基于网络药理学研究龙藤通络方治疗化疗致周围神经病变的作用机制

目的 运用网络药理学探讨龙藤通络方治疗化疗致周围神经病变(Chemotherapy-induced Peripheral Neuropathy,CIPN)的作用机制.方法 运用TCMSP和UniProt数据库获取药物的活性成分和作用靶点,借助人类基因数据库(GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、T...     

OMIM的利用和图书馆信息咨询服务的拓展

介绍在线人类孟德尔遗传数据库(Online Mendclian Inhcritance in Man,OMIM)及其检索查询，并讨论医学高校图书馆如何利用OMIM为医学生物学研究人员、医务工作者和相关读者提供遗传相关的基础、临床信息检索和咨询。     

基于网络药理学探讨防己黄芪汤治疗慢性心力衰竭的潜在机制

目的:利用网络药理学探讨防己黄芪汤治疗慢性心力衰竭(CHF)的潜在机制.方法:利用中药系统药理学技术平台(TCMSP)检索防己黄芪汤的药物活性成分及其相关靶点,并通过全球蛋白质资源(Uniprot)数据库进行基因的标准化处理.通过在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库、基因卡片(GeneCards)数据库检索得到CHF的...     

基于网络药理学的黄芪桂枝五物汤治疗胃溃疡功效研究与初步验证

目的:通过网络药理学方法系统化探究黄芪桂枝五物汤治疗胃溃疡的功效网络,并用分子对接技术进行验证.方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取黄芪桂枝五物汤的有效化合物及作用靶点,利用在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、基因疾病关联数据库(DisGeNET)、人类基因数据库(GeneCards)、毒性与基...     

芪莲舒痞方治疗慢性萎缩性胃炎的网络药理学研究

目的:基于前期研究基础通过网络药理学方法系统探讨芪莲舒痞方治疗慢性萎缩性胃炎的功效网络,并用分子对接方法进行验证.方法:利用中药系统药理数据库及分析平台(TCMSP)获取芪莲舒痞方的有效成分及靶点网络,利用在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、疾病相关基因与突变位点数据库(DisGeNET)、人类基因数据库(GeneC...     

基于网络药理学探讨中药调控癌基因诱导衰老用药规律研究

目的 探讨中药调控癌基因诱导衰老(OIS)的物质基础及用药规律.方法 检索基因组百科全书数据库(KEGG)、人类基因注释数据库(GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、CTD、Drug, Bank数据库获取OIS的作用靶点,以ADME参数与Lipinski规则为条件通过中药系统药理学分析平台(TCM...     

消炎膏外用干预血栓性浅静脉炎作用机制网络药理学研究

目的:利用网络药理学研究方法预测消炎膏外用干预血栓性浅静脉炎的作用机制.方法:利用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)挖掘消炎膏组成药物的入血成分及作用靶点,通过DisGeNET、基因卡片(GeneCards)、人类在线孟德尔遗传平台等数据库筛选出血栓性浅静脉炎的相关靶点.运用Cytoscape3.7.1软件构...     

基于网络药理学分析附子理中汤治疗晚期胃癌的作用机制

[目的]基于网络药理学方法,对附子理中汤治疗晚期胃癌的靶点及作用机制进行分析.[方法]通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)、人类孟德尔遗传在线(O...     

遗传性疾病的产前诊断(三)——遗传性生化功能障碍

在Mckusick的“人类孟德尔遗传”一书的目录中列举了1,000多种疾病,这些疾病被认为证明了孟德尔式遗传。(McKusick 1975)。这些疾病中二分之一弱(466种)为常染色体隐性遗传,而其中又有三分之一(160种)是有生化缺陷的疾病。凡是能在成纤维细胞培养中证明有生化缺陷的疾病,多半也能在羊水细胞培养中表现出来,因此可以在产前进行诊     

麦门冬汤抗肺纤维化作用机制的网络药理学研究

目的:采用网络药理学方法探讨麦门冬汤治疗肺纤维化的潜在作用机制.方法:通过中药分子机制的生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)、中医药百科全书数据库(ETCM)获取麦门冬汤的化学成分和潜在作用靶点;通过治疗靶点数据库(TTD)、人类的非线性孟德尔遗传数据库(OMIM)、DRUGBANK数据库获取肺纤维化相关的作用靶...     

充分利用在线人类孟德尔遗传(OMIM)提高医学遗传学教学质量

OMIM即"在线人类孟德尔遗传",它具有及时、准确、全面、实用等特点,充分利用OMIM是提高医学遗传学教学质量的有效途径.     

基于网络药理学研究三棱-莪术药对治疗肝细胞癌的作用机制

目的:应用网络药理学的方法,研究三棱-莪术药对治疗肝细胞癌的作用机制.方法:通过中药系统药理数据库及分析平台(TCMSP)数据库以及手工查阅相关文献,搜集并整理三棱-莪术药物的活性成分及其靶标.通过人类孟德尔遗传数据库(OMIM)和人类基因数据库(Genecards)获得三棱-莪术药对治疗肝细胞癌潜在的靶标基因.使用C...     

基于网络药理学探讨四神煎治疗类风湿关节炎的作用机制

目的:基于网络药理学探讨四神煎治疗类风湿关节炎(rheumatoid arthritis, RA)的作用机制。方法:通过中药系统药理数据库和分析平台(traditional chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)、中医药百科全书数据库(encyclopedia of traditional chinese medicine, ETCM)检索四神煎组方中药的主要化学成分,并结合文献进行筛选、补充;通过Pubchem有机小分子生物活性数据库检索化学成分的SMILES结构式及2D结构,经Swiss ADME数据库筛选后将符合标准的化学成分上传至Swiss Target Prediction数据库预测药物活性靶点;通过人类基因数据库(Gencards)、在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man, OMIM)、治疗靶标数据库(therapeutic target database, TTD)、DrugBank数据库获取RA疾病相...     

基于网络药理学探究"菟丝子-淫羊藿"治疗白癜风的作用机制

目的 基于网络药理学探究"菟丝子-淫羊藿"治疗白癜风的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台、中医药综合数据库等筛选"菟丝子-淫羊藿"的活性成分及其靶标.通过GeneCards、在线人类孟德尔遗传数据库等数据库获取白癜风的主要靶标,对交集靶标使用STRING、Cytoscape进行蛋白质-蛋白质相互作用分析...     

浅谈Prader-welli综合征

Prader-welli综合征(pws)是一种基因组印迹相关的遗传性疾病,基因组印迹是一种非孟德尔遗传方式,仅存在于哺乳动物,指配子或合子中的某些基因经过表观修饰后,在后代体细胞不同亲本来源的等位基因差异性表达现象.     

基于网络药理学和分子对接探究苓桂术甘汤治疗多囊卵巢综合征的作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接探究苓桂术甘汤治疗多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome, PCOS)的作用机制。方法 采用中药系统药理学数据库TCMSP和已发表文献筛选苓桂术甘汤方有效活性成分,通过在线人类孟德尔遗传数据库(GeneMap)、DisGeNET数据库、人类基因数据库(Gencards)以及DrugBank数据库检索PCOS的靶点。利用Venny 2.1.0在线平台获取药物疾病交集靶点。运用Cytoscape 3.9.1软件构建“药物-活性成分-潜在靶点”网络图。通过STRING数据库构建PPI网络图。依托DAVID数据库对药物疾病交集靶点进行KEGG富集分析和GO的生物功能分析。借助Chem 3D、AutoDock Tools、Vina 1.1.2以及Pymol软件对药物关键活性成分和疾病的重要靶点进行分子对接。结果 共筛选出交集靶点348个,核心靶点11个,对应着4种中药的144个有效活性成分。通过GO分析得到1660条生物过程。KEGG富集分析得到187条信号通路。将药物关键活性成分及疾病关键靶点进行分子对接。结论 苓桂术甘汤中的关键成分通...     

基于网络药理学探究黄芩治疗慢性鼻窦炎的潜在作用机制

目的 运用网络药理学探究黄芩治疗慢性鼻窦炎的潜在作用机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systematic pharmacology database and analysis platform, TCMSP)、中医药整合药理学研究平台(integrative pharmacology-based research platform of traditional Chinese medicine, TCMIP)和中药分子机制生物信息学分析工具(bioinformatics analysis tool for molecular mechanism of traditional Chinese medicine, BATMAN-TCM)筛选出黄芩的活性成分;利用Swiss Target Prediction数据库收集黄芩活性成分的靶点;利用GeneCards、在线人类孟德尔遗传(online Mendelian inheritance in man, OMIM)、gharmGKB和DrugBank数据库筛选“慢性鼻窦...     

基于网络药理学分析土茯苓治疗银屑病的作用机制

目的:以网络药理学为基础分析土茯苓在银屑病治疗中的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及文献检索获取土茯苓的活性成分及有关靶标。利用GeneCards和在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库筛选土茯苓活性成分治疗银屑病的潜在靶标。通过Cytoscape软件绘制土茯苓治疗银屑病形成的"成分-靶标-通路-疾病"网络图。利用STRING数据库进行靶点蛋白相关作用网络构建并对关键靶点的生物功能进行注释和通路分析。结果:从土茯苓中筛选与银屑病有关活性成分12个,107个共同靶点、7条生物代谢途径在治疗银屑病的过程中发挥作用。结论:土茯苓在治疗银屑病的过程中通过多个活性成分、作用靶点以及生物代谢途径发挥作用,而非通过某一单一机制发挥作用,其作用机制具有多靶点的特征。     

孟德尔遗传糖尿病研究进展

糖尿病是由多种遗传和环境因素相互作用而引起的一组慢性代谢异常综合征.一些特殊类型的糖尿病,如:青年发病的成年型糖尿病、矮妖精貌综合征、脂肪萎缩性糖尿病和Rabson-Mendenhall综合征为单基因致病并符合孟德尔遗传.本文对孟德尔遗传糖尿病的研究进展加以综述.     

基于网络药理学研究黄连温胆汤干预2型糖尿病作用机制

目的 利用网络药理学工具挖掘黄连温胆汤干预2型糖尿病的机制.方法 利用中药系统药理学数据库和分析平台检索黄连温胆汤药物成分及作用靶点,检索基因卡片、人类在线孟德尔遗传平台和DisGeNET数据库获取2型糖尿病相关靶点,取交集后,获得黄连温胆汤干预2型糖尿病的作用靶点.利用Cytoscape软件构建"药物-成分-靶点-疾...