临床微生物快速检验技术研究进展

目前感染性疾病是危害人类健康的重大隐患,尤其是对第三世界国家更是一严重的挑战.随着抗生素的滥用.导致了出现大量严重的耐药菌株,加上新的病原微生物的出现,给临床诊断和治疗带来了极大的困扰.严峻的现实给病原微生物的检测和诊断提出了更高的要求.世界卫生组织(WHO)对临床微生物实验室提出:临床微生物实验室尽可能把目标集中在快速诊断方面.传统的微生物检验法的最大弱点是慢,难以实现快速诊断与治疗,已远远不能满足对各种病原微生物的诊断以及流行病学的研究.实现更准确、更快速地检出与监测病原体成为目前临床微生物检验亟待解决的问题.随着各种生物学技术的发展和相关学科的不断发展,特别是免疫学、生物化学、分子生物学及计算机技术的不断发展,微生物的检验速度明显加快,同时明显提高了微生物的诊断水平.本文就对近年来微生物的快速检验技术研究进展作一综述.     

临床微生物检验经验

在临床医学中,一个较为重要的内容就是临床微生物检验技术。由于新感染病的出现、耐药菌的涌现、常见感染病原谱的变迁和易感人群的不断增加,使得感染性疾病并没有象人类曾经所预料的那样随着抗感染化疗时代的到来而逐一销声匿迹。相反,近年来感染性疾病又重新成为人类关注的热点。新时期,我国临床微生物检验技术如何顺应形势的发展,积极帮助临床做好感染性疾病的救治工作已显得十分迫切。     

加强临床微生物检验促进医院感染控制

随着医学科学技术的发展,临床微生物检验已日益成为疾病诊断、抗生素合理使用、医院感染控制等非常重要的手段.微生物检验水平直接关系到感染性疾病的诊治水平和医院感染控制水平.然而,国内临床微生物实验室普遍存在仪器设备简陋、检验技术落后、检验速度慢、专职人员少（基层医院细菌室只配备1人,有的还是兼职）等问题,这些现状与当今感染性疾病的严峻形势很不协调.     

微生物工作者在控制医院内感染中的作用

随着现代医学的发展 ,医院感染不断改变其自身特点 ,产生新的威胁和危害 ,这对医院感染的控制和管理工作提出了新的要求。在控制院内感染工作中 ,微生物工作者起着非常重要的作用。1　检查作用1.1　微生物室应通过建立一整套完整的工作制度、消毒隔离和质量管理措施 ,保证微生物室工作质量 ,从而大大提高病原微生物的阳性检出率及其正确率。1.2　微生物实验室是医院内病原微生物标本汇集的地方 ,它既能造成实验室内部自身的感染 ,也可通过多种途径播散全院 ,造成严重的院内感染。因此实验室工作人员应认真加强自身业务与院内感染方面的学习 …     

707例医院感染者病原体的构成及其耐药性分析

随着放疗、介入性诊治法的不断增加以及抗生素、化疗、免疫抑制剂的广泛应用,医院感染日趋严重,且耐药菌株不断增加,严重影响了住院患者的康复.为此,我们对707例医院感染者的病原体、耐药率以及医院感染的相关因素进行了回顾性分析,以探讨医院感染的病原体的构成、耐药情况以及医院感染的危险因素,为预防和控制医院感染提供理论依据.     

微生物检验在医院感染控制中的价值分析

医院感染是现代临床医学上的一种重要感染因素,是造成患者发生感染性疾病的主要诱因。在临床医学上,对医院感染进行合理有效控制,从而降低感染发生率,已经成为现代临床医学上的一项重要任务。在医院感染控制中,微生物检验的应用对医院感染控制效率以及质量的提高有着重要作用,有着很高的临床价值。本文就微生物检验在医院感染控制中的价值这一问题进行简单分析。     

宏基因组二代测序在儿童感染性疾病中应用的研究进展

儿童因各系统发育不成熟、免疫力低下等因素,面临着更为严重的感染风险,因此确定感染类型,快速明确病原微生物,早期精准诊治尤为重要.随着高通量技术的发展,宏基因组二代测序技术直接对样本中的DNA或RNA进行高通量测序,能够快速、客观的一次性检测出样本中的多种病原微生物,为急危重症和疑难感染性疾病提供了诊断依据.该文对宏基因组二代测序在儿童感染性疾病中病原体检测应用的最新研究进展进行综述.     

婴幼儿腹泻病原微生物检验结果分析

腹泻是导致婴幼儿死亡的主要原因之一,其病因主要是病原微生物的感染。能引起儿童腹泻的病原微生物主要有：病毒、细菌、原虫及真菌。如何快速、准确检出病原体,保证不漏检是临床微生物室的重要任务,现将收集齐齐哈尔地区3所医院180份门诊腹泻患儿的粪便标本中病原微生物的检验结果分析如下：     

感染性病原体二代测序技术研究进展

感染性疾病是全球人口发病及死亡的主要原因,病原学快速精准鉴定是其控制、预防的基础。传统病原学检测技术成熟、阳性预测价值高,然而却面临着病原谱窄、阳性率低、精确度低、检测周期长等局限性,常导致疾病治疗延误及抗菌药物滥用。二代测序技术(NGS)以其高通量、覆盖度广、精确度高等优势,成功应用于疑难危重感染性疾病诊治以及未知病原体鉴定、耐药基因监测、流行病学追踪调查等方面。NGS作为病原学鉴定的一种新技术,表现出巨大潜力,然而目前临床感染工作者认知及接受程度各异,本文通过综述NGS的基本原理、发展历程以及在感染性疾病病原体鉴定中的典型案例及其优势,反思其技术尚存在的挑战,使广大医疗工作者充分了解NGS作为感染性疾病诊断工具的作用及其局限性;同时提出NGS未来技术的发展方向,以期在感染性疾病的诊治中发挥更大的优势。     

医院感染常见病原体快速检测方法的研究进展

病原微生物的分离培养仍是目前发现医院获得性感染最直接的证据,但相对较长的报告周期不能满足医院对获得性感染早期发现、早期干预的需求。随着分子生物学技术的兴起和发展,大量基于基因水平和蛋白水平的微生物快速诊断技术被迅速应用于临床微生物实验室。分子杂交技术、基因芯片技术等不仅可以大大减少结果报告时间,而且可以对菌株进行种属水平间差异的检测;基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术的应用更是填补了蛋白组学在微生物领域中应用的空白;宏基因组二代测序技术也日渐成熟,目前已被成熟地应用于无菌体液等病原体的检测中。基于多位点序列分析技术的病原体同源性分析也被广泛应用于多项研究。本文仅对医院获得性感染微生物的快速诊断技术做一简要综述,以期为开发医院获得性感染病原体的快速检测技术提供借鉴和参考。     

儿科领域新发传染病研究现状

本文简要的概述了儿科领域常见新发传染病的病原微生物学研究,临床特征和流行病学特点,对预防和控制新发传染病的发生、发展、传播和蔓延具有重要意义。     

张家界市2018年病原微生物实验室生物安全现状分析

目的全面了解张家界市病原微生物实验室生物安全现状,分析张家界市病原微生物实验室生物安全目前面临的突出问题,提出对策,消除实验室生物安全隐患。方法依据《病原微生物实验室生物安全管理条例》和《病原微生物实验室生物安全通用准则》等,对辖区内的37家病原微生物实验室实施督查、分析结果、找出问题、提出建议。结果张家界市实验室生物安全状况不容乐观,存在很多安全隐患,包括职业暴露、院内感染、环境污染、缺乏培训、无证上岗、管理体系不能有效运行、单位领导不够重视和卫生主管部门监管缺失等。结论只有健全生物安全管理体系,落实管理制度,配置硬件设施,加强人员培训,提高防护意识,落实菌(毒)株管理,坚持废弃物消毒处理和进行风险评估等各项措施,才能防止实验室感染的发生,从根本上避免实验室生物安全危害。     

Histopathology in tropical medicine: a perspective

Histopathology may serve a wide spectrum of diagnostic purposes in tropical medicine other than for infectious and parasitic diseases. In addition, it is essential in defining new pathological entities and collecting statistical data on morbidity and mortality. It should also constitute a basic support for advancement and research in tropical diseases. For practical purposes, both histopathology and cytopathology are often more effective than clinical chemistry and microbiology in providing the clinician with a final diagnosis. They do not rely on complicated and delicate equipment, and the few reagents they require can be stored indefinitely. Formalin fixation permits most histological methods to be used, including special stains and immunohistochemistry. Formalin-fixed material can be examined several days after excision. Implementing pathology laboratories in tropical countries may constitute a practical, cost-effective approach to the planning of diagnostic services at the regional or district level. A fraction of the medical graduates in developing countries should be devoted to the staffing of these laboratories.     

病原微生物实验室生物安全标准体系框架研究

制定和实施病原微生物实验室生物安全标准是实现病原微生物实验室科学化、效率化、规范化管理和运行的重要手段。本文通过对国内外病原微生物实验室生物安全标准化建设的现状进行分析，提出病原微生物实验室生物安全标准体系框架，主要包含基础标准、管理标准、技术标准和行业应用4个部分，为病原微生物实验室生物安全标准化工作提供参考，助力我国生物安全事业的规范发展。     

前白蛋白与C反应蛋白在新生儿感染性疾病早期诊断中的临床价值

目的:探讨前白蛋白(PA)、C反应蛋白(CRP)在新生儿感染性疾病早期诊断中的临床应用价值。方法:以48例新生儿非感染性疾病为对照组,研究348例新生儿感染性疾病PA、CRP检测情况。结果:感染组各种疾病与对照组比较,经q检验分析均有统计学差异(P<0.05),其中PA相对于对照组出现降低,尤其败血症、细菌性肺炎、上呼吸道感染下降较为显著,CRP相对于对照组出现升高,以败血症、细菌性肺炎、上呼吸道感染较为明显;感染组重症感染及普通感染PA、CRP平均浓度经q检验分析均有统计学差异(P<0.05),重症组PA降低、CRP升高比较显著。结论:PA、CRP是评价新生儿感染性疾病早期诊断、病情监测及药物疗效的良好观察指标。     

306例非肿瘤患者侵袭性肺部真菌感染的调查分析

目的 探讨非肿瘤患者侵袭性肺部真菌感染(IPFI)的临床特点.方法 选取2008年1月-2010年5月河北省13所医院呼吸科,IPFI患者306例,收集患者的微生物学、影像学与临床诊治资料等,分析临床特点.结果 306例患者共分离出真菌336株,其中白色假丝酵母菌145株,抗真菌药物有效率以伏立康唑最高达71.4％.结论 宿主因素对于IPFI的早期诊断与预防至关重要；IPFI的致病真菌仍以假丝酵母菌属最多.     

Molecular methods for pathogen and microbial community detection and characterization: current and potential application in diagnostic microbiology

Clinical microbiology laboratories worldwide have historically relied on phenotypic methods (i.e., culture and biochemical tests) for detection, identification and characterization of virulence traits (e.g., antibiotic resistance genes, toxins) of human pathogens. However, limitations to implementation of molecular methods for human infectious diseases testing are being rapidly overcome allowing for the clinical evaluation and implementation of diverse technologies with expanding diagnostic capabilities. The advantages and limitation of molecular techniques including real-time polymerase chain reaction, partial or whole genome sequencing, molecular typing, microarrays, broad-range PCR and multiplexing will be discussed. Finally, terminal restriction fragment length polymorphism (T-RFLP) and deep sequencing are introduced as technologies at the clinical interface with the potential to dramatically enhance our ability to diagnose infectious diseases and better define the epidemiology and microbial ecology of a wide range of complex infections.     

Infection control implications of extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) production by Klebsiellae and other Gram-negative bacteria

Extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) producing organisms have been detected in Australian hospitals over the last 10 years. They are mostly encountered in very sick patients who have been hospitalised for long periods, particularly in intensive care units (ICUs). Use of invasive medical devices and broad spectrum antibiotics predispose to colonisation and infection with these organisms.Control of epidemic or endemic ESBL producing organisms is possible using a multidisciplinary approach utilising the resources of routine clinical microbiology laboratories, molecular epidemiology laboratories and clinical infection control practitioners. Many hospitals can control ESBL producing organisms using a combination of classical infection control interventions such as contact isolation and modification of antibiotic prescribing practices, in particular restriction of use of third generation cephalosporins.     

The Czech External Quality Control system in medical microbiology and parasitology

The External Quality Control (EQC) system in activities of laboratories engaged in medical microbiology and parasitology was established in the Czech Republic in 1993 when to the first laboratories which applied coded serum samples were sent for diagnosis of viral hepatitis and bacterial strains for identification. In the course of years the number of control areas increased and in 2000 there were 31 and the number of those interested in participation in EQC increased from 79 in 1993 to 434 in 2000. This year a total of 13,239 samples will be sent to laboratories. Gradually thus almost all microbiological and parasitological laboratories concerned with examination of clinical material became involved. Seven-year experience with EQC in the Czech Republic revealed that gradually the results of various examinations became more accurate, that methods became standardized and the most suitable examination sets are used.     

2018年湖南省病原微生物实验室生物安全现状调查与分析

目的 了解湖南省卫健系统病原微生物实验室生物安全现状,分析查找原因,提出改进方法和措施,为进一步规范生物安全管理提供依据。 方法 依据2018年国家卫健委病原微生物实验室生物安全检查表,将各项指标细化,选取全省有代表性的6家病原微生物实验室,以现场核查、查阅记录、询问等方式开展调查。 结果 被调查实验室在备案管理、设施设备配备、实验操作技能和实验室废弃物处置方面均符合要求,但普遍存在实验室安全管理制度不健全、风险评估、设施设备维护保养和应急预案不规范或不适用的问题,部分实验室在菌毒种管理、运输和灭菌效果监测方面不符合要求。 结论 湖南省病原微生物实验室存在一定的生物安全隐患,需要进一步加强监管。