基于网络药理学研究黄连-黄柏药对治疗溃疡性结肠炎的作用机制

目的:运用网络药理学技术研究黄连-黄柏药对治疗溃疡性结肠炎的主要活性成分,预测活性成分的作用靶点、建立"药对-活性成分-疾病-作用靶点"网络,探讨黄连-黄柏药对治疗溃疡性结肠炎的潜在作用机制.方法:运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选黄连-黄柏药对的化学成分,借助人类基因数据库获取溃疡性结肠炎的相关靶点...     

基于网络药理及分子对接探讨茵陈五苓散治疗原发性胆汁性胆管炎的作用机制

目的:基于网络药理学及分子对接技术探讨茵陈五苓散治疗原发性胆汁性胆管炎(PBC)的潜在作用机制.方法:运用系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)检索茵陈五苓散的活性成分和作用靶点.通过GeneCard、OMIM数据库收集疾病靶点.运用Cytoscape3.7.2软件构建化合物-靶点网络.采用R语言进行基因本体(GO)...     

基于网络药理学探究人参-三七药对改善无症状性心肌缺血作用机制

目的:借助网络药理学研究人参-三七药对治疗无症状性心肌缺血的作用机制.方法:借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),以"人参""三七"为检索词获取药物成分及作用靶点,运用UniProt对基因靶点标准化处理,利用Cytoscape 3.7.2软件构建成分-靶点网络图;以GeneCards平台挖掘SMI作用靶点;...     

基于网络药理学探讨四磨汤治疗慢传输型便秘的作用机制研究

目的:运用网络药理学方法探讨四磨汤治疗慢传输型便秘(STC)的机制及作用靶点.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及TCMID数据库检索四磨汤四味药物所有的有效化合物成分及筛选对应作用靶点,借助GeneCards数据库、DisGeNET数据库查找STC的疾病靶点,使用Venny 2.1.0在线软件作图...     

四妙丸对类风湿性关节炎和湿疹“异病同治”作用机制的网络药理学探讨

目的运用网络药理学方法分析四妙丸治疗类风湿性关节炎和湿疹的活性成分、作用靶点及关键通路, 探讨该方“异病同治”的作用机制。方法通过检索中药系统药理学分析平台（TCMSP）数据库并结合文献筛 选四妙丸中的活性成分及其作用靶点;利用OMIM、GeneCards、Drugbank 等数据库收集类风湿性关节炎和湿 疹的疾病相关靶点;活性成分作用靶点与疾病靶点取交集得到四妙丸治疗类风湿性关节炎和湿疹的共同靶点。 通过Cytoscape 3.7.1 软件构建“中药-活性成分-疾病共同靶点”网络;运用STRING 数据库构建共同靶点蛋白 互作（PPI）网络。通过Metascape 和DAVID 数据库对共同靶点分别进行GO 功能富集分析和KEEG 通路富集分 析。结果共筛选出四妙丸治疗类风湿关节炎和湿疹的共同靶点46 个,对应四妙丸中的45 种活性成分。四妙 丸主要通过槲皮素、山柰酚、汉黄芩素、油酸、3β-乙酰氧基苍术酮等活性成分,对TNF、IL6、IL1B、 CCL2、CXCL8 等关键基因进行调控,实现对类风湿关节炎和湿疹的异病同治作用。其作用机制可能与细胞黏 附、白细胞迁移、对脂多糖的反应等生物过程有关,并通过TNF 信号通路、类风湿性关节炎、Toll 样受体信 号通路等相关通路实现。结论四妙丸是通过多成分、多靶点、多种信号通路来发挥治疗类风湿关节炎和湿疹 的作用,与其抗炎及免疫调节作用密切相关。     

基于网络药理学与分子对接探讨"乳香-没药"治疗膝骨关节炎的作用机制

目的:运用网络药理学及高通量分子对接技术的方法,对"乳香一没药"药对治疗膝骨关节炎的潜在靶点及机制进行探讨.方法:利用计算机检索中药系统药理学数据库(TCMSP),分别检索乳香、没药的有效活性成分并筛选得到有效活性成分的靶基因.从OMIM、GeneCards数据库检索膝骨关节炎的相关靶点基因,与"乳香-没药"药对有效成...     

基于网络药理学和分子对接技术探讨杜仲-续断治疗复发性流产作用机制

目的:采用网络药理学和分子对接技术探讨杜仲-续断治疗复发性流产(RSA)的作用机制.方法:利用中药系统药理学数据库(TCMSP)检索杜仲-续断的活性成分和基因靶点.在GeneCards、OMIM和PharmGkb数据库收集RSA疾病靶点,在Cytoscape 3.7.2软件中构建活性成分-靶点网络,基于STRING数据...     

木贼-青葙子药对治疗糖尿病视网膜病变作用机制网络药理学研究

目的 运用网络药理学方法 探讨木贼-青葙子药对治疗糖尿病视网膜病变的作用机制.方法 应用TCMSP、ETCM、Uniprot数据库检索木贼和青葙子药物成分及靶点,应用GeneCards、OMIM数据库检索糖尿病视网膜病变基因,通过Venny软件获得交集靶点,利用Cytoscape3.6.1软件构建靶点关系网络,录入St...     

基于网络药理学的雷公藤治疗干燥综合征作用机制研究

目的:基于网络药理学探讨雷公藤与干燥综合征的关联关系及潜在作用机制.方法:通过检索TCMSP数据库,结合口服生物利用度和类药性分析,筛选出雷公藤中的主要活性成分及作用靶点;检索GE O数据库筛选干燥综合征的预测靶点,并将有效化合物和疾病靶点进行映射;采用Cytoscape软件构建雷公藤化合物-干燥综合征靶点相互作用网络...     

基于网络药理学和分子对接探讨柴胡-大黄药对防治胆石症的作用机制

目的:基于网络药理学和分子对接技术初步探讨柴胡-大黄药对治疗胆石症的有效物质基础及作用机制.方法:借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索柴胡、大黄的有效活性成分及潜在作用靶点;通过GeneCards、CTD、TTD数据库得出胆石症相关作用靶点.利用Cytoscape 3.7.2软件及STRING数据库构造...     

基于网络药理学探讨徐长卿-紫草-地肤子治疗湿疹的作用机制

目的 通过网络药理学探讨徐长卿-紫草-地肤子治疗湿疹的有效成分及作用机制.方法 首先,利用TCMSP平台检索徐长卿、紫草、地肤子的化学成分和作用靶点,在DrugBank、OMIM、GeneCards和TTD四个数据库筛选出治疗湿疹的靶标;其次,通过Uniprot数据库对靶点进行基因注释,利用Venny 2.1在线工具获...     

基于肝气虚证与网络药理学探讨黄芪-柴胡干预肝炎的作用机制

目的:从肝气虚证角度并通过网络药理学探讨黄芪-柴胡干预肝炎的作用机制.方法:检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)等数据库,筛选黄芪-柴胡干预肝炎的活性成分和作用靶点.构建化合物-靶点-疾病网络和蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,进行拓扑学分析,筛选关键药效分子和核心靶点.对作用靶点进行基因本体(GO)富...     

巴戟天-续断-益母草组药干预肾虚血瘀型多囊卵巢综合征网络药理学作用机制

目的:运用网络药理学方法和技术研究"巴戟天-续断-益母草"组药治疗多囊卵巢综合征(polycystic ovarian syndrome,PCOS)的主要活性成分、靶点、通路等药理学作用机制.方法:通过数据挖掘获得PCOS肾虚血瘀型核心组药巴戟天-续断-益母草;检索中药系统药理学数据库分析平台(traditional ...     

基于网络药理学及分子对接研究桃仁-红花治疗膝骨关节炎的作用机制

目的:基于网络药理学及分子对接技术研究桃仁-红花治疗膝骨关节炎(KOA)的作用机制.方法:采用TCMSP及Uniprot数据库收集整合桃仁、红花的活性成分及其药理作用靶点,在GeneCards数据库检索KOA的靶点基因,通过Venny获取疾病-药物交互靶点,借助STRING数据库及Cytoscape软件构建蛋白互作网络...     

基于网络药理学研究白术-黄芪药对抗胃癌作用机制

目的 运用网络药理学研究脾胃培源方君药药对白术-黄芪治疗胃癌的作用机制.方法 使用TCMSP数据库检索白术、黄芪的有效活性成分与作用靶点,通过Genecards、Drugbank、PharmGKB、OMIM、TTD数据库检索胃癌疾病靶点,将预测的靶点与疾病靶点取交集获得交集基因,通过Cytoscape 3.7.2搭建"...     

基于网络药理学及分子对接技术探讨半夏泻心汤治疗胃食管反流病的作用机制

目的：基于网络药理学及分子对接技术探讨半夏泻心汤治疗胃食管反流病(gastroesophageal reflux disease, GERD)的作用机制。方法：基于中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)检索半夏泻心汤组方中药活性成分,并通过Swiss Target Prediction数据库筛选活性成分相关作用靶点。在DisGeNET数据库、在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man, OMIM)和GeneCards数据库中检索疾病相关靶点及潜在作用靶点。将潜在作用靶点与其对应的活性成分导入Cytoscape 3.9.0软件构建“半夏泻心汤-活性成分-靶点”网络并进行拓扑分析筛选核心活性成分,构建蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络,拓扑分析筛选关键靶点,并构建关键靶点的PPI网络筛选核心靶点。将关键靶点导入DAVI...     

基于网络药理学和分子对接探讨消炎利胆片治疗急性胆囊炎的作用机制

目的：基于网络药理学方法和分子对接技术探讨消炎利胆片治疗急性胆囊炎的潜在作用机制。方法：采用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、化学专业数据库及ETCM数据库检索获取消炎利胆片的化学成分,通过Swiss ADME数据库进一步筛选活性成分并导入Swiss Target Prediction数据库预测药物相关靶点。利用Gene Cards数据库和OMIM数据库检索急性胆囊炎相关靶点,通过Venny 2.1在线平台获取“药物-疾病”交集靶点,并将“药物-疾病”共同靶点导入STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络。利用DAVID数据库对“药物-疾病”共同靶点进行基因本体论（GO）功能注释和京都基因与基因百科全书（KEGG）通路富集分析。运用Cytoscape软件构建“药物成分-靶点-信号通路”网络,计算网络拓扑学参数并筛选消炎利胆片发挥治疗急性胆囊炎作用的重要活性成分及核心靶点,通过Auto Dock平台进行分子对接验证。结果：共获得44个消炎利胆片活性成分及186个药物相关靶点,获得823个急性胆囊炎潜在靶点,取交集后得到“药物-疾病”共同靶点33个,这些靶点主要涉及磷脂酰...     

基于网络药理学的“川芎-延胡索”药对作用机制研究

目的:运用网络药理学理念和技术研究"川芎-延胡索"药对的主要活性成分、靶点和药理学作用机制。方法:通过检索中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库,结合口服生物利用度和类药性分析,筛选出川芎和延胡索的主要成分、靶点信息,采用Cytoscape软件构建活性成分-作用靶点网络,获取的靶点信息,筛选核心靶点。利用DAVID在线分析工具对靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和KEGG通路分析。结果:从"川芎-延胡索"药对中筛选得到58个主要活性成分相关作用于靶点220个,主要涉及在癌症、信号传导、免疫、细胞通讯及凋亡等生物学过程中的多条信号通路。结论:本研究初步揭示了"川芎-延胡索"药对的主要活性成分、靶点及协同作用机制,为进一步深入探讨其药理学作用提供了参考。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨黄芩-黄柏药对治疗银屑病的有效成分及作用机制

运用网络药理学及分子对接技术,探讨黄芩-黄柏药对治疗银屑病的有效成分及作用机制。首先通过检索文献和TCMSP数据库,搜集黄芩、黄柏中的化学成分,利用PharmMapper和UniProt数据库预测药物的作用靶点,通过OMIM、TTD、PharmGkb、DrugBank等数据库检索银屑病相关靶点,再借助Cytoscape软件分别构建"化学成分-作用靶点"网络、"银屑病靶点"网络和"化学成分-银屑病靶点"网络,使用Metascape数据库进行基因功能注释和通路富集分析,最后,利用AutoDock Vina软件将网络中度值较高的化学成分与核心治疗靶点进行分子对接。分析结果显示,网络中含有黄芩苷、汉黄芩苷、小檗碱、黄柏碱等88个化合物和30个靶点,主要涉及中性粒细胞介导的免疫[neutrophil mediated immunity(GO:0002446)]、T细胞激活[T cell activation(GO:0042110)]等免疫学生物过程和细胞色素P450对异种生物的代谢[metabolism of xenobiotics by cytochrome P450(hsa00980)]、细胞凋亡[apoptosis(hsa04210)]、磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)[PI3K-Akt signaling pathway(hsa04151)]等信号通路。分子对接结果显示,主要活性成分与靶点均能自发结合,其中46个成分与EGFR蛋白对接结合能小于-8 kcal·mol~(-1),蛋白蛋白相互作用(protein-protein interaction, PPI)分析推测表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor, EGFR)蛋白可能是治疗银屑病的关键靶点,黄芩苷、小檗碱等活性成分与EGFR蛋白均具有较高的结合亲和力。该研究初步揭示了黄芩-黄柏药对治疗银屑病的多成分-多靶点-多通路作用机制,为该药对治疗银屑病的机制研究提供理论依据。     

基于网络药理学和分子对接探讨杆努尽烟治疗慢性支气管炎的作用机制

目的 基于网络药理学探究杆努尽烟治疗慢性支气管炎的作用机制.方法 利用TCMSP、SwissTarget Prediciton等数据库预测杆努尽烟活性成分及靶点;在TTD、Durgbank、DisGeNT数据库检索慢性支气管炎靶点,利用Cytoscape Version 3.6.1软件构建活性成分-关键靶点网络,采用S...