补体C5基因单核苷酸多态性与肝细胞癌易感性关系的研究

目的探讨中国华北地区乙型肝炎患者补体C5单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphisms,SNP)与肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)易感性的关系。方法采用Mass ARRAY TM Analyzer技术平台进行C5 rs17611、rs25681及rs2300929 3个SNP的多态性基因型检测,并进行风险度分析、连锁不平衡及单倍型分析,探讨3个SNP与HCC易感性的关系。结果与对照组比较,HCC组中rs17611位点等位基因G、rs25681位点等位基因C及rs2300929位点等位基因C可明显增加HCC的发病风险[P0.05,OR(95%CI)1];单体型为rs17611G-rs25681C-rs2300929C可增加HCC发病风险(OR=3.708,95%CI:1.578~8.712),单体型为rs17611A-rs25681T-rs2300929T可减少HCC的发病风险(OR=0.525,95%CI:0.303~0.909)。结论 C5rs17611、rs25681及rs2300929 3个位点的基因多态性与HCC易感性有关,可作为筛查HCC好发的危险因素。     

慢性丙型肝炎患者病毒基因型与IL-28B基因型分布

目的：了解慢性丙型肝炎患者白细胞介素-28B（IL-28B）基因型多态性分布的特点及其临床意义。方法在27例慢性丙型肝炎患者,分离外周血细胞DNA,采用IPLEX Gold法检测宿主IL-28B基因多态性;分析患者IL-28B基因型与血清丙型肝炎病毒（HCV）基因型、HCV RNA载量和肝功能指标的相关性。结果在27例慢性丙型肝炎患者中,感染HCV基因1型1例（3.7%）,1b基因型7例（25.9%）,其它基因型19例（19/27,70.4%）;在IL-28B基因型中,rs12979860 CC基因型、rs12980275 AA基因型及rs8099917 TT基因型共24例（88.9%）,而IL28B rs12979860 CT基因型、rs12980275 GA基因型和rs8099917 GT基因型共3例（11.1%）;在HCV基因1型或1b型感染者中,IL28B rs12979860 CC基因型、rs12980275 AA基因型和rs8099917 TT基因型占62.5%（5/8）,而HCV其他基因型感染者IL28B rs12979860 CC基因型、rs12980275 AA基因型和rs8099917 TT基因型占100%（19/19）;HCV基因1型或1b型感染者与HCV其他基因型感染者比,其IL28B rs12979860位点、rs12980275位点和rs8099917位点基因型分布有显著性差异（P＆lt;0.01）;IL-28B基因多态性分布与患者血清HCV RNA载量或肝功能指标的变化无显著性相关。结论本组慢性丙型肝炎患者HCV基因型大多为非1型;大多数感染者IL-28B基因为rs12979860 CC、rs12980275 AA和rs8099917 TT基因型。     

120例类风湿性关节炎患者Ghrelin基因C408A多态性观察

目的 探讨Ghrelin基因C408A多态性与类风湿性关节炎（RA）的关系。方法 采用PCR-RFLP方法结合DNA测序技术检测120例RA患者（观察组）和150例健康查体者（对照组）Ghrelin基因C408A位点多态性及等位基因频率分布情况。结果 Ghrelin基因C408A位点存在碱基二态性C或A。对照组基因型CC型107例（71.3%）、CA型41例（27.3%）、AA型2例（1.4%）,观察组CC型71例（59.2%）、CA型46例（38.3%）、AA型3（2.5%）;对照组等位基因C频数255例（85.0%）,A为45例（15.0%）;观察组为等位基因C 188例（78.3%）,A为52例（21.7%）。各基因型在两组中的分布经卡方检验,P〈0.05。纯合AA型（P=0.019,OR=1.963,95%CI为1.362-5.015）与杂合的CA型（P=0.023,OR=1.971,95%CI为1.117-3.752）可能增加RA的发病风险。等位基因频率在两组间存在显著性差异,A等位基因可能增加发病风险（P=0.022,OR=1.607,95%CI为1.121-3.218）。观察组基因型为CC、CA、AA者发病年龄分别为（46.3±11.6）岁、（37.5±10.3）岁、（38.8±5.9）岁,不同基因型者发病年龄有统计学差异（F=26.067,P〈0.05）,基因型为AA者发病年龄较小。观察组基因型为CC、CA、AA者男性病例数目分别为27、18、1例,不同基因型RA患者性别分布差异无统计学意义。结论 RA患者Ghrelin基因C408A位点存在多态性。基因型为AA、CA者RA发病风险高于CC者。A等位基因者发病风险增加;基因型为AA者发病年龄较小。     

载脂蛋白M基因rs707921位点多态性与冠心病易感性的关系

目的检测载脂蛋白M(ApoM)基因rs707921位点的基因多态性,探讨其与冠心病(CHD)的相关性。方法采用单荧光标记探针技术检测111例CHD患者及248例对照组的ApoM rs707921位点单核苷酸多态性,分析其基因型和等位基因频率的分布情况。结果 ApoM rs707921位点3种基因型(AA型、AC型和CC型)在CHD组中分布频率为1.8%、13.5%和84.7%,在对照组中分布频率为2.0%、25.4%和72.6%,两组差异有统计学意义(P=0.039);ApoM rs707921位点A、C等位基因的频率在CHD组和对照组中分布频率分别为8.6%、91.4%和14.7%、85.3%,两组比较差异有统计学意义(P=0.023)。CHD组中AC+AA基因型者甘油三酯水平显著低于CC基因型者(P=0.043)。CHD组rs707921位点多态性不同基因型间冠状动脉病变严重程度差异无统计学意义(P0.05)。结论ApoM基因rs707921位点A等位基因可能降低CHD的发病风险,但与CHD的严重程度无关。     

APOBEC3G基因多态性与HBV感染后疾病转归的关系

目的 研究中国汉族人群载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽3G(APOBEC3G)基因多态性与慢性乙型肝炎和肝硬化的关系.方法 应用焦磷酸测序,检测202例HBV感染自然痊愈者(对照组)、217例慢性乙型肝炎患者和216例乙型肝炎肝硬化患者APOBEC3G基因rs8177832位点多态性,确定其基因型及等位基因分布.同时通过建立DNA池技术初步对APOBEC3G基因的另外4个标签单核苷酸多态性位点(tagSNP)rs17000736、rs17496046,rs9622924和rs2899313进行疾病相关性的初步筛选;HBV DNA检测采用实时定量PCR.结果 rs8177832在中国汉族人群中以A/A为主要存在形式,其基因型频率和等位基因频率在对照组、慢性乙型肝炎组和乙型肝炎肝硬化组中的分布差异无统计学意义.慢性乙型肝炎组中携带G等位基因的患者HBV DNA水平为6.25 log10拷贝/ml,携带A等位基因的患者为5.54 log10拷贝/ml,t=2.111,P=0.036.rs17000736和rs9622924两位点在中国汉族人群中分别只有G/G和C/C一种单一基因型存在,rs17496046和rs2899313两位点分别以G等位基因和A等位基因为主,这4个tagSNP(rs17000736、rs17496046、rs9622924和rs2899313)在对照组、慢性乙型肝炎组和乙型肝炎肝硬化组中等位基因频率差异均无统计学意义.结论 汉族人群APOBEC3G基因中rs8177832位点的多态性可能与HBV的复制有关,但这5个tagSNP可能与HBV感染后疾病的进展无关.     

白三烯A4水解酶基因多态性与结核性脑膜炎易感性的研究

目的 探讨中国汉族人群中白三烯A4水解酶（LTA4H）基因多态性与结核性脑膜炎的相关性。 方法 应用SNaPshot技术检测48例结核性脑膜炎患者和70名健康对照者LTA4H基因中rs1978331,rs2247570,rs2660898,rs2660845多态位点的等位基因、基因型和单体型分布频率,采用SHEsis软件进行相关统计学分析。 结果 对照组与患者组rs1978331多态性位点C等位基因例数分别为83和40、频率分别为59.3%和41.7%,T等位基因例数分别为57和56、频率分别为40.7%和58.3%,差异有统计学意义（χ²=7.080,P=0.008）;rs1978331位点CC、CT和TT基因型在对照组例和患者组中的例数分别为12、33、25和20、16、12,分布频率分别为17.1%、47.1%、35.7%和41.7%、33.3%、25.0%,差异有统计学意义（χ²=8.670,P=0.013）;rs2660898位点AA、AC和CC基因型在对照组和患者组中的数分别为28、32、10和20、12、16,分布频率分别为40.0%、45.7%、14.3%和41.7%、25.0%、33.3%,差异有统计学意义（χ²=7.980,P=0.019）;对照组与患者组单体型CACT频率分别为26.3%和45.8%,差异有统计学意义（χ²=7.349,P=0.007）。 结论 LTA4H基因中rs1978331基因多态性位点等位基因、rs1978331和rs2660898基因多态性位点基因型、单倍体型CACT与中国汉族人群结核性脑膜炎的易感性存在相关性。     

PPIA基因rs6850位点多态性与冠心病合并2型糖尿病的关系

目的 探讨PPIA基因rs6850位点多态性与冠心病（CAD）患者合并2型糖尿病（T2DM）的关系。方法选取CAD、CAD合并T2DM患者各100例,采集患者静脉血,采用直接测序法检测PPIA基因rs6850位点的基因多态性。比较两组基因型和等位基因频率分布情况,对比不同基因型患者的临床资料,采用Logistic回归分析冠心病患者发生2型糖尿病的影响因素。结果 PPIA基因rs6850位点基因型、等位基因、显性模型和隐性模型在CAD+T2DM组和CAD组间的分布差异无统计学意义（P均>0.05）。GA基因型携带者BMI较AA、GG基因型携带者升高（P均<0.05）。调整混杂因素后,Logistic回归分析显示,GG、GA、AA三种基因型均不是冠心病患者发生2型糖尿病的影响因素（P均>0.05）。结论 PPIA基因rs6850位点多态性与冠心病合并2型糖尿病患者的遗传易感性无关。     

汉族人群乙型肝炎病毒感染者外周血IL-28B基因多态性研究*

目的 分析乙型肝炎病毒（HBV）感染者外周血IL-28B基因型和等位基因频率分布,并探讨其与疾病病程和进展的关系。方法 本研究纳入江苏籍汉族健康人群145例和453例HBV感染者,后者包括无症状HBV携带者（ASC）45例,慢性乙型肝炎患者（CHB）181例,肝硬化（LC）患者69例,肝细胞癌（HCC）患者79例,乙型肝炎肝衰竭（LF）患者79例,采用PCR法和直接测序法检测外周血IL-28B基因rs12979860和rs8099917多态性位点。采用Pearson x²检验对IL-28B rs8099917与rs12979860位点进行Hardy-Weinberg平衡检验,计量资料以（x±s）表示,计数资料采用例数表示。应用SPSS 17.0软件进行方差分析、x²检验和Binary Logistic回归分析。结果 IL-28B基因rs12979860位点有CC、CT和TT 3个基因型,LF患者CC型和C等位基因频率分别为96.2%和98.1%,显著高于健康人群的87.6%和93.1%（OR=0.257,95%CI=0.068~0.973,P=0.045;OR=0.255,95%CI=0.070~0.928,P=0.038）;IL-28B基因rs8099917位点有TT 、TG和GG 3个基因型,LC患者TT型和T等位基因频率分别为92.8%和96.4%,显著高于健康人群的86.2%和92.4%（OR=0.288,95%CI=0.087~0.948,P=0.041;OR=0.299,95%CI=0.096~0.926,P=0.036）。结论 江苏地区汉族人群IL-28B基因多态性与HBV感染后不同疾病表型相关,IL-28B基因rs12979860的C等位基因和IL-28B基因rs8099917的T等位基因可能是HBV感染后病情进展的影响因素。     

TM基因多态性与急性冠脉综合征的相关性研究

目的探讨血栓调节蛋白（TM）基因多态性与急性冠脉综合征（ACS）的关系。方法首先通过文献阅读和生物学信息分析,筛选出TM基因候选单核苷酸多态性（SNP）。然后收集兰州大学第一医院心血管内科对照组（168例）和ACS组（201例）,采用病例对照研究,基于sequenom飞行时间质谱法的基因测序技术,观察TM候选SNP位点基因型在对照组和ACS组的分布。结果筛选出4个SNP,包括：rs13306848G/A,rs1042579C/T,rs3176123A/C和rs1042580A/G。在对照组和ACS组,rs13306848 G/A的GG基因型分别为128例（76.2%）和169例（84.1%）,GA基因型分别为38例（22.6%）和31例（15.4%）,AA基因型分别为2例（1.2%）和1例（0.5%）;rs1042579 C/T的CC基因型分别为97例（57.7%）和131例（65.2%）,CT基因型分别为66例（39.3%）和,63例（31.3%）TT基因型分别为5例（3%）和7例（3.5%）;rs3176123A/C的AA基因型分别为95例（56.5%）和125例（62.2%）,AC基因型分别为66例（39.3%）和68例（33.8%）,CC基因型分别为7例（4.2%）和8例（4%）。两组间rs13306848G/A、rs1042579 C/T和rs3176123A/C位点分布差异均无统计学意义（P=0.057,P=0.143,P=0.222）,且对照组与ACS各亚组相比,此三个位点的分布差异亦无统计学意义（P〉0.05）。结论 TM rs13306848G/A、rs1042579 C/T和rs3176123A/C多态性与ACS及其亚组均不相关。     

TBX5基因rs3825214位点多态性和心房颤动的相关性

目的探讨TBX5基因多态性与心房颤动的相关性。方法房颤患者100例(房颤组)和非房颤患者(对照组)107例进行TBX5基因rs3825214单核苷酸多态性和房颤的关联研究。所有患者均采集外周血提取基因组DNA,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术(PCR-RFLP)检查患者TBX5基因rs3825214多态性的基因型和等位基因分布。结果 TBX5基因rs3825214位点在入选人群中存在多态性,分别为GG、AG和AA型,其基因型频率在房颤组和对照组分别依次为28.0%,60.0%,12.0%和15.9%,50.5%,33.6%。GG基因型在房颤组的频率分布显著高于对照组(P=0.035),AA基因型在房颤组的频率分布明显低于对照组(P<0.001)。G和A等位基因频率在房颤组和对照组分别为56.0%,44.0%和41.1%,48.9%,G和A等位基因频率在两组间的差异有统计学意义(P=0.001)。结论 TBX5基因rs3825214位点多态性与房颤的发生有相关性,G等位基因可能是房颤的易感基因,GG基因型可能增加了房颤发生的危险性。     

干扰素-α/β受体基因多态性与HBV感染结局的关系

目的：探讨IFN-α/β受体基因多态性与HBV（乙肝病毒）感染不同临床转归之间的相关性。方法：应用基因测序检测80例自限性HBV感染者（SR组）和220例慢性持续性HBV感染者（PC组）[包括无症状HBV携带者（AsC组）88例和进展性肝病者132例（慢性乙型肝炎76例、肝硬化56例）]的IFN（干扰素）-α/β受体基因-568G→C、-408C→T两个位点的多态性,比较各组间基因型和等位基因频率。结果：①-568G→C位点多态性中,PC组总GG基因型频率比SR组显著升高,差异有显著性意义（P〈0.05）。等位基因G的频率,进展性肝病组均显著高于SR组（P〈0.05）。②-408C→T位点多态性中,进展性肝病组总CC基因型显著高于SR组（P〈0.05）,而肝硬化组和慢性乙型肝炎组之间,SR组和AsC组之间差异均无显著性。结论：IFN-α/β受体基因-568G→C、-408C→T两个位点的多态性,与HBV感染不同结局之间有关,携带-568G→C GG基因型和G等位基因的HBV感染者容易发展为慢性,G等位基因更趋向于进展性肝病,而携带-408C→T CC基因型患者则容易进展为慢性乙型肝炎甚至肝硬化。     

Evaluation of complement factor 5 variants as genetic risk factors for the development of advanced fibrosis in chronic hepatitis C infection

BACKGROUND/AIMS: Intercross studies in inbred mice susceptible or resistant to liver fibrosis revealed complement factor 5 as a quantitative trait gene associated with the development of fibrosis. In 277 patients with hepatitis C, two C5 SNPs, rs17611 and rs2300929, have been associated with advanced fibrosis. METHODS: We investigated the association of these C5 SNPs with advanced fibrosis in 1435 HCV infected patients and in 1003 patients with other liver diseases. We performed genotyping with melting curve analysis using fluorescence resonance energy transfer probes in the LightCycler. RESULTS: The defined high-risk genotypes (AA and TT) and alleles (A and T) were not associated with advanced fibrosis in HCV patients when Chi square testing and logistic regression analysis were applied (rs17611A 0.45 in F0-1 vs. 0.43 in F2-4, P=0.31; rs2300929T 0.91 F0-1 and 0.91 in F2-4, P=0.82). In the group of patients with liver diseases other than HCV we neither found an association of the C5 SNPs with advanced fibrosis nor an overrepresentation of the SNPs in patients with cirrhosis. CONCLUSIONS: We found no evidence that these C5 SNPs are genetic risk factors for the development of advanced fibrosis in chronic HCV infection or other chronic liver diseases.     

ICAM-1基因多态性与HBV感染不同临床结局之间的关系

目的探讨细胞间黏附分子l（ICAM-1）基因多态性与HBV感染不同临床结局之间的相关性。方法应用病例．对照研究和聚合酶链反应-序列特异性引物法（PCR-SSP）检测118例慢性持续性HBV感染患者（包括无症状HBV携带者、慢性乙型肝炎、乙肝后肝硬化患者）和60例HBV急性自限性感染者的ICAM-1基因G241R（G／A）、K469E（A／G）两个位点的多态性，比较各组间基因型和等位基因频率，并对数据进行统计分析。结果①ICAM-l G241R（G／A）位点总GG基因型频率在HBV慢性持续性感染组高于急性自限性感染组，但差异无统计学意义（X^2=1．38，P〉0．05）。②ICAM-1 K469E（A／G）位点，进展性肝病组（慢性乙型肝炎和肝硬化）总KK基因型和总K等位基因的频率与无症状携带者组和自限性感染组相比显著增高（X^2=8．60，P〈0．05；X^2=5．07，P〈0、05），而在自限性感染和无症状携带者之间却无显著差异。结论携带ICAM-1 K469E KK基因型和K等位基因的患者容易进展成慢性乙型肝炎甚至肝硬化，可致慢性HBV感染患者病情进展。     

血清IL-17水平及其基因多态性与HBV感染临床转归之间的关系研究*

目的 探讨血清白介素（IL）-17水平和IL-17-197A/G基因单核苷酸多态性与乙型肝炎病毒（HBV）感染临床转归之间的关系。方法 2015年3月~2017年8月在我院就诊的乙型肝炎肝硬化40例,慢性乙型肝炎120例,无症状慢性HBV携带者60例和自限性HBV感染者80例。采用酶联免疫吸附试验检测血清IL-17水平,使用全自动生化仪检测血浆丙氨酸氨基转移酶（ALT）、天冬氨酸氨基转移酶（AST）和总胆红素（TBIL）水平,采用多聚酶链反应结合荧光探针DNA扩增技术检测血清HBV DNA载量,使用单核苷酸检测试剂盒检测IL-17-197A/G基因单核苷酸多态性。结果 乙型肝炎肝硬化组血清IL-17水平显著高于慢性乙型肝炎组、无症状慢性HBV携带者组和自限性HBV感染组（F_3,296=102.8,P均<0.05）;慢性乙型肝炎组血清IL-17水平显著高于无症状慢性HBV携带者组和自限性HBV感染组（P均<0.05）;在乙型肝炎肝硬化组,血清高HBV DNA载量组（>1×10⁵ copies/mL）血清IL-7水平更高（t=5.1,P<0.05）,血清ALT>40 U/L组血清IL-7水平更高（t=10.7,P<0.05）;在慢性乙型肝炎组和乙型肝炎肝硬化组,血清AST>40 U/L组血清IL-7水平更高（t=24.5,P<0.05;t=22.4,P<0.05）,血清TBIL>20 μmol/L组血清IL-7水平更高（t=7.3,P<0.05;t=12.8,P<0.05）;肝硬化患者IL-17-197 AA、AG和GG基因型分别为75.0%、10.0%和15.0%,等位基因A分布频率为57.5%,G分布频率为42.5%,而慢性乙型肝炎患者则分别为25.8%、16.7%、57.5%和34.2%、65.8%,组间差异显著（P<0.05）,乙型肝炎肝硬化组以IL-17-197 AA基因型和A等位基因分布频率为主,慢性乙型肝炎组以GG基因型和G等位基因分布频率为主,HBV携带者组以AA基因型和A等位基因分布为主,自限性HBV感染者以GG基因型和G等位基因分布为主。结论 宿主免疫水平和遗传背景的相互作用决定了HBV感染的临床转归,IL-17在乙型肝炎病毒感染慢性化进程中发挥了重要作用。IL-17-197A/G位点的AA基因型和A等位基因可能是HBV易感的宿主基因,增加了HBV感染的不良转归。     

急慢性HBV感染者外周血白细胞IL-6-572位点基因多态性分析

目的探讨成年人群IL-6基因启动子区-597G/A和-572C/G位点多态性与HBV感染的关系。方法采用聚合酶链反应-限制性片断长度多态性法检测179例HBV感染者(包括118例慢性乙型肝炎和61例急性乙型肝炎)和120例健康对照人群外周血IL-6基因启动子区-597G/A和-572C/G位点基因分型。结果本研究在-597位点仅发现GG基因型,未发现GA或AA基因型,而-572位点发现CC、CG和GG基因型;对179例HBV感染者和120例健康对照人群检测发现,IL-6-572 GG基因型频率分别为15.1%和19.1%(P>0.05),而118例慢性乙型肝炎患者GG基因型(18.7%)明显高于61例急性乙型肝炎(8.2%)和健康人(11.7%),差异有统计学意义(P<0.05);在HBV感染患者G等位基因频率(47.9%)显著高于健康对照组(35.2%),但差异无统计学意义(P>0.05),而慢性乙型肝炎患者G等位基因频率(37.7%)明显高于急性乙型肝炎(22.1%)和健康对照组(26.7%),差异有统计学意义(P<0.05);多因素非条件Lo-gistic回归分析显示-572基因多态性与HBV感染后慢性化有关[P=0.038,OR=3.788(1.075～13.333)]。结论IL-6-572C/G基因多态性与HBV感染慢性化有关。     

鸟氨酸脱羧酶抗酶抑制因子1多态性与乙型肝炎肝硬化的关系

目的 研究一种高加索人群丙型肝炎肝硬化风险评分模型(cirrhosis risk score,CRS)相关基因的多态性与中国人群乙型肝炎肝硬化的关系,评估该模型在乙型肝炎肝硬化中的应用价值.方法 用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱法检测相关的11个单核苷酸多态性位点,研究人群包括肝硬化组患者和对照组无肝硬化表现者,分析各位点与肝硬化的关系,比较肝硬化组和对照组CRS值的差异.用x2检验检测哈维平衡验证样本的群体代表性.两组计量资料的比较用t检验或Wilcoxon秩和检验.单个单核昔酸多态性基因型等分类数据与肝硬化发生的关系用Pearson x2检验,差异有统计学意义的单核苷酸多态性位点进一步用Logistic回归分析判断在显性模型、隐性模型和加性模型下基因型与肝硬化发生的关系,计算比值比及95%可信区间,比值比经性别和年龄校正.结果 鸟氨酸脱羧酶抗酶抑制因子1基因的rs2679757位点与肝硬化的发生相关(x2=6.79,P＜0.05),与AA纯合子相比,携带危险等位基因G的GG+AG基因型显著增加肝硬化的发生风险,比值比为1.63,95%可信区间为1.13～2.35.位于Toll样受体4基因的rs4986791位点和鸟氨酸脱羧酶抗酶抑制因子1基因的rs62522600位点在中国人群中无多态性基因型.其他研究位点与肝硬化的发生无相关性(P＞0.05).肝硬化组和对照组的CRS中位数分别为0.57和0.62,两组比较,差异无统计学意义(P＞0.05).结论 鸟氨酸脱羧酶抗酶抑制因子1多态性rs2679757与乙型肝炎肝硬化的发生相关.高加索人群CRS模型相关的两个多态性位点在中国人群中缺乏多态性,该CRS对评估有无乙型肝炎肝硬化的发生无明显价值,其他多态性位点仍需进一步临床验证.

Abstract：

Objective A cirrhosis risk score (CRS) comprised of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in seven genes that predicts the risk of cirrhosis in Caucasian hepatitis C has been reported. The present study was to evaluate the association of 11 separate but related SNPs and the CRS with cirrhosis risk in Chinese hepatitis B patients. Methods A total of 563 Chinese subjects with persistent HBV infection (349 with evident liver cirrhosis and 214 without cirrhosis clinically or pathologically) were studied. The candidate SNPs were detected with a matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) method. The allele frequency and genotype distribution of each polymorphism as well as the CRS value within the cirrhosis and non-cirrhosis subjects were compared. Results The rs2679757 polymorphism of the antizyme inhibitor 1 (AZIN 1) gene was associated with the risk of cirrhosis ( x 2 = 6.79,P = 0.03, odds ratio for GG+AG versus AA = 1.63, 95% confidence interval = 1.13-2.35). A gene variant (rs886277) in the transient receptor potential cation channel subfamily M, member 5 gene (TRPM5) was associated with liver cirrhosis, but did not reach statistical significance ( x 2 = 5.77, P = 0.06). Two SNPs (rs4986791, rs62522600) are not polymorphic in Chinese. Genotype frequencies of other SNPs were not different between the cirrhosis and non-cirrhosis groups. The overall CRS values were not different between the cirrhotic and non-cirrhotic groups (median value 0.57 versus 0.62, Z = -1.05, P = 0.29). Conclusions SNP rs2679757 in the AZIN1 gene is associated with the risk of HBV-related liver cirrhosis in Chinese. The CRS for Caucasian population has limited applicability for predicting liver cirrhosis in Chinese hepatitis B patients. SNPs associated with cirrhosis prognosis in hepattis B patients and liver diseases with other etiologies warrant further clinical validation.     

慢性乙型肝炎病毒感染者转化生长因子-β1基因单核苷酸多态性分析

目的 探讨转化生长因子(TGF)-β1单核苷酸多态性(SNP)与慢性HBV感染的关系.方法 采用PCR方法,对74例慢性乙型肝炎患者、41例乙型肝炎肝硬化患者和41例健康人外周血细胞基因组DNA的TGF-β1基因中三个SNP位点(rs2241715、rs2241716、rs4803455)进行基因分型.数据分析采用χ2或Fisher精确概率法检验.结果 健康人的 rs2241715基因型及等位基因频率与慢性乙型肝炎和肝硬化患者相比,差异有统计学意义(χ2=11.419,P＜0.01或χ2=6.218χ2=5.961;P＜0.05),rs2241715 T/T基因型的个体患慢性乙型肝炎和乙型肝炎肝硬化的相对危险度分别为其他型的2.974倍(95%CI=1.209～7.314,P=0.018)和3.228倍(95%CI=1.201～8.675,P=0.020),rs2241716和rs4803455位点则无上述相关性.结论 TGF-131基因的rs2241715 SNP位点T/T基因型可能与慢性HBV感染密切相关.     

IL-28B基因变异与丙型肝炎的易感性及其自然清除的关系

目的探讨IL-28B基因变异与丙型肝炎的易感性和丙型肝炎病毒（HCV）自然清除之间的关系。方法利用焦磷酸测序的方法对411例HCV感染者（男性225人,女性186人）及100例健康对照人群进行了IL-28B基因变异位点rs12979860的多态性检测;对HCV感染者进行病毒定量的检测,比较HCV感染人群和健康对照人群,慢性丙型肝炎（CHC）人群和丙型肝炎自愈人群IL-28B基因变异位点的差异以及不同基因型的携带者病毒定量的差异。结果中国健康人群IL-28B基因变异位点rs12979860的最小等位基因频率为6%,与日本人相近,与欧洲人群相差较大。SNP（rs12979860）位点的等位基因频率和基因型频率在HCV感染人群和健康对照人群之间差异无统计学意义（P=0.066;P=0.072）,C/C基因型CHC人群病毒定量水平高于C/T基因型,二者之间差异有统计学意义（P=0.02）;丙型肝炎自愈人群中C/C基因型和C/T基因型差异无统计学意义（P=0.64）。结论 CHC人群rs12979860 SNP基因型与健康人群表达无明显差别,该基因型（rs12979860）不是HCV的易感基因,其CC基因型并不能预测丙型肝炎发生自愈的病程。     

Genetic polymorphism in cyclooxygenase-2 promoter affects hepatic inflammation and fibrosis in patients with chronic hepatitis C

Summary. Cyclooxygenase (COX)-2 is involved in inflammation, anti-apoptosis and carcinogenesis. The -1195GG genotype of single nucleotide polymorphism (SNP) in COX-2 promoter was associated with low platelet counts in patients with chronic hepatitis C. Polymorphism of patatin-like phospholipase domain-containing protein 3 (PNPLA3) gene (rs738409 C>G) have been reported to be associated with cirrhosis, and the major genotype of SNPs near interleukin (IL)28B are related to viral clearance. The present study was designed to assess the contribution of these SNPs to disease progression in patients with chronic hepatitis C. The study enrolled 220 Japanese patients with chronic hepatitis C. Three SNPs, -1195 COX-2, PNPLA3 and IL28B (rs8099917), were genotyped in order to analyze their association with hepatic fibrosis and inflammation. The -1195GG genotype in COX-2 was associated with advanced fibrosis and higher levels of inflammation in the liver tissues. The major genotype of IL28B was also associated with advanced fibrosis, but the polymorphism of PNPLA3 was neither associated with fibrosis nor inflammation. Multivariate analysis showed that -1195GG in COX-2 is an independent factor associated with advanced fibrosis, while the major genotype of IL28B and HCV genotype 2 were other independent factors. In conclusion, the -1195GG genotype in COX-2 is a genetic marker for liver disease progression, while the PNPLA3 genotypes are not associated with disease progression in Japanese patients with chronic hepatitis C.