基因多态性检测分析方法与疾病诊断

人类基因组是一个高度变异的体系 ,人类基因组序列草图仅仅基于少数个体的序列 ,它反映了基因组结构稳定的一面 ,并未反映不同群体和个体间的多态性。人类遗传基因多态性(ｇｅｎｅｉｎｈｅｒｉｔａｎｃｅｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ)在阐明人体对疾病、毒物的易感性与耐受性、疾病临床表现的多样性 (ｃｌｉｎｉｃａｌｐｈｅｎｏｔｙｐｅｄｉ ｖｅｒｓｉｔｙ)以及对药物治疗的反应性上都起着重要的作用。疾病基因多态性的研究不但可以揭示同一种疾病不同临床表型的实质 ,也可以为更具个体化的治疗打下基础。有关基因多态性在临床医学中的应用已…     

河南省2003年医药卫生科研进展

1．河南汉族群体中短串联重复序列的遗传多态性研究及应用：人类基因组是一个结构十分稳定的体系，同时又是一个变异的体系。在长期的进化过程中，基因组DNA的序列不断地发生变异，导致了不同种族、群体和个体间基因组的差异和多态性。随着分子生物学技术的不断发展，检测基因组DNA多态性已成为可能。河南地处中原，人口众多，河南汉族群体     

河南省2003年医药卫生科研进展

一、基础医学研究 1.河南汉族群体中短串联重复序列的遗传多态性研究及应用:人类基因组是一个结构十分稳定的体系,同时又是一个变异的体系。在长期的进化过程中,基因组DNA的序列不断地发生变异,导致了不同种族、群体和个体间基因组的差异和多态性。随着分子生物学技术的不断发展,检测基因组DNA多态性已成为可能。河南地处中原,人口众多,河南汉族群体的遗传学特征对中国北方汉族人群有较好的代表性。河南省     

河北汉族人群miniSTR D20S1082、D18S853、D17S1301基因座复合扩增及遗传多态性研究

基因组DNA多态性的研究,对人类进化和群体遗传提供了更为科学和可靠的依据。短串联重复序列(short tandem repeats,STR)遗传标记系统,由于在人类基因组中分布广泛,并且具有高度的遗传多态性及简单快捷的检测方法而被广泛应用于法医学等领域。MiniSTR基因座分析技术是通过将聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)引物的设计尽可能靠近重复区域而缩短扩增片段的一种新方法,应用于高度降解DNA样本检测,可提高检测成功率。本文从正常健康人血液中提取DNA,采用PCR技术和毛细管电泳技术,对中国河北省115例汉族无关个体进行了群体…     

慢性阻塞性肺疾病单核苷酸多态性改变的意义

慢性阻塞性肺疾病(COPD)是一种全身性的慢性进行性疾病,与异常的炎症反应及环境因素有关,其所带来的社会经济负担日益引起人们的关注.近年来,越来越多的证据表明COPD的发病与遗传因素关系密切.随着基因组学的深入研究及人类基因组全序列测定的完成,在人类基因变异的基础上可确定疾病的易感状态.单核苷酸多态性(SNP)是这一领域的一个有利工具,是指在染色体基因组水平上单个核苷酸的变异引起的DNA序列多态性,而其中最少一种等位基因在群体中的频率不小于1％.     

单核苷酸多态性的研究进展

单核苷酸多态性（ＳＮＰ）是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的一种ＤＮＡ序列多态性。ＳＮＰ现象在人类基因组中广泛存在,并具有很高的信息含量。目前已发现数万个ＳＮＰ标记,且有多个生物医学网站开辟了专页对其加以介绍。随着对ＳＮＰ检测和分析技术进一步发展,尤其是与ＤＮＡ芯片等技术的结合,它已成为第三代遗传标记,初步满足对疾病相关基因定位研究的需要,尤其是对多基因遗传病高精度基因定位的要求,并将最终     

河北汉族人群D2S1328基因座的遗传多态性研究

基因组DNA多态性的研究,对人类进化和群体遗传提供了更为科学和可靠的依据。短串联重复序列（short tandem repeat,STR)属微卫星DNA序列,重复单位2－7bp。STR位点在人类基因组中含量丰富,它是绘制基因组物理图谱和遗传连锁分析的理想标记。近年来,随着STR－PCR技术的进一步发展,解决了微量检材的分析问题,扩展了DNA分析在遗传学、人类学以及在法医学领域的应用。作者从正常健康人血液中提取DNA,采用聚合酶链反应（polymerase chain reaction,PCR）技术和聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,并结合银染的方法,对中国河北省181名汉族无关个体进行了调查,首次获得了D2S1328基因座群体遗传数据,结果报告如下。     

河北汉族人群D16S310基因座的遗传多态性研究

短串联重复序列 (ｓｈｏｒｔｔａｎｄｅｍｒｅｐｅａｔ,ＳＴＲ)属微卫星ＤＮＡ序列 ,重复单位 2 7ｂｐ。ＳＴＲ位点在人类基因组中含量丰富 ,它不仅是绘制基因组物理图谱和遗传连锁分析的理想标记 ,也是法医遗传高信息基因座的丰富来源。Ｄ16Ｓ310短串联重复序列在人类自然群体的基因频率分布尚不清楚 ,为了解大陆人群Ｄ16Ｓ310基因座的遗传多态性 ,作者采用聚合酶链反应 (ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅｃｈａｉｎｒｅａｃｔｉｏｎ ,ＰＣＲ)技术和聚丙烯酰胺凝胶电泳技术 ,并结合银染的方法 ,对中国河北省 2 0 9名汉族无关个体进行了调查 ,首次获得…     

基因多态性与我国肾脏疾病临床表型及预后的研究

人类疾病的临床表现及转归在不同个体间存在着明显的差异,而药物的治疗反映,对环境因素的易感性在不同个体间也是千差万别。人类基因组的研究为我们从人类基因多态性来揭示上述临床表型多样化的本质提供了基础。基因多态性的研究不仅提     

河南汉族人群DYS464和DYS527基因座单体型遗传多态性检测

目的：检测河南地区汉族人群中Y染色体两个多拷贝短串联重复序列（STR）基因座DYS464和DYS527单体型的遗传多态性。方法：对110例河南汉族男性无关个体血样本基因组DNA采用荧光标记引物进行PCR扩增,PCR产物在ABI3100遗传分析仪上毛细管电泳分析,并对不同重复序列分别测序。结果：DYS464基因座为四拷贝,核心序列重复数目变异在11～18次;DYS527基因座为双拷贝,核心序列重复数目变异在17～25次。110例河南汉族男性无关个体中,两个基因座所组成的单体型有104种,其中99种单体型仅出现1次,频率为0.0091,单体型基因多样性为0.9988,个体识别力为0.9897。结论：DY464和DYS527基因座具有高度多态性,适用于法医学实践和人类进化的研究。     

人类基因组微卫星DNA多态及其法医学应用

人类基因组是指人类细胞的DNA 分子中所包含的储藏有人体全部遗传信息的一整套基因它包括细胞核所构成的基因组和线粒体DNA 所构成的基因组两部分细胞核基因组规模庞大结构复杂包含了人类基因组的绝大部分基因其DNA 分子总长度可达3 10 6 Kb 基因总数约5 ~10 万个而线粒体基因组是一个结构简单的小基因组DNA 分子总长度约1 6 .6 Kb 基因数仅37 个人类基因组是一个十分稳定的体系不同民族不同群体的个体有相同数目的基因也有基本相同的核苷酸序列正是基因组结构的这种稳定性保证了人类作为一个物种的稳定性和同一物种向的共同性然而人…     

从基因水平认识与治疗心律失常

基因治疗是当前医学界发展迅猛的前沿技术 ,许多疾病都在尝试应用此技术进行根本性治疗 ,目前临床上对心律失常基本用药物或介入方法治疗 ,为了反映心律失常治疗方法的发展及基因治疗知识 ,现将心律失常基因治疗研究进展报告如下。1　基因表型人类基因组包括DNA多态性序列 ,多数为单核酸多态性 (SNPs或Snips) ,SNPs可能是非功能性的 ,发生在改变基因表达的调节区域 ,导致编码蛋白顺序改变。在病理情况下 ,则改变基因型表达 (即心肌缺血 )和 或直接改变蛋白的功能。人类基因组可能包括 >30 0 0 0 0 0SNPs。鉴定DNA变异是必须的 ,变异…     

运用18个常染色体STR进行同胞关系鉴定的案例分析

短串联重复序列（Short tandem repent，STR）在人类基因组中分布广泛，具有遗传多态性，是目前法医个体识别和亲子鉴定中重要的遗传标记。笔者在1例同胞关系鉴定中．通过对三名同胞个体和一名可疑个体18个常染色体STR基因座的联合检测分型，分析其遗传规律，使鉴定取得明确结果。现报道如下。     

单核苷酸多态性与复杂性状疾病

单核苷酸多态性(SNPs)是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异而引起的DNA序列多态性,频率大于1%.SNPs在人类基因组中广泛存在,并通常以二等位基因的形式出现,便于进行大规模和高通量分析,因此是继限制性酶切长度多态性(RFLP)和微卫星之后的第三代遗传标记.SNPs在生物学诸多领域具有广阔的应用前景.本文简要叙述了SNPs与复杂性状疾病(如肿瘤、高血压、糖尿病等)的关系,以及SNPs在复杂性状疾病的致病基因定位、发病机制的阐明、个体化用药和药物设计等领域的应用.     

人类基因组多样性计划研究进展

人类是一个具有多态性的群体。要真正了解全人类的基因组,则必须研究与比较不同人种、民族和人群的基因组,这就是"人类基因组多样性研究计划"（Human Genome diversity project,HGDP）。本文综合介绍了"人类基因组多样性研究计划"在遗传标记、分析技术、存在问题及应用前景等方面的研究进展。 1991年,一些人类遗传学专家和分子生物学专家提出了尽快对全球不同地理区域人类基因组多样性进行研究的建议[1],这一建议很快得到了人类基因组组织的支持,同时也吸引了世界各地的人类遗传学家、分子生物学家、考古学家、进化学家、历史学家…     

Y染色体SNP和STR多态在人类学研究中的应用

在人类群体遗传学研究中,Y染色体非重组区多态(特别是单核苷酸多态性和短串联重复序列)由于具有许多优势,发挥着其他标记无法替代的重要作用,因而是研究群体起源和迁移的理想工具。通过对Y染色体非重组区多态及其在人类学中应用价值的研究,尤其对Y染色体单核苷酸多态性和短串联重复序列的特点进行的综合分析,认为Y染色体非重组区多态在鉴别民族的起源和迁移研究中具有较大的准确度和可操作性,必将继续发挥巨大作用。     

多拷贝基因座DYF399S1在河南汉族群体中的遗传多态性分析

目的:研究Y染色体上1个新的多拷贝短串联重复序列基因座DYF399S1在河南汉族群体中的遗传多态性。方法:采集248名河南汉族无关男性个体的血标本,提取基因组DNA,PCR法扩增,用中性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离PCR产物并测序,采用ABI 3130基因自动分析仪和Gene Mapper ID v3.5软件分析结果。结果:DYF399S1基因座为3拷贝,在河南汉族群体继续表现为(GAAA)3N7(GAAA)12-22其模块结构包括1个重复数目变异的核心序列和1个固定的重复序列结构。按其变异模块命名等位基因,共发现11个等位基因。在248名河南汉族无关男性个体中,3个拷贝组成的单体型有94种,其中出现最多的单体型是18/18/18,频率是0.080 6,仅出现1次的单体型有49种,频率是0.004 0;单体型辨别能力(DC)是0.372 5,单体型多样性(HD)和个体识别力(DP)分别为0.865 5和0.862 1。结论:DYF399S1基因座具有高度的多态性,适用于法医学实践和人类进化的研究。     

两例TPOX基因座3个等位基因的亲子鉴定案件分析

<正>短串联重复序列(short tandem repeats, STR)广泛存在于人类基因组中,核心序列一般由2～6个碱基构成,其核心序列串联重复排列的数目变化构成序列长度差异,具有高度多态性。短串联重复序列作为一种遗传标记能在群体中稳定遗传,且遗传遵循孟德尔遗传定律。随着DNA测序技术的迅速发展,近年来多种由STR遗传标记组成系统的商品化试剂盒获得认可,STR自动分型技术得以普及。因其具有高度多态性、稳定的遗传性和可重复性、自动化程度高、     

南江黄羊基因组DNA的AFLP和RAPD研究

目的研究南江黄羊遗传多态性和探讨AFLP标记在山羊遗传多态性方面应用的可行性.方法应用RAPD和AFLP两种方法对15只南江黄羊个体基因组DNA进行了分析,并比较两种方法的检测效果.结果RAPD标记检测得到的群体遗传相似系数和多态位点比率分别为0.942和26.98%;AFLP标记检测得到的群体遗传相似系数和多态位点比率分别为0.874和31.4%.结论AFLP方法和RAPD均适合于品系内个体间的遗传检测,并且为准确评价南江黄羊的遗传稳定性提供了相关的参数.     

汉族人群Y染色体多拷贝基因座DYS464遗传多态性

【目的】 研究Y染色体多拷贝基因座DYS464遗传多态性在汉族群体中的分布规律。【方法】 选择106例汉族无亲缘关系男性个体作为研究对象，荧光标记引物PCR扩增DYS464基因座片段，ABl377自动测序仪上变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析PCR产物，并对不同重复序列分别测序。【结果】 DYS464基因座在106例汉族男性无关个体中发现有8种片段。变异11～18次。根据其中任意4种片段的组合，即片段大小和峰高的比率来命名等位基因，E-型命名方法，观察到61种等位基因，其中36种等位基因只出现1次。基因多样性和个体识别力分别为0．9853和0．9760，比目前报道的单个Y-STR基因座的多态性都高。【结论】 多拷贝基因座DYS464具有高度多态性，非常适于法医学实践和人类进化的研究。