慢性丙型肝炎患者HCV基因型调查

目的 研究丙型肝炎病毒（ＨＣＶ）基因型的流行病学特点。方法 采用ＩＮＮＯ－ＬＩＰＡ反向线形探针杂交法，对来自我国南方（上海，武汉，徐州）、北方（北京、天津）和东北（大连、沈阳）７市的１０７例慢性丙型肝炎患者进行了ＨＣＶ基因型调查。结果（１）地域性，ＨＣＶ１ｂ是主要的基因型，其检出率达８３．１７％，其中东北２市（７２．２２％）低于北方２市（８７．６５％，Ｐ〈０．０１）；２型的检出率较低，仅占６．８６     

澳门地区丙型肝炎病毒基因型分析

应用逆转录－ＤＮＡ聚合酶链反应及ＤＮＡ序列分析，对采自澳门地区４３例抗－丙型肝炎病毒抗体阳性的慢性肝火患者及５５例血液透析患者血清进行了ＨＣＶ ＲＮＡ检测及基因型分析。     

丙型肝炎病毒血清型基因型与抗HCV抗体类别的关系

采用EIA法检测丙型肝炎患者血清IgG、IgM、IgA类抗HCV抗体;以丙型肝炎病毒核心区2个型特异性合成多肽对抗HCV进行血清学分型,对已确定血清型的血清进行5′非编码区逆转录套式聚合酶链反应(RT-nPCR)和限制性片段长度多态性(RFlp)分析以确定基因型.结果:23例HCV RNA阳性的丙型肝炎患者中19例抗HCV阳性(IgG、IgM、IgA三者中至少一种阳性);12例可行血清学分型,其中1型8例,2型2例,1、2混合型2例;11例未能分型.12例已知血清型的HCV中,基因型Ⅰ型9例,Ⅱ型2例,Ⅰ、Ⅱ混合型1例.两种分型方法一致率为91.7%(11/12).提示:血清学分型具有一定应用价值,联合IgA、IgM抗HCV检测可提高血清学分型的检出率.     

山东省HCV分离株C区及NS5区核苷酸序列分析及其基因分型

目的 研究山东省丙型肝炎病毒（HCV）流行株的基因型别,方法 用反转录套式聚合酶链反应（PCR）方法分别扩增山东省HCV流行株C区（432bp)NS5区（319bp)的两个基因片段,将其克隆人T载体上并自动测序,进行同源性分析及基因型别鉴定。结果 4株HCVC区基因片段有3株为1b基因亚型,1株为2a基因亚型,10株NS5区的基因片段分析均为1b基因亚型,并且与GenBank中多个1b亚型代表株核苷酸序列同源性达90%以上,结论 山东省HCV流行株以1b亚型为主,兼有2a亚型,同一亚型中也有较大的变异,NS5区1b亚型中基因散率可达5%以上。     

丙型肝炎病毒基因型与血清HCV RNA含量关系及与干扰素应答的研究

目的探讨丙型肝炎病毒（ＨＣＶ）基因型与血清ＨＣＶＲＮＡ含量的关系及其对干扰素应答的影响。方法应用定量荧光ＰＣＲ（Ａｍｐｌｉｓｅｎｓｏｒ－ＰＣＲ）技术检测了１３５例不同基因型ＨＣＶ感染的慢性丙型肝炎患者血清ＨＣＶＲＮＡ含量，另对其中７７例进行干扰素治疗并随访１２个月以上。结果ＨＣＶ－Ⅱ型感染血清ＨＣＶＲＮＡ水平（１０７．８±３．４拷贝／ｍｌ）显著高于ＨＣＶ－Ⅲ型感染（１０６．３±２．５拷贝／ｍｌ）（Ｐ＜０．０１），Ⅲ型感染的应答率（７／１３，５３．８％）显著高于Ⅱ型感染（２０／６４，３１．３％）（Ｐ＜０．０５）。应答组治疗前血清ＨＣＶＲＮＡ含量（１０６．８±２．７拷贝／ｍｌ）显著低于无应答组（１０８．３±３．２拷贝／ｍｌ）（Ｐ＜０．０１）。ＨＣＶＲＮＡ含量低于１０６．５拷贝／ｍｌ者，无论何种型别ＨＣＶ感染均应答较好，而ＨＣＶＲＮＡ高于１０８．０拷贝／ｍｌ者则应答极差。结论ＨＣＶ基因型及病毒血症水平是预测干扰素疗效的重要因素，且后者比前者意义更大。Ⅱ型感染病毒血症水平较高可能是影响其疗效的原因之一。     

吉林省延边地区朝鲜族与汉族HCV基因型特征分析

目的分析吉林省延边地区朝鲜族与汉族丙型肝炎病毒（HCV）基因型特征。方法采用荧光定量PCR方法和探针反向杂交技术对延边地区收治的62例朝鲜族和57例汉族慢性丙型肝炎患者进行HCV病毒载量检测和HCV基因型分析,比较HCV基因型在朝鲜族与汉族之间的分布差异,并分析HCV基因型与病毒载量、2型糖尿病和肝病严重程度之间的相关性。结果朝鲜族HCV基因型显示,1b型占45．16％（28／62）、2a型占38．71％（24／62）、未分型占16．13％（（10／62）;汉族HCV基因型显示,1b型占45．61％（26／57）,2a型占40．35％（23／57）,未分型占14．14％（8／57）,朝、汉族之间各基因型分布差异无统计学意义（P〉0．05）。HCV各基因型之间HCV病毒载量差异和合并2型糖尿病分布差异之间无统计学意义（P〉0．05）,而HCV1b型在中、重度慢性丙型肝炎患者与轻度慢性丙型肝炎患者中所占的比例差异具有统计学意义（P〈0．05）。结论①吉林省延边地区HCV基因型中以1b型最多,2a型次之,还有少数其他基因型;②HCV基因型在朝、汉民族之间分布无差异;③HCV基因型与HCV—RNA载量无关;④HCV基因型在合并糖尿病者与未合并糖尿病者之间分布无差异;⑤1b型HCV感染者病情相对较重。     

不同基因型HCV膜区（E2）基因克隆及亲、疏水性分析

目的 研究丙型肝炎病毒（HCV）不同基因型膜区序列变异及其变异规律。方法 克隆不同基因型HCV的膜区基因,序列测定,核苷酸和氨基酸序列比较和分析。结果 不同基因型膜区基因相似性不同,从同一血清样本获得的不同克隆间,其同源性核苷酸大于99．2％,氨基酸大于99．9％。相同亚型核苷酸和氨基酸同源性大于80％。同型基因核苷酸和氨基酸同源性分别为（63．9－75．0）％和（64．9－72．8）％。异型基因同源性核苷酸为（59．4－67．0）％,氨基酸为（56．5－66．3）％。氨基酸序列变化在某些部位有一定保守性。不同基因HCV高变区（HVR）的亲水性和疏水性变化小于其下游3′端区域。结论 HCV基因变化可能有一定规律性。     

河北某非法采血村人群感染HCV基因亚型调查

目的 了解河北某非法采血村村民感染丙型肝炎病毒(HCV)基因亚型分布情况.方法 对该村全体村民采集静脉血标本计520份,无菌分离血清;以RT-PCR法扩增其中可利用的483份血清HCV之C/E1基因片段,双脱氧链终止法测序;用Mega4.0软件进行HCV系统进化分析,构建系统进化树,判定基因亚型.结果 483份标本中,HCV RNA阳性者70份,阳性率14.5%;基因分型1b亚型36例,占51.4%;2a亚型34例,占48.6%.结论 该村村民血清HCV检出率约为14.5%,远高于一般人群;HCV亚型构成为1b、2a各半.     

核酸探针标记和杂交技术

核酸探针检测技术日益成为诊断疾病的一种重要手段。核酸探针标记有同位素标记和非同位素标记(直接标记和间接标记)等方法,同位素标记检测敏感性高,但同位素半衰期短,不能长期保存。非同位素标记探针比较稳定,可保存较长时间,但检测敏感性稍低。在核酸探针检测中,可用固相杂交、液相杂交测定。本文综述了上述各种核酸探针标记方法和杂交技术的研究进展。     

丙型肝炎病毒基因型3感染有时可以自然清除

德国研究人员在7月《医学病毒学》杂志(J Med Virol2004；73：387-391)上报告，感染丙型肝炎病毒(HCV)基因型3有时可以自然清除，病人不需治疗。     

丙型肝炎病毒血清学分型与基因分型研究

为了解某农村单采浆供血员人群所感染丙型肝炎病毒（ＨＣＶ）的血清型和基因型构成，并对两种分型方法进行比较，本工作以ＨＣＶＣ区型特异性多肽对抗－ＨＣＶ进行血清学分型，对已确定血清型的血清进行５′非编码区（ＮＣＲ）逆转录套式聚合酶链反应（ＲＴ－ｎＰＣＲ）和限制性片段长度多态性（ＲＦＬＰ）分析以确定基因型，并对６份扩增产物进行序列测定。结果显示１４０份抗－ＨＣＶ阳性血清中，血清Ⅰ型和Ⅱ型分别为４４份（３１．４３％）和１２份（８．５７％），余８４份未能分型。４４株已知血清型的ＨＣＶ中，１ｂ、２ａ和３ｂ等３种基因型分别为３４株（７７．２７％）、９株（２０．４５％）和１株（２．２７％）。两种分型方法一致率为９３．１８％（４１／４４）。对６株ＨＣＶ５′ＮＣＲ的序列分析证实了ＲＦＬＰ分型的正确性。结论认为该人群ＨＣＶ感染以血清Ⅰ型或基因１ｂ型为主；Ｃ区型特异性多肽血清学分型法与ＲＦＬＰ基因分型法符合率高，具有一定应用价值。     

沈阳地区乙型肝炎病毒基因型分子流行病学研究

目的 研究沈阳地区乙型肝炎病毒基因型分布和特点。方法 应用半巢式聚合酶链反应（PCR）扩增乙型肝炎病毒P基因，将PCR产物应用ABI377自动测序仪直接做核苷酸序列分析，并用DNA STAR软件进行种系发生分析及基因型鉴定。结果 HBV DNA标准株P基因片段可进行基因分型。在沈阳地区慢性HBV感染者中可检出基因型B、C和D，检出率分别为22％、50％和28％，基因型C分布与基因型B、D的差异有统计学意义，在慢性乙型肝炎患者和慢性HBV携带者间各基因型间分布比较中差异无统计学意义。结论 通过测定HBV DNAP基因序列片段可进行HBV DNA基因分型。沈阳地区乙型肝炎病毒基因型有基因型B、C和D型，其中基因型C为优势基因型。     

贵州乙型肝炎病毒基因型分布及意义分析

目的调查贵州乙型肝炎病毒（HBV）基因型分布。方法选择贵阳、遵义、凯里、都匀慢性HBV感染者693例，其中无症状携带者（ASC）292例，慢性肝炎（CH）276例，肝硬化（LC）76例，肝细胞肝癌（HCC）49例。用S基因限制性片段长度多态性确定基因型，比较主要基因型的地区分布及其与临床的关系。结果693例中，B基因449例（64．79％），C型233例（33．62％），A型6例（0．87％）。D型5例（0．72％），未发现E、F基因型。B型的分布：凯里最高（96．40％），遵义、都匀其次（78．79％、76．19％），贵阳最低（53．66％）。C型的分布，贵阳（45．68％）高于都匀（23．80％）、遵义（13．13％）及凯里（3．96％），差异有统计学意义（P≤0．01）。与B型相比，C型感染者平均年龄大；ALT水平高；HBeAg阳性率低（P≤0．01）。除ASC组外，B、C2种基因型在CH、LC和HCC中的分布差异有统计学意义（P均〈0．01）。结论贵州存在A、B、C、D4种HBV基因型，但以B型为主，C型其次，A型、D型仅占很小比例。B、C基因型在贵州不同地区的分布有一定差异。与B型相比，C型感染者肝脏损害的程度较重。     

基因芯片法特异性检测丙型肝炎病毒的基因分型

目的：采用基因芯片特异性检测血清中丙型肝炎病毒（HCV）并进行基因分型。方法：设计HCV基因型特异探针，将其固定在玻璃片上制成微阵列芯片。阳性组血清60份，阴性组血清15份，乙型肝炎血清5份（抗HCV阴性）。经核酸提取，多聚酶链式反应（PCR）扩增，与芯片上的探针杂交，最后分析结果并与测序分型结果比较。结果：阳性组血清全部检测到HCV-RNA，均有基因芯片分型结果。基因芯片分型结果与测序分型结果一致者56例。阴性组血清HCV-RNA全部阴性。乙型肝炎血清全部阴性。结论：基因芯片可准确对HCV感染血清做定性检测并同时检测HCV基因型，简便快捷，特异性好，并且不需荧光标记和昂贵的荧光扫描仪器，与乙型肝炎血清无交叉反应。可替代基因测序分型，适于临床大量样品的检测。     

河南省漯河地区乙型肝炎病毒基因型别的初步研究

目的 初步确定流行于河南漯河地区的乙肝病毒的基因型的基本情况.方法 采集河南漯河地区乙型肝炎表面抗原阳性的血清,利用PCR扩增得到HBV的S基因;用DANSTAR软件对其进行核苷酸序列分析,构建系统发生树,分析基因型.结果约75.7%样本的HBV S基因序列位于HBV系统发生树的基因型C,约20%的样本其S基因位于系统发生树的基因型B,近4.3%的样本其S基因位于系统发生树的基因型D.结论 流行于河南漯河地区的乙肝病毒多数为基因型C,少数为基因型B,极少数为基因型D.     

Elevation of plasma soluble human leukocyte antigen-G in patients with chronic hepatitis C virus infection

The subversion of immune responses that hepatitis C virus (HCV) uses to escape immune surveillance and to establish persistent infection has been poorly understood. The immune-suppressive molecule human leukocyte antigen-G (HLA-G) has been supposed to play important roles in viral infection. In the current study, HCV genotype was analyzed in 67 chronic HCV-infected (CHC) patients. Plasma soluble sHLA-G (including sHLA-G1 and HLA-G5), interleukin-10 (IL-10), and interferon-γ (IFN-γ) levels were determined in these CHC patients and in healthy subjects by enzyme-linked immunosorbent assay, and the sHLA-G isoforms present in plasma were determined by Western blot. Data showed that HCV 1b was the predominant genotype, with a prevalence of 64.2%. sHLA-G was dramatically increased in CHC patients (median: 85.54 U/ml, range: 19.40-204.07) over that in normal controls (median: 9.13 U/ml, range: 5.07-69.56) (p < 0.001). Western blotting revealed that plasma sHLA-G was derived from sHLA-G1 and HLA-G5. IL-10 and IFN-γ levels were also significant higher in CHC patients than in normal controls (median: 16.3 pg/ml vs 1.8 pg/ml, p < 0.001, and 1025.3 pg/ml vs 858.3 pg/ml, p = 0.03, respectively). No significant association was observed for the HCV genotype and viral RNA load with the levels of sHLA-G, IL-10, and IFN-γ in CHC patients. These results indicate that elevation of sHLA-G expression in HCV patients was independent of viral genotype and viral RNA load. Given its immunotolerant property, an increase in sHLA-G may play a role in the persistency of HCV infection.     

丙型肝炎病毒基因分型及其与疾病程度、感染途径和干扰素疗效的关系

为探讨广州地区丙型肝炎病毒（ＨＣＶ）感染的基因型及其与疾病程度、感染途径和干扰素疗效的关系，作者应用分型ＰＣＲ技术对１５６例抗－ＨＣＶ阳性患者血清ＨＣＶＲＮＡ进行分型检测，并分析不同程度肝病及不同感染途径ＨＣＶ基因型分布，且对５１例经干扰素治疗的慢性丙肝作分型评价。结果１２４例ＨＣＶＲＮＡ阳性中，Ⅱ型占９０．３％（１１２例），Ⅲ型占８．１％（１０例），Ⅱ／Ⅲ型混合感染占１．６％（２例），未检出Ⅰ、Ⅳ型，说明广州地区ＨＣＶ感染以Ⅱ型为主；不同程度肝病及不同感染途径之间ＨＣＶ基因型构成比无明显差异，表明基因型与疾病严重程度及感染途径关系不大；干扰素治疗病例，ＨＣＶ－Ⅱ、Ⅲ型感染的总应答数、完全应答数及部分应答数分别为１８／４１，１１／４１，７／４１和８／１０，６／１０，２／１０，提示Ⅲ型感染疗效较好，ＨＣＶ基因型似可作为选择干扰素治疗病例及判断疗效的参考指标，但是由于观察的Ⅲ型病例数较少，需积累更多的资料才能作出更客观的结论。     

山东烟台地区HCV感染的基因分型研究

目的 了解山东烟台地区丙型肝炎病毒的基因分型,结合受试者的肝功能指标观察基因型别与肝损情况是否相关.方法 采用特异性PCR引物对HCV RNA5'UTR区和(或)NS5B区进行扩增,PCR产物进行序列分析,通过与GenBank中参考序列的比对,联合遗传进化树对标本予以分型.结果 9例无偿献血员中检出1b和3a两种基因亚型,分别为8例和1例.33例丙肝患者中,检出1b、2a和6a三种基因亚型,分别为22(66.7％)、10(30.3％)和1(3.03％)例.1b亚型是烟台地区HCV携带者的优势流行基因亚型,在不同人群中分布差异无统计学意义(x2=0.796,P=0.373);不同基因分型的受试者其肝损指标的差异有统计学意义(P＜0.05),2a型携带者的ALT、AST均值明显高于1b型.结论 山东烟台地区HCV基因型呈现多样性,以1b为主,并首次检出3a和6a亚型.HCV基因型与肝损指标具有相关性,2a型HCV感染可能在肝细胞的病变过程中起着重要作用.     

沈阳地区各型丙型肝炎患者丙型肝炎病毒的基因分型

目的研究沈阳地区丙型肝炎病毒（ＨＣＶ）基因型分布状况及其临床意义。方法应用聚合酶链反应（ＰＣＲ）方法对沈阳地区８４例血清抗－ＨＣＶ及ＨＣＶＲＮＡ均阳性的各临床型丙型肝炎患者进行ＨＣＶ基因分型。结果８４例丙型肝炎中,ＨＣＶ－Ⅱ型４５例（５３．６％）,ＨＣＶ－Ⅲ型２６例（３０．９％）,Ⅱ／Ⅲ混合型１３例（１５．５％）;ＨＣＶ不同基因型在各型丙型肝炎中总体分布不一致,经统计学处理,Ｐ＜０．０５;在急性肝炎、慢性肝炎轻度、中度、重度及肝炎后肝硬化中,ＨＣＶ－Ⅱ型感染分别占５５．６％,３６．２％,７５．０％,８５．７％及８８．９％;ＨＣＶ－Ⅲ型感染分别占２２．２％,４６．８％,８．３％,０％骸１１．１％。结论沈阳地区ＨＣＶ感染以Ⅱ型为主,其次为Ⅲ型及Ⅱ／Ⅲ混合型;ＨＣＶ基因型与丙型肝炎严重程度密切相关。     

Isoniazid resistance in patients with Extrapulmonary Tuberculosis using line probe assay in a private multispecialty hospital in Bangalore,India

We aimed to study the rate of isoniazid (INH) resistance in Extrapulmonary Tuberculosis samples from a private care setting.A Line probe assay was performed on 74 culture isolates of Mycobacterium tuberculosis or directly on extrapulmonary samples received in our laboratory from 2018 to 2021.The INH mono-resistance among these extrapulmonary samples was 6.7%. (5 among 74) (95% CI: 1.04%–12.48%) Resistance to rifampicin was not detected.Increasing the availability and leveraging public private partnerships in hospitals for universal testing for INH resistance may increase detection of INH monoresistance in EP-TB and improve the strategy for TB elimination.