Antimicrobial Resistance and Molecular Typing of Pseudomonas aeruginosa Isolated from Surgical Wounds in Lagos, Nigeria

The aim of the study was to determine the resistance patterns of Pseudomonas aeruginosa isolates recovered from patients with surgical wounds in hospitals and also to investigate their epidemiological relatedness using molecular typing techniques. Twenty Pseudomonas sp. isolated from surgical wounds were subjected to antibiotic susceptibility testing by disk diffusion, plasmid profile, SDS-PAGE and PCR using the parC, gyr A gene and RAPD using the 1254 primer. The isolates showed resistance to 12 different antibiotics with six being 100% resistant. Plasmids were detected in 16 (80%) of the isolates. The RAPD-PCR using the primer 1254, SDS-PAGE classified the 20 Pseudomonas spp. into 5 and 6 types respectively. Pseudomona aeruginosa strains isolated from surgical wounds were generally resistant to a broad range of antibiotics and this is rather worrisome. The typing techniques classified the 20 isolates into 5 and 6 groups.     

The characterization and comparison of Staphylococcus aureus by antibiotic susceptibility testing, enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction, and random amplified polymorphic DNA-polymerase chain reaction

Thirty-five of Staphylococcus aureus isolated from food raw materials and workers' hands in a noshery were characterized using antibiotic susceptibility testing, enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction (ERIC-PCR), and random amplified polymorphic DNA (RAPD)-PCR. As a similarity threshold of 90%, ERIC-PCR classified 35 S. aureus isolates into 28 ERIC types with discrimination indexes (D) of 0.984, while RAPD-PCR grouped 35 S. aureus isolates into five clusters (A-E) showing 19 RAPD types with D of 0.949. Four resistance patterns were observed with D of 0.826. A comparison of characterization of S. aureus indicated a clear correlation between ERIC-PCR and RAPD-PCR or resistance patterns in some strains. It was concluded that ERIC-PCR method could be used for genetic diversity of S. aureus and tracing the sources of it from the food chain.     

重症监护病房（ICU）患者感染耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）的鉴定与特征

摘要:目的　监测ICU感染耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（Methicillin Resistant Staph. Aureus,MRSA）的分布及耐药特征,为临床防控MRSA提供对策。方法　采集ICU院内感染患者感染标本,VITEK 2 COMPACT 进行病原菌鉴定及药敏试验,PCR检测mecA基因。结果　2011年1月-2013年12月期间,采集ICU患者714份感染标本,金黄色葡萄球菌检出448株,分离率为62.3%（448/714）;MRAS检出322株,检出率为71.9%,以痰标本分离率最高（80.1%）;MRSA对庆大霉素、红霉素及喹诺酮类抗菌药物耐药率均超过50%,未出现对利奈唑胺、万古霉素和替考拉宁耐药的金黄色葡萄球菌。mecA基因检出率为100.0%。结论　ICU患者感染金黄色葡萄球菌检出率高,MRSA表现多重耐药,应及时监控ICU患者感染MRSA分布及耐药特点,为促进感染患者的康复和预后提供参考。     

耐甲氧西林金黄色葡萄球菌HVR基因分型

目的了解安徽地区耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)基因型及其与耐药性,为MRSA感染的防治及分子流行病学研究提供实验依据。方法用聚合酶链反应(PCR)方法扩增MRSA mec基因高变区(HVR),据扩增片段大小差异进行基因分型,结合16种抗菌药物的MIC值,分析基因型与耐药性的关系。结果73株MRSA被分为A、B、C 3种基因型,分别占17.8%、23.3%、58.8%,各型菌株对抗菌药物的耐药性差异无统计学意义,均对万古霉素敏感。结论安徽地区耐甲氧西林金黄色葡萄球菌存在A、B、C 3种基因型别,其中以C型多见。     

耐甲氧西林金黄色葡萄球菌SCCmec分型与耐药性研究

目的研究临床分离的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)耐药性,检测MRSA葡萄球菌染色体mec盒(SCCmec)基因型,并进行杀白细胞素(PVL)毒力基因检测。方法采用标准平皿两倍稀释法测定250株MRSA对多种抗菌药物最低抑菌浓度(MIC),采用多重PCR方法对MRSA进行SCCmec基因分型,单一PCR方法对MRSA菌株进行PVL毒力基因检测。结果 250株MRSA经多重PCR方法检测SCCmec基因型,SCCmecⅡ-dcs型菌株30株,占12.0%,Ⅱ型的亚型1株,占0.4%,Ⅲ型62株,占24.8%,含有342 bp(dcs)额外扩增条带的Ⅲ型菌株141株,占56.4%,Ⅳ型7株,占2.8%,Ⅳa型1株,占0.4%,Ⅴ型1株,占0.4%,7株细菌未能分型,占2.8%,未发现Ⅰ型;单一PCR方法获得PVL呈阳性的菌株共2株,占临床分离MRSA的0.8%;各基因型对多种抗菌药物呈现不同程度的耐药。结论临床分离的MRSA以SCCmecⅢ型为主;其次为SCCmecⅡ型;有少量SCCmecⅣ型,少数菌PVL毒力基因阳性。     

青岛地区医院内感染耐甲氧西林金黄色葡萄球菌分子分型研究

目的 探讨青岛地区医院内感染的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)分子流行病学特征及脉冲场凝胶电泳(PFGE)型别与菌株表型、一般临床资料间的关系.方法 收集2003-2007年间青岛地区主要医院内感染MRSA 360株,Sma Ⅰ酶切菌株染色体DNA后,进行PFGE电泳,用Bionumericus 2.0软件对电泳图谱进行比较和聚类分析,绘制进化树.同时对患者的性别、年龄、菌株来源等进行多变量统计分析.应用纸片扩散法测定分离菌株的药物敏感谱,并与PFGE型别进行比较分析.PCR扩增不同PFGE型别MRSA代表株25株分离株的7个管家基因进行序列测定和多位点测序分型分析(MLST).结果 所有菌株经PFGE电泳后共分为5型(M0～M4型),其中M1型为优势菌型,M2型次之,M4型相对少见,M0为独特型,明显不同于其他已知PFGE型别.统计学分析发现5种PFGE型别在患者性别、年龄分布上的差异无统计学意义,但在菌株分离部位、来源有统计学的差异:M2型多分离自伤口感染,而M3型菌株多来自ICU病房,5种PFGE型在不同医院间及医院内的分布存在差异.M1与M2两型构成各医院分离菌株的主要型别.抗生素敏感性测定中未发现万古霉素耐药菌株,亦未发现某种PFGE型别与某种特定抗生紊抗性之间的直接相关性.MIST分型发现优势型M1与M3共属于国内常见ST239型,M2型则归类于ST5,M4型属于ST240,独特型中的2种PFGE谱型则分属于ST45及ST398.结论 ST239菌株为青岛地区医院内感染MRSA优势菌株;医院内MRSA的PFGE分型与菌株来源明显相关,与患者年龄、性别无关,MRSA感染普遍存在于各年龄人群中.     

2017年中国部分省市即食食品来源耐甲氧西林金黄色葡萄球菌耐药性、毒力基因分布及分子分型

目的了解中国部分省市即食食品来源耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)耐药性、毒力基因分布和脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)分型特征。方法收集2017年中国部分省市即食食品中分离到的397株金黄色葡萄球菌,采用聚合酶链式反应方法检测其mecA基因携带情况,对鉴定为MRSA的菌株进行耐药性和毒力基因检测,并进行脉冲场凝胶电泳分型。结果从397株金黄色葡萄球菌中检出32株mecA基因阳性菌株,即为MRSA菌株。32株MRSA对青霉素、苯唑西林和头孢西丁均表现为耐药,对其他抗生素的耐药率分别为红霉素78.1%、克林霉素65.6%、四环素53.1%、氯霉素28.1%和环丙沙星12.5%,对庆大霉素和复方新诺明的耐药率均小于10%;32株MRSA表现为11种耐药谱,其中有29株(90.6%)为多重耐药,最多可同时耐受9种抗生素(2株)。共27株MRSA检出了13种毒力基因,检出前4位的依次为sel-q(56.3%)、sel-k(43.8%)、seb(28.1%)和sec(18.8%),同一菌株可同时携带2种以上毒力基因。32株MRSA共分为26种PFGE带型,优势带型不明显。结论 2017年中国即食食品来源MRSA耐药谱广,多重耐药现象严重,且携带多种毒力基因,PFGE带型呈现多样性。     

社区糖尿病人群携带金黄色葡萄球菌的 分型与耐药谱关系研究

摘要:目的　了解社区糖尿病人群携带金黄色葡萄球菌的分型情况并分析其耐药谱。方法　随机抽取佛山市里水镇11个社区糖尿病人438名并收集其鼻拭子样本,根据传统实验室方法分离鉴定金黄色葡萄球菌,采用头孢西丁纸片扩散法和mecA基因扩增法进行耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（Methicillin-Resistant Staphylococcus Aureus,MRSA）的鉴定,利用多重聚合酶链式反应（Polymerase Chain Reaction,PCR）的方法对MRSA菌株进行葡萄球菌染色体盒（Staphyloccoccal Cassette Chromosome mec,SCCmec）的分子分型,应用K-B纸片扩散法分析金黄色葡萄球菌的耐药谱。结果　438份样本中分离出43株金黄色葡萄球菌,检出率为9.82%,其中22株（5.02%）为MRSA。22株MRSA中,医院获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（Hospital-Acquired MRSA,HA-MRSA）7株,社区获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（Community-Acquired MRSA,CA-MRSA）10株,SCCmec未分型5株。金黄色葡萄球菌除对替考拉宁无耐药外,对其他抗生素均有不同程度的耐药,MRSA的耐药率普遍高于甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌（Methicillin Sensitive Staphylococcus Aureus,MSSA）的耐药率,两者对红霉素和克林霉素耐药率差异有统计学意义,36.36%（8/22）的MRSA具有多重耐药性,MSSA中未发现多重耐药菌株。结论　该地区糖尿病人群携带的金黄色葡萄球菌中MRSA比例高,所携带的MRSA中以CA-MRSA为主,MRSA对抗生素的多重耐药问题值得重视。     

甲氧西林耐药葡萄球菌精氨酸代谢可移动原件研究

目的:研究临床分离的甲氧西林耐药葡萄球菌ACME携带情况以及阳性菌株流行特点。方法:收集2009年1月-2011年12月临床分离的葡萄球菌共363株,包括275株MRSA和88株MRSE,采用PCR方法对ACME编码基因arcA进行扩增。结果:275株MRSA中未发现ACME阳性菌株;88株MRSE中检测到ACME阳性菌株28株,阳性率31.8%,其中血液中分离率最高,占42.3%(11/26)。药敏结果显示,ACME阳性菌株除对利福平的耐药率较低外,对红霉素、氯洁霉素、庆大霉素、复方新诺明、四环素、左旋氧氟沙星的耐药率较高(均>30%),未发现耐利奈唑脘和万古霉素的菌株;ACME阳性菌株和阴性菌株对抗菌药物的耐药性没有显著差异(P>0.05)。结论:ACME阳性MRSE菌株在血流感染中有一定程度的流行;ACME具有广泛的水平转移功能,应加强该类菌株的监测。     

HIV感染人群鼻腔携带的MRSA与MSSA菌株耐药谱及毒素基因分布特征

目的 探究广州市HIV感染人群鼻腔携带耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(Methicillin - Resistant Staphylococcus aureus, MRSA)与甲氧西林敏感性葡萄球菌(Methicillin Sensitive Staphylococcus Aureus, MSSA)的耐药谱和毒素基因分布特征。方法 于2017年6 - 8月,便利抽取广州市某医院门诊就诊的1 001名HIV感染者并采集其鼻拭子样本,根据传统实验室方法分离鉴定出253株金黄色葡萄球菌,对鉴定出的菌株进行药物敏感性试验,利用头孢西丁纸片法和mecA扩增法鉴定MRSA,采用多重聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction, PCR) 检测毒素基因。结果 253株SA菌株中,检出MRSA 119 (47.04%) 株,MSSA 134(52.96%)株。60.08%(152/253) 金黄色葡萄球菌为多重耐药SA(Multi - Drug Resistant, MDRSA)。 MRSA菌株和MSSA菌株耐药率最高的抗生素均为青霉素(89.08%,84.33%),其次为红霉素(61.34%, 53.73%)。MRSA菌株对头孢西丁、利福平、氯霉素、四环素和米诺环素的耐药率高于MSSA菌株,差异具有统计学意义。MRSA菌株毒素基因pvl和tst检出率均为4.20%,未检出eta和etb。MSSA菌株毒素基因pvl、tst、eta和etb的检出率分别为2.99%、1.49%、2.24%和0.75%。结论 HIV感染人群鼻腔携带金黄色葡萄球菌中的MRSA和MDRSA检出率高,但MRSA和MSSA菌株pvl、 tst、eta和etb检出率低。     

重症监护室MRSA耐药性及RAPD分析

目的:调查重症监护室耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的耐药及分子流行病学情况,为控制感染提供科学依据。方法:ICU分离的金黄色葡萄球菌采用mecA基因检测法确定MRSA,对筛选出的MRSA采用纸片法检测其耐药性,用随机扩增多态性DNA(RAPD)进行分子流行病学分析。结果:MRSA的分离率为58.5%,对多种抗生素均耐药,没有发现耐万古霉素和替考拉宁的菌株。24株MRSA经RAPD分型,均获得稳定的条带,可分为四型,以Ⅱ型为主,共检出15株。结论:ICU分离MRSA菌株具有多重耐药性,应根据药敏试验结果合理选用抗生素进行治疗;通过RAPD分型研究,可了解MRSA的基因型流行特征,为控制感染提供分子流行病学依据。     

Methicillin-resistant Staphylococcus aureus: a ten-year survey in a Dublin hospital

We undertook a retrospective, longitudinal survey to monitor the changing incidence, phage types and patterns of antibiotic resistance of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) in St Laurence's Hospital (SLH), Dublin over the last 10 years. Following a peak in 1979, the incidence of MRSA has gradually decreased to around 17% of S. aureus isolates in 1986, almost identical to its incidence 10 years before. However, the spectrum of antibiotic resistance among these organisms remains broad and this seems to be at least partially related to antibiotic usage. Many strains could not be phage typed and others were typable only by the additional phage 90. This has severely limited the usefulness of phage typing in the tracing of sources of outbreaks. Thus, there is a need for a more specific method of typing as well as a rational antibiotic policy, to successfully monitor and curtail the hospital spread of MRSA.     

耐甲氧西林金黄色葡萄球菌流行情况调查

目的 了解医院耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的流行和耐药现状.方法 用苯唑西林和头孢西丁纸片扩散法,对2008年1月-2011年5月华北石油总医院住院患者送检的26743份临床标本中分离出的250 株凝固酶阳性葡萄球菌,进行甲氧西林耐药性测定.结果 250株金黄色葡萄球菌主要分离自脓液、血液及尿液,分别占51.2％、31.6％、10.8％;主要来自烧伤科及儿科,占30.0％、22.4％;共检测出MRSA 115株,检出率为46.0％,烧伤科MRSA检出32株,检出率为42.7％,占总MRSA检出株数的27.8％;其中有73.0％为多药耐药菌,未发现万古霉素耐药菌株.结论 医院MRSA流行和耐药情况较为严重,定期对MRSA进行调查和监控,有助于了解医院MRSA流行及耐药性.     

Methicillin-resistant Staphylococcus aureus from China characterized by digestion of total DNA with restriction enzymes

A series of clinical isolates of methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA) from two hospitals in China was examined. Fragment patterns obtained by digestion of total cellular DNA with restriction enzymes were used to characterize the isolates, in combination with phage-typing, antibiotic resistance profile, and plasmid profile. Digestion of total cellular DNA with restriction enzymes was most useful in discriminating between isolates and yielded additional information on the relatedness of non-identical isolates. In one hospital a single strain, resistant to a large number of antibiotics, had apparently become endemic. In the second hospital a number of distinct but related strains were present. The isolates were also related but not identical to the strain of MRSA endemic at the London Hospital.     

A major methicillin-resistant Staphylococcus aureus clone predominates in Malaysian hospitals

This study was conducted to determine the molecular epidemiology of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) in Malaysian hospitals. A total of 264 MRSA isolates from eight hospitals were subjected to typing by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) of SmaI restricted DNA. Antibiotic disk susceptibility testing was also carried out to determine their resistance patterns. Thirty-one PFGE pattern types were identified. Three major pattern types A, ZC and K were found with type A the predominant profile in c. 80% of strains and present in all hospitals. Unlike type A, other DNA pattern types were unique to the hospitals in which they were isolated. PFGE type A also consisted of strains that were multiply antibiotic resistant. The presence of a single predominant PFGE type in Malaysian hospitals is an important finding which suggests that inter-hospital spread of MRSA had occurred frequently and regularly.     

耐甲氧西林金黄色葡萄球菌及肠毒素的检测

目的评价乳胶结合实验检测耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的方法并检测MRSA的肠毒素.方法收集130株金黄色葡萄球菌临床分离株,通过药敏试验将其分为耐甲氧西林金黄色葡萄球菌和甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌(MSSA),应用乳胶结合试验和基因扩增分别检测青霉素结合蛋白2a(PBP2a)和MecA基因;用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测耐甲氧西林金黄色葡萄球菌肠毒素.结果65株MecA基因扩增阳性菌株中的62株PBP2a检测阳性,63株MSSA中,MecA基因扩增及PBP2a检测全部为阴性.MRSA产肠毒素为67株.MSSA肠毒素为19株.结论乳胶结合试验是一种简便、快速、准确检测MRSA的方法,实验室应重视金黄色葡萄球菌肠毒素的检测.     

医院与社区获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌耐药性的研究

目的为比较医院获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)与社区获得性MRSA的耐药性,以期为临床有效防治MRSA提供科学依据. 方法收集2002～2004年从各临床标本中分离出的不重复MRSA菌株, 参照卫生部医政司医院感染监控小组制定的诊断标准,将其分为社区获得性MRSA组与医院获得性MRSA两组,各组随机各取20株作为本试验的试验对象;对两组的耐药率进行配对t检验,并就其耐药性及原因进行分析. 结果社区获得性MRSA、医院获得性MRSA耐药性存在差异,医院获得性MRSA较社区获得性MRSA耐药性高. 结论 MRSA的出现是高抗生素选择压力的结果;医院获得性MRSA较社区获得性MRSA耐药性差异确实存在统计学的显著性,尤其对阿莫西林/克拉维酸、氨苄西林/舒巴坦、头孢唑林、克林霉素的耐药性差异明显; MRSA菌株多具有多重耐药性.     

MRSA呼吸系统医院感染的分子流行病学调查

目的对广州呼吸疾病研究所2001年7月～2003年3月间,金黄色葡萄球菌引起的呼吸系统医院感染进行病原学监测. 方法收集临床分离菌株,应用脉冲场凝胶电泳的方法(PFGE)进行分型,确定菌株亲缘关系,结合临床资料分析. 结果在各种呼吸道采集标本中共收集到76株金黄色葡萄球菌,耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)68株,占金黄色葡萄球菌检出率89.47%,MRSA在我所病区中引起59例医院感染,属于暴发形式发病的有23例,属于聚集性发病的有19例,散发病例17例,PFGE分型表明,绝大多数MRSA属于同一型(A型)共有60株,其中A1亚型28株,A2亚型14株,A3亚型17株,A4亚型1株. 结论MRSA引起的呼吸系统医院感染十分严重,并主要由少数菌株的传播引起,及时采取有效措施控制MRSA的流行和播散非常必要.     

徐州地区116株MRSA耐药性分析与分子流行病学调查

目的了解耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)感染现状和耐药机制,为临床合理用药提供依据。方法收集徐州地区2012—2015年各类标本中分离的金黄色葡萄球菌(SA),用头孢西丁纸片扩散法初筛MRSA菌株,扩增mecA基因进行确认,K-B法检测MRSA对药物的敏感性,E-test法测定万古霉素的最低抑菌浓度(MIC),采用多重PCR进行葡萄球菌染色体mec(SCCmec)基因分型。结果 2012—2015年210株SA共检出MRSA116株,其中mecA基因阳性114株,MRSA总检出率为55.24%。MRSA对万古霉素、奎奴普丁/达福普汀、替考拉宁和利奈唑胺的敏感率均为100%,对氯霉素和呋喃妥因的耐药率最低,分别为15.52%、1.72%,MRSA对10种抗菌药物的耐药率80%;MRSA对青霉素类、氨基糖苷类、红霉素、喹诺酮类、磺胺类、利福平、四环素、克林霉素的耐药率高于甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌(MSSA)。2012—2015年万古霉素对MRSA的MIC均为1.0μg/mL,MIC90均为1.5μg/mL,2015年发现1株MRSA的万古霉素MIC为2.0μg/mL。116株MRSA分型结果显示,SCCmecII型11株(9.48%),SCCmecIII型85株(73.28%),SCCmecIV型4株(IVa和IVb型各2株,均为1.72%),未分型MRSA16株(13.79%),未检出SCCmecI和V型。结论 MRSA呈严重的多重耐药,对万古霉素MIC无漂移,临床MRSA分离株以SCCmecIII型为主,临床应采取感染控制措施,控制MRSA感染。     

广东省人群多重耐药金葡菌的携带及耐药性分析

目的 调查广东省部分人群(动物从业人员和一般人群)的多重耐药金葡菌(multidrug-resistant S.aureus,MDRSA)携带情况,并分析菌株的耐药性.方法 对研究对象进行问卷调查和鼻拭子采样,对金葡菌进行药敏试验,分析方法采用x2检验.结果 动物从业人员中金葡菌、MDRSA、甲氧西林耐药金葡菌(methicillin-resistantS.aureus,MRSA)的携带率均高于对照人群(分别为13.3％ vs9.3％;9.5％ vs 3.4％;7.0％ vs 1.4％;均有P＜0.01).金葡菌对青霉素、克林霉素、四环素和红霉素的耐药率较高,MDRSA主要耐药模式是同时对克林霉素、红霉素、四环素耐药.除了青霉素外,动物从业人员金葡菌对各类抗生素的耐药率均高于对照人群;MRSA菌株对各类抗生素的耐药率均高于甲氧西林敏感金葡菌.结论 本研究提示职业性动物接触可能导致从业人员感染耐药细菌.