肿瘤标志物对胃癌诊断及预后的评估价值

目的探讨肿瘤标志物水平变化对胃癌诊断及预后评估的价值。方法经手术与病理学确诊的198例胃癌患者作为病例组,同时选择198例于我院体检均为健康者为对照组。采用电化学发光法检测2组患者血清中肿瘤标志物CEA、CA724、CA199的水平,并评价3种肿瘤标志物的灵敏度、特异度。结果病例组3种肿瘤标志物的含量均高于对照组,且差异均有统计学意义。同时术后该3种肿瘤标志物的水平均低于术前,差异均有统计学意义。同时（Ⅲ＋Ⅳ）期患者肿瘤标志物水平明显高于（Ⅰ＋Ⅱ）期,差异均有统计学意义。病例组患者CEA、CA724、CA199的灵敏度分别为50．9％,51．3％,47．8％;特异度分别为92．1％,91．4％,89．5％;三者联合检测的灵敏度和特异度分别达90．1％,73．4％。结论血清CEA、CA724、CA199对于胃癌的诊断有一定的辅助诊断价值,同时三者联合检测可以提高其诊断的敏感度,对于预后胃癌患者的预后有较高的评估价值。     

miR-506-3p在肝癌诊断及预后评估中的作用

目的 探讨miR-506-3p在肝癌的诊断及预后评估中的作用。方法 通过实时定量PCR(qRT-PCR)检测92例肝癌患者组织及血清样本中miR-506-3p的表达,分析血清miR-506-3p与肝癌患者病理特征的关系。工作特征曲线(ROC)分析miR-506-3p在肝癌中的诊断效能。通过随访,确认miR-506-3p在肝癌预后中的意义。通过CCK-8试验分析miR-506-3p对肝癌细胞增殖能力的影响。结果 miR-506-3p在肝癌患者组织及血清样本中均呈低表达。血清miR-506-3p表达降低提示患者TNM分期较高或分化较差。此外,血清miR-506-3p的表达诊断肝癌的曲线下面积(AUC)值为0.911,区分肝癌患者肿瘤大小、TNM分期、病理分化程度的AUC值分别为0.751,0.825,0.777。Kaplan-Meier生存分析显示,血清中miR-506-3p表达降低,肝癌患者的总体生存率明显降低。Cox比例风险回归模型分析显示出TNM分期、血清miR-506-3p低表达是肝癌患者的独立预后因素。体外实验上调miR-506-3p后肝癌细胞的增殖能力明显降低。结论miR-50...     

血清miR-153和miR-142-3p表达在宫颈癌诊断和预后评估中的价值

摘 要：［目的］ 探讨宫颈癌患者血清miR-153及miR-142-3p的表达及其在宫颈癌诊断和预后评估中的价值。［方法］ 选取2014年1月至2017年3月收治的宫颈癌患者142例,采用实时荧光定量聚合酶链反应（RT-PCR）检测宫颈癌患者血清miR-153及miR-142-3p表达水平。绘制ROC曲线分析miR-153及miR-142-3p对宫颈癌诊断的截断值,并以此为标准将宫颈癌患者分为高表达和低表达,对两组临床病理特征进行比较。采用多因素Cox回归模型分析影响宫颈癌患者术后预后不良的危险因素。［结果］ 宫颈癌组血清miR-153（0.76±0.38 vs 1.92±0.95）及miR-142-3p（2.14±1.06 vs 8.15±3.20）表达水平明显低于对照组（P<0.01）。血清miR-153及miR-142-3p表达水平诊断宫颈癌的最佳截断值分别为1.31和4.93,AUC分别为0.817（95%CI：0.755～0.878）和0.850（95%CI：0.791～0.912）。血清miR-153及miR-142-3p低表达与宫颈癌患者的临床分期、分化程度、浸润深度、淋巴结转移及脉管浸润有关（P<0.05）。miR-153及miR-142-3p低表达与宫颈癌患者生存期短有关（P<0.01）。多因素Cox回归模型分析显示,临床分期、浸润深度、淋巴结转移、miR-153＜1.32及miR-142-3p＜4.93是影响宫颈癌患者预后不良的独立危险因素。［结论］ 血清miR-153及miR-142-3p表达水平在宫颈癌患者中明显下调,miR-153及miR-142-3p有望作为宫颈癌诊断及预后评估的生物学标志物。     

用于肝癌诊断和预后的新型肿瘤分子标志物

我国是肝癌的高发地区,死亡率高,虽然肝癌的多种治疗手段层出不穷,但仍旧缺乏切实有效的提高5年生存率的治疗手段。靶向治疗是未来肿瘤治疗的重要研究方向之一,在肿瘤发生、发展和转移中起关键作用的分子是靶向治疗的理想靶点。随着蛋白组学,基因技术,分子生物技术的不断发展,逐渐发现一些具有广阔应用前景的新的肝癌肿瘤标志物和干预治疗靶点。现对其做一综述。     

miR-194-3p对胃癌细胞增殖和凋亡的影响及其机制探讨

目的:分析miR-194-3p对胃癌细胞增殖和凋亡的影响并探讨其机制。方法:采用生物信息学方法对miR-194-3p的表达情况以及预后信息进行统计分析。采用荧光定量PCR检测胃癌细胞系中miR-194-3p的表达情况;采用CCK-8实验、克隆形成实验和流式细胞技术检测miR-194-3p对胃癌细胞增殖和凋亡能力的影响;Western blot检测过表达miR-194-3p后Caspase3的表达情况。结果:与癌旁组织相比,miR-194-3p在胃癌组织中显著高表达。TCGA预后分析显示,miR-194-3p的高表达与良好的预后相关。与GES-1相比,miR-194-3p在6种胃癌细胞系中均显著低表达。CCK-8和克隆形成实验结果显示,与空载组相比,慢病毒转染过表达miR-194-3p后显著抑制胃癌细胞增殖。流式细胞术显示,miR-194-3p可显著促进胃癌细胞凋亡。Western blot结果显示,Caspase3的表达在miR-194-3p过表达的胃癌细胞中显著增加。结论:miR-194-3p在胃癌细胞中低表达,miR-194-3p的过表达可显著抑制胃癌细胞的增殖,并促进细胞凋亡。其中miR-194-3p促进凋亡的机制可能是通过Caspase3的凋亡相关通路发挥作用。     

胃癌发生过程中风险miRNAs筛选及其诊断效能评价的多中心研究

目的 探索胃癌发生过程的风险miRNAs,为上消化道机会性筛查中早期胃癌识别提供依据。方法 纳入2021年6月至2023年8月在广西医科大学附属肿瘤医院、右江民族医学院附属医院、桂林市人民医院3个中心进行上消化道癌机会性筛查的人群。选取健康体检者107例、早期胃癌患者71例、进展期胃癌患者97例。首先采用转录组测序筛选差异表达miRNAs,然后在3组前瞻性人群的血浆样本中通过RT-qPCR验证差异表达的miRNAs,最后采用受试者工作特征（receiver operating characteristic,ROC）曲线评估miRNAs的诊断效能。结果 转录组测序的差异基因分析共筛选出胃癌发生过程中的6个差异表达miRNAs,包括miR-3176、miR-885-5p、miR-203a-3p、miR-452-5p、miR-223-3p、miR-219a-2-3p。RT-qPCR结果显示,miR-452-5p在早期胃癌及进展期胃癌患者中表达上调（均P<0.001）。ROC曲线显示,miR-452-5p诊断早期胃癌和进展期胃癌的曲线下面积（area under the curve,AU...     

胃癌免疫治疗相关生物标志物的研究进展

胃癌作为一种常见的恶性肿瘤,具有较高的发病率和病死率,找到合适的治疗靶点和提高综合治疗效果迫在眉睫.既往胃癌的标准治疗手段以手术和化疗为主,但随着免疫治疗药物的不断完善以及有关程序性死亡受体1(PD-1)、程序性死亡受体配体1(PD-L1)等免疫检查点的临床试验不断开展,研究者发现免疫治疗能够有效辅助传统治疗,延长胃癌...     

基于免疫相关lncRNAs的胃癌早期诊断和预后风险模型的构建和验证

目的 基于胃癌免疫相关lncRNAs,建立早期诊断模型和预后风险模型,为胃癌早期诊断和预后预测提供数据支持.方法 利用TCGA-STAD数据集与immport数据库筛选胃癌相关免疫lncRNAs.将TCGA-STAD作为训练集,利用logistic回归分析构建胃癌早期诊断模型;单因素Cox和LASSO回归分析用于筛选影...     

前列腺癌诊断/预后和耐药分子标志物的筛选及其临床意义

目的：基于已发表的芯片数据通过生物信息学方法筛选差异表达基因,以发现前列腺癌诊断/预后和耐药相关分子标志物。方法：筛选GEO数据库中已发表的前列腺癌mRNA芯片数据GSE6956和前列腺癌细胞多烯紫杉醇耐药mRNA芯片数据GSE33455进行差异表达分析;通过生物学功能注释、基因通路富集分析、蛋白质相互作用网络（protein-protein interaction,PPI）分析等生物信息学方法发现和识别与差异表达基因相关的生物学功能和信号通路;比对TCGA数据库,验证差异表达基因在前列腺癌组织及癌旁组织中的表达,并通过Kaplan-Meier分析差异表达基因对前列腺癌患者生存率的影响;用qPCR方法验证差异表达基因在前列腺癌细胞株PC3及多烯紫杉醇耐药细胞PC3-DTX中的表达情况。结果：共筛选出227个在前列腺癌和前列腺癌多烯紫杉醇耐药细胞芯片数据中共同差异表达基因。差异表达基因主要富集到了癌症相关通路（Lysosome、Sphingolipid、FoxO、Acute myeloid leukemia）,并主要参与细胞黏附、自噬和胞内蛋白转运等生物学过程。构建PPI网络选取18个连接度最高的基因作为Hub基因。Hub基因和共同差异表达基因中,上调基因CITED2、LRP12和RPL17-C18orf32与前列腺癌患者的不良预后显著相关。qPCR验证显示CITED2在多烯紫杉醇耐药细胞PC3-DTX中高表达。结论：通过生物信息学方法筛选出在前列腺癌组织和耐药细胞中共同差异表达,且与前列腺癌患者的不良预后密切相关的基因,为前列腺癌诊断/预后和耐药分子标志物的研究提供了新的思路。     

MiR-19b-3p and miR-101-3p as potential biomarkers for prostate cancer diagnosis and prognosis

Prostate cancer (PCa) is the most commonly diagnosed male malignancy worldwide. Early diagnosis and metastases detection are crucial features to diminish patient mortality. High fat diet (HFD) and metabolic syndrome increase PCa risk and aggressiveness. Our goal was to identify miRNAs-based biomarkers for PCa diagnosis and prognosis associated with HFD. Mice chronically fed with a HFD or control diet (CD) were subcutaneously inoculated with androgen insensitive PC3 cells. Xenografts from HFD-fed mice showed increased expression of 7 miRNAs that we named “candidates” compared to CD-fed mice. These miRNAs modulate specific metabolic and cancer related pathways. Using bioinformatic tools and human datasets we found that hsa-miR-19b-3p and miR-101-3p showed more than 1,100 validated targets involved in proteoglycans in cancer and fatty acid biosynthesis. These miRNAs were significantly increased in the bloodstream of PCa patients compared to non-PCa volunteers, and in prostate tumors compared to normal adjacent tissues (NAT). Interestingly, both miRNAs were also increased in tumors of metastatic patients compared to tumors of non-metastatic patients. Further receiver-operating characteristic (ROC) analysis determined that hsa-miR-19b-3p and hsa-miR-101-3p in serum showed poor predictive power to discriminate PCa from non-PCa patients. Hsa-miR-19b-3p showed the best score to discriminate between tumor and NAT, while hsa-miR-101-3p was useful to differentiate between metastatic and non-metastatic PCa patients. Hsa-miR-101-3p was increased in exosomes isolated from blood of PCa patients. Although more detailed functional exploration and validation of the molecular mechanisms are required, we identified hsa-miR-19b-3p and hsa-miR-101-3p with high potential for PCa diagnosis and prognosis.     

胃癌分子标志物环状RNA研究进展

环状RNA(circular RNA,circRNA)是广泛存在于多物种细胞中结构稳定、高度保守、表达量丰富、可充当微小RNA海绵、具有剪切和转录调控、亲代基因修饰功能的内源性单链闭合circRNA.circRNA主要通过套索驱动的环化、内含子配对驱动的循环、内含子环化方式合成.在胃癌发生和进展过程中,不同种类的cir...     

miR-141-3p在胃癌组织和患者血浆中的表达及其临床意义

目的:检测miR-141-3p在胃癌组织及患者血浆中的表达水平,探讨其表达水平与患者病理特征和预后的关系.方法:收集河北医科大学第四医院普外科2012年5月至2013年1月胃癌根治性手术切除的组织标本及术前外周静脉血标本44例,每例标本采集肿瘤组织(非坏死部分)和配对的癌旁组织.采用实时荧光定量PCR法检测miR-141-3p在胃癌组织、癌旁组织、血浆及健康志愿者血浆(25例)的表达情况,分析miR-141-3p的表达水平与胃癌患者DFS及临床病理特征的关系.结果:miR-141-3p在胃癌组织中的表达明显降低,在血浆中的表达水平明显升高(均P＜0.01).在胃癌组织中miR-141-3p高表达组DFS明显高于低表达组(21.8 vs 10.3个月,P＜0.01),且miR-141-3p在癌组织中的表达水平与患者DFS呈正相关(P＜0.01).在血浆中miR-141-3p的高表达组DFS明显低于低表达组(9.1 vs 21.0个月,P＜0.01),且miR-141-3p血浆中的表达水平与患者DFS呈负相关(P＜0.01).miR-141-3p在胃癌患者血浆中表达水平与肿瘤TNM分期、淋巴结转移及脉管瘤栓相关(P＜0.01).结论:miR-141-3p在胃癌组织中表达显著降低且与患者预后呈正相关,其在患者血浆中表达显著升高且与患者预后呈负相关,表明miR-141-3p可作为胃癌早诊早治及患者临床预后判定的潜在标志物.     

Serum dickkopf-1 is a novel serological biomarker for the diagnosis and prognosis of pancreatic cancer

Purpose

To identify whether Dickkopf-1 (DKK1) could be a potential biomarker for early detection and prognosis in patients with pancreatic cancer (PC).

Methods

Serum was collected from 140 patients with pancreatic adenocarcinoma and 92 control patients without pancreatic adenocarcinoma. Serological levels of DKK1 were examined by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). The sensitivity and specificity was compared with carbohydrate antigen 19-9 (CA19-9). A 2-year follow-up was monitored to evaluate the correlation between DKK1 serum levels and overall survival. The expression of DKK1 in PC tumor tissues was also evaluated using immunohistochemistry staining.

Results

Serum levels of DKK1 and CA19-9 were elevated in PC patients in the early-stage cases. These levels increased with the advancement of clinical stage. There was significant difference in DKK1 serum levels between early and advanced PC stages. Receiver operating characteristic curve (ROCC) analysis showed that DKK1 was significantly better than CA19-9 in differentiating patients with PC from the controls (area under the curve (AUC) 0.919 versus 0.853, respectively), especially in distinguishing early-stage cancer from chronic pancreatitis (CP). The expression of DKK1 in PC tissues correlated with its expression in serum samples. The overall survival rate was 24.4% in the group with higher DKK1 levels and was found to be significantly different from the group with lower DKK1 levels (33.3%).

Conclusion

DKK1 may be a novel diagnostic/prognostic biomarker for PC.     

基于GEO数据库筛选胃癌分子标志物

目的：运用生物信息学方法结合基因表达数据库（Gene Expression Omnibus,GEO）筛选参与胃癌发生发展的关键基 因,以获得用于胃癌诊断、治疗靶标选择及预后判断相关分子标志物。方法： 从GEO数据库中下载与胃癌（gastric cancer,GC）相 关芯片数据集,筛选差异表达基因（differentially expressed gene,DEG）, 对DEG 做功能富集分析,构建蛋白互作网络（proteinprotein interaction network,PPI）,筛选关键基因（key gene）,进而构建共表达网络、生存曲线以及层次聚类分析。结果：共筛选出 261个GC相关DEG,通过分析获得14个关键基因,分别为PLOD1、PLOD3、COL1A1、COL1A2、COL2A1、COL3A1、COL4A1、 COL4A2、COL8A1、COL12A1、COL15A1、ITGA2、LUM、SERPINH1。关键基因主要参与胶原纤维的组织、细胞外基质的组织、 细 胞外结构的组织、皮肤形态发生、胶原的合成及血管的发育等生物学过程。生存曲线分析表明,基因COL3A1（P=0.0241）表达的 改变显著降低了胃癌患者整体生存率;基因ITGA2（P=0.0679）的表达改变也显示与GC患者的无病生存率降低有关。与正常胃 组织相比,层次聚类分析表明,GC组织中基因PLOD1、PLOD3、COL3A1、ITGA2、COL1A2、COL1A1、COL4A1、LUM、COL12A1、 SERPINH1、COL8A1表达上调。结论：经筛选获得的关键基因可作为潜在分子标志物用于GC的早期诊断、治疗靶点选择和预 后判断,并为后续的研究提供参考。     

Immune‐related gene TM4SF18 could promote the metastasis of gastric cancer cells and predict the prognosis of gastric cancer patients

Gastric cancer (GC) is one of the most common malignancies in the world, and the search for better markers has become one of the challenges today. It has been found that the L6 superfamily regulates the biological functions of numerous tumors, but transmembrane 4 L six family member 18 (TM4SF18) has been rarely reported. We found that TM4SF18 expression is upregulated in GC tissues and cells, which can be effectively diagnosed and dynamically monitored to assess the prognosis of GC patients. Furthermore, knockdown of TM4SF18 effectively inhibited proliferation, migration, and invasion of GC cells, and affected the epithelial‐mesenchymal transition process. TM4SF18 was found to be an independent prognostic factor for GC by univariate and multifactorial Cox analyses as well as by establishing nomogram plots. In addition, in TM4SF18 and immune correlation analysis, TM4SF18 expression levels were found to be negatively correlated with most immune cell marker genes and associated with numerous immune cells and immune pathways, resulting in less benefit from treatment with immune checkpoint inhibitors. In summary, we found that TM4SF18 is a promising GC biomarker that promotes the proliferation, migration, and invasion abilities of GC cells, and is associated with immune response.     

基于lncRNA-miRNA-mRNA调节网络胃癌关键基因筛选与分析

目的胃癌的分子发病机制与预后仍是亟待解决的难题。本研究通过癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库筛选出在胃癌中表达失调的基因,构建长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)-微小RNA(microRNA,miRNA)-信使RNA(mRNA)调节网络,寻找并分析网络中与胃癌患者预后相关的关键调控基因,为胃癌提供新型分子标志物。方法从TCGA官方网站中下载胃癌RNA测序数据和临床数据,使用R软件edgeR包分析胃癌中差异表达的lncRNA、miRNA和mRNA,构建差异lncRNA-miRNA-mRNA调控网络。使用R软件中的survival包对调控网络中的基因进行分析,寻找与胃癌预后相关的关键基因。使用Kaplan Meier-plotter在线数据库分析这些关键基因的预后作用。结果共有62个lncRNA、10个miRNA和10个mRNA分子参与调控网络的构建。Kaplan-Meier生存分析显示,2个mRNA(ATAD2、SERPINE1),10个lncRNA(AC018781.1、ADAMTS9-AS1、ADAMTS9-AS2、AL139002.1、AL391152.1、C15orf54、IGF2-AS、LINC00326、NKX2-1-AS1、POU6F2-AS2)和2个miRNA(miR-145、miR-508)与胃癌患者预后有统计学意义的关联,P<0.05。Kaplan Meier-plotter数据库分析显示,mRNA ATAD2(HR=1.66,95%CI为1.32~2.08,P<0.001)和SERPINE1(HR=1.36,95%CI为1.13~1.64,P=0.001)与胃癌患者的总体生存率差异有统计学意义的关联。结论成功构建了胃癌lncRNA-miRNA-mRNA调节网络后,识别出了调控网络中预后相关基因,这些基因可能作为胃癌新型的分子标志物。