丙稀酰胺凝胶电泳分析GSTM1、GSTT1的基因型。结果 CYP1A1、GSYM1和GSTT1基因型均成多态性分布，CYP1A1的基因型分布有3种，分别为A/A基因型占60．9％、A/G基因型占34．5％、G／G基因型占4．5％；GSTM1的基因型有2种分别为GSTM1＋／＋和GSTM1＋／0占85．5％、GSTM1-／-占14．5％。GSTT1基因型分布为GSTT1＋／＋和GSTT1＋／0占76．1％，GSTT10／0为23．6％。结论 在正常出生的新生儿中，他（她）们的代谢酶CYP1A1、GSTM1、GSTT1基因存在着多态性分布的现象。