Wilson病基因突变及其与临床表型相关性研究

<正>Wilson病(WD),又名肝豆状核变性(HLD),由Samuel A.K.Wilson于1912年首先描述,是一种以铜代谢障碍为特征的常染色体隐性遗传性疾病。该病主要累及肝脏及基底核区,临床表现为进行性加重的锥体外系症状、精神症状、肝硬化、肾功能损害及角膜色素环(K-F环)等。该疾病在全球范围均有分布,发病年龄     

视网膜色素变性患者RP1基因突变位点与临床表型相关性初探

目的 探索视网膜色素变性1基因(RP1)的新突变及其与特殊临床表型的相关性.方法 将2018年1月至2019年7月在山东省滨州市人民医院眼科确诊的视网膜色素变性的25个家系的86例患者纳入研究,收集临床相关资料.采用高通量二代基因测序对患者及家系样本进行基因测序,用Sanger验证确认基因变异位点,并进一步分析患者相关...     

结核杆菌异烟肼表型耐药与katG基因突变相关性研究

目的:探讨结核分支杆菌异烟肼(INH)表型耐药与KatG基因密码子315位和463位基因改变的相关性。方法:采用基因直接测序法对结核分支杆菌分离株KatG基因进行分析。结果:132株异烟肼耐药菌株中68株KatG基因密码子315位有基因突变,突变率51.52%(68/132),野生型密码子315AGC(Ser)突变成ACC(Thr)60株,AAC(Asn)6株,ACA(Thr)1株,GGC(GIy)1株。133株INH敏感菌株未发现KatG 315位基因突变。132株INH耐药菌株中123株KatG基因密码子463位有基因突变,突变率为93.18%,野生型密码子463CGG(Arg)突变成CTG(Leu)123株;133株敏感菌株中114株KatG基因密码子463位有基因突变,突变率为85.71%,野生型密码子463 CGG(Arg)突变成CTG(Leu)114株。结论:①KatG基因315位密码子突变是菌株异烟肼表型耐药的重要分子基础,以Ser315Thr错义突变为主。②KatG基因463位密码子突变与异烟肼耐药表型没有相关性,不是结核杆菌异烟肼耐药的分子标志。该位点突变可能是基因多态性,与结核菌治疗带来的选择性压力无关。     

一个独特临床表型的SPD家系HOXD13基因突变分析

先天性并指(趾)多指(趾)畸形(synpolydacty-ly,SPD)为Ⅱ型并指,典型的表现为手部3、4指并指和(或)足部4、5趾并趾,并伴有多指(趾)[1]。目前认为非综合征的SPD为常染色体显性遗传疾病,位于2q31的H0XD13基因是其致病基因。我们收集到一个3代的SPD家系,其中3例患者表现为三种变异的并指多指畸形。对该家系HOXD13基因突变的研究发现,此家系中患者均携带发生9个丙氨酸延展突变的HOXD13基因。     

SCN1A基因突变的Dravet综合征患儿不同突变特点与临床表型的相关性及药物疗效分析

目的分析Dravet综合征患儿SCN1A基因突变特点与临床表型的相关性,探讨SCN1A基因突变的Dravet综合征患儿的药物疗效。方法采用回顾性研究,使用PCR扩增技术和Sanger测序法检测2015年1月至2019年1月延安大学附属医院和延安市人民医院儿科诊治的30例Dravet综合征患儿的SCN1A基因,收集其发作类型、智力发育及药物治疗效果等临床资料,然后进行统计分析。结果经检测,30例患儿SCNI1A基因突变阳性23例,阳性率为76.67%;错义突变组患儿不典型失神和肌阵挛发作年龄晚于截断突变组,丛集样发作比率小于截断突变组,差异有统计意义(P 0. 05),而两组患儿性别构成比、发病年龄、惊厥持续状态、1岁前发作频率、发作类型、1岁前脑电图异常比率及智力发育情况相比差异无统计意义(P 0. 05); S4-S6区组与非S4-S6区组错义突变组患儿在发病年龄、不典型失神和肌阵挛发作年龄、丛集样发作比率、惊厥持续状态、1岁前发作频率、发作类型、1岁前脑电图异常比率及智力发育情况相比差异无统计意义(P 0. 05);临床疗效最好的四款药物分别为托吡脂、氯硝西泮、丙戌酸钠和左乙拉西坦,有效率分别为70. 83%、47. 62%、46. 67%和31. 82%,服用拉莫三嗪者无效率100. 00%。结论 Dravet综合征患儿SCN1A基因突变阳性率高,且突变特点与疾病临床表型具有相关性;在常用的8种药物中,托吡脂疗效最好,拉莫三嗪疗效最差。     

PTEN基因突变与胃癌临床分期的相关性研究

目的研究抑癌基因PTEN（phosphatase and tensin homology deleted on chromosome ten,PTEN）突变高发区外显子5（exon5）和外显子8（exon8）在胃癌组织中的突变频率．探讨其突变与临床分期的相关性．方法应用聚合酶链反应-单链构象多态性分析（PCR—SSCP）方法检测胃癌组织和相应癌旁正常组织中PTEN基因的突变,并对突变样本的PCR产物进行测序分析。结果42例胃癌组织中检测到PTEN基因突变3例,突变率为7．14％（3／42）,42例胃癌不同临床病理分期中,Ⅰ、Ⅱ期突变率为5．88％（1／17）,Ⅲ、Ⅳ期突变率为8．00％（2／25）,二者差异无显著性（P〉0．05）。42例相应癌旁正常组织未检测到突变,二者差异无显著性（P〉0．05）。对42例胃癌进行组织学分级,结果低分化腺癌突变率为12．00％（3／25）,中、高分化腺癌突变率为0（0／17）,二者差异无显著性（P〉0．05）。结论胃癌组织中存在PTEN基因突变,主要发毕在低分化腺癌中。而PTEN基因突褒与胃癌病理组织学分级和临床病理分期之间无显著相关性。     

2例Lesch-Nyhan综合征患儿及家系临床表型和基因突变分析

目的探讨Lesch-Nyhan综合征(Lesch-Nyhan syndrome, LNS)的临床表型和基因突变类型。方法收集2例LNS家系中先证者的临床资料,包括病史、体格检查及生化检查,抽取先证者及其家系成员外周血,采用二代高通量测序法进行基因检测,并采用Sanger测序法进行位点验证及家系验证。结果 2例先证者围生期无明显异常,均于6个月内出现发育落后,1岁6个月后出现自残行为,血尿酸增高,2例先证者HPRT1基因均存在突变,先证者1为c.609+5G>A的剪接突变,先证者2为c.212G>A,p.G71D的错义突变。结论伴尿酸增高的发育落后患儿应警惕LNS的发生,基因检测有助于该病的早期诊断。     

2例CHD2基因突变相关癫痫临床表型及遗传学分析

目的 分析2例CHD2基因突变相关癫痫患儿临床资料,探讨其临床表型和基因突变特点。方法 收集2例CHD2基因突变相关癫痫患儿(先证者)及其家系临床资料,采集先证者及其父母外周血,提取基因组DNA,采用高通量测序法对先证者外显子及旁侧内含子区域进行测序,确定基因突变位点,采用PCR-Sanger测序法验证。应用UCSC软件分析先证者突变位点保守性,应用Varseak、Mutation Taster软件分析突变位点致病性。结果 2例患儿均约3岁出现抽搐。先证者1表现为强直阵挛发作,诊断为癫痫、孤独症谱系障碍,给予丙戊酸钠、左乙拉西坦治疗后发作控制;存在CHD2基因c.2877-1＿2877delGCinsAA杂合突变,为剪接受体突变;13个物种c.2877-1位点对应的碱基(C)、c.2877位点对应的氨基酸(天冬酰胺)均呈高度保守性;家系验证及基因数据库提示为新发突变,Varseak软件分析结果提示该突变导致蛋白序列和结构变化,ACMG评级为可能致病。先证者2存在多种癫痫发作形式,合并重度发育迟缓,诊断为Lennox-Gastaut综合征,给予多种药物治疗效果差,后给予左乙拉西坦治疗后发...     

肺炎支原体23SrRNA基因突变位点与耐药表型的分析

目的 了解本地区社区呼吸道感染肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae,Mp)感染状况,探讨肺炎支原体对大环内酯类抗菌药物的耐药分子机制,并分析肺炎支原体耐药菌株23SrRNA基因突变位点与耐药表型之间的关系.方法 对400例社区获得性呼吸道感染患儿咽拭子标本进行分离培养,应用巢式聚合酶链反应(PCR)对临床分离株进行分子鉴定;通过体外药物敏感试验测定Mp临床分离株对大环内酯类抗菌药物的最小抑菌浓度(MIC),并筛选出耐药株;检测耐药株23SrRNA基因序列,并与标准菌株M129基因序列对比分析,分析突变位点与耐药表型的关系.结果 400例咽拭子标本中分离Mp 50株.其中敏感株32株,耐药株18株.18株耐药株分别出现A2063G、A2064G、A2067G 位点突变.A2063G突变株表现出对14元环大环内酯类抗菌药物耐药,A2064G突变株表现为对14、16元环大环内酯类抗菌药物的耐药,A2067G突变株表现出对交沙霉素耐药.结论 Mp对大环内酯类抗菌药物耐药现象严重,23SrRNA基因位点突变是耐药性产生的主要机制.通过对23SrRNA基因突变位点与耐药表型的分析研究,初步了解临床肺炎支原体耐药现状,并且为抗菌药物的合理选择和应用提供理论指导.     

结直肠癌组织基因突变与临床病理及MMR蛋白表达的相关性分析

目的分析结直肠癌组织KRAS、NRAS、BRAF和PIK3CA基因突变与临床病理因素及MMR蛋白表达的相关性。方法采用扩增阻碍突变系统(ARMS)和免疫组化法对122例结直肠癌石蜡组织进行回顾性分析。结果 122例结直肠癌组织中KRAS、NRAS、BRAF和PIK3CA基因突变率分别为48.4%(59/122)、4.1%(5/122)、5.7%(7/122)和5.7%(7/122)。检出KRAS与PIK3CA双突变病例3例,BRAF与PIK3CA双突变1例,未发现BRAF与KRAS或NRAS基因同时突变病例。女性患者KRAS突变率高于男性患者(P0.05),低分化腺癌KRAS突变率高于高、中分化腺癌(P0.001)。女性患者、有淋巴结转移者和MLH1蛋白表达缺失者与男性患者、无淋巴结转移和MLH1表达者比(P0.05),PMS2蛋白表达缺失者比表达者的BRAF突变率更高。黏液腺癌PIK3CA突变率较其他肿瘤组织学类型高(P0.05)。结论该4种基因在结直肠癌的突变率依次为KRAS、 BRAF、PIK3CA、NRAS,不存在4种基因全突变及3种基因突变。BRAF与KRAS、NRAS基因突变存在相互排斥现象。KRAS、BRAF、PIK3CA基因突变与结直肠癌临床病理特征存在相关性。     

临床分离人型支原体基因突变与喹诺酮耐药相关性研究

目的探讨自我院临床所分离的人型支原体（Mycoplasma hominis,Mh）对喹诺酮类药物耐药的分子生物学机制。方法从泌尿生殖道标本中分离对喹诺酮类药物不同耐药谱表型的Mh21株,采用PCR方法分别检测其DNA旋转酶和DNA拓扑异构酶Ⅳ保守区基因序列,与对喹诺酮类药物敏感的模式菌株ATCC23114及基因库中的野生型菌株PG21基因序列进行比对,分析Mh DNA旋转酶以及拓扑异构酶Ⅳ氨基酸变异与其耐药性的关系。结果对司帕沙星耐药的11株Mh均检出GyrA83位Ser→Leu氨基酸变异;对氧氟沙星和左氧氟沙星耐药或中介的19株Mh中有16株检出ParC134位Lys→Arg氨基酸变异。结论 Mh GyrA基因83位Ser→Leu变异,可能与其对司帕沙星耐药相关;ParC134位Lys→Arg变异可能与其对氧氟沙星和左氧氟沙星耐药有关。     

7个家系Wilson病同胞ATP7B基因突变分析及临床表型的研究

目的对Wilson病(WD)患病同胞进行ATP7B基因外显子测序,分析其突变的特点并探讨基因型与表型的关系。方法收集WD患病同胞的临床资料,并留取患者的外周血,提取基因组DNA,并对外显子扩增产物进行直接测序。结果 7个家系中7对同胞,共14例WD患者均检出致病突变,发现8种致病突变,包括5种错义突变,1种剪接位点突变,1种移码突变以及1种无义突变,其中,c.3851_3876del为新突变。7个家系同胞之间均为相同的基因突变形式,但同胞间临床分型不全相同,先证者临床症状多较其同胞明显,3个家系中表现为弟妹先发病。先证者与其同胞间血清铜及铜蓝蛋白水平无统计学差异。结论 WD患病同胞间基因突变形式一样,但临床分型、症状的轻重程度及发病时间可不同,WD的临床表型除了与基因突变形式有关外,还可能与其他因素相关。     

K-ras基因突变表达谱与结直肠癌肝转移的相关性分析

目的探讨K-ras基因突变谱与结直肠癌肝转移的相关性,为进一步阐明结直肠癌肝转移的分子机制提供理论依据。方法收集2008年1月至2010年8月在我院治疗的结直肠癌肝转移患者30例,进行K-ras基因突变检测,分析K-ras基因的突变类型及频率,探讨K-ras基因的突变谱与结直肠癌肝转移患者性别、年龄、原发灶位置、转移位置、病灶形态及TNM分期的相关性。结果 30例结直肠癌肝转移患者组织中K-ras基因突变者14例,突变率为47%,其中12密码子突变9例,突变率为30%;13密码子突变者5例,突变率为17%。突变表达谱在性别、年龄、原发部位、肝脏转移灶部位、病灶形态、TNM分期方面差异无统计学意义（P〉0.05）。结论 K-ras基因在结直肠癌肝转移的患者中突变率较高,以12,13号密码子突变最为常见,突变类型及频率在性别、年龄、原发部位、肝脏转移灶部位、病灶形态、TNM分期方面无显著性差异。     

苏州地区献血者血小板CD36抗原表型筛查及基因突变分析

目的 了解苏州地区血小板CD36抗原表达情况及其抗原缺失频率和基因多态性特征,为建立血小板CD36阴性表型资料库提供参考依据.方法 随机选取805例苏州市中心血站无偿献血者抗凝全血,流式细胞术筛查血小板和单核细胞表面CD36抗原的表达,分析抗原缺失类型,并结合基因组DNA测序,检测导致CD36抗原缺失的基因突变类型.结...     

胰腺导管腺癌重要驱动基因突变与临床病理特征、预后间相关性的分析

目的：探讨胰腺导管腺癌（pancreatic ductal adenocarcinoma, PDAC）重要驱动基因突变特点与临床病理特征间的关系。方法：采用靶向测序技术检测269例PDAC患者中相关基因的突变情况,并分析其中重要驱动基因（KRAS、TP53、SMAD4及CDKN2A）突变状态与包括年龄、肿瘤分化程度、预后等在内的各项临床病理特征之间的关系。结果：在269例PDAC患者中,KRAS、TP53、SMAD4、CDKN2A的突变率分别为82.53%(222/269)、55.02%(148/269)、15.24%(41/269)、11.15%(30/269)。KRAS突变均为错义突变,其中94.59%发生于2号外显子的12位密码子,5.41%则发生于3号外显子的61位密码子。KRAS突变与年龄相关,小于70岁患者中KRAS突变率为80.09%,大于70岁患者中为93.75%(P<0.05);TP53突变与肿瘤分化程度相关,中、高分化患者中TP53突变率为52.52%,低分化患者中为74.19%(P<0.05);SMAD4、CDKN2A突变与患者的各项临床病理特征均无关...     

各种凝血因子基因突变与血栓形成相关性的研究进展

目前世界上有关凝血因子基因多态性及基因突变与各种临床血栓疾病相关性的研究仍是一大热点。西方国家静脉血栓栓塞（VT）发病率高达481／10万，并随年龄增长而升高。我国该领域的研究尚属起步阶段，目前没有大样本的VT流行病学资料。     

α2珠蛋白基因突变IVS-Ⅱ-55(T→G)的临床表型分析

目的鉴定一种α2-珠蛋白基因突变类型,分析携带者的表型特征。方法收集5个携带α2-珠蛋白基因IVS-Ⅱ-55(T→G)杂合突变的婴幼儿先证者的家系和3例散发成人携带者的外周血样本进行血常规和血红蛋白电泳分析,并采用跨越断裂点聚合酶链反应(Gap-PCR)方法、PCR结合反向点杂交(PCR-RDB)法以及DNA测序方法进行珠蛋白基因缺失和突变的鉴定。结果 13例α2-珠蛋白基因IVS-Ⅱ-55(T→G)杂合突变携带者中,5例婴幼儿先证者的MCV和MCH均低于正常参考区间,表现为小细胞低色素轻中度贫血;成人(包括3例散发成人和5例家系中的成人携带者)中1例表现为小细胞低色素中度贫血,1例复合βCD27-28杂合突变表现为MCV 65 fL、MCH 20.3 pg,1例复合SEA-HPFH表现为MCV 81.9 fL、MCH 26.5 pg,其余MCV和MCH均正常; IVS-Ⅱ-55复合βCD27-28杂合突变的HbA_2为5.8%。IVS-Ⅱ-55复合SEA-HPFH的HbA_2为3.0%,Hb F为29.0%。单纯IVS-Ⅱ-55杂合子的HbA_2均正常。所有携带者均未见异常血红蛋白条带。结论单纯IVS-Ⅱ-55(T→G)杂合子的血液学表型正常,复合β地贫时表型与单纯β地贫类似。     

MYO7A基因突变分析与儿童先天性耳聋的相关性研究

目的 分析MYO7A基因突变与儿童先天性耳聋相关性。方法 选取2019年5月至2021年5月于本院就诊的先天性耳聋患儿48例作为耳聋组,另选取同期体检结果呈健康的儿童48例作为对照组。使用Madsen502便携式听力计测试两组研究对象纯音听阈均值（PTA）;采用Titan IMP440中耳分析系统测试两组研究对象宽频声导抗（WBT);采集所有研究对象外周血检测MYO7A基因突变。结果 耳聋组患者各频率下PTA明显高于对照组（P<0.05）;耳聋组患者0.5～4.0 kHz各个频率下WBT吸收率均明显低于对照组（P<0.05）;耳聋组c.462位点基因型CC、CA和AA的分布频数与对照组有显著差异,等位基因C的频率明显低于对照组（P<0.05）;耳聋组患者MYO7A基因EX43＿46Del突变人数明显多于对照组（P<0.05）;c.462C>A突变和EX43＿46Del突变对PTA和WBT影响不显著（P>0.05）。结论 MYO7A基因EX43＿46Del和c.462C>A突变与儿童先天性耳聋存在一定相关性,可通过上述两个位点基因突变情况初步预测...     

MDS及MDS/AML患者基因突变与年龄相关性分析

目的:探讨骨髓增生异常综合征(myelodysplastic syndromes,MDS)及MDS转化为急性髓性白血病(acute myeloid leukemia,AML)患者血液肿瘤相关的体细胞基因突变与患者年龄的相关性。方法:选取初诊MDS和MDS/AML患者共111例。采集患者骨髓样本或用初诊时留存的骨髓涂片,应用高通量基因测序方法检测血液肿瘤相关的58种基因的体细胞基因突变,分析基因突变与患者年龄的相关性。结果:111例患者中总基因突变阳性率为87.39%(97/111),共检测到28种基因的231例次突变。基因突变阳性组患者年龄显著大于突变阴性组(P<0.001)。突变阳性的患者中,老年组(≥60岁)突变率最高,为100%(14/14),成人(15-59岁)组突变率为89.04%(74/85),儿童(≤14岁)组突变率为75%(9/12)。儿童组人均突变基因数目为1.44个,成人组2.47个,老年组2.5个;成人组突变个数显著大于儿童组(P=0.02)。儿童组信号转导基因突变最常见,突变率为46.15%(6/13),老年组和成人组表观遗传调节基因突变最常见,突变率分别为34.29%(12/35)和22.40%(41/183)。转录因子基因突变率在老年人组突变率高于儿童组(50.00%vs 8.33%)(P=0.036);剪接因子基因突变率在成人组和老年组中均高于儿童组(44.71%vs 8.33%)(P=0.024)、(47.06%vs 8.33%)(P=0.036)。结论:不同年龄组MDS及MDS/AML基因突变有所不同,尤其儿童组与成人组及老年组差异显著,提示儿童MDS的发生可能具有与成人和老年人MDS显著不同的遗传因素。