基于网络药理学方法探究三七接骨丸治疗骨质疏松症的作用机制

目的:探究三七接骨丸治疗骨质疏松症的潜在靶点及其作用机制.方法:应用数据库中医药整合药理学网络计算研究平台筛选出本处方5味中药潜在活性成分及作用靶点;从GeneCards、TTD和OMIM数据库查询骨质疏松症疾病靶点;分别采用韦恩图取得交集,运用Cytoscape 3.8.0软件构建药物-化合物-靶点作用网络,运用...     

基于网络药理学探讨葶苈子治疗骨质疏松症的作用机制

目的：通过网络药理学研究葶苈子治疗骨质疏松症的作用机制。方法：在中药系统药理学数据库与分析平台中检索葶苈子的有效成分及相关靶点;在Gene Cards数据库、OMIM数据库中检索骨质疏松症的疾病基因靶点;通过Perl脚本找到葶苈子与骨质疏松症的共同基因,使用String网站构建葶苈子与骨质疏松症之间蛋白质-蛋白质相互作用的关系网络;最后利用R软件对葶苈子与骨质疏松症交集基因进行基因本体论（GO）功能富集分析、京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：从葶苈子中筛选出9个有效成分,作用于骨质疏松症127个靶点。蛋白质-蛋白质相互作用网络中的核心蛋白有蛋白激酶B(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、白细胞介素（Interleukin,IL）-6、血管内皮生长因子（Vascular Endothelial Growth Factor,VEGF）A、JUN蛋白、IL-1β。基因KEGG富集分析得到与骨质疏松症紧密相关通路主要有晚期糖基化终末产物（Advanced Glycation End Products,AGE）-晚期糖基化终末产物受体（A...     

骨康丸治疗绝经后骨质疏松症的临床研究

目的:观察骨康丸对绝经后骨质疏松症的临床疗效。方法:随机选用60例绝经后骨质疏松症患者,并随机分为治疗组和对照组。治疗组采用基础治疗加骨康丸治疗,对照组采用基础治疗和安慰剂。治疗组和对照组均连续给药3月。检查患者腰椎密度的变化、血清P/Ca、尿Dpyr和E2、CT、PTH的变化;观察患者腰背静息痛和运动痛的变化。结果:骨康丸有显著提高绝经后妇女腰椎骨密度的作用,P<0.01;能显著减少尿脱氧吡啶酚(DPyr)的排泄,P<0.01;能降低血钙、磷比值,P<0.05;能提高E2和CT在血中的水平,降低PTH在血中的水平,P<0.05;治疗后患者的腰背静息痛和运动痛显著减轻,P<0.01。结论:骨康丸有改善绝经后妇女腰椎骨密度和抑制骨吸收的作用,能调节体内骨代谢相关激素水平,明显减轻患者的腰背疼痛。     

基于网络药理学预测金匮肾气丸治疗骨质疏松症的作用机制

目的：基于网络药理学预测金匮肾气丸治疗骨质疏松症的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、中药分子机制综合数据库（TCMID）、中药分子机制生物信息学分析工具（BATMAN-TCM）等数据库检索金匮肾气丸药物成分及成分相关靶点;以“Osteoporosis”为关键词在人类基因数据库（GeneCards）、在线人类孟德尔遗传数据库（OMIM）、DrugBank等数据库检索骨质疏松症疾病相关靶点;制作韦恩图,获取药物-疾病交集靶点;利用String数据库、Cytoscape 3.6.1软件构建药物-疾病交集靶点蛋白互作网络及药物-成分-疾病-靶点网络;通过DAVID数据库对药物-疾病交集靶点进行基因本体（GO）、京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析,并将富集结果可视化。结果：共获得金匮肾气丸药物成分118个,包括槲皮素、山柰酚、大黄素等;有效成分相关靶点202个,疾病相关靶点1 856个,药物-疾病交集靶点87个,包括前列腺素内过氧化物合酶2（PTGS2）、转录因子（JUN）、胞间黏附分子1（ICAM1）等;GO富集分析功能条目376条,其中生物过程（BP）290条,细胞组分（CC）28条,分子功能（MF）58条,包括RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录正调控、类固醇激素受体活性等;KEGG信号通路共90条,包括类风湿性关节炎信号通路、破骨细胞分化信号通路、催乳激素信号通路等。结论：金匮肾气丸通过槲皮素、山柰酚、大黄素、薯蓣皂苷元、β-谷甾醇等有效成分作用于PTGS2、JUN、ICAM1、白细胞介素-1β（IL-1β）、基质金属蛋白酶9（MMP9）等关键靶点通过抗氧化、抑制炎症反应、促进成骨细胞增殖分化、抑制破骨细胞骨吸收等作用机制达到治疗OP的作用。     

益肾骨康丸治疗绝经后骨质疏松症48例

绝经后骨质疏松症属于“骨痹”、“骨痿”等病证范畴。笔者以中医“肾主骨”、“肾为先天之本”的理论为依据 ,自拟而制成“益肾骨康丸”3个系列方并由泉州市正骨医院制剂室制成蜜丸。从 2 0 0 1年 7月至 2 0 0 2年 7月 ,将益肾骨康丸应用于本院骨质疏松科 91例患者 ,并进行初步观察 ,取得了一定疗效。1　临床资料1.1　诊断标准 :根据中华医学会骨质疏松与骨矿盐疾病委员会 2 0 0 2年年会精神 ,我国沿用 1994年 WHO制定的以白人女性骨质疏松症骨密度测量的诊断标准。即骨密度值与当地同性别峰值骨密度相比 ,≥ - 1.0 SD为正常骨量 ,- 1.0 …     

基于网络药理学探讨新伤丸治疗膝骨性关节炎的分子作用机制

目的:基于网络药理学方法探讨新伤丸治疗膝骨性关节炎(Knee Osteoarthritis,KOA)的潜在分子作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库检索新伤丸中16个药味中含有的活性成分,筛选有效活性成分及其潜在作用靶点;运用GeneCards数据库获取与KOA相关的靶标基因,采用Cyt...     

基于网络药理学与分子对接技术探讨二陈汤调节绝经后骨质疏松症脂骨代谢紊乱的药效机制

目的 基于网络药理学与分子对接技术,利用绝经后骨质疏松症及肥胖症的共同靶点基因探究二陈汤调节绝经后骨质疏松症脂骨代谢紊乱的潜在分子机制.方法 通过GeneCards、DRUGBANK、PharmGkb、OMIM和TTD数据库分别获取绝经后骨质疏松症与肥胖症的相关靶点并进行整合,在TCMSP数据库检索二陈汤药物的有效成分...     

基于网络药理学探析生血补髓汤预测骨质疏松症的分子作用机制

目的 基于网络药理学方法探析生血补髓汤预测骨质疏松症的分子作用机制。方法 通过TCMSP和TCMID数据库检索生血补髓汤的活性成分和对应靶点;通过GEO DataSets数据库获取骨质疏松症GSE84500和GSE35958疾病芯片并合并数据;将生血补髓汤对应靶点与疾病差异基因取交集,获得生血补髓汤防治骨质疏松症预测靶点;利用Cytoscape 3.8.1软件构建“中药-疾病”可视化调控网络。交集基因导入STRING 11.0平台获得PPI网络,利用CytoNCA进行PPI拓扑分析。利用R语言对交集基因进行GO和KEGG富集分析。利用Dycharts平台绘制KEGG通路分类占比饼图。利用Cytoscape 3.8.1软件构建“成分-靶点-通路”可视化调控网络。结果 筛选得到生血补髓汤活性成分87个,包括槲皮素、木犀草素、山奈酚等;交集基因97个,PPI拓扑分析核心基因17个,包括血管内皮生长因子A(VEGFA)、白细胞介素-6(IL-6)、转录因子AP-1(JUN)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)等。GO富集分析共得到条目1 645条;KEGG富集分析得到通路115条,主要涉及脂质...     

基于网络药理学探讨四妙丸治疗骨关节炎的作用机制

目的：采用网络平台药理学的研究方法,对四妙丸（SMW）用于治疗骨关节炎（OA）的药理作用以及机制问题进行了研究和探讨。方法：主要通过在TCMSP网络平台对四妙丸进行活性药物成分的筛选、在DrugBank数据库的基础上进行了靶标的预测,应用Cytoscape 3.7.1软件构建了化合物-靶点数据分析网络;在TTD及DisGenet进行数据库的检索,获取了疾病的靶点;通过构建韦恩图,取得了疾病与活性药物作用靶点的交集,得到了四妙丸治疗OA的作用靶点;并对四妙丸进行了GO功能注释功能通路注释和KEGG通路富集分析;构建了四妙丸中药-成分-靶点-信号通路网络。结果：分析研究显示共挖掘到了四妙丸中64种共同作用成分及163个潜在共同作用靶点,OA疾病989个成分及相关共同作用靶点,得到四妙丸-疾病共同靶点18个,共同信号作用的靶点主要富集于34个生物过程和26条信号通路上。结论：四妙丸中药可能主要是通过调节PTGS2、TNF、AR等共同靶点,调控IL-17信号通路、TNF信号通路、松弛素、破骨细胞分化、松弛素等方式来抑制机体炎性反应,进一步调节机体免疫功能来治疗骨关节炎。     

基于网络药理学探讨二至丸治疗肝细胞癌的作用机制

目的:基于网络药理学方法,探究二至丸治疗肝细胞癌(HCC)的可能作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)以及文献查阅,检索并收集二至丸成分--女贞子和墨旱莲的候选活性成分及其对应的靶标。利用Uni Prot数据库和人类基因组注释数据库(Genecards)结果相比对,获得二至丸与肝细胞癌重合的潜在靶标基因。使用Cytoscape3.6.0软件构建二至丸的"候选成分-作用靶标"网络。使用omicshare平台将药物靶蛋白和疾病靶点相映射,并绘制Venn图。结合String数据库及Cytoscape软件中的Generate style from statistics工具,构建蛋白质相互作用网络。通过Systems Dock Web Site网络服务器与二至丸的活性成分进行分子对接。利用Database for Annotation,Visualization and Integration Discovery(DAVID)生物信息资源数据库,对二至丸的作用靶标进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析和GO分类富集分析。结果:共从二至丸中筛选得到21个候选活性成分,包括β-谷甾醇(beta-sitosterol),槲皮素(quercetin),木犀草素(luteolin),去甲蟛蜞菊内酯(demethylwedelolactone),山柰酚(kaempferol)等,和151个作用靶标,包括肿瘤坏死因子(TNF),血管内皮生长因子(VEGF),氨基端激酶(c-JUN),原癌基因(c-MYC),基质金属蛋白酶-9(MMP-9)等,主要涉及乙型肝炎(Hepatitis B),TNF,磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt),肿瘤抑制基因p53,Toll样受体家族(Toll-like receptor)等信号通路。结论:该研究基于网络药理学的方法预测了二至丸治疗肝细胞癌的可能的作用机制,为后续的深入研究提供了方向。     

基于网络药理学探讨山茱萸治疗骨质疏松症的作用机制

目的:基于网络药理学方法分析山茱萸治疗骨质疏松症(Osteoporosis,OP)的药理机制.方法:通过中医药系统药理学平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)数据库及相关文献获取...     

基于网络药理学的熟地黄干预骨质疏松症分子机制研究

目的:运用网络药理学方法分析熟地黄干预骨质疏松症(osteoporosis,OP)的分子机制。方法:运用网络药理学方法,采用药代动力学参数(ADME)筛选标准,通过靶基因预测技术、网络构建、网络结构拓扑分析技术、GO富集分析和KEGG通路分析技术,研究熟地黄干预OP的分子机制。结果:在中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)中检索到熟地黄中化合物76种,通过ADME筛选和PubMed验证、补充,最终获得熟地黄活性成分14种,利用靶基因预测技术获得靶基因128个。通过疾病数据库获取与OP相关的靶基因336个。利用网络构建软件和STRING数据库分别构建蛋白质相互作用网络。将两个网络相互映射,并经过网络拓扑分析,获得熟地黄干预OP的关键靶基因47个。基因富集结果显示,熟地黄干预OP主要通过RAS信号通路、RAP1信号通路、PI3K-AKT信号通路,同时还包括雌激素信号通路、低氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路、甲状腺激素信号通路、催产素信号通路、血管内皮生长因子(VEGF)信号通路、性腺激素信号通路、cGMP-PKG信号通路、钙信号通路、胰岛素信号通路。结论:熟地黄干预OP具有多组分、多靶点、协同作用的特点,其通过以RAS、RAP1、PI3K-AKT为主的众多信号通路下的关键靶基因对骨代谢产生双向调控作用,促进成骨作用;同时激活大量间接靶点,通过调节人体内分泌、改变离子通道状态、影响骨周围组织代谢等途径对骨代谢产生综合影响。     

基于网络药理学分析虎骨治疗骨质疏松症的分子机制

目的 预测虎骨治疗骨质疏松症(OP)的靶点,探讨其治疗骨质疏松的分子作用机制。方法 查阅文献,检索虎骨的化学成分和作用靶点,利用GeneCards和NCBI以及其他数据库中检索骨质疏松症相关基因。利用GO数据库和KEGG数据库进行分析富集,采用Cytoscape 3.8.0绘制中药-成分-疾病-途径-靶点网络图,并用分子对接对关键靶点进行验证。结果 成分-靶标关系网络包括19个成分和168个靶标,包括关键靶标PTGS2、EGFR等。GO功能富集分析包括1259个生物过程,147个与分子功能相关,80个与细胞组分相关。通过对KEGG信号通路的富集和筛选,获得了26条信号通路。分子对接结果表明,预测的活性物质成分和关键靶点均具有较好地结合活性。结论 虎骨中的氨基酸类等活性成分主要通过PTGS2和EGFR等靶点调节相关通路治疗骨质疏松症。反映了虎骨“多成分、多靶点、多途径”的功能特点。     

基于网络药理学的肾气丸治疗糖尿病作用机制研究

目的运用网络药理学方法筛选肾气丸的活性成分及核心靶标,探讨肾气丸治疗糖尿病的作用机制。方法经中药系统药理学分析平台(TCMSP)并结合文献查询,筛选肾气丸的活性成分;通过TTD数据库和Swiss Target Prediction数据库筛选肾气丸活性化合物的作用靶点,建立靶点数据集;通过OMIM数据库和DrugBank数据库筛选糖尿病相关的靶标;PPI数据库构建肾气丸和糖尿病的交互靶标;用Cytoscape软件构建成分-靶点-疾病交互网络图,并通过ClueGO富集分析涉及的靶点基因功能及信号通路;应用Autodock软件进行核心靶标分子对接。结果筛选得到肾气丸100个活性成分,网络分析表明肾气丸活性成分涉及低密度脂蛋白受体相关蛋白6、胰岛素受体底物1、SHC转化蛋白1等靶点58个,靶点与调控基因的转录、细胞凋亡、细胞增殖、胰岛素受体等生物过程相关,通过调节胰岛素抵抗、TNF信号通路、2型糖尿病信号通路、胰岛素信号通路等通路来发挥其抗糖尿病作用。结论肾气丸治疗糖尿病具有多成分-多靶点-多途径的特点,为进一步研究肾气丸治疗糖尿病的作用及分子机制提供了新思路和新方向。     

基于网络药理学探讨菟丝子治疗骨质疏松症的作用机制

摘 要：目的：采用网络药理学的方法探讨菟丝子治疗骨质疏松症可能的作用机制。方法：通过检索TCMSP、TCMID、SymMap、BATMAN-TCM、ETCM以及查阅文献获取菟丝子的全部成分，并筛选菟丝子活性成分以及治疗骨质疏松症的靶标；采用Cytoscape3.6.0构建菟丝子的“活性成分-靶标”网络并结合数据库String和Cytoscape3.6.0绘制所得靶标间相互作用关系；最后利用DAVID数据库对靶标基因进行GO功能分析与KEGG富集分析。结果：检索TCMSP、TCMID、Symmap、BATMAN-TCM、ETCM以及查阅文献获取菟丝子全部成分，进一步筛选出的与骨质疏松症相关的活性成分有14个，包括槲皮素、芹菜素，金丝桃苷等；活性成分发挥作用的潜在靶标有83个，主要有白细胞介素6（IL-6）、血管内皮生长因子A（VEGFA）、骨分化特异性转录分子2（RUNX2）、雌激素受体α（ESR1）等；KEGG富集分析得到与骨质疏松症紧密相关通路主要有PI3K/Akt、MAPK、TNF信号通路等。结论：中药菟丝子中槲皮素、芹菜素，金丝桃苷等活性成分可能通过PI3K/Akt、MAPK、TNF等信号通路实现对骨质疏松症的防治。     

基于网络药理学探讨大补元煎治疗阿尔茨海默病的机制

目的 利用网络药理学方法探讨大补元煎治疗阿尔茨海默病(Alzheimer disease,AD的活性成分及作用机制。方法 利用TCMSP数据库筛选大补元煎的活性成分及作用靶点,利用Gene Cards、OMIM、TTD、Drug Bank数据库筛选AD相关靶点,取交集得到大补元煎治疗AD的潜在作用靶点。将交集靶点导入STRING数据库,获取蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)关系,利用Cytoscape软件构建PPI网络及中药—成分—靶点—通路网络。借助Metascape平台进行基因本体(gene ontology,GO)功能注释和KEGG通路富集分析。结果 筛选出活性成分175个,潜在靶点187个。大补元煎治疗AD的主要活性成分为槲皮素、山奈酶、β-谷甾醇、豆甾醇等,高效应靶点为APP、STAT3、PTGS2、PTGS1、AR等,生物学通路涉及癌症通路、神经活性配体—受体相互作用、c AMP信号通路、p53信号通路、5-羟色胺能突触等。结论 大补元煎通过多成分、多靶点、多途径影响AD进程,从而发挥治疗作用。     

藤黄健骨丸调控BMP-2/Smad信号通路治疗绝经后骨质疏松症

目的 观察藤黄健骨丸对绝经后骨质疏松症模型大鼠的治疗作用。方法 将72只雌性大鼠随机分为6组,分别为假手术组（SHAM）、模型组（OVX）、仙灵骨葆胶囊组（XLGB）、藤黄健骨丸低剂量组（THJGW-L）、藤黄健骨丸中剂量组（THJGW-M）及藤黄健骨丸高剂量组（THJGW-H）。手术造模3 d后给药,除假手术组、模型组灌胃蒸馏水外,其余4组均按照相应剂量灌胃药物。连续灌胃8周后,分别检测大鼠术后各阶段体质量、子宫和肾脏重量、骨强度值,观察股骨病理变化。Western-blot法检测大鼠股骨中Runx2、BMP-2和Smad1蛋白表达水平。结果 实验结果显示,藤黄健骨丸可以增加去卵巢大鼠的子宫和肾脏重量,能够提高去卵巢大鼠的股骨荷载力,改善骨微结构,增加钙离子沉积,增加骨细胞数量。Western-blot结果显示去势大鼠骨组织中Runx2、BMP-2和Smad1相对蛋白水平降低,经过藤黄健骨丸治疗后,Runx2、BMP-2和Smad1相对蛋白水平显著升高。结论 藤黄健骨丸可以提高去势大鼠骨强度,改善骨组织形态,其作用机制可能与调控BMP-2/Smad信号通路来促进骨形成,对绝经后骨质疏...     

基于网络药理学和分子对接技术探讨锁阳治疗骨质疏松症的作用机制

目的 运用网络药理学分析中药锁阳治疗骨质疏松症的作用机制,并通过分子对接进行验证。方法 从TCMSP数据库查找锁阳的有效活性成分,通过PubChem数据库获得活性成分的结构,导入Swiss Target Prediction数据库预测其靶点。使用OMIM、DisGeNET、GeneCards数据库获得骨质疏松症(OP)相关靶点,利用Cytoscape构建“药物-成分-靶点-疾病”网络图,Venn 2.1平台获取药物-疾病共同靶点,利用STRING在线数据库建立蛋白相互作用关系并构建网络图。再使用R软件的Bioconductor生物信息软件包进行关键靶基因GO与KEGG功能富集分析,最后使用AutoDock、PyMOL、R软件对活性成分与靶点间进行分子对接验证。结果 共得到锁阳主要活性成分26个,活性成分药物靶点420个;骨质疏松症相关靶点1749个,药物-疾病共同靶点136个。根据PPI分析显示：MAPK3、EGFR、 CASP3、STAT3、MAPK8、 PTGS2、 JUN等可能是锁阳治疗OP的核心靶点,GO富集分析表明锁阳治疗骨质疏松症主要涉及炎症反应的调节、活性氧代谢过程、肌肉...     

基于网络药理学及分子对接探讨杜仲叶防治骨质疏松的作用机制

目的：采用网络药理学-分子对接预测杜仲叶防治骨质疏松症的作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及SwissTargetPrediction分析平台对杜仲叶活性成分及作用靶点进行筛选,使用GeneCards、在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库、治疗靶点数据库(TTD)对骨质疏松症的对应靶标进行筛选,将中药靶基因与疾病靶基因相交集,将交集靶点导入Cytoscape软件构建成分靶点网络,使用STRING分析平台及Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选核心靶点。对中药-疾病共同靶标进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)功能富集分析,得出中药-疾病共同靶标相关的信号通路,最后运用AutoDock与Pymol软件对预测靶标与其对应的成分进行分子对接。结果：筛选后得到杜仲叶治疗防治骨质疏松症的有效成分7个,杜仲叶-骨质疏松症共同靶标231个,并推断其作用机制可能与动脉粥样硬化信号通路的下游核因子κB信号通路,MAPK信号通路、TNF、PI3K-AKT、IL-17及HIF-1信号通路等有关,且MAPK1、STAT...