恒温扩增芯片法在儿童下呼吸道感染性疾病中的应用价值评估

目的：评价恒温扩增芯片法在儿童下呼吸道感染病原体检测中的应用价值。方法：纳入2017年1~7月于首都医科大学附属北京儿童医院住院的下呼吸道感染患儿,入院当天采集痰液等分泌物标本,通过恒温扩增芯片法（芯片法）检测13种常见病原体,比较芯片法与痰培养和血清学方法的检出率。 结果：研究期间应用恒温扩增芯片法共检测230例下呼吸道感染住院患儿,共检出182例(79.1%)病原阳性。单一病原感染77例(33.5%),混合感染105例(45.6%)。芯片法检出的主要病原菌为耐甲氧西林葡萄球菌(33.8%)、流感嗜血杆菌(27.8%)和肺炎链球菌(22.6%),芯片法对流感嗜血杆菌、肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌和肺炎克雷伯菌的阳性检出率明显高于培养法。两种方法对于铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌和肺炎支原体等的检出率差异无统计学意义。结论对于儿童下呼吸道感染病原体检测,芯片法操作简便、快速,可同时检测13种病原体,且病原体检出率明显高于培养法。     

儿童社区获得性肺炎病原微生物分布特点分析

目的：了解儿童社区获得性肺炎（CAP）病原微生物分布规律,为临床诊断和合理用药提供依据。方法：1560例年龄在1个月至9岁间的CAP患儿于入院2 h内、抗感染药物治疗前分别采集呼吸道分泌物和静脉血进行多病原联合检测。免疫荧光法检测鼻咽拭子标本中呼吸道病毒抗原,痰液用于行细菌培养,ELISA法检测静脉血中肺炎支原体及肺炎衣原体IgM。结果：在1560例CAP患儿中,痰培养细菌579株,其中革兰阳性菌213株（36.8%）,革兰阴性菌366株（63.2%）;检出前5位的细菌包括流感嗜血杆菌（7.50%）、肺炎链球菌（6.73%）、金黄色葡萄球菌（6.35%）、卡他莫拉菌（5.19%）和大肠埃希氏菌（3.46%）,前5位细菌中产酶菌占检出全部细菌的3.3%。其他病原体感染中,呼吸道合胞病毒感染率最高,为12.88%,其次为肺炎支原体（7.88%）和肺炎衣原体（8.91%）。混合感染严重,其中呼吸道合胞病毒与流感嗜血杆菌混合感染最为常见。多数病原微生物在1岁以下患儿中的感染率高于1岁以上患儿。结论：流感嗜血杆菌、呼吸道合胞病毒、肺炎支原体、肺炎衣原体为儿童CAP的主要病原体,多数病原微生物在1岁以下患儿中感染率高于1岁以上患儿,多种病原菌混合感染率高。     

142例百日咳患儿合并其他呼吸道病原体情况分析

目的 探讨临床中百日咳患儿合并其他呼吸道病原体情况.方法 采用回顾性分析方法对2011年1月至2013年12月在深圳市儿童医院住院的142例百日咳婴幼儿进行呼吸道病原学分析.采用气管插管结合负压吸引方法采集痰液标本,提取细菌DNA后,经双重PCR方法检测百日咳杆菌.痰液标本接种于血平板、麦康凯平板及嗜血巧克力平板进行其他病原的培养.部分呼吸道病毒采用PCR方法检测.结果 142例百日咳杆菌PCR检测阳性患儿中,有40例患儿诊断合并肺炎,其中≤3月龄组和3~6月龄组除感染百日咳杆菌外,合并的其他呼吸道病原体以肺炎克雷伯杆菌较为多见,6~19月龄组合并的其他呼吸道病原体以肺炎支原体较为常见.117例进行了痰培养.培养结果显示正常菌群33例;阳性84例,其中肺炎克雷伯菌33株,金黄色葡萄球菌12株,大肠埃希菌9株,鲍曼不动杆菌、副流感嗜血杆菌各7株,流感嗜血杆菌4株,肺炎链球菌、产气肠杆菌、表皮葡萄球菌各3株,溶血葡萄球菌、弗氏柠檬酸杆菌、卡他莫拉菌各1株.24例患儿合并肺炎支原体、巨细胞病毒、呼吸道合胞病毒、EB病毒.结论 百日咳患儿较易合并其他呼吸道病原体,且以肺炎克雷伯菌多见.百日咳合并肺炎患儿中,小于6月龄组以合并肺炎克雷伯菌为主,6~19月龄组以合并肺炎支原体为主.     

2016~2018年儿童呼吸道感染病原菌谱与耐药监测

目的 了解儿童呼吸道感染的病原菌种类、分布特点和耐药情况，为临床提供病原学诊断及合理使用抗菌药物的依据。方法 选取2016年1月至2018年12月因呼吸道感染就诊的15 047例患儿为研究对象，采集患儿痰标本送检，通过Phoenix-100全自动微生物鉴定药敏系统对分离的病原菌进行鉴定和药敏分析。结果 从17 174份送检的痰标本中检出阳性标本2 395份，阳性率为13.95%；共分离出2 584株病原菌，其中革兰阴性菌1 577株（61.03%），革兰阳性菌967株（37.42%），真菌40株（1.55%）。最常见的病原菌依次为流感嗜血杆菌（33.90%）、肺炎链球菌（33.55%）、卡他莫拉菌（19.20%）和金黄色葡萄球菌（3.64%）。2 331例感染阳性患儿中有251例混合感染，以流感嗜血杆菌合并肺炎链球菌感染发生率最高。病原菌检出率以冬春季较高，夏秋季较低（P < 0.05）。各年龄组患儿病原菌检出率比较差异有统计学意义（P < 0.05），其中1个月~ < 1岁组患儿病原菌检出率最高。肺炎链球菌和金黄色葡萄球菌对万古霉素、利奈唑胺和替考拉宁敏感率均为100%，流感嗜血杆菌除对氨苄西林、复方新诺明和头孢呋辛敏感率较低，对其他药物敏感率均较高。结论 儿童呼吸道感染病原菌以流感嗜血杆菌、肺炎链球菌和卡他莫拉菌为主，且常见混合型感染。不同季节、不同年龄段病原菌检出率不同。不同病原菌耐药性有不同特点，临床应依据药敏结果合理选用抗生素。     

儿童百日咳综合征491例病原学分析

目的　了解儿童百日咳综合征的病原种类,为临床诊治提供依据。方法　对重庆医科大学附属儿童医院2016年9月1日至2017年8月31日住院的491例诊断百日咳综合征患儿的病原学进行回顾性分析。结果　491例中,病原检测阳性患儿共369例,阳性率75.15%。（1）病毒检出阳性239例（48.7%）,常见病毒分别为呼吸道合胞病毒163例（68.2%）、副流感病毒-Ⅲ 66例（27.62%）。（2）细菌检出阳性169例（34.4%）,最常见细菌为流感嗜血杆菌（71例,42.01%）。（3）检出沙眼衣原体36例（7.3%）,肺炎支原体25例（5.1%）。（4）混合感染共104例（21.18%）,病毒合并细菌感染最常见,为62例（59.62%）,其中呼吸道合胞病毒合并细菌感染率最高（42例,39.62%）。结论　百日咳综合征由多种病原感染所致,以病毒感染为主,病毒中呼吸道合胞病毒感染居首位,其次是副流感病毒-Ⅲ;细菌感染以流感嗜血杆菌为主;沙眼衣原体主要集中在＜3月龄患儿;混合感染以病毒并细菌感染检出率较高。     

3岁以下肺炎住院患儿的病原学研究

目的：肺炎是小儿时期,尤其是3岁以下儿童的常见疾病,有较高的发病率和病死率。在发展中国家,病原菌以细菌感染相对多见,而病原菌的分布则随着年代不同而发生变化。该研究的目的是了解3岁以下肺炎住院患儿的深部痰液的病原学种类及分布,以期更好的指导临床用药。方法：对苏州儿童医院2006年3月至2007年1月 316 例肺炎患儿进行呼吸道深部吸痰,对其进行常见病原学检测,并分析比较。结果：316例患儿痰标本中,病原体检出率为60.8%,其中细菌检出率为51.3%,病毒总检出率为6.3%。细菌、病毒混合检出率为3.5%;细菌感染中以流感嗜血杆菌（14.6%）和肺炎链球菌（10.1%）为主;病毒感染则以呼吸道合胞病毒（4.0%）和腺病毒（3.6%）为主。结论：苏州地区3岁以下儿童的肺炎主要是由细菌感染引起的,以革兰阴性杆菌为主,流感杆菌是主要的致病菌,其次是肺炎链球菌。     

社区获得性小儿肺炎病原体组成现状及临床探讨

目的了解社区获得性小儿肺炎病原体组成现状，探讨其诊断方法及耐药状况。方法（1）对符合肺炎诊断标准的772例患儿，取患儿气道深部分泌物培养，行药敏试验。（2）应用间接免疫荧光法联检试剂，同时检测四种非典型病原体：肺炎支原体（MP）、嗜肺军团菌（Lp）、肺炎衣原体（Cpn）、Q热立克次氏体。（3）收集双份血清进行抗体（IgM）检测。结果（1）细菌培养460例，检出病原菌194株，其中革兰阳性球菌64株，革兰阴性杆菌130株。检出致病菌排列前4位的分别是大肠埃希菌，溶血链球菌、肺炎链球菌、肺炎克雷伯菌。（2）溶血链球菌、肺炎链球菌对青霉素、红霉素类抗生素耐药率达70％；大肠埃希杆菌、肺炎克雷伯菌对泰能、环丙沙星等敏感，对常用抗生素耐药。（3）772例患儿中，非典型病原体感染212例，感染率27．46％，其中MP肺炎125例，占16．19％；Lp感染100例，占12．95％；Cpn感染13例，占1．68％；Q热立克次氏体感染3例，占0．39％。（4）双份血清抗体（IgM）检测59份，血清抗体滴度4倍增高50例。（5）多重感染41例，占5．3％。结论肺炎患儿革兰阴性杆菌感染占优势。病原菌对儿科常用抗生素耐药。四种非典型病原体感染约占昆明地区小儿下呼吸道感染的1／3，其中MP、Lp感染居前两位。     

急性呼吸道感染住院患儿细菌病原学分析

目的探讨苏州地区住院儿童急性呼吸道感染细菌病原学分布。方法对2005年11月至2007年10月在苏州大学附属儿童医院住院治疗的所有急性呼吸道感染患儿,常规进行深部痰培养,进行病原学分析。结果急性呼吸道感染患儿共3069例,其中881例分离到1种或1种以上致病菌,阳性率为28.7%,最常见的病原菌为肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、金黄色葡萄球菌和卡他莫拉菌,阳性率分别为10.1%,4.3%,3.7%和2.7%,连续两年病原总阳性率呈增长趋势。总病原阳性率以1个月至1岁最高,为32.8%。流感嗜血杆菌、卡他莫拉菌、大肠埃希菌、肺炎克雷伯杆菌和真菌检出率以低龄组为主。卡他莫拉菌、流感嗜血杆菌和铜绿假单胞菌四季检出率不同。流感嗜血杆菌男性检出率高于女性。结论肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、金黄色葡萄球菌和卡他莫拉菌是小儿急性呼吸道感染常见致病菌。     

儿童社区获得性肺炎1 613例病原学特点分析

目的 了解重庆地区儿童社区获得性肺炎(CAP)患儿病原分布及特点。方法 选取2014年1~12月住院治疗的1 613例CAP患儿为研究对象,采集患儿的鼻咽抽吸物进行细菌培养、呼吸道7种病毒及肺炎支原体检测,并对其特点进行分析。结果 1 613例患儿中,有810例细菌检出阳性,阳性率为50.22%,其中检出副流感嗜血杆菌346株(40.8%),肺炎链球菌252株(29.7%),卡他莫拉菌62株(7.3%);病毒阳性者559例,阳性率为34.66%,其中检出呼吸道合胞病毒342株(58.3%),副流感病毒3 102株(17.4%),腺病毒84株(14.3%);MP阳性者481例,阳性率为29.82%;病原体混合感染检出519例(32.18%),以细菌、病毒混合检出为主(47.4%)。结论 副流感嗜血杆菌为重庆地区CAP住院患儿感染的首位细菌病原,RSV为首位病毒病原,支原体感染亦较为普遍,混合感染以细菌、病毒混合感染为主。     

培养与聚合酶链反应联合进行住院患儿肺炎细菌病原学检测

目的 探讨细菌培养与病原特异性DNA联合检测住院患儿肺炎细菌病原的应用价值.方法对187例肺炎患儿的深部呼吸道吸引物进行肺炎链球菌、流感嗜血杆菌选择性培养和普通培养,并且对同一标本采用靶序列富集多重PCR(Tem-PCB)扩增结合Luminex液态芯片检测平台进行定量测定,检测肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯杆菌、大肠杆菌、嗜肺军团菌、绿脓杆菌、鲍曼不动杆菌等14种病原菌的特异性DNA.结果细菌培养的总检出率为40.1%(75/187,含3例检出2种病原菌),病原菌依次为流感嗜血杆菌17.1%、大肠杆菌8.6%、肺炎克雷伯杆菌6.4%、金黄色葡萄球菌4.8%、肺炎链球菌3.7%、绿脓杆菌1.6%、鲍曼不动杆菌1.1%和阴沟肠杆菌1.1%.以细菌培养或Tem-PCR任一阳性为标准,联合检测的总检出率为78.6%(147/187),病原菌依次为流感嗜血杆菌28.9%、肺炎链球菌19.3%、大肠杆菌8.6%、肺炎克雷伯杆菌6.4%、金黄色葡萄球菌5.9%、鲍曼不动杆菌5.9%、绿脓杆菌2.7%和阴沟肠杆菌1.1%.结论 Tem-PCR能提高流感嗜血杆菌、肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌和鲍曼不动杆菌的检出例数.细菌培养与病原特异性DNA联合检测应用能显著提高肺炎病原的检出率,可能更真实地反映肺炎的细菌病原学情况.     

Young Malaysian children with lower respiratory tract infections show low incidence of chlamydial infection

Objective: The incidence of Chlamydia pneumoniae and Chlamydia trachomatis infection was studied among infants and young children admitted to hospital for the management of lower respiratory tract infections, over a 12 month period.
Methodology: Respiratory secretions were examined for chlamydiae by cell culture, enzyme-linked immunosorbent assay and polymerase chain reaction-enzyme immunoassay. Sera were tested by micro-immunofluorescence for chlamydial IgG, IgM and IgA. Other bacterial and viral pathogens were also looked for by standard cultural and serological methods.
Results: Of 87 patients aged 2 months-3 years, an aetiologic diagnosis was made in 41 (47.1%). C. pneumoniae and C. trachomatis were each detected in 1 (1.2%) of the patients. Among common bacterial pathogens, Haemophilus influenzae (13.8%) and Streptococcus pneumoniae (8.1%) were the most frequently identified. Respiratory viruses and elevated Mycoplasma pneumoniae antibodies were found in 10.3% and 9.1% of patients, respectively.
Conclusion: Chlamydiae are infrequent causes of community-acquired acute lower respiratory tract infections in infants and very young children in Malaysia.     

Etiology of acute lower respiratory tract infections in Gambian children: II. Acute lower respiratory tract infection in children ages one to nine years presenting at the hospital

Seventy-four children ages 1 to 9 years hospitalized because of severe pneumonia were investigated using blood cultures, lung aspirates, nasopharyngeal aspirates, serology and antigen detection procedures. A bacterial infection was identified in 57 (77%), a viral infection was seen in 25 (34%) and 18 (24%) had mixed viral-bacterial infections. The bacterial pathogens most frequently identified were Streptococcus pneumoniae and Haemophilus influenzae found in 61 and 15% of patients, respectively. The viral pathogen most frequently recovered was respiratory syncytial virus (12%). Evidence of Chlamydia pneumoniae strain TWAR and Mycoplasma pneumoniae infection was found in 12 and 4% of cases, respectively. Overall a potential pathogen was identified in 60 (81%) children, with evidence of polymicrobial infection in 30 cases (40.5%). The study provides information on the relative role of different infectious agents in the etiology of severe pneumonia in children in a developing country.     

苏州地区14994例儿童呼吸道感染细菌病原学特点

目的 了解儿童呼吸道感染的细菌病原学特点。方法 收集2005 年11 月至2014 年10 月连续9 年因呼吸道感染入住苏州大学附属儿童医院的14 994 例儿童的病例资料进行回顾性分析。结果 14 994 份呼吸道感染患儿的痰标本中,细菌培养阳性3 947 份,总阳性检出率为26.32%。第1 位细菌病原为肺炎链球菌(12.79%),其次为流感嗜血杆菌(5.02%)、卡他莫拉菌(2.91%)。在不同年份、不同季节、不同年龄段儿童细菌检出率差异有统计学意义(P<0.01)。入院前未使用过抗菌药物的患儿痰细菌培养阳性率高于使用过抗菌药物的患儿(P<0.01)。院外病程<1 个月组、1~3 个月组及>3 个月组患儿痰培养细菌检出率差异有统计学意义(P<0.05)。肺炎链球菌、卡他莫拉菌、鲍曼不动杆菌的阳性检出率随病程的延长呈上升趋势(P<0.05)。结论 肺炎链球菌是引起儿童呼吸道感染的最常见细菌病原,其次为流感嗜血杆菌和卡他莫拉菌。各种细菌在不同的年份、不同的季节、不同的年龄阳性检出率有差异。疾病病程与院外抗菌药物使用对细菌的阳性检出率有影响。     

北京地区儿童急性下呼吸道感染的病原学研究

目的 探讨儿童急性下呼吸道感染（ＡＬＲＩ）的病原学。方法 采用血培养及常用的抗原、抗体检测方法检测１０２例ＡＬＲＩ患儿常见的致病原。结果 ⑴１０２例儿童ＡＬＲＩ中,明确病原诊断的有６０例（５８．８％）。⑵在检出病原的６０例中,单纯细胞菌感染１５例（２５％）,单纯病毒感染１９例（３２％）,单纯支原体感染８例（１３％）,单纯衣原体感染１例（２％）,混合感染１７例（２８％）。⑶检出的主要病原：１０２例Ａ     

2006至2009年复旦大学附属儿科医院呼吸道感染患儿5种常见细菌构成比和耐药性分析

目的 了解复旦大学附属儿科医院4年中呼吸道感染患儿呼吸道标本中化脓性链球菌、肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、流感嗜血杆菌和卡他莫拉菌耐药率变化。方法 以2006至2009年在复旦大学附属儿科医院诊断为呼吸道感染的患儿为研究对象,采集咽拭子或痰标本行细菌培养。细菌鉴定采用NCCLS/CLSI 2006至2009年标准及英国BSAC标准。采用琼脂扩散法（KB）对5种常见细菌进行药物敏感实验,结果参照CLSI 2006至2009年标准,肺炎链球菌青霉素药物敏感实验采用E-test检测。结果 2006至2009年呼吸道标本中共分离到细菌3 169株,其中化脓性链球菌1 225株、肺炎链球菌341株、金黄色葡萄球菌297株、流感嗜血杆菌248株、卡他莫拉菌237株。①化脓性链球菌在上呼吸道细菌中构成比为74.5％~78.8％,流感嗜血杆菌和卡他莫拉菌在上下呼吸道细菌中的构成比有逐年上升趋势（P<0.05）。②2006至2009年,化脓性链球菌对红霉素耐药率为86.8％～94.7％,未发现青霉素耐药株;青霉素不敏感肺炎链球菌比例为1.4％~20.8％,4年间差异有统计学意义（P=0.007）,肺炎链球菌对红霉素耐药率为91.1％~97.9％;金黄色葡萄球菌对红霉素耐药率为50.0％~54.9％,耐甲氧西林金黄色葡萄球菌比例为7.7％~11.4％;上述3种细菌对万古霉素均敏感。流感嗜血杆菌和卡他莫拉菌β-内酰胺酶阳性率分别为17.0％~31.3％和83.1％~100％,流感嗜血杆菌对头孢呋辛耐药率较低,卡他莫拉菌对环丙沙星和阿莫西林/克拉维酸高度敏感。结论 化脓性链球菌和肺炎链球菌对青霉素高度敏感。化脓性链球菌、肺炎链球菌及金黄色葡萄球菌对红霉素高度耐药。产酶的流感嗜血杆菌对第2代头孢菌素高度敏感,卡他莫拉菌对喹诺酮类和酶抑制剂复合制剂高度敏感。     

225例支气管哮喘急性发作患儿呼吸道病原体检出及临床特征分析

目的 分析支气管哮喘急性发作患儿的呼吸道病原体检出情况及临床特征。方法 收集2017年8月至2019年8月门诊及住院支气管哮喘急性发作的225例 < 14岁患儿的鼻咽拭子,采用荧光定量PCR法检测12种病原体,包括呼吸道合胞病毒（RSV）、人鼻病毒（HRV）、流感病毒A（IFVA）、流感病毒B（IFVB）、副流感病毒1~3型（PIV1~3）、人偏肺病毒（HMPV）、腺病毒（ADV）9种病毒,以及百日咳杆菌（BP）、肺炎衣原体（CP）、肺炎支原体（MP）。结果 病毒总检出阳性率为46.2%（104/225）,共检出7种病毒,依次为HRV（19.6%,44/225）、ADV（16.0%,36/225）、IFVB（5.8%,13/225）、RSV（4.9%,11/225）、IFVA（3.6%,8/225）、PIV3（1.8%,4/225）、HMPV（0.4%,1/225）。所有病原体中BP检出率最高,为28.4%（64/225）,MP检出率为16.4%（37/225）,CP检出率为0.4%（1/225）。哮喘轻度发作组BP检出率高于重度发作组（P < 0.05）;重度发作组RSV和MP检出率高于轻度发作组（P < 0.05）。单纯BP感染、单纯病毒感染、单纯MP感染3组间阵发性咳嗽、痉挛样咳嗽、发热、肺部啰音的患儿比例及肺部影像阳性检出率的比较差异有统计学意义（P < 0.05）。结论 支气管哮喘急性发作患儿常见的呼吸道病原体为BP、HRV、MP;呼吸道病毒感染是儿童哮喘急性发作的重要病原体。不同病原体引起哮喘急性发作的临床特征及严重程度有一定差异。     

13198例急性呼吸道感染住院患儿肺炎支原体、肺炎衣原体及嗜肺军团菌分布特点分析

目的分析急性呼吸道感染(ARTI)住院患儿感染肺炎支原体(MP)、肺炎衣原体(CP)和嗜肺军团菌(LP)的分布特点。方法选取ARTI住院患儿13 198例为研究对象,留取全血和尿液,分别用被动凝集法检测血清MP;ELISA法检测血清CP;免疫层析法检测尿液LP。结果 13 198例ARTI患儿中,MP、CP、LP的检出率分别为25.31%、12.74%、3.27%,MP检出率最高(均P0.0125)。2013年与2014年MP检出率均高于2012年(均P0.0125);2013年CP检出率最高,2014年LP检出率最高(均P0.0125)。3种病原体一年四季均可检出,各季节MP的检出率均最高(均P0.0125)。3种病原体总混合感染检出率为4.35%,以MP+CP混合感染为最常见(均P0.0071)。不同年龄段患儿中,以5~16岁年龄段患儿3种病原体总检出率最高(均P0.0071)。不同ARTI患儿中,急性支气管肺炎患儿3种病原体总检出率最高(均P0.0045)。结论 MP、CP和LP是本地区ARTI患儿重要的病原体,其中以MP感染为主;LP感染呈逐年上升趋势,值得临床重视。