自动化在生物样本库中的应用现状

<正>为了将基础医学研究的成果充分应用到临床疾病诊治中,近年来,转化医学和精准医学的概念逐渐兴起,作为有望成为跨越这个鸿沟的桥梁,生物样本库如雨后春笋般地出现在全国各地,科研工作者也把目光投向生物样本库的标准化建设以及随之而来的价值发掘上~([1])。然而,生物样本库普遍存在样本数量少、样本数据不完整、质量不达标等现象,严重地影响了相关研究结果的可靠性~([2-3])。因此,高效地获     

中山大学附属第五医院生物样本库的建立与完善

<正>生物样本库即标准化收集、处理、保存和使用各种离体生物样本和表型信息,为生物医学研究提供科研材料的资源库~([1])。生物样本库涵盖了丰富的疾病临床信息与样本生物学信息,为疾病的研究、遗传和健康事业发展提供了战略性资源,是支撑转化医学和精准医疗实施的前提,更是研究型医院与学科建设的基石。欧美国家非常重视生物样本库的建设,1999年英国建     

生物样本库安全管理体系的建立与完善

正精准医学时代的到来促进了生物样本库的迅速发展~([1]),我国生物样本库的数量已经呈现逐步上升趋势。然而,生物样本库建设过程中安全管理体系的建立需要引起生物样本库建设者的高度重视。生物样本库安全管理体系需要考虑生物安全和生物安保两个层面,其中生物安全(biosafety)是     

生物样本库的临床信息整合探讨

<正>转化医学是近年来国际医学健康领域日渐崛起的一门新兴学科~([1]),倡导以患者为中心,强调基础研究人员与临床医生的密切合作,以提高医疗总体水平。来源于医院患者的生物样本库是开展转化医学研究的重要基础~([2]),其中生物样本的临床信息作为临床生物样本库的重要组成部分,更是为转化医学研究提供主要支撑。然而临床生物样本数据量庞大且非结构化,分布较为分散,如何从海量的临床数据中提取出可用信息,并与生物样本本身信息进行关联,形成临床数     

生物样本库的设施与环境

正生物样本库融合了生物样本实体、生物分子信息以及样本资料数据的综合资源,对于开展人类疾病预测、诊断、治疗等研究具有不可替代的重要作用~[1],是众多重要科研成果快速产业化、实现转化医学和精准医学的重要保证~[2]。世界范围内已将生物样本库视为发展生物医药核心竞争力的重要战略举措之一~[3],纷纷投入大量资金。要建设好生物样本库,设施和环境是根基、是基础,一定要充分重视。下面就生物样本库的设施和环境进行简单介绍。     

儿童专科医院样本库的生物样本特征分析及策略建议

正生物样本库为转化研究提供重要的研究资源~([1]),其通过与疾病特征和研究目的相关联的顶层设计、系统规范地收集健康个体来源的和疾病个体来源的血液、组织、各种体液等样本,经过与样本特性相适宜的处理后再将样本冷冻保存~([2])。生物样本库的规范建设和科学管理至关重要,对各种样本分析前变量开展质控研究以建立科学的样本处理和存     

儿童专科医院特色生物样本库的建立与应用

<正>生物样本库是一种集中收集、处理、存储和应用各种生物材料及其相关信息用于疾病的临床诊疗研究的生物应用系统~([1])。一般由两部分组成:一是样本实体库,即可以从中提取到DNA、RNA、蛋白质等成分的组织或血液等生物样本;二是样本信息库,包括从生物样本中提取DNA、RNA、蛋白质等成分所得到的个人独有的遗传信息数据及临床诊疗信息~([2])。早在1994年,中国科学院就建立了中华民族永生细胞     

生物样本库的现状、发展与思考

正生物样本库是生命科学和生物技术基础设施的重要组成部分,对经济增长和医疗保健能产生重大影响。根据国际经济合作与发展组织(OECD)的定义,生物样本库指的是"人口中生物材料以及存储在相关组织中的数据和信息的集合"~([1])。生物样本库是生物样本的存储场所,生物样本包括但不     

上海市长宁区老年人群生物样本库建设

生物样本库是一种集中保存各种人类生物材料,用于疾病的临床治疗和生命科学研究的生物应用系统,是标准化收集、处理、储存和管理人类离体器官、组织、细胞、血液、体液、分泌物、排泄物及其生物大分子衍生物等各种生物样本,以及生物样本捐赠者的临床诊治、随访等信息的机构[1].生物样本库是转化医学、精准医学的重要研究基础之一,在疾病风...     

生物安全样本库的发展、应用现状与探讨

随着转化医学、精准医学和个体化医疗的兴起及迅猛发展,生物样本库的概念逐渐引起了国内外政府及研究机构的重视,各国政府更是加大了对建库资金的投入力度[1].生物样本是实现临床到科研,再将科研成果快速用于临床,在提高科研效率的同时,能够让患者充分受益的重要生物资源.生物样本库已经成为临床疾病的治疗和预防、生命科学研究、个体化...     

底部预置二维码冻存管在生物样本存储中的应用方法

随着转化医学和健康医疗大数据快速成为医学研究的热点[1-3],越来越多的研究者认识到人类遗传资源与信息是医学研究的宝贵资源,是精准医学的基石[4].医学研究对生物样本的收集、保存和应用需求日益增加,高质量大规模生物样本库的建立对探索人类疾病新治疗途径和提高科研效率极具帮助[5-6].生物样本库一般使用冻存管储存生物样本...     

我国生物样本库建设现状与未来发展的思考

正在生命科学领域,随着精准医学时代的开启,越来越多的科研人员聚焦生物样本库的建设和研发。随着后基因组时代的来临,生物医药领域的科研人员聚焦于设计并操控生物样本库的采集、处理、分装、储存、分析、管理、分配生物样本和数据以备未来的研究使用。正是基于未来研究的需求,推动着生物样本库在政策、法律法规、行业标准化建设、运营和共享,以及生物样本库产业化和可持续性发展等诸多方面要重新探索明确定义、内     

生物样本库临床及随访信息的采集和管理

正样本库的建设在疾病的研究中起着重要的作用~([1-2])。人们很早就认识到患者的临床样本是研究人体疾病的重要材料。随着对疾病的认识加深,研究人员发现,样本和样本捐赠者疾病诊治和转归的信息在研究中也起到了至关重要的作用。例如在疾病发生发展分子机制的研究中,首先通过对病变组织的DNA、RNA和蛋白等生物大分子进行分析,获得疾病的基因/蛋白表型;而后通过患者的诊治及转归信     

血液放置时间和RNA反复冻融对RNA质量的影响

正在临床和科研工作中,血液和组织是比较容易获取的生物标本,特别适用于临床和实验室检测及生物样本库收集保存。DNA、RNA和蛋白质是三种重要的生物大分子,其中RNA在人类多种生理和病理过程中发挥着举足轻重的作用。RNA通常是从组织、全血和培养的细胞中提取获得~([1]),高质量RNA可满足RT-PCR、Northern blot、基因表达谱、转录组测序和阵列分析等生物学实验的研究需求~([2-3])。由于     

FFPE组织提取DNA样本质量评价的多中心调研

正中性福尔马林固定石蜡包埋(formalin fixed paraffin embedded,FFPE)一直是病理科处理组织样本的标准程序,也是病理科形态学诊断的基石~([1])。随着医学的发展,靶向药物在临床治疗中被广泛地使用,FFPE的组织块还必须用于药物靶点的基因诊断,特别是体细胞突变相关基因诊断,为患者提供基因的诊断结果以指导临床诊疗~([2-3])。然而,由于整     

应用Opal和Mica构建数据统一与交流平台及探索信息共享模式

正近年来,流行病学和转化医学研究中不同项目之间的资源整合越来越广泛。资源的整合可运用于流行病学队列项目,也可运用于医院的临床信息~([1-2])。这样的资源整合不用大规模地增加投入,就能满足统计分析所需的大样本量,极大地节约了研究经费和精力的投入~([3])。     

绘图教学法在我校留学生人体解剖学教学中的应用

正随着我国医学留学生数量的逐年增多,医学留学生教育也逐渐成为医学教育面临的问题,其中医学课程全英文教学是目前各大高校面临的主要挑战之一~([1])。人体解剖学特点是结构复杂、名词术语多~([2])。传统多媒体教学模式使用大量文字描述,使学生感到难记忆、易遗忘,加之教学双方用专业术语交流难度大,增加了留学生对人体解剖学知识理解和掌握的难度~([3])。图     

河北省磁县食管癌高发现场生物样本库建立与管理

肿瘤组织生物样本在肿瘤的研究中扮演着重要的角色[1],生物样本库包括生物样本实体、生物分子及样本相关临床资料等综合资源,对于开展人类疾病预测、诊断、治疗研究具有重要的作用.转化医学的兴起和发展对生物样本资源的迫切需求与日俱增[2-3].在我国已有多家单位建立了不同规模、不同类型和不同管理与应用方式的组织和血液样本资源库[4-8].本文对磁县生物样本库的建设和管理进行介绍.     

病理档案的保存与其生物样本库属性的价值实现

正病理档案包括组织、细胞、体液样本,石蜡蜡块,各种类型的切片和纸质档案、数字化档案等,也是近年来陆续建立的疾病生物样本库的重要组成部分~([1-2])。病理档案资料的完整、安全保存对防止医疗差错、保障医疗安全、提升病理诊断质量、指导制定患者后续治疗方案及医学研究均具有重要的价值。随着《病理科建设与管理指南》等管理文件的发布和临床病理学科建设的日益规范,对于病理档案的长期保存也提出了一系列具体要求(如保存时间至少为15年等)。     

中国医药生物技术协会生物样本库标准(试行)

医学标准化、高质量的生物样本库是重大疾病(尤其肿瘤)基础与临床研究、临床诊治技术研发、药物研发、健康(预测预防)研究与产业化,即实现转化医学的最宝贵资源、最重要环节之一,毫无疑问也是当今生命科学原创性研究、生物医药产业自主创新体系中至关重要的环节与保证。2009年9月美国国家癌症研究所(NCI)开始筹划建立美国第一个国家级肿瘤生物样本库,Times更是将这个国家生物样本库列为2009年改变世界十大规划之八。我国疾病样本资源极其丰富,是任何一个国家所无法比拟的,我们必须抢占重大疾病生物样本库建设先机,以抢占我国在生命科学研究与生物医药产业领域国际制高点。然而,目前我国医院生物样本库建设尚处于初创阶段,存在无序、分散、封闭、缺乏标准化流程、缺乏质控体系与信息化管理、临床资料残缺不全(尤其治疗与随访资料)、伦理学与法律不健全等问题,严重降低了我国生命科学研究水平、阻碍了创新性新药研发与临床诊治技术开发进程。中国医药生物技术协会生物样本库分会于2010年组织全国范围内的组织生物样本库建设现状调研发现,我国各相关大学、研究院所与医院都非常重视生物样本库的建立与转化医学的研究,建设单位都急盼行业与国家标准的出台。为此,中...