成都地区诺如病毒基因型流行现状分析

目的了解成都地区诺如病毒各基因型的流行情况,探索疾病暴发增长的原因,为疾病预防控制工作提供科学的依据。方法选取2014-2016年间,采用荧光PCR方法检测阳性的部分诺如病毒标本,对衣壳蛋白VP1基因的ORF2区进行测序,构建进化树并进行同源性分析。结果 89份标本均为诺如病毒GII群,包括GII.1、GII.2、GII.3、GII.6、GII.13和GII.17 6种基因型。其中2014-2015年以GII.17型为主,从2016年起,GII.2型逐渐取代GII.17型成为了主要流行株。结论成都地区诺如病毒流行株的基因型变化显著,导致了疾病的暴发增长,增大了疾病防控的难度。需要持续开展诺如病毒的分子流行病学研究,以掌握病毒变异情况,预测疾病可能的流行趋势,提高疾病防控的预警能力。     

长沙地区诺如病毒基因型分析

目的确定长沙地区引起急性胃肠炎诺如病毒的类型。方法从128例腹泻患者粪便中,提取RNA。将RNA进行逆转录、扩增、测序,并通过构建基因进化树进行分析导致长沙地区患者感染的诺如病毒的主要种类。结果63个样品中含有诺如病毒,分别为GII-3、GII-4、GII-12三种类型,其中GII-4为主要病原体。结论在长沙地区,诺如病毒GII-4是引起病毒性胃肠炎的的主要致病株。GII-4基因进化快速,已成为全球范围内导致急性胃肠炎的最常见病毒株。     

北京地区流行性腮腺炎病毒流行株基因型分析

目的了解北京地区流行性腮腺炎病毒流行株基因型分布和变异情况。方法通过SH基因的序列分析，与其他基因型参考株进行同源性比较，构建亲缘进化树。结果17株病毒均属于F基因型，VAC-S79属于A基因型，各流行株间核苷酸最大差异为5．4％，与F基因型代表株Z77158（兰州）、Z77160（上海）核苷酸最大差异分别为4．8％和7．0％；与疫苗株的核苷酸差异为14．6％～15．9％。结论近2年北京地区流行的优势株为F基因型，未发现基因型间变异，但存在较大的型内差异，有变异增大趋势，需进行持续的分子流行病学监测。     

广东省2013－2017年3种基因型诺如病毒感染暴发疫情的流行特征

目的 分析2013－2017年广东省115起由GⅡ.2、GⅡ.17和GⅡ.4/Sydney 3种基因型引起的诺如病毒感染暴发的流行特征,为诺如病毒感染疫情的防控提供科学依据。方法 通过“突发公共卫生事件报告管理信息系统”收集2013年1月1日至2017年11月30日广东省报告的诺如病毒感染暴发疫情,采用RT-PCR方法对每起疫情的病例标本进行诺如病毒核酸检测,经基因测序后确定病毒基因型,对GⅡ.2、GⅡ.17和GⅡ.4/Sydney 3种基因型暴发疫情特点进行分析,采用直接标准化法计算病例呕吐和腹泻的比例。结果 广东省2013年1月1日至2017年11月30日共报告诺如病毒感染暴发疫情167起,GⅡ.2、GⅡ.17和GⅡ.4/Sydney 3种基因型引起115起。暴发场所中,GⅡ.2型为小学占39.68%（25/63）、托幼机构占28.57%（18/63）、中学占25.40%（16/63）、大学占6.35%（4/63）;GⅡ.17型为中学占41.03%（16/39）、其他社会单位占20.51%（8/39）、小学占15.38%（6/39）、大学占12.82%（5/39）、社区和托幼机构各占5.13%（2/39）;GⅡ.4/Sydney型为大学占53.85%（7/13）、托幼机构和其他社会单位各占15.38%（2/13）、小学和中学各占7.69%（1/13）。传播途径中,GⅡ.2型为接触传播占77.78%（49/63）、食源性传播占17.46%（11/63）;GⅡ.17型为食源性传播占53.85%（21/39）、接触传播占15.38%（6/39）、水源性传播占12.82%（5/39）;GⅡ.4/Sydney型为食源性传播占53.85%（7/13）、接触传播占38.46%（5/13）。临床表现中,GⅡ.2型的标准化呕吐比例为73.76%、腹泻比例为42.85%;GⅡ.17型的标准化呕吐比例为76.37%、腹泻比例为51.40%;GⅡ.4/Sydney型的标准化呕吐比例为54.10%、腹泻比例为55.95%。结论 GⅡ.2型主要涉及小学、托幼机构和中学,以接触传播为主;GⅡ.17型主要涉及中学和其他社会单位,以食源性传播为主;GⅡ.4/Sydney型主要涉及大学,食源性传播比例最高,接触传播也有较高比例。     

614例急性腹泻患者诺如病毒基因型分析

目的 分析急性腹泻患者中诺如病毒的感染情况及流行基因型.方法 采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)对2014年-2019年丽水市人民医院614例急性腹泻患者的粪便标本进行诺如病毒的检测.结果 诺如病毒的检出率为19.22％(118/614),其中性别差异无统计学意义(x2=1.408,P＞0.05);基因型以GⅡ型...     

2017—2018年成都地区诺如病毒聚集性疫情病原基因型分析

目的 分析2017—2018年成都地区诺如病毒聚集性疫情中病毒基因型构成情况,为疾病防控工作提供依据。方法 选取2017—2018年诺如病毒聚集性疫情标本,对病毒基因RdRp及VP1区片段测序,构建进化树并进行同源性分析。结果 测序结果显示,68份肛拭子标本中 16.2%(11/68)为GⅠ群(包括GⅠ.2、GⅠ.3和GⅠ.5型),83.8%(57/68)为GⅡ群(包括GⅡ.P16-GⅡ.2、GⅡ.P17-GⅡ.17、GⅡ.P8-GⅡ.8、GⅡ.P12-GⅡ.3、GⅡ.P7-GⅡ.6和GⅡ.P15-GⅡ.15型)。2017年以GⅡ.P16-GⅡ.2型为主;2018年GⅠ群及GⅡ.P17-GⅡ.17型均显著增加,同时检出其他4种基因型。各基因型病毒变异不明显,核苷酸同源性为93.4%~100%。结论 2018年成都地区诺如病毒流行株基因型构成较2017年复杂,可能与聚集性疫情增长有关。应持续监测诺如病毒基因型流行情况,及时掌握病毒变异动态,以期提高疾病防控的预警能力。     

2011年-2013年珠海市诺如病毒胃肠炎暴发的病毒分子流行病学分析

目的研究珠海市诺如病毒胃肠炎暴发的分子流行病学特征及流行株基因型的演化情况。方法收集珠海市2011年-2013年28起胃肠炎暴发疫情患者肛拭子标本619份,采用荧光逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)定性检测诺如病毒RNA,按要求选取部分诺如病毒RNA阳性标本扩增诺如病毒衣壳蛋白,进行测序及同源性分析。结果其中17起疫情由诺如病毒感染引发,检测阳性率为19.55%(121/619);选取诺如病毒RNA阳性标本57份进行测序分型,成功分型的标本为47份,全部为No V GⅡ,14株为GⅡ.4型(其中5株为GⅡ.4 2006b,另外9株为GⅡ.4/Sydney_2012);12株属于GⅡ.3型;3株属于GⅡ.5型;18株属于GⅡ.6型。结论珠海市诺如病毒引起的食物中毒流行株属于GⅡ组,但基因亚型存在多样性,并且在短时间内造成多处暴发疫情,提示该状况将是今后防控监测的重点。     

上海市2013-2018年成年人诺如病毒引发感染性腹泻的流行特征研究

目的 了解上海市成年人感染性腹泻患者中诺如病毒的流行特征,为上海市诺如病毒感染性腹泻防控策略的制定提供科学依据。方法 在上海市22家监测点医院的肠道门诊中开展腹泻症状监测,收集患者人口学信息、流行病学资料和主要症状,同时采集患者粪便标本,送至医院所在区CDC检测诺如病毒,分析2013-2018年不同人群和季节的诺如病毒检出率,利用logistic回归分析探讨人群感染诺如病毒的影响因素。结果 在12 083例感染性腹泻患者中,诺如病毒阳性检出率为19.28%（2 330/12 083）,主要型别为GⅡ群（83.63%）。其中男性检出率（20.78%）高于女性（17.73%）,30~44岁组人群诺如病毒检出率最高（21.51%）,2015年检出率最高（23.60%）,以上差异均有统计学意义（P<0.05）。诺如病毒感染以10月至次年4月为高发季节。诺如病毒阳性患者以水样便居多（75.94%）,35.84%患者伴有呕吐症状。多因素logistic回归分析显示,男性、30~44岁组、干部职员、冬季及外出史是感染诺如病毒的危险因素。结论 上海市成年人腹泻患者诺如病毒感染率高,引起的感染性腹泻全年均可发生,冬、春季高发,在诺如病毒引发的感染性腹泻的防控工作中应针对不同年龄、性别、季节采取特异性防控措施。     

秦皇岛市海产品贝类中诺如病毒监测分析

目的了解秦皇岛市海产品中血蚶、牡蛎、海虹受诺如病毒污染情况,检测3种贝类带毒率,对检测出的诺如病毒进行GⅠ和GⅡ分型。建立Mengo病毒作为阳性质控检测病毒回收率方法。方法蛋白酶水解法富集病毒,全自动核酸提取仪提取病毒RNA,实时荧光定量PCR方法对诺如病毒进行检测和分型,用Mengo病毒做标准曲线,检测诺如病毒回收率。结果 Mengo病毒回收率均1%符合富集要求,检测牡蛎、海虹、血蚶各20份,检出诺如病毒阳性样本11份,其中GⅠ型1株,GⅡ型10株,总检出率为18.33%。牡蛎、血蚶均检出GⅡ型毒株,检出率分别为30.00%、5.00%,海虹检出GⅠ型和GⅡ型毒株,检出率分别为5.00%和15.00%。结论 3种贝类产品均受到诺如病毒不同程度的污染,GⅡ毒株含量较多,牡蚶和海虹受到污染较为严重。     

2018年南宁市诺如病毒聚集性疫情和暴发疫情流行特征分析

目的分析2018年南宁市诺如病毒聚集性疫情和暴发疫情的流行病学特征,探讨防控策略。方法对报告的9起疫情的三间分布、临床表现和传播途径进行描述性分析。选取具有代表性的8起疫情,每起疫情随机抽取2份阳性标本进行基因测序。结果 2018年南宁市共报告诺如病毒疫情9起,涉及病例145例,总罹患率为3.45%。时间分布上主要集中于夏秋季(9—10月),占全年疫情总数的66.67%(6/9);空间分布上,所有疫情均发生在教育机构,其中托幼机构占比最高(6起,66.67%),其次是小学(2起,22.22%);人群分布上,男女比为1.01∶1,以2.5～6岁幼儿为主(占55.86%)。传播途径主要为人传人(占66.67%),其次为食物传播(33.33%)。1起疫情为GⅠ和GⅡ组病毒混合感染所致,8起为GⅡ组病毒感染所致。结论引起南宁市诺如病毒聚集和暴发疫情的主要病原体是GⅡ组诺如病毒,夏秋季是高发季节,托幼机构和小学是高发场所,人传人是主要传播途径。应加强对高发场所重点人员的培训,加强校外培训机构和午托机构的监管。     

国内诺如病毒胃肠炎暴发流行特征分析

目的研究诺如病毒胃肠炎暴发在国内的流行现状。方法运用系统综述的方法在生物医学文献数据库、万方数据库、维普资讯数据库、CNKI数据库和PubMed数据库中检索关于国内诺如病毒胃肠炎暴发的文献。结果从地点分布来看,诺如病毒胃肠炎暴发主要集中在学校和农村,其次是医院、监狱、社区和公司;从时间分布来说,2004-2009年的数据显示,诺如病毒胃肠炎暴发每月均有发生,但主要集中在1-3月份和11-12月份两个阶段;从人群分布来看,诺如病毒胃肠炎暴发主要发生在中、小学生和青壮年人群。结论诺如病毒胃肠炎主要暴发于学校和农村,以中、小学生和青壮年人群为主,而且每月都有发生,时间主要集中在11月份至次年3月份,这些可能与卫生条件落后、地域广、跨越纬度多有关系。     

2016 - 2018年河南省食源性诺如病毒监测情况分析

目的 了解河南省食源性诺如病毒的致病型和分布情况,为食源性疾病的防控提供参考数据。方法 选择11家哨点医院,由门诊医生采集符合病例定义的患者信息和生物标本进行诺如病毒检测,确定致病型,同时填写上报病例信息。结果 5 412份粪便标本有273份阳性,阳性检出率5.04%（273/5 412）,其中有14份标本是Ⅰ型和Ⅱ型诺如病毒的混合感染。273例阳性病例中,小于1岁,1～5岁的年龄段阳性病例分别有132例和105例,所占比例较高（48.35%和38.46%）。暴露食品方面,由乳与乳制品、粮食类及其制品引发的病例分别为63例和56例,所占比例较大。结论 河南省食源性疾病诺如病毒基因型以Ⅱ型为主,而且有Ⅰ+Ⅱ型的混合感染病例。诺如病毒感染人群以婴幼儿和儿童为主,夏秋季多发,乳与乳制品、粮食类及其制品引发病例较多。需要加强日常监管和公众科普,降低食品安全风险。     

2000年东莞市麻疹病毒流行株基因型分析

目的 了解东莞市麻疹病毒（measles virus,MV)流行株的基因型。方法 2000年4-7月间东莞市发生有55例患者的麻疹流行,采用逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）方法直接检测麻疹病人急性期唾液中的麻疹病毒核糖核酸（RNA）的N基因和M基因,对任意选取的5份RT-PCR阳性标本和疫苗株沪-191的N基因扩增片段进行核酸序列测定,并进行序列系统树分析。结果 用RT-PCR方法直接检测的阳性率为87.3%;用血清抗-MV-IgM ELISA方法检测的阳性率为70.9%,抗MV-IgM阴性的病人唾液中有68.8%的标本MV-RNA阳性。序列分析结果表明此流行株的基因型与世界麻疹病毒流行株不同,差异为1.4%-11.7%,可归属于H基因型。结论 2000年东莞市麻疹病毒流行核酸序列完全相同,为H基因型,说明本次流行的麻疹病毒具有同源性,来源于同一传染源。     

丽水地区2017年-2019年诺如病毒感染性腹泻监测分析

目的 了解2017年-2019年丽水地区腹泻患者诺如病毒感染的流行病学特征,为丽水地区的诺如病毒的预防控制提供科学依据.方法 采用实时荧光定量RT-PCR检测2017年-2019年丽水市人民医院1 358例腹泻患者粪便标本中诺如病毒GⅠ和GⅡ基因型.结果 1 352份标本中,诺如病毒的阳性率为21.50％(292/1 ...     

2017—2018年汉中市食源性疾病监测哨点诺如病毒流行特征

目的分析汉中市食源性疾病监测哨点诺如病毒的流行特征,为食源性疾病防控提供科学依据。方法 2017年11月—2018年12月对汉中市2家食源性疾病监测哨点医院采集的293份标本进行诺如病毒荧光定量聚合酶链式反应(PCR)检测。结果 293份标本诺如病毒核酸阳性79份,阳性率为26.96%,GⅠ型和GⅡ型阳性率分别为2.05%和24.91%。女性阳性率(25.56%)低于男性(27.50%),但差异无统计学意义(P0.05)。第1季度阳性率最高,为55.10%;20～30岁青少年阳性率最高,为36.36%。可疑食品中,食用水果类及其制品(包括果脯和蜜饯)、混合食品和乳与乳制品的病例阳性率较高,分别为34.38%、32.00%和30.43%。可疑进食场所中,在学校食堂、街头食品、单位食堂场所就餐者阳性率较高,分别为50.00%、37.50%和33.33%。结论汉中市食源性疾病中存在GⅠ型和GⅡ型诺如病毒感染,以GⅡ型感染为主。为预防食源性疾病的发生,相关部门需要加强食品卫生的监督、管理工作。     

2013 - 2014年广西诺如病毒腹泻暴发疫情特征分析

目的 分析广西壮族自治区诺如病毒腹泻暴发疫情的流行特征及影响因素,为疾病防控提供科学依据。方法 采用现场流行病学调查方法收集2013年1月至2014年12月广西地区诺如病毒腹泻疫情报告及个案资料,并进行整理分析。结果 2013年1月至2014年12月,广西共报告6起诺如病毒腹泻疫情,累计病例257例,99.61%为临床诊断病例,无死亡病例。疫情暴发地点主要集中在学校;病例时间分布有明显季节性,主要集中在春秋季的3、10和11月;病例年龄主要为1～10岁(29.13%)和11～20岁(54.72%);可能的传播途径包括经水、食物、人传人接触传播等多途径。共采集87份病例、48份食堂从业人员肛拭子,检出诺如病毒RNA阳性数分别为44份和4份,检出率分别为50.57% 和8.33%。结论 广西地区诺如病毒暴发疫情主要发生在人口密集的学校,应重点针对中小学校, 开展健康宣教,加强个人卫生习惯,同时加强饮用水卫生、食品卫生等监测工作, 减少诺如病毒腹泻暴发疫情的发生。     

无锡地区2013年腹泻人群诺如病毒分子流行病学特征分析

目的了解无锡市诺如病毒流行特征及主要流行株的基因型。方法采集2013年无锡市哨点医院监测的409份急性腹泻者的粪便标本和9起诺如病毒暴发疫情的病例标本,采用实时荧光定量PCR检测诺如病毒GⅠ和GⅡ基因,对GⅡ基因阳性标本进一步进行扩增及测序分型。结果哨点监测病例诺如病毒阳性率为9.78%(40/409)。所测36株诺如病毒共有5种基因型,依次为GⅡ.Pe/GⅡ.4型28株(77.78%)、GⅡ.P12/GⅡ.3型4株(11.11%)、GⅡ.P16/GⅡ.13型2株(5.56%)、GⅡ.P7/GⅡ.6和GⅡ.16各1株(2.78%)。2013年暴发疫情病例所测35株诺如病毒共4种基因型,依次为28株GⅡ.Pe/GⅡ.4型(80.0%)、4株GⅡ.7(11.43%)、3株GⅡ.12/GⅡ.3(8.57%)。结论诺如病毒是无锡地区非细菌性腹泻最常见的病原体,无锡地区诺如病毒流行株具有多种基因型,存在不同基因型间重组株。GⅡ.Pe/GⅡ.4型(Sydney_2012)为2013年无锡地区绝对优势流行株。     

甘肃省食源性诺如病毒流行特征及影响因素分析

目的 研究甘肃省食源性疾病就诊患者中诺如病毒感染的流行病学特征,了解潜在的影响因素分布。方法 选择10家哨点医院,由门诊医生采集符合病例定义的患者信息和生物标本,进行诺如病毒检测,患者信息和生物标本检测结果录入食源性疾病监测报告系统。结果 甘肃省诺如病毒阳性率21.44%,全年有2月和7月2个高峰期, 1～2岁幼儿患者阳性率最高（27.09%）,报告暴露食品为水果类及其制品（34.22%）、肉与肉制品（25.81%）、蔬菜类及其制品（24.82%）的患者中诺如病毒阳性率显著高于其他食品。报告定型包装（19.23%）和散装食品（33.22%）者阳性率高于其他包装方式。结论 甘肃省诺如病毒处于相对较高的流行水平,低年龄段幼儿为高危人群,全年有2个流行高峰期,不同种类食品和食品不同的包装方式可能引起诺如病毒感染风险差异。