长链非编码RNAXLOC_005009对食管鳞状细胞癌生物学特性的影响

目的:探讨长链非编码RNA XLOC_005009基因对食管鳞状细胞癌(ESCC)的体外增殖、迁移、侵袭和细胞周期与细胞凋亡等生物学特性的影响.方法:收集2015-2016年河北医科大学第四医院肿瘤研究所57例ESCC患者手术切除的癌组织及癌旁组织标本.应用实时荧光定量PCR检测XLOC_005009基因在人ESCC细胞系Eca 109、Kyse 170与ESCC组织及其癌旁组织的表达,构建pcDNA3.1-XLOC_005009过表达质粒并转染Eca109、Kyse170细胞,应用MTS法、克隆形成实验、划痕实验、Transwell小室、流式细胞术分别检测转染前后细胞增殖、克隆形成、迁移、侵袭、细胞周期与凋亡的变化.结果:XLOC 005009 mRNA在食管癌组织中的表达明显低于癌旁组织(0.06±0.06 vs 0.21±0.19,P＜0.05),且食管癌细胞XLOC 005009 mRNA表达亦均低于对照组(P＜0.05).转染过表达质粒的Eca109和Kyse 170细胞XLOC_005009基因表达显著高于对照组(Eca109细胞:039±0.17 vs0.02±0.00;Kyse170细胞:0.35±0.08 vs 0.01±0.01,均P＜0.05).与对照组相比,XLOC_005009基因过表达Eca 109和Kyse170细胞增殖能力细胞显著减弱(P＜0.05);克隆形成率显著减少(P＜0.05);穿膜细胞数显著减少[Eca109细胞:(146.40±34.47) vs(193.00±26.33);Kyse170细胞:(157.80±32.51)vs (269.00±29.89),均P＜0.05];Eca109细胞迁移率无显著变化,Kyse170细胞迁移率明显减小(P＜0.05);S期细胞比例增加,细胞凋亡影响不明显.结论:XLOC_005009低表达与食管癌的发生发展密切相关,XLOC_005009过表达可抑制食管癌细胞的体外增殖、侵袭与迁移能力.     

长链非编码RNA XLOC_002319在贲门腺癌中的表达及其甲基化状态

[目的]检测贲门腺癌(GCA)中长链非编码RNA XLOC_002319(lncRNA XLOC_002319)的表达及其甲基化状态,探讨XLOC _002319在贲门腺癌发生发展中的作用.[方法]分别应用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)以及甲基化特异性PCR(MSP)检测贲门腺癌组织、癌旁不典型增生组织及癌旁正常组织中XLOC_ 002319的表达和甲基化状态.[结果]XLOC_002319在贲门腺癌组织和癌旁不典型增生组织中的表达显著低于癌旁正常组织(P＜0.01),并且在贲门腺癌组织中XLOC_ 002319的表达与组织学分化程度、淋巴结转移和TNM分期密切相关(P＜0.05).贲门腺癌组织中XLOC _002319的启动子区甲基化率(61.54％)和癌旁不典型增生组织甲基化率(54.84％)显著高于癌旁正常组织(17.95％)(P＜0.01),并且贲门腺癌组织中XLOC_002319的启动子区甲基化率与组织学分化程度、淋巴结转移和TNM分期密切相关(P＜0.05).发生XLOC_002319甲基化的贲门腺癌组织中XLOC_002319的表达显著低于未发生甲基化的贲门腺癌组织(0.217±0.074 vs 0.253±0.060,P＜0.05).[结论]XLOC_002319在贲门腺癌中的异常低表达可能与贲门腺癌的发生密切相关,且其启动子区甲基化可能是导致其表达沉默的机制之一.     

长链非编码RNA XLOC_002319在食管鳞癌中表达及其甲基化状态

目的:通过检测食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)中长链非编码RNA XLOC_002319(long non-colding RNA XLOC_002319,lncRNA XLOC_002319)基因的表达及其甲基化状态,探讨XLOC_002319基因在ESCC发生及发展中的作用.方法:分别应用RT-PCR以及甲基化特异性PCR(methylation specific PCR,MSP)的方法检测DNA甲基化转移酶抑制剂5-氮杂-2'-脱氧胞苷(5-aza-2'-deoxycitydine,5-aza-dC)处理前后的食管癌细胞株(TE1、TE13、Yes-2、Eca109和T.TN)、ESCC组织以及癌旁正常组织、食管上皮内瘤变(esophageal intraepithelial neoplasia,EIN)组织中XLOC_002319基因的表达和甲基化状态.结果:未经5-aza-dC处理的5种食管癌细胞中XLOC_002319基因的表达均呈阴性或弱阳性,经5-azadC的5种食管癌细胞中XLOC_002319基因的表达均增高.5株食管癌细胞在5-aza-dC处理前表现为XLOC_002319高甲基化状态,处理后,Eca109和T.TN细胞系中XLOC_002319基因甲基化程度降低,其余3株细胞系中XLOC_002319基因均表现为非甲基化状态.XLOC_002319基因在ESCC组织中的表达显著低于食管上皮内瘤变组织和癌旁正常组织(P＜0.01),并与组织学分化程度和TNM分期密切相关(P＜0.05).ESCC组织中XLOC_002319基因启动子区甲基化率为63.75％ (51/80),显著高于食管上皮内瘤变组织和癌旁正常组织(P＜0.01),并与淋巴结转移、组织学分化程度和TNM分期密切相关(P＜0.05).发生XLOC_002319基因甲基化的ESCC组织中XLOC_002319基因表达显著低于未发生甲基化的ESCC组织(P＜0.01).结论:XLOC_002319基因在ESCC中的低表达可能与ESCC的发生密切相关,且其启动子区甲基化可能是导致其表达沉默的机制之一.     

MiR-4659b和长链非编码RNA XLOC_008370在食管鳞癌中的表达及临床意义

[目的]检测食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)组织中微小RNA 4659b(microRNA-4659b,miR-4659b)和长链非编码RNA XLOC008370(long non-coding RNA XLOC_008370,1ncRNA XLOC_008370)的表达,探讨miR-4659b和XLOC 008370在ESCC发生及发展中的作用机制.[方法]应用实时荧光定量PCR (real-time quantitative polymerase chain reaction,qRT-PCR)的方法检测miR-4659b和XLOC 008370在50例ESCC组织中的表达情况及相关性.[结果] ESCC组织中miR-4659b的相对表达量显著高于相应癌旁组织[(0.034±0.013)vs (0.005±0.002),t=-15.205,P＜0.05]. miR-4659b的相对表达量与ESCC患者淋巴结转移有关[(0.039±0.011)vs(0.023±0.009),f=5.708,P＜o.o5].XLOC 008370在ESCC中的相对表达量显著低于相应癌旁组织[(0.0019±0.0012)vs (0.020±0.0146),t=-8.921,P＜0.05].XLOC 008370的相对表达量与ESCC患者淋巴结转移有关[(0.0016±0.0010)vs(0.023±0.0014),t=-2.040,P＜0.05],并且XLOC 008370与miR-4659b的相对表达量呈负相关(r=-0.829,P＜0.05).[结论] miR-4659b在ESCC中表达上调而XLOC_008370表达降低,且两者之间有相关性,提示miR-4659b与XLOC_008370可能存在一定的调控作用,这一机制可能在ESCC发生发展中起重要作用.     

长链非编码RNA XLOC_008370在食管鳞状细胞癌中的表达和甲基化状态及其与临床病理特征的关系

目的：检测食管鳞状细胞癌（esophageal squamous cell carcinoma, ESCC）中长链非编码RNA XLOC_008370（long non-colding RNA XLOC_008370, lncRNA XLOC_008370）的表达及其甲基化状态,探讨XLOC_008370在ESCC发生及发展中的作用机制。方法：分别应用RT-PCR以及甲基化特异性PCR（methylation specific PCR, MSP）法检测DNA甲基化转移酶抑制剂5-氮杂-2’-脱氧胞苷（5-Aza-2’-deoxycitydine, 5-Aza-dC）处理前后的ESCC细胞系（TE1、TE13、Eca109、T.TN、YES-2）以及ESCC组织及相应癌旁正常组织中XLOC_008370的表达和甲基化状态,分析其与临床病理特征的关系。结果：5种ESCC细胞中XLOC_008370的表达均呈阴性或弱阳性,经5-Aza-dC处理后,5种细胞中XLOC_008370的表达均升高。5种细胞中XLOC_008370基因呈高甲基化状态,应用5-Aza-dC处理后,Eca109、Yes-2细胞中XLOC_008370基因甲基化程度降低,非甲基化程度增加,其余3种细胞中XLOC_008370基因均表现为非甲基化状态。XLOC_008370在ESCC组织中的表达显著低于癌旁正常组织（P<0.05）,并与TNM分期和组织学分化程度密切相关（P<0.05）。ESCC组织中XLOC_008370的启动子区甲基化率为(54.02%, 47/87）,显著高于癌旁正常组织（9.20%, 8/87）（P<0.05）,并与TNM分期和组织学分化程度密切相关（P<0.05）。发生XLOC_008370甲基化的ESCC组织中XLOC_008370的表达显著低于未发生甲基化的ESCC组织（P<005）。结论： XLOC_008370的异常低表达可能与ESCC的发生密切相关,且其启动子区甲基化可能是导致其表达沉默的机制之一。     

特异长链非编码RNA在鼻咽癌中的表达及其意义

目的 分析长链非编码RNA（long non-coding RNA, lncRNA）在鼻咽癌与慢性鼻咽炎组织中表达水平的变化,寻找可能与鼻咽癌发生发展相关的特异lncRNA。方法 采用lncRNA芯片技术分析lncRNA和mRNA在鼻咽癌与慢性鼻咽炎组织的表达谱,筛选差异表达的lncRNA和mRNA,进一步研究使用了聚类分析、GO分析、pathway分析等生物信息学技术。结果 差异表达的lncRNA（2倍以上变化且P＜0.05）共856条,其中上调的共 425条,下调的共431条;差异表达的mRNA共767条,其中上调的共426条,下调的共341条。利用聚类分析方法将差异表达的lncRNA分成3类：增强子型lncRNA、HOX 基因簇、基因间lncRNA。GO分析将mRNA分成3类：生物学过程类、细胞组分类、分子功能类。Pathway分析显示mRNA共参与28条信号通路,其中参与细胞因子-细胞因子受体相互作用信号通路的上调差异表达的mRNA的富集度最高。结论 与慢性鼻咽炎相比,lncRNA在鼻咽癌组织的表达水平明显改变,提示差异表达的lncRNA可能与鼻咽癌的发生发展有关。     

长链非编码RNA在食管癌中的研究进展

随着分子生物学研究的技术革新和计算机生物信息学的蓬勃发展,长链非编码RNA（lncRNA）的作用和生物学功能得到了深入研究,其在细胞周期进程、细胞生长和凋亡等过程中具有重要的调控作用。lncRNA的异常表达与肿瘤的增殖、迁移及侵袭均密切相关。本文总结了近2年有关食管癌lncRNA的相关研究进展,介绍影响食管癌生物学特性的lncRNA调控机制,尤其是lncRNA作为竞争性内源RNA（ceRNA）的调控机制,以期为食管癌的诊断和治疗提供新思路。     

长链非编码RNA作为竞争性内源RNA在食管癌中的研究进展

长链非编码RNA(lncRNA)具有与DNA、RNA、蛋白质直接相互作用的能力,在基因表达调控中具有促进或抑制作用。大量的研究表明,lncRNA在多种肿瘤中表达失调,且对肿瘤的发生、发展具有重要作用。然而,lncRNA在食管癌中的作用机制仍然不清楚。近期的一些研究表明,lncRNA可与微小RNA(miRNA)结合,作为其竞争性内源RNA(ceRNA)发挥作用,调控其靶基因的表达,从而参与基因表达的调控。这为揭示lncRNA在食管癌中的分子机制提供了新的思路,也为食管癌的诊断、治疗、预后评估提供了新的生物标志物。本文就lncRNA作为ceRNA在食管癌中的研究进展作一综述。     

长链非编码RNA在食管癌中的研究进展

随着分子生物学研究技术的革新和计算机生物信息学的出现和蓬勃发展,长链非编码RNA（lncRNA）的作用和生物学功能得到了深入研究,其在基因的转录翻译、细胞分化、个体发育、遗传及表观遗传等生命活动中具有重要的调控作用。目前,已有众多权威研究证实lncRNA可在表观遗传学、转录水平、转录后水平与DNA、RNA、蛋白质分子相互结合,在多个重要节点调控肿瘤的进展。lncRNA异常表达与肿瘤的发生、发展和转移均密切相关。本文着重强调lncRNA主要生物学功能,并总结其在食管癌中的异常表达及其调控作用,以期为食管癌的诊断和治疗提供新思路。     

长链非编码RNA在结肠癌中的表达研究

目的 探讨长链非编码RNA（lncRNA）在结肠癌中的表达情况。方法 从公共数据平台Gene Expression Omnibus（GEO）下载结肠癌外显子芯片数据集GSE31737,包含40对结肠癌及癌旁组织。对外显子芯片探针进行重排,筛选出在基因水平特异性匹配lncRNA的探针。用Affymetrix Power Tools分析获得lncRNA表达谱,用LIMMA分析在结肠癌和癌旁组织中差异表达的lncRNA。结果 共有136 053个探针特异性匹配9294个lncRNA,约包含了Ensembl数据库中76％的lncRNA。分析GSE31737发现,与癌旁组织相比,结肠癌组织中共有87个lncRNA差异表达,其中50个高表达,37个低表达。结肠癌与癌旁组织表达值倍数变化＞1.5倍的基因共37个。结论 lncRNA表达在结肠癌组织中发生明显变化,有可能成为结肠癌的分子诊断和基因治疗的新靶点。     

长链非编码RNA ZNF667-AS1在食管鳞状细胞癌组织中的表达及其DNA甲基化状态的研究

 目的 检测长链非编码RNA ZNF667-AS1在食管鳞状细胞癌（esophageal squamous cell carcinoma, ESCC）中的表达及甲基化状态。方法 应用qPCR和MSP法检测DNA甲基化转移酶抑制剂5-Aza-dC处理前后食管癌细胞系（Kyse170、Eca109、TE1和TE13）、ESCC及相应癌旁正常组织中ZNF667-AS1基因的表达,及其CpG岛三个区域的甲基化状态。结果 在5-Aza-dC处理后的四株细胞系中,ZNF667-AS1基因的表达均增高,且其CpG岛三个区域甲基化程度均降低。ZNF667-AS1基因在ESCC组织中的表达显著低于相应癌旁正常组织,且该基因CpG岛远端启动子区及第一外显子区甲基化率在ESCC与相应癌旁正常组织中的差异均具有统计学意义（均P<0.05）。ESCC组织中CpG岛近端启动子区甲基化率显著高于相应癌旁正常组织,并与组织分化程度、TNM分期密切相关,ZNF667-AS1基因CpG岛近端启动子区发生甲基化的ESCC组织中,低表达例数高于高表达例数,差异具有统计学意义。结论 ZNF667-AS1基因在食管癌细胞系和ESCC组织中的低表达与ESCC的发生发展密切相关,且其近端启动子区的高甲基化状态可能是导 致其表达沉默的机制之一。     

食管鳞癌中DACT2基因表达及甲基化状态研究

[目的]检测食管鳞状细胞癌(ESCC)中DACT2基因表达及启动子区甲基化状态,探讨DACT2基因在食管鳞癌发生发展中的作用.[方法]分别应用逆转录—聚合酶链反应(RTPCR)以及甲基化特异性PCR(MSP)的方法检测DNA甲基转移酶抑制剂5-氮杂-2'-脱氧胞苷(5-aza-dC)处理前后的食管癌细胞系(TE1、TE13、T.Tn、Eca109)以及食管鳞癌组织及相应癌旁组织中DACT2 mRNA表达情况及启动子区甲基化状态.[结果]经5-aza-dC处理后4种食管癌细胞系中DACT2基因的表达均增高.4种未经5-aza-dC处理的食管癌细胞系中DACT2基因呈高甲基化状态.应用5-aza-dC处理后,DACT2基因在4种细胞系中均呈非甲基化状态.DACT2基因在食管鳞癌组织中的表达显著低于癌旁组织(0.66±0.53 vs 0.95±0.64,t=-2.43,P=0.018),并与淋巴结转移密切相关(t=-2.030,P=0.048).食管鳞癌组织中DACT2基因的启动子区甲基化率显著高于癌旁组织(50.0％ vs 21.1％,x2=9.439,P=0.002),并与TNM分期、组织学分化程度和淋巴结转移密切相关(P均＜0.05).发生DACT2基因甲基化的食管鳞癌组织中DACT2基因的表达量显著低于未发生甲基化的食管鳞癌组织(0.46±0.32 vs 0.78±0.61,t=-2.341,P=0.023).[结论]DA CT2基因在食管鳞癌中的异常低表达与食管鳞癌的发生、发展密切相关,且其启动子区甲基化可能是导致其表达沉默的机制之一.     

食管鳞癌中p16基因启动子区甲基化及其表达

 目的探讨食管鳞癌（ESCC）p16基因甲基化的状况及其表达与食管鳞癌临床病理特征之间的关系。方法采用甲基化特异性PCR方法（MSP）分别检测75例食管癌组织、癌旁组织和切缘组织p16基因启动子区域CpG岛甲基化状态。采用Envision免疫组化法检测食管癌组织及癌旁组织的p16蛋白的表达。结果75例标本中，食管癌组织、癌旁组织和切缘细织p16基因甲基化率分别为41．3％（31／75）、13．3％（10／75）和6．67％（5／75）。癌组织和癌旁组织P16蛋白的阳性表达率分别为29．3％（22／75）和56．7％0（17／30）。31例癌组织p16基因甲基化阳性标本中有2例（6．4％）检测到P16蛋白的表达，而44例癌组织p16基因甲基化阴性标本中有20例（45．5％）检测到P16蛋白的表达。食管癌组织p16基因甲基化率显著高于癌旁组织和切缘组织（P〈0.01），P16蛋白表达与p16基因甲基化呈负相关。p16基因启动子区甲基化与食管癌的组织学分级、肿瘤部位无明显相关，与临床分期、淋巴转移密切相关。结论p16基因甲基化在食管癌发生发展中起着重要作用，食管鳞癌的分期和淋巴结转移与p16基因甲基化之间有密切关系。     

微管不稳定蛋白Stathmin在食管鳞癌组织中的表达及意义

目的 探讨Stathmin蛋白在食管鳞癌组织中的表达及意义.方法 收集新乡医学院2006年4月至9月期间食管鳞癌切除标本及其相应癌旁组织31例,以免疫组织化学法检测Stathmin蛋白在所取标本中的表达情况.结果 在31例食管鳞癌标本中,Stathmin蛋白表达阳性的标本为23例,阳性率为74.2%,阳性颗粒可见于细胞质;分别按年龄、性别、组织类型、分化程度、淋巴结转移、肿瘤浸润深度及TNM分期将31例食管癌标本分组,Stathmin蛋白表达差异有统计学意义的因素有分化程度、淋巴结转移、肿瘤浸润深度及TNM分期(P＜0.05).结论 食管鳞癌组织中Stathmin蛋白高表达,其表达与食管鳞癌的分化程度、淋巴结转移、肿瘤浸润深度及TNM分期显著相关,Stathmin蛋白可能为人食管癌的生物治疗提供一个新靶点.     

MIM在食管鳞癌组织中的表达

目的：探讨肿瘤转移消失蛋白（ MIM）在食管鳞癌组织中的表达及意义。方法采用免疫组化S-P法检测65例食管鳞癌组织、30例癌旁不典型增生组织及65例正常食管黏膜组织中MIM表达。结果 MIM在食管鳞癌组织中的阳性表达率为75.4%、癌旁不典型增生组织中的阳性表达率为43.3%、正常食管黏膜组织中的阳性表达率为13.8%,三者两两相比差异均有有统计学意义（P〈0.05）。MIM在食管鳞癌组织中的表达与浸润程度、淋巴结转移有关（ P〈0.05）。结论食管鳞癌组织中MIM的异常表达可能是导致食管鳞癌发生、发展的原因之一。     

食管鳞癌组织中TIMP的表达

目的，探讨组织金属蛋白酶抑制剂（TIMP）在食管鳞癌中的表达及其临床意义。方法免疫组化法分别检测41例食管鳞癌患者的癌及相应正常组织中MMP-9和TIMP的表达变化。结果食管鳞癌组织中MMP-9的表达率升高且显著高于TIMP。结论MMP-9与食管鳞癌的侵袭转移有关，其机制可能与食管鳞癌组织中的MMP／TIMP平衡失调有关；MMP与TIMP联合检测有助于食管鳞癌生物学行为的判断。