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1.
EGLN1基因两个位点多态性与藏族人群高原低氧适应的关系   总被引:1,自引:1,他引:0  
吕坡  范杰  席焕久 《解剖学报》2013,44(3):419-422
目的 探讨西藏藏族人群EGLN1基因2个SNP(单核苷酸多态性)位点rs479200(C/T)、rs480902(T/C)多态性与高原低氧适应的相关性。
方法 选取世居西藏拉萨藏族150人及辽宁汉族150人的血样,提取白细胞基因组DNA,应用限制性片段长度多态性-聚合酶链反应(PCR-RFLP)技
术检测EGLN1基因2个SNP位点,分析其多态性特征。结果 rs479200位点等位基因C等位基因频率在藏族人和汉族人分别为71.33%和38.17%,
rs480902位点等位基因T等位基因频率在藏族人和汉族人分别为66.67%和36.67%,两组比较差异显著(P<0.01);rs479200位点TT、TC和CC基因
型频率在藏族人和汉族人分别为6.67%和56.67%、29.33%和33.33%、64%和10%,rs480902位点TT、TC和CC基因型频率在藏族人和汉族人分别为
60.67%和9.33%、30.66%和28.67%、8.67%和62%。两位点TC基因型两组比较差异无统计学意义;TT和CC基因型两组比较差异均显著(P<0.01)。
结论 EGLN1基因rs479200(C/T)和rs480902(T/C)SNP位点多态性与西藏藏族适应高原低氧环境存在相关性。rs479200位点的CC基因型和
rs480902位点的TT基因型可能更有利于适应低氧环境。  相似文献   

2.
目的 探讨健康人补体受体1(complement receptor type 1,CR1)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)位点与红细胞表面CR1分子水平的相关性.方法 采用多重PCR-荧光标记单碱基延伸-标签微阵列杂交基因分型技术,检测215例受试者CR1基因5个标签SNP,并采用流式细胞术测定其中81例样本红细胞CR1分子水平.采用Arlequin3.11软件对各SNP位点基因型频率进行哈温平衡(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)检验,采用SPSS 13.0软件对健康人CR1基因SNP位点基因型及等位基因分布的性别差异、不同基因型人群红细胞CR1分子水平差异和影响红细胞CR1分子水平的单因素和多因素进行统计学分析.结果 健康人CR1基因SNP位点基因型及等位基因分布性别间的差异无统计学意义(P>0.05);健康人红细胞CR1几何平均荧光强度比值(the geometric mean fluorescence intensity ratio of CR1,CR1-GMFIR)为3.36±1.26.rs11118167T>C和rs9429945C>T位点各基因型组对应的红细胞CR1分子水平总体比较,差异具有统计学意义(分别为P<0.01和P<0.05),两两比较时,rs11118167T>C位点TC、CC基因型携带者低于TT基因型者,rs9429945C>T位点CT、TT基因型携带者低于CC基因型者(P值均<0.01).在年龄、性别、5个标签SNP位点各基因型中,CR1-GMFIR与rs4844600G> A(GG/GA/AA)、rs9429945C> T(CC/CT/TT)、rs1 1118167T>C(TT/TC/CC)均呈负相关(分别为P<0.05,P<0.01,P<0.01),影响CR1-GMFIR的最主要因素为rs11118167T> C(P <0.01),其次为rs9429945C> T(P<0.01).结论 rs11118167T>C和rs9429945C>T是红细胞CR1分子水平的主要影响因素.  相似文献   

3.
目的 探讨SIRT1基因多态性与广西永福地区人群长寿的关联性.方法 采用长寿对照设计,选取广西壮族自治区永福县共500人为研究对象,包括长寿组223人、平均年龄(93.17±3.08)岁,对照组277人、平均年龄(46.92±17.12)岁.应用聚合酶链反应-高分辨熔解曲线技术结合测序验证法检测SIRT1基因上的rs3758391,rs3740051,rs2273773,rs4746720和rs10997870位点的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)的分布情况,比较长寿组与对照组人群的等位基因、基因型频率的分布特征,分析SIRT1基因多态性与长寿的关联性.结果 长寿组rs4746720位点CT基因型频率高于CC和TT基因型频率,差异具有统计学意义(P=0.000,OR=2.098,95%CI:1.412-4.117),其等位基因频率在两组间分布的差异无统计学意义.rs3758391 、rs3740051 、rs2273773位点的基因型频率和等位基因频率在长寿组和对照组间分布的差异均无统计学意义.结论 SIRT1基因rs4746720单核苷酸多态性与广西永福地区长寿人群相关联.  相似文献   

4.
目的 研究内蒙古地区汉族人群CDKAL1基因rs4712523单核苷酸多态性(SNP)的等位基因和基因型频率分布与2型糖尿病(T2DM)的相关性.方法 采用等位基因特异性聚合酶链式反应(AS-PCR),对382例内蒙古地区汉族人(其中T2DM组192例,对照组190例)rs4712523进行基因分型.结果 T2DM组中rs4712523的G等位基因频率和GG基因型频率分别为47.4%和6.3%,均显著高于对照组的35.3%和3.2%(P<0.05).G等位基因携带者患T2DM的风险是A等位基因的1.654倍(OR=1.654,95% CI=1.237-2.212).结论 CDKAL1基因rs4712523多态性位点的G等位基因可能是内蒙古地区汉族人T2 DM的易感基因之一.  相似文献   

5.
目的探讨PD-1基因多态性与肺结核发病风险以及临床特征的相关性。方法采用PCRRFLP分析方法,检测262例肺结核患者和255例健康志愿者基因组DNA中PD-1基因SNP位点rs2227981和rs2227982基因型和等位基因频率的分布情况,分析PD-1基因多态性与肺结核易感性的关系;并收集了肺结核患者的临床资料,考察PD-1基因多态性与肺结核临床特征的相关性。结果对照组rs2227981和rs2227982基因型和等位基因频率的分布符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律;rs2227981位点T等位基因(OR=2.721,95%CI:2.003~3.697,0.001)、rs2227982位点C等位基因(OR=1.614,95%CI:1.262~2.064,0.001)均与肺结核易感性相关;与rs2227981 CC基因型相比,携带PD-1 rs2227981 CT或TT基因型者具有更高的肺结核发病风险(OR=2.937,95%CI:2.018~4.274,0.001),且患者病灶范围较大(=0.009),痰菌阳性率较高(0.001);与rs2227982 TT基因型相比,携带rs2227982 TC或CC基因型者具有更高的肺结核发病风险(OR=1.706,95%CI:1.187~2.452,=0.004),且患者结核空洞的发生率较高(=0.021)。结论 PD-1基因rs2227981和rs2227982位点SNP多态性与肺结核易感性及临床特征相关。  相似文献   

6.
目的: 探讨雌激素受体1 基因(Estrogen receptor 1,ESR1) 周围区域单核苷酸多态(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点rs2046210 与女性乳腺癌发生的相关性。方法:选取114 例乳腺癌患者的组织切片和141 例健康对照者的外周血,抽提基因组DNA,采用Taqman 探针法检测SNP 位点rs2046210 的基因型,计算基因型与基因频率,先检测Hardy-Weinberg 平衡性,然后采用字2 检验进行组间比较。结果:经检测rs2046210 等位位点T、C 及其三种基因型CC、TC、TT 均符合Hardy-Weinberg 平衡性定律,具有群体代表性(字2 值分别为2.78、2.95,v=1,P 均>0.05)。等位位点T、C 在乳腺癌组的分布频率为43.40%、56.60%,在健康组的分布频率为38.30%、61.70%。两组比较差异无统计学意义(P<0.05),该位点等位基因在病例组与对照组的分布无明显差别。多态性位点的三种基因型CC、TC、TT 在乳腺癌的频率分别为35.75%、11.35% 和53.90%,对照组35.96%、22.81%和41.22%,两组间比较差异有显著统计学意义(P<0.05)。进一步比较发现,基因型CC/ TT在两组中分布差异无统计学意义(P>0.05),相对风险比值OR 为1.94(0.92 ~ 4.1,95% CI),基因型CC/ TC 在两组中分布差异无统计学意义(P =0.228>0.05),相对风险比值OR 为0.74(0.43 ~1.28,95%CI),而基因型TT/ TC 在两组中分布差异有显著统计学意义(P =0.008<0.05)。结论:在贵州地区人群,雌激素受体1 基因rs2046210 位点的单核苷酸多态性可能与乳腺癌的遗传易感性相关,特别是rs2046210 TT 基因型可能增加个体患乳腺癌的风险,而CC 基因型降低了乳腺癌的患病风险。  相似文献   

7.
目的 探讨has-miR-27a基因rs895819位点和has-miR-124a基因rs531564位点单核苷酸多态性(SNP)与妊娠期糖尿病(GDM)发病的相关性.方法 共纳入1 719例孕妇,其中GDM 839例;糖耐量正常和50 g葡萄糖负荷试验阴性者880例,作为对照组.采用TaqMan探针法检测两组孕妇SNP位点基因型,比较两组孕妇各SNP位点等位基因和基因型频率差异,以及不同基因型间临床生化指标的差异.结果 1)rs895819位点CC、CT和TT基因型频率在GDM组分别为3.1%、39.3%和57.6%,对照组分别为7.1%、37.6%和55.3%,CC基因型频率显著低于对照组(P<0.05);隐性模型(CC vs CT +TT)中两组差异仍具有显著性[P=0.001;OR0.435(0.270,0.702)];GDM组C等位基因频率(22.8%)低于对照组(25.9%)(P<0.05).2)rs895819 CC基因型孕妇空腹血糖低于CT +TT基因型孕妇(P<0.05).结论 has-miR-27a基因rs895819位点与GDM相关,C等位基因降低GDM的发病风险.  相似文献   

8.
目的:探讨共济失调毛细血管扩张症突变基因(ataxia telangiectasia mutated,ATM)rs227060位点单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)与肺癌易感性之间的相关性.方法:采用聚合酶链反应-SNP敏感性分子开关方法,检测225例肺癌患者和128例健康体检者ATM基因rs227060多态位点等位基因以及基因型频率分布特点;并应用非条件Logistic回归法统计分析rs227060单核苷酸多态性与肺癌的相关性.结果:rs227060多态位点共检测出CC,CT,TT三种基因型和C,T两种等位基因,其在肺癌组与对照组的基因型分布频率为:CC基因型17.3%与29.7%、CT基因型61,4%与59.3%、TT基因型21.3%与11%,两组间基因型频率和等位基因频率分布差异均有统计学意义(P<0.05).在对ATM rs227060基因型的多态性分析过程中发现:吸烟史在肺癌组与对照组相比差异无统计学意义(P>0.05),而年龄、性别、肿瘤家族史在肺癌组与对照组相比差异均有统计学意义(P<0.05);且以CC基因型作为对照,携带TT基因型的个体患肺癌的风险是携带CT基因型个体的3.49倍(OR=1.829;95%CI:1.045~3.199).结论:ATM基因rs227060位点单核苷酸多态性与肺癌易感性存在相关性,且携带TT基因型可增加肺癌的发病风险.  相似文献   

9.
目的探讨辽宁地区汉族人群中超长链脂肪酸延伸酶6(elongation of very long chain fatty acids protein 6,ELOVL6)基因2个SNP位点与妊娠期糖尿病(gestational diabetes mellitus,GDM)的相关性。方法选择2012年6月至2013年6月来我院就诊GDM孕妇128例(GDM组),同期健康孕妇145例作为对照组。记录一般临床资料包括年龄、孕周、身高、体质指数(body mass index,BMI),空腹胰岛素(FIN)及空腹血糖(FPG)水平。采用PCR结合直接测序,检测ELOVL6基因rs12504538和rs17041272位点SNP基因型频率和等位基因频率。分析两组孕妇不同基因型及等位基因胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)和胰岛β细胞功能指数(HOMA-β)的差异。结果 GDM组FPG、FIN及HOMA-IR值高于健康对照组,但HOMA-β水平低于健康对照组(0.05)。SNP位点rs17041272基因型及等位基因频率在GDM组和对照组间无差异。rs12504538位点基因型(TT,CT,CC)与对照组比较,T等位基因频率明显高于对照组。GDM组CT基因型孕妇FPG、FIN及HOMA-IR水平高于TT基因型者(0.05)。结论 ELOVL6基因SNP位点rs12504538与GDM发病相关,可能是GDM潜在靶向位点,C等位基因为易感基因。  相似文献   

10.
目的 探讨转化生长因子β1(TGF-β1)基因第1外显子区SNP+ 869 (T/C)和SNP+ 915 (G/C)多态性在宁夏回族、汉族人群中的分布特征.方法 用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术对210例回族和308例汉族人群转化生长因子β1第1外显子区(+ 869位点、+915位点)两个多态性位点进行检测.结果 宁夏回族群体TGF-β1基因第1外显子区两个多态性位点各基因型频率及等位基因频率分别为:+869(TT:25.24%;CT:52.38%; CC:22.38%;T:51.43%;C:48.57%);+915(GG:98.10%; GC:1.90%; CC:0%;G:99.04%;C:0.96%);宁夏汉族群体TGF-β1基因第1外显子区两个多态性位点各基因型频率及等位基因频率分别为:+869(TT:30.52%;CT:48.05%;CC:21.43%;T:54.55%;C:45.45%);+915(GG:99.03%;GC:0.97%;CC:0%;G:99.51%;C:0.49%),两组间无差异.按性别分组,亦无差异.结论 TGF-β1基因第1外显子区+869、+915两个多态性位点在宁夏回、汉族人群及不同性别间无差异.  相似文献   

11.
In the present study we investigated the effect of IL-18 on the production of IL-1β, IL-1Ra and sIL-1RII by human neutrophils. Our observations indicate that rhIL-18 induces IL-1β and, to a lesser extend, IL-1Ra and sIL-1RII production by human neutrophils isolated form peripheral blood. However, this effect was less important in comparison with LPS-stimulation. Moreover, the results obtained suggest that IL-18 can induce priming of neutrophils for IL-1β and, to a lesser extend, IL-1Ra and sIL-1RII production by LPS-stimulated cells. The capacity of IL-18 to serve as an effective modulator for IL-1β and its regulatory proteins may have significance in the inflammatory and immune reactions mediated by IL-1β.  相似文献   

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13.
Neurofibromatosis type 1 (NF1) is one of the most common autosomal dominant disorders in humans. NF1 is caused by mutations in the NF1 gene which consists of 57 exons and encodes a GTPase activating protein (GAP), neurofibromin. To date, more than 640 different NF1 mutations have been identified and registered in the Human Gene Mutation Database (HGMD). In order to assess the NF1 mutational spectrum in Korean NF1 patients, we screened 23 unrelated Korean NF1 patients for mutations in the coding region and splice sites of the NF1 gene. We have identified 21 distinct NF1 mutations in 22 patients. The mutations included 10 single base substitutions (3 missense and 7 nonsense), 10 splice site mutations, and 1 single base deletion. Eight mutations have been previously identified and thirteen mutations were novel. The mutations are evenly distributed across exon 3 through intron 47 of the NF1 gene and no mutational hot spots were found. This analysis revealed a wide spectrum of NF1 mutations in Korean patients. A genotype- phenotype correlation analysis suggests that there is no clear relationship between specific NF1 mutations and clinical features of the disease.  相似文献   

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15.
Aim: Immune system dysregulation has been implicated to play a key role in pathogenesis of Tourette syndrome (TS). IL-1α and IL-1RN are important inflammatory cytokines that mediate the inflammation. In this study, we investigated the relationship between single-nucleotide polymorphisms (SNPs) of IL-1α and IL-1RN and the susceptibility to TS in Chinese Han population. Methods: A total of 276 children with TS and their parents were recruited in the study. All DNA from our subjects were genotyped for SNPs of IL-1α rs17561 and IL-1RN rs315952 using predesigned TaqMan SNP genotyping assay. The genetic contributions of two polymorphisms were evaluated using transmission disequilibrium test (TDT) and haplotype relative risk (HRR) design. In addition, to increase the efficiency of the test, the haplotype-based HRR (HHRR) was performed. Results: No significant differences were observed in allelic and genotypic frequency of rs17561 in IL-1α and rs315952 in IL-1RN between the transmitted group and non-transmitted group (for IL-1α rs17561: TDT=0.890, df=1, P=0.402; HRR=1.011, X2=3.016, P=0.082, 95% CI=0.999-1.024; for IL-1RN rs315952: TDT=0.095, df=1, P=0.805; HRR=0.984, X2=0.008, P=0.929, 95% CI=0.695-1.394). Similarly, the analysis of HHRR also did not support a significant association (for IL-1α rs17561: HHRR=1.226, X2=0.915, P=0.339, 95% CI=0.807-1.863; for IL-1RN rs315952: HHRR=0.963, X2=0.094, P=0.759, 95% CI=0.758-1.225). Conclusion: Our results suggest that IL-1α rs17561 and IL-1RN rs315952 polymorphisms may not be associated with susceptibility to TS in Chinese Han population. However, the results still need to be replicated in a larger sample size and different populations.  相似文献   

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目的 探讨中药熏洗对食蟹猴膝骨关节炎(KOA)模型的关节液中IL-1β、TGF-β1细胞因子表达和WBC计数的影响。 方法 老年型食蟹猴9只和青年型食蟹猴6只,老年型食蟹猴根据症状作为自发性KOA模型,随机分为熏洗组(n=3)、传统组(n=3)和对照组(n=3),青年型食蟹猴为健康组(n=6)。熏洗组、传统组左侧膝关节分别接受中药熏洗或中药热敷治疗,治疗前、治疗2周、4周及6周时分别测定关节液内WBC计数、IL-1β和TGF-β水平,运用重复测量的方差分析方法进行统计分析。 结果 (1)老年食蟹猴膝关节软骨HE染色可见关节软骨退变;(2)治疗前,熏洗组、传统组和对照组的膝关节液内的WBC计数、IL-1β表达水平显著高于健康组(P<0.05),TGF-β1表达水平显著低于健康组(P<0.05);(3)相比于治疗前,治疗2周、4周和6周后,熏洗组和传统组关节液内WBC计数和IL-1β水平显著降低(P<0.05);(4)治疗2周、4周和6周时,熏洗组和传统组关节液内WBC计数和IL-1β水平均明显低于对照组(P<0.05),且熏洗组比传统组两者的水平下降更明显(P<0.05);(5)治疗2周和4周后,熏洗组和传统组关节液内TGF-β1水平较治疗前显著升高(P<0.05);(6)治疗2周、4周时,熏洗组和传统组关节液内TGF-β1水平明显高于对照组(P<0.05),且熏洗组比传统组升高关节液内TGF-β1作用更显著。 结论 食蟹猴KOA模型的膝关节液内IL-1β和TGF-β1细胞因子表达异常、WBC计数明显升高,中药熏洗和中药热敷等治疗可下调膝关节液内IL-1β和上调TGF-β1细胞因子的表达水平、降低WBC计数,有助于治疗KOA,且熏洗的效果优于传统的中药热敷。  相似文献   

17.
文题释义:HTRA1:在Duchenne型肌营养不良骨骼肌及骨关节炎和和类风湿性关节炎软骨中HTRA1表达上调, HTRA1的上调可能有助于此类疾病的进展。对HTRA1单核苷酸多态性基因型的等位基因频率与高椎间隙狭窄评分之间的关联性进行分析,HTRA1基因启动子区域的单核苷酸多态性基因型与椎间盘退变相关,在携带G等位基因组(GG+GA)和未携带组(AA)的患者中均观察到椎间隙狭窄程度显著增加,因此HTRA1可能在椎间盘病理学中起作用。  HAPLN1:是软骨细胞外基质的关键组分,通过透明质酸链结合蛋白多糖,从而稳定蛋白多糖与透明质酸的聚合体,有助于关节的抗压和减震。试验中HAPLN1基因仅在rs179851单核苷酸多态性受试者中观察到骨赘形成和椎间隙狭窄的显著组间差异,而其余3个单核苷酸多态性(5’侧翼rs975563、内含子1 rs10942332和内含子4 rs4703570)则未见。因此,HAPLN1可能是软骨稳态的重要调节因子,并有助于椎间盘退变引起的骨关节炎发病机制。背景:研究发现,HTRA1基因启动子区域的单核苷酸多态性基因型与椎间盘退变相关,而HAPLN1基因与椎间盘退变引起的骨关节炎相关。 目的:探讨分泌型丝氨酸蛋白酶HTRA1和骨细胞外基质的关键组分HAPLN1变异在椎间盘退变发病机制中的作用。方法:选择2015年4月至2018年12月在定州市人民医院接受体检的498名绝经后女性受试者,利用TaqMan PCR方法检测受试者HTRA1基因启动子rs11200638单核苷酸多态性和HAPLN1基因5’侧翼rs975563、内含子1 rs10942332、内含子2 rs179851和内含子4 rs4703570的单核苷酸多态性,分析HTRA1和HAPLN1基因多态性与椎间盘退变影像学特征之间的相关性。试验已通过定州市人民医院伦理道德委员会批准。结果与结论:①在498名受试者HTRA1基因rs11200638单核苷酸多态性中,178名为GG纯合子,222名为GA杂合子,98名为AA纯合子,将具有至少一个G等位基因(GG+GA,n=400)和没有G等位基因(AA,n=98)受试者间的椎间盘退变参数进行比较;②在HTRA1基因rs11200638单核苷酸多态性中,GG+GA等位基因组的椎间隙狭窄评分低于AA等位基因组(P < 0.001);随着椎间隙狭窄评分的升高,受试者中AA等位基因型发生风险增高(P ≤ 0.001);③在498名受试者HAPLN1基因单核苷酸多态性中,137名为TT纯合子,230名为CT杂合子,131名为CC纯合子,将CC+TT等位基因(n=361)、TT等位基因(n=137)的椎间盘退变参数进行比较;④在HAPLN1基因中,仅rs179851单核苷酸多态性的CC+TT等位基因组与TT等位基因组骨赘形成、椎间隙狭窄存在显著差异(P < 0.01);⑤在HAPLN1基因rs179851单核苷酸多态性中,椎间隙狭窄≥6分受试者的TT等位基因型发生风险显著增高(P < 0.05);随着骨赘形成评分的升高,受试者TT等位基因TT等位基因型发生风险显著增高(P < 0.001);⑥结果表明,HTRA1和HAPLN1特定基因位点的遗传变异与椎间盘退变相关。ORCID: 0000-0002-4567-2930(杨金丰) 中国组织工程研究杂志出版内容重点:组织构建;骨细胞;软骨细胞;细胞培养;成纤维细胞;血管内皮细胞;骨质疏松;组织工程  相似文献   

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19.
Thymosin alpha 1 (Tα1) has been shown to have beneficial effects on numerous immune system parameters, but little is known about the effects of Tα1 on patients with gastric carcinoma. The objective of this study was to determine the effect of Tα1 on subpopulations of Th1, Th2, Th17, and regulatory T cells (Tregs) in vitro, and to evaluate its efficacy as an immunoregulatory factor in patients with gastric carcinoma. We compared the effect of Tα1 on the frequency of CD4+ and CD8+ T cells, especially the CD4+CD25+Foxp3+ Tregs in peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from gastric carcinoma patients (N = 35) and healthy donors (N = 22). We also analyzed the changes in the proliferation of PBMCs in response to treatment with Tα1, and examined the production of Th1, Th2, and Th17 cytokines by PBMCs and tumor-infiltrating lymphocytes. The treatment of PBMCs from gastric cancer patients, with Tα1 (50 µg/mL) alone increased the percentage of CD4+CD25+Foxp3+ (suppressive antitumor-specific Tregs) from 1.68 ± 0.697 to 2.19 ± 0.795% (P < 0.05). Our results indicate that Tα1 increases the percentage of Tregs and IL-1β, TNF-α, and IL-6 in vitro.  相似文献   

20.
The frequency of individual genotypes GSTM1, GSTT1, and GSTP1 and haplotypes was determined in patients with atopic dermatitis and healthy children. The actual frequency of some haplotypes was far below the theoretical value. Some haplotypes were associated with predisposition and resistance to atopic dermatitis.  相似文献   

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