m6A-SNPs及其在复杂疾病分子遗传学研究中的应用

N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine, m6A)是真核生物mRNA最常见的一种转录后修饰, 在多种生物过程中具有关键作用。有研究表明单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)可以通过改变靶基因基序影响其m6A修饰, 进而对疾病的发生发展产生影响。随着高通量测序技术的不断发展, 越来越多的可能影响m6A修饰的SNPs(m6A-SNPs)被鉴定出来。文章主要就m6A-SNPs在复杂疾病分子遗传学研究中的进展进行综述。     

21单体综合征流产胎儿绒毛膜组织DNA 6mA的修饰研究

目的探究DNA的N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenine,6mA)修饰在21单体综合征流产胎儿绒毛膜组织基因组中的分布特点及与21单体综合征临床症状的关系。方法从4例实验组流产胎儿绒毛膜组织(核型为45, XY,-21)样本和4例对照组流产胎儿绒毛膜组织(核型为46, XY)样本中提取DNA,经质量和纯度检测合格后,采用6mA抗体进行染色质免疫共沉淀反应(chromatin immunoprecipitation, ChIP),之后进行测序。对得到的测序数据进行生物信息学分析,研究6mA位点修饰在实验组和对照组中的差异。结果峰(peaks)的相关差异基因的分析表明,在全基因组范围内,对照组相比实验组拥有更多的含6mA修饰的基因,其中对照组特有的含6mA修饰的基因为4607个,实验组仅有1059个。在21号染色体范围内,两组之间的这一差异更加明显。在实验组中特有的含6mA的基因为1769个,而对照组则高达8032个。不同范围内的分析结果都表明在21单体综合征中基因6mA修饰的水平偏低。GO富集分析和KEGG富集分析结果均表明21单体综合征中缺失的6mA基因与胚胎生长发育有着密切...     

胸腺基质淋巴细胞生成素对免疫细胞的调控作用及其研究进展

胸腺基质淋巴细胞生成素(thymic stromal lymphopoietin, TSLP), 作为一种多效性的细胞生长因子, 不仅参与人体皮肤纤维化、表皮增生以及血管生成等过程, 同时还对免疫相关疾病(如呼吸系统疾病、过敏性疾病等)中多种免疫细胞具有调控作用, 是免疫细胞的关键调控因子。TSLP主要通过TSLP受体介导的JAK/STAT、NF-κB等信号通路, 参与调控多种固有免疫细胞(如树突状细胞、肥大细胞、巨噬细胞、嗜酸性粒细胞、嗜碱性粒细胞、自然杀伤性T细胞、固有淋巴细胞)以及适应性免疫应答细胞(T和B淋巴细胞等)的分化、增殖过程与功能。现就近年来TSLP对多种免疫细胞增殖、分化及功能的调控研究进展作一综述。     

核糖体18S rRNA m6A甲基转移酶METTL5的研究进展

<正>N⁶-甲基腺嘌呤(N⁶-methyladenosine, m⁶A)即在腺苷酸的第6位氮原子处发生甲基化，是真核生物核糖核酸(ribonucleic acid, RNA)普遍的表观遗传修饰之一，存在于多种类型的RNA分子上，参与生物发生、稳定性调节、半衰期控制和前体信使RNA(messenger RNA, mRNA)剪接、输出及翻译等诸多关键细胞过程。m⁶A甲基化修饰是一种动态可逆的过程，涉及到甲基化、去甲基化和甲基化修饰位点的识别，分别由m⁶A甲基转移酶、m⁶A去甲基化酶和m⁶A甲基化阅读蛋白介导^[1-3]。     

RNA m6A去甲基化酶ALKBH5基因敲除对老年小鼠小脑形态和功能的影响

目的观察RNA m6A去甲基化酶ALKBH5基因敲除之后对老年小鼠小脑形态和功能的影响, 探究ALKBH5在小脑退行性病变中的作用。方法免疫印迹实验检测不同年龄C57BL/6野生型小鼠(包括2月龄、6月龄、12月龄、18月龄)小脑中ALKBH5的蛋白水平。通过免疫组织化学实验检测中年(12月龄)及老年(18月龄)野生型小鼠和ALKBH5基因敲除(ALKBH5-/-)小鼠中NeuN、Calbindin-D28K、MAP2、胶质纤维酸性蛋白等蛋白的表达情况。平衡木实验和步态实验检测小鼠平衡能力以及运动协调能力。结果 ALKBH5蛋白在小脑中的表达水平随着小鼠生理性衰老的进行而逐渐升高。在中年小鼠中, 野生型和ALKBH5-/-小鼠的体重、脑重以及小脑的形态大小没有明显差别, 同时颗粒神经元、浦肯野细胞及神经元树突的形态和数量均未见明显改变。在老年小鼠中, 相较于野生型小鼠, ALKBH5-/-小鼠的体重、全脑重和小脑重分别下降15%、10%和21%(P<0.05)。ALKBH5在浦肯野细胞中的表达高于其他类型的神经细胞, 与之对应在老年ALKBH5-/-小鼠中浦肯野神经元的数量下降4...     

LYPD1, 一种免疫细胞浸润调控因子参与卵巢癌的不良预后

目的探究Ly6/Plaur结构域包含蛋白1(Ly6/ Plaur domain-containing 1, LYPD1)在卵巢癌中的作用、潜在机制以及与卵巢癌患者不良预后的关系。方法癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据中分析不同癌症中LYPD1的表达。同时, 以TCGA数据库中卵巢癌患者临床生存数据评价LYPD1对卵巢癌患者预后的影响。采用Metascape数据库对LYPD1在卵巢癌生物学功能进行富集分析。CCK-8方法检测细胞增殖活性, 流式细胞术检测细胞凋亡。Western印迹方法检测低表达LYPD1后对于SKOV3和A2780细胞中NF-κB蛋白的影响。肿瘤免疫评估资源(Tumor Immune Estimation Resource, TIMER)数据库分析LYPD1对于卵巢癌免疫细胞浸润的影响。结果 LYPD1在卵巢癌中高表达, 且在卵巢癌中的总生存率较低, 同时LYPD1与疾病特异性生存率和无进展期相关。此外, 低表达LYPD1能够抑制卵巢癌细胞增殖活性, 诱导凋亡。I-κB激酶/NF-κB信号通路是LYPD1参与卵巢癌恶性进展的...     

固有免疫细胞在宿主抗烟曲霉免疫中的作用

烟曲霉是一种环境中丝状真菌, 也是一种机会致病菌, 其感染宿主后能够引起慢性曲霉病和侵袭性曲霉病。曲霉病的发生发展是宿主与病原体相互作用的结果, 免疫状态不同的患者感染曲霉后临床症状存在差异。宿主对吸入真菌孢子的固有免疫应答是曲霉病发生的关键决定因素。本综述主要总结了目前对烟曲霉孢子侵入后宿主固有免疫细胞防御真菌感染的作用, 包括巨噬细胞、中性粒细胞、自然杀伤细胞、自然杀伤T细胞及肥大细胞, 为曲霉感染的致病机制解析、临床防治等相关研究提供一定的参考。     

DNA甲基化在法医学中的研究进展和应用现状

目前表观遗传学在各个领域展开深入研究, 因其不以DNA序列改变为前提的特殊遗传模式, 而在法医学中具有很高的应用和研究价值。在表观遗传学中, DNA甲基化作为发现最早且研究最多的表观遗传现象, 其为解决同卵双生子的鉴别、年龄的推断、组织体液的推断等法医学实践问题提供了新的思路和方法。本文将对法医学中DNA甲基化的常用检测方法进行总结和归纳, 并对DNA甲基化在同卵双生子的鉴别、年龄的推断和组织体液的推断中的研究进展和应用现状进行阐述。以此展示了DNA甲基化和法医学的密切联系, 并对其在法医学领域中的研究价值和应用前景进行了讨论。     

急性髓系白血病患者表观遗传学修饰基因突变的分析

目的探讨急性髓系白血病(AML)患者表观遗传学修饰基因突变(EMMs)的携带率及其临床特征。方法选取2011年5月至2021年2月于连云港市第一人民医院初诊的172例AML患者为研究对象。应用二代测序技术检测42种髓系基因的变异情况, 回顾性分析EMMs患者的临床及分子学特征, 以及去甲基药物(HMAs)对其生存的影响。结果在172例初诊的AML患者中, 71例(41.28%)携带EMMs [EMMs(+)], 变异基因分别为TET2(14.53%, 25/172)、DNMT3A(11.63%, 20/172)、ASXL1(9.30%, 16/172)、IDH2(9.30%, 16/172)、IDH1(8.14%, 14/172)、EZH2(0.58%, 1/172)。EMMs(+)患者的外周血血红蛋白低于EMMs(-)患者(72 g/Lvs. 88 g/L, Z=-1.985, P<0.05)。老年AML患者的EMMs(+)携带率显著高于青年患者[71.11%(32/45)vs. 30.70%(39/127), χ2 = 22.38, P<0.001]。EMMs与NPM1...     

腺病毒肝炎

自2022年4月以来, 儿童不明原因重症肝炎在全球多国报道。截止5月11日, 全球已有20多个国家报告了至少448例不明原因儿童急性重症肝炎病例。鉴于部分病例检测出腺病毒, 因此腺病毒感染被怀疑是造成此次儿童急性重症肝炎的可能病因。本文就既往腺病毒感染引起肝炎(腺病毒肝炎)的流行病学、临床特征及发病机制等方面的研究和报道进行简单综述, 为我国开展不明原因重症肝炎的预防和控制提供参考。     

FRCs调控淋巴结微环境的研究进展

成纤维网状细胞(fibroblastic reticular cells, FRCs)是淋巴结内一类特殊的基质细胞。近年来大量研究发现, FRCs通过构建导管网络支撑淋巴结的三维结构, 还产生细胞外基质, 分泌细胞因子和趋化因子, 参与调控淋巴结微环境的免疫稳态。FRCs在炎症、肿瘤和其他免疫性疾病的发生发展过程中发挥重要作用。文章介绍了FRCs在淋巴结内的分化、分布及功能, 阐述了FRCs调控淋巴结微环境的相关机制及意义。     

微小RNA的差异表达与胚胎质量的相关性

目的探讨微小RNA(micro RNA, miRNA)差异表达与胚胎质量的相关性, 为胚胎的植入前选择提供新的依据。方法用TaqMan微小RNA阵列(MicroRNA Array)对8个囊胚样本进行miRNA表达谱检测, 筛选稳定高表达且有价值的miRNA。扩大样本量后选择囊胚, 针对筛选的miRNA进行逆转录PCR检测, 同时采用二代测序平台检测胚胎的染色体异常, 对结果进行分析比较。结果 MicroRNA Array检测发现mir-720、mir-372、mir-886-3p和mir-512-3p表达量较高, 而mir-145表达量较低, 推测与早期胚胎发育相关。选择56个废弃囊胚, 对上述5种miRNA进行检测, 结果显示mir-145和mir-886-3p在染色体正常组中显著低表达。mir-145以相对表达量9作为阈值, mir-886-3p以相对表达量3作为阈值, 其以上均未见胚胎染色体检测为正常者。结论特定的miRNA表达差异与胚胎染色体异常存在相关性, 有可能作为一种新的胚胎选择的生物标记。     

人腺病毒重组研究进展

人腺病毒(HAdV)是急性呼吸道感染、腹泻、急性眼角结膜炎等多种疾病的常见病原体。许多研究表明HAdV基因组易发生基因重组, 进而形成新的基因型别, 迄今已报道的104个型别中53～104型为重组形成的新基因型, 在全球范围内引起多次疫情, 对疾病的防控提出新挑战。目前对其重组研究较少, 亟需深入研究以揭示重组机制及临床意义。     

人腺病毒流行病学研究进展

截至2022年3月, 人腺病毒(human adenoviruse, HAdV)已明确了111种型别, 分属7个亚属(A-G)。HAdV感染后可诱发多种疾病, 目前在全球范围内流行, 在人员密集或封闭区域易暴发, 其暴发的季节性也随气候、时间及地区等而变化, 缺乏明显的规律。近年来一些新的重组HAdV相继报道, 组织嗜性改变, 形成高致病力、高传染性的新型毒株, 且易与其他呼吸道病毒共感染, 这给疾病监测和防控带来极大的挑战。本文就HAdV的流行学特征研究进行综述, 为疾病预防控制和疫苗研制提供参考。     

轮状病毒疫苗应用研究进展

轮状病毒可导致婴幼儿严重腹泻, 最有效的预防手段是为婴幼儿接种轮状病毒疫苗。轮状病毒疫苗在全球的广泛应用, 显著降低轮状病毒疾病负担, 且具有较高的成本收益。目前我国未将轮状病毒疫苗纳入免疫规划, 疫苗接种率较低。本文通过阐述轮状病毒疫苗种类、覆盖率和接种率、经济学评价、对毒株型别的影响, 以及疫苗存在的问题, 了解疫苗研究进展, 推进建立我国轮状病毒疫苗监测, 促进轮状病毒疫苗在我国使用。     

长新冠研究进展

长新冠是COVID-19急性感染期后产生的多系统性疾病, 现已报道的长新冠相关症状有200多种, 累及机体的多个器官, 约有10%以上的长新冠患者产生长新冠症状。随着研究的深入, 有关长新冠的病理变化、风险因素以及疾病特征的研究证据越来越多。虽然这些发现对理解长新冠至关重要, 但目前仍有许多问题尚未解决。本文从长新冠的症状、患病率、发病机制、诊断标准、风险因素以及新发疾病等方面对相关研究进行综述, 以期为读者提供长新冠相关研究的参考信息。     

肠道病毒基因重组研究进展

肠道病毒(enterovirus, EV)可引起多种感染性疾病, 临床表现复杂多样。作为RNA病毒, EV的RNA依赖的RNA聚合酶缺乏校对功能, 导致其基因发生高频率的突变和重组, 从而使EV获得进化优势, 进而发生对宿主的免疫逃逸、对抗病毒药物的抗性, 也可使病毒的传播力和致病性增强或组织嗜性发生改变。本文综述了EV的重组机制, 并对部分重要型别和新型别EV的重组情况以及重组对病毒流行、致病性的影响进行了概述。     

膀胱癌分子病理学研究进展

膀胱癌具有高度的组织形态学异质性, 非肌层浸润性膀胱癌、肌层浸润性膀胱癌和转移性膀胱癌的分子特征不同。随着对膀胱癌分子特征的认识不断深入, 国际上提出了几种膀胱癌的分子分型, 以及这些分子分型与临床的相关性。本文阐述了肌层浸润性膀胱癌的分子分型、非肌层浸润性膀胱癌以及转移性膀胱癌的分子特征, 并对肌层浸润性膀胱癌的组织学类型与分子分型的关系, 以及分子分型在膀胱癌治疗和预后中的价值进行了叙述。     

YTHDC1 m6A修饰调控与疾病发病机制的研究进展

<正>表观遗传学是指DNA序列不变的情况下，基于非基因序列改变所致的基因表达水平的变化^[1]，如DNA甲基化^[2]、RNA甲基化^[3]、组蛋白修饰^[4]、染色质构象变化^[5]等。表观遗传学在真核生物中的变化主要是调控细胞增殖^[6-7]、分化^[8]、代谢^[3,9]、周期循环^[10]以及免疫调控^[11]等生物学过程，这一过程中通过某些调控分子量的变化或发生结构修饰变化等，进而靶向调节下游靶基因的生物学效应。     

甲基丙二酸血症cblA型12例分析

目的 探讨甲基丙二酸血症(methylmalonic acidemia,MMA)cblA型患儿的临床特点、基因变异类型及治疗效果。方法 分析12例cblA型MMA患儿的临床表现,治疗方案及预后,对先证者及其父母进行MMAA基因的变异分析。结果 MMA cblA型患儿主要表现为呕吐、气促和嗜睡。维生素B12治疗对11例(91.7%)患儿有效。治疗后患儿血丙酰肉碱、丙酰肉碱与乙酰肉碱比值、尿甲基丙二酸及甲基枸橼酸水平均显著降低,差异有统计学意义(均P < 0.05)。8例患儿生长发育正常(66.7%),4例智力运动发育落后(33.3%)。检测到14种MMAA基因变异,包括6种新变异：c.54delA(p.A19Hfs*43)、c.275G>A(p.G92V)、c.456delT(p.G153Vfs*8)、c.667dupA(p.T223Nfs*4)、c.1114C>T(p.Q372X)和c.1137₁138delCA(p.F379Lfs*27)。最常见的变异为c.365T>C(p.L122P)(29.2%)。结论 cblA型MMA患儿主要表现为...