筠连县伤寒暴发流行菌株的耐药谱、噬菌体定型及质粒分析

筠连县伤寒暴发流行菌株的耐药谱、噬菌体定型及质粒分析刘衡川，王南志，余倩，叶梅君，周蓉华西医科大学公共卫生学院（成都６１００４１）质粒分析近年来被广泛用于流行病学研究中。肖黔林［１］等对伤寒沙门氏菌引起的暴发和散发流行进行了研究，用质粒分析可将８４株...     

福建省鼠伤寒沙门氏菌病原学特征变迁趋势

目的：了解福建省鼠伤寒沙门氏菌的病原学特征变迁情况。方法：采用噬菌体分型、质粒谱分析及耐药性测定的方法,对福建省１９８０～１９９５年１５年鼠伤寒沙门氏菌的病原学特征进行动态监测。结果：福建省鼠伤寒沙门氏菌的噬菌体流行型别存在明显的变迁与更迭;质粒谱型有逐渐增多且分散趋势;菌株耐药率逐年大幅度上升,耐药谱逐年迅速增宽,多重耐药菌株逐年急剧增多,耐药现象日趋严重。结论：噬菌体分型、质粒谱分析及耐药性测定是监测福建省鼠伤寒沙门氏菌病原学特征变迁趋势的有效方法。     

应用耐药谱,质粒谱和噬菌体分型分析医院内鼠伤寒沙门氏菌感…

１９８８年鞍山市中心医院及鞍钢铁东医院婴儿室、新生儿室同时发生了一起急性腹泻暴发。经流行病学调查，病原菌分离确定为一起鼠伤寒沙门氏菌引起的院内感染暴发，对从患儿粪便、病房外环境中分离出的４５株菌进行血清学、耐药性，质粒图谱和噬菌体分型测定，并以同年散发菌株为对照，发现此次暴发菌株抗原结构完全相同，对常用抗生素耐药，耐药谱基本一致，具有相同的质粒谱，噬菌体分型６０．４２％属４７７４型，与散发菌株有明     

福建省鼠伤寒沙门菌病原学特征研究

目的：了解福建省鼠伤寒沙门菌（鼠伤寒菌）的病原学特征及其流行病学意义。方法：采用噬菌体分型、质粒谱分析、耐药性测定、R质粒检测与消除和致病因子检测等方法，对福建省1980－1995年间不同地区与来源（人、动物、食品、外环境等）的鼠伤寒菌进行研究分析。结果：鼠伤寒菌可分为20个噬菌体型，其中7774与3774等7个型是优势型（89．6％）；并检出10种质粒，可分成13个质粒谱型，60Md质粒是流行性质粒，质粒谱Ⅰ型、Ⅲ型、Ⅳ型和Ⅵ型为优势质粒谱型（85．7％）。不同年段与不同来源菌株的噬菌体流行型别组成互不相同，从而构成各自特有的流行型别。鼠伤寒耐药率逐年大幅度上升，耐药谱及多耐菌株亦逐年剧增。氟喹诺酮、头孢菌素和丁胺卡那霉素是治疗严重耐药菌的敏感药物；尤其是氟哌酸，既可治疗严重耐药菌感染，又可一定程度消除耐药性质粒。鼠伤寒菌的多重耐药性主要由R质粒介导；致病因子有内毒素、外毒素和侵袭性；生化及抗原变种株也可引起食物中毒、医院感染及感染性腹泻的流行。结论：噬菌体分型、质粒谱分析、耐药性测定、R质粒、致病因子和生物变种检测等是监测鼠伤寒菌病原学特征的有效方法。     

绍兴县伤寒流行菌株噬菌体定型及药敏实验结果

我们对1987～1989年搜集的70株伤寒菌株进行了噬菌体定型和耐药谱的检定。其中8株分离自带菌者粪便,10株分离自患者粪便,52株分离自住院伤寒患者的血液、骨髓和胆汁。全部菌株经生化反应及血清学鉴定,符合Ka-uffmann 伤寒沙门氏菌特性,质控菌株为ATCC25922。噬菌体定型用96型噬菌体定型法;耐药谱测定采用Kivby-Bauev 纸片法,试验菌液浓度8.4×10~7CFu/ml。抑杀菌试验采用试管两倍稀释法,试验菌液浓度为8.4×10~7CFu/ml;试验药物浓度起始为128μg 或u/ml,最终为0.03μg 或u/ml。     

应用耐药谱、质粒谱和噬菌体分型分析医院内鼠伤寒沙门氏菌感染的暴发

１９８８年３月鞍山市中心医院及鞍钢铁东医院婴儿室、新生儿室同时发生了一起急性腹泻暴发．经流行病学调查、病原菌分离确定为一起鼠伤寒沙门氏菌引起的院内感染暴发。对从患儿粪便、病房外环境中分离出的４５株菌进行血清学、耐药性、质粒图谱和噬菌体分型测定，并以同年散发菌株为对照，发现此次暴发菌株抗原结构完全相同，对常用抗生素耐药，耐药谱基本一致。具有相同的质粒谱，噬菌体分型６０．４２％属４７７４型，与散发菌株有明显差别．分析结果表明，两所医院分离菌株具有同源性，传播途径为院内交叉感染．     

绍兴县防疫站研究防治伤寒药物取得成效

由绍兴县科委组织评审的一项伤寒耐药谱分析及有效治疗药品的筛选研究,目前通过省、市医药专家鉴定。这项科技成果是绍兴县防疫站在近三年的城乡伤寒流行中对病原菌特征进行系统、全面的考察研究所得,他们通过伤寒噬菌体定型,菌株耐药谱测定和对18种常用抗生素的杀菌作     

浙东沿海地区伤寒、副伤寒沙门氏菌耐药性监测及噬菌体分型

近年来,各地相继发生了耐药性伤寒沙门氏菌引起的伤寒流行。本市从1989年以来,伤寒发病率突然上升,局部地区造成流行。为了解宁波市伤寒菌株的药敏状况和噬菌体型别分布,我们收集了1989、1990年分离的伤寒、甲型副伤寒沙门氏菌275株,开展了耐药性监测、噬菌体分型、质粒检测等工作,现将结果报告如下。     

安顺市区沙门氏菌环境污染调查

在贵州省安顺市１９８５年水型伤寒爆发流行后，为调查该市环境中沙门氏菌污染情况，我站于１９８６～１９８８年对市区所属医院和贯城河污水及部分食物的沙门氏菌进行了监测，共采集污水及食品６１９份，沙门氏菌阳性率为４１．８４％，分属Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、Ｅ１五个群１２个血清型，伤寒沙门氏菌经Ｖｉ噬菌体分型为Ｍ１型。纸片药敏试验为多重性耐药菌株。阐明了沙门氏菌流行的部分传播媒介途径。     

甘肃省部分地区鼠伤寒沙门氏菌噬菌体分型、耐药性及质粒检测

我们于1990年7月～1991年8月从食物中毒、腹泻病患者排泄物中分离出276株鼠伤寒沙门氏菌,并进行了噬菌体分型、耐药性测定、质粒检测试验。现报告如下。材料与方法:(1)测试菌株:276株鼠伤寒沙门氏菌是从本省兰州市、武威市、白银市、临夏4市搜集。(2)标准菌株:大肠ATCC25922、绿脓杆菌ATCC27853、金萄菌ATCC25923;质粒检测用标准E·Coli V517;均由中国预防医学科学院流行病学微生物学研究所提供。(3)鼠伤寒沙门氏菌噬菌体:由中国医学细菌保藏     

志贺菌痢暴发菌株的分子流行病学分析

目的 探讨4种基因分型方法在一起F2a志贺菌痢暴发的流行病学研究中的意义。方法 对43株从患粪便和食物中分离菌株进行质粒图谱分析、质粒DNA酶切图谱分析、随机PCR分析、setl／set2毒力基因PCR分析。结果 随机PCR将43株F2a志贺菌分为2个不同的谱型，质粒图谱、setl／set2毒力基因PCR分为3个不同的谱型。而质粒：DNA酶切图谱分为4个不同的谱型。其中基因型完全相同的菌株35株，为引起本次菌痢暴发的流行株。7株基因型不同的菌株是本次暴发期间同时存在的散发病例。从食物中分离的菌株基因型与流行株相同，证明此次暴发是通过污染的食物而引起传播的。食堂炊事员粪便中虽然分离出了F2a志贺菌，但基因型与流行株不同，不是本次暴发的传染源。结论 DNA水平上的分型方法能更为准确、深入地揭示菌痢暴发过程中各分离株之间的流行病学联系。     

Emergence of ceftriaxone resistant Salmonella enterica serovar Typhi in Eastern India

In view of widespread isolation of fluoroquinolone (FQ) resistant Salmonella enterica serovar Typhi globally, third generation cephalosporins (ceftriaxone) are used as alternative drugs for treatment of typhoid fever in recent years. But reports on emergence of third generation cephalosporin resistant S. Typhi have been documented from various countries including India posing threat in future use of this drug for typhoid treatment. Here, we report on genomic analysis of a third generation cephalosporin resistant S. Typhi strain isolated for the first time from Eastern India, Kolkata during 2019. The study strain was phenotypically resistant to ceftriaxone, ampicillin. Whole genome sequencing revealed the presence of conjugative IncX3 plasmid carrying bla_SHV-12 gene on it. The study strain belongs to H58 haplotype (4.3.1.2) and ST1 type. Comparison of phylogenetic analysis of the study strain with other cephalosporin resistant S. Typhi strains across the world revealed that three strains isolated from Western part of India during 2016 were its closest neighbours. Hence close monitoring of cephalosporin resistant S. Typhi strains are of great importance to control the furure use of this antibiotic for the treatment of typhoid fever.     

Application of a new phagetyping scheme to campylobacters isolated during outbreaks

A new scheme for phagetyping campylobacters has been evaluated using strains isolated from five outbreaks. The phagetyping results have been compared with the results of Penner serotyping, Lior serotyping and Preston biotyping. Phagetyping recognized the causative strains in all of the incidents and also differentiated these strains from animal and environmental strains isolated during these investigations. In some outbreaks phagetyping proved to be more discriminatory than serotyping or biotyping, e.g. strains of Penner serotype 2, and serogroup 4, 13, 16, 50 were subdivided by this method. Phagetyping is to be recommended for typing strains from outbreaks and although the results indicate that it may be used alone we advocate that it should be used in conjunction with one of the established typing methods.     

2011—2020年湖南省伤寒、副伤寒流行病学特征和菌株耐药分析

目的 分析2011—2020年湖南省伤寒、副伤寒流行特征和菌株耐药情况,为做好伤寒、副伤寒防控工作提供依据。方法 收集2011—2020年湖南省伤寒、副伤寒监测数据,采用描述性流行病学方法分析三间分布特征,对各市州分离上送的67株伤寒、副伤寒沙门菌采用梅里埃VITEK2 Compact 全自动细菌鉴定及药敏分析系统进行细菌鉴定和药敏分析。结果 10年间湖南省共报告伤寒、副伤寒病例9 888例,死亡0例,年均发病率1.47/10万。发病人群以农民、散居儿童、学生为主,5—9月为高发季节,主要集中在湘南和湘西地区。2011—2020年湖南省共报告4起伤寒、副伤寒暴发疫情,暴发场所均为学校,传播途径均为水型传播。67株伤寒、副伤寒菌对头孢他啶、氨曲南和厄他培南100%敏感;对哌拉西林/他唑巴坦、头孢吡肟和复方新诺明敏感率为98.5%;对氨苄西林/舒巴坦敏感率为97.0%;对头孢唑林、头孢替坦、阿米卡星、庆大霉素和妥布霉素敏感性较低（＜10%）。55.3%菌株对三类及以上抗生素耐药,发现1株同时对8种抗生素耐药。结论 湖南省伤寒、副伤寒发病呈持续低发状态,局部地区存在暴发。菌株多重耐药现象严重,应加强疫情及耐药监测。     

深圳市龙岗区沙门菌质粒图谱和耐药性分析

目的了解深圳市龙岗区沙门菌的质粒图谱分布和耐药性。方法利用快速小量质粒提取技术及电泳图谱方法,对深圳市龙岗区2003—2007年食物中毒及伤寒、副伤寒疫情中分离的67株沙门菌进行质粒图谱分析并做药敏试验,药敏试验采用改良K—B法。结果质粒阳性率为67．2％（45／67）。质粒携带株每株1—8个不等数量的质粒,相对分子质量大小为1．1。54．2kb,质粒条带数以1～3条居多,未发现耐药谱与质粒特征有关。沙门菌对氟哌酸、氯霉素、氨基糖苷类及第3代头孢类抗生素完全敏感,对青霉素、苯唑西林完全耐药,对头孢氨苄的耐药率高达41．8％,对氨苄西林、羧苄西林、哌拉西林、四环素和复方新诺明的耐药率分别为37．3％、37．3％、25．4％、25．4％和3．0％;沙门菌多重耐药率为13．0％。结论深圳市龙岗区人群携带的沙门菌耐药情况比较普遍;检测沙门菌质粒阳性率不高,质粒特征与耐药谱无关。     

Analysis of plasmid pattern in paediatric intensive care unit outbreaks of nosocomial infection due to Enterobacter cloacae.

Sequential outbreaks of nosocomial infection due to multiply-resistant Enterobacter cloacae occurred in September 1987, and between December 1988 and January 1989, in a paediatric intensive care unit. A total of eight neonates were affected and most had received ventilatory support. Initially, we were unable to determine whether the two outbreaks were caused by the same strain of E. cloacae. After applying plasmid profile analysis to identify epidemic strains, we established that the strain from the first outbreak was different from the second outbreak strain, as each had its own plasmid pattern. During the second outbreak, an environmental bacteriological survey was carried out. We found that the distilled water containers were contaminated with E. cloacae which had the same plasmid profile. After changing the distilled water containers and by reinforcement of aseptic techniques, the nosocomial outbreak was terminated.     

1986年我国急性出血性结膜炎流行的病原学研究

An epidemic of Acute Hemorrhagic Conjunctivitis (AHC) broke out in Shanghai, Henan and Fujian provinces of China in 1986. Twenty four strains of etiologically suspected virus were then isolated but not correctly identified. In 1990 9 out of 24 strains from these three places were re-examined by us in our laboratory, and found feasible to be neutralized by CA 24V antiserum, but not by antiserum to EV 70 as once reported by Henan. It was also found that these viruses (one strain from each of these three places) produced pathogenic changes in suckling mice, showed definite immuno-fluorescence with Mcabs, and were neutralized by McAbs against CA 24V which was isolated from Beijing by our laboratory in 1988. It is evident that all the isolates isolated from Shanghai, Henan and Fujian provinces in 1986 were Coxsackie-virus A 24 variant (CA 24V).     

云南省鼠疫菌质粒特征及地理分布

目的探讨云南省鼠疫菌质粒分子流行病学意义.方法按Kado和Liu法提取云南省44个县市及中缅边境一带共1020株鼠疫菌的质粒,经琼脂糖凝胶电泳进行检测分析.结果云南省鼠疫菌具有相对分子质量(Mr)分别约3.93、6.05、22.97、35.65、45.35、64.82、74.59、111.36和129.55×106的9种质粒,其中3.93、35.65和111.36×106的3种质粒为云南省鼠疫菌特有.按质粒组成可分为10种不同类型的质粒谱,其中Ⅰ～Ⅴ种类型较为常见,且在分布上具有明显的地区集中现象.结论根据鼠疫菌质粒特征,可将云南省自1982年以来发生鼠疫流行的地区划分为多片相对独立的疫源地.认为80年代重新开始的家鼠鼠疫流行,可能来源于多片潜伏的鼠疫自然疫源地的复燃.     

2018年烟台市同期五起伤寒病原学研究及溯源分析

目的分析烟台市5起伤寒病原学特征及分子流行病学关联。方法2018年自烟台市5例伤寒确诊病例样本和流行病调查样本分离获得6株伤寒沙门菌菌株,病例发病时间自2018年5月26日至7月24日,分别分布于烟台牟平区水道镇、烟台蓬莱区登州街道、烟台龙口东莱街道、烟台牟平区文化街道、烟台芝罘区福莱山街道。采用常规细菌分离方法和XbaⅠ/BlnⅠ双酶切脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术对伤寒杆菌进行溯源分析,同时开展viaB毒力基因检测和27种临床常用抗生素敏感试验对伤寒杆菌进行病原学研究。结果6株伤寒杆菌经PFGE-XbaⅠ和PFGE-BlnⅠ电泳分为4个PFGE模式,其中3株菌同源性100%;1株多耐药菌(外籍患者),1株单耐药菌(外省滞留史患者),1株完全敏感菌,同一PFGE模式的3株菌药敏表型一致,除对氨基糖甙类和喹诺酮类部分抗生素中介外,对其他抗生素均敏感;除外籍患者标本分离株viaB基因阴性外,其他菌viaB基因均阳性。结论烟台寒杆菌对临床常用抗生素敏感性良好,仍需重视伤寒散发病例发生和伤寒输入感染。     

血浆凝固酶阴性葡萄球菌鉴定及耐药谱分析

目的比较几种血浆固酶阳性葡萄球菌鉴定方法,探讨质粒谱与耐药谱之间的关系。方法生化、粘质、耐药谱及质粒谱分析对来自医院１８８株血浆凝固酶阴性葡萄球菌（ＣＮＳ）进行了鉴定。结果头部葡萄球菌（头葡）、表皮葡萄球菌（表葡）、木糖葡萄球菌（木葡）、人型葡萄球菌（人葡）为其主要生化型。５０％菌株产生粘质,耐药率高达９４％。对万古霉素（ＶＡＮ）、氟哌酸（ＮＯＲ）、丁胺卡那霉素（ＡＫＮ）敏感。质粒检出率７３．９％。３种质粒谱常见。结论手术伤口、患者鼻咽部、医护人员及空气标本中ＣＮＳ之间有同源性。８０％以上头葡和木葡只携带１个５４ｋｂ质粒。携带有２．２、１．６ｋｂ,１．６、１．４ｋｂ成对质粒的ＣＮＳ大多具有同一耐药谱