基于网络药理学的治伤风颗粒治疗感冒的作用机制探讨

目的应用网络药理学技术探讨治伤风颗粒治疗感冒的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和药物靶点信息数据库(DrugBank)检索治伤风颗粒的化学成分及作用靶点;基于GeneCards数据库检索“感冒”的靶点,取药物与疾病靶点交集,应用Cytoscape软件构建“活性成分-靶点-疾病”网络。应用STRING数据库建立蛋白质互作(PPI)网络,应用R软件进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果通过筛选共得到治伤风颗粒有效成分146种,药物靶点280个,疾病靶点1 418个,提取出两者的共同靶点117个。将药物与靶点导入Cytoscape软件,分析得出槲皮素、山奈酚和木犀草素等为中药中度值较高的活性成分,无水咖啡因为西药中度值最高的活性成分。STRING数据库分析得出IL-6、AKT1、INS、VEGFA、MAPK8等属于感冒的关键靶点。GO分析显示生物过程(BP)、细胞组分(CC)和分子功能(MF)3个方面的富集条目。KEGG通路富集分析筛选得出TNF信号通路、IL-17信号通路等20条信号通路,并绘制了“通路-靶点”关系图。结论基于网络药理学分析筛选出了治伤风颗粒治疗感冒的活性成分、作用靶点和通路,初步得出了其作用机制,为该药的深入研究提供了一定的依据。     

基于网络药理学和分子对接探讨黑骨藤追风活络胶囊治疗类风湿关节炎的作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接探讨黑骨藤追风活络胶囊（HZC）治疗类风湿关节炎（RA）的作用机制。方法 通过ETCM数据库和文献查阅获得复方活性成分,运用Swiss Target Prediction平台进行靶点预测。用GeneCards、DisGeNET、OMIM数据库筛选RA相关靶点,绘制韦恩图获取药物和疾病交集靶点。采用STRING平台构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,利用Cytoscape3.9.1软件中centiscape2.2插件筛选潜在关键靶点。用DAVID数据库对关键靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析,用Cytoscape3.9.1软件绘制药物-活性成分-靶点-通路网络图。最后选取核心成分与核心靶点进行分子对接。结果 共筛选出32个有效成分,药物与疾病交集靶点91个,主要活性成分为槲皮素、盐酸青藤碱和杠柳苷元,核心靶点为肿瘤坏死因子（TNF）、信号转导与转录激活因子3(STAT3)、表皮生长因子受体（EGFR）。作用机制可能与HIF-1信号通路、TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路、JAK-STAT信号通路等有关。分子对接显示主要活性成分与关键靶点具有很...     

基于网络药理学的桂枝茯苓丸治疗宫颈癌的机制研究

目的探讨桂枝茯苓丸治疗宫颈癌的有效活性成分及作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)选取桂枝茯苓丸中各药物的化学成分,筛选活性成分及潜在靶点。通过Gene Cards数据库挖掘宫颈癌的疾病靶点,依据药物靶点与疾病靶点构建桂枝茯苓丸有效成分靶点与疾病靶点的韦恩图、化合物-靶点网络调控图、PPI网络图,同时进行GO富集分析及KEGG通路富集分析。结果桂枝茯苓丸中共494个化合物,筛选出85个活性化合物,对应宫颈癌83个靶点,分析数据表明,桂枝茯苓丸治疗宫颈癌的核心有效活性成分依次为槲皮素、β谷甾醇、山奈酚、黄芩苷、红景天苷、豆甾醇、谷甾醇等,其治疗宫颈癌的核心靶点依次为PGR、NCOA2、PTGS1、CHRM1、NR3C2等;依据CS值发现的关键节点涉及IL-6、EGFR、MAPK8、CASP3、VEGF、MYC等;主要涉及反应依次为对酮的反应、类固醇激素的反应、细胞对化学应激的反应等;细胞过程主要涉及的部分依次为膜筏、膜微区、膜区、核染色质等;分子过程主要涉及的反应依次为DNA结合转录因子结合、RNA聚合酶Ⅱ特异性DNA结合转录因子结合、DNA结合转录激活物活性等;主要涉及关键信号通路依次为糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、PI3K-Akt、MAPK等。结论桂枝茯苓丸可通过多靶点途径发挥治疗宫颈癌的作用,其治疗机制与调控核心相关蛋白、基因及信号通路密切相关,为基础研究提供参考。     

基于网络药理学探讨肝积汤治疗肝癌的分子机制

目的 探讨基于网络药理学的肝积汤活性成分、治疗靶点及分子机制。方法肝积汤的活性成分及作用靶点从TCMSP数据库筛选,肝癌相关靶点从GeneCard数据库获取,运用String数据库对共同靶点做蛋白互作网络分析,GO和KEGG富集分析采用Bioconductor生物信息软件包进行,“成分－靶点－通路”网络图采用Cytoscape制作。结果 从 TCMSP 中获得肝积汤有效活性成分 80种以及249 个药效分子靶点。与检索到的885 个肝癌相关靶点取交集,得到95个共同靶点。蛋白互作网络分析显示有TP53、VEGFA、AKT1等15个核心靶点。GO 功能分析表明,这些靶点主要富集在细胞对化学应激的反应,细胞对氧化应激的反应,对脂多糖反应等；涉及细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶全酶复合物、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶复合物,蛋白络氨酸激酶等,主要涉及DNA结合转录因子结合、RNA聚合酶Ⅱ特异性DNA结合转录因子结合、泛素样蛋白连接酶结合。KEGG 富集分析结果显示,肝积汤作用靶点富集在相关肝癌发生与发展的通路上,如PI3K-Akt信号通路、乙型肝炎病毒信号通路、人巨细胞病毒感染信号通路。结论 槲皮素、木犀草素、山柰酚等可能为肝积汤治疗肝癌的关键成分,TP53、VEGFA、AKT1等为核心靶点,PI3K-Akt、乙型肝炎病毒、人巨细胞病毒感染等通路为主要作用的通路。     

参竹心康方治疗慢性心力衰竭的作用机制

目的：基于网络药理学筛选参竹心康方主要活性化合物,预测参竹心康方在对于慢性心力衰竭治疗中的潜在作用靶点及信号通路,对其作用机制进行研究。方法：主要利用TCMSP平台并结合ETCM数据库检索参竹心康方各中药的化学成分及活性成分作用靶点;通过DisGeNET、DrugBank、OMIM、GeneCards数据库获取慢性心力衰竭的主要靶点;运用Cytoscape软件系统构建“药物-活性成分-靶点”网络及PPI网络,筛选核心靶点。采用Metascape数据平台对交集靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。结果：得到参竹心康方有效成分158个、药物靶点1688个、慢性心衰靶点1913个,最终获得参竹心康方作用于慢性心衰的关键靶点206个,KEGG通路204条。结论：参竹心康发治疗慢性心衰主要成分为槲皮素、山奈酚、木犀草素、黄芩苷、异鼠李素,关键靶点为AKT1、VEGFA、IL6、TNF、TP53,关键通路涉及PI3K-Akt信号通路、JAK-STAT信号通路、钙信号通路、cAMP信号通路、cGMP-PKG信号通路等。     

基于网络药理学探讨小柴胡汤治疗胃食管反流病合并失眠的作用机制

目的 基于网络药理学探讨小柴胡汤治疗胃食管反流病(GERD)合并失眠的潜在作用机制。方法 通过在线数据库筛选小柴胡汤的活性成分、药物靶点以及GERD和失眠的疾病靶点;取药物靶点和疾病靶点的交集,利用STRING数据库分析交集靶点的相互作用;通过Cytoscape软件构建和分析“活性成分-靶点”“药物-活性成分-共同靶点-疾病”、蛋白质相互作用(PPI)网络;通过DAVID数据库对交集靶点进行基因本体(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;通过BioGPS对核心靶点进行基因定位,结合Cytoscape构建“成分-靶点-通路-器官/组织”网络;使用AutoDockVina进行主要活性成分与核心靶点的分子对接。结果 小柴胡汤治疗GERD合并失眠的主要活性成分包括槲皮素、山奈酚、黄芩素等多种化合物,关键靶点包括丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)、白细胞介素-1B(IL-1B)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、肿瘤蛋白53(TP53)等,与RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、炎症应答、信号转导等生物过程相关,涉及的通路包括癌症途径、AGE-RAGE信号...     

基于网络药理学探讨芍药甘草汤治疗慢性萎缩性胃炎的作用机制探讨

目的 采用网络药理学探究芍药甘草汤治疗慢性萎缩性胃炎（CAG）的作用机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）数据库、文献挖掘整理芍药甘草汤化学成分;利用GeneCards、OMIM、DrugBank、TTD数据库收集CAG的相关靶点;利用Venn图筛选交集靶点,由Cytoscape软件构建“活性成分-疾病靶点”网络,由String数据库和Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络;利用Metascape数据库进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析;利用AutoDock软件进行分子对接。结果 筛选出芍药甘草汤有效活性成分103个,与CAG相关靶点76个,重要活性成分包括槲皮素、山奈酚、柚皮素、甘草查尔酮A,核心靶点包括丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、肿瘤抑制因子p53(TP53)、肿瘤坏死因子（TNF）等,KEGG通路主要富集于白细胞介素-17(IL-17)、TNF、缺氧诱导因子1(HIF-1)等通路。分子对接结果显示化合物与关键靶点有较好的结合能力。结论 芍药甘草汤可通过多成分、多靶点、多通路发挥对CAG的治疗作用。     

应用网络药理学探讨菟丝子治疗多囊卵巢综合征伴胰岛素抵抗的可能机制

摘要：【目的】 挖掘中药菟丝子用于防治多囊卵巢综合征（PCOS）伴胰岛素抵抗（IR）的潜在作用机制。【方法】 通过多个数据库检索菟丝子成分与靶点及PCOS、IR相关疾病靶点，在Uniprot对筛选并去重后的靶点进行校准，取成分与疾病靶点的交集基因，在Cytoscape创建菟丝子“活性成分—PCOS-IR”网络与PPI网络；基于Metascape对菟丝子治疗PCOS-IR的靶点用以GO和KEGG富集分析预测其作用机制。【结果】 初步获得菟丝子29种化学成分，经筛选，留存13种主要活性成分，主要为黄酮类物质，包括槲皮素、芹菜素、山奈酚、异鼠李素、β-谷甾醇、芝麻素、苦参碱、紫云英苷、金丝桃苷等。共收集764个PCOS、IR相关疾病靶点，与活性成分靶点进行，获得104个交集基因，PPI网络分析结果显示这些基因主要与脂质反应、生殖结构发育、细胞凋亡、类固醇激素受体活性等生物进程有关，它们的分子功能主要与核受体活性、BH3结构域结合、IR结合等相关，主要富集在膜筏、囊泡腔、细胞器外膜、蛋白激酶复合体等部位。【结论】菟丝子通过多成分、多靶点以及多途径参与PCOS伴IR调控机制，其中13种主要成分可能为其药效物质基础，它们通过AGE-RAGE信号通路、PI3K-Akt信号通路、JAK/STAT信号通路等发挥效应，以上数据为菟丝子进一步的临床应用及基础研究提供参考依据。     

基于网络药理学分析外用应急软膏治疗寻常型银屑病的机制

目的 探讨网络药理学分析外用应急软膏治疗寻常型银屑病作用机制的价值,为临床提供参考。方法 依托中药药理学平台（TCMSP）筛选外用应急软膏主要药物的活性成分和作用靶点;通过检查人类基因信息数据库（GeneCards）和人类孟德尔遗传研究平台（OMIM）选取疾病作用靶点。以R语言绘制韦恩图;运用STRING平台搭建蛋白互作网络（PPI）;构建药物-化合物-靶点-疾病互作网络,使用Bioconductor生物信息软件包进行基因本体（GO）功能富集和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集通路分析。结果 获得365个化合物和2 201个靶点,并得到99个靶点与寻常型银屑病密切相关,富集分析得到133个GO功能条目和149条KEGG信号通路。结论 外用应急软膏药物活性成分可通过白细胞介素-6(IL-6)、信号转导和转录激活因子3(STAT3)、蛋白激酶B1(AKT1)等多个靶点调节糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体（AGE-RAGE）、肿瘤坏死因子（TNF）、丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）等多条信号通路发挥抑制炎症反应,修复皮肤屏障的作用。     

青蒿治疗系统性红斑狼疮的网络药理学分析

目的:通过网络药理学方法研究青蒿治疗系统性红斑狼疮(SLE)的潜在作用机制.方法:通过中国传统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选青蒿的有效活性成分和作用靶点,运用Uniprot数据库将药物靶点进行基因名字标准化处理,在GeneCards、OMIM数据库中检索SLE相关靶点,使用R软件绘制Venny图找出青蒿与SLE共同作用靶点,String数据库构建蛋白质互作(PPI)网络,Cytoscape软件中进行PPI网络可视化,构建"药物-活性成分-潜在靶点-疾病"网络,并筛选出核心基因,对共同作用靶基因进行GO、KEGG富集分析.结果:筛选得到青蒿的有效活性成分22个,111个青蒿有效成分与SLE共同作用靶基因,30个核心基因.GO功能富集显示青蒿治疗SLE生物学过程和功能主要集中在细胞因子受体结合、细胞因子活性、核受体活性、转录因子活性、受体配体活性、类固醇激素受体等.KEGG通路富集显示,青蒿治疗SLE主要涉及TNF、IL-17、Toll样受体、Th17细胞分化等信号通路.结论:通过构建"药物-活性成分-潜在靶点-疾病"网络,阐释了青蒿多成分、多靶点、多条通路治疗SLE的作用机制,为深入研究青蒿治疗SLE的机制提供一定参考意义.     

基于网络药理学方法研究大黄牡丹汤治疗阑尾炎的作用机制及物质基础

目的 运用网络药理学方法研究大黄牡丹汤治疗阑尾炎的作用机制及分子基础。方法 在TCMSP数据库中,检索大黄牡丹汤中五味中药的主要化学成分,通过TCMSP平台查找及预测中药化合物对应靶点,在genecards数据库中搜索阑尾炎疾病靶点,取二者靶点交集导入Swiss平台获得PPI网络,筛选核心作用靶点并构建大黄牡丹汤-潜在靶点-阑尾炎作用网络。对核心靶点进行基因本体（gene ontology,GO）分子功能及基因组百科全书（kyto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）富集分析。采用DiscoverStiudio软件对活性成分与靶点进行分子对接。结果 筛选得大黄牡丹汤中主要活性成分有11个,该活性成分的有效靶点有166个,阑尾炎疾病709个,取交集得核心靶点66个;GO富集分析显示靶点基因主要涉及RNA聚合酶II启动子的转录正调控、一氧化氮生物合成过程的正调控、平滑肌细胞增殖正调控、蛋白磷酸化正调控等;KEGG富集结果显示大黄牡丹汤可能具有调控FoxO信号通路、鞘脂类信号通路、toll样受体信号通路等功效;结论 大黄牡丹汤可通过调控机体炎症反应、NF-kappa B信号通路、炎症介质对TRP通道,参与促炎症细胞因子的转录调节等治疗阑尾炎。     

基于网络药理学的黑地黄丸治疗肾性贫血机制探究

目的:基于网络药理学方法探究黑地黄丸治疗肾性贫血的作用机制.方法:运用网络数据库对黑地黄丸成分及肾性贫血靶点进行检索筛选;运用Cytoscape软件,构建中药成分-靶点网络,运用STRING数据库构建黑地黄丸治疗肾性贫血的蛋白互作网络图,进行拓扑分析,找出核心靶点,最后用DAVID6.8数据库对药物-疾病交集靶点进行G...     

基于网络药理学预测青风藤治疗类风湿关节炎的分子机制

目的运用网络药理学的方法探讨青风藤治疗类风湿关节炎的分子机制。方法通过TCMSP平台筛选青风藤活性成分及作用靶点;在GeneCards和OMIM数据库中获取类风湿关节炎靶基因。通过R语言对基因进行匹配运算并绘制韦恩图;在String平台生成成分-蛋白互作网络图;Cytoscape 3.6.1软件构建成分-靶点网络;通过R3.5.1软件进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。结果共筛选出6个活性成分和23个潜在作用靶点;GO功能富集显示,青风藤可以影响炎症因子的细胞信号转导等生物学过程。KEGG通路富集分析显示,青风藤可以通过调控P53等凋亡相关通路发挥抗类风湿关节炎的作用。结论青风藤可能通过作用于CASP3、JUN、OPRD1等关键靶点调控P53等信号通路,从而调控炎症细胞凋亡进而发挥治疗类风湿关节炎的作用。     

基于网络药理学-分子对接技术探讨泽泻 抗炎作用的分子机制

摘要：目的：应用网络药理学方法及分子对接技术，探讨泽泻发挥抗炎作用的活性成分及其对应靶点和相关通路。方法：通过TCMSP筛选出泽泻的活性成分，运用SwissTarget Prediction 数据库预测活性成分相关靶标，同时采用GeneCards数据库得到炎症相关靶点，再将获得的活性成分靶点和炎症靶点导入VENNY2.1得到药物治疗疾病的潜在靶点；再运用STRING数据库、Cytoscape3.7.1软件构建简化后的药物治疗疾病的靶蛋白互作图（PPI）并筛选关键靶点。利用DAVID数据库对关键靶点进行GO功能富集分析和KEGG信号通路分析，再用Cytoscape3.7.1软件构建“化合物-靶点-通路”图并筛选核心成分与核心靶点。最后运用AutoDock Vina和Pymol将核心成分与核心靶点进行分子对接。结果：获得10个药物活性成分，得到相关潜在靶点284个，疾病潜在靶点11414个，药物治疗疾病的相关靶点260个，有SRC、HSP90AA1、PIK3CA、MAPK1、AKT1、LCK、FYN、JAK1、PLCG1、JAK1等关键靶点58个；涉及PI3K-Akt信号通路、ErbB信号通路、FoxO信号通路等133条通路。结论：泽泻发挥抗炎的作用机制可能是一方面通过调控PIK3、AKT、m-TOR等相关蛋白，激活PI3K-Akt信号通路，从而抑制细胞凋亡；另一方面可能通过调控EGFR相关蛋白，介导ErbB信号通路，从而干预炎症细胞生长。本研究基于网络药理学方法和分子对接技术，阐释了泽泻通过多种成分、多靶点、多信号通路发挥抗炎作用与机制，为该药的进一步研究提供了有益参考和科学依据。     

游离穿支皮瓣联合桃红四物汤加减治疗四肢软组织缺损

目的:观察游离穿支皮瓣联合桃红四物汤加减治疗四肢软组织缺损的临床疗效。方法:病例选自2016年4月—2019年3月,采用游离穿支皮瓣治疗四肢软组织缺损的患者72例。随机分为治疗组与对照组,对照组予常规治疗,治疗组在对照组基础上服用加味桃红四物汤,术前、术后第1天及术后第7天行凝血常规、血常规、及各项生化检验,并观察术后2周2组皮瓣存活情况。结果:术前、术后第1天2组患者的凝血活酶时间(PT)、活化部分凝血活酶时间(APTT)、FIB、红细胞计数(RBC)、血红蛋白(HGB)比较,差异无统计学意义,术后第7天治疗组优于对照组,差异有统计学意义。术后2周治疗组皮瓣愈合优良率高于对照组,差异有统计学意义。结论:游离穿支皮瓣术后患者应用桃红四物汤加补益类中药不仅可以活血化瘀,改善皮瓣血运,还可以提高患者血红蛋白及红细胞数,改善患者全身症状,为皮瓣良好存活及患者康复创造良好的条件。     

柴胡舒肝散合桃红四物汤加减联合奥卡西平治疗带状疱疹后遗神经痛疗效观察

目的:观察柴胡舒肝散合桃红四物汤加减联合奥卡西平治疗带状疱疹后遗神经痛(PHN)的临床疗效。方法:将42例PHN患者随机分为对照组和治疗组,每组21例,两组患者均予以口服营养神经药物等基础治疗,在此基础上,对照组口服奥卡西平片0.3g/次,2次/d;治疗组在对照组的基础上给予柴胡舒肝散合桃红四物汤加减治疗。两组患者均治疗4周。观察两组患者在治疗前后的疼痛程度(VAS评分)改变、焦虑情况(SAS评分)、抑郁情况(SDS评分)以及睡眠质量(AIS评分)的改善情况。结果:对照组与治疗组治疗总有效率分别是76.19%和95.23%,差异有统计学意义(P<0.05);治疗后治疗组患者的VAS评分、SAS评分、AIS评分均显著低于对照组(P<0.05);治疗组与对照组相比,两组的SDS评分虽都有所下降,但差异无统计学意义(P>0.05)。结论:柴胡舒肝散合桃红四物汤加减联合奥卡西平对PHN疗效显著,无明显副作用,不仅能够有效地减轻患者疼痛症状,还能改善患者的焦虑及失眠情况,从而改善患者心理状态及提高生活质量,具有临床应用价值。     

基于网络药理学探讨定喘汤治疗支气管哮喘的作用机制

目的采用网络药理学方法探讨定喘汤治疗支气管哮喘的作用机制。方法利用TCMSP筛选定喘汤药物的有效活性成分,并通过GeneCards等数据库进行检索获得支气管哮喘相关的疾病靶点。采用DAVID v.6.8数据库进行GO富集分析及KEGG通路富集分析。结果经数据库分析,定喘汤与支气管哮喘的共同靶基因为286个。GO-BP功能分析结果显示,共同基因主要作用于正向调控RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录、血管生成、ERK1和ERK2级联反应等,负向调控凋亡过程等。KEGG富集分析结果显示,共同靶点可以与哮喘相关的T细胞受体信号通路、FcεRI信号通路、B细胞受体信号通路等多条信号通路发挥作用。通过与常用西药相关蛋白比较发现,定喘汤可发挥β2受体激动剂和吸入皮质激素的作用。结论定喘汤从多成分、多靶点、多通路的角度治疗支气管哮喘的作用机制对后续深入研究具有重要意义。     

桃红四物汤联合低分子肝素预防腰椎术后深静脉血栓的临床研究

目的:评价桃红四物汤预防腰椎手术术后深静脉血栓形成的临床疗效。方法:收集从2016年1月1日起入院准备行腰椎手术的病例,术前常规查双下肢深静脉B超,白介素-8、血小板计数、血D-二聚体、活化部分凝血活酶时间(APTT)及血浆凝血酶原时间(PT)等,随机分为两组,两组术后常规第二天予抗凝治疗,治疗组在抗凝的基础上加用桃红四物汤,对照组常规抗凝治疗。两周后复查双下肢深静脉B超、血红蛋白、白介素-8、血小板计数、血D-二聚体、活化部分凝血活酶时间(APTT)及血浆凝血酶原时间(PT)。对比两组术后深静脉血栓发生率;观察治疗后血红蛋白、白介素-8、血小板计数、血D-二聚体、活化部分凝血活酶时间(APTT)及血浆凝血酶原时间(PT)的变化情况。结果:治疗组术后深静脉血栓发生率低于对照组(P<0.05);治疗组术后血红蛋白计数、APTT及PT水平高于对照组;术后白介素-8、血小板计数、血D-二聚体水平低于对照组(P<0.05)。结论:桃红四物汤联合常规抗凝治疗可以有效的降低腰椎术后深静脉血栓形成的风险,并且改善术后患者的应激状态,减少失血及炎性反应。