牡丹叶治疗原发性痛经机制研究

目的:探究牡丹叶治疗原发性痛经的多成分、多靶点、多途径作用机制,尝试建立其可能的"药物-核心成分-关键靶标-主要通路"的网络药理研究模式。方法:针对牡丹叶中15个入血成分,利用中药整合药理学计算平台建立牡丹叶调节疾病的候选靶标网络图,再根据网络拓扑特征参数值筛选出牡丹叶治疗疾病的关键靶标名称及其所参与的通路,并最终绘制出"药物-核心成分-关键靶标-主要通路"多维网络关系图。结果:预测实验表明,15个入血成分的作用靶点约为299个,共涉及主要通路20条与原发性痛经相关。结论:牡丹叶可能通过作用于镇痛、解痉、抗炎、激素调节以及免疫调节等相关的蛋白靶点和通路起到治疗原发性痛经的作用。     

基于网络药理学探究红花注射液治疗原发性痛经的作用机制

目的 基于网络药理学探究红花注射液治疗原发性痛经的作用机制.方法 利用网络药理学技术筛选红花注射液治疗原发性痛经的潜在活性成分及靶点,构建"活性成分-潜在靶点"网络和潜在蛋白互作网络.筛选核心靶标,并对潜在靶点进行GO分析、KEGG通路富集及与临近基因的富集分析.建立原发性痛经大鼠模型,考察红花注射液干预后相关通路蛋白...     

基于网络药理学的莲子心中生物碱类成分发挥传统安神功效的药理机制研究

莲子心具有传统的安神功效,但是其作用机制不明确。该研究以莲子心传统安神功效与镇静催眠之间的关系为切入点,采用网络药理学方法研究预测莲子心中主要药效成分的镇静催眠药理作用机制,建立其"活性成分-靶标-通路-疾病"的网络药理学研究模式。针对莲子心中主要药效成分——生物碱类成分,采用Swiss Target Prediction服务器反向药效团匹配方法,TCMSP以及BATMAN-TCM服务器预测莲子心生物碱成分靶标,并通过Drug Bank,OMIM,TTD等数据库筛选出FDA批准的镇静催眠药物的靶标,筛选出两者的交集基因。通过对交集基因的GO及KEGG通路富集分析,采用Cytoscape 3. 7. 1软件构建莲子心"活性成分-靶标-通路-疾病"网络。网络分析表明,21个活性成分共涉及44个靶标,28条通路,预测出其中21个成分、35个靶标蛋白和15条通路与镇静催眠相关。莲子心可能通过作用于神经活性受体配体相互作用(neuroactive ligand-receptor interaction)通路、肌动蛋白细胞骨架(regulation of actin cytoskeleton)通路、钙信号通路(calcium signaling pathway)、胆碱能突触(cholinergic synapse)通路等通路相关的靶标起到镇静催眠的功效。该研究初步揭示了莲子心传统安神功效的潜在活性成分及其可能的作用机制,为进一步的药效物质基础和作用机制实验研究提供了理论依据。     

温经汤治疗原发性痛经的网络药理学作用机制＊

目的 本文将通过网络药理学结合分子对接对温经汤治疗原发性痛经作用机制进行预测。方法 利用TCMSP、TCMID及BATMAN-TCM数据库，收集温经汤活性成分并预测其作用靶标。通过GeneCards数据库、OMIM数据库筛选原发性痛经的靶标，并运用R软件获取疾病交集靶标，绘制韦恩图。运用Cytoscape软件构建温经汤治疗原发性痛经的成分-靶标网络图，通过STRING数据库构建PPI靶标蛋白互作网络，并进行核心靶标的GO功能富集分析及KEGG通路富集分析。通过Autodock Vina软件对药物活性成分与疾病核心靶标进行分子对接验证。结果 筛选得到温经汤治疗原发性痛经的124个活性成分和31个药物-疾病共同靶标，并推断其作用机制可能与介导HIF-1、TNF、PI3K-Akt等105条信号通路相关。槲皮素、山柰酚、豆甾醇等活性成分与PTGS1、ESR1、PGR等核心靶标对接结果良好。结论 温经汤活性成分可能通过发挥镇痛、抗炎、调节激素水平、缓解平滑肌痉挛和改善缺氧状态等药理作用来治疗原发性痛经。     

基于网络药理学研究复方钩藤降压片治疗高血压的作用机制

该文通过网络药理学研究预测复方钩藤降压片潜在的主要活性成分和作用靶点,探讨其多成分-多靶点-多通路的治疗高血压的可能作用机制。采用整合药理学平台(TCMIP)构建复方钩藤降压片成分靶标-疾病靶标网络,通过网络分析方法筛选关键节点,并在此基础上对关键节点进行通路富集分析,探索复方钩藤降压片治疗高血压可能参与的生物过程。靶点网络特征分析显示,所预测复方钩藤降压片中有35个活性成分与前列腺素内源性过氧化物合酶(PTGS1,PTGS2)、ATP合成酶(ATP1A1,ATP5A1,ATP5C1,ATP5B)等29个主要蛋白有很强的相互作用,富集到血压调节、G-蛋白耦合受体激活、心肌细胞肾上腺素能信号转导和血小板激活等15条通路,参与对高血压病理过程不同环节的调控。该研究初步揭示了复方钩藤降压片治疗高血压的潜在活性成分及其可能的作用机制,为进一步的药效物质基础和作用机制实验研究提供了理论依据。     

苦豆子中黄酮类成分的网络药理学研究

该实验运用网络药理学研究苦豆子黄酮类活性成分潜在的药理作用。借助反向药效团匹配的靶标识别服务平台PharmMapper预测苦豆子中11种黄酮类成分潜在作用靶点,通过DAVID和KEGG数据库进行通路注释分析,并采用Cytoscape软件构建苦豆子黄酮类"成分-靶点-通路"网络模型。结果表明苦豆子黄酮类活性成分通过调控INSR,KDR,MET等62个靶点,干预B细胞受体信号转导途径、胰岛素信号通路、神经营养因子信号通路等44条通路发挥抗炎、调节血糖等作用,这与该课题组前期以苦豆子黄酮类成分为基础进行的相关药理学研究所得结果相符合,初步证实了网络药理学的分析结果。该研究探讨了苦豆子黄酮类成分"多成分-多靶点-多通路"的作用机制,体现了中药多成分、多靶点、多途径的作用特点,为深入阐释苦豆子药用的相关机制及开发利用苦豆子资源提供了科学依据。     

用于妇科血瘀证原发性痛经的四物汤类方主要活性成分网络药理学分析

目的： 采用网络药理学方法对用于妇科血瘀证原发性痛经的四物汤类方主要活性成分的分子作用机制分析,探索其多成分-多靶点-多通路相关关系。方法： 针对类方中藁本内酯、正丁烯基酜内酯、川芎内酯、阿魏酸、没食子酸、芍药苷、焦地黄素A、梓醇等共有的活性成分及各方差异的代表性活性成分,依据PharmMapper数据库构建多成分-蛋白网络,获取的靶点信息利用Kyoto encyclopedia of genes and genomes （KEGG）通路数据库,采用Cytoscape软件建立四物汤类方成分-靶点-通路网络模型。结果与结论： 网络分析表明,在细胞过程中起重要作用的丝氨酸苏氨酸蛋白激酶是四物汤及其类方共有的潜在作用靶点群;四物汤主要活性成分涉及神经-内分泌-免疫等相关的51条通路,除与四物汤相同的通路外,少腹逐瘀汤偏重于脂质代谢;香附四物汤偏重于氨基酸代谢通路;桃红四物汤偏重于碳水化合物代谢;芩连四物汤偏重于ErbB,VEGF信号转导通路。四物汤及衍化方既有共同的作用靶点及通路,又各有偏重,体现了方剂多成分、多靶点、多途径作用模式,该研究为深入研究四物汤类方分子作用机制提供线索。     

基于网络药理学及分子对接探讨圣愈汤治疗原发性痛经的作用机制

目的:通过网络药理学和分子对接对圣愈汤治疗原发性痛经的作用机制进行预测。方法:利用TCMSP数据库收集圣愈汤的活性成分并预测其靶点,通过GeneCards与OMIM数据库,获取与原发性痛经相关的靶点。通过STRING数据库构建PPI蛋白互作网络。对核心靶点进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析。采用AutoDock Vina软件进行分子对接验证,并用PyMOL软件展示其相互作用。结果:筛选得到圣愈汤作用靶点216个,原发性痛经相关靶点共646个。圣愈汤治疗原发性痛经共52个活性成分,34个药物-疾病共同靶点,其作用机制可能与流体剪切应力与动脉粥样硬化、RAGE、HIF-1等96条信号通路相关。分子对接结果显示槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇与VEGFA、PPARG、HMOX1对接良好。结论:圣愈汤活性成分可以通过镇痛、抗炎、免疫调节等方面,通过多条信号通路,改善组织缺氧状况及血管微循环状态,达到治疗原发性痛经的作用。     

基于网络药理学方法研究补肾活血方治疗肾纤维化药效物质基础及分子作用机制*

目的:探讨补肾活血方治疗肾纤维化的药效物质基础及分子作用机制。方法:基于网络药理学理论框架,结合ADME性质筛选、靶点预测、网络构建及KEGG通路富集分析等方法进行研究。结果:补肾活血方中5味药材共包含491个化合物,其中具有良好的ADME性质的188个潜在活性成分中,共有136个活性成分及其对应的59个靶标与补肾活血方治疗肾纤维化密切相关。通过构建“药材-活性成分-靶标”网络及对网络进行分析,共获得19个关键化合物和5个关键靶标。此外,在对靶标进行KEGG通路分析时,共获得19条与补肾活血方治疗肾纤维化相关的通路,其中,PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、HIF-1信号通路为主要通路。结论:补肾活血方可通过多成分、多靶标及多通路的作用模式治疗肾纤维化。本研究为补肾活血方治疗肾纤维化的药效物质及潜在作用机制研究提供了一种新的研究思路,为该方剂的进一步升级改造及临床研究提供了必要的理论依据。     

“远志-石菖蒲”药对治疗阿尔茨海默病的作用机制研究

目的:研究"远志-石菖蒲"药对治疗阿尔茨海默病的网络药理学作用机制。方法:采用网络药理学方法筛选远志、石菖蒲中的活性成分,并获取药物活性成分靶点与阿尔茨海默病的靶标蛋白。构建药物活性成分-阿尔茨海默病靶标网络,对靶点进行基因本体(GO)富集分析及基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果:远志-石菖蒲药对中共筛选出有效成分12个,相关靶标40个;筛选得到阿尔茨海默病相关靶点14个;富集分析结果筛选通路得到KEGG分析5条,GO分析2条。通路分析结果结合参考文献表明,远志-石菖蒲治疗阿尔茨海默病主要通过PI3K-Akt信号通路、ErbB信号通路、雌激素信号通路等发挥作用。结论:"远志-石菖蒲"药对治疗阿尔茨海默病具有多成分、多靶点、多途径的特点。该研究结果可为该药对的临床应用和进一步应用提供参考,并为进一步研究其治疗阿尔茨海默氏病(AD)的机理奠定基础。     

基于网络药理学探讨黄芪-当归配伍活性成分改善血管内膜增生的作用机制

目的采用网络药理学方法探讨黄芪-当归配伍改善血管内膜增生的药效物质和可能的作用靶点。方法利用TCMSP数据库,获取黄芪-当归的有效成分,利用Pharmmaper数据库搜集活性成分所对应的靶标。通过Genecards、DigSeE和OMIM数据库,收集血管内膜增生相关的靶标,并与药物作用靶标相比较,筛选出共同部分,作为药物成分作用的预测靶标。利用STRING获取预测靶蛋白之间的相互关系,根据相互关系大小筛选出核心靶标。利用Cytoscape 3.6.1软件,绘制"药物-成分-疾病-靶标"网络图、核心靶标相互作用网络图。用R语言进行核心靶标的KEGG通路富集分析和GO生物过程分析。结果收集到黄芪-当归药对的20个活性成分,共得到193个潜在药物作用靶点、487个潜在疾病靶点,主要作用于EGFR、ESR1、ALB、MAPK8、PGR等多个靶标,涉及PI3K-Akt、MAPK、Ras等多条信号通路以发挥抗血管内膜增生的作用。结论基于网络药理学方法,初步探讨了黄芪-当归配伍改善血管内膜增生可能的靶标和信号通路,可为黄芪-当归配伍作用机制的研究提供参考。     

基于网络药理学研究策略解析痛泻要方治疗溃疡性结肠炎的分子作用机制

目的运用网络药理学研究策略对痛泻要方治疗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)的作用机制进行预测分析。方法利用BATMAN-TCM在线分析工具与DrugBank和OMIM数据库构建"成分-靶标-通路-疾病"网络及进行通路富集分析,阐释痛泻要方治疗UC的分子作用机制。结果筛选共得到72个痛泻要方活性成分,195个成分候选靶标与12条关键生物学通路,主要集中在炎症-免疫反应、神经调节作用、生长发育等生物学过程,其中JAK-STAT通路参与了多个生物学过程。经分析,Thymol、Lauric Acid、N-Methyltyramine等成分可能是作用于UC的关键活性成分。结论运用网络药理学研究策略对痛泻要方治疗UC的生物学过程进行靶标预测和网络构建,阐释了痛泻要方作用于UC的潜在分子机制,为痛泻要方治疗UC的活性成分药物筛选提供理论依据。     

基于系统药理学研究香附治疗原发性痛经的作用机制

目的:探讨香附治疗原发性痛经的作用机制。方法:通过系统药理学研究平台(TCMSP)挖掘香附治疗原发性痛经的潜在活性分子及相应的靶点,并利用Uniprot、DAVID等数据库筛选与原发性痛经相关的治疗靶点,将其映射到KEGG数据库,分析其潜在的作用机制。结果:应用系统药理学方法从香附中筛选出14种候选活性分子及83种与原发性痛经发生、发展密切相关的靶点蛋白。利用Cytoscape软件构建香附的活性分子—靶点网络,其中节点数97个,药物分子与靶点的相互作用关系187条;从KEGG数据库中获得的与原发性痛经相关的通路有24条,其中大部分靶点蛋白集中分布在VEGF信号通路、HIF-1信号通路、Toll样受体信号通路。结论:香附以多分子、多靶点、多通路的方式治疗原发性痛经,靶点蛋白映射的多条通路主要涉及调节原发性痛经患者体内炎症因子、前列腺素合成、新生血管的形成等过程。     

基于网络药理学的化痰通脉饮“半夏-当归”药对抗多囊卵巢综合征作用机制的研究

目的通过网络药理学的研究方法,研究半夏-当归药对治疗多囊卵巢综合症(PCOS)的作用机制,构建其"中药成分-核心靶点-通路"的分子调控网络,探讨化痰通脉饮治疗PCOS"多成分-多靶点-多通路"的作用机制。方法从中药系统药理学分析平台(TCMSP)结合文献检索中寻找与化痰通脉饮"半夏-当归"药对中可能的药效成分并进行成分打靶;采用Pubchem数据库确定活性成分的化学结构,并基于结构相似度模型的靶标识别服务平台(SwissTargetPrediction)分析预测潜在作用靶点,通过生物学信息注释数据库(DAVID)对靶点基因功能及代谢通路进行富集分析,采用网络可视化工具Cytoscape软件构建"中药成分-核心靶点-通路"网络模型。结果通过筛选和文献检索补充,在中药半夏中共筛选出潜在活性成分26个,当归活性成分14个,二者活性成分的作用靶点分别为169个和56个。其中作用于PCOS的核心靶点有PTGS2、PGR、ESR1、NOS3等。结论该研究从网络药理学角度预测了化痰通脉饮中半夏-当归药对分别发挥燥湿化痰、养血活血作用的主要活性成分和其协同增效药理作用机制,为进一步探讨其作用机制奠定了基础。     

基于网络药理学的苓桂术甘汤治疗阿尔茨海默病的潜在作用机制研究

目的利用网络药理学技术研究苓桂术甘汤治疗阿尔茨海默病(AD)的潜在作用机制。方法利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)、Swiss、SuperPred和Stitch数据库寻找与苓桂术甘汤中4味中药相关的化学成分及其作用靶点,并以口服利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18为阈值对化合物进行筛选,再通过文献查找加以补充;通过OMIM、TTD、GAD、Pharm Gkb数据库获取与AD疾病相关的靶标,并进一步筛选得到苓桂术甘汤治疗AD的潜在作用靶点;采用DAVID6.8数据库对相关潜在作用靶点进行GO分析及KEGG代谢通路富集分析;利用Cytoscape软件构建"单味药-活性成分-作用靶点"相互作用网络并进行度值和中介度分析,确认可能的关键靶点和关键通路。结果在苓桂术甘汤中,共筛选出126个与AD相关的潜在活性成分和120个潜在作用靶点;GO生物功能分析共包含565条富集结果,其中生物过程396条,分子功能121条,细胞组成48条,主要涉及蛋白结合、细胞、氧化还原过程等;KEGG富集得到67条代谢通路,主要包括神经活性配体-受体相互作用通路、癌症通路、5-羟色胺能突触通路和钙信号通路等。结论网络药理学研究结果揭示了苓桂术甘汤治疗AD的多成分、多靶点、多途径的作用特点,并预测了其可能的活性成分、作用通路和关键靶点,为其药效物质基础和作用机制研究提供了理论基础。     

基于中药整合药理学平台分析黄连汤治疗胃炎的作用机制

目的:探讨黄连汤治疗胃炎的功效物质基础和可能的作用机制,为该复方的后续应用与研发提供参考。方法:利用中药整合药理学平台预测黄连汤治疗胃炎的主要活性成分和作用靶点,构建黄连汤成分靶标-疾病靶标网络,筛选关键节点进行通路富集分析,探索黄连汤多成分-多靶点-多通路治疗胃炎的可能作用机制。结果:黄连汤预测的175个活性成分与胃炎相关的538个关键靶标相互作用,通过趋化因子、雌激素和T细胞受体等信号通路参与幽门螺旋杆菌感染侵润、胃黏膜损伤、胃黏膜萎缩等胃炎发生与发展过程中病理环节的调控。结论:该研究初步揭示了黄连汤治疗胃炎的潜在活性成分及其可能的作用机制,为该方进一步的药效物质基础和作用机制实验研究提供了理论依据。     

探讨中药剂肝复乐治疗肝硬化基于网络药理学的作用机制

目的 通过网络药理学研究预测中药剂肝复乐的主要活性成分的作用靶点与通路,建立其“化合物-靶点-通路”的网络模型。方法 利用网络药理学,获得肝复乐中抗肝硬化的活性成分及其相关靶点。通过与MalaCards、OMIM数据库中肝硬化相关基因以及从基因芯片筛选比对,选择既关键的靶点基因进行后续分析,靶点经KEGG通路富集分析后,使用Cytoscape软件构建肝复乐“化合物-靶点-通路-疾病”网络。结果 对该网络进行分析发现,预测出60个化合物、16个靶点蛋白和15条通路与肝硬化相关。中药方剂肝复乐可能通过作用于炎症、物质代谢、肿瘤发生相关的蛋白/基因靶点及通路,起到治疗肝硬化的作用。结论 该研究初步揭示了中药剂肝复乐治疗肝硬化的活性成分及其可能的作用机制,为以后的药效物质基础和作用机制实验研究提供了理论依据。     

基于网络药理学的六经头痛片治疗偏头痛的作用机制探讨

目的对六经头痛片进行网络药理学研究,探究其治疗偏头痛的作用机制。方法选取六经头痛片中的18个入血及活性成分为研究对象,依据反向药效团匹配方法预测化合物的作用靶点,借助MAS 3.0生物分子功能软件及京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库获取相关通路并进行关联分析,最后利用Cytoscape软件构建六经头痛片"化合物-靶点-通路-疾病"的网络药理图。结果实验表明,18个化合物可通过72个作用靶标作用于88条通路,其中36个蛋白靶点和22条通路与偏头痛相关。结论六经头痛片可能通过干预与血管内稳态、炎症、神经中枢、免疫及激素调节等相关通路,起到疏风活络、利窍止痛的作用从而治疗偏头痛。     

基于网络药理学探讨桔梗-苦杏仁与肺癌相关分子机制

目的:基于网络药理学方法筛选桔梗-苦杏仁药对中的活性成分,预测治疗癌症的作用靶点及信号通路,构建多成分-多靶点-多通路的相互作用网络,进一步探究其治疗肺癌的可能作用机制。方法:通过中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)以及文献查阅,检索并收集桔梗-苦杏仁的活性成分及其对应的靶标。利用UniProt数据库和Genecards数据库获得桔梗-苦杏仁治疗肺癌的潜在靶标基因。用Cytoscape 3.6.0软件构建"成分-靶标"网络。结合String数据库及Cytoscape软件中的Generate style from statistics工具,构建蛋白质相互作用网络。通过Systems Dock Web Site网络服务器与桔梗-苦杏仁的活性成分进行分子对接。利用功能注释生物信息学分析平台(DAVID)数据库,对桔梗-苦杏仁的作用靶标进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析和基因本体(GO)分类富集分析。结果:共筛选得到桔梗-苦杏仁的14个活性成分,包括acacetin,cis-dihydroquercetin,spinasterol,licochalcone B,luteolin等,和103个作用靶标,包括诱导型一氧化氮合酶蛋白(NOS2),环加氧酶1蛋白(PTGS1),雄激素受体(AR),环加氧酶2蛋白(PTGS2),二肽基肽酶4(DPP4)等,主要涉及prostate cancer,small cell lung cancer,hepatitis B,T cell receptor signaling pathway等信号通路。结论:该研究基于网络药理学的方法预测了桔梗-苦杏仁治疗肺癌的可能的作用机制,为后续的深入研究提供了方向。     

基于网络药理学的小陷胸汤治疗冠心病作用机制

目的:通过网络药理学方法预测小陷胸汤治疗冠心病靶标并分析其作用特征,构建"成分-靶标-通路"网络药理模型,揭示小陷胸汤治疗冠心病的潜在通路机制。方法:中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获得药物有效成分,Swiss靶标预测数据库(Swiss Target Prediction)反向药效团匹配法预测"小陷胸汤-冠心病"靶标;治疗靶标数据库(TTD),Drugbank,疾病-基因网数据库(Dis Ge NET)取美国食品和药物管理局(FDA)批准的冠心病并集靶标。韦恩图获得相关交集,GEO2R在线分析靶标特征,Funrich version 3软件分析生物过程,运用插件Reactome FI对靶标通路富集分析,采用Cytoscape软件构建"成分-靶标-通路"网络。结果:网络分析表明,小陷胸汤治疗冠心病是通过25个治疗成分调控24个靶标,通过GEO2R在线多个基因芯片分析,靶标存在上下调差异,上调靶标11个,下调靶标13个,作用于4大生物过程,21条具体通路。结论:小陷胸汤治疗冠心病的机制可能是通过黄连生物碱类和黄酮类、半夏的核苷类和有机酸类、瓜蒌的豆甾醇类和黄酮类参与基因表达、新陈代谢、蛋白质代谢等生物过程,调节相关靶蛋白的基因表达,调控基因转录通路、生物氧化反应和脂类和脂蛋白代谢、胰岛素样生长因子结合蛋白(IGFBPs)对胰岛素样生长因子(IGF)转运和摄取、细胞外基质的降解等信号通路。