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相似文献
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1.
《中成药》2019,(5)
目的分析左金丸活性成分-靶点-多维作用机制。方法通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库获取左金丸活性成分及对应靶点,TTD数据库预测分析左金丸潜在治疗疾病,Cytoscape软件分别构建活性成分-靶点、靶点-疾病网络,STRING平台构建靶蛋白互作网络,BINGO和MCODE插件对靶基因进行GO生物过程富集和聚类分析,生物学信息注释数据库(DAVID)对靶点进行KEGG信号通路分析。结果左金丸中13种活性成分作用于49个潜在靶点,涉及炎症反应调节、突触传递、细胞分化、凋亡等19个生物子簇;KEGG富集得到消化液分泌、癌症、内分泌、神经递质、炎症、信号转导、心血管7大类22条信号通路,在消化、神经、心血管系统疾病以及炎症、癌症等方面具有治疗价值。结论本研究揭示了左金丸活性成分、靶点、多维作用机制,可为其临床治疗价值拓展提供新的线索。  相似文献   

2.
目的基于网络药理学研究枳实芍药散活性成分-靶点-通路及其药理机制。方法利用网络药理学分析平台(BATMAN-TCM)获取枳实芍药散活性成分及其对应靶点;利用STRING平台构建蛋白互作网络(PPI),依据度值和介数筛选关键靶蛋白;利用Bi NGO和MCODE插件对关键靶基因进行基因本体(GO)生物过程富集和聚类分析;利用DAVID数据库分析靶点的京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路。结果获得辛弗林、D-柠檬烯、N-甲基酪胺、没食子儿茶素、芍药新苷等26个主要活性成分及143个靶点,发现了DRD2、MAPK1、CHRM2、TNF、PTGS2、SLC18A2等35个关键靶点。聚类分析418个GO生物过程得到解热抗炎、神经突触递质、蛋白质分泌运输、转录、细胞代谢调控等10个子簇。KEGG信号通路富集主要涉及神经递质、信号转导、肿瘤、物质代谢及其他等5大类22条信号通路。结论枳实芍药散能作用于前列腺素内环氧合酶2、肿瘤坏死因子、乙酰胆碱受体、多巴胺受体、5-羟色胺受体、视黄酸受体α等靶点,参与抗炎、神经递质调节、抗肿瘤等生物过程和信号通路,对炎症、胃肠系统、神经系统及肿瘤疾病具有良好的药理作用。  相似文献   

3.
目的基于网络药理学方法分析芎附散活性成分、靶点、通路之间的关系,探讨其作用机制。方法依托BATMAN-TCM数据库和TCMSP平台筛选芎附散的活性成分及靶点;借助STRING平台构建靶蛋白相互作用网络;利用BiNGO和MCODE插件进行靶基因GO生物过程富集和聚类分析;通过DAVID数据库富集分析关键靶点的KEGG信号通路。结果从芎附散中筛选得到丁苯酞、(Z)-藁本内酯、α-香附酮、洋川芎内脂A、洋川芎内脂I等14种活性成分;作用于DRD5、HTR2A、ADR、MAOA、F2、VEGF、NOS3、ESR1、PGR等30个关键靶点;参与内皮细胞与血管形成、多巴胺受体信号通路等12个主要GO生物过程子簇;调控血小板活化、血管内皮生长因子、钙离子、雌激素信号通路,以及5-羟色胺、多巴胺、γ-氨基丁酸等神经递质通路。结论初步解释了芎附散治疗神经系统、心血管系统以及妇科疾病的药效物质基础及其作用机理。  相似文献   

4.
目的:运用网络药理学方法研究小半夏汤活性成分、靶点、通路及生物过程,探讨其药效物质及作用机制。方法:通过TCMSP数据库及BATMAN-TCM分析平台获取小半夏汤活性成分及靶点;采用string数据库构建PPI网络,运用Cytoscape软件进行可视化展示;通过DAVID数据库富集靶点KEGG信号通路;利用BINGO、ClueGO插件进行GO生物过程富集和聚类分析。结果:发现小半夏汤16种活性成分作用于209个靶基因,主要富集在心血管、神经、癌症、炎症等7大类30条KEGG通路;SRC、MAPK1、FOS、JUN、CREB1、ESR1、 BCL2、TNF等43个关键靶基因,主要参与轴突再生、神经元投影再生等神经生物过程。结论:小半夏汤除了化痰散饮、和胃降逆的传统功效外,还可能在炎症、癌症以及心血管和神经系统方面具有药理作用。  相似文献   

5.
目的:基于网络药理学研究鹿茸活性成分-靶点-通路及其药理机制。方法:利用网络药理学分析平台(BATMAN-TCM)获取鹿茸活性成分及其对应靶点;利用STRING平台构建蛋白互作网络(PPI),依据度值和介数筛选关键靶蛋白;利用ClueGO插件对关键靶基因进行基因本体(GO)生物过程富集;利用Metascape数据库分析靶点的(KEGG)信号通路。结果:获得17-β-雌二醇、α-雌二醇、视黄醇、雌酮等14个成分及306个靶点,发现了MED1、ADCY1、RXRA、CXCR4、ESR1、DRD2等26个关键靶点。ClueGO分析57个GO生物过程得到G蛋白耦合受体蛋白信号通路的负调节、一氧化氮生物合成、前列腺发育等7个子簇。KEGG信号通路富集主要涉及癌症、内分泌系统、癌症特定类型、抗肿瘤耐药性、免疫系统、物质依赖、信号转导等7大类68条信号通路。结论:鹿茸是通过多成分、多靶点、多信号通路协调发挥治疗疾病作用,其中在治疗骨质疏松症和抗肿瘤方面具有潜在的优势。  相似文献   

6.
孙帅玲  马晓北 《陕西中医》2021,(12):1793-1797
目的:基于网络药理学方法探讨茵陈蒿汤治疗高脂血症的作用机制。方法:使用TCMSP数据库筛选出茵陈蒿汤主要活性成分及作用靶点; 使用Gencards、Drugbank、OMIM数据库筛选高脂血症靶基因,利用韦恩图取交集得到潜在作用靶点; 利用String平台分析靶点蛋白的交互关系; 通过Metascape平台进行GO富集和KEGG富集分析其作用机理; 并利用Cytoscape构建“活性成分-靶点-通路”可视化网络图。结果:共筛选茵陈蒿汤17个有效成分,57个调治高脂血症潜在靶点; PPI网络中Degree值前3名的核心靶点分别为IL-6、AKT1、TNF; GO与KEGG富集主要通过细胞对活性氧代谢、脂质反应、对脂多糖反应等过程及AGE-RAGE、流体剪切应力与动脉粥样硬化、HIF-1等信号通路发挥其生物效应,体现了茵陈蒿汤多成分、多靶点、多通路调治高脂血症的特点。结论:茵陈蒿汤通过抑制脂肪生成、代谢,促进胆固醇排泄,抗氧化,调节炎症反应血管重塑等发挥调节血脂的作用。  相似文献   

7.
目的:通过网络药理学探讨淫羊藿增强免疫功能可能的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索淫羊藿的活性成分和靶点。利用Cytoscape 3.7.1软件构建“药物-活性成分-靶点”网络图。通过人类基因数据库(GeneCards)检索免疫抑制的相关靶点,利用STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析,利用DAVID平台进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集通路分析。结果:筛选出淫羊藿21个有效活性成分,179个潜在靶点。GO生物过程共562条,包括信号转导、炎症反应、凋亡过程等;KEGG信号通路共120条,主要涉及癌症途径、MAPK信号通路、PI3K-AKT信号通路、TNF信号通路等。结论:淫羊藿的活性成分通过作用于AKT1、TP53、IL6、VEGFA等靶点,参与信号转导等生物过程,调控癌症途径、TNF信号通路等多个途径发挥增强免疫功能的作用。  相似文献   

8.
目的基于网络药理学方法分析葶苈大枣泄肺汤治疗结核性胸膜炎的作用机制。方法借助中药系统药 理学分析平台( TCMSP)和蛋白数据库(UniProt)获得葶苈子、大枣的活性成分及其作用靶点。利用Genecards 数 据库和OMIM 数据库获取结核性胸膜炎相关疾病靶点,并与活性成分靶点进行映射,取交集,得到葶苈大枣 泄肺汤治疗结核性胸膜炎的共同(直接)靶点。使用String 数据库和Cytoscape 3.7.2 软件构建靶蛋白互作(PPI) 网络及活性成分-靶点网络。通过Metascape 数据库对共同靶点进行GO 功能和KEGG 通路富集分析,借助微 生信网站绘制富集气泡图,利用Cytoscape 3.7.2 软件构建共同靶点-信号通路网络。结果共有18 个活性成分 通过24 个共同靶点作用于结核性胸膜炎,核心靶点主要包括MMP9、VEGFA、IL6、TNF、IL1B、CCL2 等。 共同靶点的GO 功能富集分析涉及包括细胞因子信号转导、趋化因子调控、脂多糖应答在内的主要生物进程。 KEGG 通路富集分析得到AGE-RAGE、NF-κB、HIF-1、癌症中的转录失调、癌症中的蛋白聚糖通路等11 条 显著相关的信号通路。结论葶苈大枣泄肺汤可能主要通过抑制炎症、增强免疫、抗氧化等途径对结核性胸膜 炎起到治疗作用。  相似文献   

9.
目的:采用网络药理学方法探讨酸枣仁汤的作用机制.方法:借助TCMSP平台预测酸枣仁汤中药成分的作用靶点与通路,利用Cytoscape软件分别构建成分-靶点网络、PPI网络,使用DIVID数据库进行GO富集分析和KEGG信号通路富集分析.结果:经筛选获得酸枣仁汤中五味中药酸枣仁、川芎、知母、茯苓、甘草含有的135种活性成分,332个相应靶点;PPI网络包括293个节点;GO条目146个,其中生物过程为94个,分子功能条目34个,细胞组成条目18个;KEGG通路22条.结论:酸枣仁汤不仅可以用于治疗失眠、焦虑等精神系统疾病,还可以用于治疗肿瘤、循环系统等疾病,同时参与5-羟色胺、氮素代谢等生物过程,揭示了酸枣仁汤多成分、多靶点、多通路的药理作用特点.  相似文献   

10.
目的利用生物信息技术研究薏苡附子散网络药理学机制。方法依托BATMAN-TCM数据库对薏苡附子散进行成分筛选和靶点预测,利用STRING平台构建靶蛋白相互作用网络,利用BiNGO和MCODE插件对靶基因进行GO生物过程富集和聚类模块分析,通过DAVID服务器对薏苡附子散潜在靶基因进行KEGG信号通路富集。结果薏苡附子散中去甲乌药碱、薏苡素、苯甲酰乌头原碱、薏苡酯等14个活性成分,作用于5-羟色胺受体、多巴胺受体、M2胆碱受体、前列腺素受体E2、肾上腺素受体等66个靶点,涉及cAMP信号转导、钙离子调节、神经调节、细胞周期、细胞凋亡等多种生物过程,参与神经调节、内分泌调节、信号转导、糖类代谢、精神疾病、炎症及其他7大类19条信号通路。结论薏苡附子散不仅具有治疗胸痹急痛、强心、中枢止痛的作用,还可能具有抗癌、抗炎、抗抑郁及调节血糖等作用。  相似文献   

11.
目的:运用网络药理学方法挖掘桂枝-柴胡治疗慢性心力衰竭(CHF)伴抑郁(MDD)的主要活性成分、靶点及信号通路,探究其潜在作用机制.方法:通过TCMSP数据库和相关文献检索桂枝-柴胡主要活性成分及其作用靶点,经BAT-MAN-TCM平台对预测靶点予以补充,构建药物靶点库;通过GeneCards、DisGeNET数据库分别获取CHF与抑郁相关靶标,二者取交集,建立疾病靶标库;利用R语言将药物靶点库与疾病靶标库取交集,构建Venn图;通过STRING数据库和Cytoscape 3.7.1软件及其内在插件构建化合物-靶标网络及PPI核心网络;最后利用DAVID数据库对核心网络靶点进行GO富集和KEGG通路注释分析.结果:筛选出桂枝-柴胡有27个活性成分,288个靶基因;筛选出CHF伴MDD相关靶基因882个,药物与疾病Venn图提取关键靶点83个,PPI核心网络构建筛选出12个关键基因;GO分析(P<0.05且靶点基因富集度>10%)得到19条生物过程,13条细胞组分表达过程,8个分子功能相关过程;KEGG分析(P<0.05)显示72条信号通路,包括HIF-1信号通路、TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路、神经活性配体-受体相互作用信号通路等.结论:桂枝-柴胡活性成分通过多成分、多靶点、多通路发挥CHF伴MDD的治疗作用.  相似文献   

12.
目的:基于网络药理学方法分析龟甲胶治疗围绝经期失眠症的作用机制。方法:借助中药分子机制的生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)检索龟甲胶所含中药的化学成分和作用靶基因,同时检索人类基因数据库(GeneCards)、人类孟德尔遗传综合数据库(OMIM)获得与围绝经期失眠症治疗相关的靶基因,借助Venny2.1平台对疾病靶基因与药物作用靶基因取交集,采用Cytoscape 3.7.2软件绘制疾病-靶基因-通路-中药成分网络图,利用String数据库构建靶基因蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,采用R语言对靶基因进行GO功能、KEGG通路富集分析。结果:根据网络药理学相关数据库检索及分析得到龟甲胶所含中药的6个活性成分与围绝经期失眠症相关的ASPA、MPO、PPIG、EDN1、GLRA1等21个关键靶基因相互作用。GO功能富集分析得到相关条目共592个,其中生物过程514个,细胞组分49个,分子功能29个。主要涉及茶酚胺代谢、神经递质水平调节、突触传递,多巴胺能、氨基酸结合、神经递质受体活性等信号通路,KEGG通路富集分析筛选得到11条信号通路,主要涉及多巴胺能突触、苯丙胺成瘾、cAMP信号通路、TNF信号通路等。结论:龟甲胶可通过多靶点、多通路达到治疗围绝经期失眠症的效果,这为进一步深入探讨其作用机制提供了参考。  相似文献   

13.
目的:通过网络药理学和分子对接探讨茵陈蒿汤治疗慢加急性肝衰竭的作用机制。方法:利用TCMSP、Uniprot数据库收集茵陈蒿汤活性成分及对应靶点;使用GeneCards和OMIM数据库收集慢加急性肝衰竭相关靶点,并筛选药物与疾病交集靶点;运用STRING数据库获得蛋白质相互作用(PPI)网络,Cytoscape 3.9.1软件构建“中药-活性成分-靶点”网络,利用Metascape数据库进行GO生物功能和KEGG通路富集分析;借助AutoDock等软件进行分子对接验证。结果:茵陈蒿汤治疗ACLF的核心活性成分包括槲皮素、异鼠李素、山柰酚、豆甾醇、β-谷甾醇等,核心靶点有AKT1、MAPK、TNF、IL-6等。KEGG分析主要涉及AGE-RAGE信号通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路和TNF信号通路等188条信号通路。分子对接结果显示核心成分与核心靶点具有良好的结合活性。结论:茵陈蒿汤治疗慢加急性肝衰竭具有多成分、多靶点、多通路的综合优势和特点。  相似文献   

14.
目的 采用网络药理学方法预测酸枣仁汤抗抑郁的作用机制。方法 在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索酸枣仁汤的活性成分及相应靶点,在GeneCards、OMIM及DRUGBANK数据库获取抑郁症相关的靶点;使用STRING数据库构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络;对交集靶点利用DAVID数据库进行基因本体论(GO)富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析;使用Cytoscape 3.7.1软件构建“酸枣仁汤-成分-靶点-通路”网络。结果 从酸枣仁汤中筛选出15个核心活性成分,涉及槲皮素、山柰酚、柚皮素等;32个核心靶点,涉及STAT3、JUN、AKT1、MAPK1等;GO富集得到的条目共276个[伪发现率(FDR)<0.01],KEGG富集得到114个信号通路(FDR<0.01),涉及PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、VEGF信号通路等。结论 此研究初步探讨了酸枣仁汤抗抑郁的多成分、多靶点、多通路作用机制,为抑郁症的治疗提供思路和参考。  相似文献   

15.
侯雪楠  张苗  崔赛男  杨蕾  李强 《新中医》2020,52(11):26-31
目的:运用网络药理学的方法探讨四逆散"一方多效"的分子机制。方法:通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库进行四逆散主要活性成分、相关作用靶点的预测和筛选。借助检索相互作用的基因/蛋白质搜索工具平台(STRING)构建靶蛋白互作网络,利用BiNGO和MCODE插件对靶基因进行基因本体(GO)生物过程富集和聚类分析,运用注释、可视化和集成发现的数据库(DAVID)平台对关键靶点京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路进行富集分析。结果:从四逆散中共筛选出121种活性成分,并作用于248个潜在靶点,参与炎症免疫调控、体内物质代谢、信号转导等54个主要GO生物过程,调控癌症、免疫炎症、细胞信号转导等137条信号通路。结论:四逆散有"一方多效"的临床应用价值,其不仅对多种免疫炎症疾病(如溃疡性结肠炎、类风湿性关节炎等)具有很好的疗效,同时也可以有效治疗神经系统疾病、癌症等。  相似文献   

16.
目的:通过网络药理学分析藿朴夏苓汤的成分、靶点及其潜在的作用机制,探讨其对新型冠状病毒肺炎的治疗作用。方法:通过TCMSP搜集藿朴夏苓汤组方的活性成分及靶点,运用STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用分析,使用Cytoscape 3.6.0软件构建网络,并进行模块化、拓扑学分析筛选关键靶点,将筛选到的关键靶点导入DAVID数据库,进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。结果:藿朴夏苓汤的11味中药含71个活性成分235个靶点,蛋白质-蛋白质相互作用网络具有4个模块,筛选出41个关键靶点,GO功能富集分析涉及72个条目,KEGG通路富集分析涉及73个通路。结论:藿朴夏苓汤的成分具有抗炎、免疫调节、抗肺纤维化的作用,可能通过调控肿瘤坏死因子信号通路、Toll样受体信号通路、NOD样受体信号通路、HIF-1信号通路等发挥对新型冠状病毒肺炎的治疗作用。  相似文献   

17.
目的:基于网络药理学探讨三物黄芩汤治疗乳腺癌的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选三物黄芩汤有效活性成分及潜在靶点,在Genecard、OMIM和TTD数据库中寻找乳腺癌相关靶点基因,取三物黄芩汤靶点基因与乳腺癌相关靶点基因共同靶点。通过Cytoscape 3.5.0软件构建“三物黄芩汤活性成分-潜在靶点-乳腺癌”网络图。运用String数据库构建构建蛋白质互作(PPI)网络图。对潜在靶点基因进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果:TCMSP数据库筛选得到三物黄芩汤有效活性成分83个,主要包括有木犀草素、槲皮素、菜豆素、汉黄芩素、黄芩素、黄芩苷以及地黄多糖等。与乳腺癌相关潜在作用靶基因99个,KEGG富集通路分析主要包括脂质-动脉粥样硬化信号通路、化学致癌作用-受体激活通路、PI3K/Akt信号通路以及IL-17信号通路等。结论:三物黄芩汤具有多活性成分,能通过多靶点、多通路发挥乳腺癌治疗作用。  相似文献   

18.
目的 运用网络药理学及分子对接技术,探讨益肾清肝方逆转乳腺癌内分泌治疗耐药的活性成分、潜在靶点和作用机制。方法 通过TCMSP数据库筛选益肾清肝方的有效活性成分和作用靶点,利用GEO数据库检索获得乳腺癌内分泌治疗耐药的原始基因表达谱数据(GSE67916)以获取乳腺癌内分泌治疗耐药的相关靶基因,并与活性成分作用靶点相映射以得到共同靶点。通过STRING在线数据库构建益肾清肝方逆转乳腺癌内分泌治疗耐药PPI网络,并借助Cytoscape3.8.2软件筛选关键靶点;通过Metascape平台对关键靶点进行GO和KEGG富集分析,利用Cytoscape3.8.2软件构建靶点-活性成分-通路相互作用网络,对主要活性成分与关键靶点进行分子对接验证。结果 共筛选出益肾清肝方活性成分122个,与疾病的交集靶点30个,主要涉及ESR1、TP53、STAT3、MAPK1、PGR等。KEGG富集分析显示FoxO、P53、雌激素、PI3K-Akt等信号通路可能是益肾清肝方逆转乳腺癌内分泌治疗耐药的关键信号通路,由靶点-活性成分-通路网络得出β-谷甾醇、木犀草素、山柰酚、槲皮素、苦参碱等是发挥作用的主要活性成...  相似文献   

19.
目的:通过网络药理学和分子对接技术,探讨黄芪-白花蛇舌草抗非小细胞肺癌(NSCLC)的潜在活性成分和作用机制。方法:利用TCMSP和Uniprot数据库获取黄芪-白花蛇舌草的主要活性成分及靶点基因;GeneCards、OMIM数据库获取NSCLC靶点基因;绘制韦恩图得到疾病和活性成分共同靶点;STRING数据库构建中药成分靶蛋白-疾病靶蛋白的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;Cytoscape 3.9.1软件绘制成分-靶点网络图,通过网络拓扑分析筛选出关键靶点及成分;DAVID数据库及Bioinformatics平台进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;PyMol软件和AotoDock软件绘制相应的分子对接图。结果:经筛选共得到653个黄芪-白花蛇舌草活性成分靶点和6178个疾病靶点,两者交集靶点154个。GO功能富集到747个生物过程、83个分子功能和150个细胞组分,KEGG通路富集分析得到167条信号通路。分子对接结果显示,PTGS1蛋白与活性成分槲皮素、山柰酚、芒柄花黄素均结合稳定。结论:黄芪-白花蛇舌草可能通过槲皮素、山柰酚、芒柄花黄...  相似文献   

20.
《中药材》2019,(11)
目的:采用网络药理学方法探究中药干姜的主要活性成分及其抗肿瘤转移作用机制。方法:在中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库中检索干姜的化学成分,根据"类药五原则"与"口服生物利用度"≥30%这一标准筛选干姜的活性成分,预测其活性成分对应的作用靶点,采用Cytoscape 3.2.1软件构建活性成分-预测靶点网络图。在Genecards数据库中以"anti-tumor metastasis"为关键词搜索抗肿瘤转移靶点,与干姜靶点映射筛选出共同靶点作为干姜的抗肿瘤转移靶点。将干姜抗肿瘤转移靶点导入STRING数据库中进行蛋白质-蛋白质相互作用分析,构建靶蛋白相互作用网络图(PPI),利用Cytoscape 3.2.1的"CytoNCA"插件筛选干姜的抗肿瘤转移核心靶点。使用DAVID数据库及Cytoscape 3.2.1的"GlueGO"插件对干姜抗肿瘤转移靶点进行KEGG信号通路富集分析和GO生物过程富集分析。结果:获得干姜中具有类药性、口服吸收良好的活性成分52种,对应靶点101个。其中抗肿瘤转移靶点40个,核心靶点10个。KEGG富集分析得到与干姜抗转移作用有关的信号通路62条,主要涉及TNF信号通路、VEGF信号通路等。GO富集分析得出与干姜抗转移作用有关的生物过程45个,主要涉及低氧反应、活性氧代谢过程等。结论:本研究初步揭示了干姜的药效物质基础及其可能的抗肿瘤转移作用机制,可为干姜抗肿瘤研究提供参考。  相似文献   

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