血府逐瘀汤治疗子宫内膜异位症的网络药理学研究

目的以网络药理学方法探讨血府逐瘀汤治疗子宫内膜异位症可能的作用机制。方法通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)获取血府逐瘀汤各中药的主要活性成分,再利用Swiss Target Prediction数据库获取与主要活性成分相关性位于前15位的作用靶点。借助GeneCards筛选治疗子宫内膜异位症潜在的作用靶点,用Cytoscape 3.6.0软件建构血府逐瘀汤活性成分-子宫内膜异位症靶点-通路网络图;使用STRING数据库建构靶蛋白相互作用网络,用Cytoscape 3.6.0软件构建蛋白质相互作用网络图,根据Degree值筛选出前5位的靶蛋白,采用Systems Dock Web Site预测筛选出的靶蛋白与活性成分的结合活性。最后,利用g:profiler数据库对关键靶点进行KEGG通路富集分析和GO基因富集分析。结果从血府逐瘀汤中筛选出主要活性成分164个,与子宫内膜异位症相关的作用靶点105个,血府逐瘀汤治疗子宫内膜异位症主要涉及肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、雌激素信号转导通路等。结论血府逐瘀汤可作用于子宫内膜异位症的多个靶点,参与多条信号通路的调控,可为其药理机制研究提供新的方向。     

基于网络药理学探讨三棱-莪术药对治疗子宫内膜异位症的作用机制

目的:采用网络药理学的方法预测三棱-莪术药对治疗子宫内膜异位症（EMT）的主要活性成分、靶点及信号通路,探讨其作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索三棱-莪术药对的中药化学成分,以口服生物利用度（OB）≥30%、类药性（DL）≥0.18为阈值筛选潜在的活性化合物;通过TCMSP查询活性化合物对应的靶标;运用GeneCards和人类孟德尔遗传数据库（OMIM)预测疾病靶点;利用韦恩图找到活性成分靶点和疾病靶点的交集靶点;使用Cytoscape 3.7.2软件构建疾病-药物-有效成分-靶点蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络;采用String在线数据库和Cytoscape软件绘制交集靶点PPI网络;最后借助R软件和Bioconductor生物信息软件包进行基因本体（GO）功能富集分析及京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,并使用Cytoscape软件绘制靶点-信号通路网络图。结果:筛选得到三棱-莪术活性成分8个,对应靶点77个,EMT相关靶点1 600个,交集靶点34个。GO功能富集分析结果显示三棱-莪术药对可影响1 054个生物学过程、22个细胞组分和65个分子功能。KEGG通路富集分析得到91条通路,三棱-莪术药对治疗EMT主要与雌激素信号通路、IL-17信号通路、AGE-RAGE信号通路、甲状腺激素信号通路、P53信号通路等有关。结论:三棱-莪术药对治疗EMs具有多靶点、多途径、多通路的特点。     

宣白承气汤治疗支气管哮喘的网络药理学分析

目的 运用网络药理学方法探讨宣白承气汤治疗支气管哮喘的作用机制。方法 通过TCMSP数据库筛选宣白承气汤的活性成分及作用靶点,通过GeneCards数据库筛选支气管哮喘的疾病相关靶点,获取二者交集靶点,即宣白承气汤治疗支气管哮喘的潜在作用靶点。使用Cytoscape 3.7.2软件构建“疾病-药物-活性成分-靶点”网络,并分析网络中的核心活性成分;将交集靶点导入STRING数据库进行蛋白互作（PPI）网络分析,筛选出潜在核心靶点;运用R语言软件包对交集靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果 共筛选得到34个活性成分及64个潜在作用靶点（交集靶点）;获得香叶木素、羟基芫花素、泽兰黄醇素、α-菠菜甾醇等核心活性化合物,IL-6、MAPK3、MMP-9、PPARG和ICAM1等核心靶点;共筛选得到67条信号通路,关键通路包括神经活性配体-受体相互作用信号通路、c AMP信号通路、钙信号通路、TNF信号通路、Th17细胞分化、Th1/Th2细胞分化等。结论 宣白承气汤可能是通过香叶木素、羟基芫花素等关键活性成分,作用于IL-6、MAPK3、MMP-9等潜在核心靶点,调控神经活性配体-受体...     

基于网络药理学研究巴戟天抗抑郁的分子作用机制

目的运用网络药理学的方法探讨巴戟天治疗抑郁症的分子作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP数据库)筛选出巴戟天的活性成分和对应的作用靶点;利用GeneCard、OMIM等数据库筛选出抑郁症的潜在靶点;采用Cytoscape 3.6.1软件构建药物-成分-疾病-靶点的可视化网络;以STRING数据库对关建靶点构建蛋白互作网络分析;最后进行基因本体论(GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果从巴戟天中筛选出有效成分20个,得到可作用于抑郁症的靶点22个。GO分析富集得到65个生物学功能,KEGG通路分析富集得到48条信号通路。结论巴戟天通过多靶点、多通路发挥对抑郁症的治疗作用,其作用机制可能与胆碱能突触、神经活性配体-受体相互作用、甲状腺激素信号通路、PI3K-Akt信号通路、雌激素信号通路等相关。     

基于网络药理学的桃核承气汤治疗子宫内膜异位症的作用机制研究

目的：采用网络药理学方法探究桃核承气汤治疗子宫内膜异位症的成分、作用靶点和作用机制。方法：通过数据库收集桃核承气汤的活性成分,获得其靶点,结合子宫内膜异位症的靶点,构建“桃核承气汤成分靶点-子宫内膜异位症靶点”网络,分析获得共有靶点。通过与FDA药物靶点比较,分析共同靶点可能治疗的疾病,构建“关键靶点-疾病”网络。接着,将共同靶点进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路分析。最后将活性成分与关键靶点进行分子对接。结果：收集得到桃核承气汤114个活性成分及其236个靶点,401个子宫内膜异位症靶点,从中筛选出48个共同靶点。共同靶点与1 215个FDA药物靶点之间有29个关键靶点,与56种疾病相关联,其中包括子宫内膜异位症。GO分析表明,共同靶点与细胞外基质、细胞膜及DNA结合紧密相关,并涉及RNA酶和转录过程的正调节、ERK1/2通路正调控等多个生物过程。KEGG通路分析显示这些靶点参与类风湿性关节炎、TNF、雌激素、VEGF等63条信号通路调控。分子对接发现,8个桃核承气汤活性成分与5个共同靶点对接成功,其中甘草异黄酮和槲皮素与5个靶点都有较好的结合活性。结论：初步揭示了桃核承气汤治疗子宫内膜异位症的作用机制,有利于其深入地研究和开发。     

半夏泻心汤治疗功能性消化不良的网络药理学研究

目的：借助网络药理学平台,研究半夏泻心汤治疗功能性消化不良（FD）的作用靶点及作用机制。方法：基于中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）筛选半夏泻心汤的有效成分及作用靶点。通过GeneCards数据库提取FD相关基因。运用Cytoscape软件构建“活性成分-靶点-疾病”网络图,上传关键靶点至STRING平台建立蛋白质-蛋白质相互作用网络,最后利用ClueGO插件进行京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：半夏泻心汤有效活性成分共211种;关键靶点共70个,包括ALB、CASP3、VEGFA等;KEGG通路富集得到相关作用通路15类,主要涉及TNF信号通路、核因子κB信号通路、5-羟色胺（5-HT）信号通路、PI3K-AKT信号通路等。结论：调节炎症、胃动力、胃肠高敏性以及雌激素含量等途径是半夏泻心汤治疗FD的潜在作用机制,本研究为FD治疗方案的进一步改进提供了客观的参考方向。     

基于网络药理学的麻黄汤治疗新型冠状病毒肺炎潜在机制研究

目的:运用网络药理学探究麻黄汤治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在机制。方法:从TCMSP、TCM-ID数据库检索并筛选得到麻黄汤中的主要活性成分;通过检索Pub Chem数据库得到每种活性成分的SMILES结构并导入Swiss数据库得到预测靶点;采用CTD数据库筛选得到ARDS的已知治疗靶点,使用Uniprot数据库对所有靶点进行名称校正后,取靶点的交集部分导入String数据库筛选得到网络核心靶点;再采用Cyoscape 3.7.1软件构建药物-靶点-疾病网络进行数据可视化,通过CTD数据库进行GO的生物学过程富集分析和KEGG通路富集分析,预测其潜在作用机制。结果:从麻黄汤中筛选得到78个活性成分、24个潜在靶点;GO富集分析得到生物学过程809条;信号通路分析得到249条显著相关通路。结论:麻黄汤通过作用于多个靶点和多条信号通路,协同干预ARDS进程,从而实现对COVID-19的防治作用。     

白芷治疗白癜风作用机制的网络药理学分析

目的利用网络药理学方法研究白芷治疗白癜风的作用机制。方法以化合物的口服生物利用度（OB）≥ 30%、类药性（DL）≥0.18、肠上皮通透性（Caco-2）≥-0.4 为筛选指标,通过中药系统药理数据库与分析平 台（TCMSP）、TTD 数据库、Swiss Target Prediction 数据库以及人GeneCards 等数据库,筛选白芷的活性成分及 预测其治疗白癜风的潜在作用靶点。将活性成分和潜在作用靶点导入Cytoscape 软件构建白芷治疗白癜风的 “活性成分-作用靶点”网络。将潜在作用靶点录入STRING 平台构建靶点间的蛋白相互作用（PPI）网络。采用 DAVID 数据库对潜在作用靶点进行GO 富集分析和KEGG 通路富集分析。结果共筛选得到亚油酸乙酯、别 异欧前胡素、欧前胡素、异欧前胡素、8-氧甲基异欧前胡内酯、油酸乙酯、异紫花前胡内酯等21 个活性成 分,作用于40 个潜在作用靶点。PPI 网络分析得到CASP3、MAPK1、MAPK8、ESR1、MAPK14、AR 等6 个 核心作用靶点。潜在作用靶点参与了细胞凋亡、肽酰丝氨酸磷酸化、丝裂原活化蛋白激酶的激活等多种生物过 程;涉及细胞凋亡、肿瘤坏死因子信号通路、FOXO 信号通路、HIF-1 信号通路等多条信号通路。结论白芷 可能通过调控炎症、细胞凋亡、免疫功能、氧化应激等多个方面以发挥治疗白癜风的作用。     

基于网络药理学研究归肾丸对薄型子宫内膜大鼠的治疗作用机制

目的 该研究通过网络药理学的方法探讨归肾丸治疗薄型子宫内膜的关键核心靶点及相关信号通路等作用机制,进一步运用动物实验加以验证所得靶点,验证归肾丸对薄型子宫内膜的影响。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）数据库检索归肾丸中8味中药组成的有效化学成分、活性成分靶点和靶点简称;运用GeneCards数据库和在线人类孟德尔遗传数据库（OMIM）检索薄型子宫内膜相关的靶点基因;运用韦恩软件对归肾丸的药物靶点和薄型子宫内膜的疾病靶点进行取交集操作,将交集靶点导入STRING数据库及Cytoscape 3.7.2软件进行可视化分析获得“药物-疾病”的蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络;再将交集靶点输入Enrichr数据库和David数据库分别进行基因本体（GO）富集分析及京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析。以得到的可能核心关键靶点作为理论基础,建立大鼠薄型子宫内膜模型,归肾丸及雌激素干预21 d后,通过苏木素-伊红（HE）染色法观察大鼠的内膜厚度;通过蛋白免疫印迹法（Western blot）和实时荧光定量聚合酶链式反应（Real-time PCR）检测表皮生长因子受体（EGFR）,基质金属蛋白酶9（MMP9）,白细胞介素1β（IL-1β）,丝裂原激活蛋白激酶14（MAPK14）这4个核心关键靶点的蛋白和mRNA的表达水平。结果 通过韦恩软件共获得130个交集靶点;将130个交集靶点导入STRING数据库和Cytoscape软件中,得到包括33个节点,107条边的蛋PPI网络;DAVID 6.8数据库进行GO分析中的功能注释分析,共涉及167个生物过程（BP）,22个细胞组分（CC）,39个分子功能（MF）;DAVID 6.8数据库进行KEGG富集分析,与薄型子宫内膜相关的通路共34条;Western blot和Real-time PCR分别对6组大鼠子宫内膜组织中的EGFR,MMP9,IL-1β,MAPK14蛋白和mRNA的表达结果进行分析,归肾丸能够增强EGFR,MMP9,IL-1β,MAPK14蛋白和mRNA在薄型子宫内膜上的表达。结论 通过网络药理学的理论分析及动物实验的研究结果发现,归肾丸能够有效改善薄型子宫内膜的相关指标,并通过增加EGFR,MMP9,IL-1β,MAPK14蛋白和mRNA表达水平,促进内膜组织增殖,改善内膜偏薄的症状。     

基于网络药理学的百合抗抑郁作用机制研究

目的：采用网络药理学方法探究百合抗抑郁的作用机制。方法：通过检索中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、BATMAN等在线数据库并结合文献调研,构建百合成分数据库;通过SwissTargetPrediction平台预测各成分潜在作用靶点,构建“成分-靶点”网络;以抑郁症为背景从GeneCards、OMIM、DrugBank数据库获得疾病靶点;通过与百合各成分靶点比对获得百合及抑郁共有靶点;采用Cytoscape构建百合抗抑郁的“成分-靶点-通路”网络,并进行KEGG通路富集分析。结果：通过网络药理学方法筛选得到百合发挥抗抑郁作用的16个生物活性成分,这些成分可作用于88个抑郁症相关的靶标。其中百合皂苷可能是其抗抑郁主要活性成分。百合可通过多靶点（STAT3、AKT1、JUN、VEGFA、TNF、APP、MAPK14、ESR1、AR和HSP90AA1等）参与小胶质细胞激活或衰减及雌激素水平的调节发挥抗抑郁作用,其中晚期糖基化终末产物（AGE）/晚期糖基化终末产物受体（RAGE）信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶（PI3K）/蛋白激酶B（Akt）信号通路、鞘脂信号通路、C型凝集素受体信号通路、雌激素信号通路可能是其抗抑郁关键途径。结论：预测了百合抗抑郁的活性成分和潜在靶点,为百合及其复方抗抑郁机制研究提供参考。     

基于网络药理学探讨益肾清肝方逆转乳腺癌内分泌治疗耐药机制

目的 运用网络药理学及分子对接技术,探讨益肾清肝方逆转乳腺癌内分泌治疗耐药的活性成分、潜在靶点和作用机制。方法 通过TCMSP数据库筛选益肾清肝方的有效活性成分和作用靶点,利用GEO数据库检索获得乳腺癌内分泌治疗耐药的原始基因表达谱数据（GSE67916）以获取乳腺癌内分泌治疗耐药的相关靶基因,并与活性成分作用靶点相映射以得到共同靶点。通过STRING在线数据库构建益肾清肝方逆转乳腺癌内分泌治疗耐药PPI网络,并借助Cytoscape3.8.2软件筛选关键靶点;通过Metascape平台对关键靶点进行GO和KEGG富集分析,利用Cytoscape3.8.2软件构建靶点-活性成分-通路相互作用网络,对主要活性成分与关键靶点进行分子对接验证。结果 共筛选出益肾清肝方活性成分122个,与疾病的交集靶点30个,主要涉及ESR1、TP53、STAT3、MAPK1、PGR等。KEGG富集分析显示FoxO、P53、雌激素、PI3K-Akt等信号通路可能是益肾清肝方逆转乳腺癌内分泌治疗耐药的关键信号通路,由靶点-活性成分-通路网络得出β-谷甾醇、木犀草素、山柰酚、槲皮素、苦参碱等是发挥作用的主要活性成...     

基于网络药理学-分子对接技术研究柴胡治疗卒中后抑郁的药效物质基础及作用机制

目的：通过网络药理学和分子对接技术,探讨柴胡治疗卒中后抑郁（Post-stroke Depression, PSD）的潜在活性成分和可能的作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）和蛋白质序列数据库（Uniprot）筛选出柴胡主要活性成分及其靶点基因,并将目标蛋白名称标准化,通过GeneCards、OMIM数据库获取PSD靶点基因;对两者靶点取交集后采用STRING数据库构建柴胡治疗PSD的潜在靶点的蛋白质-蛋白质相互作用网络图;利用Cytoscape-v3.9.1软件进行核心靶点筛选;利用DAVID数据库对潜在靶点进行基因本体（GO）功能富集分析及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。最后,利用PyMol软件和AutoDockTools-1.5.7软件对柴胡主要活性成分与核心靶点使用分子对接技术绘制相应的分子对接图。结果：共筛选得到柴胡活性成分17个,去重后对应靶点175个,疾病靶点852个,经Venny数据库预测到疾病-药物交集靶点45个。GO功能富集分析结果显示共获得323个GO功能注释,KEGG通路富集分析结果显示获得106条信号通路。分子对接...     

参附注射液治疗糖尿病酮症酸中毒的网络药理学研究

目的 通过中药复方网络药理学方法，探究参附注射液（SFI）治疗糖尿病酮症酸中毒（DKA）的作用机制。方法 使用TCMSP数据库搜索并筛选出SFI中的活性成分及其作用靶点，利用GeneCards数据库得到DKA的治疗靶点，再将药物活性成分的作用靶点与疾病的治疗靶点分别经UniProt数据库统一为相应基因名。通过R软件进行统计分析，得到SFI治疗DKA的潜在靶点并绘制Venn图，对共同靶点进行富集分析并可视化。通过STRING数据库绘制潜在靶点的PPI网络。结果 筛选后得到了SFI的活性成分24个，包括人参皂苷RH2、人参二醇、人参皂苷-Rh4＿qt、山柰酚、穿心莲内酯、β-谷甾醇等，及其相应的104个作用靶点。得到DKA的治疗靶点817个，SFI治疗DKA的潜在靶点20个。GO富集分析的结果与胰岛素分泌、药物反应、信号传递、蛋白结合等生理活动相关。KEGG分析结果32个，其中包含以下8条信号通路：nod样受体信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、HIF-1信号通路、NF-κB信号通路、toll样受体信号通路、C型凝集素受体信号通路、IL-17信号通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路。...     

基于网络药理学与体外实验探讨川芎活性成分治疗缺血性脑卒中的作用机制

目的 运用网络药理学和体外细胞实验探究川芎活性成分治疗缺血性脑卒中的潜在作用机制。方法检索TCMSP数据库、Genecards数据库、Drugbank数据库等及相关文献,获得川芎活性成分、作用靶点及缺血性脑卒中相应疾病靶点,并将作用靶点与获得的疾病靶点的交集作为潜在靶点;利用String平台,对潜在靶点构建蛋白-蛋白互作（PPI）网络;采用R语言软件包对潜在靶点进行基因本体（Gene ontology,GO）功能及京都基因与基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）富集分析,然后使用Cytoscape软件分析其网络拓扑结构,筛选其核心靶点,并进行分子对接验证。在此基础上,通过CCK-8法检测川芎中的活性成分对缺氧缺糖/再灌注损伤细胞模型的作用,免疫印迹法（Western blot）验证川芎单体成分对相关靶点蛋白的影响。结果 川芎治疗缺血性脑卒中的主要潜在活性成分有16个;药物-疾病靶点有53个;涉及的信号通路主要有神经元神经活性配体-受体相互作用信号通路、钙离子信号通路、血管内皮生长因子信号通路等;关键核心靶点与活性成分藁...     

基于网络药理学的真武汤治疗糖尿病肾病的潜在机制探索

目的:运用网络药理学及生物信息学方法对真武汤治疗糖尿病肾病(DN)的潜在作用靶点进行研究,探索真武汤多成分-多靶点-多途径-多通路治疗DN的作用机制。方法:从中药系统药理学数据库(TCMSP)中筛选出真武汤中药物的活性成分,通过STITCH数据库预测作用靶点;同时应用GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库筛选DN疾病相关靶点,并对潜在作用靶点进行映射。利用STRING数据库进行蛋白互作网络分析,使用Cytoscape构建蛋白相互作用网络,采用DAVID数据库进行GO分析和KEGG信号通路富集分析。结果:筛选出真武汤中活性成分59个,预测潜在靶点95个;其中与DN疾病相关靶点54个;信号通路66条。结论:真武汤治疗DN具有多成分、多靶点、多途径、多通路的作用特点;其潜在作用机制极大可能是通过调控DN疾病发生及发展中的肿瘤坏死因子信号通路、结节样受体信号通路、NF-κB信号通路等过程对其进行干预及治疗。     

基于网络药理学及生物信息学研究益气化痰方治疗慢性阻塞性肺疾病的作用机制

目的基于网络药理学及生物信息学探究益气化痰方（黄芪、甘草、党参等）治疗慢性阻塞性肺疾病 （COPD）的可能作用机制。方法通过TCMSP 数据库、GEO 数据库及OMIM 数据库获取益气化痰方治疗COPD 的活性成分与潜在靶点;使用Cytoscape 3.7.2 软件,构建“中药-活性成分-潜在靶点-疾病”网络并对潜在靶 点进行PPI 网络拓扑分析;使用Cytoscape 3.7.2 软件对潜在靶点进行GO 功能富集分析;借助R 软件对潜在靶 点作KEGG 通路富集分析;最后,采用AutoDock Vina 1.5.6 软件将活性成分与潜在靶点进行分子对接。结 果筛选得到154 个益气化痰方活性成分及益气化痰方治疗COPD 的潜在靶点19 个。“中药-活性成分-潜在 靶点-疾病”网络及蛋白互作网络拓扑分析得出主要的潜在靶点有乙酰胆碱酯酶（ACHE）、α1A-肾上腺素受体 （ADRA1A）、对氧磷酶1（PON1）、白细胞介素6（IL-6）、白细胞介素10（IL-10）、表皮生长因子受体（EGFR） 等;GO 功能富集分析涉及过氧化氢代谢过程,活性氧生物合成过程等生物功能;KEGG 通路富集分析结果包 括低氧诱导因子1（HIF-1）信号通路、叉头盒O（FoxO）信号通路、Janus 激酶-转录激活因子（JAK-STAT）信号通 路等条目;分子对接结果显示,益气化痰方主要活性成分与潜在靶点均具有较好的结合活性,可形成较为稳定 的结合构象。结论益气化痰方在治疗COPD 方面具有多成分、多靶点、多通路的特点,可能通过调节炎症反 应、氧化应激和气道黏液分泌等机制发挥治疗作用。     

基于网络药理学和生物信息学探讨养血清脑颗粒治疗血管性痴呆的作用机制

目的基于网络药理学及生物信息学探讨养血清脑颗粒治疗血管性痴呆的作用机制。方法通过TCMSP、BATMAN-TCM数据库、GEO数据库、OMIM数据库等获取养血清脑颗粒治疗血管性痴呆的活性成分及潜在靶点;应用R语言绘制GEO数据集相关热图, 使用Cytoscape 3.8.2软件构建"中药-活性成分-潜在靶点"网络, 并采用CytoNCA插件进行PPI网络拓扑分析;使用Metascape网站对潜在靶点进行GO及KEGG富集分析;采用AutoDock Vina 1.5.6软件将活性成分与潜在核心靶点进行分子对接。结果筛选得到养血清脑颗粒活性成分135个及治疗血管性痴呆的潜在靶点186个。GO功能富集分析显示, 主要涉及蛋白激酶结合、转录因子结合等生物功能;KEGG通路富集分析结果主要富集于PI3K-Akt信号通路、AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路等;分子对接结果显示, 养血清脑颗粒主要活性成分与潜在作用靶点有良好的结合活性。结论养血清脑颗粒治疗血管性痴呆具有靶点多、通路广的特点, 可通过抑制神经细胞凋亡、减轻炎性反应等机制发挥治疗作用。     

佛手散治疗阿尔茨海默病分子机制的系统药理学研究

目的利用系统药理学方法和体外实验探究佛手散治疗阿尔茨海默病（Alzheimer disease,AD） 的分子 机制。方法利用TCMSP、TCM-Mesh、ETCM 和TCMID 数据库筛选佛手散的活性成分;利用TCMSP、ETCM 和PharmMapper 数据库对活性成分进行作用靶点预测。利用DisGeNet、GAD、CTD、TTD、HPO 和Orphadata 数据库筛选出AD 疾病相关靶点,并与佛手散活性成分作用靶点映射取交集,交集基因即为佛手散治疗AD 的 潜在作用靶点。通过String 数据库构建佛手散治疗AD 潜在作用靶点的蛋白互作（PPI） 网络;利用Cytoscape 3.6.1 软件构建“活性成分-潜在作用靶点”网络。通过WebSestalt 及David 分析平台对潜在作用靶点进行GO 功能及KEGG 通路富集分析,并进行体外实验验证。结果共筛选出佛手散52 个活性成分,预测得到185 个 共同靶点,最终确定31 个佛手散治疗AD 的潜在作用靶点。GO 功能富集分析结果表明,潜在作用靶点参与生 物调控、刺激反应、细胞间通讯等生物学过程;细胞膜、蛋白复合物、囊泡参与等细胞组分;蛋白结合、离子 结合、分子转导活性、水解酶活性等分子功能。KEGG 富集分析得到13 条信号通路。体外实验结果表明,佛 手散对谷氨酸钠诱导损伤的PC12 细胞有保护作用,可通过降低胞内Ca2+浓度和NO 含量达到降低细胞凋亡率 的效果。结论佛手散在治疗AD 方面具有多成分、多靶点、多途径的整体调控特点,可能与其通过豆甾醇、 Z-藁本内酯、藁本内酯、β-谷甾醇等活性成分调控5-羟色胺能突触通路、神经配体-受体交互作用通路、Ca2+ 信号通路以及cGMP-PKG 信号通路等多通路有关。     

苓桂术甘汤改善胰岛素抵抗的网络药理学分析

目的基于网络药理学探讨苓桂术甘汤改善胰岛素抵抗（IR）的分子机制。方法利用中药系统药理学分 析平台（TCMSP）获取苓桂术甘汤的活性成分及作用靶点, 通过OMIM、DisGenet、KEGG、TTD、GAD、 Drugbank 等数据库获取IR 疾病相关靶点,并利用VennDiagram 包获得二者的交集靶点即为苓桂术甘汤治疗IR 的潜在作用靶点。利用Cystoscape 3.6.0 软件及STRING 数据库分别构建中药-活性成分-潜在作用靶点网络、 苓桂术甘汤治疗IR 潜在作用靶点的蛋白相互作用（PPI）网络,并进行网络特异性分析,最后借助topGO、 GOplot 包对结果进行可视化处理,阐明可能的关键靶点和关键通路。采用org.Hs.eg.db、ClusterPofiler 包对苓桂 术甘汤治疗IR 的潜在作用靶点进行GO 功能及KEGG 通路富集分析。结果共筛选出苓桂术甘汤120 个活性 成分、73 个潜在作用靶点。分析得到槲皮素、柚皮素、山柰酚、芒柄花素、β-谷甾醇等关键活性成分,维甲 酸X 受体α（RXRA）、雌激素α 受体（ESR1）、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1（AKT1）等关键靶点。苓桂术甘汤对IR 的治疗作用与糖脂代谢、激素应答、转录过程和氧化应激等生物学过程相关,涉及晚期糖基化（AGERAGE） 信号通路、肿瘤坏死因子（TNF）信号通路、磷脂酰肌醇-3 激酶/蛋白激酶B（PI3K/AKT）信号通路等 多条通路。结论苓桂术甘汤可能主要通过槲皮素、柚皮素、山柰酚等活性成分调节糖脂代谢、肿瘤坏死因 子等信号通路发挥治疗IR 的作用。     

基于网络药理学探讨失笑散治疗子宫内膜异位症痛经的作用机制研究＊

目的 采用网络药理学方法探讨失笑散的功效物质基础对子宫内膜异位症痛经方面的作用机制。方法 依托TCMSP数据库检索失笑散中五灵脂,BATMAN-TCM数据库检索失笑散中蒲黄相关的所有化学成分,整合作用靶点预测（STPD）,进而构建化合物-靶点网络图;通过Gene Cards、DisGeNET数据库筛选子宫内膜异位症痛经相关的靶点,进而构建疾病靶点相互作用网络图;筛选药物靶点和疾病靶点相互作用图的核心靶点。采用DAVID数据库对失笑散作用靶点进行生物功能及代谢通路分析。结果 选择筛选出失笑散中的15个活性成分,共涉及225个作用靶点;通过网络拓扑特征评价筛选出与失笑散在子宫内膜异位症痛经方面作用的核心靶点41个,主要通过癌症通路、粘着斑、丝裂原活化蛋白激酶、细胞凋亡、NOD样受体、T细胞受体信号通路发挥对子宫内膜异位症痛经的治疗作用。结论 通过网络药理学验证了失笑散多成分、多靶点、整体调节的作用特点,预测了失笑散在子宫内膜异位症痛经中的主要作用机制,为其活性成分研究和实验研究提供理论依据。