日本血吸虫(中国大陆株)成虫表达序列标签的获取及分析

随机挑取日本血吸虫（中国大陆株）成虫cDNA文库单个重组克隆进行部分测序以获得EST（ex-pressed　sequence　tag）,获得的EST通过 BLAST程序同EMBL寄生虫数据库和GeneBank数据库进行比较及同源性分析。结果在随机挑取日本血吸虫（中国大陆株）成虫cDNA文库150个单个重组克隆中,获得了56个有价值的EST序列,其中47个在GeneBank dbEST中登录。7.1％EST序列为日本血吸虫已知序列,3.6％为日本血吸虫同源序列,曼氏血吸虫或其他生物的同源序列占25％,未知序列占55.6％。通过同源性分析可知,大多数同源序列具有看家基因功能。另外,也发现了几个有价值的基因。     

日本血吸虫细菌人工染色体文库的初步构建(英文)

初步构建了一个日本血吸虫细菌人工染色体（BAC）文库,该文库已包含1000多个含基因组DNA插入片段的重组pEcBAC1克隆,平均插入片段为120kb。BAC文库将为日本血吸虫基因的结构与功能研究提供新的资源。     

日本血吸虫卵基因表达文库的构建

日本血吸虫卵基因表达文库的构建陈淑贞吴海玮张兆松（南京医科大学寄生虫学教研室，南京２１００２９）关键词日本血吸虫；虫卵；基因表达；文库作者从人工感染日本血吸虫尾蚴４５天的家兔肝脏分离日本血吸虫卵，液氮中冻存。临用时研磨成粉再加变性液匀浆。按Ｐｒｏｍｅ...     

中国大陆日本血吸虫微卫星DNA变异

目的探讨中国大陆日本血吸虫微卫星DNA变异。方法对中国大陆浙江、江西、安徽、湖南、湖北、四川、云南七省及菲律宾Sorsogon省日本血吸虫虫株进行6个微卫星DNA位点分析。结果中国大陆日本血吸虫湖区虫株间遗传距离为0．018-0．189，山区虫株间遗传距离为0．095-0．114；湖区与山区虫株间遗传距离为0．128～0．366；中国大陆与菲律宾虫株间遗传距离为0．248～0．4640。结论微卫星DNA显示中国大陆日本血吸虫存在较大变异，结合地理环境、螺类宿主和易感性，中国大陆日本血吸虫至少存在二个不同虫株。     

日本血吸虫表达序列标签的获取和分析

目的 运用表达序列标签(expressed sequence tag，EST)技术，从日本血吸虫成虫cDNA文库中分离、鉴定和分析表达基因序列，为日本血吸虫病的防治提供候选疫苗和药物靶点。方法 构建日本血吸虫成虫cDNA文库，随机挑取重组阳性克隆进行测序，将获取的EST登录GenBank，并进行生物信息学分析。结果 随机挑取382个阳性克隆进行测序，获得149个EST(登录号分别为：CA747382～CA747391，BU917055～BU917058，CA305307～CA305309，BU581980，BU582400～BU582403，BU666906和(A946548～CA946666)，同源性比较发现，部分序列与血吸虫的生活史的不同阶段和不同性别序列有一定的同源性。结论 EST技术有助于快速、经济地获取和研究日本血吸虫表达基因。     

日本血吸虫亲免素基因的扩增及序列分析

【目的】研究日本血吸虫亲免素基因编码序列的结构及进行初步的功能预测。【方法】用5’端和3’端锚定PCR从尾蚴库中扩增，以获取日本血吸虫中国大陆株亲免素基因完整的开放阅读框(open reading frame，ORF)；用生物信息学技术确认其是否为亲免素编码基因并进行结构功能的初步分析和预测。【结果】用5’端和3’端锚定PCR从尾蚴库中获得了亲免素基因5’端和3’端所缺序列，得到的亲免素基因cDNA的总序列长为1438bp，其ORF长1296bp，编码431个氨基酸。利用生物信息学技术鉴定其为日本血吸虫亲免素基因的完整cDNA序列。并用RT-PCR从日本血吸虫尾蚴mRNA扩增出亲免素基因的ORF。【结论】成功获得了日本血吸虫亲免素编码基因的全长cDNA，为进一步的功能研究打下了基础。     

中国大陆日本血吸虫微卫星DNA标记的研究

目的 研究中国大陆日本血吸虫（Schistosoma japonicum）微卫星DNA基因变异。方法 日本血吸虫种群取自中国大陆7个流行省现场：浙江省（嘉善），安徽省（贵池），江西省（永修），湖北省（武汉），湖南省（岳阳），四川省（茅山，天全），云南省（大理）以及菲律宾Sorsogon省。对每一种群20个样本的DNA，用11个日本血吸虫微卫星；M5A，J5N，MFI，CA11-1，S6-1，RRPS，2AAA，S7-1，CGA3，S9-1和MPA分析。结果 中国大陆日本血吸虫不同的种群之间和种群内存在高水平的多态性，进一步证实中国株和菲律宾株分属不同虫株，在中国大陆不同种群间也存在明显遗传变异。结论 证明了用微卫星对日本血吸虫进行种群基因学研究的可行性，并提示中国大陆存在日本血吸虫不同的虫株。     

中国人基因组粘粒文库的构建

用ＳｕｐｅｒＣｏｓｌ粘粒载体构建中国人基因组文库，共得到５．９７×１０~５个有效克隆，插入外源ＤＮＡ片段长度为３２～４５ｋｂ，平均４０ｋｂ，约８．１２倍于人类基因组３×１０~９碱基ＤＮＡ长度。用分布于不同染色体上６个已知标志做ＰＣＲ鉴定，结果皆有特异扩增，表明这些位点均包含在库中。     

日本血吸虫Calpain的DNA疫苗诱导小鼠免疫保护性研究

目的　研究日本血吸虫中国大陆株Calpain的DNA疫苗对Balb/c小鼠的免疫保护性作用。方法　大量制备pVAC质粒DNA和pVAC -CalpainDNA疫苗 ,Balb/c小鼠 5 0只 ,随机均分为对照组和实验组 ,对照组每只小鼠的股四头肌注射接种 10 μgpVAC质粒DNA ,实验组以同样方式注射 10 μgpVAC -CalpainDNA疫苗 ,第 3周加强免疫一次。第 4周每只小鼠经腹部皮肤感染 ( 2 5± 1)条尾蚴 ,感染 6周后剖杀 ,从门静脉灌流收集计成虫数、碎脾计T淋巴细胞总数、从各鼠肝脏的同一部位切下小块肝组织 ,置 5 %KOH溶液消化后 ,计算每克肝组织虫卵数 ,比较减虫率、减雌率和减卵率。于免疫前、第一次免疫后 2周和感染后 2周分别从尾静脉采血 ,用ELISA测定抗体水平。结果　与对照组相比 ,实验组获得 36.84%的减虫率、36.36%的减雌率和 43.31%的减卵率 ,感染后实验组小鼠IgG抗体水平升高幅度大于对照组 ,对照组T淋巴细胞数显著多于实验组。结论　CalpainDNA疫苗可诱导小鼠产生较好的免疫保护作用 ,具有较大的发展潜力     

日本血吸虫中国大陆株副肌球蛋白编码基因的PCR扩增

根据已知的日本血吸虫菲律宾株的副肌球蛋白分子的部分ｃＤＮＡ序列，设计两对寡核苷酸引物（引物１／２和引物３／４），以聚合酶链式反应（ＰＣＲ），用引物１／２从本室两个日本血吸虫中国大陆株ｃＤＮＡ库中均扩增出与预期大小（９２７ｂｐ）一致的特定ＤＮＡ片段。巢式ＰＣＲ——以第一扩增产物为模板，用引物３／４扩增出约５００ｂｐ的单一条带，与预期片段（４９４ｂｐ）大小一致。表明ＰＣＲ产物为编码副肌球蛋白的目的基因片段。     

用抗体探针筛选日本血吸虫成虫cDNA文库

本文将重组体噬菌斑的表达抗原转移至硝酸纤维素膜上,用经假筛选法纯化的日本血吸虫感染兔血清（IRS）来检测。结果6×10~5个噬菌斑形成单位（pfu）初筛出23个可能阳性噬菌斑,经再次筛选,其中有8个克隆持续出现阳性。结果表明该免疫筛选能有效地分离单个编码日本血吸虫抗原的克隆,筛选效率高,特异性强,不需同位素标记技术,操作简便,为进一步筛选编码诱导日本血吸虫保护性免疫力的抗原基因打下了基础。     

基于基因组学的日本血吸虫序列分析平台的构建及应用

[目的]构建基于基因组学的日本血吸虫序列分析平台。[方法]基于工作站和Linux操作系统,利用公开的日本血吸虫或相关资源,收集有关生物信息学序列分析工具,并自行编写相关软件实现多种资源的有机整合。[结果]构建了本地化的日本血吸虫序列分析平台,在此基础上,自主设计了日本血吸虫EST序列的电子延伸系统、基于日本血吸虫EST数据库的同源全长cDNA序列检索系统和序列自动注释系统等。[结论]所构建的序列分析平台不仅可以完成常规的序列分析工作,还可成功地完成EST序列的电子延伸,同源全长cDNA序列的检索以及序列的自动注释,它可对大规模日本血吸虫序列进行快速、方便、高效的分析,为充分利用血吸虫基因组开展疫苗研究和新药开发提供了有效的技术手段。     

免疫筛选日本血吸虫成虫cDNA文库基因的亚克隆与鉴定

目的 亚克隆免疫筛选日本血吸虫ｃＤＮＡ文库得到的基因。方法 在体外将血吸虫ｃＤＮＡ文库基因的ＰＣＲ产物和ｐＧＥＭ－Ｔ载体连接,转染大肠杆菌ＸＬ１－Ｂｌｕｅ,经抗生素及呈色底物Ｘ－ｇａｌ粗筛,再用限制性内切酶及ＰＣＲ方法进一步鉴定。结果 成功地将文库中４个大小不同的日本血吸虫基因片段连接到载体中,获得４个重组子。结论 为可能编码保护性抗原的血吸虫基因测序和将其亚克隆入真核表达质粒奠定基础。     

日本血吸虫大陆株26KDa基因重组蛋白保护性免疫力的研究

本文报道了ｒＳｊｃ２６ＧＳＴ分别抗原可诱导宿主产生抗日本血吸虫感染的保护性免疫力，获得免疫的小鼠虫贡荷与肝、脾组织中虫卵负荷均下降，减虫率与肝、脾减卵分别为３０与５７．１１％、７９．９７％。ＥＬＩＳＡ测免疫鼠血清特异性抗体水平明显升高。提示ｒＳｊｃ２６ＧＳＴ作为日本血吸虫病候选疫苗矍有广泛应用前景。     

日本血吸虫（大陆株）成虫基因表达谱的研究

报告作1998年至2000年有关日本血吸虫（大陆株）成早基因表达谱研究的结果，主要扬：已测定551条EST，其中519条EST已送入国际基因数据库（GenBank/dbEST），并获得了GenBank的登录号。经同源整合后，519长EST序列归类为388个基因序列，其中，24条（6.19％）为日本血吸虫已知基因序列；18条（4.64％）EST与曼长血吸虫已知基因序列同源，90条（23.19％）EST与其它生物的已知基因序列同源，同源基因包括精氮酸酶、酰胺酸酶、微纤维蛋白、肌动蛋白、细胞色素C氧化酶、二硫异构酶、加长因子、热激蛋白70、Y盒结合蛋白和抗凋亡因子等。其余的256条（65.98％）EST在Gen-Bank中未发现有已知基因的同源序列。将非日本血吸虫同源序列EST或未检索到同源序列的EST初步定义为日本血吸虫亲基因/未知基因序列EST，共364条。已克降日本血吸虫精氮酸酶基因、Y-盒结合蛋白基因和抗凋亡-1因子3个新基因的全长cDNA，其GenBank的登录号分别为AF402615、AF367371和AF333765。本研究结果丰富了血吸虫基因组数据，并为进一步筛选日本血吸虫疫苗候选基因或药物靶位提供了科学依据。     

日本血吸虫(中国株)成虫cDNA表达库构建的初报

从改进现有的血吸虫病免疫诊断以及发展针对日本血吸虫感染的实验性分子疫苗的目标着想,考虑到需要制备克隆化的抗原。目前已采用日本血吸虫(中国株)成虫的mRNA,在载体λgtll 噬菌体以及宿主大肠杆菌y1090这一系统中构建了一个cDNA 表达库,并对该表达库用抗体进行筛选。有关建库的基本步骤描述于后:     

基于基因组学的日本血吸虫序列分析平台的构建及应用

 [目的]构建基于基因组学的日本血吸虫序列分析平台。[方法]基于工作站和Linux操作系统,利用公开的日本血吸虫或相关资源,收集有关生物信息学序列分析工具,并自行编写相关软件实现多种资源的有机整合。[结果]构建了本地化的日本血吸虫序列分析平台,在此基础上,自主设计了日本血吸虫EST序列的电子延伸系统、基于日本血吸虫EST数据库的同源全长cDNA序列检索系统和序列自动注释系统等。[结论]所构建的序列分析平台不仅可以完成常规的序列分析工作,还可成功地完成EST序列的电子延伸,同源全长cDNA序列的检索以及序列的自动注释,它可对大规模日本血吸虫序列进行快速、方便、高效的分析,为充分利用血吸虫基因组开展疫苗研究和新药开发提供了有效的技术手段。     

日本血吸虫中国大陆株琥珀酸脱氢酶铁硫蛋白的克隆与表达

目的：克隆日本血吸虫琥珀酸脱氢酶铁硫蛋白（sjSDISP）全长编码基因,并对所获基因在大肠杆菌中进行表达。方法：根据基因库中SjSDISP对应的EST（BU804141）以及日本血吸虫成虫cDNA文库载体λgtl1多克隆位点邻近核苷酸序列设计引物,以日本血吸虫成虫cDNA文库为模板,采用锚式PCR对SjSDISP基因不完整的3′端和5′端进行扩增、测序,用电子软件拼接成全长cDNA,将其克隆到表达载体pGEX-4T-1上,经琼脂糖凝胶电泳、限制性内切酶消化、PCR和测序鉴定后,选择阳性克隆进行表达及Western印迹分析。结果：获得1071bp全长cDNA,其理论推导为编码278个氨基酸残基的蛋白质。SjSDISP基因在大肠杆菌BL2．中获得良好表达。该融合表达产物相对分子质量约为56kD,且能被日本血吸虫成虫抗原免疫血清特异识别。结论：编码日本血吸虫琥珀酸脱氢酶铁硫蛋白全长cDNA克隆及其在大肠杆菌中的表达获得成功。