补肾活血汤促进骨质疏松性骨折愈合的主要活性成分及 网络药理机制研究

【目的】 利用网络药理学方法探讨补肾活血汤治疗骨质疏松性骨折的主要活性成分及药理作用机制。【方法】 从中药系 统药理学数据库与分析平台（TCMSP）中收集补肾活血汤的化学成分。通过DisGeNET数据库收集骨质疏松症的疾病靶点。通 过韦恩图筛选出补肾活血汤治疗骨质疏松症的预测作用靶点。通过基因本体论（GO）功能和京都基因与基因组百科全书 （KEGG）通路富集分析获得补肾活血汤治疗骨质疏松性骨折的生物过程和信号通路。采用Cytoscape 3.9.1 软件构建“中药成 分-疾病靶点-通路”网络图,并通过拓扑参数分析,以度值作为考察,获得补肾活血汤治疗骨质疏松性骨折的主要活性成 分。通过在线String 11.5 软件构建蛋白-蛋白相互作用（PPI）网络,并通过拓扑参数分析补肾活血汤治疗骨质疏松性骨折在蛋 白分子水平上的药理机制。【结果】 共筛选出 1 236个化学成分,其中包含了 72个预测作用靶点,涉及 DNA的转录、翻译甚 至酶与酶之间的结合等生物过程,与糖尿病、动脉粥样硬化、癌症等KEGG信号通路有交集。【结论】 补肾活血汤主要是通过 脱氢二甘醇4、Yangambin、阿托品、花生四烯酸、鞣花酸、豆甾醇、异鼠李素等主要成分调控核转录因子p65、丝裂原活化 蛋白激酶、雌激素受体、肿瘤坏死因子、细胞肿瘤抗原等蛋白分子发挥促进骨质疏松性骨折愈合的作用。     

基于系统药理学探索莪术有效成分的药理作用机制

目的:通过一系列系统药理学方法初步探讨了莪术有效成分的药理作用机制。方法:利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库获取莪术中有效成分;从Pharm Mapper Server中获得莪术有效成分的靶蛋白;Uni Prot数据库中获取靶标的基因名称并于CTD数据库中获取基因相对应的疾病;运用网络可视化软件,构建莪术有效成分-靶点-疾病相互作用网络;借助DAVID工具进行莪术有效成分蛋白质群的基因本位论(GO)分析和靶蛋白作用通路的富集分析。结果:文本挖掘结果表明莪术主要相关疾病有肿瘤性疾病、神经系统疾病和代谢性疾病;GO分析结果表明莪术主要通过类固醇激素介导的信号通路、从RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录起始、凋亡过程的负调控、肽基络氨酸磷酸化、蛋白质自磷酸化、视黄酸受体信号通路、从RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录的正调节等作用发挥生物学功能;信号通路富集结果表明莪术主要作用蛋白与癌症途径,PPAR信号通路,癌症中的蛋白多糖,非小细胞癌,PI3K-Akt信号通路等信号通路有关。结论:莪术可能主要通过调控癌症途径,PPARP,PI3K-Akt信号通路等多途径发挥其药理作用。综合运用系统药理学的方法可以实现快速而全面地分析药物的药理作用。     

基于网络药理学探讨黄芪治疗肌少——骨质疏松症的作用机制＊

目的 利用网络药理学研究黄芪治疗肌少-骨质疏松症的作用机制。方法 首先借助TCMSP分析平台、GeneCards数据库和OMIM数据库,分别筛选中药活性成分、中药靶标、肌少症疾病靶标和骨质疏松症疾病靶标,将肌少症疾病靶标和骨质疏松症疾病靶标取交集,得到肌少-骨质疏松症疾病靶标。将中药靶标与肌少-骨质疏松症疾病靶标取交集,得到中药-疾病靶标并构建中药-疾病-靶标调控网络。然后通过构建中药-疾病共同靶标的蛋白互作网络,筛选核心靶标基因。最后将中药-疾病共同靶标进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,得出中药-疾病共同靶标相关的信号通路。结果 筛选得到黄芪治疗肌少-骨质疏松症的20个活性成分和10个中药-疾病共同靶标,并推断其作用机制可能与催乳素信号通路、内分泌失调信号通路、雌激素信号通路、乳腺癌信号通路、类风湿性关节炎信号通路、Toll样受体信号通路、胰岛素抵抗信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等有关。结论 基于网络药理学探讨了黄芪治疗肌少-骨质疏松症的作用靶标及信号通路,为中药单体开发提供了理论依据。     

基于网络药理学及分子对接探讨杜仲叶防治骨质疏松的作用机制

目的：采用网络药理学-分子对接预测杜仲叶防治骨质疏松症的作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及SwissTargetPrediction分析平台对杜仲叶活性成分及作用靶点进行筛选,使用GeneCards、在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库、治疗靶点数据库(TTD)对骨质疏松症的对应靶标进行筛选,将中药靶基因与疾病靶基因相交集,将交集靶点导入Cytoscape软件构建成分靶点网络,使用STRING分析平台及Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选核心靶点。对中药-疾病共同靶标进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)功能富集分析,得出中药-疾病共同靶标相关的信号通路,最后运用AutoDock与Pymol软件对预测靶标与其对应的成分进行分子对接。结果：筛选后得到杜仲叶治疗防治骨质疏松症的有效成分7个,杜仲叶-骨质疏松症共同靶标231个,并推断其作用机制可能与动脉粥样硬化信号通路的下游核因子κB信号通路,MAPK信号通路、TNF、PI3K-AKT、IL-17及HIF-1信号通路等有关,且MAPK1、STAT...     

枸杞子-丹参药对治疗视网膜色素变性的分子机制探讨

目的:基于网络药理学和生物信息学方法探讨枸杞子-丹参(LFSMR)药对治疗视网膜色素变性(RP)的分子机制。方法:通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选和预测LFSMR药对可能的入血活性成分和作用靶点;通过疾病基因数据库挖掘视网膜色素变性相关的基因靶点;采用功能蛋白联合网络数据库(STRING)绘制成分-靶点和疾病-靶点的蛋白质-蛋白质交互作用(PPI)网络,并取这两个网络的交集;运用注释、可视化和整合发现数据库(DAVID)对交集网络进行基因本体和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析;采用cyto Hubba分析筛选关键靶点。结果:在TCMSP数据库共检索出与LFSMR相关的活性成分390个,根据药代动力学参数筛得活性成分110个,进一步筛选获得19个入血活性成分,并检索出与这些成分相关的靶点208个;从疾病基因数据库获得与RP直接相关的基因206个;成分靶点和疾病靶点PPI网络取交集后得到79个基因;这些基因主要涉及蛋白自体磷酸化、转录调节、细胞增殖等生物学过程,分子功能主要涉及三磷酸腺苷结合、转录因子活性、核心启动子结合等,富集于核质、转录因子复合物、细胞核、细胞质等区域,主要与神经营养素信号通路,细胞周期相关通路,Wnt信号通路有关;进一步分析筛选得到LFSMR治疗RP的8个关键性基因靶点。结论:LFSMR药效作用的物质基础为多孔甾醇、丹参酮ⅡA等19个入血活性成分,其治疗RP的关键靶点包括E2F转录因子1(E2F1),视网膜母细胞瘤基因1(RB1)等8个基因,主要作用机制与调控神经营养素信号通路、细胞周期相关通路等信号网络有关。     

骨碎补治疗骨质疏松性骨折的网络药理学研究

目的运用网络药理学探索骨碎补治疗骨质疏松性骨折的作用机制。方法首先采用TCMSP分析平台、GeneCards数据库和OMIM数据库,分别筛选中药活性成分、中药靶标及疾病靶标,将中药靶标与疾病靶标取交集,得到中药-疾病靶标并构建中药-成分-疾病-靶标调控网络。然后通过构建中药-疾病靶标的蛋白互作网络和条形图,筛选核心靶标。最后将中药-疾病靶标进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,得出中药-疾病靶标相关的信号通路。结果筛选得到骨碎补治疗骨质疏松性骨折的14个有效成分和51个中药-疾病靶标,中药-疾病靶标涉及的GO功能主要包括类固醇激素受体活性、核受体活性、转录因子活性、类固醇结合、参与凋亡过程的半胱氨酸型内肽酶活性、泛素样蛋白连接酶结合、RNA聚合酶Ⅱ转录因子结合等。中药-疾病靶标涉及的KEGG通路主要包括前列腺癌信号通路、动脉粥样硬化信号通路、TNF信号通路、糖尿病并发症的AGE-RAGE信号通路、细胞凋亡信号通路、丙肝信号通路、乙肝信号通路等。结论基于网络药理学探讨了骨碎补治疗骨质疏松性骨折的作用机制,为中药现代化研究提供了思路。     

基于网络药理学探讨补肾强督治偻方治疗强直性脊柱炎的作用机理

目的通过网络药理学方法探讨补肾强督治偻方治疗强直性脊柱炎的作用机理。方法运用中药系统药理学成分分析平台(BAT-MAN)数据库获取补肾强督治偻方的作用靶标基因,于CTD数据库中获取强直性脊柱炎疾病相对应的靶标基因,将两者取交集后获取疾病-药物蛋白靶基因,运用网络可视化软件STRING构建蛋白质间相互作用网络,并将结果进行网络可视化展示,通过网络结构和节点间加权重联系的计算分析算法筛选出重要的关键基因。借助DAVID在线工具进行疾病-药物交集靶基因的基因本体论(GO)分析和KEGG通路富集分析。最后在CTD数据库中获取关键基因于强直性脊柱炎的疾病治疗作用。结果补肾强督治偻方靶标基因与强直性脊柱炎疾病靶标基因的交集基因有705个。GO分析结果显示,补肾强督治偻方-强直性脊柱炎交集靶基因的生物功能主要包括基因表达的阳性调控、炎症反应、细胞增殖阳性调控等;信号通路富集结果显示,补肾强督治偻方-强直性脊柱炎交集靶基因的网络主要涉及肿瘤坏死因子信号通路、雌激素信号通路、T细胞受体信号通路等。获得关键基因23个,都与痛症、炎症性疾病及关节炎性疾病相关。结论补肾强督治偻方治疗强直性脊柱炎是多靶点、多通路、多选择的复杂机制过程,其机制多与抗炎和镇痛相关。     

基于网络药理学方法探究补肾活血汤治疗激素性股骨头坏死的作用机制

目的:探讨补肾活血汤治疗激素性股骨头坏死(steroid-induced osteonecrosis of the femoral head,SONFH)的作用机制。方法:通过中医药整合药理学网络计算研究平台(integrative pharmacology-based network computational research platform of Traditional Chinese Medicine,TCMIP)v2.0预测、筛选补肾活血汤组方中14味中药的作用靶标,通过GeneCards、CTD和OMIM数据库查询SONFH的疾病靶点。根据获取的药物靶标和疾病靶点,进一步利用TCMIP v2.0中医药关联网络分析模块构建"药物靶标-疾病靶点"相互作用网络,根据网络拓扑特征值筛选补肾活血汤治疗SONFH的核心作用靶点。利用GO和KEGG数据库,采用富集算法挖掘上述方剂核心作用靶点的生物学功能和通路信息。结果:共获得891个补肾活血汤药物靶标和365个SONFH疾病靶点。经"药物靶标-疾病靶点"相互作用网络分析,最终筛选出31个补肾活血汤治疗SONFH核心靶点,GO功能分析富集出生物过程532条、分子功能29条,KEGG信号通路富集分析出相关通路共12条,主要涉及炎症免疫调节(chemokine signaling pathway,Toll-like receptor signaling pathway,NOD-like receptor signaling pathway,leukocyte transendothelial migration,Complement and coagulation cascades,cytokine-cytokine receptor interaction)、血管新生及血液循环调节(VEGF signaling pathway)、神经系统调节(neuroactive ligand-receptor interaction)和细胞功能调节(apoptosis,regulation of actin cytoskeleton)等方面。结论:结合SONFH的病理机制,排除缺乏特异性的信号通路,我们推测补肾活血汤可能通过调节TLR4/NF-κB和VEGF信号通路发挥补肾壮骨、活血化瘀的功效,这可能是其治疗SONFH的作用机制之一。     

基于整合药理学探究当归四逆汤抗寒凝心脉型心肌梗死的作用机制

目的 基于整合药理学探究当归四逆汤抗寒凝心脉型心肌梗死的作用机制.方法 采用中医药整合药理学研究平台(TCMIP)V2.0,检索并获取当归四逆汤组方活性成分及靶标、心肌梗死靶标信息,构建中药-成分-靶点-通路多维分析,得到蛋白质相互作用网络(PPI).同时,通过基因本体数据库(GO)功能分析、京都基因和基因组百科全书库...     

阿魏酸调控心肌肥厚的作用机制

目的:运用网络药理学与分子对接技术研究阿魏酸调控心肌肥厚的作用机制。方法:通过Gene Card、TCM、Open Targets、Swiss Target Prediction、STRING和David等数据库,筛选并构建阿魏酸调控心肌肥厚的相关靶点及蛋白互作网络PPI。将得到的共同靶点上传到David平台,进行GO(基因本体)功能富集和KEGG(京都基因百科全书)通路富集。运用Swiss Dock软件对主要靶点进行分子模拟对接,得到的结果用UCSF Chimera1.15进行分析。结果:阿魏酸作用于心肌肥厚的核心基因是STAT3、CASP3、MTOR、AR、MAPK1和ERBB2,与MAPK1、ERBB2和CASP3的亲和力最高;参与的调控生物过程包括细胞增殖调控、信号传导、调控RNA聚合酶Ⅲ启动子转录、调控Stat3蛋白酪氨酸磷酸化和磷脂酰肌醇介导的信号传导等,涉及信号通路包括缺氧诱导因子-1信号通路、Rap1信号通路、鞘脂信号通路和叉头状转录因子信号通路等。结论:阿魏酸可通过多个靶点、通路调控心肌肥厚,实际运用效果尚不清楚,仍需要深入研究。     

从网络药理学分析三七-马齿苋药对配伍治疗溃疡性结肠炎的效用机制研究

目的基于网络药理学的方法,从分子水平探讨三七-马齿苋药对配伍治疗溃疡性结肠炎(UC)的药理学作用机制。方法从GEO数据库检索并下载获得UC的差异表达基因。依托TCMSP检索三七-马齿苋化学成分及作用靶点。应用STRING平台、R语言、PERL语言等生物信息学工具筛选出交集靶点并进行京都基因和基因组百科全书(KEGG)途径、基因本体(GO)富集和蛋白质-蛋白质相互作用分析,获得GO功能及KEGG通路注释结果,构建"靶点-通路"网络。结果从GSE38713数据集获得568个UC的差异表达基因。共筛选出16个有效化合物,64个与UC有关的作用靶点。GO及KEGG分析显示,交集靶点参与白细胞迁移、氧化应激反应、转录因子活性、直接配体调节的序列特异性DNA结合、血红素结合、类固醇激素受体活性、生长因子结合、蛋白质异二聚活性等多种生物学过程,调节白细胞介素-17(IL-17)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、癌症中的蛋白多糖信号通路等。结论三七-马齿苋药对配伍通过调控炎症反应和免疫系统,对UC的发生、发展、耐药等相关过程发挥防治作用。     

基于网络药理学探讨柴胡对4种分子分型乳腺癌的治疗机制

目的：基于网络药理学探究柴胡对4种分子分型乳腺癌的治疗机制。方法：应用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中医药综合数据库(TCMID),获取柴胡的药物靶标,应用GeneCards和人类孟德尔遗传数据库(OMIM)获取4种分子分型乳腺癌的疾病靶标,将二者靶标进行网络分析,应用STRING平台构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,通过Cytoscape软件统计靶标的关联频次。应用R语言软件对公共交集及非公共交集靶标进行基因本体(GO)富集分析。应用DAVID平台对公共交集及非公共交集靶标进行京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,通过Cytoscape软件将结果制成网络图。结果：交集的靶标共101个,其分子功能主要包括：RNA聚合酶Ⅱ转录因子结合、泛素-蛋白质连接酶结合、激酶调节活性等。其参与通路主要包括：MAPK信号通路、P53信号通路、VEGF信号通路等。结论：柴胡治疗4种分子分型乳腺癌是多靶标、多信号通路共同作用的过程。对于4种分子分型乳腺癌,其机制多与调节肿瘤细胞的增殖、凋亡、转移相关。     

基于网络药理学的仙鹤草-鸡血藤治疗原发免疫性血小板减少症的作用机制研究

目的：基于网络药理学方法研究仙鹤草-鸡血藤治疗原发免疫性血小板减少症(ITP)的作用机制。方法：通过TCMSP平台筛选仙鹤草-鸡血藤的活性成分及其对应的靶基因,搜索疾病靶点、仙鹤草-鸡血藤治疗ITP的共同靶标基因,构建仙鹤草-鸡血藤活性成分-ITP靶标基因关系网络图、蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果：获得仙鹤草-鸡血藤活性成分29种,作用靶点663个,疾病相关靶点1001个,成分-疾病-靶点47个。PPI网络显示,肿瘤坏死因子、白介素-6、白介素-1β、信号转导及转录激活蛋白3等靶点与仙鹤草-鸡血藤治疗ITP的关系最为密切。GO功能富集分析中,生物过程主要集中在对炎症反应、细胞对有机化合物的反应、对脂多糖的反应等;分子功能主要集中在蛋白结合、细胞因子活性、相同的蛋白质结合等;细胞组分主要集中在细胞外间隙、等离子膜外侧、细胞外区域等。KEGG通路富集分析主要包括肿瘤坏死因子信号通路、趋化因子信号通路、Toll样受体信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶-丝氨酸-苏氨酸激酶信号通路等。结论：仙鹤草-鸡血藤可通过多靶...     

基于网络药理学原理的黄芪-金银花药对干预急性呼吸窘迫综合征的分子机制研究

[目的]基于网络药理学原理,探讨课题组前期实验有效方益气化瘀解毒方核心药对黄芪-金银花干预急性呼吸窘迫综合征(ARDS)的分子通路及作用机制。[方法]应用整合药理学平台对黄芪、金银花化学成分及ARDS疾病候选靶标进行收集,根据结构相似性原理选取相似性分数≥0. 8的所有药物靶标作为"黄芪-金银花"药对的潜在作用靶标,建立药物候选靶标信息数据库,通过该平台的蛋白质-蛋白质相互作用信息(PPI)数据库,获得"黄芪-金银花"药对作用的潜在靶标与ARDS疾病靶标之间的蛋白质-蛋白质相互作用信息(PPI),通过网络分析,构建"中药-核心成分-关键靶标-主要通路"的可视化网络图,进一步明确中药干预疾病的作用机制。[结果]黄芪-金银花药对共预测得到76个活性成分,其中黄芪化合物成分29个,金银花化合物成分47个。其干预ARDS作用涉及的前100个核心靶标中已知治疗ARDS的直接靶标(known disease target)78个,潜在药物靶标(putative drug target)3个,共同靶标(common target)2个;其干预ARDS的作用涉及ErbB信号通路、FoxO信号转导通路、Ras信号途径、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)-蛋白激酶B(AKT)信号通路、神经营养因子信号转导通路、细胞生长与死亡等相关生物过程和代谢通路。[结论]黄芪-金银花药对主要活性成分可针对多个靶点、多条通路发挥干预ARDS的作用,其作用与TSC1、NSDHL、GRB2、MYC、MAP2K等关键靶标及ErbB信号通路、FoxO信号转导通路、Ras信号途径、MAPK信号通路和PI3K-AKT信号通路等有关。     

基于网络药理学探讨当归四逆汤治疗2型糖尿病的作用机制

目的通过网络药理学方法探讨当归四逆汤治疗2型糖尿病(T2DM)的作用机制。方法借助中药系统药理学技术平台(TCMSP)获取当归四逆汤主要化学成分、对应靶点及靶标基因,借助人类基因数据库(GeneCards)获取2型糖尿病相关靶标基因,将药物靶标基因与疾病靶标基因映射得到当归四逆汤作用于2型糖尿病的预测靶点。利用Cytoscape 3.7.1软件构建中药化合物-靶点网络及蛋白与蛋白相互作用网络(PPI),利用DAVID6.8在线工具进行潜在基因的基因本体(Gene Ontology, GO)分析及基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)通路富集分析。结果当归四逆汤作用于2型糖尿病的有效成分有112个,相关靶点65个,关键靶点16个。GO分析结果显示,当归四逆汤治疗2型糖尿病潜在基因的生物功能主要涉及细胞凋亡、氧化应激、蛋白结合等;KEGG通路富集结果显示,当归四逆汤治疗2型糖尿病潜在基因的通路主要涉及缺氧诱导因子(HIF-1)信号通路,胰岛素信号通路,肿瘤坏死因子(TNF)信号通路,胰岛素抵抗,叉头转录因子(FoxO)等信号通路。结论当归四逆汤治疗2型糖尿病是多成分、多靶点、多通路的复杂过程,主要通过参与细胞凋亡、氧化应激、蛋白结合等发挥治疗2型糖尿病的作用。     

基于网络药理学的"土茯苓-金银花"药对治疗类风湿关节炎作用机制研究

目的 运用网络药理学方法筛选"土茯苓-金银花"药对治疗类风湿关节炎(RA)的有效成分和作用靶点,探究其主要成分-核心靶点-疾病的复杂网络关系.方法 通过中药系统药理学平台(TCMSP)收集"土茯苓-金银花"药对的活性成分及作用靶点;通过GeneCards及OMIM、Drugbank数据库收集RA的疾病相关基因,构建"核心成分-核心靶点-核心通路"网络并筛选出"土茯苓-金银花"药对治疗RA的核心靶点,然后进一步行蛋白互作网络分析(PPI)、GO生物功能注释、KEGG通路富集分析.结果 ①在TCMSP数据库初步提取土茯苓化学成分75种,金银花化学成分240种,经ADME筛选后共获得土茯苓15种,金银花23种活性成分,包括紫杉酚、槲皮素、山萘酚、香茅醇、豆甾醇等.土茯苓主要成分作用靶点基因252个,金银花主要成分作用靶点基因352个.②在GeneCards数据库、OMIM的两个数据库、Drugbank数据库检索得到671个RA靶点.③土茯苓、金银花与RA的共同靶点基因55个.PPI网络分析发现JUN、AKT1、IL-10、VEGFA、TNF等可能是"土茯苓-金银花"药对治疗RA的关键靶点.④在DAVID数据库提交基因序列,得到富集分析结果KEGG Pathway 96条信号通路,"土茯苓-金银花"药对治疗RA主要参与的信号通路包括TNF信号通路、Toll样受体信号通路、HIF-1信号通路、NOD样受体信号通路、破骨细胞分化、雌激素信号通路、T细胞受体信号通路等.GO富集分析包括生物过程(BP)355条结果,涉及RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、一氧化氮生物合成过程的正调控、炎症反应、对脂多糖的反应、脂多糖介导的信号通路、平滑肌细胞增殖的正调控、血管生成、细胞对脂多糖的反应、血管新生的正调控、以DNA为模板的转录正调控等;细胞成分(CC)27条结果,分子功能(MF)50条结果,主要涉及酶结合、细胞因子活性、转录因子结合、相同的蛋白质结合、蛋白质结合、序列特异性DNA结合、类固醇激素受体活性、蛋白磷酸酶2A结合、转录激活子活性,RNA聚合酶Ⅱ核心启动子近端区域序列特异性结合、肿瘤坏死因子受体结合等.结论 "土茯苓-金银花"药对的主要活性成分通过TNF信号通路、Toll样受体信号通路、HIF-1信号通路、NOD样受体信号通路、破骨细胞分化、雌激素信号通路、T细胞受体信号通路等信号通过参与RA发病的炎症反应,从而发挥了缓解RA病情的临床作用.本研究初步探究了"土茯苓-金银花"药对治疗RA的作用靶点和作用通路,为进一步更深入地挖掘其治疗RA的作用机制奠定了基础.     

基于网络药理学分析"茯苓-泽泻"治疗前列腺炎作用机理研究

目的:基于网络药理学探讨"茯苓-泽泻"治疗前列腺炎作用机制.方法:利用ETCM数据库获取药对活性成分及靶点;运用GeneCard、CTD数据库获取前列腺炎相关靶点;采用Cytoscape构建和分析网路,其中共同靶点映射到String数据库进行PPI网络分析;采用DAVID在线工具对重要靶标进行基因本体论(GO)分析和KEGG通路富集分析.结果:共筛选出茯苓活性成分31个,预测靶点231个;泽泻活性成分22个,预测靶点251个,疾病靶点633个,药物靶点与疾病共靶点63个,参与39条信号通路,涉及19个生物学过程.结论:"茯苓-泽泻"药对可能主要通多其三萜类成分调节TNF、PTGS、NFKB1、MAPK14等靶点,促进RNA聚合酶II启动子转录起始,正负调控,蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶活性,调控PI3K-Akt、TNF、HIF-1、Toll样受体信号通路等参与组织的抗炎、氧化应激等生物学修复过程,治疗前列腺炎.     

基于网络药理学探讨大黄黄连泻心汤治疗2型糖尿病作用机制

目的:基于网络药理学方法探讨大黄黄连泻心汤治疗2型糖尿病的作用机制。方法:借助中药系统药理学技术平台(TCMSP)获取大黄黄连泻心汤主要化学成分、对应靶点及靶标基因,借助人类基因数据库(Gene Cards)获取2型糖尿病相关靶标基因,将药物靶标基因与疾病靶标基因映射得到大黄黄连泻心汤作用于2型糖尿病的预测靶点。利用Cytoscape3. 7. 1软件构建中药化合物-靶点网络及蛋白与蛋白相互作用网络(PPI),利用DAVID 6. 8在线工具进行潜在基因的基因本体(GO)分析和京都基因及基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:大黄黄连泻心汤作用于2型糖尿病的有效成分有17个,相关靶点94个,关键有效成分17个,关键靶点16个。GO分析结果显示,大黄黄连泻心汤治疗2型糖尿病潜在基因的生物功能主要涉及氧化应激、细胞凋亡、蛋白结合、炎症反应等; KEGG通路富集结果显示,大黄黄连泻心汤治疗2型糖尿病潜在基因的通路主要涉及低氧诱导因子(HIF),肿瘤坏死因子(TNF),磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt),核转录因子-κB(NF-кB),血管内皮生长因子(VEGF)等信号通路。结论:大黄黄连泻心汤治疗2型糖尿病是多成分、多靶点、多通路的复杂过程,主要通过参与氧化应激、细胞凋亡、蛋白结合、炎症反应等发挥治疗2型糖尿病的作用。     

温肾养血方调控PI3K/Akt/FoxO3A信号通路改善高龄雌鼠子宫内膜容受性的作用机制

目的 基于网络药理学和实验验证,探讨温肾养血方提高高龄雌鼠子宫内膜容受性的有效成分、作用靶点及可能的作用机制。方法 基于BATMAN-TCM和整合药理学平台对温肾养血方中的中药成分及药物靶标进行检索;以“anovulatory sterility”和“anovulatory infertility”为关键词,通过人类孟德尔遗传数据库（OMIM）和GeneCards数据库,对排卵障碍性不孕症靶标进行搜集;基于STRING数据库中的蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）数据库,并通过Cytoscape构建温肾养血方成分靶标及排卵障碍性不孕症靶标核心网络;基于DAVID数据库中基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）对共有靶标进行功能和通路分析,并建立“中药-成分-靶标-通路”分子网络,对核心靶点进行动物实验验证。结果 共获得化学成分253个,药物靶标326个,疾病靶标819个,共有靶标74个。GO和KEGG对共有靶标进行功能和通路分析结果显示,共有靶标主要参与了一氧化氮生物合成过程的正调控、细胞增殖的正调控、对雌二醇的反应、老化、氧化应激反应、血管生成等生物学过程。对GO过程中氧化应激反应以及KEGG前20中的5个重要通路进行分析,通过构建“中药-成分-靶标-生物学过程/通路”多维网络发现,共20种中药41种化学成分,这些成分通过影响35个靶标参与了低氧诱导因子-1（HIF-1）信号通路,肿瘤坏死因子（TNF）信号通路,叉头框蛋白O（FOXO）信号通路,Toll样受体（TLR）信号通路,磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B（PI3K/Akt）信号通路。动物实验结果显示,温肾养血方可提高高龄雌性ICR小鼠子宫磷脂酰肌醇3-激酶（PI3K）,磷酸化（p）-PI3K,Akt,p-Akt,叉头框蛋白O3A（FoxO3A）和p-FoxO3A的表达量。结论 温肾养血方通过影响Akt1,双氧化酶-2（DUOX2）,表皮生长因子受体（EGFR）,血红素加氧酶-1（HMOX1）,髓过氧化物酶（MPO）等靶标干预氧化应激及PI3K/Akt/FoxO3A信号通路提高高龄雌鼠子宫内膜容受性。     

基于网络药理学探讨荷叶抗非酒精性脂肪肝的作用机制

目的：基于网络药理学探讨荷叶抗非酒精性脂肪肝(NAFLD)的作用机制。方法：利用TCMSP平台和Swiss Target Prediction等数据库搜集荷叶活性成分和作用靶点。通过GeneCard、GenCLiP3数据库获取NAFLD的相关靶点,利用Cytoscape 3.8.2软件构建荷叶成分-疾病-靶点蛋白网络。使用STRING数据库和Cytoscape 3.8.2软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,进行基因本体(GO)功能与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果：获得荷叶活性成分15种,潜在靶点441个,疾病相关靶点1316个,成分-疾病-靶点161个。PPI网络显示,丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶、白细胞介素6、肿瘤抑制基因p53、血管内皮生长因子、肿瘤坏死因子等靶点与荷叶抗NAFLD的关系最密切。GO功能主要有药物的反应、凋亡过程的负调控、胞液、核浆、细胞质、线粒体酶结合、细胞因子活性、转录因子结合等。KEGG通路主要涉及乙型肝炎、癌症的途径、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、Toll样受体信号通路、NOD样受体信号通路、缺氧诱导因子-1信号通路等。结论：荷...