细胞色素氧化酶P4501A1基因多态性与中国西南地区汉族人群慢性阻塞性肺疾病易感相关性的研究

目的:探讨中国西南地区汉族人群细胞色素氧化酶P4501A1(CYP1A1)基因多态性与慢性阻塞性肺疾病(COPD)易感性和肺功能损害程度的关系.方法:应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析的方法分别对年龄、性别、吸烟史匹配的115例COPD患者和94例健康对照者的外显子7上rs1048943和内含子1上rs4646421的基因多态性进行检测.结果:115例COPD患者外显子7rs1048943位点A/A、A/G、G/G3种基因型的分布频率分别是39.1%,53.1%,7.8%,而对照组分别为56.4%,39.4%,4.2%,两组比较差异有统计学意义(P＜0.05).内含子1上rs4646421位点C/C、C/T、T/T3种基因型的分布频率分别为27.0%,51.3%,21.7%;而对照组这三个基因型的分布频率分别为24.5%,53.2%,22.3%,两组比较差异无统计学意义(P＞0.05).肺功能正常者即对照组与COPDⅠ级患者、COPDⅠ级与Ⅱ级患者、COPDⅡ级与Ⅲ级患者、COPDⅢ级与Ⅳ级患者之间基因型分布进行比较,rs1048943位点P值分别为0.294,0.718,0.052,0.405;rs4646421位点P值分别为0.808,0.366,0.301,0.356.结论:CYP1A1外显子7rs1048943位点基因多态性可能与中国西南地区汉族COPD患者的发病有关.     

骨保护素基因rs2073617T/C、rs2073618G/C多态性在东南沿海地区汉族人群中分布及与急性冠状动脉综合征相关性研究

目的 探讨骨保护素(OPG)基因启动子rs2073617T/C和第一外显子rs2073618G/C位点基因多态性在福建地区汉族人群中的分布及与急性冠状动脉综合征(ACS)的相关性.方法 纳入720例福建地区无血缘关系的汉族人为研究对象,分成ACS 360例(ACS组)和对照组360例(对照组),采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术,对OPG基因rs2073617T/C和rs2073618G/C多态性位点进行基因型分型,同时采用DNA测序对酶切产物进行鉴定.结果 (1)在福建地区汉族人群中,OPG基因rs2073617T/C多态性位点存在TC、TT、CC三种基因型;rs2073618G/C多态性位点也存在GG、GC、CC三种基因型.(2)对ACS组与正常对照组OPG基因rs2073617T/C、rs2073618G/C基因型及等位基因频率分布进行比较均无统计学差异(P均>0.05).(3)ACS组患者单支病变、双支病变及三支以上病变组之间比较OPG基因rs2073617T/C、rs2073618G/C各基因型差异无统计学意义(P均>0.05).结论 福建地区汉族人群OPG rs2073617T/C、rs2073618G/C位点基因多态性与ACS发生无明确相关性.     

Smad7基因rs4464148位点单核苷酸多态性与胆管癌的相关性

[目的]探讨Smad7基因rs4464148位点单核苷酸多态性与胆管癌发生风险及预后的相关性.[方法]取湖南省人民医院2010年1月至2014年1月期间行手术切除并经过病理确诊的70例胆管癌组织(观察组)和40例非肿瘤性疾病患者的胆管组织(对照组),所有胆管癌患者术前没有接受过辅助性放化疗.使用LDR-PCR方法进行检测观察组和对照组Smad7基因rs4464148位点单核苷酸多态性,分析不同基因型与胆管癌发病风险及其预后的关系.[结果]Smad7基因rs4464148位点有AA、AG、GG基因型,观察组AG/GG基因型频率和G等位基因频率均高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05).Logistic多因素回归分析显示,AG、AG/GG型基因型OR值分别为1.40、1.35,AG/GG基因型可能是胆管癌的发病因素.淋巴结转移、无复发或进展患者AG/GG、AA基因型频率比较,差异有统计学意义(P<0.05).rs4464148 AG/GG基因型患者3年生存率低于AA基因型患者,但差异无统计学意义(P>0.05).[结论]Smad7基因rs4464148位点AG/GG基因型可能是胆管癌的发病危险因素,有可能成为判断胆管癌预后的指标.     

TNFAIP3基因rs5029939位点与重症肌无力相关研究

目的：探讨肿瘤坏死因子ɑ诱导蛋白3(TNFAIP3)基因rs5029939位点多态性与重症肌无力（MG）的相关性。方法：98例中国北方成年MG患者（MG组）和87例健康对照（对照组）纳入研究。采用SNPscanTM多重SNP分型试剂盒检测MG组和对照组rs5029939基因位点的基因型，并进行组间和组内基因型的比较。结果：MG患者TNFAIP3基因rs5029939位点C/C、C/G、G/G基因型及等位基因G出现的频率与对照组比较差异无统计学差异（P>0.05）。将病例组按照性别、发病年龄、是否伴发胸腺瘤、抗AChR抗体是否阳性及临床分型进行亚组分析，结果显示抗乙酰胆碱受体抗体阴性患者rs5029939位点的G基因频率显著低于抗乙酰胆碱受体阳性患者（P=0.046, OR=0.328, 95%CI 0.115-0.935），其余各亚组比较差异均无统计学意义（P>0.05）。结论：TNFAIP3基因rs5029939位点多态性与MG患者抗AChR抗体表达相关。     

MiR-149 rs22928323位点基因多态性与RA相关性分析

目的探讨微小RNA-149(MiR-149)rs22928323位点基因多态性与类风湿关节炎(RA)发病的关系。方法选取确诊的RA患者90例(RA组)、健康自愿者90例(健康组),收集时间2014年1月-2016年12月,采用聚合酶链反应(PCR)技术检测两组外周血MiR-149 rs22928323位点的基因型、等位基因频率,并采用多因素分析法研究MiR-149 rs22928323位点基因多态性与RA发病的关系。结果 RA组患者的MiR-149 rs22928323位点TC基因型50.00%高于健康组TC基因型的28.89%(P0.05),RA组的等位基因T的频率51.67%显著的高于健康组的等位基因T频率36.67%(P0.05);RA组和健康组的年龄、性别、白细胞(WBC)、血小板(PLT)、尿WBC比较,差异均无统计学意义(P0.05);RA组的尿蛋白、抗角蛋白抗体(Antikeratin antibody,AKA)阳性率、抗环瓜氨酸肽抗体(Anti-cyclic citrullinated peptide antibody,CCP)阳性率均显著的高于健康组(P0.05);Logistic回归分析显示:AKA阳性表达、CCP阳性表达、等位基因T的频率增加是人群RA发病的独立危险因素(P0.05)。结论 RNA-149(MiR-149)rs22928323位点等位基因T频率增加是人群RA发病的独立危险因素。     

Smad7基因rs4464148位点单核苷酸多态性与胆管癌的相关性

[目的]探讨Smad7基因rs4464148位点单核苷酸多态性与胆管癌发生风险及预后的相关性.[方法]取湖南省人民医院2010年1月至2014年1月期间行手术切除并经过病理确诊的70例胆管癌组织(观察组)和40例非肿瘤性疾病患者的胆管组织(对照组),所有胆管癌患者术前没有接受过辅助性放化疗.使用LDR-PCR方法进行检测观察组和对照组Smad7基因rs4464148位点单核苷酸多态性,分析不同基因型与胆管癌发病风险及其预后的关系.[结果]Smad7基因rs4464148位点有AA、AG、GG基因型,观察组AG/GG基因型频率和G等位基因频率均高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05).Logistic多因素回归分析显示,AG、AG/GG型基因型OR值分别为1.40、1.35,AG/GG基因型可能是胆管癌的发病因素.淋巴结转移、无复发或进展患者AG/GG、AA基因型频率比较,差异有统计学意义(P<0.05).rs4464148 AG/GG基因型患者3年生存率低于AA基因型患者,但差异无统计学意义(P>0.05).[结论]Smad7基因rs4464148位点AG/GG基因型可能是胆管癌的发病危险因素,有可能成为判断胆管癌预后的指标.     

散发性乳癌WIF-1基因启动子区多态性研究

目的探讨WIF-1基因启动子区rs58172684 A/G与rs2336433 C/T位点单核苷酸多态性与散发性乳癌发生的关系。方法采用等位基因特异性扩增（ASA）法对200例乳癌病人和200例正常对照者的WIF-1基因启动子区rs58172684 A/G与rs2336433 C/T位点单核苷酸多态性进行分析,PCR产物进行测序。结果乳癌病人WIF-1基因启动子区rs58172684 A/G与rs2336433 C/T位点基因型频率与正常对照者比较差异具有显著性（χ2=117.475、38.798,P〈0.001）;乳癌病人rs58172684 G等位基因频率显著高于正常对照者（χ2=11.620,P〈0.001）。rs58172684 A/G位点AA、AG、GG等3种基因型和rs2336433 C/T位点CC、CT、TT等3种基因型与年龄、病理分级、组织分型及淋巴结转移无关（P〉0.05）。结论乳癌病人WIF-1基因启动子区rs58172684 A/G与rs2336433 C/T单核苷酸多态性可能与散发性乳癌的发生相关,G等位基因可能为其发生的遗传危险因素。     

深圳地区类风湿关节炎患者 IL-17A 基因 rs2275913 位点多态性与血清中 IL-17A，IL-38 水平表达的相关性研究

目的　了解深圳地区类风湿关节炎（Hieumatord arthritis, RA）患者 IL-17A 基因 rs2275913 位点多态性与血清中 IL17A,IL-38 水平表达的相关性。方法　选择 103 例 RA 患者作为 RA 组,另选取 116 例非 RA 健康人群作为对照组。分别检测 IL-17A,IL-38 及类风湿因子（rheumatoid factors, RF）水平,同时对 IL-17A 基因 rs2275913 位点多态性进行分析。结果 RA 组 IL-17A 和 RF 水平（54.06±1.87 pg/ml 和 29.65±4.02 IU/ml）明显高于对照组（33.29±1.42 pg/ml 和 5.27±1.38 IU/ml）,而 IL-38 水平（40.92±8.67 pg/ml）明显低于对照组（53.78±12.04 pg/ml）,两组差异有统计学意义（t=7.206 5,18.297 2,5.0197,均 P<0.05）。RA 组随着病情活动度的加重 IL-17A 和 RF 水平明显升高,而 IL-38 水平明显降低,不同活动度之间差异均有统计学意义（F=12.527 1,7.935 1,9.2702,均 P<0.05）。RA 组 IL-17A 基因 rs2275913 位点AA基因型和A等位基因检出率（47.57%和63.11%）明显高于对照组（15.52%和30.60%）,两组差异有统计学意义（χ2=5.9256,4.027 2,均 P<0.05）。RA 组 AA 基因型 IL-17A 水平比 AG 和 GG 基因型明显升高,而 IL-38 水平明显降低,不同基因型之间差异有统计学意义（F=7.062 5,5.187 3,P 均 <0.05）,但不同基因型 RF 水平差异无统计学意义（F= 1.096 1,P=0.120 5）。经 Spearman 相关性分析,RA 组 IL-17A 水平与 RF 水平呈正相关,而与 IL-38 水平呈负相关（r=0.501 2,-0.692 4,均 P<0.05）。结论　RA 组 IL-17A 水平明显升高,且随病情活动度加重而升高。同时 IL-17A 基因 rs2275913 位点多态性与深圳地区 RA 发病的易感性相关,其中 AA 基因型可能是 RA 发病的易感危险基因之一。     

东北汉族人群抵抗素基因rs1862513(G/C)多态性与2型糖尿病相关性研究

目的探讨东北汉族抵抗素基因rs1862513(G/C)位点与2型糖尿病发病及临床表型相关性。方法应用连接酶反应分型法检测79例2型糖尿病患者及79例正常对照者rs1862513(G/C)多态性。结果 2型糖尿病组和对照组抵抗素rs1862513(G/C)位点基因型分布分别为GG49.5%、GC44.3%、CC6.2%和GG40.2%、GC47.4%、CC12.4%;等位基因频率分别为G型71.6%、C 28.4%和G型63.9%、C型36.1%,该位点的基因型分布和等位基因频率在两组间分布均无统计学意义(P值均0.05)。病例组CC基因型患者空腹血糖明显低于GG基因型患者(P值0.05),体重指数、总胆固醇、甘油三酯、糖化血红蛋白、高密度脂蛋白胆固醇、低密度脂蛋白胆固醇、胰岛素以及胰岛素敏感指数等临床检测指标在rs1862513(G/C)三种基因型患者之间没有显著差异(P值均0.05)。结论东北汉族人群抵抗素基因rs1862513(G/C)多态性与2型糖尿病发病无显著相关性,但与患者空腹血糖值相关。     

IL2RA,IL-10基因单核苷酸多态性与儿童EBV-HLH相关性的研究

目的:探讨IL2RA,IL-10基因单核苷酸多态性(SNPs)与儿童EBV-HLH发病的关系及关联SNPs对患儿预后的影响。方法:对EBV-HLH组(51例),EBV相关传染性单核细胞增多症(EBV-IM)组(48例)和EBV血清阳性的健康儿童组(52例),用SNaPshot基因分型检测技术检测IL2RA基因的rs2104286、rs12722489、rs11594656位点和IL-10基因的rs1800896、rs1800871、rs1800872位点的基因型,分析各SNP的基因型频率、等位基因频率在每组的分布差异;以关联SNPs进行生存分析。结果:IL-10基因rs1800896位点AA基因型在EBV-HLH组的出现频率高于IM组(58.8%vs 25.0%)和健康对照组(58.8%vs 26.9%);A等位基因在EBV-HLH组的出现频率高于IM组(74.5%vs 54.2%)和健康对照组(74.5%vs 57.7%)。IL-2RA基因rs2104286位点AA基因型在EBV-HLH组的出现频率高于IM组(54.9%vs 27.1%)及健康对照组(54.9%vs 25.0%);A等位基因在EBV-HLH组的出现频率高于IM组(70.6%vs 51.0%)及健康对照组(70.6%vs 46.2%)。不同基因型的EBV-HLH患儿的Kaplan-Meier生存曲线,差异无统计学意义。结论:IL-10基因rs1800896位点及IL-2RA基因rs2104286位点多态性可能与儿童EBV-HLH发病相关,两位点的AA基因型、A等位基因可能是儿童EBV-HLH的易感危险因素。     

CALU(rs2307040)基因多态性与华法林稳定剂量的关系研究

目的:探讨CALU(rs2307040)基因型在中国汉族人群中的分布情况及其基因多态性与瓣膜置换术后华法林稳定剂量的相关性。方法:采用Snapshot技术检测226例研究对象CALU(rs2307040)位点基因型,研究其基因型及等位基因频率;比较其中176例瓣膜置换术患者基因多态性与华法林稳定剂量的相关性。结果:226例研究对象,CALU(rs2307040)位点基因型AA、AG和GG分别有0、40和186例,各占0%、17.7%和82.3%,A和G等位基因的频率分别为8.8%和91.2%;176例瓣膜置换术后患者服用华法林达稳定状态,AA型未检出,AG组与GG组比较,华法林日维持剂量、INR值和PT值均无显著统计学差异。结论:中国汉族人群CALU(rs2307040)基因多态性可能不是瓣膜置换术后华法林个体剂量差异的影响因素。     

Associations between inflammasome‐related gene NLRP3 Polymorphisms (rs10754558 and rs35829419) and risk of bladder cancer in a Chinese population

BackgroundNLRP3 inflammasome as a component of immune system has been found related to several cancers, but no study has assessed NLRP3 polymorphisms on risk of bladder cancer (BC). We aim to investigate whether NLRP3 polymorphisms are associated with the risk and clinical features of bladder cancer (BC) in a Chinese population.MethodsGenotype frequency of two commonly studied NLRP3 SNPs (rs10754558 and rs35829419) was examined in 154 patients with BC and the 308 healthy controls. NLRP3 gene polymorphisms were genotyped by polymerase chain reaction‐restriction fragment length polymorphism method.ResultsThe distribution frequencies of GG, AG+GG, GG, and G allele in NLRP3 (rs10754558) genotypes were significantly different between case and control group (OR = 2.296, P = .022; OR = 1.598, P = .020; OR = 1.998, P = .049; OR = 1.557, P = .006), but no statistical difference existed for rs35829419. Among smokers and alcohol drinkers, for rs10754558, individuals with AG, GG, and GG+AG genotypes had a higher BC risk compared with individuals with AA; for rs35829419, individuals with variant genotypes (AG and GG+AG) had a stronger risk of developing BC compared with individuals with AA (all P < .05). In stratified analyses of tumor size and tumor node metastasis, AG or GG genotypes of rs10754558 and rs35829419 SNPs were associated with BC risk (both P < .05).ConclusionNLRP3 polymorphisms (rs10754558 and rs35829419) were related to BC risk and tumor size and lymph node metastasis, especially among smokers and alcohol drinkers.