人端粒酶逆转录酶基因RNAi表达载体的构建、鉴定

目的 构建端粒酶逆转录酶（hTERT）基因的RNA干扰（RNAi）表达载体。方法 化学合成能编码针对hTERT基因的短发夹RNA（shRNA）序列的寡核苷酸，退火处理后克隆到pSilencer1．0-U6 shRNA表达载体的U6RNA聚合酶Ⅲ（Pol Ⅲ）启动子的下游，构建重组RNAi质粒pSliencer-hTERT。结果 经酶切电泳及测序分析证实，目的序列成功插入到预计位点。结论 已成功构建pSliencer-hTERT载体，为进一步研究其对端粒酶活性的抑制作用打下基础。     

Inhibition of RAW264.7 Macrophage Inflammatory Cytokines Release by Small Haparin RNAi Targeting TLR4

In order to construct an expression vector carrying small hairpin (sh) RNA (shRNA) for toll-like receptor 4 mRNA and a reporter gene of enhanced green fluorescence protein (EGFP) and study the inhibition of cytokine release by RAW264.7 cell induced by lipopolysaccharide (LPS) stimulation through transfection and expression of shRNA targeting TLR4 gene via the RNAi mechanism, the reporter gene plasmid pEGFP-C1 (4.7 kb) and psiRNA-hHlneo (2979 bp) were used. The H1 promotor and double Bbs I restrict endoenzyme site were cloned from plasmid psiRNA-hH1neo and reconstructed them into plasmid pEGFP-C1 in the Mlu I restrict endoenzymic site, forming plasmid pEGFP-H1/siRNA, which contained Bbs site and reporter EGFP gene. Then an oligonuclear hairpin sequence targeting TLR4 gene was designed by internet tool and inserted into the plasmid pEGFP-H1/siRNA forming plasmid pEGFP-H1/TLR4-siRNA. After transfection of pEGFP-H1/TLR4-siRNA into RAW264.7 cells, tumor necrosis factor-alpha (TNF-α) release by the cells after stimulation by LPS was detected. The results showed that the constructed pEGFP-H1/TLR4-siRNA carrying hairpin RNA for TLR4 gene and reporter EGFP gene were proven to be right by restriction endonuclease analysis. The expression of EGFP gene was (50.37±8.23) % and after transfection of the plasmid pEGFP-H1/ TLR4-siRNA the level of TNF-αreleased by RAW264.7 cell was down regulated. It was concluded that shRNA targeting TLR4 gene could inhibit the TNF-αrelease by RAW264.7 cells evoked by LPS.     

抑制表皮生长因子受体基因表达的pSIREN-Shuttle RNAi表达载体的构建

目的:构建抑制表皮生长因子受体(EGFR)基因表达的RNA干扰(RNAi)质粒表达载体pSI-REN-Shuttle-EGFR。方法:化学合成3条编码短发夹RNA序列的、特异靶向EGFR基因的寡核苷酸链,各69个碱基,退火,克隆到RNAi-Ready pSIREN-Shuttle载体的人源U6启动子的下游,重组构建RNAi质粒,3种载体转染人鼻咽癌细胞株(CNE),用RT-PCR分析pSIREN-Shuttle-EGFR载体对EGFR基因的mRNA表达抑制效果。结果:重组构建的pSIREN-Shuttle-EGFR载体经插入基因片段序列分析,表明69个碱基成功插入到预计位点,并且序列完全一致。CNE细胞EGFR基因的mRNA被明显抑制。结论:RNAi质粒表达载体介导对EGFR基因的RNA干扰可能是鼻咽癌干预治疗的一种有效手段。     

靶向C基因的shRNA抗乙型肝炎病毒在BHK-21细胞中的复制与表达

目的 研究靶向乙型肝炎病毒(HBV)C基因的shRNA(shRNA)诱导RNAi(RNAi)在BHK-21细胞中抑制HBV的复制与表达及抗病毒效果.方法 根据成都军区昆明总医院传染病中心克隆测序的中国56个民族CHB患者HBV基因组(基因型B属ayw1亚型)已在GenBank登录注册:CYN/2002和CYN/2000(GenBank登录号AY517488,AY517489,等),为了监测siRNA功能提供报告基因系统,将HBV C基因PCR产物克隆构建成报告基因表达载体pC-EGFP-N1和载体pCDNA3.1B(-),设计并构建两个靶向同源(CYN/2002和CYN/2000)毒株HBV C基因的长24核苷酸(nt)的shRNA表达质粒(S1和S2),随机设计的用于对照的非同源长24 nt的shRNA表达质粒S3,将其克隆到载体pU6上,构建成表达目的 shRNA重组表达载体,并与pC-EGFP-N1共转染BHK-21细胞.首先在BHK-21细胞中使用BH-2型荧光显微镜观察和FACS-440型流式细胞仪检测绿色荧光蛋白(EGFP)表达细胞数量,评估该shRNA表达质粒在转染后不同时间对C基因/EGFP融合报告基因表达的抑制作用,接着在BHK-21细胞中通过实时荧光定量PCR(RT-PCR)进一步检验了shRNA抗病毒效果.结果 通过BH-2型荧光显微镜观察和FACS-440型流式细胞仪检测,发现在shRNA表达质粒和pC-EGFP-N1共转染BHK-21细胞24 h后,与pC-EGFP-N1或pEGFP-N1单质粒转染相比,S1或S2的共转染组、S1+S2的共转染组使EGFP的表达水平降低了90%,而对照质粒S3或pU6共转染组无显著降低EGFP的表达水平,差异有统计学意义(P＜0.01);应用RT-PCR检测C基因mRNA和EGFP基因mRNA的表达量,结果与BH-2型荧光显微镜和FACS-440型流式细胞仪检测结果相吻合,差异有统计学意义(P＜0.01).进一步证实了RNAi抗病毒效果,抗病毒效应持续时间超过48 h.结果 发现,创建的靶向C基因的shRNA能够有效特异地抗C-EGFP基因在BHK-21细胞中的复制与表达.结论 靶向C基因的RNAi技术能够有效特异地抗HBV在BHK-21细胞中的复制与表达.RNAi可能成为抗重大传染病HBV/HCV安全有效的应急疫苗.     

质粒介导的RNA干扰对AD293细胞中HBcAg表达的抑制作用

目的:研究质粒介导的RNA干扰效应对HBcAg基因表达的抑制作用.方法:设计并构建针对HBcAg基因的小发夹RNA表达载体,将构建好的shRNA表达载体和HBcAg-增强型绿荧光蛋白融合蛋白表达载体共转染人胚肾细胞株AD293,以空载体组以及针对无关序列的shRNA表达载体组为阴性对照,流式细胞术和实时荧光定量PCR法检测RNAi的抑制效果.结果:构建的特异性shRNA表达载体可以抑制HBcAg基因在AD293细胞中的表达,流式细胞仪检测抑制率可达76%,实时荧光定量PCR 法检测HBcAg基因的mRNA,抑制率可达58.6%.结论:质粒介导的RNAi可以有效抑制HBcAg基因的表达,为利用RNAi进行抗乙型肝炎病毒复制研究提供了一个可供选择的方法.     

SARS病毒S蛋白的原核表达与DNA疫苗的构建

目的探讨SARS冠状病毒的刺突(spike，S)蛋白的免疫学特性，以及S蛋白作为SARS—CoV病毒疫苗组分的可行性。方法将S蛋白基因分段克隆入原核表达载体pET—15b，并在大肠杆菌中表达，经过亲和层析得到纯化的重组蛋白rSa和rSb；将全长S基因克隆入真核分泌表达载体pSecTagB，得到重组DNA疫苗pSecS，免疫小鼠，得到SAS—CoV S蛋白抗血清。然后用纯化的重组蛋白rSa和rSb建立的SARS—CoV S抗体ELISA检测技术研究所构建的S-DNA疫苗的免疫效果。结果分段的重组蛋白rSa和rSb在大肠杆菌中均以可溶性形式得到高效表达，并能与SARS确诊病人血清以及pSecS免疫鼠血清发生特异性抗原抗体反应，原核表达的重组分段S蛋白具有SARS—CoV S蛋白相似的抗原性。结论原核表达的两段重组S蛋白有可能作为抗原组分用于临床SARS—CoV检测中；所构建的SARS—CoV的S基因核酸疫苗能在小鼠体内产生特异性抗体，这为进一步SARS DNA疫苗的研制提供一定的借鉴作用。     

靶向呼吸道合胞病毒M2基因pshRNA载体质粒的构建及意义

目的：构建针对呼吸道合胞病毒（RSV）M2基因mRNA的短发卡结构状RNA（shRNA）重组载体质粒，为利用RNA干扰技术抗RSV感染的深入研究奠定基础；方法：按shRNA设计原则，选择RSV—M2基因作为靶基因，设计19bp长的能产生短发卡结构的两段DNA反向重复序列，中间以9bp序列间隔，经退火形成互补双链，克隆至转录载体pgenesil-1上，重组质粒经酶切和测序鉴定，然后将构建成功的重组质粒转染HEP2细胞，荧光显微镜下观察绿色荧光细胞发生率以评估转染效率。结果：将设计合成的DNA片段成功克隆至载体上，经酶切及序列鉴定为目的序列，并且荧光显微镜下观察细胞有较多的绿色荧光蛋白表达。结论：成功构建了针对RSVM2基因mRNA的shRNA重组载体质粒，可利用重组质粒进一步研究其对RSV感染的抑制，从而为抑制RSV感染寻找新的基因治疗手段。     

mTOR反义RNA真核表达载体的构建及其在血管平滑肌细胞中的表达

目的：构建哺乳类动物雷帕霉素靶蛋白（mTOR）的反义RNA真核表达载体，观察其对血管平滑肌细胞（VSNC）功能的影响。方法：提取人VSMC总RNA，反转录-聚合酶链反应（RT-PCR）扩增mTOR基因cDNA序列，经pGEM-T载体克隆后双酶切，将cDNA序列反向插入绿色荧光蛋白表达载体pEGP-C1，构建mTOR基因反义RNA真核表达载体。转染VSMC，采用Western blot法检验反义表达载体对mTOR蛋白表达的影响，流式细胞仪检测细胞周期的变化。结果：经RT-PCR获得664bp产物，T载体克隆后，经DNA测序，确定该片段为mTOR基因cDNA，进而构建反义RNA真核表达载体pEGFP-C1-mTOR，测序证明序列正确后转染VSMC，证实其能够显著抑制mTOR蛋白产物表达，VSMC的分裂、增殖过程受阻。结论：已经成功构建mTOR基因的反义RNA真核表达载体。     

基因沉默Delta N p63对膀胱肿瘤生长抑制和CDK4的影响

目的采用RNA干扰(RNAi)方法,研究当Delta N p63基因的表达沉默后,对人膀胱癌裸鼠皮下移植模型肿瘤的抑制作用,并检测对细胞周期素依赖性激酶4(CDK4)基因和蛋白表达的影响,进一步揭示Delta N p63基因在膀胱肿瘤中的作用机制。方法首先构建Delta N p63基因特异性短发卡RNA(shRNA)表达质粒,将表达质粒转染至裸鼠皮下移植模型肿瘤瘤体内,比较各组肿瘤体积,光镜下检测肿瘤组织病理学改变,RT-PCR方法检测CKD4基因的表达变化,Western blot和SP免疫组化检测CKD4蛋白表达变化。结果质粒注射到肿瘤8周后,治疗组、对照组与生理盐水组比较,治疗组与生理盐水组瘤体积比较差异有统计学意义(P<0.01),抑瘤率74.62%。光镜结果显示治疗组肿瘤生长受到明显抑制,细胞核分裂象明显减少,可见坏死和凋亡肿瘤细胞、局部炎症细胞浸润。RT-PCR结果显示治疗组CKD4基因表达降低,蛋白检测结果显示CKD4蛋白表达下降。结论沉默Delta N p63表达后,可显著抑制人膀胱癌裸鼠肿瘤模型中肿瘤的生长,Delta N p63可能通过抑制CKD4的表达而抑制肿瘤的细胞生长。     

应用RNA干扰技术抑制乙型肝炎病毒抗原表达的实验研究

目的 构建针对乙型肝炎病毒(HBV)核心区的siRNA表达载体pSIHBV／C,观察其对HBV复制和表达的影响。方法 将构建成功的pSIHBV／C与1．3倍HBV真核表达质粒pHBV1．3共转染HepG2细胞,转染后24、48、72h,用Abbott试剂检测细胞上清中HBsAg和HBeAg,并用免疫荧光染色法观察细胞内病毒核心抗原和表面抗原的表达。结果 成功构建了针对HBV核心区的siRNA表达载体pSIHBV／C,并发现它能明显抑制HBsAg和HBeAg的分泌,转染后第2天抑制率达高峰,分别为92％、85％,而随机序列的siRNA无此作用。免疫荧光染色结果也证实转染24b后,随pSIHBV／C比例的升高,其对HBV抗原表达的抑制作用也随之增加,当pSIRNA／C与pHBV1．3比例为1：20时,pSIHBV／C对细胞内HBsAg和HBcAg表达的抑制作用最强。结论 乙型肝炎病毒核心区的siRNA具有显著和特异的抗HBV复制和表达的作用。     

重组质粒pEGFP-C3-caveolin-1构建及在小鼠足细胞中的表达

目的:构建真核表达重组质粒pEGFP-C3-caveolin-1及稳定转染小鼠足细胞.方法:用RT-PCR法扩增小鼠肾脏caveolin-1的开放阅读框(ORF),构建TA克隆,用EcoR Ⅰ、BamH Ⅰ酶切位点亚克隆至真核表达质粒pEGFP-C3中,酶切和测序鉴定.脂质体转染法转染小鼠足细胞,荧光显微镜下动态观察转...     

Nogo-66受体RNA干扰质粒的构建及其干扰效率鉴定

目的 构建及筛选高效率针对Nogo-66受体(Nogo-66 receptor, NgR) 进行RNA干扰(RNAi)的质粒.方法 RT-PCR克隆NgR,插入表达质粒中,构建NgR-GFP融合蛋白表达质粒.根据NgR序列,设计4对针对NgR mRNA进行RNAi的寡核苷酸.退火后,插入短发夹RNA(short hairpin RNA, shRNA)表达质粒中,构建shRNA表达质粒.将NgR-GFP融合蛋白表达质粒与shRNA表达质粒共转染AAV-293细胞.通过对GFP表达量的观察及Western blotting定量检测NgR-GFP融合蛋白表达量,鉴定shRNA表达质粒对NgR的干扰效率.结果 针对NgR进行RNAi的4个序列中,有1个序列的干扰效率大于90%以上.结论 成功构建了1个针对NgR的高效RNAi表达质粒.     

RT-PCR对SARS患者粪便SARS冠状病毒RNA的连续测定及其临床意义

目的采用RT-PCR方法,观察SARS冠状病毒(SARS-associatedcoronavirus,SARS-CoV)在SARS患者粪便中的排出状况。方法以2003年5月16日至23日在本院住院的46例临床确诊SARS患者为研究对象,连续留取粪便标本共103份,提取RNA后采用14对SARS-CoV特异性引物,对每份标本同时进行7次套式RT-PCR扩增,只要有1次RT-PCR结果阳性即判定该标本为阳性。结果在46例患者中,有17例(37.0%)患者的粪便SARS-CoV套式RT-PCR扩增结果为阴性,29例(63.0%)为阳性。粪便SARS-CoVRT-PCR结果阳性时SARS患者的病程为(31.76±10.78)d(12～64d),其中最长1例为64d,系2次连续留取的粪便标本均为阳性、每次标本用2个不同引物RT-PCR扩增结果均为阳性。结论SARS-CoV在患者粪便中排出的时间可长达发病后64d,平均32d,对SARS患者恢复期的消毒隔离应该予以足够的重视。     

短发夹RNA靶向抑制EGFR基因对人卵巢癌Skov-3细胞凋亡和细胞周期的影响

目的 探讨RNA干扰(RNAi)对卵巢癌细胞表皮生长因子受体(EFR)基因表达的影响及其效应.方法 体外合成EFR的DNA模板序列和pSilencer 2.1-U6neo质粒构建编码shRNA的表达载体,应用脂质体Lipofectamine 2000将其转染到人卵巢癌Sov-3细胞,采用半定量RT-PCR、免疫细胞化学技术检测转染前后Sov-3细胞EFR基因的变化;采用AnnexinV/PI双染色标记的流式细胞仪检测siRNA诱导的细胞凋亡,PI染色检测细胞周期阻滞.结果 成功构建pSilencer-EFR短发卡状siRNA真核表达载体;靶向EFR的序列特异性的siRNA可以有效抑制Sov-3细胞EFR基因的表达;流式细胞分析显示,Sov-3细胞凋亡率明显增加,细胞周期出现明显的0/1期阻滞.结论 RNAi沉默EFR表达可以诱导卵巢癌Sov-3细胞凋亡,并使卵巢癌Sov-3细胞停滞在0/1期,RNAi可作为研究卵巢癌发生发展机制和基因治疗的有效工具.     

多药耐药基因RNAi重组腺病毒构建

目的 构建抑制多药耐药基因(MDR1)表达的RNAi腺病毒载体,探讨基因治疗改善癫痫多重耐药现象的可行性.方法 根据大鼠MDR1基因序列,选择3个19nt的靶序列,设计并合成3对66nt含编码短发夹RNA(shRNA)序列的寡核苷酸,构建pSIREN-shuttle-MDR1重组质粒,测序分析正确后转染通过马桑内酯诱导的已表达多重耐药蛋白的大鼠星形胶质细胞,通过RT-PCR法测定多药耐药蛋白(P-gp)表达量,判断所设计的3条DNA序列对于P-gp表达的抑制作用.选择抑制效率最高的1个重组质粒,将其中的MDR1 shRNA表达结构酶切后插入腺病毒载体pAdeno-X,构建的pAdeno-MDR1经Pac1酶切后与脂质体共转染HEK293细胞进行病毒包装扩增纯化,所得病毒液作酶切电泳及测序分析正确后再转染大鼠星形胶质细胞模型.RT-PCR及免疫组织化学法分别测转染前后星形胶质细胞模型的MDR1及P-gp表达量.结果 重组质粒及pAdeno-MDR1病毒经PCR、酶切、测序分析证实构建正确.病毒滴度为6×109 pfu/mL.重组腺病毒转染星形胶质细胞后MDR1及P-gp表达量减少,干扰效率接近100%.结论 成功构建针对大鼠MDR1基因的RNAi腺病毒载体,并通过体外实验证实其对大鼠MDR1基因的高效抑制作用.为进一步探索难治性癫痫的多药耐药机制和基因治疗奠定了基础.     

慢病毒携带shRNA对内皮细胞组织因子表达的抑制作用

目的:构建RNA干扰慢病毒栽体,研究慢病毒携带的短发夹干扰RNA(short hairpin RNA,shRNA)对内皮细胞中组织因子(tissue factor,TF)表达的抑制作用.方法:将靶向人TF基因的2条shRNA表达序列克隆到慢病毒栽体pENTRTM/U6的黏性末端,测序鉴定后,与目标栽体pLenti6/BLOCKiTTM-DEST vector进行位点特异性重组,再测序;经脂质体导入293 FT细胞,包装成慢病毒,收集病毒上清并测定病毒滴度.RT-PCR和ELISA检测干扰后内皮细胞TF的表达.结果:将目的序列成功连接到裁体上,并经测序分析证实载体构建成功;在293FT细胞中进行慢病毒包装,收集上清并检测病毒滴度为5×105/TU.RT-PCR和ELISA检测结果证实构建的携带shRNA的慢病毒可显著抑制内皮细胞TF的表达.结论:成功构建了携带人TF基因的RNAi慢病毒载体,慢病毒携带的短发夹干扰RNA能干扰内皮细胞中TF的表达,可为血栓栓塞性疾病的防治提供一种有效的方法.     

用于分子影像学研究的双融合报告基因表达载体的构建及功能验证

目的 构建增强型绿色荧光蛋白(EGFP)和人转铁蛋白受体(TfR)双融合报告基因表达载体,并进行功能鉴定,为活体光学/磁共振双模式成像提供实验基础.方法 将TfR基因克隆到pEGFP-C1载体,构建重组pEGFP-C1 -TfR质粒.pEGFP-C1 -TfR质粒转染293T细胞48 h后,通过荧光显微镜观察EGFP的表达情况;通过RT-PCR检测TfR的表达情况;通过激光共聚焦扫描显微镜检测EGFP-TfR融合蛋白的亚细胞定位;通过Tf探针摄取和竞争实验检测EGFP-TfR融合蛋白的功能.结果 测序结果显示,EGFP-TfR基因序列正确,无突变或缺失.重组质粒转染293T细胞后,荧光显微镜下观察到EGFP的表达;RT-PCR结果显示TfR高效表达;EGFP-TfR融合蛋白主要位于细胞膜,并能够特异介导Tf的内吞.结论 EGFP-TfR双融合报告基因表达载体构建成功,并且能够高效表达发挥各自的功能,可以用于后续的活体光学/磁共振双模式成像.