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1.
目的应用长链非编码RNA基因芯片研究HOX基因在喉癌组织与癌旁正常组织中的表达谱。方法设立5组经过严格配对的实验组(人喉癌组织)与对照组(同一患者癌旁正常组织)。手术中切取人喉癌组织及癌旁正常组织,应用Triozl法抽提所取标本总RNA,纯化RNA后,将等量的两组RNA样本逆转录为荧光标记的cRNA混合物,与长链非编码RNA基因芯片进行杂交。应用Agilent扫描仪对芯片荧光信号图像进行扫描,及对原始数据进行计算机统计学分析,结果得到实验组与对照组两种组织之间HOX基因的LncRNA和mRNA的差异表达谱。结果在LncRNA表达谱的统计结果中,筛选出差异表达HOX基因簇的LncRNA有18条,表达上调的有8条,表达下调的有10条。在mRNA表达谱的统计结果中,筛选出差异表达的HOX基因簇的mRNA有17条,表达上调的有15条,表达下调的有2条。结论与癌旁正常组织相比,HOX基因在喉癌组织中的表达谱发生了显著变化。 相似文献
2.
目的:研究喉鳞癌组织与相邻正常黏膜的基因表达谱差异。方法:对2例经病理证实的喉鳞状细胞癌标本和邻近的正常黏膜组织标本与基因表达谱芯片进行杂交,利用激光共聚焦荧光检测系统扫描芯片杂交信号,获得样品中基因序列及表达信息。结果:对比2例喉癌和邻近正常组织的基因表达图谱,发现癌组织和正常组织存在差异表达,2例标本重复出现且差异表达的基因共74个,其中喉癌组织表达上调的基因(R>=5)27个,表达下调的基因(0<R<0.2)47个。结论:利用基因表达谱芯片可以在喉鳞状细胞癌组织和邻近的正常组织之间一次比较7000多个基因表达变化,并能找出病理组织中表达异常的基因。 相似文献
3.
目的 miRNA芯片筛选与喉鳞状细胞癌(laryngeal squamous cell carcinoma,LSCC)形成相关的差异miRNAs,结合生物信息学分析确定并进一步验证具有诊疗价值的目标miRNAs 。方法 AffymetrixGeneChipmiRNAArray3.0芯片对5对LSCC组织及相应的癌旁组织行差异miRNAs的筛选,原始数据上传Gene Expression Omnibus数据库。采用Mev软件中配对方式t检验进行芯片探针的差异分析,经Affymetrix Analysis Center分析后将差异探针转换为差异表达的miRNAs;选择我们前期工作确定的微小染色体维持蛋
白4(mini chromosome maintenance protein4,MCM4)作为核心基因,采用Mirfocus数据库生物信息学分析MCM4的调控miRNAs并结合相关文献确定目标miRNAs;采用
RT-PCR在另外21对LSCC组织及相应的癌旁组织中验证目标miRNAs。结果 经差异筛选分析,有127个差异表达的miRNAs,其中78个miRNAs在肿瘤组织中高表达,49个
miRNAs在肿瘤组织中低表达;采用Mirfocus数据库生物信息学分析参与核心基因MCM4的调控miRNAs并结合相关文献,确定高表达的hsa-miR-183-5p、hsa-miR-24-3p为与MCM4调控作用相关的目标miRNAs;hsa-miR-30a-5p为另一个潜在的目标miRNA,且在肿瘤组织中低表达;通过RTPCR验证这3个差异表达的目标miRNAs与芯片筛选结果一致。结论 基于miRNAs芯片筛选分析得到的hsa-miR-183-5p、hsa-miR-24-3p及hsa-miR-30a-5p对LSCC的发生发展具有重要调控作用,可作为潜在的诊疗靶点。 相似文献
4.
目的:运用miRNA芯片筛选与喉咽鳞状细胞癌对TPF方案诱导化疗敏感性相关的差异miRNAs,生物信息学分析确定具有诊疗价值的目标miRNA并进行验证。方法利用Affymetrix GeneChipmiRNAArray4.0芯片对12例TPF方案诱导化疗敏感的原发喉咽鳞状细胞癌患者及9例不敏感的患者的肿瘤组织行差异miRNA的筛选。选择文献中已经报道的和肿瘤发生相关的miRNA作为目标miRNA,并采用RT-PCR在24例原发喉咽鳞癌肿瘤组织(14例敏感,10例不敏感)中验证目标miRNA。结果筛选出24个miRNA在敏感组与不敏感组间表达有显著差异,其中6个miRNA在对TPF方案诱导化疗敏感组中表达上调,18个miRNA表达下调。运用miRNA靶基因预测数据库mirfocus对筛选出的24个差异miRNA进行分析,确定在敏感组中低表达的hsa-miR-211-3p、hsa-miR-4253、hsa-miR-4443、hsa-miR-193b-3p作为目标miRNA。采用RT-PCR对目标miRNA进行验证,hsa-miR-4253、hsa-miR-4443、hsa-miR-193b-3p与芯片筛选结果一致。结论 hsa-miR-4253、hsa-miR-4443、hsa-miR-193b-3p在诱导化疗敏感组与不敏感组间有显著性差异,可作为治疗方案的选择指标,并为进一步研究喉咽鳞状细胞癌对诱导化疗敏感性奠定分子生物学基础。 相似文献
5.
激光捕获显微切割及基因芯片技术构建喉鳞状细胞癌全基因组表达谱 总被引:1,自引:1,他引:1
目的 通过全基因组寡核苷酸基因芯片构建喉部纯化组织基因表达谱,筛选与喉癌相关的候选靶基因.方法 采用RNA保护技术保护组织标本,激光捕获显微切割纯化分离8例声门型喉癌标本中癌细胞及其相对应的癌旁相对正常的黏膜上皮细胞,结合HG U133.Plus2.0芯片技术,构建16例喉部纯化组织标本全基因组表达谱,筛选出喉癌相关靶基因;选择部分特异性的候选靶基因通过荧光定量PCR在mRNA水平检测基因的表达情况.结果 对16例喉部纯化组织基因组表达谱进行统计学处理及聚类分析,筛选出与喉癌发病相关的候选靶基因2351个;假阳性率为0.63%.对特异性候选基因MMP12、KRT16、RARB、PRB1 mRNA的荧光RT-PCR检测结果与基因表达谱的结果具有一致性.结论 利用全基因组基因芯片构建基因表达谱,可准确、高效地筛选出喉癌相关的候选靶基因,为寻找喉癌临床早期诊断的分子标记物及喉癌潜在的药物作用靶分子奠定坚实的理论基础. 相似文献
6.
张庆军段瑞钦胡基刚赵素斌 《中国耳鼻咽喉头颈外科》2013,(5):231-234
目的探讨c-Cbl在喉癌组织中的表达及临床意义。方法应用免疫组化(SP)法检测40例喉癌组织、15例癌旁组织和8例喉正常黏膜组织中c-Cbl蛋白的表达情况。应用流式细胞术定量检测40例喉癌组织、13例癌旁组织和5例喉正常黏膜组织中c-Cbl的含量。结果免疫组化示喉癌组织、癌旁组织及喉正常黏膜组织中c-Cbl的表达强度呈下降趋势,3组相比有显著性差异。应用流式细胞术检测c-Cbl蛋白在喉癌组织、癌旁组织及喉正常黏膜组织中的表达量分别为1.8424±0.1814、1.6350±0.3889、1.1026±0.0181,3组相比有显著性差异。在喉癌组织中c-Cbl蛋白表达与其病理分级有关。结论 c-Cbl蛋白与喉癌的发生发展有关。 相似文献
7.
目的 探讨声门上型喉鳞状细胞癌(简称鳞癌)颈淋巴转移中上皮-间质转化过程相关的小分子RNA(microRNA,miRNA).方法 对12例声门上型喉鳞癌患者(淋巴转移组6例,非淋巴转移组6例)的原发肿瘤组织进行miRNA芯片筛选;对40例声门上型喉鳞癌患者(淋巴转移组20例,非淋巴转移组20例)通过实时定量PCR法验证筛选出的显著差异表达的miRNA;应用生物信息学预测已验证的miRNA的靶基因,根据各基因的功能筛选与上皮-间质转化相关的基因,对应找到可能与声门上型喉鳞癌颈淋巴转移中上皮-间质转化过程相关的miRNA.结果 芯片筛选结果显示10个miRNA在两组间的表达差异有意义,其中在6例转移组中上调的有miR-192、miR-634、miR-223、miR-409、miR-365、miR-143、miR-1224、miR-30d和miR-1249,下调的有miR-494.40例较大样本验证结果与芯片筛选结果相符.通过靶基因预测及功能分析,miR-192、miR-143、miR-409及miR-634可能通过抑制Krüppel样转录因子、E-钙黏蛋白和磷脂酰肌醇3-激酶等靶基因的转录上调上皮-间质转化过程,从而促进声门上型喉鳞癌颈淋巴转移.结论 筛选和验证与声门上型喉鳞癌颈淋巴转移相关的miRNA,miR-192、miR-143、miR-409及miR-634的表达失调可能在声门上型喉鳞癌转移的上皮-间质转化过程中扮演着重要的角色,需要进一步深入研究. 相似文献
8.
目的 研究喉咽癌组织与相邻正常黏膜的基因表达谱差异,从基因组水平初步探讨喉咽癌易侵袭和转移的机制。方法 3例经病理证实为鳞状细胞癌的喉咽癌标本和邻近的正常黏膜组织标本,提取细胞总RNA,反转录为Cy3标记的癌旁正常喉黏膜cDNA,及Cy5标记的喉咽癌cDNA,与共有人类癌症相关基因886条的基因表达谱芯片Human Cancer CHIP Ver.4.0进行杂交, 杂交芯片用双通道激光扫描仪进行扫描记录,利用ImaGene分析软件将信号强度数值化。基因显著性表达的判定标准为:每个基因的喉咽癌组织和癌旁正常组织的平均灰度比值R(Cy5/Cy3)相差2倍或2倍以上,则认为差异有统计学意义。结果 在3例样本中重复表达且相差2倍以上的基因共51个,喉咽癌组织表达上调者39个,表达下调者12个。本实验发现显著差异的新基因4个,这些基因序列已被测出,但其功能却未知。其中表达差异非常显著(平均相差5倍以上)的主要包括,上调基因:基质金属蛋白酶-1 (MMP-1),整合素β4(Integrinβ4),Bcl-2,CXCL13,黑色素瘤特异性抗原(PRAME );下调基因:早期生长反应基因-1 (early growth respons gene-1, Egr-1),MRP1/ CD9。结论 基因芯片技术可以用来筛选在喉咽癌肿瘤细胞增殖、侵袭、转移过程中发挥重要作用的多种基因,为进一步深入研究提供靶点。 相似文献
9.
目的 探讨成纤维细胞生长因子2型受体(fibroblast growth factor 2,FGFR2)在喉癌中的表达及临床意义。方法 应用免疫组织化学(SP法)检测FGFR2蛋
白在40例喉癌组织、15例癌旁组织和8例正常喉黏膜中的表达情况。应用流式细胞术的方法定量检测40例喉癌组织、13例癌旁组织和5例正常喉黏膜组织中FGFR2的含量。结果 喉癌组织、癌旁组织及正常喉黏膜中FGFR2蛋白的表达强度呈下降趋势,差异有统计学意义(H =11.4573,P <0.01)。FGFR2蛋白在喉癌组织、癌旁组织及正常黏膜中的表达量分别为1.8776±0.1683、1.1815±0.2710和1.0100±0.1341,差异有统计学意义(F =93.1797,P =0.0000)。喉癌组织中FGFR2蛋白的表达量明显高于癌旁组织及正常喉黏膜组织,而癌旁组织与正常喉黏膜相比无显著性差异。喉癌组织中FGFR2蛋白表达与病理分级有关,而与其临床分期、淋巴结转移、临床分型、肿瘤大小、吸烟量、年龄和性别均无关。结论 FGFR2蛋白在喉癌中的发生、发展有一定的相关性。 相似文献
10.
目的:明确水通道蛋白1(AQP1)在喉癌组织中的表达和分布,并探讨其在喉癌发病中可能的作用机制及意义。方法:取喉癌组织20例及癌旁正常组织15例,应用RT-PCR,Western blot,免疫组织化学技术检测AQP1蛋白在喉癌和正常对照组织中的表达及分布。结果:AQP1表达于正常喉黏膜固有层的血管内皮细胞及喉黏膜腺体上。在喉癌组中主要表达于肿瘤的血管内皮细胞,在肿瘤上皮细胞和癌巢中亦有表达。喉癌中AQP1 mRNA及蛋白表达水平较癌旁正常组织增多,二者之间差异有统计学意义。结论:AQP1在喉癌组织中表达增高,在癌旁正常组织中较低,提示AQP1在喉癌发病中的重要作用有待深入研究。 相似文献
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基质金属蛋白酶11在喉癌中的表达 总被引:1,自引:0,他引:1
目的:检测喉癌中基质金属蛋白酶11(MMP11)的表达,探讨MMP11的表达与喉癌浸润和转移的关系.方法:采用免疫组织化学法检测63例喉癌组织和相应的癌旁正常组织MMP11蛋白的表达,运用RT-PCR技术检测22例喉癌和相应的癌旁正常组织冻存标本中MMP11 mRNA水平的表达.结果:采用免疫组织化学法检测喉癌和癌旁正常组织MMP11的表达,癌组织MMP11的表达阳性率明显高于癌旁正常组织(P<0.01).运用RT-PCR方法检测喉癌和癌旁正常组织MMP11 mRNA的表达,癌组织MMP11 mRNA的表达阳性率明显高于癌旁正常组织(P<0.01).MMP11蛋白表达在T3 T4组高于T1 T2组(P<0.01),淋巴结转移组高于非淋巴结转移组(P<0.05).MMP11 mRNA表达在T3 T4组高于T1 T2组(P<0.05),淋巴结转移组高于非淋巴结转移组(P<0.05).MMP11蛋白及MMP11 mRNA的表达与肿瘤原发部位和分化程度无明显相关性(P>0.05).结论:MMP11的表达与喉癌浸润和转移密切相关,可作为预测喉癌浸润和转移潜能的参考指标之一. 相似文献
12.
目的研究细胞凋亡调控因子Fas、FasL和Fas相关死亡结构域蛋白(Fas-associated death domain protein,FADD)基因在喉癌中的表达及其意义。方法免疫组化法检测喉癌及癌旁组织中Fas、FasL和FADD表达。结果喉癌组织中Fas、FADD阳性表达率显著低于癌旁组织,FasL阳性表达率显著高于癌旁组织(P〈0.05);高分化鳞状细胞癌(简称鳞癌)Fas阳性表达率显著高于中低分化鳞癌(P〈0.05),高分化鳞癌FasL阳性表达率显著低于中低分化鳞癌(P〈0.05);FADD阳性表达率与肿瘤有无淋巴结转移密切相关(P〈0.05)。Fas与FADD蛋白表达之间呈显著正相关(r=0.43,P〈0.05)。结论检测喉癌组织中Fas、FasL、FADD表达对评价喉癌的恶性程度、预后及治疗有重要意义。 相似文献
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喉癌及癌旁组织中脂质过氧化物及超氧化物歧化酶的研究 总被引:4,自引:0,他引:4
本文应用黄嘌呤氧化酶法和硫代巴比妥酸法对32例喉癌及癌旁组织,12例正常喉组织中自由基清除酶———超氧化物歧化酶(SOD)活性和自由基代谢产物过氧化脂质(LPO)含量测定。检测结果表明,喉癌组织中SOD活性及LPO含量均高于癌旁组织及正常对照组,统计学处理P<0.01,差异非常显著,故认为喉癌的发生与自由基的关系较为密切。 相似文献
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目的 :探讨诱导型一氧化氮合酶 (iNOS)在喉癌喉咽癌组织中的表达及其临床意义。方法 :采用逆转录 聚合酶链反应 (RT PCR)技术检测 4 0例喉癌及 12例喉咽癌 (喉癌喉咽癌组 )、5 0例癌旁组织 (癌旁组 )、12例良性肿瘤 (良性肿瘤组 )及 7例正常喉黏膜 (正常喉黏膜组 )组织中iNOSmRNA的表达。结果 :喉癌喉咽癌组阳性表达率为 78.85 % ,与正常喉黏膜组 (0 % )和癌旁组 (2 0 .0 0 % )比较 ,差异有极显著性意义 (P <0 .0 1) ;与良性肿瘤组 (4 1.6 7% )比较 ,差异亦有显著性意义 (P <0 .0 5 )。有局部淋巴结转移组 (95 .2 4 % )显著高于无局部淋巴结转移组 (6 7.74 % ) (P <0 .0 5 ) ;iNOSmRNA阳性表达与T分级呈正相关 (P <0 .0 5 ) ,与细胞分化程度呈负相关 (P <0 .0 5 )。结论 :喉癌喉咽癌组织中iNOSmRNA呈高表达 ,提示iNOS可能通过合成NO在分子水平参与了喉癌喉咽癌的发生、发展 ;NO供体药物和iNOS特异性抑制剂的开发 ,必将为肿瘤治疗带来可喜的前景。 相似文献
16.
OBJECTIVE: To explore the expression and significance of NF-kappaB in laryngeal carcinoma. METHOD: The protein expression of NF-kappaB p65 in laryngeal carcinoma tissue and normal laryngeal tissue was examined by Western blot; NF-kappaB DNA binding activity was examined by electrophoretic motility shift assay (EMSA) in 20 laryngeal carcinoma tissue and 12 normal laryngeal tissue. RESULT: The levels of NF-kappaB p65 protein and NF-kappaB DNA binding activity in the laryngeal carcinoma tissue were higher than those in normal laryngeal tissue. CONCLUSION: NF-kappaB may be an important oncoprotein and involves in the occurrence and development of laryngeal carcinoma. 相似文献
17.
目的探讨骨桥蛋白(OPN)和尿激酶型纤溶酶原激活物(uPA)在喉鳞状细胞癌组织中的表达及其与喉癌侵袭、转移的关系。方法应用免疫组织化学方法检测64例喉癌组织、18例癌旁正常黏膜中OPN和uPA的表达,从部位、分化程度、临床分期、淋巴结转移等不同方面分别进行对照分析,比较其有无差异。 结果64例喉癌组织中OPN与uPA蛋白的阳性表达率分别为62.5%(40/64)、65.6%(42/64)。OPN与uPA的表达与肿瘤组织临床病理分期和有无淋巴结转移有关(P<0.05),与患者年龄、性别、肿瘤的部位及分化程度等无关(P>0.05),且二者表达呈正相关(r=0.6625,P<0.05)。 结论OPN和uPA基因蛋白在喉癌的侵袭转移过程中起着重要作用,有望成为反映喉癌生物学特性及评价预后的重要标记分子。 相似文献
18.
喉癌手术安全切缘的免疫组化研究 总被引:14,自引:2,他引:12
目的:从基因蛋白水平角度研究喉癌手术安全切缘。方法:应用 L S A B免疫组化法,检测了ras、cm yc、p53 癌基因在30 例喉癌,边缘区,癌旁0.5、1.0、1.5、2.0 cm 粘膜处和 4 例正常喉粘膜中的表达情况。结果:三种癌基因产物的单独及联合表达阳性率依正常粘膜→癌旁2.0 cm →1.5 cm →1.0 cm →0.5 cm →边缘区→癌顺序递增,且癌基因蛋白的表达在距肿瘤0.5 cm 以内的癌旁组织与癌旁组织1.0 cm 处有显著性差异( P < 0.05)。结论:距肿瘤0.5 cm 内的癌旁组织应视为癌前期病变,以切缘距肿瘤0.5 cm 作为喉癌手术安全切缘的标准较为合适 相似文献