浙江省台州地区新确诊HIV感染者耐药突变研究

目的 了解浙江省台州地区新确诊艾滋病病毒(human immunodeficiency virus,HIV)感染者HIV原发性耐药情况.方法 对浙江省台州地区2012-2013年新确诊的所有≥18岁的HIV感染者进行pol基因扩增并测序.运用美国阿拉莫斯国家实验室HIV核酸序列库,判定HIV基因亚型.根据WHO耐药突变位点列表(2009年)并参照美国斯坦福大学HIV耐药数据库,确定HIV耐药突变位点及其对各种抗逆转录病毒药物的敏感性.结果 共有507名HIV感染者纳入研究,成功扩增416例(82.1％)患者血浆HIV的pol基因,共发现7种HIV基因亚型,分别是CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC、B、CRF01 _AE/B、CRF01_BC和CRF06_cpx,以CRF01_AE为最具优势的亚型,占49.8％;其次是CRF07_BC,占32.0％.13例感染者具有WHO推荐的耐药突变位点,耐药率为3.1％.结论 浙江省台州地区的HIV原发性耐药率处于低水平状态,然而,潜在耐药突变率较高,随着扩大抗病毒治疗的进一步推动,有必要加强HIV耐药监测.     

新确认HIV-1感染者耐药相关基因位点突变研究

目的了解北京市朝阳区新确认HIV-1感染者耐药相关位点突变的情况。方法选取2014年朝阳区新确认的HIV-1感染者125例,提取血浆中的病毒RNA,用反转录PCR和套式PCR扩增HIV病毒的pol区,并进行序列测定及耐药分析。结果 92份标本扩增成功,扩增阳性样本亚型分布以CRF01_AE亚型为主,占58.70%,31例(33.70%)为CRF07_BC亚型,6例(6.53%)为B亚型,1例(1.07%)为CRF08_BC亚型;经耐药相关位点分析,27例出现了至少一种耐药相关突变;11例(11.96%)患者携带的耐药相关突变位点可能会引起不同程度的耐药。结论朝阳区新确认HIV-1感染者原发性耐药处于相对较高的水平,与新确认的感染者中以男男性接触人群为主有关,同时提示应当对HIV原发性耐药监测常规化。     

2013年江西省HIV-1耐药警戒线调查

目的了解2013年江西省HIV-1耐药株的传播水平。方法采用WHO的二项顺序抽样法,随机抽取2013年江西省16岁~25岁符合耐药警戒线调查标准的HIV-1感染者血浆样本,提取病毒RNA,采用RT-PCR和巢式PCR扩增HIV pol区基因片段进行原发耐药基因变异分析。结果 47个研究对象的HIV亚型有CRF07_BC、CRF01_AE和B'亚型,分别占51.06%(24/47)、42.55%(20/47)和6.38%(3/47),其中CRF07_BC和CRF01_AE为主要亚型;不同传播途径的感染者中,HIV亚型分布差异无统计学意义。47份样本中仅有1份来自异性性接触感染者的样本存在RT区耐药突变位点(M184V)。结论 2013年江西省HIV-1耐药株的传播水平为低度(5%),个体在抗病毒治疗前尚不需要进行耐药检测。但是随着抗病毒治疗规模的逐步扩大,有必要继续加强HIV耐药株传播的监测工作。     

绍兴市艾滋病治疗患者HIV耐药基因分析

目的了解绍兴市抗病毒治疗患者的耐药基因变异情况,以进一步指导抗病毒药物的选择。方法分析2013年7月-2014年5月绍兴地区抗病毒治疗大于1年且病毒未抑制的36例感染者样本,采用RT-PCR和nest-PCR方法扩增HIV-1的pol基因区全长,参照美国斯坦福大学HIV耐药数据库,确定HIV亚型及耐药突变位点。结果病毒耐药率为6.85%(33/482),33例病毒未抑制感染者样品检测到耐药突变,主要亚型为CRF01_AE和CRF07_BC。检测到针对核苷类逆转录酶抑制剂(NRTIs)的耐药突变,主要类型有M184V、K70R、D67N,针对非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTIs)耐药的突变,主要类型有V179D/E/T、K103N、Y181CY、V90I、G190A。结论绍兴市HIV经抗病毒治疗后易产生耐药性,应加强对HIV耐药变异监测和患者服药依从性干预。     

深圳市2010年感染HIV的男男性接触者原发耐药基因突变监测

目的了解深圳市2010年男男性接触者(MSM)HIV-1耐药传播情况,监测2010年该地区MSM人群HIV毒株的流行情况。方法收集深圳市2010年专题调查的14例HIV-1抗体阳性的MSM血浆,提取病毒RNA,采用RT-PCR方法扩增pol区的基因片断,并对扩增片断进行序列测定和分析。结果 CRF01_AE亚型占45.39%(64/141),CRF07_BC亚型占39.71%(56/141),B亚型占14.89%(21/141)。3份出现NRTI耐药突变,突变的类型分别为:L210W,T215S,T215I;1份出现NNRTI耐药突变,突变的类型为:K103N,Y181C,P225H;无样本出现PI耐药突变,总体耐药突变率为2.8%。结论深圳地区MSM人群中耐药传播目前仍处于低度水平。感染株主要为CRF01_AE、CRF07_BC和B3种亚型,CRF01_AE仍是深圳市MSM人群中HIV主要流行亚型,CRF07_BC重组亚型在深圳市MSM人群中增长迅速。     

上海市闵行区未经抗病毒治疗的HIV-1感染者耐药突变研究

目的研究上海市闵行区未经HIV抗病毒治疗的HIV-1感染者/获得性免疫缺陷综合征(AIDS)患者的原发耐药水平和闵行区现今HIV病毒的流行现状。方法收集2016年-2018年上海市闵行区首次确认为HIV-1阳性的HIV感染者血浆,采用反转录/巢式PCR扩增pol基因,并进行序列测定和亚型分析。结果闵行区HIV-1感染者感染途径为异性性行为(29/27.9),同性性行为(70/67.3),注射毒品及输血(5/4.8),基因亚型共6种:CRF01_AE、CRF07_BC、CRF B、CRF D、CRF C、CRF08_BC,主要的基因亚型为CRF01_AE(57例,54.8%)和CRF07_BC(31例,29.8%); 104例中有10例(9.6%)分别产生了对非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)以及蛋白酶类抑制剂(PIs)的耐药突变,其中9例具有潜在低度耐药。结论闵行区未出现主要的耐药基因突变,传播耐药处于低度流行水平,应加强对HIV-1耐药情况的监测;闵行区艾滋病的防治重点为外来流动人员以及男男性行为人群。     

云南省红河州2011年HIV-1耐药传播警戒线调查

目的 调查2011年云南省艾滋病高流行区红河州未经抗病毒治疗的HIV感染者中耐药株的传播水平.方法 根据耐药警戒线调查方案,对红河州2011年1～6月新确证的59份年龄在16～25岁的HIV-1感染者的样本进行耐药基因型检测和耐药株传播水平分析.结果 41份完成了耐药基因型鉴定.其中,56.1％的样本为CRF08_BC,其他依次为:CRF07_BC、CRF01_AE和CRF07_BC/CRF08_BC.扩增阳性的样本中检测到蛋白酶区突变位点L10F/I和A71V,逆转录酶区突变位点A62V、T69S/N和V179D/DN.然而未检测到监测相关的耐药突变(Surveillance Drug Resistance Mutations,SDRM),按照耐药警戒线的统计方法估算耐药株流行率小于5％.结论 红河州目前HIV-1耐药株处于低度流行水平,今后在加强重点人群防治的基础上,应规范抗病毒治疗及对感染者进行科学管理,同时有计划地开展相关的耐药监测.     

昆明市2010年HIV-1耐药传播警戒线调查

目的 了解2010年昆明市未经抗病毒治疗的HIV感染者中耐药株的传播水平.方法 根据WHO推荐的HIV耐药警戒线调查方法,对2010年1-8月收集的62份年龄＜25岁的HIV-1新发现感染者的血液样本进行HIV-1耐药基因型检测和耐药株传播水平分析.结果 62份样本中,54份完成耐药基因型鉴定.按pol基因区进行分型,其中53.2％的样本为CRF08 BC亚型,其他亚型包括CRF07_BC、CRF01_AE、C.根据采样时间顺序,前47份扩增阳性的样本用于耐药传播水平的分析,其中1份出现针对蛋白酶抑制剂类药物的耐药突变位点,耐药株流行率＜5％.结论 昆明市HIV耐药株尚处于低度流行水平,为控制耐药传播水平的上升,规范治疗及科学管理仍然是当前艾滋病患者治疗工作的重点.     

台州市2016-2018年新报告HIV/AIDS抗病毒治疗前HIV-1耐药及亚型流行特征分析

目的 了解台州市新报告HIV/AIDS抗病毒治疗（ART）前HIV-1耐药情况及亚型流行特点。方法 于2016年1月至2018年12月在台州市开展新报告HIV/AIDS在ART前HIV-1耐药的横断面调查,RT-PCR扩增获得HIV-1 pol基因片段并测序,提交序列至斯坦福大学耐药数据库,根据2014年WHO耐药监测指南的推荐标准,确定耐药突变位点以及HIV-1毒株对抗病毒药物的敏感性。结果 2016-2018年台州市新报告HIV/AIDS中成功获得HIV-1 pol基因区序列的研究对象806例,ART前HIV-1耐药率为2.9%（23/806）,其中,非核苷类反转录酶抑制剂（NNRTIs）、核苷类反转录酶抑制剂（NRTIs）和蛋白酶抑制剂（PIs）耐药率分别为1.9%（15/806）、0.6%（5/806）和0.0%。2016-2018年新报告HIV/AIDS在ART前HIV-1耐药率依次分别为1.6%、1.8%和4.8%。NNRTIs和NRTIs耐药突变位点以K103 N（0.7%）和M184I/V（0.5%）为主。HIV-1亚型以CRF01_AE（42.7%,344/806）、CRF07_BC（28.9%,233/806）和CRF08_BC（11.2%,90/806）为主。同性性传播者HIV-1亚型以CRF01_AE（53.3%,136/255）和CRF07_BC（32.2%,82/255）为主;异性性传播者HIV-1亚型以CRF01_AE（37.7%,203/539）、CRF07_BC（27.5%,148/539）和CRF08_BC（16.1%,87/539）为主。结论 2016-2018年台州市新报告HIV/AIDS在ART前HIV-1耐药率处于低流行状态,但存在上升趋势,需加强对HIV-1耐药型毒株的监测工作。     

云南省人类免疫缺陷病毒-1亚型分析

目的 研究云南省人类免疫缺陷病毒-1(HIV-1)亚型的地理及人群分布.方法 采集云南省2001-2006年1319名HIV-1感染者血液标本,分离血清后提取病毒RNA,用巢式PCR方法对gag基因片段进行扩增.扩增产物经基因序列测定,测序结果用进化树分析方法进行亚型分析.结果 成功获得了644名HIV感染者的基因序列,发现云南存在7种HIV-1亚型的流行,包括CRF08_BC、CRF07_BC、CRF07/08_BC,CRF01_AE、C、B'及URFB/C.C/CRF07_BC/CRF08_BC在各地均存在,而CRF01_AE主要存在于与缅甸接壤的德宏、保山、西双版纳和普洱.此外,还发现在感染C/CRF07_BC/CRF08_BC的人群中,61.6%(270/438)为注射吸毒感染,而感染CRF01_AE的人群中,注射吸毒传播仅占8.5%(15/177).结论 云南省存在7种HIV-1亚型流行,亚型分布与传播途径相关,并存在地域分布上的差异.     

宁夏HIV-1感染者原发性耐药及基因变异型研究

目的 掌握本地区HIV-1 病毒耐药毒株的流行与传播情况,为有效的抗病毒治疗提供参考依据。方法 2018年3月1日-6月30日在宁夏开展HIV/AIDS抗病毒治疗前HIV-1耐药的横断面调查。提取获得HIV-1 pol基因区序列,根据2015年WHO耐药监测指南的推荐标准,采用Shafer 的耐药性突变积分表耐药评分,分值≥15判为耐药。结果 调查68例HIV/AIDS,58例巢式PCR检测获得HIV-1病毒pol区基因序列。年龄中位数为36.5岁（IQR:30～50）;男性55例(94.8%),女性3例(5.2%), Shafer 的耐药性突变积分表耐药评分,7例判为耐药,耐药率12.1%。存在4种基因亚型,分别是B亚型、CRF01_AE 亚型、CRF07_BC亚型和CRF55_01B亚型。结论 宁夏HIV-1原发性耐药率处于较高水平,应继续加强艾滋病抗病毒治疗前耐药监测。     

2018年临沂市MSM人群新感染 HIV-1病毒基因亚型分析

目的了解临沂市MSM人群新感染HIV-1病毒基因的流行亚型。方法收集2018年1～4月临沂市新感染的经男男性行为传播的未经治疗的HIV-1阳性血浆样本,应用巢式-聚合酶链反应(Nested-PCR)扩增病毒基因的pol区片段,进行基因测序和亚型分析。结果收集到符合条件的样本31例,成功扩增出29例感染者病毒的有效序列,共检出4种基因亚型:CRF07_BC、CRF01_AE、C、CRF55_01B,优势毒株为CRF01_AE(62.07%)和CRF07_BC(20.69%)亚型。结论本时段内临沂市新确证的MSM感染者毒株以CRF01_AE亚型为主,监测临沂市MSM人群HIV-1感染者毒株亚型分子流行病学特征,对临沂市艾滋病防治非常必要。     

2018年珠海市HIV-1基因型及耐药分析

目的 了解2018年广东省珠海市新确诊且未接受抗病毒治疗的HIV-1抗体阳性病例不同感染途径病毒亚型分布和耐药情况。 方法 收集研究对象血浆标本207份,提取病毒RNA,采用巢氏RT-PCR扩增HIV -1多聚酶pol区,测序定型和耐药分析。 结果 在男男性行为者中流行基因型为CRF07_BC(43.3%)、CRF01_AE(36.1%)和CRF55_01B(13.4%);在异性性感染人群优势基因型为CRF01_AE(52.5%)、CRF07_BC(31.1%)和CRF08_BC(6.6%);在3例注射吸毒感染人群检出CRF01_AE;有1例血源性感染病例检测基因型为H亚型;在MSM和异性性感染人群产生低度耐药,低度耐药率分别为4.1%和4.9%;在注射吸毒和血源性传播感染人群未检出耐药病例。 结论 在经性传播途径感染HIV-1多种基因型共同流行,以CRF01_AE和CRF07_BC基因型为主;在四类人群未检出低度以上耐药病例,总体传播性耐药呈低度流行。     

2016—2019年深圳市龙岗区16～25岁HIV感染者病毒亚型及耐药特征分析

目的 了解深圳市龙岗区抗病毒治疗前HIV - 1感染者基因亚型和耐药株流行现况。方法 HIV/AIDS流行病学数据来源于全国艾滋病综合防治数据信息管理系统。采用描述性研究方法,对HIV感染者的流行特征进行统计分析,率和构成比的比较采用χ2检验或Fisher精确检验。收集2016—2019年新报告的16～25岁的HIV感染者血清样品,扩增HIV pol区全部蛋白酶基因和部分逆转录酶基因区域,测序后进行HIV - 1基因分型和耐药突变位点分析。结果 173份血清样品成功获得pol序列片段,男性占93.64%(162/173),单身占95.95%(166/173),外省户籍者占65.32%(112/173),同性性传播占67.63%(117/173)。HIV - 1亚型以CRF07_BC(43.35%)和CRF01_AE(32.95%)为主,其次为CRF55_01B(13.87%)、B(5.78%)和其他亚型(4.05%)。不同年份HIV - 1亚型分布差异有统计学意义(H = 9.456,P = 0.042)。总传播耐药率为5.78%（10/173）,非核苷类反转录酶抑制剂（NNRTIs）耐药率为4.62%(8/173),核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)为2.31%(4/173)。同性性传播的耐药率为7.69%(9/117),异性性传播为1.79%(1/56)。突变发生率为21.97%(38/173),未检测出PIs突变,主要耐药突变位点中5个针对NNRTIs和4个针对NRTIs。次要突变V179D/E高达17.34%(30/173),主要发生在CRF55_01B亚型,不同HIV - 1亚型检测出V179D/E突变差异有统计学意义(χ2 = 91.733,P＜0.001)。5例病例对一线治疗药物NNRTIs耐药,1例对NNRTIs和NRTIs双重耐药。结论 2016—2019年深圳市龙岗区HIV - 1亚型分布表现为以CRF07_BC和CRF01_AE为主,多个亚型共存的特点。HIV - 1感染者原发耐药率已达到中度水平,MSM人群中NNRTIs类药物的耐药需引起重视。应加强年轻的MSM人群的耐药监测。     

2013年江西省部分小于25岁HIV感染者亚型及原发耐药状况分析

目的了解2013年江西省部分年龄25岁的HIV感染者的亚型和原发耐药情况。方法随机抽取34份年龄25岁HIV感染者的血浆样本,提取病毒RNA,采用RT-PCR和巢式PCR扩增HIV pol区和gag区基因片段,利用pol区基因序列测定结果分析HIV感染者原发耐药情况,同时利用gag区基因序列测定结果分析HIV感染者的亚型分布状况。结果 34位25岁的HIV感染者的HIV亚型以CRF07_BC和CRF01_AE为主,分别占52.94%(18/34)和47.06%(16/34),且34份样本中未发现主要的监测性耐药突变。结论与2002年吸毒人群的HIV亚型流行状况相比,2013年江西省部分25岁HIV感染者的亚型分布发生了显著变化,为进一步掌握江西省HIV-1亚型流行状况,应对近年来发现的HIV感染者进行分子流行病学调查。耐药株在25岁的HIV感染者中的传播水平较低。     

东莞市HIV-1流行株pol基因序列特征和亚型分析

目的 了解东莞市人类免疫缺陷病毒Ⅰ型（human immunodeficiency virus type 1,HIV-1）感染者的流行病学特征及亚型的分布情况。方法 选取50例样本,收集流行病学资料,采用RT-PCR法扩增pol基因序列并测序,应用BioEdit、Genotyping和MEGA等生物学软件对pol基因进行序列分析。结果 收集的50例样本最终成功扩增得到32份样本的pol基因序列,其中CRF01_AE亚型12例;CRF_07BC亚型11例;B亚型7例;CRF55_01B亚型2例。各亚型基因离散率分别为CRF01_AE是（0.075±0.039）、CRF07_BC是（0.030±0.009）、B亚型是（0.073±0.022）,各亚型之间的基因离散率差异有统计学意义（F=41.055,P<0.001）,CRF01_AE亚型和B亚型内毒株间的基因离散率均大于与CRF07_BC亚型（P值均小于0.001）。结论 CRF01_AE和CRF_07BC亚型在东莞市HIV-1流行株中占优势,CRF07_BC亚型在各亚型之间的基因离散率最小。     

广西壮族自治区2020年新报告≥50岁男性HIV感染者的HIV-1基因亚型分布及其与首次CD4+T淋巴细胞的关联

  目的  分析2020年广西壮族自治区(简称广西)新报告50岁及以上男性(简称中老年男性)HIV感染者的HIV-1基因亚型构成特点及不同基因亚型与首次CD4+T淋巴细胞(简称CD4)计数的关联。  方法  以市为抽样单位,采用分层随机抽样法选取广西2020年新报告中老年男性HIV感染者为研究对象,对其血浆进行病毒RNA提取、逆转录扩增、测序、HIV-1基因亚型和亚簇判定,使用多因素模型评价CD4计数可能存在统计学关联的影响因素。  结果  共纳入分析606例HIV感染者,主要流行毒株有CRF01_AE、CRF07_BC及CRF08_BC三种,其构成比分别为57.6%(349/606)、17.2%(104/606)及22.1%(134/606),其首次CD4中位数分别为145(51, 271) 个/μL、212(110, 330) 个/μL及178(100, 307)个/μL。CRF01_AE感染者首次CD4值低于CRF07_BC感染者(Z=-3.363, P=0.002),也低于CRF08_BC感染者(Z=-2.983, P=0.009)。二元logistic回归分析模型分析显示,CRF01_AE为广西中老年人群CD4≤200个/μL的独立危险因素(aOR=1.453, 95% CI: 1.047~2.017)。  结论  CRF01_AE、CRF07_BC和CRF08_BC为广西2020年新报告中老年男性HIV感染者主要毒株,其构成以CRF01_AE为主,CRF01_AE为CD4≤200个/μL的独立危险因素,提示感染CRF01_AE毒株中老年男性的疾病进展较快,对广西艾滋病流行危害较大。     

云南省德宏州HIV-1新近感染者基因型耐药分析

目的 了解云南省德宏州HIV-1新近感染者中耐药的发生情况.方法 收集德宏州2006年7-12月期间所有的HIV-1阳性样品共1048份,使用BED捕获酶免疫试验进行新近感染检测,共检出新近感染样品101份;使用Bayer公司的TruGene方法进行基因型耐药检测,应用所有样品的序列构建系统进化树以确定样品的亚型.结果云南省德宏州HIV.1新近感染者巾的耐药发生率为6.25%(4/64),样品PR区中M36I/V、L63P和H69K等次要耐药突变出现的频率较高,分别占81.25%、70.31%和65.63%;HIV-1流行株以C/CRF07 BC/08_BC为主,占65.63%(42/64).结论德宏州HIV-1新近感染者中耐药的流行处于中等水平;有必要加强HIV-1的耐药监测.