早期肺鳞癌相关蛋白的筛选及其表达验证

目的应用蛋白质组学技术筛选早期肺癌癌变相关蛋白。方法利用双向凝胶电泳方法分离人早期肺鳞癌组织和相应癌旁正常组织总蛋白,选择差异蛋白质点进行质谱分析。免疫组织化学法验证部分差异蛋白质的表达差异。结果用DeCyder软件DIA模块分析显示,每块2-DE胶分离近1470左右个蛋白质点,再经过BVA模块分析,找出在9张图像中均出现,差异有统计学意义(P0.05)、两组间蛋白含量比值在1.5倍以上的差异性蛋白质点24个,成功鉴定14个。选择在癌组织中高表达的差异蛋白点进行质谱分析,最终鉴定为AnnexinⅡ、Cathcpsin D等蛋白质。免疫组织化学检测结果显示,AnnexinⅡ、Cathcpsin D蛋白在肺鳞癌组织中的阳性表达率均显著增高(P0.05)。结论蛋白质组学方法是一种应用于初步筛选早期肺癌相关蛋白的有效方法 ,所鉴定的蛋白为进一步筛选用于肺癌早期诊断及其治疗的分子标志物奠定了前期基础。     

燃煤污染型砷中毒肝损伤患者血清差异蛋白质的筛选

目的 对比分析燃煤污染型砷中毒肝损伤患者和健康人血清中差异表达的蛋白,筛选与燃煤污染型砷中毒致肝损伤发生密切相关的血清蛋白质.方法 6例血清标本来自于贵州省兴仁县交乐病区燃煤型砷中毒肝损伤患者及病区健康人(对照组),采用双向凝胶电泳(2-DE)分离血清中总蛋白,硝酸银染色后经图像分析识别差异表达的蛋白质,基质辅助激光解吸电离飞行时问质谱(MALDI-TOF-MS)鉴定差异表达的蛋白质点,寻找与燃煤污染型砷中毒致肝损伤有关的蛋白质.结果成功地建立了血清2-DE图谱.差异蛋白分析显示,砷中毒肝损伤组平均蛋白点数为(824±31)个,对照组为(782±42)个,两组血清2-DE图谱的匹配率为94.9%(782/824).筛选出两组间的差异蛋白点49个,对其中表达量差异3倍以上的30个蛋白点进行MALDI-TOF-MS分析,鉴定出相关蛋白10个.与对照组比较,其中α2-巨球蛋白、B细胞受体相关蛋白31、细胞角蛋白1、载脂蛋白A-I在砷中毒肝损伤组表达上调,触珠蛋白、α2-HS-糖蛋白、细胞外信号调节激酶4、锌指蛋白323、ZAP-70、SP40表达下调.结论成功地建立了分辨率高、重复性较好的燃煤污染型砷中毒肝损伤患者血清2-DE图谱,并筛选出一些与健康人血清中差异表达的蛋白质,这些蛋白质能否作为燃煤污染型砷中毒肝损伤诊断的血清标志物还有待于进一步验证.     

核苷二磷酸激酶等蛋白在人胰腺癌与癌旁组织中的差异表达

目的 应用比较蛋白质组学方法研究人胰腺导管腺癌组织和癌帝组织之间差异的蛋白质.方法利用双向凝胶电泳(2-DE)对8例胰腺导管腺癌组织和癌旁组织的总蛋白进行分离,两组间差异蛋白质点用质谱和数据库检索鉴定利用蛋白质印迹分析和免疫组织化学法检测差异蛋白在胰腺癌和癌旁组织的表达.结果 鉴定出30个差异表达蛋白,包括亲环素A、过氧化氧化还原蛋白1、14-3-3 sigma、Annexin Ⅱ、热休克蛋白27、核苷二磷酸激酶(NDPD)等.差异表达蛋白NDPK在35例胰腺癌组织表达率为77.1%,而配对癌旁组织为28.6%.结论 2-DE为基础的蛋白质学技术是研究肿瘤的一种重要手段.NDPK等差异表达蛋白可能是潜在的胰腺癌诊断标记物.     

VNN1在溃疡性结肠炎中表达的研究

目前临床上仍缺乏与溃疡性结肠炎（UC）疾病进展和预后相关的分子标志物。目的：探讨UC患者肠黏膜组织、血清和粪便中泛酰巯基乙胺酶1(VNN1)表达及其临床意义。方法：选择2018年12月—2020年1月新疆维吾尔自治区人民医院治疗的UC患者100例和健康志愿者100名,留取结肠镜活检组织、血液和粪便标本。应用PCR、蛋白质印迹法和免疫组化法分别检测肠黏膜组织中VNN1 mRNA和蛋白表达,ELISA法测定血清和粪便中VNN1表达。结果：UC患者肠黏膜组织中VNN1 mRNA和蛋白表达均明显高于健康对照者（P<0.05）。免疫组化法显示UC患者肠黏膜组织中VNN1表达明显高于健康对照组（P<0.05）。ELISA法显示UC患者血清VNN1表达明显高于健康对照者（P<0.05）,而粪便中VNN1表达无明显差异（P>0.05）。结论：UC患者肠黏膜组织和血液中VNN1高表达,可作为UC新的分子标志物。     

应用蛋白质组学技术筛检肝癌血清差异蛋白质并分离鉴定阿朴脂蛋白AⅡ

目的 应用蛋白质组学技术筛选并鉴定肝癌患者血清中的差异蛋白质.方法 采用表面增强激光解析及电离飞行时间质谱技术,对33例肝癌患者和33例正常对照的血清蛋白质进行了检测分析,筛选肝癌的差异蛋白;用等电点沉淀法、十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳及高效液相色谱串联质谱等一系列方法分离鉴定差异蛋白质.肝癌组与正常组蛋白质峰差异比较采用两样本t检验. 结果 肝癌组与正常人组血清蛋白质图谱在相对分子质量为2 000～10 000范围内,有65个蛋白质峰差异有统计学意义(P<0.05),由此组建的诊断模型灵敏度为100%,特异度为96.97%其中包括8706.5 M/Z和8579.2M/Z(t值分别为2.562和2.783,P值均<0.05),经分离鉴定其为阿朴脂蛋白AⅡ. 结论 阿朴脂蛋白AⅡ是肝癌的差异蛋白之一,可能与肝癌的发生有关.     

肝纤维化患者血清差异蛋白质的筛选

目的: 对比分析肝纤维化患者和健康人血清中差异表达的蛋白质, 筛选与肝纤维化发生密切相关的血清蛋白质.方法: 肝纤维化患者和健康人空腹血清标本各6例分别等量混合成2个样本, 去除血清中的白蛋白和IgG. 利用双向凝胶电泳(2-DE)分离肝纤维化血清和健康人血清总蛋白质后, 硝酸银染色, 经图像分析筛选差异表达的蛋白点. 应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDITOF-MS)鉴定差异表达的蛋白点, 并用ELISA法对其中部分差异蛋白的表达水平进行验证.结果: 筛选出2组间的差异蛋白点共517个, 对其中表达量差异3倍以上的24个蛋白点进行MALDI-TOF-MS分析, 鉴定出包括触珠蛋白、载脂蛋白A-Ⅳ、转铁蛋白、T细胞受体b链、血清白蛋白及血清白蛋白前体等8个蛋白质, 其中3个蛋白质在肝纤维化血清中表达上调, 5个蛋白质在肝纤维化血清中表达下调. 与健康人血清比较, ELISA法检测肝纤维化血清中触珠蛋白、载脂蛋白A-Ⅳ表达均下调, 结果与双向凝胶电泳一致.结论: 肝纤维化血清与健康人血清的蛋白质表达谱表现出一定差异, 这些差异表达的血清蛋白质有望成为肝纤维化诊断与判定预后的血清标志物.     

类风湿关节炎患者外周血单个核细胞蛋白质组学研究

目的 运用蛋白质组学的方法,比较正常人及早期活动性类风湿关节炎(RA)患者外周血单个核细胞(PBMCs)蛋白质的差异表达,寻找RA疾病相关致病蛋白质.方法 选取9例早期活动期RA患者以及9名健康成年志愿者,用淋巴细胞分离液分离PBMCs,抽提PBMCs中的蛋白,采用同相pH梯度(IPG)双向凝胶电泳(2-DE)分离正常人及RA患者PBMCs总蛋白质.凝胶经考马斯亮蓝染色显色后,PDQuest图像分析软件进行比较分析、识别差异表达的蛋白质,对差异蛋白质点用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)进行鉴定,运用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法验证部分差异蛋白质.结果 获得RA患者及正常人PBMCs蛋白质双向凝胶电泳图谱,平均蛋白质点数分别为556和579,匹配率分别为89.4%和 88.5%,通过比较分析,差异表达蛋白质点数为23,选取18个点进行质谱鉴定,成功鉴定14个蛋白质,其中a-肌动蛋白、纤维蛋白素原a-链、载脂蛋白A-I(ApoA-I)等9个蛋白质点在RA中表达上调,硫氧还蛋白-2、谷胱甘肽S-转移酶等6个蛋白质点在RA中表达下调,这些差异蛋白质的功能涉及物质代谢、抗氧化、信号传导、能量产生及细胞骨架.并用RT-PCR方法验证差异蛋白质ApoA-I.其结果与上述蛋白质差异表达结果相符.结论 在RA患者PBMCs中存在着差异表达蛋白质,这些差异蛋白质可能是RA发病的内在因素.其RT-PCR结果与蛋白质差异表达相符,证明蛋白质组研究的可靠性.     

肺癌与正常人血清蛋白质双向电泳差异分析

利用双向电泳(2-DE)分离肺癌患者和正常人的血清蛋白质,银染显色,Umax扫描仪获取图像,Melanie4软件分析图像,寻找肺癌相关差异蛋白质.结果建立了较稳定的肺癌和正常血清蛋白质2-DE图谱,平均蛋白质点数约400个.软件分析显示,两组共有11个差异蛋白质点,其中肺癌患者量上调的差异点9个,量下调的差异点2个.提示差异蛋白质分离为进一步肺癌相关血清蛋白质的鉴定和其他肿瘤血清蛋白质组学研究奠定了良好基础.     

三水白虎汤对类风湿关节炎滑膜成纤维细胞增殖的蛋白质组学影响

目的 探讨三水白虎汤(SSBH)对类风湿关节炎(RA)滑膜成纤维细胞(FLS)增殖的蛋白质组学影响.方法 组织块培养法收集RA患者的关节FLS,体外传代培养,取3～6代细胞,分别加入SSBH含药血清培养(SSBH组)及加入生理盐水制备的血清培养(对照组).培养72 h后提取细胞总蛋白,用双向凝胶电泳(2-DE)分离细胞总蛋白,凝胶经银染显色和图像数据分析识别差异蛋白位点;基质辅助激光解析电离飞行时间质谱对差异蛋白位点进行鉴定.结果 两组FLS蛋白2-DE图谱均出现差异蛋白质点.在差异蛋白表达量超过3倍的蛋白质点中,选取27个差异蛋白位点进行质谱分析,共鉴定出包括表达上升的IL-1受体拮抗蛋白等25种蛋白质.结论 SSBH可能通过上调RA患者FLS中IL-1受体拮抗蛋白来抑制滑膜增生,这可能是该方剂治疗RA的药理作用机制之一.     

老年糖尿病肾病患者血浆差异蛋白的表达

目的探讨老年糖尿病肾病(DN)与健康人群血浆差异蛋白的表达。方法选取老年DN患者10例(试验组),同期查体健康人群10例(对照组),采用荧光差异双向凝胶电泳(2D-DIGE)检测老年DN患者及健康志愿者血浆蛋白质组的表达情况,以差异表达1.5倍为截断值挑选蛋白质斑点并行质谱分析。结果应用老年DN患者及健康志愿者血浆成功构建差异表达双向凝胶电泳图谱,并分析筛选出33个差异表达斑点,通过质谱分析数据库比对鉴定出6种差异表达蛋白。结论 2D-DIGE技术可有效筛选老年DN相关特异蛋白,为进一步筛选DN血清标志物提供依据。     

肝癌发生不同病理阶段血清蛋白质组的比较

目的 比较肝癌发生不同病理阶段血清蛋白质组的表达变化情况,从中寻找特异性标志物.方法 用双向凝胶电泳分离正常人,慢性肝炎、肝硬化和肝癌患者的血清蛋白质,结合质谱技术对差异点进行鉴定; Western blot检测结合珠蛋白β链以验证蛋白质水平的表达.计量资料数据以均数±标准差(x±s)表示,采用方差分析和LSD检验进行两两比较.结果 4组血清的双向电泳图谱经软件匹配分析,并与基质辅助激光解析电离飞行时间质谱相结合,成功鉴定出结合珠蛋白,SAA1、SP40等30个差异蛋白质点,K cluster聚类分析不同的变化模式.在差异蛋白质点中,7个蛋白质点均为结合珠蛋白,呈现由正常→肝炎→肝硬化持续下调、到肝癌又上调的模式.Western blot证实结合珠蛋白β链的表达与双向电泳表达相一致.结论 在肝癌发生的动态过程中各疾病阶段的血清蛋白质差异表达有4种明显变化模式,可能为肝癌的早期诊断和预后提供依据,与肝癌发生发展相关的结合珠蛋白很可能是肝硬化发展到肝癌的一个潜在早期诊断标志物.     

晚发型阿尔茨海默病蛋白质组学中触珠蛋白的表达

目的建立晚发型阿尔茨海默病(LOAD)蛋白质组学技术体系,寻找并鉴定与LOAD发生有关的生物标记物。方法选择8例经病理证实为LOAD患者的颞叶脑皮质为LOAD组,另选择5例尸体解剖为正常老年人颞叶脑皮质为对照组。分别采用固相pH梯度双向凝胶电泳分离总蛋白质,凝胶经银染显色后,用图像分析软件进行比较分析、确定差异蛋白质点。将选取的差异蛋白质点进行胶内酶切,采用基质辅助激光解析-电离-飞行时间质谱及电喷雾电离串联质谱法进行质谱分析;搜索数据库鉴定蛋白质。结果分别获得两组脑组织双向电泳蛋白质组表达图谱,筛选并鉴定出表达有明显差异的蛋白质点11个,其中蛋白质点2触珠蛋白在LOAD组有明显上调。结论筛选并鉴定表达有明显差异的蛋白质点11个,可能成为具有临床诊断意义的LOAD潜在标记物,从而为阿尔茨海默病的早期诊断和治疗提供理论和实验依据。     

肺结核患者外周血单个核细胞蛋白质差异的表达

目的 应用比较蛋白质组学方法筛选出肺结核患者发病免疫相关蛋白质,为阐明结核病的发病的免疫机制和诊断治疗提供理论依据.方法 收集10例肺结核患者和10名健康志愿者外周血单个核细胞(PBMC),采用双向凝胶电泳分离细胞总蛋白,运用Image Master 2D Elite 5.0图像分析软件识别差异表达的蛋白质点,应用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱获取肽质量指纹图谱,检索数据库鉴定差异表达的蛋白质点,并对差异表达的蛋白质用Western blot进行验证.两组间比较采用秩和检验.结果 建立了重复性良好的肺结核患者和健康志愿者PBMC的双向凝胶电泳图谱,找出14个表达量有明显差异的蛋白质点并鉴定出共12种蛋白质,其中冠蛋白1A等10种蛋白在肺结核组中表达上调,普列克底物蛋白(PLEK)和Ras基因抑制蛋白1(RSU1)在肺结核组中表达下调;Western blot法验证PLEK在肺结核组表达下调,与双向凝胶电泳结果一致.结论 对肺结核患者PBMC的比较蛋白质组学研究鉴定出冠蛋白1A、PLEK等12种差异蛋白质,其中PLEK和冠蛋白1A可能通过对单核巨噬细胞吞噬作用的调节在肺结核发病中起着重要作用.     

染氟成骨细胞的双向电泳和质谱鉴定

目的探讨双向电泳和质谱鉴定技术在染氟成骨细胞蛋白表达变化中的意义,为探索氟骨症发病机制提供有效手段。方法采用小鼠乳鼠颅骨来源的成骨细胞进行培养,抽提染氟(2mg/L)72h组和对照组成骨细胞蛋白,用双向凝胶电泳进行分离及ImageMaster2DElite软件分析电泳图谱,基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱仪对两组间比较具有统计学意义的差异蛋白点进行鉴定。结果在对照组成骨细胞蛋白双向电泳图谱上可观察到671个蛋白点,而在染氟组双向电泳图谱上可见到837个蛋白点;在染氟成骨细胞表达有明显差异的蛋白点经质谱鉴定出12种(7种蛋白表达增多,5种降低),主要是与细胞代谢旺盛、蛋白质氧化折叠和氧化应激等相关的蛋白。结论实验所采用的双向电泳和质谱鉴定方法可有效分离和鉴定成骨细胞蛋白点,为氟骨症的发生机制提供了有价值的新线索,表明蛋白质组学技术较其他方法具有很大的优越性。     

Comparative proteomics analysis of human gastric cancer

AIM： To isolate and identify differentially expressed proteins between cancer and normal tissues of gastric cancer by two-dimensional electrophoresis （2-DE） and matrix-assisted laser desorption/ionization time-of- flight mass spectrometry （MALDI-TOF-MS）. METHODS： Soluble fraction proteins of gastric cancer tissues and paired normal tissues were separated by 2-DE. The differentially expressed proteins were selected and identified by MALDI-TOF-MS and database search. RESULTS： 2-DE profiles with high resolution and reproducibility were obtained. Twenty-three protein spots were excised from sliver staining gel and digested in gel by trypsin, in which fifteen protein spots were identified successfully. Among the identified proteins, there were ten over-expressed and five under-expressed proteins in stomach cancer tissues compared with normal tissues. CONCLUSION： In this study, the well-resolved, reproducible 2-DE patterns of human gastric cancer tissue and paired normal tissue were established and optimized and certain differentially-expressed proteins were identified. The combined use of 2-DE and MS provides an effective approach to screen for potential tumor markers.     

铜绿假单胞菌相关性肺损伤的蛋白质差异表达研究

目的 利用蛋白质组学方法筛选铜绿假单胞菌急性肺损伤特异相关蛋白质,为鉴别诊断感染与非感染因素引起的急性肺损伤提供理论依据.方法 建立感染(铜绿假单胞菌急性肺损伤)与非感染(包括机械通气急性肺损伤、油酸急性肺损伤)大鼠模型,应用双向凝胶电泳技术分离总蛋白,Image Master双向凝胶电泳软件分析差异表达蛋白质点后,应...     

Laboratory markers in ulcerative colitis: Current insights and future advances

Ulcerative colitis(UC)and Crohn’s disease(CD)are the major forms of inflammatory bowel diseases(IBD)in man.Despite some common features,these forms can be distinguished by different genetic predisposition,risk factors and clinical,endoscopic and histological characteristics.The aetiology of both CD and UC remains unknown,but several evidences suggest that CD and perhaps UC are due to an excessive immuneresponse directed against normal constituents of the intestinal bacterial flora.Tests sometimes invasive are routine for the diagnosis and care of patients with IBD.Diagnosis of UC is based on clinical symptoms combined with radiological and endoscopic investigations.The employment of non-invasive biomarkers is needed.These biomarkers have the potential to avoid invasive diagnostic tests that may result in discomfort and potential complications.The ability to determine the type,severity,prognosis and response to therapy of UC,using biomarkers has long been a goal of clinical researchers.We describe the biomarkers assessed in UC,with special reference to acute-phase proteins and serologic markers and thereafter,we describe the new biological markers and the biological markers could be developed in the future:(1)serum markers of acute phase response:The laboratory tests most used to measure the acute-phase proteins in clinical practice are the serum concentration of C-reactive protein and the erythrocyte sedimentation rate.Other biomarkers of inflammation in UC include platelet count,leukocyte count,and serum albumin and serum orosomucoid concentrations;(2)serologic markers/antibodies:In the last decades serological and immunologic biomarkers have been studied extensively in immunology and have been used in clinical practice to detect specific pathologies.In UC,the presence of these antibodies can aid as surrogate markers for the aberrant host immune response;and(3)future biomarkers:The development of biomarkers in UC will be very important in the future.The progress of molecular biology tools(microarrays,proteomics and nanotechnology)have revolutionised the field of the biomarker discovery.The advances in bioinformatics coupled with cross-disciplinary collaborations have greatly enhanced our ability to retrieve,characterize and analyse large amounts of data generated by the technological advances.The techniques available for biomarkers development are genomics(single nucleotide polymorphism genotyping,pharmacogenetics and gene expression analyses)and proteomics.In the future,the additionof new serological markers will add significant benefit.Correlating serologic markers with genotypes and clinical phenotypes should enhance our understanding of pathophysiology of UC.