SARS冠状病毒RNA聚合酶编码区分析

SARS冠状病毒(SARS coronavirus ,SARS CoV)和同家族的其他冠状病毒一样,是一类单链的正义RNA病毒 ( single-stranded, (+)sense RNA virus).与其他种类的病毒(如负义RNA 病毒)相比,这类病毒有两个最重要的特征:(1)在其成熟的病毒颗粒中并没有RNA聚合酶(viral RNA polymerase)存在,即病毒复制、转录所需的病毒特有的RNA聚合酶,是在侵入宿主细胞之后才合成的. 而且,只是在病毒的扩增阶段,保留在宿主细胞内行使功能,并不参与病毒颗粒的组装.     

RNA依赖的RNA聚合酶研究进展

RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase，RDRP)是模板依赖性的聚合酶家族成员之一，按其分子结构可分为两大类，RNA病毒RDRP和细胞RDRP。RDRP参与病毒感染和RNA沉默的许多环节，是目前病毒学研究的热点之一。     

小鼠骨桥蛋白(OPN)基因RNA干扰慢病毒载体的构建及体内抑制效果鉴定

 目的 构建骨桥蛋白(osteopontin,OPN)基因RNA干扰慢病毒载体并在小鼠体内鉴定其抑制效果。方法 参照OPN GenBank上的序列,对OPN基因沉默位点进行分析,设计针对OPN信使RNA的小发夹RNA(short hairpin RNA,shRNA)OPN shRNA及阴性对照(negative control shRNA,NC shRNA)序列,合成pSicoR GFP shRNA重组体。经鉴定序列无误后,与pCMV VSV G 和pCMV dR8.91辅助质粒包装并转染293FT细胞,得到有效滴度为5×109 TU/mL的病毒原液。经尾静脉将构建的慢病毒载体注射入小鼠体内,qRT PCR及Western blot检测小鼠肝脏OPN mRNA及蛋白的抑制效果。结果 成功构建针对OPN的shRNA慢病毒载体,经纯化、浓缩得到滴度为5×109TU/mL病毒原液。与正常对照组、阴性对照组相比,实验组OPN mRNA及蛋白表达水平明显下降;正常对照组、实验组OPN mRNA及蛋白表达水平无明显差别。结论 利用RNA干扰技术,借助慢病毒载体,成功构建小鼠肝脏OPN基因低表达模型。为进一步研究OPN在胆石症等疾病中的作用提供了有力工具。     

非编码RNA与复发性流产的研究进展

复发性流产(recurrent spontaneous abortion, RSA)是妊娠常见的并发症之一,其病因较为复杂,临床发生率逐年上升。非编码RNA(non-coding, ncRNA)在复发性流产的发生与发展中具有重要作用,ncRNA能通过调节细胞周期、细胞凋亡和上皮间充质转化等细胞过程来影响滋养细胞的生长、迁移与侵袭。多项研究发现ncRNA中长链非编码RNA、微RNA、环状RNA等均与复发性流产密切相关,可以作为复发性流产潜在诊断与预测性生物学标志物。本文综述近年来非编码RNA与复发性流产关系的相关研究进展,为诊断与治疗复发性流产提供思路。     

农吉利对小白鼠S_(180)瘤组织核酸含量及~(32)P参入量的影响

据国内临床报告:农吉利甲素(野百合碱)对皮肤癌、宫颈癌等有显著疗效。国内外动物试验资料也发现有较高的抑瘤率。其抑瘤作用机制,尚待深入探讨。近年来大量国内外文献资料证明:肿瘤发生与机体细胞核酸的生物合成密切相关。病毒的致癌原理乃是:DNA病毒的DNA掺入宿主细胞的DNA中,改变了宿主细胞的遗传特性而引起癌变;RNA病毒由于有“依赖RNA 的 DNA聚合酶”(又名逆转录酶),可由RNA逆行复制出前病毒所需的DNA,     

外泌体源性非编码RNA作为肝癌标志物的研究进展

非编码RNA(ncRNA)为不具备编码蛋白质功能的基因组转录产物,在基因转录、转录后及翻译水平发挥调控作用,与肿瘤发生和发展密切相关。外泌体ncRNA在细胞间通讯中起着关键作用。某些外泌体ncRNA在肿瘤中存在差异性表达,提示其具备作为肿瘤液体活检标志物的潜在价值。本文对外泌体ncRNA中的微小RNA(microRNA, miRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)、环状RNA(circular RNA, circRNA)作为肝细胞癌标志物的研究进展进行综述,探讨了外泌体源性非编码RNA作为肝癌诊断与预后新型生物标志物的临床应用价值。     

非编码RNA在肺动脉高压中的机制及最新研究进展

肺动脉高压(PAH)是一种高度恶性的心血管疾病,其发病机制尚不明确。关于PAH的影响因素,目前认可度较高的主要有肺血管重塑、炎症、肺细胞异常增殖及遗传因素等。非编码核糖核酸(ncRNA)是一类不能翻译成蛋白质的RNA分子,主要包括微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)及环状RNA(circRNA)。近年来大量研究表明,ncRNA参与PAH的许多病理过程。ncRNA在PAH的调控作用有望阐明PAH的发病机制并为其治疗提供新思路。     

非编码RNA与糖尿病血管病变的关系

非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)为一类不编码蛋白的RNA分子,是机体重要的生物调控因子,在转录及转录后水平调控基因表达,影响糖尿病血管病变的发展过程.ncRNA按其片段大小主要分为微RNA(microRNA,miRNA)、长链非编码RNA(long non coding RNA,lncRNA)及...     

长链非编码RNA与乙型肝炎病毒相关肝细胞癌的研究进展

许多人类肿瘤是由致瘤病毒引起的,除病毒编码蛋白外,大量证据表明,由致瘤病毒诱导宿主转录的非编码 RNA（non-coding RNA, ncRNA）也是促进肿瘤产生的重要辅佐因子。在早期,由于ncRNA不能编码蛋白质,因而被研究者认为是无用的RNA,但随着科学技术的发展,人们逐渐了解其在多种生物学过程中的重要性。肝细胞癌（hepatocellular carcinoma, HCC）在原发性肝癌中的占比大,其患者死亡率在所有癌症中排名第三,常见于亚洲、非洲和欧洲南部,乙型肝炎病毒（hepatitis B virus, HBV）的慢性持续性感染是其主要产生原因。大于200个核苷酸识别的ncRNA被称为长链非编码RNA（long noncoding RNA, lncRNA）。目前人们对lncRNA在HBV相关HCC中的机制仍不清楚,但越来越多的证据表明lncRNA在HBV相关HCC过程中发挥了关键性作用,使得lncRNA成为HCC治疗的关键要素。本文主要就HBV感染导致的HCC与lncRNA之间的关系作一综述。     

小RNA (miRNA)在辅助性T (Th)细胞发育及功能中的重要作用

 小RNA (MicroRNA,miRNA)是近来发现的一类保守的非编码内源性RNA,可针对性调控机体内的信使RNA(messenger RNA,mRNA),因其作用重要而在临床和科研中受到广泛关注。本文主要阐述miRNA的基本概念及其在辅助性T细胞(T helper cell,Th)发育和功能中的重要作用。     

非编码RNA在肺动脉高压中的作用

非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)是一类具有多种功能而不翻译蛋白质的RNA。它包括microRNA、lncRNA、ceRNA等。ncRNA主要通过表观遗传学在基因转录过程中对其表达进行调控。近年大量研究发现ncRNA可以引起多种疾病,如心血管疾病、肿瘤、肺动脉高压(PAH)等。本文对ncRNA在PAH形成过程中的作用相关研究进展作综述,以期为肺动脉高压的治疗提供理论依据。     

伤寒沙门菌核糖核酸酶 G对胞内非编码RNA T3956水平的影响

目的: 研究伤寒沙门菌核糖核酸酶G（RNase G）对非编码RNA（ncRNA）T3956胞内水平的影响。方法: 利用自杀质粒介导的同源重组方法制备伤寒沙门菌RNase G基因（rng）缺陷变异株;利用重组质粒pBAD将rng导入rng缺陷变异株,构建rng缺陷回补株;通过实时定量PCR分别比较伤寒沙门菌野生株、rng缺陷变异株、回补株等在不同生长时期的ncRNA T3956水平。结果: 成功制备伤寒沙门菌rng缺陷变异株、rng缺陷回补株和空质粒对照株; 实时定量PCR结果表明,rng缺陷株中T3956的胞内水平较野生株有所升高,并且在对数中期和稳态期升高得更加明显,而回补株胞内T3956的水平又得到恢复。结论: 伤寒沙门菌RNase G能够参与对胞内ncRNA T3956水平的调控,并且在细菌对数生长中期和稳态期作用更为明显。     

环状RNA在乙肝病毒相关性肝细胞癌中的研究进展

肝癌是常见的恶性肿瘤之一,肝细胞癌是最常见的病理类型,在我国80％以上的肝癌患者合并了乙肝病毒(hepatitis B virus,HBV)感染.近年来研究发现,环状RNA(circular RNA,circRNA)作为非编码型 RNA(non-coding RNA,ncRNA)中的一员,其可由pre-mRNA反向剪接...     

非编码RNA——功能基因组研究的新热点

多年来,研究者们对人类基因组的关注主要集中在编码蛋白质的基因和蛋白质本身.随着人类基因组计划的完成和哺乳类转录组数据的不断积累,揭示出人类和其他高级真核生物的遗传物质只有极小一部分编码蛋白质[1],而超过97%的转录产物是功能多样的RNA分子,即非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)[2].     

乙肝病毒(HBV)感染对肝细胞癌(HCC)患者A-to-I RNA编辑的影响

 目的 探究乙肝病毒（hepatitis B virus,HBV）感染对肝细胞癌（hepatocellular carcinoma,HCC）患者肝脏正常组织和癌组织中腺嘌呤转变为次黄嘌呤（adenine to inosine,A-to-I）RNA编辑活性的影响。方法 从基因表达数据库（gene expression omnibus,GEO）收集28套成对正常组织和癌组织的转录组数据,分为HBV阴性正常组织（HBV-N）组、HBV阴性癌组织（HBV-T）组、HBV阳性正常组织（HBV+N）组和HBV阳性癌组织（HBV+T）组。用SPRINT软件进行位点鉴定后,从催化酶表达水平、位点编辑水平和位点所在基因的基因本体论（gene ontology,GO）富集通路层面进行分析。结果 在正常组织和癌组织中均发现HBV感染时腺苷酸脱氨酶1（adenosine deaminases acting on RNA 1,ADAR1）表达水平更高。癌组织中HBV阳性样本的A-to-I RNA编辑水平上升,正常组织中则无此现象。两类组织中HBV阳性样本编辑基因显著富集在细胞增殖、基因调控相关信号通路。结论 HBV感染上调ADAR1的表达,从而改变宿主编辑事件活性,这对HCC的发生发展可能有促进作用。     

非编码RNA相互作用在胃癌中的研究进展

胃癌(GC)发生与基因和表观遗传改变密切相关。非编码RNA(ncRNA)间的竞争性内源性调控,间接影响下游靶基因的表达,与GC的恶性生物学行为密切相关。深入研究ncRNA调控GC相关基因的表达,为GC的早期诊断和寻找预后标志物提供了可能。本文综述了近年来在GC中发现的ncRNA间的竞争性内源性调控,为GC的早期诊断、生物标志物的开发和应用提供一种新的思路或策略。     

免疫RNA与正常RNA治疗30例慢性乙型肝炎的效果对比观察

HB是一种免疫失调疾病,因此,用特异性和非特异性免疫调节剂治疗是合理的。本文采用双盲法,用免疫RNA和正常RNA对30病HB病人进行了同步性的疗效对比观察。经1-2疗程旨,免疫RNA组自觉症状减轻和肝功能明显改善,细胞免疫功能增强,HBsAg阴转率27％,滴度下降者13.3％,HBeAg阴转40％,并能明显增加外周血白细胞和血小板,治愈率67％,总有效率80％。正常RNA组的HBsAg阴转率27％,HBeAg阴转0％,治愈率20％,总有效率53％。结果显示,特异性HBsAg-iRNA组治疗效果明显优于非特异性正常RNA组。     

森林脑炎病毒RNA的提取及其性质

从森林脑炎病毒感染的鼠脑组织中直接抽提总核酸,然后经Sepharose4B柱层析将病毒RNA与细胞RNA分离,方法简便、分离的病毒RNA在260nm处有典型的紫外吸收光谱,260/280nm的比值近似2,对RNase敏感,有感染性。     

小干扰RNA对人淀粉样前体蛋白基因的沉默作用

目的 观察小干扰RNA(siRNA)对人淀粉样前体蛋白(APP）基因的沉默作用，方法 该研究将设计好的一对寡核甘酸在细胞内源性地转录成小发夹RNA（shRNA)，同时构建了携带两个APP亚型的增强型绿色荧光蛋白（EGFP）的GFP-APP重组质粒。利用EGFP作为报告基因。在COS-7细胞内通过共转染siRNA表达质粒和GFP-APP的重组质粒来观察沉默效应。结果 针对APP的siRNA可有效地下调APP基因。结论 针对APP的siRNA将不仅在研究APP基因功能和深入研究阿尔茨海默病（AD）的病理分子机制上，而且在运用siRNA这种新型的反应核酸药物治疗AD方面扮演重要角色。