颅内肿瘤的蛋白质组学研究进展

蛋白质组学是后基因组时代的一门重要学科，它包括双向凝胶电泳技术、激光捕获微切割技术、质谱鉴定技术、蛋白质芯片技术、生物信息学等。蛋白质组学从整体水平对蛋白质进行综合分析，目前已广泛应用于临床和生物医学各个领域，但到目前为止，只有少数报道从血清、脑脊液、肿瘤组织等方面研究了蛋白质组学在颅内肿瘤的诊断价值。本文就蛋白质组学技术的发展情况及其在颅内肿瘤研究中的最新应用进展进行综述。     

蛋白质组学技术在颅脑损伤研究中的应用

蛋白质组学(proteomics)是从整体水平对蛋白质进行研究的一门重要学科,颅脑损伤的蛋白质组学研究目前尚处于起步阶段,它揭示了颅脑损伤后脑组织多种蛋白质的改变及翻译后修饰的变化。采用高通量蛋白质组技术,研究颅脑损伤后的整体蛋白表达变化,有可能为颅脑损伤的监测和治疗提供新的靶标,对于判断颅脑损伤程度、评估预后、调整治疗方案等却有着重要意义。本文就蛋白质组学技术的发展及其在颅脑损伤研究中的应用进展进行综述。     

蛋白质组学技术进展及在老年神经病之中的应用

目的:阐述蛋白质组学研究的最新进展及其在老年神经系统疾病的应用。蛋白质组学是功能基因组时代的支柱学科,是从基因组水平对蛋白质进行综合分析。经典的蛋白质组技术基于双相电泳分离和纯化蛋白质,然后用质谱进行鉴定。蛋白质组学研究有助于阐明老年神经系统疾病的发病机制,寻找疾病相关蛋白,针对疾病靶点定向合成药物。蛋白质组学将为老年神经系统疾病的诊断、治疗和新药研发起到巨大的推动作用。     

创伤性颅脑损伤后蛋白质组学研究进展

目前蛋白质组学技术被越来越多地应用于发生率及死亡率极高的创伤性颅脑损伤领域。作为研究蛋白质整体水平的重要学科,它以其全面性、高通量等特点,为该病的基础和临床治疗研究提供了新思路与新方法。本文将蛋白质组学技术作为一门方法学对其要点进行介绍,也将其在创伤性颅脑损伤研究领域中的新进展进行综述。     

蛋白质组学与器官移植

：随着质谱仪器、蛋白质和肽段的分离技术及数据分析工具的发展,不同组织、器官或细胞的蛋白质表达谱的研究也得到了迅速发展。蛋白质组学最基本的目的就是定性和定量地鉴定一个细胞或组织中的全部蛋白质。因此,如何充分利用质谱数据对蛋白质组学研究的意义很大。近几年,蛋白质组学已开始被应用到器官移植的同种异体排斥反应以及排异反应相关生物标记物的发现等领域。通过这一技术在器官移植中的广泛应用,可以早期发现及处理移植物的排异。因此,蛋白质组学的研究在器官移植排斥反应的诊断中将具有潜在的应用前景。     

开展蛋白质组学科研工作对提高血管神经病学研究生教学质量的重要性

正蛋白质是生理功能的执行者,是生命现象的直接体现者,蛋白质组学是在大规模水平上研究蛋白质的特征[1]。目前,血管神经病学蛋白质组学研究已经取得了一定的进展[2-4]。开展蛋白质组学研究不仅为临床上疾病分子标志物筛查等提供科研支持,同时,将科研的最新成果转变为教学内容传授给学生,大大提高神经学科研究生的教学质量。     

蛋白质组学在精神科学领域的应用

蛋白质组学是在人类基因组计划研究发展的基础上形成的新兴学科,蛋白质组主要是指一个基因组、一种生物或一种细胞、组织所表达的全套蛋白质,它主要研究蛋白质的特性,包括蛋白质表达水平、氨基酸序列、翻译后加工和蛋白质的相互作用,在蛋白质水平上了解细胞的各种功能、生理生化及疾病的病理过程等[1].     

蛋白质组学在肝脏疾病中的研究进展☆

学术背景：蛋白质组学技术的快速发展和广泛应用,为寻找肝病的特异性标志物提供了值得探索的有效手段。近年来在肝脏的相关研究中,许多有潜在价值的标记物相继被发现。 目的：综合分析蛋白质组学在肝脏发育、再生及疾病中的研究进展。 检索策略：应用计算机检索Medline1995-01/2007-07有关蛋白质组学与肝脏疾病关系的文章,检索词为“proteomics,liver”,限定文章语言种类为English。同时计算机检索CNKI数据库1995-01/2007-07 有关蛋白质组学与肝脏疾病关系的文章,检索词“蛋白质组,肝脏”,限定文章语言种类为中文。对资料进行初审,并查找全文。纳入标准：①有关蛋白质组学的研究。②蛋白质组与肝脏疾病关系的研究。排除标准：重复研究和Meta分析。共收集到156篇有关蛋白质组学与肝脏疾病、肝移植关系的文献,纳入32篇。 文献评价：纳入的32篇文章中有关蛋白质组学研究背景的文献3篇,有关健康状态肝脏蛋白质组学研究的文献6篇,有关肝脏疾病蛋白质组学研究的文献23篇。 资料综合：蛋白质组学是指应用各种技术手段来研究蛋白质组的学科,其目的是从整体的角度研究生物机体、组织、细胞甚至细胞器基因编码的全部蛋白质,从整体水平出发的蛋白质组学研究可在更贴近生命本质的层次上去发现和理解生命活动的规律。然而目前针对肝病诊断、分期和治疗的策略十分有限。蛋白质组学技术在肝脏疾病以及肝移植的早期预警、诊断、治疗预后以及肝移植方面具有十分诱人的发展前景。 结论：随着蛋白组学在肝脏疾病中研究的不断深入,将为肝脏疾病的诊治带来一场新的革命。     

脑脊液中神经系统疾病的生物标志物

蛋白质组学（proteomics）技术是采用高分辨率的蛋白质分离手段及高效率的蛋白质鉴定技术,全景式的研究各种特定环境下的人类蛋白质的表达,是后基因组时代的重要技术。蛋白质组学研究主要有两种：组成蛋白质组学,是研究一种组织或细胞基因组的表达的所有蛋白质;另一种是比较蛋白质组学,主要是鉴定不同种类和状态下各种样本之间蛋白质的表达,比较蛋白质组学在临床医学中应用价值巨大。对重大疾病的比较蛋白质组学的研究,可以有助于疾病的早期诊断,预测疾病的转归、检测病情的变化,了解疾病的病理生理过程、寻找新的药物靶点、观察疗效。脑脊液存在于脑室系统,被认为是脑和脊髓的淋巴,正常脑脊液含有极微量的蛋白质,且绝大部分为白蛋白,球蛋白仅有微量,在发生某些疾病如：颅内感染、脑出血、脑肿瘤、中毒性脑病时,脑脊液可发生不同程度的质变和量变,且多为球蛋白,近年来国外应用蛋白组学技术对神经系统疾病患者脑脊液行特异性蛋白标志物检测,探索找到这种疾病的理想的生物标志物,应能代表这种疾病的基本发病机制,其合理性应能被神经病理学所证实,生物标志物在诊断这种病时敏感性和特异性较高,具备可行性和无侵害性。     

《中国现代神经疾病杂志》2008年第8卷著者索引

(按汉语拼音字母顺序排列)C曹向宇等经颈动脉溶栓治疗脑静脉窦血栓的影像学及组织病理学研究(6):535陈宝敏等人脑胶质瘤干/祖细胞系SU-2放射耐受及其相关机制的初步研究(5):453陈宝师等抗血管生成靶向药物治疗恶性胶质瘤的临床研究(5):432陈彪等蛋白质组学技术在神经变性疾病研     

蛋白质组学技术在神经变性疾病研究中的应用

蛋白质是生命活动的载体和生理功能的执行者，对蛋白质复杂多样的结构、功能和相互作用的深入研究，将在分子、细胞和生物体等多个层次上全面揭示生命现象的本质。而蛋白质组学技术可以一次完成大量蛋白质的高通量分析．具有其他研究手段无法比拟的优势，是当今生命与生物技术中最活跃、最前沿、应用最广泛的研究领域之一。自2003年正式启动国际“人类蛋白质组计划”以来．我国政府对蛋白质的研究和发展十分重视，不断加大投入，并将“功能基因组和蛋白质组”研究纳入国家“十一五”科学技术发展规划，成为生物和医药领域4项重大研究项目之一．这必将推动我国蛋白质研究的深入发展，同时有助于了解疾病的发病机制和发现具有应用前景的生物学标志物。随着我国人口老龄化进程的加速，帕金森病和阿尔茨海默病等中枢神经系统疾病的患病率逐年上升，但目前在诊断方面尚无可靠的生物学标志物，而主要依靠医师的临床经验．其漏诊率和误诊率均较高。因此，应用先进的蛋白质组学技术，尽快开发出具有早期预警、早期诊断价值的生物学标志物将是今后中枢神经系统疾病研究的前沿课题。我们将本期专题定为“蛋白质组学研究”，旨在使临床医师更为深入地了解蛋白质组学的相关技术及其在中枢神经系统疾病研究中的应用前景，也希望使大家知道这项实验室中的前沿技术已距临床很近．在不久的将来会成为我们诊断各种神经系统疾病的先进技术。[编者按]     

急性重型脑外伤后脑蛋白表达变化的蛋白质组研究

目的应用蛋白质组学技术，研究重型人脑外伤后的脑皮层蛋白质组表达变化的情况。方法提取脑挫伤部位皮层的总蛋白。通过双向电泳，分离蛋白。应用胶内酶切、生物质谱，鉴定由图像分析软件所得出的具有表达差异的蛋白质点。结果在急性期8h内，目前已发现138个蛋白质点，表达水平具有显著性差异变化。在已鉴定出的83个蛋白点中，属于64种蛋白质。依其功能可分为：细胞骨架、代谢反应、核酸蛋白合成与更新、信号传导、氧化应激反应、功能未知等几类。在急性期，大多数差异蛋白表达水平呈波动变化。结论蛋白质组技术作为一个有力的大规模、高通量的分析蛋白质混合物工具，可快速的建立脑蛋白表达谱。在急性期，脑蛋白质表达呈剧烈变化主要为参与细胞代谢反应、结构修复等组织代偿反应。     

CHPF2在胶质瘤中的表达及预后意义

目的 采用生物信息技术分析软骨素聚合因子2(CHPF2)在胶质瘤中的预后意义,并通过实验进一步验证其在正常和胶质瘤细胞中的表达情况。方法 首先在GEPIA和HPA数据库对CHPF2在胶质瘤和正常细胞的表达水平进行分析,随后在癌症基因组图谱(TCGA)和中国脑胶质瘤基因组图谱(CGGA)下载基因表达和临床信息文件对CHPF2在胶质瘤中的表达、预后、功能注释、免疫浸润和免疫检查点等情况作进一步阐明。最后采用蛋白质印迹(Western Blot, WB)技术分析了CHPF2在正常和胶质瘤组织中的表达水平。结果 CHPF2在胶质瘤中的表达量高于正常组织,且随着肿瘤等级的升高而增加。除性别、放疗和肿瘤再发情况外,年龄、化疗、肿瘤复发、IDH、1p/19q及MGMT等在CHPF2高低表达组中均具有统计学差异。CHPF2较一些常见预后标志物(如TP53、MKI67及EGFR等)对胶质瘤患者生存具有更好的预测性能,可以作为一个独立的预后因素,并通过对TCGA和CGGA数据库的独立预后分析结果进行综合的Meta分析作进一步验证。通过GO、KEGG和GSEA方法,对CHPF2可能富集到的通路进行研究。采用...     

SELDI蛋白芯片技术在中枢神经系统肿瘤研究领域中的应用

1994年Wilkins等首先提出了“蛋白质组”的概念,揭开了蛋白组学研究的序幕。蛋白组学是以蛋白质组为研究对象,研究机体的蛋白质组成、表达,了解蛋白质之间的相互作用,探索蛋白质功能与细胞生命活动规律的一门新兴学科。蛋白质组学技术的应用为疾病的发生、发展机制及诊疗方法的研究提供了新的手段。     

胶质瘤中蛋白质异常糖基化的研究进展

蛋白质的糖基化修饰是一种十分常见的翻译后修饰，影响着超过一半已知真核生物蛋白质的功能。蛋白质异常糖基化是恶性肿瘤的普遍特征，蛋白质异常糖基化往往会通过糖蛋白的基因突变、核苷酸糖供体的变化、糖基转移酶的表达或定位的异常等多种方式导致糖脂和糖蛋白在结构和含量上异常，进而导致蛋白质的功能异常，有助于促进肿瘤的恶性进展。由于胶质瘤的恶性度高，预后差，因此临床急需寻找胶质瘤恶性进展中的关键分子事件。众多的研究发现蛋白质异常糖基化在胶质瘤的发生、发展及不良预后中起着至关重要的作用，同时与胶质瘤相关的糖基化在早期诊断和治疗中也被广泛研究。该综述主要介绍与胶质瘤相关的N-连接糖基化，O-连接糖基化，糖基磷脂酰肌醇（GPI）锚定这3种糖基化形式，阐述其发生机制以及具体作用机制，并探讨异常糖基化在检测和治疗胶质瘤中的临床潜力，以期为解决胶质瘤预后差的现状提供理论基础。     

蛋白质组学在垂体腺瘤差异表达蛋白检测中的应用进展

双向聚丙烯酰胺凝胶电泳与质谱技术、生物信息学的结合,使得将蛋白质组学技术应用于临床肿瘤的研究中成为可能。比较蛋白质组学中的很多方法已经应用于肿瘤研究的不同领域。垂体腺瘤是临床常见颅内良性肿瘤,因激素分泌异常和肿瘤占位压迫引起一系列临床症状。应用比较蛋白质组学研究垂体腺瘤,发现差异表达蛋白质,并对这些差异表达蛋白质的翻译后修饰,尤其是对磷酸化修饰方面进行深入研究,有望为研究垂体腺瘤的分子发生机制、生物标志物、早期诊断和治疗提供新的思路。     

蛋白质组学技术及脑脊液差异蛋白质组学研究进展

患者脑脊液蛋白数量升高是许多神经系统疾病的典型特征,而今蛋白质组学的飞速发展为研究这些患者脑脊液的差异蛋白质组提供了良好的技术平台.本文综述了蛋白质组学的研究方法,以及应用这些方法对脑脊液蛋白质组学研究的新进展.     

骨髓间充质干细胞定向分化研究中蛋白质组学的地位与应用☆

背景：细胞分化的实质是细胞内基因的选择性表达，导致细胞新的特异性的蛋白质的合成，从而在生化、结构及功能上发生变化，原有的基因组和分析单一蛋白的模式已不能满足研究的需要。蛋白质组学技术是大规模、系统性研究蛋白质变化及其相互作用的强有力工具，可以用于骨髓间充质干细胞定向分化的分子机制研究当中。 目的：介绍蛋白质组学的概况，总结蛋白质组学在骨髓间充质干细胞向心肌、成骨及脂肪细胞定向分化方面的研究进展，讨论其面临的问题，并对蛋白质组学研究方法进行展望。 方法：在CNKI数字图书馆全文数据库、Sciencedirect 数据库、I.S.I 数据库中检索有关骨髓间充质干细胞特性、定向分化及蛋白质组学在骨髓间充质干细胞定向分化研究中应用的文章，纳入近年来起重大影响以及开启和引领新方向的重要研究成果。 结果与结论：纳入29篇文章进行综述，总结蛋白质组学技术在骨髓间充质干细胞向心肌、成骨及脂肪细胞分化领域提供的信息及积累的经验。随着蛋白质组学在方法学及技术上的不断创新和发展，将会成为研究骨髓间充质干细胞定向分化潜在机制的强有力工具，帮助人们早日揭开其中蕴含的生命奥秘。     

不同放疗敏感性胶质瘤组织蛋白质组学比较研究

目的 比较放疗敏感性不同胶质瘤间蛋白质组差异,寻找可成为胶质瘤放射敏感性标记物的蛋白质.方法 收集放疗前的胶质瘤组织标本,以放疗后预后为判断标准,选择不同放疗敏感标本各3例,分为敏感组和耐受组.用二维液相色谱-质谱联用方法对肿瘤蛋白质组进行分析,筛选两组之问表达差异蛋白.应用Western印迹技术验证差异蛋白的表达.结果 丝切蛋白-1在放疗耐受组中表达明显增高,胶质瘤细胞大体形态无变化.结论 丝切蛋白-1可能与胶质瘤放疗敏感性相关.     

基因芯片与组织芯片在胶质瘤研究中的应用

生物芯片是现代医学科学史上的一次重大技术突破,具有高通量、高灵敏度、并行检测的特点。根据其性能可分为基因芯片、组织芯片、蛋白质芯片、细胞芯片等。在胶质瘤研究方面,基因芯片和组织芯片应用广泛。基因芯片和组织芯片联合应用,在筛选胶质瘤相关基因中具有很好的互补作用,能够为基因诊断与治疗寻找有效靶点。